如果要在近两年的医药圈评选出最火的“明星分子”,抗体药物偶联物(ADC)绝对当仁不让。从井喷的临床试验管线到动辄数十亿美元的授权交易,ADC药物正以前所未有的速度重塑肿瘤治疗格局。这一崛起并非偶然:一方面,随着对肿瘤生物学理解的加深,传统化疗的毒性瓶颈与单抗药物的单药疗效天花板日益凸显;另一方面,以第一三共Enhertu为代表的第三代ADC药物在临床上取得的巨大成功,验证了该技术平台的巨大潜力,引发了资本的涌入与MNC(跨国药企)的巨额交易,推动了整个行业的技术迭代。
然而,耀眼的光芒背后是极高的技术壁垒。与传统的“小分子”或“大分子”药物不同,ADC本质上是一个“跨界混血儿”。它既有抗体的精准靶向性,又背负着小分子毒素的强杀伤力,而维系两者生命的则是至关重要的Linker(连接子)。这种“抗体+毒素+连接子”的三元结构,虽然赋予了它强大的抗肿瘤活性,却也给开发者带来了巨大的挑战。ADC的研发绝不能简单地套用抗体药物的开发模板,因为在偶联之后,分子的物理化学特性、稳定性乃至免疫原性都会发生剧变。因此,ADC的产品开发(尤其是CMC环节)拥有完全不同于传统抗体药物开发的考量维度,例如药物抗体比(DAR)的均一性控制、连接子的稳定性以及偶联工艺的放大等,都是决定其成败的关键。
为了揭开这层神秘面纱,本文将开启一场关于ADC药物研发的“深度游”。我们将按照药物研发的时间轴,从最初的靶点发现、抗体筛选,到核心的Linker与Payload(载荷)构建,再到决定产品能否落地的CMC(化学、制造和控制)工艺,以及不可或缺的临床前研究与临床研究。通过逐层递进的剖析,旨在让读者不仅看到ADC的辉煌现状,呈现一个立体、完整的ADC药物开发图谱,更能洞悉其从实验室到病床背后的科学逻辑与工程挑战。
第一章:ADC药物研发的“精准导航”——靶点与抗体发现
在ADC药物的全生命周期中,靶点发现与抗体发现是决定项目生死的第一道关口。与开发传统单抗药物只需关注“抗体能否结合”不同,ADC药物的“抗体-连接子-毒素”三元结构决定了其开发逻辑必须前置。抗体不仅要充当精准的“导航系统”,其结合后能否被细胞内吞、内吞速率快慢,直接决定了后续毒素能否在肿瘤细胞内有效释放。因此,ADC的靶点评估与抗体筛选,是一个从“虚拟计算”到“实体验证”、从“裸抗性能”到“偶联后功能”的递进式证据链。
通常,这一阶段需要耗时约12-15个月,可细分为靶点评估与验证、抗体产生与初步筛选、抗体工程化与优化三个核心步骤。
1.1 靶点评估与验证:从海量数据中锁定“可成药”靶点
靶点评估并非单一实验,而是一个层层递进的筛选漏斗。其核心在于确认靶点在肿瘤细胞中的特异性高表达、与肿瘤发生发展的密切关联性,以及最关键的内化能力(ADC必须被细胞内吞才能释放毒素)。具体要做三件事:(1)组学筛选与生物学验证:确认肿瘤依赖性和内化能力(ADC 必须被细胞内吞才能释放毒素);(2)可成药性评估:表达丰度、抗原脱落特性、种属交叉;(3)FTO 检索与竞品格局:避开已拥挤的靶点赛道,做自由实施分析。
1.1.1 虚拟初筛与假设生成(In Silico)
在项目启动初期,研发团队首先利用生物信息学手段进行大人群假设生成。通过挖掘TCGA、GTEx、GEO等公共数据库,分析肿瘤组织与正常组织的RNA-seq数据,计算差异表达倍数(Fold Change)。同时,借助Human Protein Atlas (HPA) 查看蛋白水平的IHC表达图谱,并利用DepMap数据库评估靶点的基因必要性(敲除后肿瘤细胞是否死亡)。这一“虚”的步骤解决了群体水平的表达差异问题,极大压缩了后续实验的搜索空间。
1.1.2实体验证与蛋白水平确证以及可成药性分析
公共数据库的数据多为mRNA水平,而“mRNA不等于蛋白,总蛋白不等于细胞表面暴露的抗原”。因此,必须通过实体样本进行验证。
表达谱精确定量:利用商业FFPE肿瘤组织芯片(TMA)进行IHC染色,评估靶标在肿瘤组织的阳性率与染色强度;同时利用靶向质谱(MRM/PRM)和定量流式细胞术(QIFIKIT)对细胞表面抗原拷贝数进行绝对定量。国内头部企业如恒瑞、科伦博泰等,普遍采用“商业TMA初筛 + 质谱/流式确证”的策略。
内化能力评估(ADC特有核心): 这是ADC靶点验证中最具决定性的一环。研发人员常采用pHrodo标记的抗体,通过流式细胞术或共聚焦显微镜实时监测荧光信号增强,以计算内化速率常数(ke)。此外,利用皂草素(saporin)偶联抗体进行功能性内化验证,若抗体能内化,皂草素进入细胞质会杀死细胞,这直接回答了“内化是否能有效释放payload并致死”这一核心问题。
在确认靶点的生物学特性后,需进行可成药性评估,包括跨膜区预测、表位作图、种属交叉反应(为NHP毒理铺垫)以及抗原脱落风险评估。
1.1.3 FTO分析
最后,通过智慧芽等专利数据库进行自由实施(FTO)检索,避开已拥挤的靶点赛道,确保项目的知识产权安全性。
1.1.4靶点评估与验证所需的样本
靶点评估与验证所需的样本主要包括:数据库样本 vs 实体瘤样本,下面介绍一下如何分工与获取。
1.1.4.1数据库样本(虚)
用于"大人群假设生成",特点是样本量大、覆盖广、成本低,但只是 mRNA 或 curated 蛋白水平数据。
核心数据库与获取方式:
•TCGA(https://portal.gdc.cancer.gov/):33 个癌种 6000+ 肿瘤样本,通过 GDC API 程序化下载 RNA-seq 数据
•GTEx(https://gtexportal.org/):5000+ 正常组织样本
•GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/):NRC 从中整理了 >26000 肿瘤 + >8800 正常样本的同平台微阵列数据
