Elevated milk replacer (MR) feeding supports early-life growth in dairy calves but may increase the biological complexity of weaning by shifting calves from milk-derived intestinal nutrient absorption to solid-feed-dependent gastrointestinal maturation. Bile acids (BA) are involved in lipid digestion, enterohepatic cycling, gut-liver signaling, and host-microbial interactions; however, their trajectories during weaning under high-MR feeding systems remain poorly characterized. This companion study evaluated whether plasma BA profiling reveals metabolic remodeling during weaning in calves subjected to different weaning durations. Twenty Holstein calves, including 10 males and 10 females, received MR ad libitum from wk 1 to 7, were standardized to 12 L/d at wk 8, and were assigned to either a 3-wk or 6-wk step-down weaning protocol, with 10 calves per treatment. Both protocols included a final week at 2 L/d before complete MR withdrawal. Plasma samples were collected at calf age wk 10, 13, and 16, representing protocol-dependent stages of the weaning transition and early postweaning period. Bile acids were quantified using targeted liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Individual BA were analyzed using repeated-measures mixed models, and global BA profile structure was evaluated using multivariate analyses. Plasma BA profiles were remodeled primarily across sampling week rather than by weaning duration as a broad treatment effect. The most consistent response was a decline in taurine-conjugated BA, including taurocholic acid, taurolithocholic acid, taurodeoxycholic acid, taurochenodeoxycholic acid, and tauromuricholic acid, from wk 10 to wk 16. In contrast, selected non-taurine BA contributed more strongly at later sampling points. Glycocholic acid increased from wk 10 to wk 13 and remained elevated at wk 16, whereas glycoursodeoxycholic acid declined after wk 10. Cholic acid, deoxycholic acid, and chenodeoxycholic acid showed weaning duration × sampling week interactions, indicating that the 3- and 6-wk protocols modified the temporal kinetics of selected BA species without producing a broad treatment-wide shift in the total measured plasma BA pool. Total measured plasma BA concentration did not differ by weaning duration or sampling week, suggesting that temporal remodeling was driven mainly by changes in individual BA species rather than by a broad shift in total circulating BA abundance. Multivariate analyses confirmed progressive separation of plasma BA profiles across wk 10, 13, and 16, with wk 13 occupying an intermediate position. Overall, these results show that circulating BA profiles capture a previously underexplored component of weaning physiology in calves fed elevated MR allowances, linking the transition from milk-derived lipid digestion to solid-feed-associated gastrointestinal and enterohepatic maturation.

2026-06-05·JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

The Combination of Machine Learning and Metabolomics for the Clinical Diagnosis of Hepatocellular Carcinoma

Article

作者: Li, Yi-Ning ; Wang, Shan ; Cheng, Kang ; Chang, Zhen-Peng ; Yin, Yue ; Cao, Lin-Lin ; Zhao, Yu-Shang

The early diagnosis of hepatocellular carcinoma (HCC) lacks biomarkers with a high sensitivity and specificity. This study was to find sensitive and specific diagnostic markers for HCC by analyzing the imbalance of serum metabolites in patients with HCC. Nontargeted and targeted metabolomic analyses were used to explore dysregulated metabolites, and many bile acids (such as DCA, GUDCA, GCDCA, GCA, TCDCA, TDCA, TCA, LCA, and TUDCA) and steroid hormones (such as DHEAS, DHEA, Aldo, Cortisone, and 18-OHF) were found to be dysregulated in HCC. A machine-learning model based on bile acids and steroid hormones was constructed using XGBoost to distinguish HCC from normal controls (NC), patients with chronic hepatitis B (CHB), and patients with metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD). We found that the levels of bile acids and steroid hormones in HCC patients were disturbed compared with NC, CHB, and MASLD patients. The XGBoost model showed strong diagnostic ability in the internal test subset of the training cohort (AUC = 0.876) and was verified in an independent test cohort (AUC = 0.813). It exhibited good diagnostic performance in the detection of early-stage and small-size HCC (AUC = 0.896 and AUC = 0.830) and performed better than the classical biomarker alpha-fetoprotein (AFP). In conclusion, our study established a novel XGBoost model based on bile acids and steroid hormones and might be helpful for the early diagnosis of HCC.

