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超级人源化抗体改造技术：突破传统免疫原性优化的边界 | 晶泰科技·药时代直播间第4期正文共：4762字  4图预计阅读时间：13分钟作者 | 辰公子文章来源 | 药时代公众号封面图来源 | 《三国演义》如果给过去10年上市的药物做一个排名，评价其成功程度的话，Keytruda（K药）大概可以排进前3，排第1或许存在争议，但肯定会有一批拥趸。在K药的成功之路上，一个绕不开的名字是Roger Perlmutter——时任默沙东的执行副总裁兼实验室负责人。Perlmutter博士具有医学背景，早在1997年就加入了默沙东任研发部资深副总裁，不过在2001年却出走安进，在安进担任研发负责人，度过了11年的时光。直到2013年，默沙东的研发负责人Peter S. Kim博士光荣退休后，Perlmutter博士才重归老东家，接任了这一职位。在默沙东的第二段职业生涯里，Perlmutter博士做出最大的贡献就是准确判断了K药的价值，并确定了其开发路线。他拍板定下了基于生物标记物的开发方法，并因此让K药在NSCLC上赢下了“关键战役”；给联用定下了方略，为K药现今2100多项临床试验的注册，数十项适应症的获批奠定了基础。如果说欧加农的PD-1团队是“K药之父”，那么默沙东里的Perlmutter博士团队则可以被冠以“K药教父”的名头。在K药的开发上，Perlmutter博士展现了敏锐的洞察力和毒辣的眼光，并留下了一句格言，“当你意识到这东西的潜在价值后，就应该把全部职业生涯压上去。”然而，Perlmutter博士却并没有陪着K药一路走下去，他对K药的偏爱引发了一些不满的声音，有分析师认为，对于默沙东这个体量的公司来说，他们有些过于依赖K药了。最终，Perlmutter博士在2020年向默沙东正式递交了辞职申请。“Perlmutter要去哪？”成为了热议的话题。悬念并没有持续太久，转过年来的5月，Roger Perlmutter便宣布加入了一家初创公司并担任首席执行官，将这家名为Eikon Therapeutics的小biotech带入了人们的视野。从Perlmutter博士后续的动作来看，这里俨然成为他下一个“押注职业生涯”的地方。诺奖得主亲自下场Perlmutter博士加入Eikon后，还从老东家默沙东那里挖来了2位重量级的高管。一位是默沙东公司前全球临床开发高级副总裁兼首席医疗官Roy D. Baynes博士，另一位则是默沙东前全球CEO Kenneth C. Frazier。他们于2022年3月份宣布加入Eikon，Baynes博士担任Eikon执行副总裁兼首席医疗官，Frazier则加入Eikon董事会担任独立董事，与Perlmutter博士一起组成了“老默三巨头”。不好意思，放错图了。左：Roy D. Baynes，中：Roger Perlmutter，右：Kenneth C. Frazier此外，默沙东前实验室高级副总裁兼BD主管Benjamin Thorner也跟随Perlmutter博士一同加入了Eikon担任总法律顾问首席商务官，负责监督公司所有的法律事务和交易制定。为何这些行业领袖都甘愿加盟这家初创biotech呢？原因可能很简单，这家公司的创始人——Eric Betzig博士，比他们的行业地位更高。这是一位诺贝尔奖得主。2014年，Eric Betzig博士因在开发超分辨率荧光显微技术方面的突出贡献，而摘得了诺贝尔化学奖的桂冠。图源：诺贝尔奖官网虽然获得的是化学奖，但这荧光显微项技术却显然更适合生命科学的工作。在过去的300多年时间里，光学显微镜都是我们观察微观世界的方法，通过这种方法，我们看到了细胞，认识了微生物。但光学方法能看到的东西是有极限的，由于光具有波动性，光源上的一个点在经过显微系统发生衍射后，会投射成一片区域，这片区域就是常说的分辨率。分辨率的大小与光的波长有关，根据公式计算，其最小值为波长的一半。那么在可见光下，我们通过光学显微镜可获得的最小分辨率就只能达到为0.2微米（200纳米），即阿贝衍射极限，也就是我们能观察到的最小尺寸。这个尺寸已经非常细微，但对于想要微观世界里生命物质的科研工作者来说还远远不够。一些中型病毒的尺寸已经小于0.2微米，蛋白质的大小在20纳米左右，DNA的直径仅为2纳米。有大量的细胞器、蛋白质分子是我们无法用光学显微镜看清的。超分辨率荧光显微技术相较于传统成像技术，将分辨率的极限提高了10~20倍，让我们能够直接观察纳米级的分子，给未来生物技术的应用带来无限可能。这也是Eikon成立的基础。观察！观察！Eikon成立之初的主要工作就是用超分辨率显微镜实时观察细胞中蛋白质的运动，为此，他们甚至动用了CRISPR基因编辑技术对目标蛋白进行荧光标记。Perlmutter博士表示，长久以来，我们关于细胞生物化学的几乎所有知识，都来自冷冻或是固定后的细胞样本，制药界一直没什么工具能观察活体细胞的动态调控机制，我们从来没有真的了解过蛋白质的动态。在这种情况下，Eikon通过将物理学、工程学和机器学习进行结合，以拓展传统的药物发现方法，极大的激起了Perlmutter博士的兴趣。因为这能带来海量的、无法通过常规方法获取的高质量数据。高质量数据对现阶段的药物发现至关重要，有了足够的高质量数据，我们就能搭建精准的模型，并对药物的作用进行预测。那么最高质量的数据是什么呢？无疑是人体试验的数据。但相比于体外试验，人体试验的样本量是有限的，甚至是渺小的，这也是“如何用最小的样本量获取最准确的试验结果”成为临床试验设计的重要课题的原因。Eikon的单分子追踪（SMT）可以打造一种介于体外和人体之间的观测目标——观测选定蛋白质在活细胞中的运动轨迹。目前，他们已经可以将观察尺度缩小到10纳米，观测周期缩短至10微妙。观测以时间为单位，SMT技术会绘制每个单位内的蛋白质运动参数，包括蛋白质的结合率、解离率、跳跃长度、角动量以及其在与靶点结合的持续时间等。来源：Eikon官网目前，在计算机的辅助下，Eikon每周可产生的数据量已经达到1.5PB（1 PB=1024 TB =1048576GB ），预计很快就将达到1PB/天的数据生产量。Perlmutter表示，他们的数据服务可存储约20PB的数据，与很多大型制药公司从成立至今保存的数据量相当。Perlmutter博士认为，现在每一款能改善病情的药物的诞生都是一种奇迹，因为人们对疾病背后的病理原因都没有很深的理解。目前出了几种能治疗单基因遗传病的基因疗法外，所以药物都只能通过弥补病理损害的方式取得获益，是“治标不治本”的方法。通过在药物发现环节引入SMT技术，可以给过去难以成药的靶点构建新的生物学机制，Eikon已经借此催生出了很多项目。