NAUTILUS INC

近日，英国生物科技初创公司Portal Biotech宣布完成3500万美元A轮融资，由NATO Innovation Fund与Earlybird联合领投，Science Creates VC、Pillar VC、8VC等多家知名机构跟投。这不仅是该公司自2021年创立以来最大的一轮融资，也标志着欧洲生命科学工具赛道的一次高能注资。 真正引发业内讨论的，是投资方的身份：NATO Innovation Fund。这个由北约成员国共同出资、聚焦“战略性颠覆技术”的基金首次将目光瞄准了生物工具领域——这是该机构少有的生命科学类投资。 NATO基金在公告中直言：“Portal Biotech正在开发一项能够提升国家生物安全能力的核心底层技术。”换句话说，这笔投资不仅是对蛋白质测序未来的押注，更关乎生物竞争与数据独立的技术赛跑。 01 一家从高校实验室走出的“蛋白质新读码器” 脱胎于格罗宁根大学Maglia实验室，Portal成立于2021年，由长期从事蛋白质单分子研究的教授Giovanni Maglia与技术创业者Andy Heron（现任Portal首席执行官）联合创立。Maglia教授在纳米孔（nanopore）技术领域深耕超过十年，曾在《Nature Nanotechnology》等纳米科学与技术领域顶级学术期刊发表关于蛋白穿孔机制、电流识别的核心论文。 CEO兼联合创始人Andy Heron曾在全球测序巨头Oxford Nanopore Technologies担任高级总监，多年负责单分子测序平台的工程化与产品推进，对纳米孔测序的底层逻辑和商业化路径均有深刻理解。机器学习与生物信息学副总裁Tim Massingham则在Oxford Nanopore期间主导机器学习开发工作，推动测序精度与算法性能提升。他拥有超过二十年的机器学习与生物信息学经验，并在欧洲分子生物学实验室（EMBL）等研究机构积累了丰富的科研背景。首席运营官Selly Saini则在医疗器械和诊断领域拥有二十多年经验，曾任强生高管、擅长公司规模化及供应链建设。 Portal团队成员的背景在学术深度、工程经验与商业落地上形成互补，构建了一支兼具原创技术突破、平台工程转化与产业执行力的核心团队，也为其从实验室走向平台生态奠定了坚实基础。 图1：Portal Biotech团队合照 从左到右：Tim Massingham（机器学习和生物信息学副总裁），Andrew Heron（联合创始人&首席执行官）， Giovanni Maglia（联合创始人&首席战略官）和Selly Saini（首席运营官） Portal目前规模约为11至50人，已在伦敦创新中心Scale Space搭建跨学科团队，并在荷兰延续与Maglia实验室的深度合作。这一发展路径虽然低调却节奏清晰，三年内吸引多方资本，截至2025年7月已完成两次融资，总金额超4500万美元。 表1：Portal Biotech里程碑事件一览 02 从质谱到电流信号，“看见”蛋白质的另一种方式 要理解Portal的颠覆性技术路径，首先需回顾当前主流蛋白质组学工具——质谱（Mass Spectrometry，MS）。作为科研与临床检测的金标准，质谱具备高通量、高灵敏度等优点，但其过程冗长：样本需先酶切成小片段，再逐一识别，整个过程不仅耗时，且存在大量“上下文信息”的丢失。这就像是通过“拼碎纸条”来理解一封信，难免失真。 Portal选择了另一条路径，具体而言，Portal将蛋白质链逐段拉入工程化纳米孔通道，并通过分析每个氨基酸穿孔时产生的电流扰动，再结合人工智能（AI）模型进行实时序列识别。其最终目标，是在无需酶切、无需标签、无需繁复样本制备的前提下，直接读取原始蛋白分子的完整序列及修饰信息。 这一方法的最大创新，在于其“原始直读”的能力。Portal平台不仅可识别氨基酸顺序，更能精确捕捉质谱难以还原的翻译后修饰（Post-Translational Modifications，PTMs），如磷酸化、乙酰化等，这些微小却关键的化学修饰常是疾病早期信号的关键线索。 如果说传统质谱是“读碎纸条”，Portal的方法更像是“高清扫描整封信件”，不仅信息保留更完整，也让解读更加精准。 不少业内人士将Portal称作“蛋白质测序领域的小Oxford Nanopore”。这并非空穴来风。两者在技术路径与平台战略上有诸多相似之处：都基于纳米孔（Nanopore）传感原理，通过分析生物分子穿过纳米孔时引发的电流变化，实现对序列信息的读取；都强调便携、快速、可现场部署的硬件设计，目标是让测序走出大型实验室，融入更广泛的实际场景。 不过，相比DNA测序，蛋白质的复杂性远高于核酸。这些“软塌塌”的长链分子不仅缺乏统一电荷，还存在多种空间构象与翻译后修饰，使得识别过程更像是从模糊信号中“听懂一门新语言”。Portal需要解决的不仅是如何稳定拉伸蛋白链、精准采集电流信号，更要依赖人工智能（AI）模型从海量干扰中还原出氨基酸序列与修饰信息。 在这一点上，Portal不只是“复刻”Oxford Nanopore的技术路线，而是在其基础上，探索一条难度更高、但潜力更大的蛋白质测序新路径。 03 不止于仪器，而是重构蛋白质测序生态的平台 Portal并不满足于打造一台科研级样机，而是致力于重塑蛋白质测序的技术生态。 当前，Portal正在开发一款台式化、一体化、可现场部署的测序系统，融合纳米孔芯片、标准化样本处理流程、AI识别算法与云端数据平台，提供“从样本到结果”的完整闭环服务。其目标是：让蛋白质测序像PCR一样简单易用，走进大学实验室、生物技术公司，甚至未来的临床研究现场。 在最核心的蛋白质层面，该平台可实现单分子级别的端到端测序，直接解析完整蛋白的氨基酸序列，并准确定位所有修饰位点，提供高度精细的分子信息。这一多维度能力体现了Portal打造通用型底层检测平台的技术野心。 虽然产品仍处于样机阶段，Portal已明确规划了多个关键应用场景： 首先，在生物安全与应急响应领域，其便携式系统结合AI识别能力，可支持现场识别未知蛋白，用于特定公共卫生事件或特殊检测场景。 其次，在精准医学领域，该平台通过识别蛋白质的翻译后修饰（PTMs），可辅助肿瘤早筛、遗传病筛查与罕见病诊断。 再者，该平台也具备药物发现潜力：识别药物作用下的蛋白表达变化，助力早期go/no-go决策与靶点验证。 此外，Portal Biotech的平台架构不仅聚焦于蛋白质组学，还具备向代谢组学与多肽分析扩展的能力。据官网介绍，该系统能够实现对小分子、肽段以及完整蛋白的多维检测。 