•Human Protein Atlas(https://www.proteinatlas.org/):蛋白水平的 IHC 表达谱,可通过 XML 接口程序化抓取
•UniProt / ENSEMBL:蛋白序列、跨膜区、亚细胞定位,通过 REST API 抓取
•DepMap:CRISPR-Cas9 和 RNAi 基因必要性筛查数据
•ADCdb:已临床 ADC 的靶点-抗体对
应关系
获取方式:写 Python 脚本通过各数据库 REST API 批量抓取,或者用 GDC Data Transfer Tool 下载 TCGA 数据。NRC 的做法是建一个 MySQL 数据库,把各来源的 ADC 靶点特征数据 ETL 进去统一查询。
1.1.4.2实体瘤样本(实)
用于"蛋白水平验证 + 功能性确认",特点是贴近临床真实状态,但样本量小、获取难、成本高。
样本类型与获取渠道:
样本类型
用途
国内获取渠道
FFPE 肿瘤组织芯片(TMA)
IHC 评估靶标在肿瘤 vs 正常组织的蛋白表达
医院病理科合作、商业样本供应商(如上海芯超、paraffin-embedded tissue 库)、BioBank
新鲜/冷冻肿瘤活检
靶向质谱定量、原代细胞解离、流式定量
三甲医院肿瘤科合作、临床试验中心、PDX 模型库
正常组织微阵列
评估 on-target/off-tumor 风险
商业供应商、尸检组织库
PDX 模型
体内药效 + 回溯性靶标丰度
国内 PDX 平台(如中科院上海药物所、各大药企内部平台)
细胞系
2D/3D 模型表达、内化筛选、ADC 体外杀伤
ATCC、DSMZ、中科院细胞库
类器官
保留肿瘤异质性的功能验证
医院合作、 commercial organoid bank
食蟹猴抗原/细胞
物种交叉反应、NHP 毒理铺垫
药明康德、昭衍新药等 CRO 的 NHP 资源
1.1.5国内头部企业走的是哪条路线
综合公开资料,国内 ADC 头部企业(恒瑞、科伦博泰、百利天恒、荣昌、信达、映恩等)的阶段一路线呈现"混合路线"特征,但可以归纳出几种典型模式:
路线 A:靶点优先 + Fast-Follow / 差异化(恒瑞、科伦博泰、荣昌等主流)
逻辑:在已验证的 ADC 靶点(HER2、TROP2、CLDN18.2、B7-H3、Nectin-4、HER3 等)上做差异化布局。
•恒瑞:HER2 ADC(SHR-A1811)正面竞争 + HER3 ADC(SHR-A2009)卡位新靶点,已递交 NDA
•科伦博泰:TROP2 ADC(SKB264)联合免疫方案,拓展 PD-L1 阴性人群
•靶点选择依据:基于 TCGA/GTEx/HPA 等公共数据库做表达特异性初筛 + 文献调研临床需求 + IHC 在实体瘤 TMA 上验证
•抗体发现:内部杂交瘤/噬菌体展示平台 + 部分外部合作
路线 B:新靶点 First-in-Class 探索(少数头部 + Biotech)
逻辑:通过多组学挖掘全新靶点,承担更高风险换取 FIC 机会。
•利用 TCGA/GTEx/GEO 等公共数据做 in silico 靶点发现(参考 NRC 管线方法 )
•结合糖蛋白质组学鉴定细胞表面糖蛋白
•代表:部分新兴 Biotech 如三优生物等建立了"靶点验证-抗体筛选-连接子载荷优化"的完整平台
路线 C:双抗 ADC / 新技术平台路线(百利天恒、康宁杰瑞)
逻辑:不只在靶点维度差异化,更在"抗体形式"上创新。
•百利天恒 BL-B01D1(EGFR×HER3 双抗 ADC)是全球首个获批的双抗 ADC
路线 D:合作开发 / License-in
•通过与海外 Biotech 合作获取已验证的抗体或靶点(如映恩生物与多家 MNC 的合作)
综上所述:从公开管线反推,国内头部企业的共性特征在靶点选择与确证方面呈现以下共性:以"公共数据库 + 文献"为主:TCGA/GTEx/HPA 做初筛,再用内部/合作医院的 FFPE 样本做 IHC 验证,样本获取:以"医院合作 + 商业 TMA + PDX/细胞系库"三位一体,极少依赖直接从临床大批量获取原代样本。
最务实的路线是:公共数据库(TCGA/GTEx/HPA)做 in silico 初筛 → 文献和专利调研锁定候选靶点 → 商业 FFPE TMA 做 IHC 验证 → 内部/合作抗体平台产生抗体 → AI 辅助抗体工程化 → 原型偶联验证。其中"实体瘤样本"主要用于 IHC 验证和功能性确认,而不是用于初筛——初筛的活儿交给数据库,效率和成本都更优。
这也是 NRC 等国际顶级研发机构和国内恒瑞、科伦等头部企业的实际做法 。区别在于:资源充足的大公司会同时跑多条靶点线(路线 A + B 并行),而 Biotech 更倾向于集中资源在 1-2 个差异化靶点上快速推进 PCC。
1.1.6靶点评估与验证的推进流程
在 ADC 开发中,靶点评估与验证是决定项目生死的第一道关口。它不是一个单一实验,而是一个从“虚拟筛选”到“实体验证”、从“群体统计”到“单细胞功能”的递进式证据链。下面把这件事拆成 6 个可执行的步骤,并明确每一步需要什么实验技术手段、用什么样本。
步骤一:靶点发现与初筛(In Silico 为主,文献为辅)
目标:从全基因组中快速锁定“肿瘤高表达、正常组织低表达”的候选靶点,缩小范围。
做什么
具体手段
样本/数据来源
性质
差异表达分析
用 R/Python 分析 TCGA 肿瘤 vs GTEx 正常组织的 RNA-seq 数据,计算 TPM 和 Fold Change
TCGA + GTEx 公共数据库
