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本文目录
一、JAMA观点 | 人工智能在临床研究中的应用
二、人工智能应用于临床试验的8个考虑要素
三、变革性影响 | 人工智能在临床研究中的创新作用
四、“AI+CRO”下个超级风口?人工智能如何助力临床研究。计算机“摩尔定律”向左,药物开发“反摩尔定律”向右,如何破局?
五、人工智能与临床试验的结合——从数据到治疗的革命
一、JAMA观点 | 人工智能在临床研究中的应用。
(leila 精医光瀚)
本期文章和大家分享一篇发表在JAMA(《美国医学会杂志》)上的评论文章《AI在临床中的应用》(Translating AI for the Clinician),探讨了医学AI技术开发的框架,并概述了该技术在现代医疗中的目的和潜在用途。
迄今为止,机器学习(machine learning,ML)和人工智能(artificial intelligence,AI)在医学领域稳步发展,有望改善患者的治疗效果、优化临床实践,并可能降低医疗费用。
随着传统AI(如机器学习、计算机视觉技术和自然语言处理)向以生成式预训练转换器(generative pre-trained transformers,GPT)为基础的生成式AI的扩展,带来了大量开发和向医生和患者普及的空间。
然而,为了最大限度发挥这些工具的积极影响,需要制定一个框架,帮助医生和患者在临床实践的背景下理解AI,包括AI在临床实践中的用途、安全性和监测证据。我们认为,AI开发和测试的临床框架将加速AI工具在医学中的发展和应用,该框架将证据生成与适用场景、获益和风险联系起来,并使临床医生能够在实践指南背景下快速理解AI。
为充分发挥其潜力,当前医疗AI技术的开发需要重点关注将AI技术与具体的临床“适应症”(clinical indications)和可能的临床应用方式(clinical use case)对齐,以最大限度地发挥影响。我们认为,这一步是对目前开发途径的概念性变革。
现有的开发路径侧重于使用先进计算技术和现有医疗数据源,尤其强调多样、数量和广度,虽然这对形成AI算法和模型很必要,但却不足以确保AI技术在临床中的成功应用。因此,我们必须首先明确哪些具体问题或场景能获益于AI的应用。
图中的A部分列举了临床医生在诊疗患者时的10个常见临床问题,包括与患者沟通、记录患者就诊情况、风险分层、诊断、解释检验检查结果、使用行为疗法、药物或手术治疗患者、监测、学习、参与研究和继续教育。这些将是AI在医疗保健领域发挥作用的关键“适应症”。
人工智能在临床实践中的整合、开发和指南建议
医疗人工智能技术的证据应该像所有临床实践指南一样进行评估和审查(图C)。如果人工智能技术像医学中的传统疗法一样进行测试,我们当前的标准通常会评估诸如正在治疗的特定疾病(即指示)、可用数据集所代表的患者群体、人工智能整合到临床实践的研究设计以及与现有护理相比的治疗效果等因素,以制定指南建议。I类建议(例如,用于冠状动脉血管成形术期间的人工智能算法,以减少对患者的辐射和对比剂暴露)将需要一个随机试验策略,有和没有算法的算法在足够广泛的接受冠状动脉干预的患者人群中展示好处。
通过这种方式,使用证据、成本效益、人因测试和总体健康结果都将是临床推荐使用证据审查的一部分(就像它们今天对药物疗法、生物制剂和设备一样)。
未来几十年的医疗保健创新无疑将依赖于日常医疗交付中产生的健康数据量。结合人工智能能力的快速增长所带来的技术突破,这些医疗保健创新才能真正彻底改变我们所知的医学实践。然而,如果不将人工智能技术开发的重点重新聚焦于与临床医生和患者理解的确保广泛采用和最大影响以改善人类健康所需的健康目标更紧密的对齐,这种潜力将无法实现。
参考文献:Patel MR, Balu S, Pencina MJ. Translating AI for the Clinician. JAMA. 2024;332(20):1701–1702.
