NTRK1 inhibitor(Mochida Pharmaceutical)

单细胞组学 1. Estradiol regulates osteoclast sialylation via ST3Gal1 in postmenopausal osteoporosis. 雌二醇通过ST3Gal1调节绝经后骨质疏松症中的破骨细胞唾液酸化。绝经后雌激素缺乏导致骨流失加速，但雌激素信号调节破骨细胞形成的分子通路尚未完全明确。研究发现雌激素受体α抑制FOS介导的ST3GAL1转录，从而降低破骨细胞唾液酸化水平并抑制骨吸收。该研究揭示了雌激素缺乏与破骨细胞活化之间的新分子联系，为骨质疏松治疗提供了新靶点。 绝经后骨质疏松 | ST3GAL1, 破骨细胞唾液酸化 | 单细胞RNA测序, 唾液酸酶处理 Dou Ce · … · Luo Fei · · 2026/02/12 该研究由骨科学陆军军医大学Luo Fei团队完成 Bone research 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41413-025-00498-x 2. A practical guide to targeted single-cell RNA sequencing technologies. 靶向单细胞RNA测序技术的实用指南。常规单细胞测序存在检测效率低和转录本覆盖不全等偏差，限制了对特定转录本的研究。综述分类讨论了五类靶向测序方案的优缺点，并提供了选择最合适方法的决策树。该指南将帮助研究人员优化实验设计，提高单细胞水平上特定基因的检测精度。 转录组异质性 | 基因检测偏差 | 靶向单细胞测序 Moro Giulia · … · Basler Konrad · · 2026/02/14 该研究由分子生命科学苏黎世大学Konrad Basler团队完成 Communications biology 原文链接：https://doi.org/10.1038/s42003-026-09675-y 3. cRGD-Functionalized macrophage extracellular vesicles loaded with GSK2033 enhance T cell antitumor immunity in GBM by disrupting the LXR/ABCA1-Mediated Myelin lipid transfer axis. 功能化巨噬细胞外泌体增强胶质母细胞瘤免疫治疗。胶质母细胞瘤因免疫抑制微环境和血脑屏障阻碍而面临巨大挑战。研究开发了装载LXR拮抗剂的cRGD外泌体，通过阻断脂质转移增强T细胞抗肿瘤活性。该纳米药物能有效穿透血脑屏障并抑制肿瘤生长，为GBM免疫治疗提供了新策略。 胶质母细胞瘤, 免疫抑制 | LXR/ABCA1轴, 脂质转移 | 外泌体, 纳米药物 Bi Changlong · … · Luo Xiangying · · 2026/02/14 该研究由神经外科中南大学湘雅医院罗项英团队完成 Journal of nanobiotechnology 原文链接：https://doi.org/10.1186/s12951-026-04116-8 空间组学 1. Colonic spatial single-cell proteomics and murine models link mitochondrial dysfunction to dimeric IgA-secreting plasma cell deficiency in Crohn's disease. 线粒体功能障碍导致克罗恩病中二聚体IgA分泌浆细胞缺乏。克罗恩病患者粘膜体液免疫失调的起源尚不清楚，特别是分泌型IgA（SIgA）减少的机制。研究通过空间单细胞蛋白质组学发现，线粒体氧化磷酸化受损阻碍了结肠IgA+浆细胞的分化与成熟。该发现揭示了代谢障碍在克罗恩病发病中的关键作用，为未来治疗策略提供了新方向。 克罗恩病 | 线粒体氧化磷酸化, 二聚体IgA | 空间单细胞蛋白质组学, 代谢组学 Raschdorf Annika · … · Derer Stefanie · · 2026/02/12 该研究由营养医学石勒苏益格-荷尔斯泰因大学医院Derer Stefanie团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69069-w 2. Local antibody feedback enforces a checkpoint on affinity maturation in the germinal center and promotes epitope spreading. 局部抗体反馈调节生发中心亲和力成熟与表位扩展。循环抗体影响体液免疫，但局部表位竞争如何塑造生发中心反应仍待深入研究。研究发现高亲和力B细胞通过局部抗体反馈抑制同表位低亲和力克隆，并促进免疫反应向其他表位扩展。该发现揭示了抗体反馈在优化免疫应答多样性中的关键作用。 体液免疫应答, 表位扩展 | 生发中心, 抗体反馈, 亲和力成熟 | 空间转录组学, mRNA-LNP免疫 Yan Yu · … · Batista Facundo D · Immunity · 2026/02/13 ⭐ 该研究由免疫学拉贡研究所Batista Facundo D团队完成 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.immuni.2026.01.011 3. Developing a Single-Cell Spatial Transcriptomics Workflow for In Vivo Evaluation of Implanted Biomaterials. 空间转录组学揭示植入材料的体内响应。传统组织学方法难以捕捉驱动生物材料组织重塑的复杂细胞机制，限制了材料的理性设计。研究开发了基于Xenium平台的生物信息学流程，识别出支架表面独特的巨噬细胞和成纤维细胞亚群及其空间演变规律。该工作证明空间转录组学是优化生物材料设计、理解细胞动态的强有力工具。 生物材料兼容性, 异物反应 | 巨噬细胞异质性, 组织纤维化 | Xenium空间转录组, 生物信息学流程 Chan Alex H P · … · Tan Richard P · · 2026/02/15 该研究由生物医学悉尼大学Tan Richard P团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) 原文链接：https://doi.org/10.1002/advs.202513242 基因组或者转录组学 1. Chronic dental lighting disrupts blood-retinal barrier homeostasis via vascular and inflammatory pathways. 