单细胞组学
1. Nav1.5 in the dorsal root ganglion plays a crucial role in mechanical hypersensitivity.
背根神经节中的Nav1.5在机械超敏反应中发挥关键作用。电压门控钠通道是痛觉传递的关键介质,但Nav1.5在体感系统中的具体作用此前不明。研究证明Nav1.5主要表达于DRG中的TrkB阳性神经元,缺失Nav1.5会显著削弱神经病理性疼痛和内脏痛模型中的机械敏感性。该研究确立了Nav1.5作为机械超敏反应的关键调节因子及潜在镇痛靶点。
机械超敏, 慢性疼痛 | Nav1.5钠通道, TrkB神经元 | 条件性敲除, 单细胞RNA测序
Zhang Chen-Jing · … · Zhou Xue-Long · · 2026/03/11
该研究由浙江大学医学院附属妇产科医院周雪龙团队完成 Brain : a journal of neurology
原文链接:https://doi.org/10.1093/brain/awaf438
2. PAICS mediates DNA damage and cerebellar neuronal loss in C9orf72 amyotrophic lateral sclerosis.
PAICS介导C9orf72型肌萎缩侧索硬化症中的DNA损伤和神经元丢失。C9orf72基因突变是ALS最常见的遗传原因,但其导致小脑病理的机制仍未解决。研究发现C9orf72缺失导致嘌呤合成基因paics下调,进而引发DNA修复缺陷和神经元凋亡。该研究揭示了PAICS是小脑变性的关键介质,为ALS和FTD提供了新的治疗靶点。
肌萎缩侧索硬化症(ALS) | PAICS, DNA损伤修复 | 单细胞转录组学, 斑马鱼模型
Singh Jaskaran · … · Patten Shunmoogum A · Brain : a journal of neurology · 2026/03/11
原文链接:https://doi.org/10.1093/brain/awag092
3. Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations.
多样性杂交小鼠的细胞类型特异性网络分析识别出人类骨密度GWAS关联基因。将GWAS关联变异转化为功能机制和因果基因是当前的一大挑战。研究利用小鼠骨髓基质细胞的大规模单细胞转录组数据构建网络,识别出21个可能影响人类骨密度的驱动基因。该工作展示了利用小鼠单细胞组学数据优先筛选人类骨质疏松症遗传靶点的有效性。
骨密度, 骨质疏松 | GWAS, 基因调控网络 | 单细胞转录组测序
Dillard Luke J · … · Farber Charles · · 2026/03/11
该研究由弗吉尼亚大学Charles Farber团队完成 eLife
原文链接:https://doi.org/10.7554/eLife.100832
4. Phase 1 pilot study for hemophilia-A: AAV8 vector with prophylactic tacrolimus-glucocorticoid achieves therapeutic FVIII activity
AAV8载体联合预防性免疫抑制在血友病A治疗中实现治疗级FVIII活性。AAV基因治疗中免疫反应对转基因表达的影响是主要挑战。研究评估了GS001载体联合泼尼松和他克莫司的疗效,发现高剂量组患者FVIII活性显著提升且持久,单细胞分析证实该方案有效抑制了CD8+ T细胞反应。该研究证明了预防性免疫抑制在增强基因治疗效果和安全性方面的价值。
血友病A | AAV基因治疗, 免疫抑制 | 单细胞RNA测序
Liu, Wei · … · Zhang, Lei · · 2026/03/11
该研究由中国医学科学院血液病医院张磊团队完成 Signal Transduction and Targeted Therapy
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41392-026-02599-3
基因组或者转录组学
1. Evolution and spillover dynamics of yellow fever at the forest–urban interface in Brazil
巴西森林-城市交界处黄热病的进化与溢出动力学。黄热病毒在森林与城市间的传播机制仍不明确。研究通过整合蚊媒监测、非人灵长类尸体监控和病毒宏基因组学,揭示了圣保罗一次暴发的传播动力学,并估算出极高的基本再生数。该发现表明多源监测可为动物源性病毒溢出风险提供有效的早期预警。
黄热病 | 病毒溢出, 传播动力学 | 病毒宏基因组学
Telles-de-Deus, Juliana · … · Faria, Nuno R. · Nature Microbiology · 2026/03/11
⭐ 该研究由牛津大学Nuno Faria团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41564-026-02302-w
2. Antibiotic use and gut microbiome composition links from individual-level prescription data of 14,979 individuals