2026-06-01·CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS

Causal Effects of Hydrophilic Bile Acids on Carfilzomib‐Related Cardiovascular Events in Multiple Myeloma: A Mendelian Randomization Study

Article

作者: Eric Farber-Eger ; Qing Lu ; Quinn S Wells ; Michael G. Fradley ; Samia Shabnaz ; Kenneth H Shain ; Neyousha Shahisavandi ; R. Frank Cornell ; Rachid C. Baz ; Daniel Lenihan ; Yan Gong ; Mohammed E. Alomar ; Marwa Tantawy ; Timothy J. Garrett ; Danny DeAvila ; Samuel M. Rubinstein

Carfilzomib is highly effective in the treatment of multiple myeloma, but it has been associated with cardiovascular adverse events that impact patient outcomes. Our prior global metabolomic analyses indicated an association between hydrophilic bile acids and carfilzomib‐cardiotoxicity risk, although a causal relationship remained to be determined. Here, our objective was to validate the previously identified bile acids in an independent cohort and investigate whether these hydrophilic bile acids play a causal role in carfilzomib‐cardiotoxicity using Mendelian randomization. Using targeted metabolomics, we validated the association between glycoursodeoxycholic acid and carfilzomib‐cardiotoxicity in an independent cohort ( n = 61). We then performed two‐sample Mendelian randomization analyses, using metabolome‐wide association study results to provide the genetic instruments for bile acid levels as exposure and genome‐wide association study summary statistics from the UK Biobank ( n = 484,598) as the outcome data for cardiovascular adverse events. Causal inference was assessed with the inverse‐variance weighted method, followed by multiple sensitivity analyses. Higher glycoursodeoxycholic acid concentration (odds ratio = 0.34, P = 0.032) was associated with lower cardiotoxicity risk after adjusting for hypertension and high levels of brain natriuretic peptides. Mendelian randomization analysis demonstrated a robust causal effect of glycoursodeoxycholic acid on cardiotoxicity risk (β = −0.00065, P = 6.2 × 10 −5 ). Gene enrichment analysis indicated pathways involving potassium channel regulation and thromboxane signaling to be implicated. This integrative metabolomic and genetic investigation supports a potential protective role of glycoursodeoxycholic acid in cardiovascular vulnerability and motivates larger, carfilzomib‐specific studies to evaluate its utility for risk stratification.