计算
泛癌表达谱
查询 Human Protein Atlas (HPA) 的 IHC 表达图谱,确认蛋白水平趋势
HPA 数据库
计算
文献与专利调研
检索 PubMed、Google Scholar、ClinicalTrials.gov、ADCdb,评估靶点的已知生物学、临床进展、竞品格局
文献/专利库
文献
靶点必要性评估
查询 DepMap 的 CRISPR-Cas9 和 RNAi 筛查数据,确认靶基因敲除后肿瘤细胞是否死亡
DepMap 数据库
计算
需要具备的技术能力:
•生物信息学分析能力:熟练使用 R/Python 进行 RNA-seq 数据处理(DESeq2、edgeR 等)、生存分析(Kaplan-Meier plotter)。
•文献检索与情报分析能力:熟练使用 PubMed、智慧芽等工具。
样本:此阶段全部是数据库样本,不涉及实体样本。
步骤二:靶点生物学与疾病关联性验证(湿实验 + 生信)
目标:确认靶点与肿瘤发生发展、预后、耐药等直接相关,而不仅仅是“伴随表达”。
做什么
具体手段
样本
性质
生存分析
用 KM plotter 或 TCGA 临床数据,分析靶点高/低表达患者的 OS/PFS 差异
数据库(带临床注释)
计算
基因必要性验证
在目标细胞系中进行 CRISPR-Cas9 敲除或 shRNA 敲降,观察表型(增殖、凋亡、迁移)
肿瘤细胞系
实验
功能回复实验
敲除后重新过表达靶点,观察表型是否恢复
肿瘤细胞系
实验
信号通路分析
Western Blot、磷酸化抗体芯片,确认靶点激活的通路
细胞系/组织裂解液
实验
临床相关性
分析靶点表达与临床病理特征(分期、分级、亚型、耐药)的关联
临床数据库/队列
混合
需要具备的实验技术:
•分子克隆:构建敲除/敲降/过表达载体。
•CRISPR-Cas9 / RNAi:基因编辑技术。
•细胞表型分析:CellTiter-Glo(增殖)、Annexin V/PI(凋亡)、Transwell(迁移)、流式细胞术。
•Western Blot / 蛋白印迹:基础蛋白检测。
•ELISA / 多因子检测:细胞因子/蛋白分泌检测。
样本:主要是细胞系(2D/3D),部分数据来自数据库。
步骤三:靶点表达谱精确定量(核心实验环节)
目标:在蛋白水平确认肿瘤 vs 正常组织的表达差异,并定量细胞表面抗原拷贝数。这是 ADC 靶点评估中最关键也最容易出错的环节。
做什么
具体手段
样本
性质
肿瘤组织蛋白表达
IHC 染色,评估靶标在肿瘤组织的阳性率、染色强度(H-score)
FFPE 肿瘤组织芯片(TMA)
实验
正常组织蛋白表达
IHC 染色,评估靶标在正常器官的暴露情况(on-target/off-tumor 风险)
正常组织微阵列
实验
靶点精确定量
靶向质谱(MRM/PRM),绝对定量靶标蛋白在组织和细胞中的拷贝数
新鲜/冷冻肿瘤组织、细胞系
实验
细胞表面抗原密度
定量流式细胞术(QIFIKIT),用已知荧光强度的标准微球换算抗原拷贝数
肿瘤细胞系、原代细胞
实验
肿瘤微环境共定位
多重免疫荧光(mIF/mIHC),同时标记靶标和免疫细胞标志物(CD8, CD68 等)
FFPE 组织
实验
需要具备的实验技术:
•免疫组化(IHC):包括切片、染色、图像分析(Aperio 等扫描系统)。
•靶向质谱(MRM/PRM):需要合成同位素标记的标准肽段,建立质谱检测方法。这是蛋白定量的金标准,但门槛较高。
•流式细胞术:需要配备激光的流式细胞仪,以及 QIFIKIT 等标准品。
•多重免疫荧光:需要多光谱成像系统(如 Vectra Polaris)。
样本获取:
•FFPE TMA:商业供应商(如上海芯超、US Biomax)、医院病理科合作。
•新鲜/冷冻组织:三甲医院肿瘤科合作、临床试验中心。
•细胞系:ATCC、中科院细胞库。
关键点:IHC 只能半定量,且主观性强;靶向质谱和流式才能给出绝对拷贝数。国内头部企业通常IHC 做初筛,质谱/流式做确证。
步骤四:靶点内化能力评估(ADC 特有核心)
目标:确认抗体结合靶标后,能被肿瘤细胞内吞并转运到溶酶体。这是 ADC 释放毒素的前提——不内化的靶点,做 ADC 必死(不是死律,对于采用不可裂解连接子或膜不通透毒素(如 DM1、MMAF)的 ADC,靶标必须高效内化,否则毒素无法释放;但对于可裂解连接子 + 高膜通透性毒素(如 MMAE、DXd、SN-38)的 ADC,内化并非绝对前提,可通过胞外释放或旁观者效应实现疗效;另外靶点在肿瘤微环境中而不在肿瘤细胞内的ADC,也要视情况而定)。
做什么
具体手段
样本
性质
内化速率测定
用 pHrodo 标记的抗体(pH 敏感荧光染料)与细胞孵育,通过流式或共聚焦显微镜实时监测荧光信号增强
肿瘤细胞系
实验
内化途径分析
用化学抑制剂(如氯喹、巴菲霉素 A1、dynasore)处理细胞,确定内化是通过网格蛋白、小窝蛋白还是巨胞饮
细胞系
实验
溶酶体共定位
将抗体与荧光染料(如 Alexa Fluor 488/594)偶联,与细胞孵育不同时间,与溶酶体标志物(Lamp-1)做共聚焦显微镜共定位
细胞系
实验
功能性内化验证
将抗体与皂草素(saporin,一种核糖体失活蛋白)偶联,如果抗体能内化,皂草素进入细胞会杀死细胞;此实验可同时验证内化效率和毒性
细胞系
实验
原代细胞/类器官验证
在患者来源的原代细胞或类器官中重复内化实验,确认临床相关性
原代细胞/类器官
实验
需要具备的实验技术:
•荧光显微镜 / 共聚焦显微镜:观察内化动态和亚细胞定位。
•流式细胞仪:高通量定量内化速率。
•抗体荧光标记技术:pHrodo 标记、传统荧光染料标记。
