Jmdna

在这个高度不确定的时代里，他坚定地选择运用长期主义，去对抗短期的噪音。在基因检测行业剧烈波动、洗牌不断的当下，解码生物创始人潘加奎显得格外冷静。撰文丨魏欣然43岁，连续创业者，生命科学产业的长期参与者。他不太擅长站在台上“打鸡血”，却习惯用复盘、记录和微小但持续的进步，推动一家企业的持续发展。2025年年底，“药创新”与潘加奎完成了一次深度对话。在这次访谈中，潘加奎反复提到了两个词——时间与积累。在他看来，无论是个人成长、企业经营，抑或生命科学本身，真正的价值都需要在时间中得到验证。解码生物创始人 潘加奎一次“换专业”，决定了人生方向如果为过去20年画一条时间轴，潘加奎认为，最重要的转折发生在本科毕业前。2000年，潘加奎开启了自己在中国矿业大学的本科生涯，彼时，他原本学习的是矿物加工工程专业。然而，在大四那年，他被一句“21世纪是生命科学世纪”所感召，决定跨专业考研，成功考入上海交通大学的生物化学与分子生物学专业学习。这次看似非理性的跨界，后来成为一切故事的起点。在潘加奎看来，生命科学最大的魅力在于其充满未知。“哪怕二十多年过去了，我们对于生命的理解仍然非常有限。”对于他而言，无论是科学研究还是产业化应用，这种“尚未被完全定义”的状态，都意味着广阔且长远的发展空间。潘加奎的创业生涯同样起步得非常早。硕士毕业工作两年多后，他便走上了创业之路，成为了布局生命科学领域的先行者。然而，创业初期对于管理的不熟悉、对于风险的低估，也让他的公司“摔了很多跟头”。2018年，公司一度陷入现金流危机，账上资金甚至不足以支付员工下个月的工资。而正是在那一年的公司年会上，潘加奎公开进行了复盘与自我批判，并确立了“企业成功=战略×组织能力”的发展基调。这一认知，也成为了解码生物此后发展的重要原点。在“浪潮”中顺势而为：国产替代与一次关键决策解码生物真正完成跃迁，始于一次对“时代浪潮”的精准判断。2020年，解码生物成为了华东地区首个引进国产高通量测序平台的企业。彼时，许多同行们都并不理解这一选择，毕竟国产平台还没有被充分验证，而且更不可思议的是，解码生物之前从来没有运营过任何测序平台。尽管如此，潘加奎坚信，在生命科学领域，国产替代的浪潮已然来临，国产测序走到国际舞台的聚光灯下只是时间问题，因此应当提早布局。在首台国产高通量测序仪的签约仪式上，潘加奎在业内首次提出“第四方检测”的创新模式，致力于为中小医学实验室和科研服务公司，提供“多、快、好、省、稳”的检测服务，赋能整个生命科学的研究及产业化应用。解码生物实验室内景“一个公司的战略，必须顺势而为，而且最好能够走在前面一点。”潘加奎介绍，从一台设备、一个平台开始，解码生物逐步构建起了超大规模测序能力，日产能高达220T，已成为全球最大的测序中心之一。但规模的扩大并非终点。随着上游竞争加剧、行业环境变化，解码生物也在不断调整自身定位：从单一的第四方检测设想，扩展为了如今的纯测序、科研服务、医学检验三大板块并驾齐驱。其中，空间组学成为了解码生物近年来重点投入的科研服务方向之一。在潘加奎看来，过去的转录组检测，更像是把一整块组织“打碎后一起测”，只能看到整体的平均结果。而空间转录组则是在此基础上，进一步把“细胞所在的位置”也纳入分析，让研究人员知道：哪些细胞在什么位置、它们彼此之间如何相互影响。这对于理解肿瘤微环境、不同细胞之间的组织异质性，以及疾病如何发生和演变，都提供了更加直观也更加接近真实情况的视角。