这或许是Perlmutter博士愿意在Eikon“押上下一段职业生涯的原因”。2年融资7.75亿美元却开始疯狂License in？即便是在资本寒冬的岁月，Eikon这样的明星Biotech也不缺融资。2021年5月5日，Eikon宣布完成1.48亿美元的A轮融资，领投公司The Column Group，参投公司 包括Foresite Capital、Innovation Endeavors 和 Lux Capital。2022年1月6日，Eikon宣布完成5.178亿美元的B轮融资，此次融资除了首轮参与的4家投资机构外，还增加了13个投资机构，其中不乏General Catalyst、StepStone这样的知名投资机构，以及2家加拿大的政府投资。2023年6月1日，Eikon再次透露了正在进行约1.06亿美元C轮融资的计划。至此，从Perlmutter博士加入之后的2年多时间里，Eikon已经完成超7.7亿美元的融资，投资者争相给钱，对其极为看好。难么，拿到六七亿美元后，Eikon做了什么呢？主要有三件事。第一，平台打造。SMT技术所需的CRISPR基因编辑和蛋白质荧光标记、超分辨率显微镜、分析数据所需的分析软件、自动运行SMT的自动化系统，可存储20 PB的存储器......直接硬件投资相对一般的初创biotech要大很多。第二，扩张团队。根据几篇不同时期的报道，Eikon一直在快速扩张团队。2022年初时，公司已建立了大约100人的团队，而到了2023年6月，公司已经扩张到了350人，其中最大的部分是软件工程师团队，约300人。从人员构成的角度讲，说Eikon是一家AI公司也不为过。此外，他们还计划在今年年底前将团队扩建至460人。第三，大举引进产品。2023年6月1日，Eikon一口气宣布达成3笔交易，其中有2笔是和中国公司达成的合作。具体包括：与英派药业引进就IMP1734及其他PARP1选择性抑制剂签订独家授权及合作协议，获得除大中华区以外所有区域内独家开发、生产和商业化的权利。从博笛生物（Seven and Eight Biotherapeutics）引进两款TLR7/8双激动剂项目，分别是BDB001和BDB018 ，获得其全球权利。从Cleave Therapeutics处引进了一系列临床前项目，用于解决蛋白质稳态、DNA损伤修复和染色质重塑的问题。这些功能在肿瘤和神经退行性疾病中有重要意义。这波操作让Eikon一下子多了2款临床阶段的产品和1款即将进入临床阶段的产品，这步操作可能会让一些人大跌眼镜。作为一家致力于改变药物发现流程、靶向不可成药靶点，坐拥诺奖得主、K药教父和一众顶级制药界领袖的biotech，在2年融到7亿多美元后，一口气引进了4款产品，确实会有一种“挂羊头卖狗肉”的嫌疑。Eikon是怎么想的呢？把技术用在合适的地方对于License in的行为，Perlmutter博士给了一段意味深长的解释：对Eikon来说，蛋白质追踪技术确实是一件利器，可以帮助我们很好的发现药物靶标，并构建内部管线。但Eikon的成立却并非是为了单纯的商业目的，公司的目标是帮助项目更好的推进，无论这个项目是否来源于公司内部。我们希望能在合适的开发阶段，将我们的技术恰当的用在药物上以便其最终得以商业化。我们的业务并非售卖“一技之长”。这段话读着似懂非懂，不过结合当下创新药开发的全球环境，我们大致能感受到Perlmutter博士的意思。对于药企或者研发人员来说，做源头创新是诱人的，但对整个医疗环境来讲，却未必是最优解。源头创新的好处是竞争小，但费时费力，凭一家之力很难在每个环节都做到最优，并开发出一款完美的药物，失败的几率很高。根据前人的经验，开发me better的产品是一个不错的选择，但现在全球药企数量与日俱增，同靶点的项目层出不穷，资源的无谓消耗也在增加。如果能把两者结合起来或许会更好。通过多方合作、各展所长的方式，把较为创新的产品做到尽量极致完美，既避免了资源的无谓消耗，又增加了创新药的成功率。对Eikon来说，他们的蛋白质追踪技术既可以用来开发新靶点，也可以用来筛选、优化药物分子。如果仅留作自用，未免太浪费。合作共赢，对自己，对合作方都是极具吸引力的选择。在今年的JPM周上，Eikon与超过30家生物技术公司进行了会面，每家公司都在尽力向Eikon推荐他们的产品。看Eikon最终引进的项目，都具有独特的创新性。选择性PARP1抑制剂可能会规避此前PARP抑制剂同时阻断PARP1/2导致的毒性，TLR7/8则是新一代免疫调节剂，在与PD-(L)1的联用上展现了不错的潜力。目前这两个赛道，都没有产品获批上市。结语手握“制药屠龙刀”的Eikon，选择了“独乐乐不如众乐乐”，Perlmutter博士表示，公司没兴趣围绕这些新技术修建护城河，这些设备对整个世界都很重要！Come one，call all，把大家都叫过来吧！他们甚至准备开发一种操作更简单，对用户更友好型的实验室台式版蛋白追踪设备，以便其他公司有朝一日可以使用。这种无视竞争，乐于分享的精神，或许正是科学进步的重要推动力。参考资料：1. The Startling History Behind Merck's New Cancer Blockbuster2.如何变革生物医药研发生产力？| 药明康德全球论坛实录3.https://www.fiercebiotech.com/biotech/eikon-goes-prodigy-biotech-clinical-stage-buyer-flash-platform-remains-beating-heart4.https://endpts.com/roger-perlmutters-eikon-signs-three-licensing-deals-raises-106m-in-series-c-tranche/5.专栏 | 面壁十年图破壁——诺贝尔化学奖得主埃里克⋅贝齐格（Eric Betzig）博士的传奇故事6.其他公开资料华盛顿病人之后，越来越多阿尔茨海默病患者的感人故事被分享！点击阅读原文，与药时代一起快乐学习！