项与 Glycoursodeoxycholic Acid 相关的新闻（医药）

2026-08-13

·柠檬生信

IF45.8！十年磨一剑！湘雅院长雷光华“国自然+代谢组+宏基因组”斩获《Science》！

点击蓝字，了解更多柠檬生信酸了代码，甜了科研引言 INTRODUCE 生信树结生信果，生信果连你和我！大家好，我是柠檬🍋。 🧠全球5.95亿人受困于骨关节炎，但目前没有任何药物能延缓软骨退变。 👨🎓中南大学湘雅医院院长雷光华团队这篇《Science》最让我佩服的不是实验量，而是他们敢把OA从“机械磨损”拽出来，重新定义为“肠道信号失调”的产物。 👀这个视角转换，比单纯筛药高了一个维度。而且他们从人群代谢组出发，一路打到菌群、干细胞、真实世界数据，每个环节都做干净了——相比之前耿同学锤的那篇数据存疑的《Nature》子刊，这份严谨确实配得上“十年磨一剑”。文献解读 ARTICLE Interpretation 文章题目：通过GLP-1介导的肠道-关节轴进行骨关节炎治疗，可靶向肠道FXR信号通路发表时间：2025年4月4日影响因子：45.8 01 研究背景骨关节炎（OA）尚无疾病修饰药物。既往提示肠道菌群失调与其相关，但功能性的肠-关节轴是否存在尚未证实，胆汁酸代谢在其中的作用也不明确。 02 研究目的本研究旨在证实肠-关节轴存在并探索靶向FXR治疗OA的可行性。 03 研究方法 1.数据样本：人群队列：纳入2个独立队列共1868例开展血浆胆汁酸靶向代谢组检测，981例开展粪便宏基因组测序；英国IQVIA数据库：构建5972例队列验证UDCA获益；验证队列：采集40例配对样本测FGF19、GLP-1水平。 2.组学分析：靶向代谢组学：UPLC-MS/MS定量血浆/回肠胆汁酸谱，比较OA vs. 对照，并与KL分级、疼痛、关节间隙狭窄、骨赘等OA严重程度指标做回归关联。鸟枪宏基因组：MaAsLin2做物种水平→OA表型关联；再与BA指标做偏Spearman相关，锁定 Clostridium bolteae为关键菌。多组学交叉：将胆汁酸代谢组数据与肠道菌群宏基因组数据进行关联分析，构建"菌种—代谢物—表型"的关联网络。图解摘要思路解析 Results Interpretation 01 临床发现：锁定关键代谢物GUDCA 团队先做了两件扎实的事。发现队列1700多人，验证队列150多人，对血浆做了靶向胆汁酸代谢组学【图1A】。结果很干净：骨关节炎患者血液中的GUDCA水平显著低于健康对照，而且GUDCA越低，关节损伤越严重，包括KL分级、关节间隙狭窄、骨赘大小和疼痛评分都呈现出一致的趋势【图1D-E】。这个结果在两个独立队列里都站住了。图1.基于自然人群对骨关节炎患者胆汁酸代谢特征的分析柠檬评判：代谢组学最怕批次效应和样本降解，能在两个不同时间、不同人群的队列里重复出同一个结果，至少说明他们的样本处理和LC-MS方法开发是极其靠谱的。 02 动物验证与机制深挖有了人群关联，下一步是因果验证。团队在两种OA小鼠模型里口服GUDCA，8周后软骨退化明显减轻，OARSI评分显著降低，骨赘形成也减少了【图2B-G】。动物实验这块我想多说一句。口服给药后还要检测肠道内容物里的胆汁酸谱，这个操作窗口非常窄。收集小鼠肠道内容物是个“手速活”——处死后要迅速分离肠道分段，挤出内容物，液氮速冻。时间稍微拉长一点，菌群的代谢活动就变了，胆汁酸数据就不准了。他们能在给药后稳定检测到肠道内GUDCA和TUDCA显著升高，说明整个实验的操作流程控得很死。图2.GUDCA通过拮抗肠道FXR信号素来延缓骨关节炎的进展 GUDCA是怎么起效的？团队一步步往下挖。体外AlphaScreen实验证实GUDCA是FXR的拮抗剂，IC50为67.5μM【图2J】，且GUDCA不激活TGR5【图2I】。更有说服力的是遗传学证据：在小鼠肠道特异性敲除FXR后，不给药，关节炎本身就好转了【图2O-P】。而在敲除鼠里再给GUDCA，没有额外的保护效果【图2Q-R】——这说明FXR就是这个通路里的核心靶点，GUDCA就是通过抑制它来起效的。图2.GUDCA 通过拮抗肠道 FXR 信号素来延缓骨关节炎的进展柠檬建议：他们直接选了一个参考剂量，虽然有文献依据，但如果补一个剂量-效应曲线，数据会更扎实，也为后续临床转化提供更直接的参考。 