针对小分子与代谢物检测，平台可对代谢产物进行定量分析，并用于评估样本的纯度，为代谢研究和药物开发提供基础数据支持；针对多肽，Portal采用兼容质谱的肽光谱法，不仅可识别翻译后修饰，还具备区分手性差异及其他同分异构体的能力。 整体来看，Portal的平台以快速、直读、定量、可扩展、成本可控为优势，构建出“设备+试剂+算法+云端”四位一体的完整系统。这一结构不仅体现其技术闭环能力，也为其平台型商业模式打下基础。 图2：Portal Biotech平台优势 04 一场关于精准、通量与场景的重新竞赛 在蛋白质组学这场技术突围战中，Portal并不是唯一玩家。当前主流仍是液相色谱-质谱联用（LC-MS），由Thermo Fisher、SCIEX等行业巨头主导。与此同时，一批新兴公司正围绕“单分子读取”路线展开竞争，其中以Quantum-Si、Nautilus和Seer为代表，它们各自探索不同的路径。 Quantum-Si借助单分子蛋白条码标签技术优化识别流程；Nautilus采用蛋白质的迭代映射进行大规模单分子蛋白分析；Seer则通过其Proteograph工具套件，采用纳米颗粒进行采样，将样本预处理自动化，并兼容主流LC‑MS平台，提升上机通量和分析深度。 Portal的路径明确：跳过标签与光学系统，直接读取全长蛋白。但要实现这一技术跃迁，仍需在精度、通量与成本间找到平衡。尤其在科研市场，唯有跑出“比质谱更简单、更经济”的实际价值，才能争取用户试用与复购。 蛋白质测序曾被誉为继基因组学之后的下一个信息革命高地。但十余年来，该领域受限于高成本、碎片化结果与实验复杂度，始终未能大规模普及。Portal的愿景，是通过一种底层新路径，重建蛋白质世界的“阅读方式”。它既不是简单的质谱替代品，也不是单一检测设备，而是试图以测序芯片+算法模型+数据平台的闭环模式，构建一个新一代蛋白信息生态。 对于中国市场而言，这一案例也释放出一个深刻信号：在生物科技的关键基础工具上，真正有全球影响力的创新，往往不是单点突破，而是“从实验室到平台”的全栈整合能力。能否在原创性、工程转化与产业路径上三者并进，或许正是未来国产底层生物技术能否突围的关键命题。 如果您想对接文章中提到的项目，或您的项目想被动脉网报道，或者发布融资新闻，请与我们联系；也可加入动脉网行业社群，结交更多志同道合的好友。 近 期 推 荐 声明：动脉网所刊载内容之知识产权为动脉网及相关权利人专属所有或持有。未经许可，禁止进行转载、摘编、复制及建立镜像等任何使用。文中如果涉及企业信息和数据，均由受访者向分析师提供并确认。 动脉网，未来医疗服务平台

SEATTLE, July 31, 2025 (GLOBE NEWSWIRE) -- Nautilus Biotechnology, Inc. (NASDAQ: NAUT; or “Nautilus”), a company pioneering a single-molecule proteome analysis platform, today reported financial results for the second quarter ended June 30, 2025. “In Q2, we achieved major milestones that underscore the continued advancement of our platform,” said Sujal Patel, CEO of Nautilus Biotechnology. “Not only did we continue our momentum across both targeted and broadscale proteomic development efforts, but we also publicly shared the first scientific manuscript to feature novel data generated using the Nautilus Platform. The manuscript represents nearly a decade of pioneering work by our team and collaborators. In it, we introduce and validate application of our Iterative Mapping method showing that it can measure proteoforms at a resolution and breadth never before possible. “We have also signed two collaborations with major research institutes to utilize the Nautilus platform and Tau proteoform assay. Through studies of co-incident post-translational modifications on Tau across brain regions in human tissue and across models of Alzheimer's disease progression we aim to enable researchers to make fundamental advances in understanding disease-relevant biology. Together, these achievements represent both the demonstration and external recognition of the exceptional performance of our platform and mark a critical step toward enabling researchers to uncover proteomic insights that we believe will shape the future of biomarker and therapeutic discovery.” Second Quarter 2025 Financial Results Operating expenses were $17.1 million for the second quarter of 2025, a 18% decrease compared to $20.8 