2026 年 1 月 6 日,Nimbus Therapeutics 宣布与礼来达成13亿美元协议,将运用 Nimbus 的计算化学和基于结构的药物设计方法共同开发新型口服肥胖症治疗药物。此前双方曾合作开发针对 AMPK 的药物用于治疗心血管代谢疾病。Nimbus Therapeutics 是在计算化学领域领军企业 Schrödinger 的技术平台上构建并采取类似 Hub-and-Spoke 的公司架构,已实现两个项目的成功出售。
Nimbus Therapeutics 利用人工智能增强型计算化学开发小分子
by
TiPLab 木桃
Nimbus 致力于通过人工智能增强的计算化学方法开发突破性小分子药物。通过将前沿计算技术与一系列定制的基于机器学习的预测建模方法相结合,来攻克那些经过充分验证但传统上难以成药且具有巨大潜力的靶点。
采用以靶点为中心的策略,运用先进的蛋白质结构分析、分子模拟、机器学习预测和系统化的数据分析,通过这些工具提供的原子尺度洞见从而设计出高度精确的分子。
Nimbus 由 Atlas Venture 和化学模拟和计算机辅助(in silico)药物发现领域的领导者 Schrödinger, Inc.于 2009 年创立。通过与Schrödinger 建立合作,Nimbus 获得了对包括新一代 WaterMap 等前沿技术的优先使用权和若干关键靶点的独家开发权。其中,Schrödinger 提供特定靶点的定制软件包、专属计算化学团队与云计算资源支持。而 Schrödinger 则持有 Nimbus 的大量股权并将获得根据管线开发进程的里程碑付款。
WaterMap 用于评估结合位点中特定水分子的能量。其不仅能够准确预测结合亲和力,还能解释一些原本无法解释的结构-活性关系,从而识别特定的优化策略。
2021年,双方进一步扩大合作,进一步拓展基于物理学的药物发现与机器学习相结合的前沿领域。
Nimbus 采用了一种以资产为中心的新型公司架构(Hub-and-Spoke),旨在提升资产流动性和资本周转速度:以有限责任公司(LLC)作为运营主体,并将特定项目放入特定子公司进行运作,例如,2023年,Nimbus 将其 TYK2 项目子公司 Nimbus Lakshmi, Inc.出售给武田。2016 年,将其 ACC 项目子公司 Nimbus Apollo 出售给吉利德。
参见:The Nimbus Experiment: Structure-Based Drug Deals
Nimbus 的内部管线包括:分别针对肿瘤靶点WRN和免疫学靶点SIK2以及多个肿瘤学、免疫学和代谢性疾病领域的临床前项目:
NDI-219216:一种高效且选择性的非共价 WRN 解旋酶抑制剂,针对微卫星不稳定性高 (MSI-H) 肿瘤,目前正处于 I/II 期临床开发阶段。WRN(沃纳综合征解旋酶)是 DNA 复制和修复所必需的酶。多项研究表明,具有微卫星不稳定性(MSI)的肿瘤细胞的存活依赖于 WRN 解旋酶的活性。与共价疗法相比,NDI-219216 的非共价作用机制可能提供更持久的靶向活性和更宽的治疗窗口。
SIK2(盐诱导激酶 2)抑制剂:正推进针对炎症和自身免疫性疾病的首次人体试验。盐诱导激酶(SIK)家族参与调控转录程序,这些程序能够激活病理过程,例如促炎信号并抑制修复机制。SIK 抑制剂有望通过阻断病理通路并促进修复来纠正这些失衡状态。
公司还有两个项目已经卖给第三方,包括Zasocitinib(NDI-034858;免疫;已由 Takeda 拥有)和NDI-010976(肝病/代谢;已由 Gilead 拥有)。
TYK2(酪氨酸激酶 2)是一种重要的信号转导激酶,与免疫介导的疾病密切相关。Zasocitinib是一种高选择性的变构 TYK2 抑制剂,用于治疗银屑病和银屑病关节炎,2023 年 TYK2 项目被武田收购,目前正在开展多项 II/III 期临床试验。
ACC(乙酰辅酶 A 羧化酶)是一种参与脂肪酸合成和调控脂肪酸分解的酶。NDI-010976是一种强效的肝脏靶向的变构 ACC 抑制剂,用于治疗 MASH,并可能用于治疗肝细胞癌和其他疾病。2016 年ACC 抑制剂项目被吉利德收购,目前正在开展治疗 MASH 的 II 期临床试验。
因 Nimbus 采用的特殊公司架构,其相关管线的专利最初由其子公司递交,比如:
在被收购前,TYK2 项目相关专利的专利申请人为Nimbus Lakshmi Inc,目前专利权人为武田,包括:涉及化合物通式的一系列专利家族:PCT/US2015/018071、PCT/US2017/056555、PCT/US2018/043917、PCT/US2019/063510、PCT/US2019/056230和PCT/US2020/014746;涉及治疗用途的专利家族PCT/US2023/064902等;涉及制剂的专利家族PCT/US2023/064899等。
在被收购前,ACC 项目相关专利的专利申请人为Nimbus Apollo, Inc.,比如:涉及化合物通式的专利家族PCT/US2012/064528。
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