03 信号传递：GLP-1是那个跑腿的信使肠道的事搞清楚了，那信号是怎么传到膝盖的？原来FXR被抑制后，肠道干细胞会分化出更多L细胞，这些L细胞大量分泌GLP-1进入血液【图3A-C】。而关节软骨和滑膜上恰恰有GLP-1的受体（GLP-1R）。为了证明GLP-1确实是那个“传话的”，团队做了一个极精巧的阻断实验：在关节腔内局部注射GLP-1R拮抗剂exendin 9-39，结果GUDCA的保护作用被完全抵消了【图3P】。反过来，直接关节内注射GLP-1受体激动剂利拉鲁肽，软骨就能得到保护【图3S】。这个实验设计给我最大的启发是“局部阻断”的思路。过去我做的组织间通讯研究，要么全身敲除要么外周给药，很难精确定位信号在哪一站发挥作用。直接把拮抗剂打进关节腔——简单、直接、成本低，但能干净地回答“GLP-1是不是在关节本地起效”这个问题。这个实验技巧值得借鉴。图3.肠道Fxr基因敲除通过增加表达GLP-1的肠上皮细胞（EECs）数量并促进GLP-1分泌，从而缓解骨关节炎（OA）柠檬评判：说实话，看到这个实验设计的时候我是真觉得漂亮。因为在小鼠膝关节腔里做局部注射，操作难度极高。关节腔体积大概只有几微升，针尖偏一点就打进肌肉或韧带里了，数据就废了。 04 菌群溯源：谁在制造GUDCA？既然GUDCA在患者体内减少了，那上游是谁在调控？团队对981份粪便做了宏基因组测序，锁定了一种叫Clostridium bolteae的细菌【图4C】。这种菌的丰度与GUDCA水平正相关，在OA患者肠道里明显减少【图4A-B】。但光有相关性不够，必须做功能验证。研究者把C. bolteae定植到小鼠肠道，结果UDCA（GUDCA前体）水平升高【图4F】，FXR靶基因FGF15表达下降【图4J】，GLP-1阳性L细胞增多【图4L】，关节炎也缓解了【图4O】。从临床关联到菌群鉴定再到功能回补，这个链条每一步都做了，没有跳步。图4.C. bolteae是肠道连接通讯中促进 UDCA 物种产生的关键肠道微生物柠檬评判：这里面最费工夫的应该是细菌定植实验——无菌鼠或抗生素清除背景后再单菌定植，周期长且定植效率不稳定。能把这套完整跑下来，实验设计和执行都相当扎实。 05 转化价值：老药新用研究的最终目的是造福患者。团队发现UDCA（熊去氧胆酸，一个FDA早已批准用于原发性胆汁性胆管炎的药物）是GUDCA的前体。给小鼠口服UDCA后同样能通过FXR-GLP-1轴有效改善OA。最重磅的来自真实世界数据：在近6000人的英国医疗数据库里，UDCA新使用者的膝关节置换风险比非使用者低了54%【图5J】。读到这个HR=0.46的时候，我是真的想鼓掌。为什么？因为老药新用的最大价值在于安全性已知、转化周期短。UDCA用了40多年，不良反应谱很清楚，这意味着如果后续临床试验顺利，可以直接进入疗效验证阶段，不用从头做毒理学和安全性摸索。图5.UDCA 通过肠道-关节轴缓解了小鼠骨关节炎（OA）的进展，并与人类OA相关膝关节置换术风险降低相关柠檬评判：当然，观察性研究无法完全排除混杂因素。但动物机制与人群数据相互印证，UDCA作为一个安全性已知的老药，进入骨关节炎临床试验的成本远低于新药研发。这恰恰是“老药新用”策略的核心价值所在。抄作业 Method reference 第一步：临床差异入手。不需要一上来就死磕机制，先找患者和健康人之间稳定存在的差异分子或差异菌群。代谢组学+宏基因组学联用，是目前性价比最高的筛选策略。第二步：正反双向锁死靶点。发现差异后，用激动剂和抑制剂（或基因敲除）两条腿走路，避免假阳性。第三步：把“器官间通讯”拆成可验证的单元。激素入血、远端受体结合、局部阻断——每一步都要单独验证。第四步：寻找已上市的可替代物。你的靶点或代谢物未必能直接成药，但找到结构类似或处于同一通路的已获批药物，转化路径会短很多。柠檬有话说 SUMMARY 本研究首次完整阐明 “C. bolteae — GUDCA — 肠道FXR — L细胞增殖 — GLP-1 — 关节GLP-1R” 的肠-关节轴，将OA从局部退变疾病提升至系统代谢调控层面。同时也给“老药新用”提供了一个教科书级别的示范。如果后续临床试验能跑通，那真的可以改写骨关节炎的治疗格局。注：本篇为个人读文献笔记，非官方解读。涉及实验细节以原文及补充材料为准。点分享点收藏点在看点点赞