二、人工智能应用于临床试验的8个考虑要素
(临床药理知识库 ,作者CP-Knowledge)
导语
不可否认新药研发是一个数据密集型的工作。虽然过去几年中人工智能(AI)取得了令人瞩目的进展,但研究者们仍然面临着海量数据的挑战。本文探讨了在临床试验中利用AI进行数据管理的宏观策略,同时避免潜在的陷阱。
1.理解临床试验数据的复杂性
ConcertAI首席执行官Jeff Elton表示:“临床试验数据的复杂性可能难以让领域以外的人理解”。
“可能会有60到70个不同的纳入和排除标准,这些标准可能包括实验室检查结果、过去的药物暴露史、药物反应,甚至包括类似“这名患者是否预计还能活六个月”的猜测性问题”——Elton解释到。
“临床试验是一个相当繁琐的过程,针对每个患者,研究人员可能都需要查看数十个屏幕、文件和应用程序,这需要很长时间”,Elton表示。
此外,临床试验数据的固有复杂性和多样性面临着进一步的挑战。例如,在肿瘤治疗领域,临床试验通常包含多方面的设计,包括复杂的组织取样和分子处理要求。
当面临这种复杂性时,医疗组织必须确保拥有具备经验的人员,维护有组织和标准化的数据记录流程。人工智能和机器学习工具的使用可以简化数据处理工作。
2.采用迭代方法利用AI进行临床试验数据管理
在最近举行的2023年美国临床肿瘤学会(ASCO)会议上,Concert AI分享了它如何成功地自动化了一项研究所需的55%的数据。同时,他们也承认可能很难实现100%的数据自动化。
该公司研发的DTS eScreening软件,是一种基于机器学习的工具,旨在根据根据临床试验入排标准对患者进行排名。该公司在一项多中心临床试验中评估了该工具,该试验涉及49项数字化标准和10156名患者。DTS eScreening采用了机器学习算法LightGBM来开发17个模型。这些模型根据各种标准预测患者参加临床试验的资格,包括ECOG评分(癌症研究中采用的标准衡量标准)。使用的其他指标包括癌症分期、实验室结果和生命体征,平均预测准确率超过99%。
AI的应用,如DTS电子筛选软件,有望引领临床试验未来发展的方向。“AI也许可以使得人们的生产力提高10倍,从长远来看,通常需要一整天的临床试验文书工作现在有望在一到两个小时内完成”。
1992年~2022年PubMed收录的临床试验中
提及人工智能的研究数量
3.AI中用于临床试验数据管理的多维方法
正如2019年NPJ Digital Medicine的一篇文章所指出的那样,药物临床研发阶段一直较为缓慢地接受新兴技术。但是现在,通过使用光学字符识别(OCR)和自然语言处理(NLP)等工具,显著提高效率已成为可能。这些技术可以从PDF及其它文档中提取文本,并可以快速处理大量文件。例如,OCR和NLP可系统地提取和组织诸如纳入和排除标准之类的数据。这种技术极大地加速了数据处理效率,使研究人员能够专注于更重要的任务。
Concert AI依赖于传统方法(例如随机森林)和深度领域知识(如大型语言模型)的组合。此外,跨科学的交叉碰撞非常关键,临床试验中AI工具的开发需要医学、药学、临床信息学、流行病学、编码人员等的共同参与。
专业团队应将AI模型的开发视为科学研究,旨在实现AI达到与人类相同的准确性和记忆力。这种方法与传统的AI开发流程形成鲜明对比,传统流程中80%的时间用于数据准备,只有20%的时间用于模型开发和验证。
4.越具针对性的AI工具,性能越优