长期牙科照明通过血管和炎症通路破坏血-视网膜屏障稳态。牙科医生日常工作中暴露于高强度照明，其对视网膜屏障稳态的长期影响及机制研究较少。研究发现长期牙科照明会减少视网膜血管并激活NF-κB炎症通路，其中蓝光和白光LED的损伤尤为显著。该研究揭示了牙科照明诱发职业性眼病的潜在机制，为牙科医生选择光源提供了科学指导。 血-视网膜屏障破坏 | NF-κB信号通路, 慢性光损伤 | 转录组测序, 组织透明化技术 Sun Haiyang · … · Chen Junyu · · 2026/02/13 该研究由口腔医学四川大学华西口腔医院Chen Junyu团队完成 International journal of oral science 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41368-025-00414-3 2. Dissection of innate-immune-ligand- and interferon-protein-mediated transcriptional responses in human THP1 cell states. 人THP1细胞中先天免疫配体与干扰素介导的转录响应解析。干扰素调节因子（IRFs）在不同免疫通路中的具体分工及反馈调节机制需要系统性的图谱分析。研究通过敲除或过表达IRFs，定义了不同通路激活的基因亚群，并揭示了IRF3在巨噬细胞状态下的特异性作用。该研究为剖析复杂炎症基因特征提供了宝贵资源，有助于精准靶向炎症信号通路。 炎症反应 | 干扰素调节因子, ISGs | 转录组测序, 基因敲除 Lama Lodoe · … · Tuschl Thomas · · 2026/02/12 该研究由RNA分子生物学洛克菲勒大学Tuschl Thomas团队完成 Communications biology 原文链接：https://doi.org/10.1038/s42003-025-09343-7 3. Inference of SARS-CoV-2 exposure biomarkers using large-scale T-cell repertoire profiling. 利用大规模T细胞库分析推断新冠病毒暴露生物标志物。开发基于群体免疫特征的传染病监测方法对于理解病毒传播和个体免疫反应至关重要。研究应用机器学习分析了1200多个TCR库，通过批次校正和HLA分型构建了高精度的COVID-19暴露分类器。该方法为基于AIRR-seq的大规模队列免疫状态评估铺平了道路。 新冠病毒感染 | T细胞受体库, 免疫记忆 | 机器学习, T细胞受体测序 Vlasova Elizaveta K · … · Shugay Mikhail · · 2026/02/12 该研究由转化医学皮罗戈夫俄罗斯国立研究医科大学Shugay Mikhail团队完成 Genome medicine 原文链接：https://doi.org/10.1186/s13073-025-01589-4 4. CGRP signaling links tumor-associated pain to immune evasion in oral squamous cell carcinoma. CGRP信号将肿瘤相关疼痛与口腔鳞癌的免疫逃逸联系起来。固态肿瘤中外周感觉神经与肿瘤生长的关系，特别是疼痛与免疫抑制之间的联系尚未阐明。研究发现感觉神经通过释放CGRP限制抗肿瘤免疫反应，而阻断CGRP受体可减缓肿瘤生长并增强免疫。该研究表明靶向CGRP可能是减轻口腔癌疼痛并提高治疗效果的潜在策略。 口腔鳞状细胞癌 | CGRP信号, 免疫逃逸 | 神经消融, 转录组测序 McIlvried Lisa A · … · Scheff Nicole N · · 2026/02/13 该研究由神经生物学匹兹堡大学Scheff Nicole N团队完成 Cell reports 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116994 5. Pathogen effector disarms circadian-immune crosstalk by targeting TCP14, a dual regulator of clock and defense. 病原体效应子通过靶向TCP14破坏植物昼夜节律与免疫的交叉对话。病原体如何通过劫持宿主免疫核心蛋白来破坏生物钟调节的防御反应仍是研究难点。研究发现TCP14是连接昼夜节律与免疫的关键枢纽，而病原体效应子HaRxL21通过干扰TCP14来抑制防御基因表达。该工作揭示了病原体通过破坏宿主节律枢纽来实施攻击的新范式。 植物免疫 | TCP14, 昼夜节律 | 时间序列转录组测序, 蛋白互作分析 Wang Yu · … · Zhou Mian · · 2026/02/12 该研究由植物生物学首都师范大学Zhou Mian团队完成 Cell reports 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116944 6. Quantitative genetics of natural S. cerevisiae strains upon mating reveal heritable determinants of fitness and differential mating affinities. 酿酒酵母有性生殖的遗传决定因素。有性生殖中适应性如何遗传以及亲本是否存在择偶偏好是进化生物学的核心问题。研究利用近百种天然分离株进行大规模杂交，发现不同碳源下后代适应性与亲本遗传距离及择偶偏好相关。该工作为理解适应性遗传提供了重要的定量遗传学资源。 适应性遗传, 择偶偏好 | 杂种优势, 遗传距离 | 基因组条形码, 定量遗传分析 Strauss Sivan Kaminski · … · Pilpel Yitzhak · · 2026/02/12 该研究由遗传学魏茨曼科学研究所Pilpel Yitzhak团队完成 Cell reports 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116972 7. 8-Shogaol from White Ginger induces cell apoptosis and autophagy in human colon cancer HCT116 cells and in vivo. 8-姜酚诱导结肠癌细胞凋亡与自噬。结肠癌发病率逐年上升，探索生姜提取物8-姜酚的抗癌机制具有重要意义。