•类器官培养:Matrigel 3D 培养体系。
样本:主要是肿瘤细胞系,进阶验证用原代细胞/类器官(来自临床样本或 PDX 模型)。
步骤五:靶点可成药性与成药性评估
目标:确认靶点是“可成药”的——即能被抗体特异性结合,且结合后不会引起不可接受的毒性。
做什么
具体手段
样本
性质
跨膜区与胞外域预测
用 TopCons、Phobius 等工具预测靶点的跨膜螺旋和信号肽
蛋白序列(UniProt)
计算
表位作图
用氢氘交换质谱(HDX-MS)或丙氨酸扫描突变,确定抗体结合的关键残基
重组蛋白、细胞
实验
种属交叉反应
测试抗体与食蟹猴、小鼠、大鼠等种属的靶点同源性及结合能力
重组蛋白、细胞系、食蟹猴组织
实验
脱靶结合评估
用蛋白芯片(如 HuProt 人类蛋白组芯片)筛选抗体与数千种非靶蛋白的交叉反应
蛋白芯片
实验
抗原脱落评估
用 ELISA 检测细胞培养上清或患者血清中的可溶性靶标,评估抗原脱落风险
细胞上清、血清
实验
需要具备的实验技术:
•蛋白表达与纯化:原核/真核表达系统,用于制备重组蛋白。
•表面等离子共振(SPR)/生物膜干涉(BLI):实时监测抗原抗体结合动力学。
•氢氘交换质谱(HDX-MS):表位作图,设备昂贵但信息量大。
•蛋白芯片:高通量交叉反应筛查。
样本:重组蛋白、细胞系、食蟹猴样本(用于 NHP 毒理铺垫)。
步骤六:FTO(自由实施)与竞品分析
目标:确保项目不侵犯他人专利,并评估市场竞争格局。
做什么
具体手段
样本
性质
专利检索
检索靶点、抗体序列、ADC 结构等相关专利
专利数据库(智慧芽、Incopat)
文献
序列比对
将候选抗体序列与已知专利序列比对,评估侵权风险
专利序列
计算
竞品管线分析
梳理全球同靶点 ADC 的临床阶段、技术路线、关键数据
临床试验库、会议摘要
文献
需要具备的技术能力:
•专利分析能力:熟悉专利法律状态和权利要求解读。
•序列比对工具:BLAST、IgBLAST。
样本:无实体样本。
实验技术手段全景图(按类别汇总)
如果要从零搭建一个 ADC 靶点评估平台,需要以下核心技术模块:
模块
核心技术
关键设备/试剂
生物信息学
RNA-seq 分析、生存分析、跨膜预测、蛋白结构预测
高性能计算集群、R/Python
分子生物学
基因克隆、CRISPR-Cas9、RNAi、qPCR
超净台、PCR 仪、转染设备
细胞生物学
细胞培养(2D/3D)、流式细胞术、显微镜(共聚焦)
CO₂ 培养箱、流式细胞仪、共聚焦显微镜
蛋白分析
IHC、Western Blot、ELISA、靶向质谱、HDX-MS
切片机、质谱仪、WB 电泳系统
免疫学
抗体标记(pHrodo 等)、多色流式、蛋白芯片
抗体标记试剂盒、多色流式细胞仪
药理学
原代细胞/类器官培养、PDX 模型
类器官培养系统、动物房
专利情报
专利检索、序列比对
智慧芽/Incopat 账号
国内头部企业的实际做法
国内头部企业(恒瑞、科伦博泰、百济神州、信达等)在靶点评估与验证环节,通常采用“内部核心能力 + 外部 CRO 合作”的模式:
•内部团队:负责靶点初筛(生信)、文献/专利调研、IHC 验证(用内部 TMA 库)、细胞水平功能验证(内化、流式)。
•外部 CRO:将靶向质谱、HDX-MS、蛋白芯片、PDX 模型构建等需要重资产设备的任务外包给专业 CRO(如药明康德、康龙化成、昭衍新药、华大蛋白等)。
•医院合作:通过与三甲医院建立联合实验室,获取临床 FFPE 样本和新鲜肿瘤组织,用于 IHC 和原代细胞验证。
典型路线:
•Fast-Follow 项目:直接跳过步骤一(靶点发现),从步骤三(表达验证)开始,用公共数据和内部 TMA 快速验证已验证靶点(如 HER2、TROP2)在特定癌种的表达,然后进入抗体发现。
•First-in-Class 项目:完整走完 6 个步骤,重度依赖生信分析和内部/合作医院的样本库,周期长、风险高,但一旦成功回报巨大。
1.2 ADC药物抗体筛选与工程化逻辑
完成了靶点筛选与验证之后,接下来便进入 ADC 药物开发的核心环节——抗体发现与工程化改造。需要明确的是,尽管同样涉及抗体的筛选与优化,但 ADC 药物对抗体的选择逻辑与传统单抗药物有着本质区别:单抗药物追求的是抗体本身的生物学功能(如阻断信号通路或介导免疫细胞杀伤),而 ADC 的抗体则更像是搭载了"细胞毒性弹头"的精准导航系统——它不仅要"认得准",更要"进得去",且其结构稳定性必须能够承受后续偶联工艺的改造。
1.2.1 ADC的裸抗选择标准
关于"适合做 ADC 的裸抗"究竟应该满足哪些标准,目前业界尚未形成全球统一的放行阈值。不过,经过 T-DM1、Enhertu 等十余年产品的迭代积累,行业在发现阶段已逐步沉淀出一套筛选优先区间。需要特别强调的是:这些数值只是候选抗体能否进入偶联验证环节的"入场券",而绝非 ADC 终产品的放行标准——裸抗指标达标,仅仅意味着"偶联后失败的概率较低";一个抗体最终能否成为合格的 ADC 弹头,仍必须以偶联产物的实际表征数据(如偶联后稳定性、细胞毒性、旁观者效应等)作为最终裁判。
下面按维度给出可操作的区间和建议。
一、靶点结合与内化能力(功能维度)
这是 ADC 抗体区别于普通治疗性抗体的第一道门槛——裸抗本身不一定需要 治疗活性,但必须"认得准、进得去"。
指标
推荐区间
说明
抗原结合 KD(SPR/BLI)
0.1–1 nM
ADC 综述给出的可接受阈值;皮摩尔级亲和力有助于肿瘤摄取与 payload 递送
内化速率 kint
需大于解离速率 kd
内化必须快于解离,否则 ADC 在释放 payload 前就脱离抗原
内化效率(流式/显微镜)
30 min–2 h 内可见明显酸性内体定位