Elton详细解释道:“目前AI系统仍处于早期阶段,尚未广泛涉足各个领域。我们正在利用其算法能力来处理具体、有限的领域,以确保最佳性能。当下的主要应用之一是让AI分析临床文件并重新编码诊断代码。然后,将这些代码与医疗记录中的实际诊断代码进行比较,将AI打造成医学信息编码专家。”
"仅仅三天时间,我们看到AI编码的准确性达到了惊人的高度,这是非常卓越的。更令人兴奋的是,我们可以为AI提供模板或表型,引导它寻找我们想要的特定模式和关联,并为其提供支持。"
临床概念提取和医学关联提取任务AI模型的F1 Score比较
在机器学习中,F1 Score是一种度量指标,结合了精确度和召回率,用于评估模型在二元分类任务上的准确性。
(引用自NPJ Digital Medicine 文章 “A large language model for electronic health records“)
5.开源和透明可以推动医药研究的进步
在科学研究中,特别是在AI领域,开源能够推动创新,加快进展。GatorTron AI模型和Google的DeepMind开发者通过共享训练代码,不仅增强了其工作的可靠性和可验证性,同时也为领域内的合作进步铺平了道路。
该研究作者在github上公布了训练代码。
6.监管和可解释的重要性
缺乏监督的问题是,最终会得到一个黑匣子AI系统。如果无法解释AI的决策,就不知道是否能够信任它。它可能会产生偏差甚至没有依据的联想,这可能会对医疗保健等领域造成不利影响。
7.在临床试验中采用AI进行数据管理时,确保问责制
采用AI进行临床试验数据管理时,以下几点需注意:
①将AI引导到特定问题上。
②在数据集成中限制其创造能力。
③审慎地管理其对不同数据集的访问。
美国政府问责局通过制定联邦政府的第一个框架意见来确保AI工具的问责制和负责任的使用。
8.应对AI滥用场景
本领域中存在AI误用的可能性,表现形式可能为各种各样。比如,AI可能会深度伪造出一些信息。这会给临床试验的真实性带来威胁。
应理性认识新技术发展过程中带来的潜在威胁,不能因噎废食放弃新技术的发展和应用。官方的倡导、网络安全专家的参与、相关政策的完善、执法机构的介入会有效减轻这些滥用,推动AI在医疗领域中的应用。
三、变革性影响 | 人工智能在临床研究中的创新作用。
(leila 精医光瀚)
通过数据分析、预测建模和患者招募,人工智能正在加强诊断、个性化治疗和临床试验,从而彻底改变医疗保健。
人工智能(AI)正在通过加强患者招募和简化药物开发来改变临床研究。在本文中,我们将通过先进的数据分析和预测建模,探讨人工智能对临床试验的变革性影响。
人工智能对医疗保健的影响包括增强诊断、个性化治疗和提高运营效率。但鲜为人知的是,机器学习在临床试验中的重要性与日俱增,它通过数据分析、预测建模和患者招募优化推动了临床试验的进展。
人工智能加快了药物发现的速度,提高了试验的准确性,并在加快治疗的同时降低了成本。例如,人工智能算法可以高效地分析大量数据,以确定潜在的候选药物,准确预测治疗结果,并优化临床试验设计,从而更快、更成功地进行试验。 此外,人工智能驱动的平台(如 DeepMind 的 AlphaFold)已证明有能力预测分子的三维结构,从而彻底改变药物设计和发现过程。
图 AlphaFold 等人工智能平台预测分子结构
人工智能在临床试验中的应用
人工智能正被应用于临床研究的各个领域,以提高效率、准确性和成果。
以下是人工智能在临床试验中产生重大影响的关键领域的详细介绍:
- 数据分析和模式识别。人工智能可以分析来自临床试验、电子健康记录和其他来源的大量数据,发现人类无法发现的模式和相关性。这能更精确地确定治疗效果和患者反应。