通过miRNA组学分析发现，8-姜酚通过抑制PI3K/AKT信号通路诱导HCT116细胞发生G2/M期阻滞、凋亡及自噬。该研究为8-姜酚用于结肠癌治疗提供了系统的机制依据。 结直肠癌, 细胞凋亡 | PI3K/AKT通路, miRNA调控, 自噬 | miRNA组学, 流式细胞术 Zhang Rui · … · Wei Zhao-Jun · · 2026/02/09 该研究由食品与生物工程合肥工业大学Wei Zhao-Jun团队完成 Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.phymed.2026.157954 8. Compound starch granule formation in grass seeds is associated with distinct temporal patterns of gene expression. 禾本科种子复粒淀粉形成的基因表达模式。禾本科植物淀粉颗粒形态多样，但决定单粒与复粒形成的遗传因素尚不清楚。通过对105个物种的形态调查及转录组分析，发现SS3a和SBE1等基因的特定表达模式与复粒形成相关。该研究为理解淀粉发育的自然变异及品质改良提供了重要数据集。 淀粉颗粒形态, 种子发育 | SS3a, SBE1, 基因表达模式 | 比较转录组学, 电子显微镜 Watson-Lazowski Alexander · … · Seung David · · 2026/02/13 该研究由植物生物学约翰·英纳斯中心Seung David团队完成 Current biology : CB 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.cub.2026.01.038 9. A novel GIPR/GLP-1R dual agonist improves systemic metabolism through differentially regulating inflammation and lipid metabolism in obesity. 新型GIPR/GLP-1R双激动剂通过调节炎症和脂代谢改善肥胖。双受体激动剂在减重方面效果显著，但其具体代谢调节机制仍待阐明。研究发现THDBH120通过GLP-1R改善脂代谢，通过GIPR减轻脂肪组织炎症。该研究证实了双受体在系统代谢中的协同作用，具有重要的临床应用潜力。 肥胖 | GIPR, GLP-1R, 脂肪炎症 | 转录组测序, 动物模型 Zhang Feng · … · Hu Fang · · 2026/02/12 该研究由代谢性疾病中南大学湘雅二医院胡芳团队完成 Journal of advanced research 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.jare.2026.02.006 10. Blood-based epigenetic instability linked to human aging and disease. 血液DNA甲基化不稳定性成为衰老与疾病的新型生物标志物。DNA甲基化的复杂异质性使得识别驱动疾病发生的早期表观遗传变化变得困难。研究发现一组表观遗传稳定位点，其甲基化变异性随年龄增加，并与血液癌症及心血管风险密切相关。该研究强调了甲基化不稳定性在疾病预警中的价值，揭示了其与克隆演化的联系。 衰老, 血液肿瘤, 心血管疾病 | DNA甲基化不稳定性, 克隆造血 | 表观遗传分析 Basrai Salman · … · Abelson Sagi · · 2026/02/14 该研究由癌症研究安大略癌症研究所Sagi Abelson团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69430-z 11. Extrusion fountains are hallmarks of chromosome organization emerging upon zygotic genome activation. 喷泉状挤压结构是合子基因组激活时染色体组织的特征。发育初期基因表达启动伴随着染色体结构的剧烈变化，但其早期折叠过程及功能仍不明确。研究在斑马鱼胚胎中发现了增强子处的“喷泉”结构，由Cohesin蛋白的初始积累和随后重分布形成。该发现揭示了发育过程中染色体折叠的起始机制，并证明了增强子在组织染色体架构中的核心作用。 胚胎发育, 染色体折叠 | 合子基因组激活(ZGA), Cohesin, 增强子 | Hi-C, 聚合物模拟 Galitsyna Aleksandra · … · Onichtchouk Daria · · 2026/02/14 该研究由发育生物学弗莱堡大学Daria Onichtchouk团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69105-9 12. Enabling global-scale nucleic acid repositories through versatile, scalable biochemical selection from room-temperature archives. 室温核酸存档系统助力全球规模的基因组生物库建设。传统的核酸存储依赖昂贵的冷链和低效的自动化处理，限制了大规模生物库的建立。研究引入了一种可扩展的室温存储系统，通过条形码和生化选择实现类似数据库的复杂查询。该系统在SARS-CoV-2和临床样本中验证了高效检索能力，为资源匮乏地区的病原体监测和基因组研究提供了新方案。 基因组存档, 病原体监测 | 生化选择检索 | 室温核酸存储, DNA条形码 Berleant Joseph D · … · Bathe Mark · · 2026/02/14 该研究由生物工程麻省理工学院Mark Bathe团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69402-3 13. Loss-of-function variants in the CAPN1 activator CD99L2 cause X-linked spastic ataxia. CD99L2功能缺失变异被鉴定为X连锁痉挛性共济失调的病因。许多罕见运动障碍的遗传病因不明，限制了临床诊断和治疗。研究通过对2811名患者的基因组分析，发现CD99L2变异通过损害CAPN1蛋白酶的激活导致神经退行性变。该发现不仅为痉挛性共济失调提供了新的分子诊断依据，也揭示了突触功能障碍在相关疾病中的关键作用。 