长期处方数据揭示抗生素对肠道菌群持久影响。抗生素是已知的菌群干扰物,但其长期后果在大规模人群中研究较少。研究结合近1.5万人的处方记录与粪便元基因组,发现抗生素使用在数年后仍与菌群多样性降低相关。该发现强调了抗生素使用的长远健康风险,呼吁更谨慎的临床用药。
肠道菌群失调 | 抗生素干扰 | 元基因组学, 处方数据关联分析
Baldanzi, Gabriel · … · Fall, Tove · Nature Medicine · 2026/03/11
⭐ 该研究由乌普萨拉大学Tove Fall团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41591-026-04284-y
3. Genetic pathways linking oxytocin-vasotocin hypothalamic subunit architecture with psychiatric and metabolic traits
下丘脑亚单位与精神及代谢特征的遗传关联。催产素和血管加压素信号异常与精神和代谢疾病共病有关,但其遗传基础尚不清晰。研究通过双变量混合模型发现下丘脑特定亚单位与精神特征存在广泛遗传重叠,并定位了95个新关联位点。这些发现阐明了下丘脑亚单位的遗传结构,为研究相关共病提供了新途径。
精神疾病, 代谢综合征 | 催产素, 血管加压素 | 全基因组关联分析(GWAS), 神经影像
Sartorius, Alina I. · … · Quintana, Daniel S. · Molecular Psychiatry · 2026/03/11
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41380-026-03508-4
4. NAD^+ controls circadian rhythmicity during cardiac aging
NAD+调控心脏衰老过程中的昼夜节律。昼夜节律紊乱和NAD+水平下降是衰老的标志,但二者在心脏衰老中的关系尚不明确。研究发现衰老会导致心脏昼夜基因表达紊乱,而补充NAD+前体NR可重编程转录组并逆转心脏肥大。该研究揭示了NAD+在调节心脏生物钟中的核心作用,为防治衰老相关心脏病提供了新方向。
心脏衰老, 昼夜节律紊乱 | NAD+代谢, SIRT1 | 转录组学, 烟酰胺核糖(NR)补充
Carpenter, Bryce J. · … · Dierickx, Pieterjan · Communications Biology · 2026/03/11
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s42003-026-09818-1
5. Integrated small and long RNA sequencing reveals piRNA mediated transposon repression during human oogenesis
整合长短RNA测序揭示人类卵子发育中piRNA介导的转座子抑制。piRNA通路在人类卵子中的作用尚不明确。研究通过单细胞测序发现,PIWIL3相关的短piRNA在卵子发育中广泛抑制转座子,而长piRNA则提供特异性抑制。该研究提供了人类卵子发育中RNA共表达的宝贵数据集,揭示了不同PIWI/piRNA类群在维持基因组稳定性中的协同作用。
卵子发育, 基因组稳定性 | piRNA, 转座子抑制 | 单细胞RNA测序
Zhang, Fengjuan · … · Wu, Ligang · · 2026/03/11
该研究由中国科学院分子细胞科学卓越创新中心吴立刚团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-70296-4
6. Comparative centromere genomics reveals evolutionary divergence in Solanaceae genomes
茄科植物基因组比较揭示着丝粒的进化分化。着丝粒的重复序列和快速进化特性长期阻碍了其大规模表征。研究通过长读长测序和CENH3 ChIP-seq,描绘了茄子、辣椒和番茄的着丝粒图谱,发现其主要由不同种类的逆转录转座子组成。该研究揭示了茄科植物着丝粒显著的进化动态和种内变异,为植物着丝粒进化研究奠定了基础。
茄科植物基因组学 | 着丝粒进化, 逆转录转座子 | 长读长测序, ChIP-seq
Wan, Penglong · … · Liao, Yi · · 2026/03/11
该研究由华南农业大学廖毅团队完成 Genome Biology
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s13059-026-04028-8
7. CircNSD2 promotes metastasis and immune escape by increasing the USP10/SRSF6-mediated alternative splicing of TPM1 in TNBC