- 招募和留住患者。人工智能算法可简化临床试验的参与者选择,通过分析庞大的数据集,迅速准确地识别符合条件的患者。这样就能使参与者更符合试验标准,从而加快招募速度并提高保留率。
- 治疗效果预测分析。通过分析患者的历史和当前数据,预测算法可以准确预测治疗结果。这有助于设计高效的试验和定制治疗方案,从而提高疗效并最大限度地减少对患者的副作用。
- 自动化数据收集和管理。人工智能可以自动收集、组织和分析数据,最大限度地减少人为错误并提供实时见解。这可以简化流程,加快研究速度,推动新疗法的发展。
临床研究中的人工智能
面临的挑战
随着人工智能不断推动临床研究领域的变革,我们必须认识到其在带来希望的同时也存在着潜在的隐患。虽然人工智能具有提高效率、增强准确性、简化患者招募和降低成本等诱人优势,但其实施并非没有挑战。
以下是一些关键注意事项:
- 人工智能算法中的潜在偏差。人工智能系统是根据历史数据进行训练的,这些数据可能包含固有的偏差,如选择偏差、抽样偏差或测量偏差。例如,由于训练数据以男性为主,模型在女性患者身上的表现可能很差(选择偏差);在城市数据上训练时,模型不能很好地推广到农村患者身上(抽样偏差);或者由于数据收集中的系统误差(测量偏差),导致不准确性长期存在。
如果不加以控制,这些偏差可能会导致结果偏差,影响患者护理和研究结果。
- 数据隐私和安全问题。临床研究涉及大量敏感的患者数据,因此确保数据隐私和安全至关重要。人工智能系统很容易受到网络攻击和破坏,从而引发对患者信息保密性和完整性的担忧。
- 监管和道德挑战。人工智能技术的飞速发展往往超越了监管框架和伦理准则。有关在临床研究中适当使用人工智能的问题层出不穷,其中包括知情同意、透明度和问责制等问题。
- 对高质量数据的依赖。虽然人工智能依赖数据而发展,但其有效性取决于数据集的质量、多样性和范围。不充分、有偏见或不足的数据会影响人工智能见解的可靠性和有效性,阻碍临床研究的进展。
通过解决这些问题,利益相关者可以为人工智能在临床研究中的应用铺平道路,从而提高医疗保健成果。
人工智能在临床研究中的
重点和未来前景
由于多种因素,心脏病学、肿瘤学、神经病学和罕见病已成为临床研究中实施人工智能的重点领域。首先,这些领域通常涉及复杂的数据集,因此人工智能驱动的分析和预测时机已经成熟。
其次,这些领域的疾病(如心脏病、癌症、神经系统疾病和罕见病)具有高风险的性质,需要精确和个性化的诊断和治疗方法,而人工智能恰恰擅长提供这种诊断和治疗方法。
此外,人工智能技术的进步使研究人员能够针对这些医学专科所面临的独特挑战,开发出创新的解决方案。因此,人工智能已越来越多地融入到这些领域的临床研究中,为改善患者治疗效果和提高医疗服务效率铺平了道路。随着研究人员不断探索人工智能的能力,它在临床研究中的作用有望扩展到以前未知的领域,开创精准医疗和改善医疗效果的新时代。
四、“AI+CRO”下个超级风口?人工智能如何助力临床研究。计算机“摩尔定律”向左,药物开发“反摩尔定律”向右,如何破局?
(原创 Jo的随笔 Jo的随笔)
一款创新药,10亿美元、10年、不到8%成功率,一半都耗费在了临床研究,AI如何助力临床研究?
2024年3月在《Nature》杂志上刊登了一篇关于AI如何加速临床试验的文章,提及了多家人工智能(AI)科研机构和初创公司在助力临床试验优化方面取得的进展,非常值得细品。“AI+制药”到“AI+医疗”掀起了千层浪,但能实现产业化规模的,即将在一二级市场有所突破的下一个超级投资风口,会是“AI+CRO”吗?
计算机“摩尔定律”向左,药物开发“反摩尔定律”向右,如何破局?
