【编者荐语】近日(2025年1月初),Nature Medicine杂志发表两项CAR-T治疗自身免疫病的临床试验的结果,以及一项临床转化研究的分析结果。本文所述的该研究报告了 Descartes-08,一种基于mRNA而非整合型慢病毒载体的重症肌无力的治疗随机、双盲、安慰剂对照的2b期试验的探索性生物标志物分析。
现译介如下,原文PDF已上传文末小程序,点击免费下载。
嵌合抗原受体(CAR)-T 细胞疗法有望通过重置免疫系统,改变自身免疫性疾病的治疗格局。然而,这类细胞疗法在自身免疫病领域的应用受到诸多障碍限制,包括需住院给药、淋巴细胞清除,以及与细胞因子释放综合征和非特异性免疫抑制相关的安全性顾虑。基于 RNA 的细胞疗法有望解决这些局限性。本文报道了一项针对全身型重症肌无力患者开展的随机、双盲、安慰剂对照 2b 期试验的预设探索性分析结果,该试验取得了成功,受试者接受的是一种自体来源、RNA 编码的抗 B 细胞成熟抗原(BCMA)CAR-T 细胞疗法,即 Descartes-08。在无需淋巴细胞清除的门诊治疗场景下,66.7% 的患者(10/15 例)经 Descartes-08 瞬时靶向 BCMA 治疗后,获得了持久的临床疗效。研究人员通过流式细胞术、血清谱分析、多重细胞因子分析以及bulk/单细胞转录组分析,对比了 Descartes-08 治疗组(≤19 例)与安慰剂组(≤15 例)的差异,结果发现该疗法实现了自身反应性的精准调控,具体表现为免疫效应功能增强、BCMA 阳性浆细胞与浆样树突状细胞活性降低,以及白细胞介素 6(IL-6)等疾病相关细胞因子水平下降。此外,抗体和 T 细胞受体分析显示,Descartes-08 治疗组受试者体内的循环自身反应性抗体谱和 T 细胞克隆谱系发生了改变。上述效应的产生并未伴随免疫抑制,具体依据是患者体内的疫苗特异性抗体水平未出现下降,也未发生低丙种球蛋白血症。本研究的发现揭示了一种全新的免疫重置模式,为靶向 BCMA 的 RNA 细胞疗法成为更易普及的自身免疫病治疗方案提供了有力支持。该临床试验在临床试验数据库(ClinicalTrials.gov)的注册号为 NCT04146051。
引言
嵌合抗原受体(CAR)-T细胞疗法通过重置免疫系统,具备改变自身免疫病治疗格局的潜力,但在该领域的应用受限于多项关键障碍,包括需住院给药、淋巴细胞清除预处理、细胞因子释放综合征(CRS)风险及非特异性免疫抑制等。基于RNA的细胞疗法凭借其独特优势,有望解决这些局限性——RNA编码的CAR呈瞬时表达特性,可在无需淋巴细胞清除的情况下给药,且能避免基因组修饰相关的继发恶性肿瘤风险,实现门诊治疗模式。
B细胞成熟抗原(BCMA,TNFRSF17)作为治疗靶点具有显著特异性,其主要表达于浆细胞(PC)、浆样树突状细胞(pDC)及部分记忆B细胞,而在多数B细胞等其他细胞表面不表达。在自身免疫病进程中,PC分泌驱动疾病的自身抗体,pDC产生强炎性的Ⅰ型干扰素,因此靶向BCMA可精准清除致病性细胞,避免广泛免疫抑制。
Descartes-08是一款自体RNA编码的抗BCMA CAR-T细胞疗法。研究者此前开展的多中心、开放标签研究已证实其治疗全身型重症肌无力(MG)的强效与持久性,而本次报告的是一项双盲、随机、安慰剂对照2b期试验的预设探索性生物标志物分析结果。该2b期试验共纳入36例符合标准的MG患者,随机分为Descartes-08治疗组(20例)和安慰剂组(16例),所有患者接受单次白细胞分离术,随后进行6次每周一次的输注(Descartes-08或安慰剂),治疗无需预处理化疗。试验达到主要终点:治疗后3个月,Descartes-08组66.7%的患者MG综合评分(MGC)较基线改善≥5分,显著高于安慰剂组的27.3%(P=0.0472),且疗效持续至12个月,无需额外输注。本研究旨在通过多维度生物标志物分析,揭示Descartes-08实现临床疗效的潜在机制,验证其精准免疫调控作用。
研究结果
(一)Descartes-08可靶向并杀伤人类BCMA+靶细胞
为验证Descartes-08的功能,研究者将其RNA有效载荷电转染至CD8+ T细胞,结果显示转染后24小时,细胞表面即可检测到稳定的抗BCMA CAR表达(图1b-d)。CAR RNA在转染后快速被检出,随后逐渐降解至基线水平,与CAR蛋白表达在第1天达到峰值后下降的趋势一致(图1e-f)。经改造的T细胞展现出强效的抗原特异性杀伤活性,可特异性识别并杀伤人类BCMA+靶细胞,同时产生IFNγ和Granzyme B等效应细胞因子,但不会升高MG相关的IL-6等炎症因子(图1g,Extended Data Fig.1,Extended Data Table1)。此外,Descartes-08能高效清除健康人和MG患者来源的自体PC(图1h-i,Supplementary Fig.2)。