痉挛性共济失调, 罕见运动障碍 | CD99L2, CAPN1, 突触功能障碍 | 全外显子组测序, 转录组分析 Menden Benita · … · Haack Tobias B · · 2026/02/14 该研究由医学遗传学图宾根大学Tobias B Haack团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69337-9 14. Combining xQTL and genome-wide association studies from diverse populations improves druggable gene discovery. 整合xQTL与GWAS提升可药用基因发现。传统SNP关联研究在识别复杂疾病的候选药物靶点方面存在局限。研究开发了GenT框架，整合多族群数据和功能基因组学，识别出数十个与阿尔茨海默病等相关的候选基因。实验证实NTRK1抑制剂可降低AD神经元中的tau磷酸化，证明了该预测框架的有效性。 阿尔茨海默病, 精神分裂症 | 药物靶点发现 | GWAS, xQTL, 机器学习 Lorincz-Comi Noah · … · Cheng Feixiong · · 2026/02/14 该研究由基因组医学克利夫兰医学中心程飞雄团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69236-z 15. Sortilin exhibits tumor suppressor-like activity by limiting EGFR transduction function. Sortilin通过限制EGFR转导功能发挥抑癌作用。EGFR异常激活驱动肺癌生长，但靶向治疗常因其转录因子功能的代偿而产生耐药。研究发现Sortilin能减弱胞质EGFR的信号转导，并与EGFR共同结合在cMYC等致癌因子的调节元件上。Sortilin在肺腺癌中的表达水平可能成为预测抗EGFR疗法疗效的重要指标。 肺腺癌, 治疗耐药 | Sortilin, EGFR, cMYC | 染色质结合分析 Lapeyronnie E · … · Lalloué F · · 2026/02/14 该研究由肿瘤进展利摩日大学Fabrice Lalloué团队完成 Oncogene 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41388-026-03680-5 16. Systems genetic dissection of brain gene expression reveals excitotoxic mechanisms of Alzheimer's disease. 系统遗传学揭示阿尔茨海默病的兴奋性中毒机制。从死后脑转录组中解析阿尔茨海默病的因果通路面临缺乏时间分辨率的挑战。研究利用果蝇模型筛选了数百个AD相关基因，发现突触调节网络介导了谷氨酸兴奋性损伤。该跨物种策略建立了病理、转录扰动与神经变性之间的因果链，为治疗提供了新靶点。 阿尔茨海默病, 神经变性 | 兴奋性中毒, 突触调节 | 果蝇模型, 系统遗传学 Zhao Pinghan · … · Shulman Joshua M · · 2026/02/14 该研究由神经科学贝勒医学院Joshua M Shulman团队完成 Molecular psychiatry 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41380-026-03479-6 17. Higher order repeat structures reflect diverging evolutionary paths in maize centromeres and knobs. 高阶重复结构揭示玉米着丝粒与染色体结的进化差异。玉米卫星DNA在着丝粒和染色体结中具有独特的基因组背景，但其内部高阶重复（HOR）模式尚不清晰。研究利用HiReNET管线分析了玉米及其祖先的基因组，发现HOR在卫星序列中普遍存在且在染色体结中表现出更强的结构化分布。该研究阐明了重复序列在减数分裂驱动和基因组进化中的关键作用。 基因组进化 | 高阶重复序列(HOR), 减数分裂驱动 | 基因组组装, HiReNET分析管线 Piri Rebecca D · … · Dawe R Kelly · · 2026/02/14 该研究由生物信息学佐治亚大学Dawe R Kelly团队完成 Genome biology 原文链接：https://doi.org/10.1186/s13059-026-03993-4 18. T Cell Senescence Induced by DNMT1 Deletion Mediates Cardiac Transplant Tolerance via Altered CDKN1A Methylation. DNMT1缺失诱导T细胞衰老促进心脏移植耐受。心脏移植后的免疫排斥是影响移植物存活的关键，其表观遗传调控机制尚不明确。研究发现T细胞特异性敲除DNMT1可通过改变CDKN1A启动子甲基化诱导CD4+ T细胞衰老，从而抑制排斥反应并延长移植物存活。该发现揭示了DNMT1在免疫耐受中的作用，为抗排斥治疗提供了潜在靶点。 心脏移植排斥 | DNMT1, T细胞衰老, CDKN1A | 全基因组甲基化测序(WGBS), 基因敲除小鼠 Chen Yuqi · … · Wang Yixuan · · 2026/02/13 该研究由心血管外科华中科技大学同济医学院附属协和医院Wang Yixuan团队完成 Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2026.02.015 19. Divergent Responses of Bacterial Communities to Permafrost Degradation and Their Associations With Carbon Across Vertical Profiles. 多年冻土退化诱导细菌群落响应并加速碳释放。冻土退化威胁全球有机碳库，但微生物群落跨垂直剖面的响应机制仍不清晰。研究通过对青藏高原125份样本进行宏基因组测序，揭示了活动层与冻土层细菌多样性及稳定性的差异化变化。结果表明退化诱导的微生物响应可能放大碳释放，为预测气候变暖下的碳动态提供了新见解。 冻土退化与碳循环 | 细菌群落稳定性, 垂直剖面异质性 | 宏基因组测序 Chen Shengyun · … · Yang Yunfeng · · 2026/02/15 该研究由环境微生物学清华大学Yang Yunfeng团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) 原文链接：https://doi.org/10.1002/advs.202510516 蛋白质组学 1. Brain-derived neurotrophic factor and the derived dodecapeptide function as Toll-like receptor 4 antagonists in acute lung injury. BDNF及其衍生肽通过拮抗TLR4缓解急性肺损伤。