CircNSD2通过调控TPM1可变剪接促进三阴性乳腺癌转移与免疫逃逸。三阴性乳腺癌(TNBC)恶性程度高且易转移,TGF-β诱导转移的环状RNA机制尚不清晰。研究发现circNSD2作为支架稳定SRSF6并重编程TPM1剪接,同时上调PD-L1抑制T细胞免疫。该研究揭示了circNSD2在TNBC进展中的关键作用,为其诊断和治疗提供了新靶点。
三阴性乳腺癌, 肿瘤转移 | CircNSD2, 可变剪接 | RNA测序, RNA pulldown
Sun, Yuhan · … · Yang, Qifeng · · 2026/03/11
该研究由山东大学杨其峰团队完成 Molecular Cancer
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s12943-026-02627-4
蛋白质组学
1. Proteomic landscape of Ewing sarcoma primary tumors and metastases
尤文肉瘤原发瘤与转移瘤的蛋白质组图谱研究。尤文肉瘤是一种罕见的儿科骨肿瘤,其微环境和分子机制尚不完全明确。研究对170份肿瘤样本进行深度质谱蛋白质组分析,揭示了铁死亡通路与化疗反应的关联,并定义了与预后相关的分子亚型。该研究为理解尤文肉瘤生物学及开发新的治疗策略提供了宝贵的分子资源。
尤文肉瘤 | 铁死亡, 肿瘤微环境 | 质谱蛋白质组学
Gordon, Sagi · … · Geiger, Tamar · · 2026/03/11
该研究由魏茨曼科学研究所Tamar Geiger团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-70449-5
2. Structural dynamics and immunogenicity of the recombinant and outer membrane vesicle-embedded Meningococcal antigen NadA
膜嵌入式脑膜炎球菌抗原具有更强免疫原性。蛋白质亚单位疫苗与天然抗原的结构差异往往影响最终的免疫保护效果。研究通过氢氘交换质谱发现,膜嵌入式NadA比可溶性抗原更易暴露抗原表面并诱导更强的杀菌抗体。该研究为优化疫苗设计、模拟天然表位构象提供了重要依据。
脑膜炎球菌感染 | NadA抗原, 构象动力学 | 氢氘交换质谱, 外膜囊泡技术
Calvaresi, Valeria · … · Norais, Nathalie · · 2026/03/11
该研究由GSK疫苗研发中心Nathalie Norais团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-70059-1
代谢组学
1. Gut-derived hyodeoxycholate reprograms the spleen–eye immunometabolic axis to suppress autoimmune uveitis
肠道来源的猪去氧胆酸通过重编程脾-眼免疫代谢轴抑制自身免疫性葡萄膜炎。自身免疫性葡萄膜炎缺乏除免疫抑制外的针对性疗法。研究发现患者体内猪去氧胆酸(HDCA)显著缺失,补充HDCA可通过调节脾脏巨噬细胞代谢增加油酸产生。系统性油酸随后抑制眼部炎症反应,为该病提供了基于肠道代谢产物的新治疗策略。
自身免疫性葡萄膜炎 | 猪去氧胆酸(HDCA), 巨噬细胞重编程 | 代谢组学, 免疫代谢分析
Li, Yitao · … · Jia, Wei · · 2026/03/11
该研究由香港浸会大学贾伟团队完成 Cell Death & Differentiation
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41418-026-01696-8
多组学
1. ApoE4 Drives Microglial Lipid Dysregulation in Alzheimer’s Disease via Epigenetic Reprogramming of the Asxl1/LXRα–H3K4me3 Axis
ApoE4驱动AD小胶质细胞脂质代谢紊乱。ApoE4是迟发性阿尔茨海默病最大的遗传风险因素,但其导致小胶质细胞功能障碍的机制不明。研究揭示ApoE4通过削弱Asxl1-LXRα轴降低脂质外排基因表达,导致脂质堆积和吞噬功能受损。增强Asxl1功能为对抗ApoE4介导的AD病理提供了新策略。
阿尔茨海默病 | ApoE4, Asxl1-LXRα轴, 脂质代谢 | 单细胞核转录组测序, 表观遗传分析
Lin, Lanyan · … · Lin, Fan · · 2026/03/11
该研究由福建医科大学林帆团队完成 Journal of Neuroinflammation
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s12974-026-03740-3
2. Gut microbiota-derived lactate is associated with disrupted cardiac circadian rhythms in alcoholic heart disease
肠道菌群来源乳酸关联酒精性心脏病节律紊乱。酒精性心脏病涉及菌群失调和代谢紊乱,但其与心脏昼夜节律的联系尚不明确。研究发现酒精诱导的乳酸升高通过影响昼夜节律基因导致心肌损伤,而膳食纤维可恢复平衡。该研究揭示了“肠-心轴”机制,为酒精性心血管疾病提供了新生物标志物。