在人源化异种移植模型中,免疫缺陷的NSG小鼠被植入人类恶性PC后,输注Descartes-08 1天内,超过80%的循环CD45+CD8+ T细胞表面可检测到CAR表达(图1j-l)。与未修饰T细胞治疗组或未治疗组相比,Descartes-08组小鼠的恶性PC负荷得到有效控制,生物发光信号显著降低(图1m-n,Supplementary Fig.3)。这些数据证实,Descartes-08通过RNA瞬时工程改造T细胞,是一种高效、选择性清除BCMA+靶细胞的治疗技术。
(二)Descartes-08可规模化生产且具备优良CAR-T功能表型
基于临床前研究结果,研究者在2b期试验中验证了Descartes-08的临床级规模化生产可行性。36例随机化患者中,35例的Descartes-08制剂展现出一致的质量特征,包括良好的细胞活力、CD8+细胞比例及CAR表达水平(图2b-d)。对制剂的T细胞标志物分析显示,其包含与强效CAR-T功能相关的标志性表型,涵盖中央记忆性T细胞(TCM)、效应记忆性T细胞(TEM)、终末效应性T细胞(TTE)及干细胞样记忆性T细胞(TSCM),其中TSCM细胞通过其可塑性和快速增殖能力介导高效治疗效应(图2e,Supplementary Fig.4)。同时,Descartes-08制剂中的T细胞未出现耗竭表型(TEX),表现为CD39、LAG3和PD-1的共表达水平极低(图2e,Supplementary Fig.5)。
药代动力学分析显示,采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测,Descartes-08输注后,患者全血中RNA水平显著升高,而输注前及治疗后3个月(末次输注后约7周)均未检测到明显的RNA信号(n=19),证实其瞬时表达特性(图2f)。这些结果表明,Descartes-08可从具有不同抗体血清型和治疗史的MG患者体内稳定制备,且具备支持临床疗效的优良表型特征。
(三)Descartes-08优先减少BCMA高表达PC和活化pDC
为阐明Descartes-08的作用机制,研究者通过流式细胞术检测了患者循环中浆母细胞(PC的循环前体细胞)和pDC的数量及活化状态。尽管MG患者筛选期的浆母细胞和pDC数量均处于健康人正常参考范围内(图3a-b,Supplementary Figs.6-7),但功能评估显示,MG患者浆母细胞表面的BCMA表达水平显著高于健康供体(HD,P=0.007),pDC表面的关键活化标志物CD86表达水平也显著高于HD(P=0.002)(图3c-d)。
治疗后,Descartes-08组患者的浆母细胞和pDC出现特异性功能改善:治疗后3个月,浆母细胞的BCMA表达水平较安慰剂组显著降低(n=6,P=0.035);治疗后1个月,pDC的CD86表达水平显著下降(n=11,P<0.001),且这一降低趋势持续至治疗后3个月,12个月时仍维持低水平(n=7,Extended Data Fig.2)。值得注意的是,尽管细胞活化状态发生显著改变,浆母细胞和循环pDC的数量并未发生变化,与筛选期水平一致(图3g-h)。这些结果表明,Descartes-08通过优先清除BCMA高表达(BCMAhi)的活化细胞亚群,使MG患者异常的浆母细胞和pDC功能恢复正常,而安慰剂无此效应(图3e-f)。
(四)Descartes-08选择性调控自身反应性抗体谱
鉴于Descartes-08治疗后患者临床疗效持久且BCMA+ PC减少,研究者推测其可能通过精准调控自身反应性抗体谱发挥作用。采用噬菌体免疫沉淀测序(PhIP-Seq)技术分析患者纵向血清样本,该技术可展示人类蛋白质组中的全部自身抗原,通过皮尔逊相关系数(r)评估自身反应组库(autoreactome)的相似性(r=1表示完全一致,r=0表示完全不同)。