几十年来,计算能力遵循摩尔定律(Moore’s Law),以可预测的速度前进。2012年,研究人员创造了“Eroom’s Law”(反向摩尔定律,Moore’s Law倒着拼写)这一术语来描述药物开发的对比路径,揭示了药物开发面临的困境,即新药研发的成本和时间随着时间的推移而呈现指数级增长的趋势。对药企来说,一款新药的面世可能历经“10亿美元的资金投入、10年的研发周期”。这里面,有一半的时间和金钱花在了临床试验上,这些试验规模越来越大、越来越复杂。
如下图所示,据统计,全球每100个启动一期临床的创新药里,到最后仅约7个药物能走到获批上市阶段,POS(Probability of Success,成功概率)仅7.87%。如果按照适应症划分,过去成功概率最高的是血液疾病(Hematology)23.94%、其次是代谢疾病(Metabolic)15.48%、感染类疾病(Infection disease)紧随其后13.20%;肿瘤疾病(Oncology)成功概率仅5.27%、心血管(Cardiovascular)则更低仅有4.75%。换句话说,即便排除万难进入临床一期阶段的药物,最终真正能够成功获批上市的几率,仅7.87%,更不用说在早期的靶点发现和验证阶段,淘汰率更是高得惊人。
一些研究人员希望计算机领域的摩尔定律(Moore’s Law)的成果,能够帮助遏制制药领域的Eroom’s Law(反摩尔定律)。人工智能 (AI) 已被用于在药物发现的早期阶段取得重大进展,协助寻找合适的疾病靶点和新分子设计。现在,科学家开始使用人工智能来管理临床试验,包括编写方案、招募患者、和分析数据的任务。
提高临床方案设计合理性
临床试验过程的第一步是临床方案设计。应该给予什么剂量的药物?给多少病人?应该收集哪些数据?University of Illinois(伊利诺伊大学)计算机科学家 Jimeng Sun 实验室开发了一种名为 HINT(分层交互网络)的算法,可以根据药物分子、目标疾病、和患者资格标准来预测试验是否会成功。他们随后开发了一个名为 SPOT(临床试验结果的顺序预测模型)的系统,该系统还考虑了训练数据中试验的发生时间,并对最近的试验进行了更大的权衡。根据预测的结果,制药公司可能会决定改变试验设计,或完全尝试不同的药物。
伊利诺伊州罗斯蒙特市(Rosemont, Illinois)一家名为“Intelligent Medical Objects”的公司开发了 SEETrials,这是一种促使 OpenAI 的大型语言模型 GPT-4,从临床试验摘要中提取安全性和有效性信息的方法。这使得试验设计者能够快速了解其他研究人员如何设计试验以及结果如何。加利福尼亚州斯坦福大学遗传学家 Michael Snyder 的实验室去年开发了一种名为 CliniDigest 的工具,该工具可同时汇总来自美国主要医学试验注册处 ClinicalTrials.gov 的数十条记录,并添加对统一摘要的引用。他们用它来总结临床研究人员如何使用智能手表、睡眠追踪器、和血糖监测仪等可穿戴设备来收集患者数据。
改革临床研究是“业界感兴趣的一个大话题”,不仅是上面提到的University of Illinois Jimeng Sun实验室、和Intelligent Medical Objects公司,此外,Saama 是一家位于加利福尼亚州坎贝尔(Campbell, California)的软件公司,该公司利用人工智能帮助组织实现部分临床试验的自动化。
匹配最符合资格的入组志愿者
临床试验中最耗时的部分是招募患者,占研究时间的1/3。几乎每5个临床试验项目就有1个甚至没有招募到所需的受试者人数,而且几乎所有试验都超出了预期的招募时间表。一些研究人员希望在保持安全的同时放宽一些资格标准来加速这一进程。由生物医学数据科学家 James Zou 领导的斯坦福大学(Stanford University)团队开发了一个名为 Trial Pathfinder 的系统,该系统可以分析一组已完成的临床试验,并评估调整参与标准如何影响风险率,或患者中严重疾病或死亡等负面事件的发生率。在一项研究中,他们将其应用于一种肺癌的药物试验,发现按照 Trial Pathfinder 的建议,调整标准将使符合条件的患者数量增加一倍,增加风险率不会增加。研究表明,该系统也适用于其他类型的癌症,并且实际上减少了有害后果,因为它使病情较重的人(他们可以从药物中获益更多)有资格接受治疗。