神经营养因子在神经系统外的作用日益受到关注，但在急性炎症性肺病中的功能尚不明确。研究发现BDNF在肺上皮细胞中受损，其通过直接结合并拮抗巨噬细胞上的TLR4来抑制炎症。合成的衍生肽BDP-12保留了抗炎效果且无副作用，为急性炎症性疾病提供了潜在的治疗药物。 急性肺损伤, 脓毒症 | BDNF, TLR4, 巨噬细胞炎症 | 蛋白质组学, 合成肽治疗 Zhu Weiwei · … · Liang Guang · · 2026/02/14 该研究由心血管医学温州医科大学梁广团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69541-7 2. BamA self-insertion drives inner-to-outer membrane remodelling in diderm Firmicutes. BamA自插入驱动双层膜厚壁菌门的膜重塑。孢子形成涉及复杂的膜变化，但双层膜孢子形成菌如何重建其功能性外膜尚不清楚。研究发现外膜蛋白BamA和LptD在成熟孢子中缺失，但在萌发时通过BamA和新蛋白SonA的自发折叠与插入启动外膜生物合成。该模型揭示了细菌在无预存蛋白情况下从头构建外膜的进化策略。 细菌孢子形成, 外膜生物合成 | BamA, SonA, 膜重塑 | 蛋白质组学, 脂质体重建 Beskrovnaya Polina · … · Tocheva Elitza I · · 2026/02/14 该研究由微生物学英属哥伦比亚大学Elitza I Tocheva团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69191-9 3. Deficiency of lysosomal TMEM175 in myeloid macrophages exerts anti-tumor immunity via inflammasome and cross-presentation pathway. 巨噬细胞TMEM175缺失通过增强抗原交叉提呈抑制肿瘤。TMEM175在神经退行性疾病中的作用已知，但其在肿瘤免疫监视中的功能尚未明确。研究发现巨噬细胞缺失TMEM175可促进M1型极化并增强T细胞激活，从而抑制肿瘤生长和转移。该研究揭示了TMEM175作为免疫治疗新靶点的潜力，并阐明了其通过NLRP3炎症酶发挥作用的机制。 肿瘤免疫逃逸, 癌症转移 | TMEM175, NLRP3炎症小体, 巨噬细胞极化 | 基因敲除, 蛋白质组学 Zhang Ziqi · … · Wei Xiawei · · 2026/02/14 该研究由生物治疗四川大学华西医院魏霞蔚团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69546-2 4. A two-step actin-mediated strategy enables Campylobacter jejuni to promote mitochondrial aggregation and iron homeostasis, for intracellular survival and persistence. 空肠弯曲杆菌通过肌动蛋白介导的策略实现胞内生存。空肠弯曲杆菌是胃肠炎的主因，但其在宿主细胞内持久存在的机制尚不明确。研究发现该菌利用效应蛋白重塑宿主肌动蛋白，从而聚集线粒体并维持铁稳态。该发现揭示了细菌适应胞内环境的复杂机制，为阻断其临床感染提供了新靶点。 胃肠炎, 胞内生存 | 肌动蛋白重塑, 线粒体聚集 | 蛋白质组学, 基因突变 Nasher Fauzy · Wren Brendan W · · 2026/02/14 该研究由感染生物学伦敦卫生与热带医学院Brendan W Wren团队完成 Communications biology 原文链接：https://doi.org/10.1038/s42003-026-09713-9 代谢组学 1. Depression of tryptophan may contribute to adverse effects of naproxen. 色氨酸水平降低可能导致萘普生的副作用。非甾体抗炎药常伴有胃肠道和心血管副作用，其具体机制仍待阐明。研究发现萘普生通过置换结合的色氨酸导致其血浆水平下降，补充色氨酸可减轻小鼠的肠道出血和心脏炎症。该发现为监测和缓解NSAIDs副作用提供了潜在的生物标志物和干预策略。 药物副作用, 胃肠道损伤 | 色氨酸代谢, 萘普生 | 代谢组学, 动物模型 Ghosh Soumita · … · FitzGerald Garret A · · 2026/02/14 该研究由转化医学宾夕法尼亚大学Garret A FitzGerald团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69684-7 多组学 1. Integrated chromatin and transcriptomic profiling reveals sex-specific mechanisms of gene regulation in hepatic nutrient responses. 肝脏营养反应中基因调节的性别差异机制。性别与饮食如何在染色质组织水平相互作用并驱动肝脏代谢反应的分子机制仍不明确。研究通过整合转录组与染色质可及性分析，发现睾酮在调节性别二态性基因PNPLA3中发挥关键抑制作用。该研究为理解代谢性疾病的性别差异提供了表观基因组学资源和新的分子解释。 肝脏代谢 | PNPLA3, 睾酮 | 染色质可及性测序, 转录组测序 Zhang Zhengyi · … · Sallam Tamer · · 2026/02/12 该研究由心脏病学加州大学洛杉矶分校Sallam Tamer团队完成 PLoS biology 原文链接：https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3003601 2. Human iPSC-based Modeling of Pulmonary Fibrosis Reveals p300/CBP Inhibition Suppresses Alveolar Transitional Cell State. 基于iPSC的肺纤维化模型揭示p300/CBP抑制可抑制肺泡过渡态细胞。特发性肺纤维化（IPF）中出现的肺泡过渡态细胞（ATCS）是纤维化的原因还是结果仍存争议。