Eikon Therapeutics has tacked on a handful of new assets through dealmaking as it continues to add nine-digit fundraising hauls. Eikon Therapeutics emerged with the promise of Nobel Prize-winning molecule tracking technology. But now, CEO Roger Perlmutter, M.D., Ph.D., and co. are using their more than $600 million war chest for something else: buying up clinical-stage drugs.  The biotech's leaders—many coming from Perlmutter's former haunt Merck & Co.—didn't have to work hard to find the right projects, despite keeping its internal ambitions close to the vest. Eikon took meetings with more than 30 companies at this year's J.P. Morgan conference in San Francisco with many clamoring to strike up partnerships.  “It is clearly a buyer's market,” said Perlmutter, wryly, in an interview with Fierce Biotech. And buy, Eikon has. In the biotech's most significant splash since raising more than $600 million in two financing rounds, more than four drugs will be brought in, building a clinical pipeline in the process. It's as if Eikon threw a surprise birthday party for its J.P. Morgan guests, rather than the other way around. In keeping with the biotech's buttoned-up public persona, Perlmutter is not disclosing financial terms, but described the prices as “fair in today's environment.” He described Eikon as a company with the competitive makeup to take the baton from biotechs that simply didn't have the resources to pursue their own projects. That's been a huge theme for biotech this year, as companies try to offload assets to save themselves and prioritize more streamlined pipelines.   "As you can imagine, people were willing to work with us on terms that we thought were very favorable," he said.  And what would an Eikon announcement be if it didn’t include news of additional cash inflow? The company is adding $106 million in series C funds, a fraction of the $518 million series B closed in January 2022, though Perlmutter says this is just the first tranche and more is coming. He acknowledged that this has been a more difficult funding environment than the first two rounds, but that closing the first stage now gave the company enough funds to pay for early clinical development of its new assets. “It was a window of opportunity because people were eager to come in now and they might not have been eager to come in later,” he said. “So let's do it now.”   A brand new pipeline   Leading the haul for Eikon are global rights to two toll-like receptor 7 and 8 agonist immune modulators from Seven and Eight Biopharma, BDB001 and BDB018, respectively. BDB001 is in a phase 2 trial for solid tumors as both a monotherapy and combo treatment alongside anti-PD-1 or anti-PD-L1 treatments. BDB018 has been touted as Seven and Eight's “next generation” agonist, but recruitment in a phase 1 trial has continued for almost two years and remains ongoing, according to the clinical trial record.  Eikon will also take hold of ex-greater China rights to a PARP inhibitor from China-based IMPACT Therapeutics called IMP1734. The two companies plan to ask the FDA to enter into human trials in the third quarter of this year. Eikon will also collaborate with IMPACT on a second brain-penetrant PARP inhibitor but did not specify which one.   