人工智能可以消除优化资格标准时的一些猜测和体力劳动。 James Zou说,有时即使是在同一家公司工作并研究同一疾病的团队也会提出不同的试验标准。但现在包括罗氏(Roche)、基因泰克(Genentech)和阿斯利康(AstraZeneca)在内的几家公司正在使用 Trial Pathfinder。 前面提到的伊利诺伊大学计算机科学家 Jimeng Sun 实验室,最近已经开发出 AutoTrial,这是一种训练大型语言模型的方法,以便用户可以提供试验描述并要求其生成适当的标准范围,例如体重指数。
一旦研究人员确定了资格标准,他们就必须找到符合条件的患者。纽约哥伦比亚大学(Columbia University in New York City)生物医学信息学家 Chunhua Weng 实验室开发了 Criteria2Query。通过基于网络的界面,用户可以用自然语言输入纳入和排除标准,或输入试验的识别号,程序将资格标准转换为正式的数据库查询,以在患者数据库中查找匹配的候选者。
Chunhua Weng 实验室还开发了帮助患者寻找试验的方法。一个称为 DQueST 的系统由两部分组成。第一个使用 Criteria2Query 从试验描述中提取标准。第二部分为患者提出相关问题,以帮助缩小搜索范围。 Jimeng Sun 实验室与美国国立卫生研究院(US National Institutes of Health)合作开发的另一个系统 TrialGPT 是一种提示大型语言模型为患者找到合适试验的方法。根据患者和临床试验的描述,它首先确定患者是否符合试验中的每个标准并提供解释。然后,它将这些评估汇总为试验级分数。它对许多试验都这样做,并为患者对它们进行排名。
帮助研究人员和患者找到彼此不仅可以加快临床研究的速度,它还使其更加可靠。试验常常不必要地排除儿童、老年人或孕妇等人群,但人工智能可以找到方法将他们纳入其中。患有晚期癌症和患有罕见疾病的人尤其很难找到可以参加的临床试验,然而在真实世界里,这部分晚期癌症喝罕见病患者在努力寻找临床试验机会方面,往往超出大多数人的想象,因为他们迫切需要接受治疗,临床试验就是这些患者生存的希望,这方面,Chunhua Weng实验室的人工智能可以帮助他们与相关项目匹配。
人工智能还可以减少试验所需的患者数量。位于加利福尼亚州旧金山(San Francisco, California)的一家名为 Unlearn 的初创公司在临床试验中为患者创建数字双胞胎。根据试验开始时实验患者的数据,研究人员可以使用双胞胎来预测同一患者在对照组中的进展情况并比较结果。 Unlearn 的创始人兼首席执行官 Charles Fisher 表示,这种方法通常可以将所需的对照患者数量减少 20% 到 50%。该公司与多家小型和大型制药公司合作。Charles Fisher 表示,数字双胞胎不仅有利于研究人员,也有利于参加试验的患者,因为他们接受安慰剂的机会较低。
患者Drop-out老大难问题的解决
一旦患者入组,临床试验的退出率(Drop-out rates)一直是个老大难的话题,退出率高。在对 95 项临床试验的分析中,近 40% 的患者在第一年停止服用处方药物。诺华公司(Novartis)的研究人员曾经提到,人工智能可以提供帮助的方式,其中包括使用过去的数据来预测谁最有可能退出,以便临床医生进行干预,或者使用人工智能来分析患者服药的视频,以确保不会错过剂量。
无论是在研究期间还是在正常的临床实践中,聊天机器人都可以回答患者的问题。Ayers, J. W. et al.的一项研究从 Reddit 的 AskDocs 论坛获取问题和答案,并将问题提交给 ChatGPT。近 80% 的情况下,医疗保健专业人员更喜欢 ChatGPT 的答案而不是医生的答案。在Li, Y. et al.的一项研究中,研究人员通过对医患对话的大型语言模型(Meta 的 LLaMA-7B)进行微调并使其实时访问在线资源,创建了一个名为 ChatDoctor 的工具。 ChatDoctor 可以回答有关比 ChatGPT 训练数据更新的医疗信息的问题。
Ayers, J. W. et al. JAMA Intern. Med. 183, 589–596 (2023).