“科学研究，离不开好的工具。很多重要发现，往往是先有了工具，成果才慢慢浮现出来。”谈及在空间组学领域的战略布局，潘加奎这样说道。伴随生命科学技术向时空组学方向加速演进，解码生物顺势布局Bruker、华大智造、10xGenomics、Akoya等前沿技术平台，构建起行业领先的时空组学技术矩阵，成为业内时空组学平台最丰富的公司之一。其中值得一提的是，解码生物已经获得布鲁克（Bruker）空间生物学DSP与SMI两项“卓越中心”认证。解码以肿瘤伴随诊断为核心的临床业务布局，与科研服务深度协同。科研服务深耕的空间组学等前沿技术，积累的实验数据与方法学经验，为肿瘤伴随诊断的技术升级、靶点筛选及精准检测提供核心支撑；医学检验从临床一线沉淀的真实世界数据，又为科研服务指明临床导向的研究方向，加速技术落地转化。二者联动为临床医生提供“科研探索—精准诊断”一体化支持，助力肿瘤个性化治疗；同时为药企打通靶点验证、临床试验到疗效监测全链路服务，高效赋能肿瘤领域临床诊疗与创新药研发。从创业实践到系统学习：阅读，成为一条自我进阶之路“我其实不是从一开始就很爱读书的，甚至在阅读方面还有一点点障碍，阅读速度比较慢。”谈起自己长久坚持的阅读习惯，潘加奎坦言。2007年，潘加奎从上海交通大学硕士毕业，并于2010年开始了人生中的第一次创业，彼时的他还没有形成大量阅读的习惯。创业过程中走过的一些弯路让他意识到：仅凭自身经验试错，成本实在太高了。“很多时候，我们的‘顿悟’，只是前人的常识。”真正开始系统性的阅读，始于创业之后的自我补课。潘加奎把自己的系统性阅读分成了三个层次：最底层是历史与人文，中间层是经营管理，而位于顶层的则是生命科技本身。在历史与人文领域，潘加奎花两年的时间阅读了柏杨版《资治通鉴》，一共736万字，72册，至今他已读完超过75%。在他看来，历史并不提供现成的答案，却不断提醒人性中的骄傲、偏执与短视所带来的代价。“不管你从事哪个领域、哪个专业，都有必要了解这方面的历史人文常识。”对于管理类书籍的阅读，则更多是为了解决现实的问题。在阅读这类书籍时，潘加奎更看重“能不能用”。如今，他会带着整个管理团队去学习一些管理学知识，积少成多，日积月累，“真到用的时候，这些知识至少能成为一条线索”。至于生命科学专业本身，对于潘加奎来说则是必须持续追踪的前沿领域。“一个细胞里的奥秘是无穷无尽的，哪怕今天，人们对于生命科学的研究依然处于一个比较早期的状态。”而这份对未知的敬畏，以及对专业前沿领域的持续探索，也构成了他对生命科学行业长期信心的底层逻辑。写给未来的信：坚信长期主义的力量2019年，潘加奎在参加了创业营，其中有个环节是给5年后的自己写一封信。2024年，当这封信被寄回时，他发现，信中关于公司与个人成长的期许，竟然大体实现了。“念念不忘，必有回响。”他并不把这视为玄学，而是一种长期目标在潜意识中持续引导行动的结果。解码生物创始人 潘加奎这种长期主义，体现在潘加奎工作与生活的方方面面：每天坚持写日记、带领公司员工撰写日报、持续复盘；连续跑步500多天，把对3—5公里的坚持，变成一场横跨数十年的长远计划；在企业文化中反复强调“创造价值”“长期主义”和“自我批判”……“人很容易高估短期的发展，而对长期的发展却过于悲观，其实应该倒过来，短期要悲观，长期要乐观。”在潘加奎看来，真正重要的不是一时的速度，而是长远的方向是否正确、是否能够持续。而这也是他2025年重新开始撰写个人公众号的原因。