与细胞杀伤效力直接相关
靶点表达适应性
能覆盖目标适应症的抗原拷贝数范围
参考阈值:PSMA 10⁴–10⁵ copies/cell、CD33 5×10³–10⁴、HER2 ≥10⁶;但也有 1500 copies/cell 即可起效的案例
种属交叉
与 cyno 抗原结合
为 NHP 毒理研究铺垫
脱靶结合
FACS 阴性细胞信号背景水平
避免正常组织摄取导致毒性
亲和力不是越高越好:ka 或内化过快会造成"结合位点屏障"(binding site barrier),限制 ADC 在肿瘤内部的穿透深度。这也是近年"降亲和力优化肿瘤穿透"策略的理论基础。
值得注意的是,在传统 ADC 的设计逻辑中,"抗体-靶点复合物必须被肿瘤细胞内吞"几乎是金科玉律——因为只有进入细胞,连接子才能在溶酶体中被切割,释放出细胞毒性 payload。然而,随着新型 ADC 的不断开发,这一铁律正在被重新审视:抗体内化能力不再是 ADC 药物对抗体的绝对硬性要求,其重要性必须结合具体项目的靶点特性、连接子化学、payload 膜通透性以及旁观者效应进行综合评估,不可一概而论。
最直接的证据来自 Neri 团队 2017 年发表在 International Journal of Cancer 上的研究。他们用靶向 Tenascin-C 剪切异构体 A1 结构域的 F16 抗体(该靶点定位于肿瘤内皮下细胞外基质,抗体结合后根本不发生内化),通过 Val-Cit 二肽连接子偶联 MMAE,构建出完全非内化的 ADC。令人惊讶的是,这种 ADC 在 U87、A431、MDA-MB-231 三种小鼠肿瘤模型中实现了肿瘤完全消退,治愈剂量仅为 7 mg/kg。机制研究发现,Val-Cit 连接子能够在内皮下细胞外基质中被蛋白酶切割——这颠覆了"Val-Cit 只能在溶酶体内被组织蛋白酶 B 切割"的传统认知。
CD20 这个经典靶点也为"弱内化也能成 ADC"提供了有力佐证。CD20 本身内化速率极慢,曾被长期认为"not considered a desirable target for ADCs"。但 Law 等人早期的研究显示,利妥昔单抗通过可裂解的 Val-Cit 二肽连接子偶联 MMAE 后,在 CD20 阳性淋巴瘤异种移植模型中展现出强大的抗肿瘤疗效——其关键在于 MMAE 具有极强的膜通透性,即使在胞外或细胞表面释放,也能自由穿透细胞膜发挥杀伤作用。这一化学逻辑已被临床验证:国内进入临床的 CD20 ADC(MRG001、TRS005)均采用"I 型抗体 + vc 可裂解连接子 + MMAE"的组合策略,利用 MMAE 的膜通透性弥补 CD20 内化慢的缺陷,在复发/难治性 B 细胞非霍奇金淋巴瘤中获得了 38.2%–46.6% 的客观缓解率。
即便是高度成功的 TROP2 ADC Trodelvy(sacituzumab govitecan),其设计逻辑也在一定程度上"稀释"了对内化效率的绝对依赖。Trodelvy 确实仍通过 TROP2 介导的内吞进入细胞,并在酸性内体/溶酶体中水解连接子释放 SN-38;但由于 SN-38 具有膜通透性,释放后的毒素能够穿透细胞膜,杀死邻近的 TROP2 阴性细胞——即"旁观者效应"。Gilead 的官方机制说明指出,SN-38 在远离血管的肿瘤细胞中也被检测到,且呈现与 TROP2 表达无关的分布模式。这意味着,即使肿瘤群体中并非每个细胞都能高效内化 ADC,只要有一部分细胞能内化并释放 SN-38,毒素就能"扩散"到周围细胞。Enhertu 在 HER2-low 乳腺癌中的突破同样得益于此逻辑:DXd 的强膜通透性 + 高 DAR(~8)+ 旁观者效应,使得 ADC 不再需要"击中每一个肿瘤细胞",从而降低了对单个细胞高效内化速率的绝对要求。
但需要特别澄清的是:"内化不重要"是有严格边界条件的。上述案例的有效性,全部建立在"可裂解连接子 + 膜通透性 payload"的组合基础之上。若将 vcMMAE 中的 MMAE 替换为膜通透性极差的 MMAF,针对弱内化靶点的 ADC 活性会完全消失;而 T-DM1 使用的不可裂解连接子 + 膜不通透的 DM1,则必须高度依赖内化与溶酶体降解,因此只对 HER2 高表达且均一的肿瘤有效。
因此,在当代 ADC 开发中,抗体内化能力的考量必须具体项目具体分析:对于选择不可裂解连接子或膜不通透毒素(如 DM1、MMAF)的 ADC,内化效率依然是决定生死的关键变量;而对于选择可裂解连接子 + 高膜通透性毒素(如 MMAE、DXd、SN-38)的 ADC,即使靶点内化能力一般甚至不内化,也可通过胞外释放、旁观者效应或靶向肿瘤微环境(TME)成分等策略实现疗效。这也解释了为何当下 ADC 开发中选择"可裂解连接子 + 高膜通透性毒素"成为主流——它本质上是用化学手段"购买"了对抗体内化能力的容错空间,使得 ADC 的抗体选择逻辑从"必须高效内化"扩展到了更广阔的"连接子-毒素组合代偿"维度。
二、物理稳定性(热稳定性与聚集倾向)
这是裸抗"偶联耐受性"的核心预测指标。偶联后 CH2 域通常会被显著扰动、Tm 下降、聚集倾向升高,且这种变化与 DAR 正相关——所以裸抗必须留出足够余量。
指标
方法
推荐区间
警戒线
Fab Tm
DSF/DSC
>65°C
<59°C 风险高
CH2 Tm1
DSF/DSC
>65°C
<55°C 高风险
CH3 Tm
DSC
>70°C
—
Tagg(聚集起始温度)
DLS/SLS
>55°C
<55°C 风险高
Tm1 onset
DSF
与 Tm1 差值 < 5°C
差值过大提示协同性差