million for the corresponding prior year period. The decrease in operating expense is attributable to continued focus on cost optimization, variability in the timing of research and development activities, and decreased salaries, related benefits, stock-based compensation, and professional services expenses. Net loss was $15.0 million for the second quarter of 2025, as compared to the net loss of $18.0 million for the corresponding prior year period. Cash, cash equivalents, and investments were $179.5 million as of June 30, 2025. Webcast and Conference Call Information Nautilus will host a conference call to discuss the second quarter 2025 financial results, business developments and outlook before market open on Thursday, July 31, 2025, at 5:30 AM Pacific Time / 8:30 AM Eastern Time. Live audio of the webcast will be available on the “Investors” section of the company website at: www.nautilus.bio. About Nautilus Biotechnology, Inc. With its corporate headquarters in Seattle, Washington and its research and development headquarters in San Carlos, California, Nautilus is a development stage life sciences company working to create a platform technology for quantifying and unlocking the complexity of the proteome. Nautilus’ mission is to transform the field of proteomics by democratizing access to the proteome and enabling fundamental advancements across human health and medicine. To learn more about Nautilus, visit www.nautilus.bio Special Note Regarding Forward-Looking Statements This press release contains forward-looking statements within the meaning of federal securities laws. Forward-looking statements in this press release include, but are not limited to, statements regarding Nautilus’ expectations regarding the company’s business operations, financial performance and results of operations; expectations regarding operating expenses and cash runway; expectations with respect to any revenue timing or projections; expectations with respect to the development required for and the timing of the launch of Nautilus’ product platform and full commercial availability; the functionality and performance of Nautilus’ product platform, its potential impact on providing proteome or proteoform access, pharmaceutical development and drug discovery, expanding research horizons, and enabling scientific explorations and discovery; expectations regarding platform specifications required by potential customers and partners and the timeline for adoption of Nautilus’ platform by researchers; and the present and future capabilities and limitations of emerging proteomics technologies. These statements are based on numerous assumptions concerning the development of Nautilus’ products, target markets, and other current and emerging proteomics technologies, and involve