记录、思考、总结，对于他而言既是自我修炼，也是价值的延伸。“哪怕我的文章只影响了一个人，也是有意义的。”访谈的最后，潘加奎谈到了自己对于行业未来趋势的预测：基因测序将越来越普及，科研工具也会持续进化，AI必将深度改变生命科学的研究及产业化，分子检测也正从严肃医疗走向健康管理与消费医疗。但无论行业如何变化，他反复强调的，仍然是同一句话——时间会放大一切真正有价值的事情。在这个高度不确定的时代里，他坚定地选择运用长期主义，去对抗短期的噪音。欢迎加入解码生物返回搜狐，查看更多

表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor，EGFR)基因突变是非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer，NSCLC)致癌驱动因素之一,三代表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitor，EGFR-TKIs)已成为该基因突变患者标准治疗选择，但耐药是其主要临床挑战。 耐 药 后 评 估 共识Ⅰ：对三代EGFR-TKI耐药患者进行评估时,推荐对已知或高危部位进行影像学检查以评估疾病进展;血清学肿瘤标志物可用于预测疾病进展，其中SCCA与CYFRA21-1有助于评估是否发生鳞状细胞癌转化，NSE和ProGRP辅助评估是否发生SCLC转化；动态监测cDNA或CTC可辅助评估疗效及预测疾病进展(共识级别2B)。 耐 药 机 制 共识Ⅱ：原发性耐药主要与治疗前已存在对TKI不敏感的EGFR其他位点突变或其他信号通路激活等机制有关。推荐用NGS鉴定基因突变，判断肿瘤潜在耐药分子机制(共识级别:1A)。 共识Ⅲ：获得性耐药在三代EGFR-TKI一线和二线治疗后均可发生，两者耐药机制存在差异，主要包括EGFR依赖性、非EGFR依赖性、组织学转化、细胞周期相关变异及未知耐药机制。C797X突变是常见EGFR依赖性耐药机制，MET扩增是常见非EGFR依赖性耐药机制。三代EGFR-TKI联合治疗的获得性耐药机制与TKI单药治疗大致相同,耐药突变发生率因联合方案不同而有所差异(共识级别:1A)。 耐 药 后 检 测 对于经三代EGFR-TKI治疗耐药患者，广谱分子检测有助于明确耐药机制，为后续治疗提供指导。推荐采用单种或多种方法联合进行广谱分子检测，检测范围包括但不限于EGFR突变、MET扩增及蛋白过表达、HER2突变及扩增、RET重排、ALK重排、NTRK1/2/3基因融合、ROS1重排、BRAF突变、KRAS突变和PIK3CA突变等。 共识Ⅳ：对于三代EGFR-TKI治疗耐药患者，推荐采用单种或多种方法联合进行广谱分子检测以明确耐药机制；首选组织样本检测，如组织不可及，可采用外周血ctDNA或其他体液样本补充。除分子检测外，建议同步行组织活检以排除SCLC等组织学转化。耐药后检测应在疾病进展后1个月内完成，对于快速进展（症状恶化）患者可缩短至2周内，避免延迟精准治疗（共识级别:2A）。 耐药后进展模式和治疗策略 针对三代EGFR-TKIs耐药机制的探索日益清晰，可供选择的耐药后治疗方案日益增多。对于原发性耐药，现阶段尚缺乏充分的循证医学证据，临床实践中通常在原EGFR-TKI基础上尝试联合化疗或抗血管生成治疗；对于获得性耐药可根据患者疾病进展模式及特定耐药机制选择相应治疗方案。 