为什么 CH2 的 Tm 如此关键? 文献反复证实:偶联后 CH2 域是构象稳定性受冲击最严重的区域——T-DM1 研究中,仅连接子附着(T-MCC)就让 trastuzumab 的 CH2 Tm 下降,偶联 DM1 后进一步下降;半胱氨酸偶联 vc-MMAE/mc-MMAF 后,HDX-MS 也检测到 CH2 和 CH2-CH3 界面构象动力学增强。因此裸抗的 CH2 Tm 必须留出 5–10°C 的余量,否则偶联后极易跌入不稳定区。
Tm 本身对 ADC 长期储存稳定性的预测力有限——AbbVie 的研究显示 Tagg 和 B22 与 40°C 加速 8 周后 HMWS 形成的相关性(ρ>0.8)远强于Tm。但在裸抗筛选阶段,Tm 仍是最实用的高通量指标;进入 ADC 形态后,必须把 Tagg、B22、kD 作为核心预测指标补上。
三、胶体稳定性与疏水性("疏水预算"维度)
这是 ADC 特有的考量——payload 几乎都是高度疏水的,偶联后抗体表面疏水性会显著跃升,导致胶体稳定性下降、聚集增加。
指标
方法
推荐区间
SEC 单体纯度
SEC-HPLC
≥95%,HMW ≤3%(早期评估通用门槛)
HMW(裸抗)
SEC-HPLC
<2% 为佳,<3% 可接受
LMW(裸抗)
CE-SDS 或 SEC
<1%
电荷异质性(icIEF)
icIEF
主峰占比 >70%,酸性/碱性变体各 <15%
B22(低浓度胶体稳定性)
SLS
>0(净排斥)
kD(动态光散射)
DLS
>0
表面疏水性
HIC 保留时间 / 疏水荧光探针
留出"疏水预算"——裸抗本底疏水性越低越好
"疏水预算"概念:偶联后表面疏水性会显著增加(auristatin 类尤其明显),这是聚集的主驱。因此裸抗本底的 HIC 保留时间应尽量短、疏水探针信号尽量低,为 payload 的疏水性"留空间"。裸抗阶段疏水性偏高的候选,偶联后几乎必然聚集。
四、表达与可生产性
指标
推荐区间
说明
瞬时转染表达量
>50 mg/L
低表达预示下游纯化损失大
稳定池表达量
>1 g/L
为商业化生产留余地
纯化收率
>60%
低收率常伴随聚集/降解
糖基化(尤其 Fc 岩藻糖)
依 ADC 类型而定
若不需 ADCC,岩藻糖化正常即可;若需增强 ADCC,可考虑 AFuc
五、化学稳定性与 PTM 热点
指标
推荐做法
脱酰胺热点(Asn/Gln)
处于 CDR 且关键则保留,否则工程化去除
异构化(Asp-Gly/Asp-Ser)
评估应力下降解风险
氧化(Met/Trp/Cys)
尤其关注铰链区 Cys 附近的 Met
应力测试
高温/强光/氧化条件下孵育,SEC + icIEF 监控降解
ADC 特有风险:偶联造成的局部构象扰动可能暴露裸抗阶段被埋藏的 PTM 热点,使其变为活性位点。因此裸抗的化学稳定性余量要比普通治疗性抗体更保守。
六、偶联兼容性(ADC 特有维度,最容易被忽视)
这是普通抗体成药性评估里没有、但 ADC 发现阶段必须加的"第六维":
考察项
推荐标准
表面可及赖氨酸分布
若做定点偶联,需提前工程化;若随机赖氨酸偶联,需评估溶剂可及赖氨酸是否集中在 CH2(CH2 域赖氨酸偶联会显著 destabilize)
链间二硫键可还原性
半胱氨酸偶联需确保部分还原后结构完整性可控
工程化偶联位点(若定点)
溶剂可及性适中 + 局部正电荷微环境最优(参考 THIOMAB 研究:LC-V205C 优于 Fc-S396C)
Fab 结合对局部构象扰动的鲁棒性
偶联后 SPR KD 变化 < 3 倍为佳
DAR 均一性潜力
定点偶联路线优先,目标 DAR 2 或 4
关键认知:文献明确指出,偶联会通过三种机制破坏裸抗性质——①疏水性增加降低胶体稳定性;②赖氨酸偶联丢失正电荷、减少静电排斥;③CH2 域构象扰动。这意味着即便裸抗在常规指标上完美,偶联后仍可能聚集——所以"偶联兼容性"这一维必须在发现阶段就通过原型偶联验证。
七、ADC 发现阶段的"淘汰门槛"建议
把上述维度整合为一个分级筛选漏斗:
优先推进(裸抗阶段)
•Fab Tm > 65°C,CH2 Tm1 > 65°C
•SEC 单体 ≥ 95%,HMW ≤ 2%
•HIC 疏水性本底偏低
•KD 0.1–1 nM,内化快于解离
•瞬时转染表达 > 50 mg/L
•电荷异质性适中(主峰 > 70%)
可接受但需改造
•Tm1 在 55–65°C 之间:可通过序列工程化提升
•HMW 2–3%:优化纯化或制剂可救
•表达量 20–50 mg/L:评估稳定池潜力
直接淘汰
•CH2 Tm1 < 55°C(偶联后必然跌入不稳定区)
•HMW > 3%
•表面疏水性本底偏高(HIC 保留时间长)
•抗原结合 KD > 10 nM 或内化速率 ≤ 解离速率且计划采用不可裂解连接子/膜不通透毒素
•严重 PTM 热点且位于 CDR 关键位置
八、最重要的提醒:裸抗指标 ≠ ADC 指标
上述所有区间都是裸抗阶段的筛选标准。真正的"ADC 可开发性"必须在偶联后用以下指标重新评估:
•SEC-HPLC:HMWS 变化(ΔHMWS%)作为物理稳定性主要衡量标准,加速稳定性 40°C 8 周后 ΔHMWS 越低越好
•HIC-HPLC:DAR 分布与异构体谱
•DLS / SLS:Tagg 与 B22(预测力最强)
•DSF / DSC:偶联前后 Tm 对比,CH2 域扰动幅度
•CD 光谱:二级结构变化
•SPR / 细胞结合:抗原结合保留率(目标 > 70%)
•细胞杀伤:EC50 与裸抗相比应有数量级提升