结果显示,Descartes-08组患者治疗后3个月的自身反应组库r值中位数为0.72,显著低于安慰剂组的0.89(P=0.034),且这一改变持续至治疗后6个月(r值中位数=0.74,n=10)(图3j)。筛选期至治疗第1天期间进行的白细胞分离术,对所有患者(包括Descartes-08组和安慰剂组)的自身抗体谱均产生一定影响,与循环白细胞部分清除相关(图3k)。抗乙酰胆碱受体(AChR)抗体是MG的确诊指标,但并非疾病进展生物标志物,研究证实其滴度与MG日常生活活动评分(MG-ADL)所反映的临床病情变化无相关性(n=21,图3l),且尽管自身反应组库发生显著重塑,Descartes-08治疗后患者的抗AChR抗体滴度未出现显著变化(图3m,Extended Data Table2)。这些数据表明,Descartes-08可选择性重塑自身反应性抗体谱,而不影响抗AChR抗体滴度,进一步支持其精准免疫调控特性(图3i)。
(五)Descartes-08维持全身免疫细胞群、免疫球蛋白和疫苗滴度稳定
与靶向CD19等广泛表达抗原的CAR-T疗法不同,Descartes-08的瞬时药代动力学特征使其有望仅靶向致病性BCMAhi细胞,而不影响正常免疫细胞。流式细胞术分析证实,Descartes-08组与安慰剂组相比,治疗后3个月和12个月的CD19+ B细胞、CD20+ B细胞、T细胞、自然杀伤(NK)细胞及单核细胞的频率均未发生显著变化(图4a-e,Supplementary Fig.8)。同时,患者的总免疫球蛋白水平(IgG、IgA、IgM)在治疗后3个月和12个月均维持稳定,与安慰剂组无差异(图4f-h,Extended Data Table3);麻疹、腮腺炎、风疹、白喉、破伤风等常见疫苗的滴度也未出现降低,证实Descartes-08不影响患者的体液免疫记忆(图4i-m,Extended Data Table4)。
研究者进一步分析了92种与MG发病和治疗相关的细胞因子,结果显示白细胞分离术导致淋巴毒素α(LTA)、β神经生长因子(B-NGF)、潜伏转化生长因子β1(TGF-β1)、CD6和IL-7的水平发生显著变化,但这些细胞因子在治疗后3个月均恢复至预处理水平(图4n)。Descartes-08输注后,多种与自身免疫病相关的细胞因子水平显著降低,包括IL-6、IL-24、CCL19和ARTN,其中IL-6作为MG严重程度的关键指标,在治疗后3个月的水平显著低于安慰剂组(P=0.019)(图4o-p)。部分细胞因子的降低趋势持续至治疗后12个月,包括EN-RAGE、TRAIL、TNFSF14(LIGHT)和TGF-β1(Extended Data Fig.3)。
亚组分析显示,Descartes-08治疗有效患者的RANKL水平在治疗后1个月(P=0.035)和3个月(P=0.030)均显著降低,可能与Descartes-08靶向清除表达RANKL的pDC相关(图4w);既往未接受过生物制剂(补体抑制剂、FcRn抑制剂或CD19/CD20靶向抗体)的患者,其IL-6(P=0.010)、CCL19(P=0.002)和VEGFA(P<0.001)水平在治疗后1个月显著降低,而VEGFA在自身免疫病中通常升高,这些变化为筛选适宜治疗的患者提供了潜在依据(图4y-ab)。
(六)Descartes-08给药与临床疗效相关的转录组特征改变
研究者采用bulk RNA测序和单细胞RNA测序(scRNA-seq),分析了患者筛选期和治疗后3个月外周血单个核细胞(PBMC)的蛋白质表达变化。均匀流形逼近与投影(UMAP)分析显示,安慰剂组(n=7)和Descartes-08组(n=7)患者治疗前后的免疫细胞组成无明显变化,与Descartes-08精准靶向稀少BCMA+细胞的特性一致(图5a)。尽管两组患者的BCMA+细胞(浆母细胞和pDC)组成无显著差异,但Descartes-08治疗有效患者的浆母细胞和pDC数量较无效患者显著减少(图5b-c);同时,Descartes-08组内部,有效患者的调节性T细胞(Treg)数量增加,无效患者减少,而Treg细胞通过抑制效应性CD4+ T细胞维持免疫平衡,其数量在MG中通常降低(图5d)。