共识Ⅴ：对于经三代EGFR-TKIs治疗耐药后出现寡进展患者，推荐在继续原EGFR-TKIs治疗的基础上联合局部治疗，如手术、放疗、介人治疗或消融治疗(共识级别:2A)。 共识Ⅵ：对于经三代EGFR-TKIs治疗耐药后出现颅内进展患者，推荐在继续原EGFR-TKI治疗基础上，根据肿瘤位置、大小和患者身体状况等进行综合评估后,联合手术和/或放射治疗:对于进展累及脑膜患者，可考虑将三代EGFR-TKI加量、更换其他三代EGFR-TKI并加量或联合抗血管生成药物治疗。推荐对累及脑膜进展患者进行脑脊液NCS检测，以寻找潜在治疗靶点(共识级别:1A)。 共识Ⅶ：针对三代EGFR-TKIs治疗后出现EGFR其他位点突变或HER2异常的患者，目前尚缺乏大样本数据支持确切疗效的治疗方案。可根据突变类型选择参加相应靶点药物的临床研究，或参照耐药机制不明处理原则，给予联合用药策略(见共识9)(共识级别:2B)。 共识Ⅷ：三代TKI耐药后出现MET扩增和/或过表达者，建议在原方案基础上联合MET抑制剂或更换为EGFR-MET双抗治疗(共识级别:1A)。 共识Ⅸ：对于经三代EGFR-TKIs治疗耐药后出现广泛进展且耐药机制不明患者，可选择在EGFR-TKIs基础上联合化疗或抗血管生成药物治疗、免疫联合化疗及抗血管生成治疗、双抗联合治疗、组合抗体联合治疗以及ADC治疗等;对于某些符合条件患者，可鼓励参加临床试验。目前已获批的方案包括信迪利单抗联合化疗及贝伐珠单抗、依沃西单抗联合化疗、芦康沙妥珠单抗(共识级别:1A)。 耐 药 治 疗 后 随 访 管 理 共识Ⅹ：三代EGFR-TKIs治疗耐药后进展晚期NSCLC患者,经积极治疗后无症状或症状稳定，应定期(每8~12周)接受血清学肿瘤标志物检测及胸腹部增强CT等检查；伴脑或骨转移者需复查脑MRI和/或全身骨扫描。对于再次获得完全缓解的患者，进行ctDNA、CTC动态监测有助于评估预后和制定后续治疗策略(共识级别:2A)。 AI在三代EGFR-TKI耐药管理中的应用 共识Ⅺ：AI在评估三代EGFR-TKIs耐药风险、疗效预测、探索耐药机制以及辅助耐药后治疗决策等方面具有应用潜力。AI模型多基于回顾性数据构建，外部验证不足，暂不能替代临床医师决策，建议作为辅助工具用于风险分层及方案推荐。进一步探索AI在三代EGFR-TKIs耐药评估、耐药机制探索及辅助治疗决策中的价值(共识级别:2B)。 关 于 我 们 14年行业深耕铸就品牌力量  中国规模最大的测序服务中心之一 解码(上海)生物医药科技有限公司成立于2011年，公司总部位于上海国际医学园区。旗下的上海解码医学检验所有限公司实验室及办公面积逾6000m2，深耕生命科学领域十余年，并已建成超大规模测序服务中心，日均测序产能近200T，业务以江浙沪为中心，服务范围辐射全国。 汇聚全球顶尖主流分子检测平台 解码生物与华大智造、lllumina、PacBio、Agena等顶尖的跨国企业建立了战略合作伙伴关系。现拥有DNBSEQ-T20x2一台，DNBSEQ-T7 14台，NovaSeqXPlus 2台，PacBio Revio system1台，MaSSARRAY飞行时间质谱2台，荧光定量PCR仪 300余台。 资质齐全，质量保障 CAP认证实验室，拥有二级生物安全实验室资质，连续8年累积满分通过国家卫生健康委临床检验中心（NCCL）及上海市临床检验中心（SCCL）发布的室间质评300余次。 全程服务 合作共赢 提供全面的售前咨询和售后服务，以合作伙伴为中心的共同成长的全方位服务体系。 供 稿 人 丨小肥棍 编辑排版丨小肥龙