研究利用iPSC衍生的肺泡类器官模型，通过多组学筛选鉴定出p300/CBP抑制剂能有效抑制ATCS的产生。该研究阐明了肺纤维化的生物学机制，并为IPF治疗提供了潜在的药物靶点。 特发性肺纤维化 | p300/CBP, 肺泡过渡态细胞 | 诱导多能干细胞, 肺泡类器官 Tsutsui Yusuke · … · Gotoh Shimpei · · 2026/02/12 该研究由诱导多能干细胞京都大学Gotoh Shimpei团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-68909-z 3. Single-cell multi-omic analyses highlight the essential role of NKX2.2-CLEC16A/endosomal pathway for human pancreatic differentiation and function. 单细胞多组学揭示NKX2.2-CLEC16A轴在胰腺分化中的关键作用。探究指导干细胞分化的基因调控程序对于理解细胞命运决定和开发治疗平台至关重要。研究通过单细胞多组学分析定义了胰腺分化的动态景观，并构建了具有1型糖尿病特征的人源干细胞模型。该研究为揭示细胞命运决定的分子机制提供了强大平台，并为糖尿病治疗应用铺平了道路。 1型糖尿病 | NKX2.2, CLEC16A | 单细胞多组学, 胰腺祖细胞平台 Chen Guo · … · Zhu Saiyong · · 2026/02/13 该研究由生命科学浙江大学Zhu Saiyong团队完成 Cell reports 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116990 4. Genomic foundations of salt tolerance in desert cyanobacteria. 荒漠蓝细菌耐盐性的基因组基础。蓝细菌是超盐荒漠生物结皮的基础，但其极端环境适应机制仍待阐明。通过对腾格里沙漠蓝细菌进行基因组组装及多组学分析，发现光合作用和信号转导基因显著扩张。该研究揭示了极端环境下蓝细菌生存的协调基因组与代谢机制。 极端环境适应, 耐盐性 | 氨基酸代谢, 信号转导 | 比较基因组学, 转录组与代谢组整合分析 Ye Tong · … · Wang Gaohong · · 2026/02/13 该研究由微生物学安徽医科大学Wang Gaohong团队完成 Cell reports 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116988 5. Generation of a comprehensive epigenomic atlas in clear cell renal cell carcinoma informs kidney cancer progression and heritability. 透明细胞肾细胞癌综合表观基因组图谱。肾癌进展及遗传性的表观遗传机制尚需系统性图谱支持。研究整合了194个表观组和转录组数据集，揭示了从正常到肿瘤转变中的增强子重编程及发育通路激活。该图谱为理解肾癌发生提供了新视角和丰富的社区资源。 透明细胞肾细胞癌, 肿瘤进展 | 增强子重编程, HIF2α, 发育通路 | ChIP-seq, ATAC-seq, RNA-seq Abou Alaiwi Sarah · … · Freedman Matthew L · · 2026/02/12 该研究由肿瘤表观遗传学丹娜-法伯癌症研究所Matthew L. Freedman团队完成 Cell reports 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116968 6. Disarming bacterial iron homeostasis and sulfur antioxidant defenses via coordination-driven photosensitizer de-aggregation for enhanced photodynamic infection eradication. 协同光动力疗法通过干扰细菌铁稳态和抗氧化防御杀菌。细菌的氧化应激耐受限制了光动力疗法的疗效。研究构建了Ga3+工程化光敏剂GaCe6，通过干扰Fur调节的铁感应系统和硫代谢，诱导胞内氧化还原崩溃。该策略为克服耐药菌感染提供了一种化学配位与代谢干扰结合的新方案。 耐药菌感染, 生物膜 | 铁稳态, 硫代谢, 氧化还原崩溃 | 光动力疗法, 多组学分析 Guo Zhao · … · Ge Min · · 2026/02/09 该研究由生物医学工程香港城市大学Ge Min团队完成 Biomaterials 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.biomaterials.2026.124056 7. Spatiotemporal interplay between epithelial and mesenchymal cells drives human dentinogenesis. 单细胞与空间转录组图谱揭示人类牙本质发育机制。牙本质缺陷常见且难以修复，其发育过程中上皮-间充质相互作用的机制尚不完全清楚。研究构建了人类牙齿发育时空图谱，发现DE通过WNT-NOTCH通路引导DP分化，并验证了DLX6-AS1+细胞的修复潜力。该研究为牙齿再生和牙本质缺陷修复奠定了重要的理论和细胞基础。 牙本质发育, 牙本质缺陷 | WNT-NOTCH通路, DLX6-AS1 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学 Wei Wei · … · Zhang Ran · · 2026/02/14 该研究由口腔医学首都医科大学张冉团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69545-3 8. Transcriptomic and metabolomic insights into gabapentin's therapeutic role in neurogenic inflammation of rosacea. 加巴喷丁缓解玫瑰痤疮神经源性炎症的机制研究。神经源性炎症在玫瑰痤疮发病中起重要作用，但加巴喷丁的治疗机制尚不明确。研究通过转录组和代谢组分析发现，加巴喷丁通过调节NF-κB通路减轻皮肤炎症和潮红。该研究阐明了加巴喷丁的新型作用机制，为其在玫瑰痤疮临床应用提供了理论依据。 