一个常被忽视的事实:Tm 在裸抗阶段是好的筛选指标,但对 ADC 终产品的储存稳定性预测力有限——AbbVie 研究显示 Tm 与 40°C 加速 8 周的 ΔHMWS 无显著相关性,而 Tagg(ρ>0.8)和 B22(ρ>0.7)才是强预测因子。这提示我们:裸抗阶段看 Tm 筛候选,ADC 阶段看 Tagg+B22 做制剂筛选。
1.2.2抗体产生与初步筛选:在“湿实验”中寻找最优解
1.2.2.1抗体产生的三条主流技术路线
不同阶段、不同资源禀赋的企业会选择不同路线,三条路线各有优劣:
路线
技术原理
亲和力范围
人源化程度
周期
适合场景
杂交瘤
免疫动物 B 细胞与骨髓瘤细胞融合
0.1–10 nM
需要后续人源化
数月
经典路线,许多上市 ADC 抗体来源
噬菌体/酵母展示
抗体片段展示在噬菌体/酵母表面,构建大型文库,"吸附-洗脱-扩增"循环筛选
1–100 nM
不需人源化(可直接全人源)
数周
高通量、无需免疫、可全人源
单 B 细胞 / 转基因小鼠
流式分选抗原特异性 B 细胞 + 单细胞 PCR;或转基因小鼠直接产生全人源抗体
0.1–10 nM
不需
数周–数月
周期与全人源兼顾
酵母展示平台流程很典型:抗原准备 → 定制化抗体文库构建 → FACS 筛选高亲和力克隆 → 亲和力/特异性/表位验证 → 亲和力成熟 → ADC 构建评估 。
国内头部企业实际选择:
•恒瑞:单 B 细胞测序平台 + 高通量展示技术筛选,并配有高通量自动化抗体生产
•百济神州:基于多层组学数据整合分析和生物学实验室验证,发现并验证创新性 ADC 靶点
•荣昌生物:全面集成 ADC 平台,自研桥接偶联技术
•信达生物:自研 αTAA 平台 + 与 Synaffix 合作获取定点偶联技术
现代 ADC 发现的一个显著趋势:不再单一依赖某条路线,而是"杂交瘤/单B/展示"多路线并行,哪个出好克隆就用哪个。恒瑞、百济等头部企业均是这种"组合拳"打法。
1.2.2.2初步筛选的五层漏斗(核心实验手段)
第一层:抗原结合筛选(ELISA / FACS / BLI / SPR)
从文库/杂交瘤上清中筛出"能结合"的克隆:
•ELISA:高通量初筛,适合从数百到数千克隆中快速分流
•FACS:基于抗原表达细胞的流式筛选,能同时评估结合与内化倾向
•BLI(Octet):生物层干涉技术,并行测量蛋白-蛋白相互作用,无需检测试剂
•SPR(Biacore):精确测定 KD、ka、kd,是亲和力"金标准"
关键参数:
•目标 KD:0.1–1 nM(ADC 黄金区间)
•内化速率必须快于解离速率(kinternalization > koff)(需根据ADC产品释放payload的逻辑来确定)
第二层:内化能力筛选(最关键,ADC 特有)
抗体结合好不等于内化好。主流有两种筛选方法:
① 荧光标记 + 流式/高内涵
•抗体 NHS-SS-biotin 或直接荧光标记
•4°C 结合 → 37°C 启动内化 → 低 pH 缓冲液去除表面抗体 → 流式/高内涵定量
•可同时评估数百个抗体
② Fab-ZAP 内化筛选系统
•Fab 片段偶联皂草素(saporin),内化后核糖体失活 → 细胞死亡
•敏感性高,可检测中等亲和力抗体的内化
•文献报道可适合数百至上千个抗体的中等规模筛选
注意:Fab-ZAP 等替代方法的数据与真实 ADC 可能不完全一致 ,所以只能用于"初筛分流",不能替代后续的"小量 ADC 直接筛选"。
第三层:交叉反应与特异性
•种属交叉:测试与食蟹猴等 NHP 靶点的交叉反应(为毒理铺垫)
•脱靶筛选:蛋白芯片(HuProt 等)评估与非靶蛋白的交叉反应
•正常组织交叉:确认抗体不与关键正常组织抗原结合
第四层:初步可开发性
•表达量:瞬时转染 >50 mg/L 为佳
•纯度:SEC 单体 ≥95%,HMW ≤2–3%
•热稳定性:DSF 测 Tm,Fab >65°C,CH2 >65°C
•聚集倾向:DLS 测 B22、kD
•疏水性:HIC 保留时间,留出"疏水预算"
第五层:小量 ADC 直接筛选(最关键的一步,决定 ADC 排名)
这是 ADC 抗体筛选最具决定性的一环——抗体排名 ≠ ADC 排名。很多在抗体水平表现优异的克隆,做成 ADC 后细胞毒性反而差 。
药明 XDC 的高通量偶联平台是行业标杆做法 :
1.Protein A/G 捕获抗体:从纯化抗体或杂交瘤上清中捕获
2.柱上偶联:在 Protein A/G 微球上进行偶联反应
3.统一 DAR:通过 NEM + vcMMAE 混合偶联,确保不同抗体获得一致的 DAR
4.96 孔板规模:高通量制备数十到数百个小量 ADC
5.质量控制:每个 ADC 测浓度、SEC 纯度、DAR
6.细胞毒性排序:在相同 DAR 下,用 OVCAR-3 等细胞系测 IC50 和最大杀伤
支持的偶联方式:
•半胱氨酸偶联:MC-vcMMAE
•赖氨酸偶联:SMCC-DM1
•其他:MC-GGFG-DXd 等
这一步的本质是:把"偶联后功能"前移到抗体筛选阶段。一个裸抗完美但做成 ADC 后细胞毒性差的克隆,在这一步就被淘汰,避免推进到下游才发现。
1.2.2.3必备的实验技术平台清单
如果要从零搭建 ADC 抗体发现平台,需要以下核心技术模块:
1. 抗体产生平台
•杂交瘤技术:免疫动物、细胞融合、HAT 筛选
•噬菌体展示:文库构建、淘选、scFv/Fab 表达
•酵母展示:FACS 高通量筛选
•单 B 细胞平台:流式分选、单细胞 PCR、VDJ 测序
•转基因小鼠:RenMab/RenLite/RenNano 等全人源小鼠平台
2. 抗体表达与纯化
•瞬转表达:Expi293 / ExpiCHO 系统
•蛋白 A/G 纯化:AKTA 层析系统
•高通量表达:96 孔深孔板小规模表达 + 自动化纯化
3. 结合动力学分析