substantial risks, uncertainties and other factors that may cause actual results to be materially different from the information expressed or implied by these forward-looking statements. Risks and uncertainties that could materially affect the accuracy of Nautilus’ assumptions and its ability to achieve the forward-looking statements set forth in this press release include (without limitation) the following: Nautilus’ product platform is not yet commercially available and remains subject to significant scientific and technical development, which is inherently challenging and difficult to predict, particularly with respect to highly novel and complex products such as those being developed by Nautilus. Even if our development efforts are successful, our product platform will require substantial validation of its functionality and utility in life science research. In the course of Nautilus’ scientific and technical development and associated product validation and commercialization, we may experience material delays as a result of unanticipated events. We cannot provide any guarantee or assurance with respect to the outcome of our development, collaboration, and commercialization initiatives or with respect to their associated timelines. For a more detailed description of additional risks and uncertainties facing Nautilus and its development efforts, investors should refer to the information under the caption “Risk Factors” in our Annual Report on Form 10-K as well as in our Quarterly Report on Form 10-Q to be filed for the quarter ended June 30, 2025 and our other filings with the SEC. The forward-looking statements in this press release are as of the date of this press release. Except as otherwise required by applicable law, Nautilus disclaims any duty to update any forward-looking statements. You should, therefore, not rely on these forward-looking statements as representing our views as of any date subsequent to the date of this press release. Disclosure Information Nautilus uses filings with the Securities and Exchange Commission, its website (www.nautilus.bio), press releases, public conference calls, public webcasts, and its social media accounts as means of disclosing material non-public information and for complying with Regulation FD. Therefore, Nautilus encourages investors, the media, and others interested in Nautilus to review the information it makes public in these locations, as such information could be deemed to be material information. Media Contactpress@nautilus.bio Investor Contactinvestorrelations@nautilus.bio (in thousands)June 30, 2025 December 31, 2024Assets Current assets: Cash and cash equivalents $34,457 $27,646 Short-term investments 113,416 102,247 Prepaid expenses and other current assets 2,852 2,933 Total current assets 