2026-08-12

·生信速通

IF47.3！中南大学团队【宏基因组测序→代谢组】双验证解锁肠-关节治疗通路，力登《Science》刊！

引言 💡肠道菌群居然能直接调控膝盖软骨病变？今天这篇顶刊重磅工作彻底刷新关节炎认知，中南大学湘雅医院联合中科院上海药物所团队，依托大队列人群代谢组、宏基因组、基因编辑小鼠、药物临床真实数据多重验证，完整打通肠道胆汁酸-FXR-GLP-1调控通路，找到了老药UDCA治疗骨关节炎全新机制，下面完整拆解全文核心逻辑。宏基因组测序、多组学、机器学习冲刺高分医学文章无头绪？生信速通专属方案带你理清发文思路，轻松搞定高分医学发文~ 26年全套生信发文套路整理就绪，后台可领取 👇认准生信速通，吃透高分生信SCI密码参考文献研究亮点>> 🔵老药新用落地临床 UDCA为FDA成熟上市药物，安全性佳；真实大队列证实其可减少膝关节置换风险，省去新药研发周期，转化潜力巨大。 🔵多层证据闭环验证双人群队列、基因编辑小鼠、菌群干预、GLP-1药物回补、上万份临床数据库交叉佐证，结论扎实可靠。 🔵开创口服治疗新方向传统疗法以关节注射为主，该研究证实靶向肠道FXR口服给药就能远程保护软骨，为骨关节炎口服改良药物开辟全新思路。 01 研究背景 📝骨关节炎堪称中老年 “致残头号元凶”，全球近6亿人饱受关节疼痛折磨，目前没有能逆转软骨损伤的特效药。过往只模糊知道肠道菌群和关节毛病有关，但没人摸清中间完整信号链条，菌群、代谢物到底怎么远程影响膝关节，一直是空白，这篇研究把整条肠 - 关节调控通路完整做实。 02 研究方法 📌靶向代谢组学两大队列超1800份血浆胆汁酸样本批量检测，快速锁定GUDCA是骨关节炎关键差异代谢物，精准关联疾病轻重程度。 📌粪便宏基因组测序近千份人群粪便菌群全景解析，定位产UDCA关键菌Clostridium bolteae，搭建菌群 - 胆汁酸关联网络。 📌多组学联合分析（代谢组+宏基因组）多维数据交叉验证，从人群层面建立 “菌群 - 胆汁酸 - 骨关节病变” 因果关联，避免单一组学假阳性偏差。 📌机器学习（MaAsLin2多元线性回归）优势：校正年龄、BMI等混杂因素，筛选与骨关节炎强相关的差异菌种、胆汁酸指标，降低人群混杂干扰。 📌细胞/类器官测序（肠道类器官、原代软骨细胞转录检测）体外直观验证FXR对肠道干细胞、L细胞的调控作用，补充人体队列无法开展机制实验的短板。研究结果 1 在两个独立队列中，鉴定出与骨关节炎（OA）相关的BA代谢改变，其特征为GUDCA值降低 📌队列设计 1714人发现队列、154人验证队列，依据KL分级划分OA患者与对照 OA人群年龄、女性占比、BMI显著偏高 📌胆汁酸检测结果 OA患者UDCA家族胆汁酸水平显著降低 GUDCA、TUDCA与OA患病风险负相关，为核心差异标志物 UDCA相关比值下降、初级胆汁酸比值升高提示病情加重 GUDCA越低，关节病变、疼痛等OA症状越严重图1 基于自然人群的骨关节炎（OA）患者BA代谢谱分析 2 GUDCA通过拮抗肠道FXR信号通路，延缓了骨关节炎（OA）的进展 📌排除TGR5受体通路细胞实验：GUDCA无法激活TGR5下游cAMP信号动物敲除验证：Tgr5敲除小鼠中GUDCA仍能保护关节，药效不受影响 📌基因敲除最终佐证肠道特异FXR激动剂给药会加重软骨损伤肠道Fxr敲除小鼠OA自发减轻；敲除后GUDCA无治疗效果结论：GUDCA通过抑制肠道FXR缓解骨关节炎图2 GUDCA通过拮抗肠道FXR信号通路，延缓了骨关节炎（OA）的进展 3 肠道Fxr基因敲除可通过增加表达GLP-1的肠内分泌细胞数量并促进GLP-1分泌，从而缓解骨关节炎（OA） 📌GLP-1远程作用膝关节 GLP-1仅在肠道生成，经血循环抵达关节，软骨、滑膜均表达GLP-1R。