Li, Y. et al. Cureus 15, e40895 (2023).
整合功能
人工智能可以帮助研究人员管理录入的临床试验数据。诺华公司(Novartis)的研究人员报告称,可从非结构化报告中提取数据,并对图像或实验室结果进行注释,添加缺失的数据点(通过预测结果中的值)并识别人群中对治疗有独特反应的亚组。斯坦福大学的 James Zou 实验室开发出了 PLIP,这是一种人工智能驱动的搜索引擎,可以让用户在大型医疗文档中查找相关文本或图像。James Zou教授一直在与制药公司洽谈,希望用它来组织临床试验中的所有数据,包括笔记和病理照片。患者的数据可能以不同的格式存在,分散在不同的数据库中;同时,James Zou教授还在与保险公司合作,开发了一种语言模型,可以从医疗记录中提取账单信息,并且此类技术还可以从恢复结果、症状、副作用和不良事件等报告中提取重要的临床试验数据。
为了收集试验数据,研究人员有时必须制作 50 多个病例报告表。中国一家名为太美科技(Taimei Technology,今年1月29日递交港交所上市申请)的公司正在使用人工智能根据试验方案自动生成这些数据。
一些公司正在开发将许多人工智能方法集成到一个系统中的平台。Intelligent Medical Objects生命科学部门负责人Xiaoyan Wang与同事合作共同开发了AutoCriteria,这是一种促使大型语言模型从临床试验描述中提取资格要求并将其格式化为表格的方法。这为软件套件中的其他人工智能模块提供信息,例如寻找理想试验地点、优化资格标准和预测试验结果的模块。 Wang 表示,该公司很快将提供 ChatTrial,这是一个聊天机器人,研究人员可以询问系统数据库中的试验情况,或者如果以某种方式调整假设的试验会发生什么。该公司还帮助制药公司准备临床试验报告,提交给负责对药物在美国的使用进行最终批准的美国食品和药物管理局(FDA)。
伊利诺伊州 Jimeng Sun 实验室的学生 Zifeng Wang 正在与 Jimeng Sun 教授和另一位联合创始人 Benjamin Danek 一起,为一家名为 Keiji AI 的初创公司筹集资金,他们正在孵化一款名为 TrialMind 的产品,将提供一个聊天机器人来回答有关试验设计的问题,类似于Xiaoyan Wang的产品,它将完成通常需要数据科学家团队才能完成的任务,例如编写代码来分析数据或生成可视化效果。人工智能在临床试验中有很多机会,尤其是随着最近大型语言模型的兴起。
在大新冠疫情开始时,Saama 公司与辉瑞 (Pfizer) 合作进行了 COVID-19 疫苗试验。使用 Saama 公司的人工智能技术 SDQ,他们在短时间内“清理”了3万多名患者的数据。这是真正推动人工智能为该领域带来的影响的完美用例。该工具使用多种机器学习方法来标记异常或重复数据。专家可能需要两个月的时间才能手动发现数据集的任何问题,而此类软件可以在不到两天的时间内完成。
Saama 公司开发的其他工具可以通过预测哪些患者需要推动来预测试验何时达到某些里程碑或降低退出率。它的工具还可以结合患者的所有数据,例如实验室测试、可穿戴设备的统计数据和笔记来评估结果。
人工智能在临床试验中的部署存在一些伦理和实际挑战。人工智能模型可能存在偏见;它们的结果可能很难重复;它们需要大量的训练数据,这可能会侵犯患者隐私或造成安全风险;研究人员可能会变得过于依赖人工智能;算法可能太复杂而难以理解。缺乏透明度在临床试验中可能会出现问题,因为了解决策的制定方式对于信任和验证至关重要。International Journal of Surgery最近发表的一篇Chopra, H. et al. 评论文章指出:“在临床试验中使用人工智能系统,尚无法取代人类的常识、直觉、和医学训练等的模仿和学习”。
Chopra, H. et al. Int. J. Surg. 109, 4211–4220 (2023).