150,725 132,826 Property and equipment, net 3,728 4,076 Operating lease right-of-use assets 25,920 28,256 Long-term investments 31,636 76,405 Other long-term assets 1,180 1,180 Total assets $213,189 $242,743 Liabilities and Stockholders' Equity Current liabilities: Accounts payable $974 $987 Accrued expenses and other liabilities 2,938 2,548 Current portion of operating lease liabilities 4,225 4,097 Total current liabilities 8,137 7,632 Operating lease liabilities, net of current portion 23,958 26,381 Total liabilities 32,095 34,013 Stockholders' equity: Preferred stock — — Common stock 13 13 Additional paid-in capital 485,669 481,679 Accumulated other comprehensive income 77 57 Accumulated deficit (304,665) (273,019)Total stockholders’ equity 181,094 208,730 Total liabilities and stockholders' equity $213,189 $242,743 Three Months Ended June 30, Six Months Ended June 30,(in thousands, except share and per share data) 2025 2024 2025 2024 Operating expenses Research and development $10,394 $12,436 $21,930 $25,366 General and administrative 6,703 8,353 14,011 17,030 Total operating expenses 17,097 20,789 35,941 42,396 Other income (expense): Interest income 2,080 2,798 4,311 5,675 Other expense (16) (19) (16) (19)Total other income $2,064 $2,779 $4,295 $5,656 Net loss $(15,033) $(18,010) $(31,646) $(36,740)Net loss per share attributable to common stockholders, basic and diluted $(0.12) $(0.14) $(0.25) $(0.29)Weighted-average shares used in computing net loss per share attributable to common stockholders, basic and diluted 126,204,632 125,317,650 126,174,603 125,226,552 Six Months Ended June 30,(in thousands) 2025 2024 Cash flows from operating activities Net loss $(31,646) $(36,740)Adjustments to reconcile net loss to net cash used in operating activities Stock-based compensation expense 3,877 6,393 Amortization of operating lease right-of-use assets 2,336 2,160 Depreciation 922 1,028 Amortization (accretion) of premium (discount) on securities, net (980) (1,453)Changes in operating assets and liabilities: Prepaid expenses and other assets 160 (71)Accounts payable (51) (308)Accrued expenses and other liabilities 390 (706)Operating lease liabilities (2,295) (2,026)Net cash used in operating activities (27,287) (31,723)Cash flows from investing activities Proceeds from maturities of securities 45,878 53,500 Purchases of securities (11,278) (15,694)Purchases of property and equipment (615) (1,159)Net cash provided by investing activities 33,985 36,647 Cash flows from financing activities Proceeds from exercise of stock options 26 275 Proceeds from issuance of common stock under employee stock purchase plan 87 289 Net cash provided by financing activities 113 564 Net increase in cash, cash equivalents and restricted cash 6,811 5,488 Cash, cash equivalents and restricted cash at beginning of period 28,648 20,399 Cash, cash equivalents and restricted cash at end of period $35,459 $25,887