基因集富集分析(GSEA)显示,bulk RNA测序中,安慰剂组(n=6)与Descartes-08组(n=14)、Descartes-08组有效患者(n=9)与无效患者(n=5)之间存在显著的通路差异,上调通路包括IFNα应答、IFNγ应答、TNF-NF-κB信号、IL-6/JAK/STAT3信号和炎症反应,均与免疫效应功能增强相关(图5e)。scRNA-seq分析显示,Descartes-08组患者的浆母细胞、pDC和Treg细胞均富集促免疫基因特征,而安慰剂组无此现象,且浆母细胞的凋亡基因上调,进一步验证了流式细胞术观察到的靶向调控效应(图5f-h)。此外,浆母细胞中TNF-NF-κB通路上调可限制骨髓PC功能,pDC中TNF信号上调可减少IFNα产生,Treg中IFNγ信号上调可抑制抗原提呈细胞和致病性T细胞增殖。B细胞和T细胞(CD4+、CD8+)亚群也呈现促免疫通路富集,且Descartes-08组与安慰剂组的CD4+ T细胞转录组谱存在显著差异,有效患者与无效患者的差异更为明显,提示Descartes-08可能对CD4+ T细胞产生旁侧激活效应(图5i-n,Extended Data Figs.4-5)。
(七)Descartes-08重塑TCR库且不显著改变循环T细胞表型
基于CD8+ T细胞的转录组特征变化,研究者通过TCR测序评估了患者循环中的TCR库特征。结果显示,与安慰剂组相比,Descartes-08组患者的TCR克隆扩增和收缩更为显著(图6a-b),治疗后2个月与第1天相比,多个TCR克隆型发生扩增或收缩,且新扩增的克隆型并非来源于Descartes-08制剂本身(图6c-d)。这一结果与scRNA-seq数据一致,因为NF-κB信号通路在T细胞活化(包括受体信号和共刺激)中发挥关键作用,与TCR动态变化增强相关(P=0.049)。
流式细胞术检测显示,Descartes-08治疗后,患者的CD8+ T细胞记忆亚群(TSCM、TCM、TEM)、CD4+ T细胞记忆亚群及辅助性T细胞亚群(Th1、Th2、Th17)的表型与制剂分析结果一致。仅观察到治疗后1个月Th2细胞比例显著降低(P=0.014),治疗后3个月CD8+ TSCM细胞比例呈上升趋势,其余T细胞亚群的频率在Descartes-08组与安慰剂组之间无显著差异(图6e-m,Supplementary Figs.9-10)。这些数据表明,Descartes-08可重塑TCR库,且不会显著改变T细胞群的整体表型组成。
讨论
本研究通过多维度生物标志物分析,揭示了Descartes-08治疗MG的精准免疫重置机制,其核心效应包括:优先清除BCMAhi PCs和活化pDC、重塑自身反应性抗体谱、降低疾病相关细胞因子水平、调控T细胞转录组特征及TCR库、增加Treg细胞数量,且所有效应均在不引发广泛免疫抑制的前提下实现——患者的全身免疫细胞群、免疫球蛋白水平和疫苗滴度均维持稳定。这种精准免疫重置模式与传统CAR-T疗法(依赖整合型载体和淋巴细胞清除,导致广泛免疫抑制)存在本质区别,且Descartes-08的瞬时BCMA靶向策略避免了CRS、低丙种球蛋白血症等常见不良反应。
Descartes-08的作用机制可能涉及精准清除BCMAhi致病性细胞或干扰其功能,由于MG患者中针对自身抗原的PC持续受到刺激,高表达BCMA以维持存活,因此Descartes-08可优先清除这类分泌致病性自身抗体的PC亚群;此外,病理刺激下未成熟B细胞可能上调BCMA表达,靶向这些细胞也可能阻断疾病进展。但直接验证这些假设存在挑战,因为关键靶细胞(如骨髓中的PC、炎症组织中的活化pDC和B细胞)主要位于循环系统之外,而Descartes-08可能具备在病变组织中特异性发挥效应的内在能力,其循环外活性得到生物标志物变化(PC、pDC、细胞因子、转录组、自身抗体谱)的间接支持。
与现有MG治疗手段相比,Descartes-08具有显著优势:FcRn抑制剂和补体抑制剂需持续给药维持疗效,且分别靶向循环抗体和抗体效应功能;抗CD19 CAR-T疗法需淋巴细胞清除,导致B细胞广泛耗竭和免疫球蛋白降低,而Descartes-08无需淋巴细胞清除,不影响抗AChR抗体滴度(其仅为分型工具,非疾病进展标志物),且疗效持续12个月。本研究的局限性在于采用临床放射免疫分析法检测抗AChR抗体滴度,无法评估抗体亲和力、亚类等致病性特征,未来可采用细胞-based检测技术获取更丰富的抗体功能数据,结合CAR+细胞数量和疾病相关细胞因子(如IL-6)监测治疗进展。
综上,Descartes-08通过RNA工程与BCMA靶向相结合,构建了一种安全、可及的CAR-T治疗平台,其精准免疫重置机制为MG及其他自身抗体介导的自身免疫病提供了新的治疗方向,支持进一步开展大规模临床试验验证其长期疗效和安全性。
研究方法
(一)临床前实验