随着2024年3月18日,全球瞩目的顶级AI盛会 - 英伟达(Nvidia,NVDA) 2024年GPU技术大会(NVIDIA GTC 2024)的召开。据会上公开数据显示,今年大会与医疗保健和生命科学相关的会议共有90场,数量在具体行业分布中排名第一。由此可见英伟达CEO黄仁勋押注“AI+制药”赛道的决心。2023年英伟达投资了9家制药行业中以人工智能和数据为核心的公司。英伟达正在寻求“AI+医疗”,即将人工智能应用于医疗保健领域。今年3月末,英伟达最近透露,正在与一家名为 Hippocratic AI 的初创公司合作开发能够理解和处理与患者护理相关的基本任务的虚拟代理。黄仁勋公开表示,“学计算机的时代过去了,生命科学才是未来。”黄仁勋说,如果有重来一次的机会,他会首先考虑生物学,特别是和人类相关的生物学。
从“AI+制药”、到“AI+医疗”已然席卷全球,距离规模化最近的下个一二级市场的投资超级风口会是“AI+CRO”板块吗?拭目以待!
五、人工智能与临床试验的结合——从数据到治疗的革命
(原创 合成生物催化剂工程2 微生物遗传与工程生物学)
对于开发新药的初创公司来说,临床试验的过程不仅充满了风险,而且过程缓慢、成本高昂,特别是在患者招募和罕见病试验中,挑战尤为艰巨。目前人工智能和机器学习已经应用到了加速药物研发的流程,那么我们是否能够让临床试验也从中受益呢?
近期,Highlander Health宣布愿意投资支持通过简化临床试验流程,来推动个性化医疗发展的公司。在先前的临床试验中就已经有利用电子健康记录来筛选合适试验参与者并跟踪临床结果,并在2012年Flatiron Health公司开发了专门的软件将肿瘤学临床试验中电子健康记录数据整合到一个庞大的数据集中,并用于AI模型的训练,帮助制药公司加速临床试验招募。在肿瘤学领域,这种基于现实世界数据来应用于机器学习的方式已经取得了显著的成果,并且通过了临床专家验证,确保其准确性。
相比之下,个性化医疗和罕见病的进展较慢,主要是因为这一类患者的病史复杂,症状也更复杂,导致电子病历的数据质量差且难以共享。对此,Highlander Health公司计划通过创建一个学习型医疗保健系统,将临床数据和日常护理数据相结合,并不断利用这些数据来改善病人的治疗,加快药物开发的速度。
对于新兴的生物公司来说,若从一开始就将人工智能和机器学习融入其生态系统,可快速获得收益。例如,利用大型语言模型可以处理电子健康记录中的手写笔记,精准地匹配患者与临床试验,甚至可将临床成像和诊断数据纳入试验结果。随着时间推移,AI有望优化整个临床试验设计,通过将现实世界数据融入到试验中,从而减少安慰剂组人数,并降低患者的招募成本。
在未来,AI模型有可能创建出“数字双胞胎”,这些虚拟的患者副本可以帮助预测特定治疗的效果。美国食品药品监督管理局对使用现实世界数据的兴趣也在增加,意味着这正是公司探索并测试这些新方法的最佳时机。
在药物开发中,成功的关键在于数据。AI需要高质量的训练数据,而现阶段的临床试验虽然生成了大量数据,但尚未充分利用这些数据进行有效的模型训练。随着Highlander Health的资金大力支持,生物技术公司现在有机会在AI领域迈出重要一步,通过改进数据利用,推动药物研发的速度与效率。
(曹晟源摘译)
end
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