玫瑰痤疮, 神经源性炎症 | NF-κB通路, 加巴喷丁 | 转录组学, 代谢组学 Jiang Ziqi · … · Wei Bin · · 2026/02/14 该研究由皮肤病学重庆医科大学魏斌团队完成 Communications biology 原文链接：https://doi.org/10.1038/s42003-026-09662-3 9. Kinic index: an artificial intelligence-driven predictive model and multitarget drug discovery framework for hepatocellular carcinoma patients. AI驱动的肝细胞癌异烟酰化指数预测模型。肝癌的高度异质性使得预后预测和药物开发面临巨大挑战。研究建立了KinicI模型，识别出与不良预后相关的CYP2C9和G6PD，并筛选出潜在药物。该平台为肝癌的分子分层和多靶点药物发现提供了精准医疗基础。 肝细胞癌, 预后预测 | 异烟酰化, CYP2C9, G6PD | 人工智能, 多组学整合 Zhou Jinglin · … · Zhang Hongquan · · 2026/02/14 该研究由肿瘤与细胞生物学北京大学张宏权团队完成 NPJ precision oncology 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41698-026-01324-1 10. NK Cell Activation by Platinum Boosts Immunotherapy in HR+/HER2- Breast Cancer. 铂类药物激活NK细胞增强HR+/HER2-乳腺癌免疫治疗疗效。免疫治疗在HR+乳腺癌中效果有限，亟需寻找增效策略。研究通过多组学分析发现活化NK细胞的丰度与抗PD-L1疗效正相关，且铂类药物能通过NF-κB通路增强NK细胞毒性。该研究揭示了铂类药物与免疫治疗的协同机制，为乳腺癌联合治疗提供了临床依据。 HR+/HER2-乳腺癌 | NK细胞激活, NF-κB通路 | 单细胞RNA测序, 多组学整合 Chen Yi-Yu · … · Shao Zhi-Ming · · 2026/02/15 该研究由乳腺外科学复旦大学附属肿瘤医院Shao Zhi-Ming团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) 原文链接：https://doi.org/10.1002/advs.202518978 11. Pan-3D Genome Analysis Reveals the Roles of Structural Variation in Chicken Chromatin Architectures, Domestication and Production Traits. 鸡泛三维基因组分析揭示结构变异对驯化与生产性状的影响。结构变异（SV）如何通过重塑染色质三维结构影响鸡的性状尚不明确。研究整合了15个新组装的染色体水平基因组及Hi-C等多组学数据，构建了首个鸡泛三维基因组资源。研究识别了影响季节性繁殖和胴体性能的关键SV，为家禽功能基因组研究与育种实践提供了重要参考。 鸡的驯化与生产性状 | 染色质三维结构, 结构变异(SV) | 泛基因组组装, Hi-C测序 Zhou Zhen · … · Nie Qinghua · · 2026/02/15 该研究由动物遗传育种华南农业大学Nie Qinghua团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) 原文链接：https://doi.org/10.1002/advs.202520068 12. UBE2T-Driven p53 Degradation Rewires Glycolysis to Orchestrate Lactylation-Mediated CAFs Activation and ECM Deposition in Pancreatic Cancer. UBE2T调控乳酸化促进胰腺癌间质沉积。胰腺导管腺癌中糖代谢产生的乳酸如何调节成纤维细胞激活并影响微环境尚不明确。研究发现UBE2T通过降解p53增强糖代谢，产生的乳酸诱导成纤维细胞H3K18乳酸化，进而促进细胞外基质沉积并抑制免疫疗效。靶向UBE2T联合免疫治疗为改善胰腺癌预后提供了新策略。 胰腺导管腺癌 | UBE2T-p53轴, 组蛋白乳酸化, 糖酵解 | 多组学分析, 基因敲除模型 Ma Yong · … · Jiao Zuoyi · · 2026/02/15 该研究由普通外科学兰州大学第二医院焦作义团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) 原文链接：https://doi.org/10.1002/advs.202514933 13. DSG2+ Cancer Stem Cells Co-Located With FAP+ Myofibroblasts in the Tumor Boundary That Determines the Efficacy of Immunotherapy in Non-Small Cell Lung Cancer. DSG2阳性癌干细胞生态位影响肺癌免疫疗效。非小细胞肺癌中癌干细胞的转录程序及其空间组织特征尚未得到充分阐明。研究通过整合单细胞与空间转录组学，发现DSG2+癌干细胞富集于肿瘤边缘，并与FAP+成纤维细胞共定位形成耐药生态位。该发现揭示了影响肺癌治疗反应的空间组织机制，为克服耐药提供了新靶点。 非小细胞肺癌 | DSG2, 癌干细胞, 肿瘤微环境 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Fan Guangyu · … · Shi Yuankai · · 2026/02/15 该研究由肿瘤内科学中国医学科学院肿瘤医院石远凯团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) 原文链接：https://doi.org/10.1002/advs.202514543 生物信息软件 1. Artifact-suppressed 3D retinal microvascular segmentation via multi-scale topology regulation. 伪影抑制的3D视网膜微血管分割技术。准确的视网膜血管分割对糖尿病视网膜病变诊断至关重要，但受伪影和标注数据匮乏限制。研究提出多视图拓扑感知网络MT-Net，通过维度转换和伪影抑制模块提升分割精度。该技术为视网膜OCTA影像分析提供了高效的自动化工具。 