临床前研究包括体外和体内实验:体外实验中,从HD和MG患者的PBMC中分离CD8+ T细胞,经活化后转染Descartes-08 RNA,通过流式细胞术检测CAR表达,采用细胞毒性实验验证其对BCMA+靶细胞(MM.1S-GFP细胞、自体PC)的杀伤活性,通过LEGENDplex检测细胞因子分泌;体内实验中,NSG小鼠植入人类恶性PC后输注Descartes-08,评估CAR表达和PC负荷控制效果(图1)。
(二)临床试验设计
MG-001 part3是一项多中心、双盲、随机、安慰剂对照2b期试验,纳入45例全身型MG患者,其中36例符合制造标准并随机分组(Descartes-08组20例,安慰剂组16例)。所有患者接受单次白细胞分离术制备自体CAR-T产品,随后进行6次每周一次的输注,治疗无需预处理化疗。临床疗效评估采用MGC和MG-ADL评分,主要终点为治疗后3个月MGC评分改善≥5分的患者比例。1例Descartes-08组患者在2次输注后因非安全或疗效原因退出,最终35例患者纳入生物标志物分析(图2a)。
(三)Descartes-08制造与表征
患者PBMC经白细胞分离术后,在良好生产规范(GMP)条件下处理并制备Descartes-08,通过荧光显微镜检测细胞活力,流式细胞术分析CD8+细胞比例和CAR表达,验证制剂的表型特征(图2b-e)。
(四)生物标志物检测与分析
生物标志物检测包括:流式细胞术分析PBMC中免疫细胞(浆母细胞、pDC、T细胞亚群等)的数量和表型(BCMA、CD86表达);qRT-PCR检测全血中Descartes-08 RNA水平;PhIP-Seq分析自身反应性抗体谱;CLIA认证实验室检测抗AChR抗体、免疫球蛋白和疫苗滴度;Olink Target 96 Inflammation面板分析92种炎症因子;bulk RNA测序和scRNA-seq分析转录组特征;Adaptive Immunosequencing分析TCRβ链CDR3区域克隆性(图3-6)。
(五)统计分析
采用线性混合效应模型分析炎症因子变化;组间比较采用双尾非配对t检验,组内纵向比较采用双尾配对t检验;非正态分布数据经对数转换后分析;TCR克隆扩增采用卡方检验结合Benjamini-Hochberg校正;GSEA用于通路富集分析;数据以中位数、四分位数范围或均值±标准差表示,P<0.05为差异有统计学意义。
声明:尽管本公众号译者对本文进行了二轮审校,以尽力确保内容的准确和完整,但仍然可能存在翻译或理解的不当,请读者以原文为准。如有翻译不当处,您可在公众号对话框中发送反馈,译者会尽快校对并予以回复。尽管竭力避免,但论文翻译可能引入生成式AI的幻觉问题,指导临床实践的内容须以原文为准。
预打样(Proof)稿件内容说明:部分论文在推送发布时,期刊尚在校稿,所提供的原文为非正式版本。可能存在排版、表述等问题,需以正式版为准。如果在您阅读本文时正式版已发表(至少在本推送发布后3个月以后),您可以在评论区留言,编者将更换PDF源。
文献:Fedak, R. R., Ruggerie, R. N., Shan, Y., Curvino, E. J., de Sousa, J. F., Daniel, S., Ngo-Casi, M., Kamboh, H., Vu, T., Durmuş, H., Mozaffar, T., Howard, J. F., Jr, English, E. P., Benson, A., Duvernay, M. T., Singer, M. S., Kalayoglu, M. V., Brunn, C., Bodansky, A., Anderson, M. S., … MG-001 Study Team (2026). BCMA-directed mRNA CAR-T cell therapy for myasthenia gravis: exploratory biomarker analysis of a placebo-controlled phase 2b trial. Nature medicine, 10.1038/s41591-025-04170-z. Advance online publication. https://doi.org/10.1038/s41591-025-04170-z
文献原文:BCMA-directed mRNA CAR-T cell therapy for myasthenia gravis exploratory biomarker analysis of a placebo-controlled phase 2b trial.pdf