酒精性心脏病 | 肠道菌群, 乳酸, 昼夜节律基因 | 16S rRNA测序, 代谢组学, 转录组学
Siang, Wei · … · Ren, Lai · · 2026/03/11
该研究由中国科学院昆明动物研究所赖仞团队完成 npj Biofilms and Microbiomes
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41522-026-00958-0
3. Lipid-dependent accrual of a subset of monocyte-derived macrophages is essential for tissue regeneration
脂质沉积巨噬细胞是肝脏再生的关键调节者。肝损伤后的再生过程涉及复杂的免疫与代谢协同,但具体机制不明。研究识别出一类富含脂质的巨噬细胞亚群(LIMMs),其通过CD36介导的信号通路产生IL-6。阻断该过程会显著损害肝细胞增殖,揭示了再生性炎症的新调节机制。
肝再生 | CD36, IL-6, 脂质沉积巨噬细胞 | 单细胞转录组学, 脂质组学
Yao, Tao · … · Wu, Ying · Nature Metabolism · 2026/03/11
⭐ 该研究由陆军军医大学吴英团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s42255-026-01480-5
4. Integrated omics reveal the effects of vitamin D deficiency on gut microbiota and plasma metabolism in experimental autoimmune uveitis
维生素D缺乏通过菌群失调加重葡萄膜炎。维生素D缺乏与多种自身免疫病相关,但其在葡萄膜炎中的作用机制尚不明确。研究发现维生素D缺乏会导致菌群失调、屏障受损及LRAT下调,从而放大视网膜炎症。该研究揭示了“肠-眼轴”在疾病中的作用,并确定LRAT为潜在治疗靶点。
自身免疫性葡萄膜炎 | 维生素D, LRAT, 肠道菌群 | 整合组学分析, 屏障功能评估
Chen, Zhijun · … · Yang, Peizeng · · 2026/03/11
该研究由重庆医科大学杨培增团队完成 Journal of Neuroinflammation
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s12974-026-03765-8
5. Factor VIII restores bone parameters and modulates muscle proteo-metabolome in Factor VIII knockout male mice
凝血因子VIII可恢复骨参数并调节肌肉代谢。除止血外,FVIII在骨骼和肌肉发育中的潜在作用此前未被充分研究。研究发现FVIII缺失会导致小鼠出现骨质疏松表型及肌肉纤维类型转变,而补充FVIII可逆转骨骼病变。该研究全面刻画了FVIII缺失的肌肉骨骼表型,为血友病并发症治疗提供了新见解。
血友病并发症, 骨质疏松 | 凝血因子VIII, 肌肉代谢组 | 蛋白质组学, 代谢组学
Babuty, Antoine · … · Heymann, Dominique · · 2026/03/11
该研究由南特大学Dominique Heymann团队完成 Bone Research
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41413-025-00485-2
6. Advances in single-cell and spatial omics for studying symbiotic nitrogen fixation: comparative cellular and evolutionary perspectives
单细胞与空间组学在共生固氮研究中的进展。单细胞和空间转录组学通过解析根瘤内的细胞异质性和基因表达动态,彻底改变了共生固氮研究。本文综述了豆科植物中控制免疫识别和固氮代谢的保守及特异性程序。整合表观组学数据为理解关键共生基因的调节提供了新见解,为非豆科作物的固氮工程提供了框架。
共生固氮, 根瘤发育 | 细胞异质性, 基因表达调控 | 单细胞转录组, 空间组学
Shi, Yan · … · Wang, Haifeng · · 2026/03/11
该研究由中国科学院王海峰团队完成 Genome Biology
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s13059-026-04024-y
生物信息软件
1. Accurate Prediction of Core-Hopping Transformations Using Molecular Dynamics-Derived Conformational Ensembles: Application to the Discovery of Novel P2X3 Antagonists.