2025年5月，华中科技大学同济医学院附属协和医院的蔡开琳教授团队（邓胜和博士、王军博士、邹发龙硕士和程登龙硕士为共同第一作者，曹英豪博士和蔡开琳教授为通讯作者）在国际顶级期刊 Cancer Research 上发表题为Palmitic Acid Accumulation Activates Fibroblasts and Promotes Matrix Stiffness in Colorectal Cancer重磅成果。这篇研究揭示棕榈酸（PA）在肠癌中的堆积激活了肿瘤细胞的NF-κB通路，诱导相关细胞因子CSF1/TGFβ1/CXCL8分泌，促使正常成纤维细胞转化为基质型癌相关成纤维细胞（mCAFs），进而导致细胞外基质硬化并推动肠癌梗阻的发生。 研究还发现天然化合物香草酮可抑制该过程，为梗阻性肠癌提供了潜在治疗策略。 值得关注的是，本研究中至关重要的空间转录组GeoMx DSP和mIF检测分析工作，由深圳解码时空组学团队独立完成，其精准、高效的技术支持为研究结论的验证与机制解析提供了坚实的数据保障。 研 究 背 景 结直肠癌已成为全球第三大常见癌症，而其中约33% 的患者会遭遇梗阻、穿孔等紧急情况，这类梗阻性结直肠癌（OCRC）的死亡率最高可达 30%，预后更是远差于普通结直肠癌。 一直以来，临床医生们都困惑：为什么同样是结直肠癌，有些患者会出现致命梗阻，有些却不会？本文主要通过DSP + mIF 精准锁定mCAFs老巢。 DSP 和 mIF 两种技术简介 DSP 数字空间分析：相当于给肿瘤组织装了 “精准定位 + 全景扫描” 功能。它能在保留组织形态的前提下，精准锁定我们关注的细胞（比如癌细胞、纤维细胞），还能量化分析这些细胞里的基因/蛋白表达，就像在肿瘤 “地图” 上精准标记出每个 “嫌疑细胞” 的活动轨迹。  mIF 多重免疫荧光染色：好比给细胞装了 “彩色身份证”。传统染色只能看一种细胞标志物，而 mIF 能同时给多种标志物染上不同颜色，让我们清晰看到不同类型细胞的分布、互动，比如谁在促进肿瘤生长，谁在 “搞破坏” 导致梗阻。 研究队列和方法 本研究纳入了1470例结直肠癌患者的组织样本，其中198 例 OCRC 患者和 1272 例普通结直肠癌患者。 本研究整合了数字空间图谱GeoMx DSP、多重免疫荧光、拉曼光谱、原子力显微镜、非靶向代谢组学、组织病理与成像技术与RNA测序等多维技术检测。 研 究 结 果 1.临床样本表型筛选 —— 发现 OCRC 与 CRC 的核心差异。 肿瘤组织（尤其是 OCRC）存在显著的 ECM 重塑表型，核心特征为胶原纤维含量富集、结构排列紊乱、力学硬度升高（如图1）。 图1，OCRC与结直肠癌在细胞外基质（ECM）组成、生物力学特性及胶原特征方面存在显著差异 2.精准技术深挖机制：定位关键细胞与分子，DSP+mIF精准锁定 OCRC 特异性mCAFs 是梗阻的 “幕后黑手”（如图2）。 DSP技术精准锁定 OCRC 特异性mCAFs 形态学marker：α-SMA、PanCK和Syto13； 圈选 OCRC (ROI=10个)、CRC (ROI=8个)、正常组织 (ROI=6个)。 DSP技术的核心结果：在OCRC组织的αSMA阳性CAF区域中，编码胶原、基质金属蛋白酶、LOX以及mCAF特异性标志物（如FN1, LUM, POSTN） 的基因显著上调。