关节注射GLP-1拮抗剂，可抵消GUDCA、肠道FXR敲除的护软骨效果。 GLP-1激动剂利拉鲁肽局部给药，直接减轻软骨损伤，体外可上调软骨合成、抑制降解。 📌人群数据库佐证合并糖尿病的OA患者使用GLP-1激动剂，膝关节置换风险显著下降（HR=0.73）。 📌完整轴结论确立通路：GUDCA抑制肠道FXR→肠道干细胞增殖、L细胞增多→循环GLP-1上升→激活关节GLP-1R，缓解骨关节炎。图3 肠道Fxr基因敲除可通过增加表达GLP-1的EECs数量并促进GLP-1分泌，从而缓解骨关节炎（OA） 4 C. bolteae是肠道-关节通讯过程中促进UDCA物种产生的关键肠道微生物 📌人群菌群测序 981人粪便宏基因组显示OA菌群结构紊乱；致病特征为C. bolteae丰度大幅下降，且该菌与保护型胆汁酸GUDCA高度正相关。 📌菌株功能 C. bolteae与已知UDCA合成菌同源性98%，具备生成UDCA的能力。 📌动物定植实验小鼠补充C. bolteae后体内UDCA升高，抑制肠道FXR、提升GLP-1，显著减轻软骨损伤。图4 C. bolteae是肠道-关节通讯过程中促进UDCA物种产生的关键肠道微生物 5 UDCA ，一种经FDA批准的FXR拮抗剂，通过肠道-关节轴机制缓解了骨关节炎的进展 📌UDCA药物基础特性 FDA上市老药，可转化为强效FXR拮抗剂GUDCA，长期用药安全性高为GUDCA前体，理论上具备骨关节炎干预潜力 📌小鼠药效实验 DMM、老年自发OA小鼠口服UDCA，软骨损伤、骨赘显著减少，肠道保护信号上调肠道特异FXR敲除后，UDCA护关节药效完全消失，药效依赖肠道FXR通路图5 UDCA能通过小鼠的肠道-关节轴缓解骨关节炎（OA）的进展，并与人类中骨关节炎相关膝关节置换术的风险降低存在关联文章小结 ⭕简单说这篇Science讲透了一条跨器官治病新路子：肠道细菌生成胆汁酸，压住肠道FXR后身体会多分泌GLP-1，顺着血液跑到膝盖保护软骨，现成老药UDCA就能激活这条通路，大幅降低重症换膝概率。但研究仍存在短板：仅聚焦胆汁酸单一通路，肠道其他代谢物对关节的影响未挖掘队列以中老年人群为主，年轻骨关节炎患者数据不足仅动物层面验证肠道干细胞调控，缺少人体肠道组织原位实验，后续还需开展前瞻性临床对照试验确认UDCA长期疗效。如果你也想做宏基因组测序、多组学、机器学习生信发文，快速落地高分发文思路，欢迎后台咨询，生信速通一站式帮你搞定！今天的高分医学干货就先分享到这里～有想拆解的顶刊思路、想解决的发文难题，汇总26年成熟易落地的发文思路，需要的小伙伴后台留言即可领取！声明：以上内容是我个人解读生信文献的思路整理，仅用于学习交流与自我总结，并非专业权威解读。若出现理解偏差或专业错误，欢迎大家留言指正交流！下方查看历史分享 IF28.4！多校强强联合「表观多组+单细胞AI算法」破译胃癌肝转移关键通路，拿下双1区TOP！IF109！GBD 2023仅四图一表再登《柳叶刀》！IF18.1！复旦大学郁金泰团队【多组整合→SHAP→MR】完整图谱，纯生信发表《Nature》子刊！