糖尿病视网膜病变, 血管分割 | 拓扑一致性, 伪影抑制 | 深度学习, OCTA, 3D图像处理 Luo Ting · … · Zhang Dan · · 2026/02/10 该研究由计算机科学宁波工程学院Zhang Dan团队完成 Medical image analysis 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.media.2026.103988 2. A unified survey on drug-target interaction and binding affinity prediction: Models, representations, and challenges. 药物-靶点相互作用与亲和力预测综述。准确预测药物与靶点的相互作用是现代药物研发的关键步骤，计算方法已成为不可或缺的工具。本文系统回顾了从特征驱动到大规模预训练模型的演进路径，并探讨了冷启动等实验挑战。该综述为药物发现领域的计算模型开发提供了全面的技术指引。 药物发现, 靶点识别 | 药物-靶点相互作用 (DTI), 结合亲和力 | 深度学习, 预训练模型, 网络分析 Wang Yike · … · Zhang Zilong · Biotechnology advances · 2026/02/12 ⭐ 该研究由计算机科学海南大学Zhang Zilong团队完成 原文链接：https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2026.108843 3. CycloPepper: a machine learning platform for predicting cyclization outcomes and optimizing synthesis of therapeutic cyclopeptides. CycloPepper平台利用机器学习优化治疗性环肽的合成。环肽因其高稳定性和结合力成为重要药物候选，但其合成中的环化位点选择极具挑战。研究开发了自动化合成平台CycloBot并构建了包含306个环肽的数据集，训练出准确率达84%的预测模型。CycloPepper为加速环肽药物研发提供了高效的计算工具和实验指导。 环肽药物研发 | 环化位点预测 | 机器学习, 自动化合成 Pan Yourong · … · Li Chengxi · · 2026/02/14 该研究由生物工程浙江大学李承熙团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69441-w 4. Multi-to-uni modal knowledge transfer pre-training for molecular representation learning. 分子表示学习的多模态知识迁移预训练框架。现有方法常要求分子数据模态完整，难以适应仅有2D拓扑图的现实场景。研究提出M2UMol框架，通过知识迁移使2D编码器能模拟多模态信息，显著提升下游任务精度。该工具包的开发将便利药物发现过程，促进相关领域的分子研究。 药物发现 | 分子表示学习 | 深度学习, 预训练模型 Xiong Zhankun · … · Zhang Wen · · 2026/02/14 该研究由生物信息学华中农业大学张文团队完成 Nature communications 原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-69302-6 5. Modeling nascent transcription from chromatin landscape and structure with CLASTER. 深度学习模型CLASTER实现染色质结构到新生转录的预测。理解表观遗传特征如何驱动新生转录是基因调控研究的核心挑战。研究开发了基于表观遗传数据的深度神经网络CLASTER，能够整合染色质景观与三维结构信息并精准预测千碱基分辨率的转录水平。该模型为探索基因组组织规律及预测表观遗传扰动影响提供了强力工具。 基因表达调控 | 染色质三维结构, 表观遗传驱动 | 深度学习, CLASTER模型 Pielies Avellí Marc · … · Rasmussen Simon · · 2026/02/14 该研究由计算生物学哥本哈根大学Rasmussen Simon团队完成 Genome biology 原文链接：https://doi.org/10.1186/s13059-026-03992-5 6. Predicting disease-specific histone modifications and functional effects of non-coding variants by leveraging DNA language models. DNA语言模型精准预测阿尔茨海默病特异性组蛋白修饰。组蛋白修饰失调与神经退行性疾病密切相关，但现有计算方法缺乏对疾病特异性特征的识别。研究开发了基于大语言模型和混合专家架构的深度学习框架，利用多样本表观组数据学习AD相关的分子特征。该模型不仅提升了修饰位点的预测精度，还为揭示非编码变异的功能影响提供了新范式。 阿尔茨海默病 | 组蛋白修饰, 非编码变异 | 大语言模型, 混合专家架构(MoE) Wang Xiaoyu · … · Song Jiangning · · 2026/02/14 该研究由生物化学莫纳什大学Song Jiangning团队完成 Genome biology 原文链接：https://doi.org/10.1186/s13059-026-04003-3 7. SiCmiR Atlas: Single-Cell miRNA Landscape Reveals Hub-miRNA and Network Signatures in Human Cancers. SiCmiR Atlas揭示人类癌症单细胞miRNA图谱与网络特征。由于技术限制，单细胞水平的miRNA表达分析一直难以实现。研究开发了神经网络SiCmiR，可从常规单细胞转录组数据预测miRNA表达，并构建了包含936万个细胞的SiCmiR-Atlas数据库。该资源为识别细胞类型特异性miRNA标志物及调控网络提供了强力支持，推动了单细胞非编码RNA研究。 肿瘤异质性 | miRNA调控网络 | 深度学习, 单细胞miRNA预测 Cai Xiao-Xuan · … · Huang Hsien-Da · · 2026/02/15 该研究由计算生物学香港中文大学（深圳）Huang Hsien-Da团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) 原文链接：https://doi.org/10.1002/advs.202514446 声明：本文使用了AI进行翻译和总结