而其他CAF亚型（如炎性CAF（CXCL12、CCL2和 LIF）、血管CAF（NOTCH3和MCAM）、抗原呈递CAF（HLA-DRA, HLADRB1和CD74））的标志物则没有变化。并且结直肠癌组织与正常组织之间，这些癌相关成纤维细胞（CAF）标志物的表达未观察到显著差异。另外富集分析显示，OCRC组织中癌相关成纤维细胞（CAFs）的上调基因主要参与细胞外基质 - 受体相互作用及细胞外结构组织过程。有趣的是，结直肠癌（CRC）组织中，αSMA 阳性癌相关成纤维细胞显著富集于参与糖胺聚糖（GAGs）降解与分解代谢的基因，提示其与 OCRC 组织中的癌相关成纤维细胞存在功能分化。同时进行了RNA测序验证，结果证实OCRC 组织中显著高表达mCAF的标记基因COL1A1、COL3A1、MMPs和LOX，而炎性CAF、血管CAF和抗原呈递CAF无显著变化（如图2A、B、C）。 mIF验证 标志物：αSMA（红色，CAFs 通用标志物）、FN1（纤连蛋白，绿色，mCAF 特异性标志物）、POSTN（骨膜蛋白，紫色，mCAF 特异性标志物）和DAPI（蓝色，细胞核染色，用于细胞计数）。 检测结果：OCRC 组织中，αSMA（CAFs 标志物）与 FN1/POSTN（mCAF 标志物）的共定位细胞（即 mCAF）数量显著高于 CRC 组织。OCRC 中 mCAF 主要聚集在肿瘤间质区域，且围绕胶原纤维分布，与 AFM 检测到的 “ECM 硬化区域” 高度重合，直接印证 mCAF 与 ECM 重塑的空间关联。 图2，基质区基因表达模式和CAF共定位信息 3.PA如何与CAF起作用，从相关性到因果机制的验证，再到治疗靶点 OCRC患者比非梗阻CRC患者有更高的体重指数（BMI） 和更差的脂质代谢指标（高TG、高LDL-C等），这可能提示OCRC可能与全身性及肿瘤局部代谢异常有关。通过非靶向代谢组学分析得到棕榈酸（PA） 在OCRC组织中的相对含量显著升高。 尤其是在OCRC组织中，肿瘤内PA水平与CAF的数量呈显著正相关。通过体内外实验证明，PA的核心作用是先激活肿瘤细胞NF-κB通路，活化的肿瘤细胞大量分泌CSF1、TGFβ1、CXCL8去激活正常成纤维细胞(NF)转化为mCAF。 本研究通过细胞系和小鼠模型发现香草酮能有效抑制NF-κB通路，阻断上述链条，减轻ECM硬化并抑制肿瘤生长，为治疗提供了潜在策略。 这项研究不仅为 OCRC 患者带来了新的治疗方向，更让我们看到：精准医疗技术能让我们更深入地理解癌症，从 “对症治疗” 走向 “对因治疗”。 当然，研究团队也提到，目前还需要更多临床数据验证，但这无疑是结直肠癌治疗领域的重要突破。希望未来能有更多这样的科研成果落地，让更多癌症患者远离痛苦，拥抱希望！ 关于解码时空 解开生命密码，守护人类健康 解码时空是解码（上海）生物医药科技有限公司（简称：解码生物）旗下专注于时空组学技术服务的核心品牌，依托解码生物在多组学领域的深厚积累，聚焦于空间位置与时间维度整合的生命科学研究，为科研机构、药企及临床提供从样本处理到数据分析的全链条解决方案。 解码时空的技术体系与应用场景深度融合布鲁克空间生物学、华大智造、10x Genomics等战略合作伙伴的前沿平台，成为国内时空组学服务的标杆。 供 稿 人 丨邱萍   编辑排版丨赵陈龙   审 核 人 丨徐晓玲，王佳茜