2026-07-30

·生信客

IF47.3！中南大学湘雅医院院长雷光华团队凭”多组学“拿下《Science》正刊！打通肠-关节通路！

点击上方蓝字关注我吧！生信客 Bioinformatics passenger 骨关节炎病根居然藏在肠道里！一条肠道 - 关节通路被完整证实，给关节痛治疗开辟全新路子！ ✅ 目前全球近 6 亿人受骨关节炎折磨，还没有能逆转病情的特效药，肠道菌群和关节病变的关联一直只有零散猜想。 ✅ 中南大学湘雅医院从胆汁酸、肠道受体、肠道激素、特定肠道菌层层拆解，摸清整条调控链条，还找到了已上市老药可复用治疗。 ✅ 一起剖析背后的思维框架与内在逻辑吧~ 想做数据分析？锁定生信客，每天分享高分文献，手把手教你创新选题，定制思路，全面数据分析！第一时间投稿抢发，锁定领域首发优势！需要的快关注我们后台咨询吧 01 研究亮点 02 研究创新 ● 机制创新证实 FXR 经肠道干细胞调控 GLP-1，更新原有通路认知。 ● 论证创新关节阻断实验直接验证 GLP-1 为肠 - 关节传导介质。 ● 菌群创新首次明确C.bolteae是UDCA合成关键肠道菌。 ● 转化创新多维度证据支撑 UDCA 可用于骨关节炎治疗。如果你也想用“多组学+基因敲除”进行生信分析，快点击上方名片，联系”生信客“后台咨询吧！专注于数据挖掘，选题分析，方案评估，高分文献思路复刻! 文献解读 03 研究背景全球超 5.95 亿人受骨关节炎困扰，至今没有能逆转软骨损伤的特效药。早前仅发现肠道菌群和关节病变相关，可完整、可干预的肠 - 关节调控通路始终未被证实。 04 研究方法人群多组学分析 ● 代谢组：1868 人双队列血浆胆汁酸靶向检测，关联 OA 病情 ● 宏基因组：981 人粪便测序，筛选差异菌C. bolteae ● 真实世界数据库：5972 人队列分析 UDCA 置换风险，配套血浆 GLP1/FGF19 检测 ● 多元回归、菌群关联统计模型动物实验 ● 构建 DMM / 老年 OA 小鼠； ● 使用 Fxr、Tgr5 基因敲除鼠； ● 药物 / 菌群关节干预，组织病理与胆汁酸检测。体外细胞 / 类器官 ● 肠道类器官、软骨原细胞培养； ● AlphaScreen、cAMP 体外通路验证。分子检测 ● qPCR、原位杂交、Western blot 检测相关基因与敲除效率。 05 研究结果人群胆汁酸与菌群差异 ● 1868 人双队列代谢组显示，骨关节炎患者血浆 GUDCA 显著降低，且含量和关节损伤程度负相关。 ● 981 份粪便宏基因组证实患者C. bolteae丰度下降，该菌与 GUDCA 呈最强正相关。基于自然人群对骨关节炎患者BA代谢特征的分析 GUDCA 通过肠道 FXR 缓解关节退变 ● 小鼠灌胃 GUDCA 可减轻软骨磨损、减少骨赘形成。 ● 体外实验证明 GUDCA 为 FXR 拮抗剂，作用不依赖 TGR5 通路。 ● 肠道特异性 Fx 敲除后，GUDCA 无保护效果，证实靶点为肠道 FXR。 GUDCA 通过拮抗肠道 FXR 信号通路来延缓骨关节炎的进展。 FXR 调控肠道干细胞提升 GLP-1 ● 抑制肠道 FXR 促进 Lgr5 干细胞增殖，增多分泌 GLP-1 的 L 细胞。 ● 关节仅表达 GLP-1 受体，无 GLP-1 合成细胞；阻断关节 GLP-1R 会抵消 GUDCA 疗效。 ● 关节腔注射 GLP-1 激动剂利拉鲁肽，直接延缓软骨降解。肠道Fxr基因敲除通过增加表达 GLP -1的肠上皮细胞（EECs）数量并促进 GLP -1分泌，从而缓解骨关节炎（OA）。 C. bolteae 重塑胆汁酸改善骨关节炎 ● 小鼠定植C. bolteae后体内 UDCA 升高，抑制肠道 FXR、提升 GLP-1，减轻关节病变。 C. bolteae是肠道连接通讯中促进 UDCA 物种产生的关键肠道微生物。上市药 UDCA 具备护关节作用 ● 小鼠口服 UDCA 可激活肠 - 关节通路，缓解骨关节炎。 ● 5972 人真实世界队列显示，长期使用 UDCA 人群膝关节置换风险更低。 UDCA 通过肠道-关节轴途径缓解了小鼠的骨关节炎（OA）进展，并与降低人类OA相关膝关节置换手术的风险相关。完整调控通路总结 ● 明确C. bolteae→UDCA/GUDCA→肠道 FXR→GLP-1→关节功能性肠 - 关节轴。 06 文章小结总体来看，这项研究完整证实了肠 - 关节调控通路，明确胆汁酸、菌群、FXR 与 GLP-1 的联动机制，UDCA 老药新用也提供可靠临床转化思路，为骨关节炎新药研发打下扎实基础。通过这篇文章我们能学到： ● 先靠大人群多组学筛差异指标； ● 再用基因敲除小鼠做实机制； ● 最后拉真实临床数据验证。从细胞动物到人群层层闭环，不靠单一实验下结论，逻辑特别扎实。声明：本文分享的所有生信思路和实操经验都是我个人学习总结，只用来交流学习、自我复盘，不能当作专业权威科普。如果哪里出现专业错误，欢迎大家评论提醒我。 END 往期回顾： IF41.3！武汉大学中南医院副院长鲁志兵团队就发了心血管顶刊！“GEO+转录组+基因敲除”找到心梗损伤“元凶”ANXA！ IF47.3！复旦郁金泰教授团队就发了《Science》正刊！“UKB+基因敲除”锁定帕金森全新受体！ IF9.4！零实验发柳叶刀子刊！中国疾控慢病中心周脉耕团队靠GBD 2023破解心血管防控难题！ IF8.7！广西医科大学蒋俊俊团队就发了双一区TOP刊！基于LASSO算法构建糖结核不良结局预测列线图！

100 项与 Glycoursodeoxycholic Acid 相关的药物交易

登录后查看更多信息