利用分子动力学衍生的构象系综准确预测骨架跃迁转化。传统的骨架跃迁方法难以评估新骨架对配体取代基构象平衡的影响。研究开发了DynaCore算法,通过计算分子动力学模拟中的构象系综相似性,成功设计并识别出新型高效P2X3拮抗剂。该算法为药物化学中的骨架替换和先导化合物优化提供了强有力的计算工具。
药物研发 | P2X3受体 | 分子动力学模拟, DynaCore算法
Pala Daniele · … · Biagetti Matteo · Journal of medicinal chemistry · 2026/03/11
原文链接:https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c02642
2. Retentive Network promotes efficient RNA language modeling of long sequences
RNAret提升长序列RNA语言模型建模效率。传统的Transformer模型在处理长RNA序列时面临计算复杂度过高的挑战。研究提出基于保留网络的RNAret模型,实现了线性复杂度和高效的长序列处理能力。该模型在预测RNA相互作用和二级结构等方面表现卓越,推动了RNA生物学的计算研究。
RNA功能预测 | RNA二级结构, RNA相互作用 | 保留网络, 语言模型
Shen, Yi · … · Chen, Ming · · 2026/03/11
该研究由浙江大学陈铭团队完成 Communications Biology
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s42003-026-09757-x
3. AF2BIND: predicting small-molecule binding sites using the pair representation of AlphaFold2
利用AlphaFold2特征预测小分子结合位点。识别蛋白质结合位点对药物研发至关重要,但从头预测仍具挑战。研究开发了AF2BIND逻辑回归模型,无需同源建模或配体信息即可准确预测结合位点。该工具已应用于人类蛋白组,发现了数千个潜在的新药物靶点,将有力推动药物发现进程。
药物研发, 靶点识别 | 蛋白质-小分子结合 | AlphaFold2, 机器学习
Gazizov, Artem · … · Polizzi, Nicholas F. · Nature Methods · 2026/03/11
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41592-026-03011-2
4. AI-powered biomechanical modeling for ACL-reconstructed knees: predicting knee joint contact forces via computer vision and deep learning
AI驱动的前交叉韧带重建术后膝关节接触力预测。ACL重建患者面临极高的骨关节炎风险,实时监测膝关节接触力对康复至关重要。研究开发了一个结合肌肉骨骼建模与深度学习的非侵入性框架,能高精度预测日常生活中的接触力。该技术实现了从实验室静态分析向动态实时监测的转变,具有广阔的应用前景。
前交叉韧带重建, 骨关节炎 | 膝关节接触力(KCF) | 计算机视觉, 深度学习
Chen, Tianxiao · … · Gu, Yaodong · · 2026/03/11
该研究由宁波大学顾耀东团队完成 Journal of NeuroEngineering and Rehabilitation
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s12984-026-01939-2
声明:本文使用了AI进行翻译和总结