环球视野，深度视角 各位亲爱的股东，大家早上好中午好晚上好。 最近流量扑街，感谢各位股东不弃多多转发吧（不然我就去做标题党）。 2025年3月4日，英国纳米孔测序龙头Oxford Nanopore Technologies（ONT）发布财报。 然后，突然就崩了。 截至当日收盘，ONT股价暴跌13.13%(这该死的数字巧合)。 可是，隔壁刚被中国商务部爆锤的Illumina还微涨了。 难道，ONT才是制裁的最大的受害者？ 带着这个疑问，我们梳理了一遍财报发现并非如此。 #01 高速狂飙 2024全年ONT营收1.832亿英镑，不变汇率下核心业务增长率23.3%。 如果，我们严格一点，只看报告的“实际”增长率。 其实也不差，其核心业务营收1.792亿英镑，增长19.7%，总营收增长8.0%。 依然算得上是高速狂飙。 毛利率57.5%，相较于去年的53.3%增长明显。 亏损1.462亿英镑，相较于去年略微下降。 调整后的EBITDA为-1.161亿，相较于2023年略有扩大，但问题也不大。 明明是高速狂飙，为啥从股价上看就是挨了重锤呢？ 可恶啊..泪水不争气的打湿了刚端上来的猪脚饭。 一个可能的点是ONT的预期不及投资人的预期，好比网友见面前都幻想对方1.85腹肌男，实际上1.85有的，就是缺了腹肌。 开个玩笑，大概率，我们认为ONT在科研市场的营收权重过大扰动了ONT的股价表现。 #02 成败萧何 我们从财报中可以看到，ONT在科研领域的用户占比最高。 2024年科研终端用户的收入达到1.275亿英镑，增长1.9%，占比70%。 即便在合成生物学、生物制药和临床端的增长都高达2位数，然而其占比太低。 也就是说，ONT对于科研资金的依赖度极高。 这点，Illumina占比仅有49%，还算上其他应用市场份额。 如果单纯看科研市场，这个比例会更低。 所以当美国举起缩减NIH经费的砍刀时，ONT慌了。 管理层表示，他们在NIH资金方面风险敞口大概在10%-15%。 得，成也萧何败也萧何了。 所以，预估的2025年营收增长率为20%-23%。 要知道，当年预测2024年增长率可是20%-30%哦。 另外，在财报会上“export control/restriction”一直被提及，这说的就是向中国出口的限制。 这也影响了2025年ONT对市场前景的判断。 原表述是“尽管中国区需求强劲，但是在H2出口产品挑战上升，我们仍然认为未来的环境充满挑战”。 咨询了下国内终端用户，有用户表示确实要填很多表格。 呃，但并不是全部。 难道他们属于重点关注对象？ ONT亚太区表现并不差，去年的核心产品增长率达到22.1%，占所有营收比例为22%左右。 中国区销售额占比8%，想想也表现的不至于过差。 大概测算下， 足见中国区市场需求 #03 未来挑战者 让人意外的是，这次财报会上ONT并没有提及华大。 去年华大Cyclone发布次日也就是2024年9月10日，ONT向美国加州南区法院递交了传票申请，以便送达给Complete Genomics Inc、Innomics Inc、MGI Americas Inc等公司。 ONT打算起诉华大基因集团（BGI Group）及其子公司，理由是违反合同和可能违反专利许可。 但是，2024年11月4日，ONT撤回了传票申请。 不过，事情并未就此结束。 2024年12月6日，据Genomeweb报道ONT再次起诉BGI。 只不过，地点换成了自己的主场英国英格兰和威尔士商业与产权高院。 2025年3月1日，华大又把CycloneSEQ G400-ER（原WY01）端了出来，G400-ER是全球单芯片设计通量最高的纳米孔长读长测序仪。 没想到啊，ONT还能坐得住。 要么，还在关键阶段，不方便过多透露信息。 要么，还没顾得上。 比如，现在ONT在忙的PromethION芯片升级计划。 PromethION现有芯片有2675个纳米孔，预计新的产品将提高15%-30%的数据产量。 呃，就是这进度嘛...估计得2025年下半年才能有早期试用。 掀桌子！Roche SBX测序仪惊艳亮相 另外一个挑战者就是来自Roche的SBX了，我们也聊过。 那么，ONT对此的评价是什么呢？ 简单的说：啥也不是。 ONT认为： 第一，所谓Roche SBX测序就是跟传统SBS测序类似（我...不认同）。 第二，ONT能制直接测DNA/RNA/加计划，横跨短片段和长片段测序，我们Unique！ 不过，华大和Roche一起挑战可不是闹着玩的啊。 #04 最后 ONT的2025可能是转折点的开始，我们认为有3个因素是必须要考虑的。 第一，宏观环境的持续动荡，包括经济下行、贸易保护、开支减少等等，都将影响整个行业，没有人能独善其身； 第二，竞争环境持续加剧，随着华大CycloneSeq系列纳米孔测序仪推出，海外布局是必然选项，国内还有今是、齐碳，且安序源据说已经准备商业化了，只会越来越难； 第三，新品的推出速度不够，或者说对于低成本产品的投放还有欠缺，当宏观需求不足的时候高价产品是首先被抛弃的。 ONT也认识到了自己需要尽快扩展市场，所以销售部门的人数从2023年的416人增加到了489人，增加了近18%。 可得加把劲，不然这个2025，日子可不好过。 更重要的是，2027年还得要盈利呢... END 找小编，扫这里！ 至此，各位股东星标了么？点赞了么？转发了么？在看了么？谢谢！ 所有内容均不作为投资建议，信息均来自公开资料。 近期文章： Illumina测序仪被禁！国产替代的未来不止测序！ Stellaromics|3D空间生物学，是啥？ Exact Sciences：癌症早筛营收破21亿美元 蛋白组学公司Nautilus裁员+跳票 Myriad Genetics：2024高速，2025换挡 Agilent：下调全年预期，但，中国区拔群 相关资料：注1：https://a.storyblok.com/f/196663/x/1ffdd01a8f/oxford-nanopore-2024-annual-results-4-march-2025.pdf注2：https://a.storyblok.com/f/196663/x/a13732df7e/ont-2024-annual-results-presentation-5-march-2025.pdf