The cherry on top is a “suite of preclinical compounds” from Cleave Therapeutics. Like the other two deal announcements, financial details were not included. Cleave has disclosed one preclinical VCP/p97 to treat neurodegeneration, though a specific disease area has not been declared.  So just like that, Eikon goes from zero clinical prospects to three. Financing aside, Perlmutter attributes Eikon's clinical preparedness to the credibility of Roy Baynes, Ph.D., the chief medical officer who was plucked from Merck last year. Baynes brought on Kevin O’Brien to lead clinical operations after more than 13 years at Gilead and then tacked on Harry Raftopoulos, M.D., as senior vice president of clinical research and head of oncology. Raftopoulos worked with Banes and Perlmutter at Merck before spending five years at Bayer.  “We built up every aspect of the leadership team in clinical development including head of regulatory, safety, biostatistics, all aspects of the clinical operations, ” said Perlmutter. “And we're moving along just as fast as you can imagine.”  So what about that internal pipeline—which Eikon said would be developed using super-resolution fluorescence microscopy for drug discovery? The company’s top internal compounds are in the lead optimization stage, according to Perlmutter, roughly 18 months to two years away from the clinic. He did not provide a timeline for formally unveiling the compounds but said the company is “making good progress." Eikon previously said its first programs would focus on oncology, immunology and neurodegenerative diseases.   Meanwhile, Eikon is accruing massive amounts of data, derived from the company’s single molecule tracking technology that allows the tracking of behavior and movements of individual proteins in a cell. That results in a lot of data—roughly one and a half petabytes every week, or 1.5 million gigabytes. Perlmutter says the largest team in the company of roughly 300 people are software engineers that are using machine learning to help manage all of this information. Even though the tracking technology serves as a potential boon in terms of target discovery and ultimately internal pipeline creation, Perlmutter says the company is not here to sell.  “Our goal is to advance programs into development, whether they come from others or come from us, to apply our tools to them at every stage as appropriate, and to ultimately commercialize those programs,” he said. “We're not in the business of selling those things that we do so well.” He did say, however, that Eikon is working on a user-friendly lab benchtop version of the tracking technology that other companies could someday access.