•SPR(Biacore 8K):亲和力精确测定
•BLI(Octet):高通量、无标记
•ELISA / FACS:初筛
4. 内化与功能筛选
•流式细胞仪(BD FACSCelesta 等):内化定量
•高内涵成像:Incucyte 活细胞成像系统,实时监测内化、杀伤、旁观者效应
•Fab-ZAP 系统:中等通量内化筛选
•iQue 高通量流式:单孔内多重分析
5. 小量 ADC 偶联平台
•Protein A/G 柱上偶联:96 孔板规模
•DAR 控制:NEM 封端 + 位点特异性偶联
•ADC 纯化:尺寸排阻色谱(SEC)去除游离 payload
•ADC 分析:HPLC-SEC(纯度)、LC-MS(DAR)、HIC(异构体分布)
6. 可开发性初筛
•DSF/differential scanning fluorimetry:热稳定性
•SEC-HPLC:聚集体
•DLS:流体力学半径、B22
•HIC:疏水性
•icIEF:电荷异质性
7. 细胞水平功能验证
•CellTiter-Glo / CCK-8:细胞毒性
•共培养旁杀:流式或高内涵读数的旁杀系数
•PDX/类器官:临床相关性验证
1.2.2.4国内头部企业的实际做法
综合公开材料,国内头部 ADC 企业在"抗体产生与初步筛选"环节的打法呈现三大共性:
1. 恒瑞医药:全栈自研 + 单 B 细胞平台
•恒瑞构建了完整的内部能力 :
•单 B 细胞测序平台:高通量单 B 细胞测序 + 自动化抗体生产 + 生物信息学分析
•高通量展示技术:利用高通量展示技术进行抗体筛选,同时优化分子的亲和力和成药性
•ADC 创新平台(HRMAP):包含不同 MOA 的有效载荷、最佳连接子/偶联方式,以及成熟的抗体发现和工程能力
•特点:全产业链闭环,从抗体发现到 ADC 构建全程内部完成
2. 百济神州:组学驱动 + 全球化标准
•多层组学数据整合:基于多层组学数据整合分析和生物学实验室验证,发现并验证创新性 ADC 靶点
•特点:强调"创新性靶点"的 First-in-Class 策略,抗体发现与靶点验证深度耦合
3. 科伦博泰:生物信息学辅助 + OptiDC 平台
•生物信息学辅助的抗体发现工作流程
•OptiDC 平台:已建立广泛的细胞毒性小分子库、亲水性连接子、可定制 DAR
•特点:强调"抗体-连接子-载荷"的整体优化
4. 信达生物:自研 + License-in 双轨
•自研 αTAA 平台:差异化抗体发现
•与 Synaffix 合作:引入临床阶段定点偶联技术,快速基于自有抗体开发 ADC
•特点:抗体自己发现,偶联技术合作引入,加速管线推进
5. 荣昌生物:全面集成 ADC 平台
•自研全面集成 ADC 平台:包含 ADC 连接子及载荷优化的筛选平台、专有 Thiel-bridge 偶联技术、载荷及偶联工艺开发、连接子/载荷 GMP 合成、ADC 的 DS/DP GMP 生产
•特点:维迪西妥单抗(RC48)已商业化,平台经过上市验证
6. 君实生物:自动化高效筛选
•抗体偶联药研发平台:结合已有的抗体筛选及功能测定的自动化高效筛选平台 + 自主开发的抗体偶联药高效平行合成技术
•特点:强调"自动化"和"快速筛选最优候选抗体"
1.2.2.5国内头部企业的共性模式
把上述企业的实践提炼出来,国内头部 ADC 企业在"抗体产生与初步筛选"环节普遍采用:
1. "内部核心能力 + 外部合作"的混合模式
•内部:单 B 细胞平台、噬菌体展示、杂交瘤、高通量筛选、小量 ADC 偶联
•外部合作:信达 + Synaffix(定点偶联技术)、多家企业与药明 XDC 等 CRO 合作
2. 早期引入"小量 ADC 直接筛选"
•借鉴药明 XDC 的高通量偶联平台思路 ,在抗体筛选阶段就用统一 DAR 的小量 ADC 做细胞毒性排序
•这一步把传统的"先选抗体 → 再做 ADC"的串行流程,改为"抗体筛选与 ADC 功能验证"并行
3. 生物信息学辅助
•科伦博泰明确采用生物信息学辅助的抗体发现工作流程
•百济神州用多层组学数据整合指导靶点发现和抗体设计
4. 自动化与高通量
•君实生物的自动化高效筛选平台
•恒瑞的高通量展示技术 + 自动化抗体生产
•这是头部企业相对于中小 Biotech 的核心优势——能用机器人做大规模并行筛选
5. 全人源化路线为主
•单 B 细胞、转基因小鼠(RenMab 等)等全人源技术路线成为主流
•传统杂交瘤的人源化改造逐步减少
1.3 抗体工程化与优化:以“ADC终产品性能”为锚点
抗体工程化与优化是 ADC 发现阶段从“找到一个能结合的抗体”到“找到一个做成 ADC 后疗效、安全性、可生产性俱佳的 PCC”的关键一跃。它的核心逻辑是:所有改造都必须以"ADC 终产品性能"为锚点反向优化,而不是把裸抗优化到传统指标完美就结束——这正是前几轮我们反复强调的"裸抗调好了≠偶联后没问题"在工程化阶段的体现。
1.3.1工程化优化的六大目标维度
从初筛阶段拿到的 lead 抗体通常存在某些"短板",工程化要针对性补强。六大优化方向:
维度
优化目标
典型手段
亲和力调优
KD 调到 0.1–1 nM 黄金区间;避免过度亲和导致肿瘤穿透差
定向进化、亲和力成熟、CDR 突变
表位优化
选择能促进内化、且内化后能有效释放 payload 的表位
表位作图、竞争结合筛选
Fc 工程
调控 ADCC/CDC(依 ADC 设计需求开/关)、延长半衰期、降低免疫原性
Fc 静默突变(LALA-PG)、FcRn 突变延长半衰期
人源化与去免疫原性
鼠源/兔源抗体转人源,消除 T 细胞表位
CDR 移植、框架区人源化、T 细胞表位删除
结构稳定性与可开发性
提升热稳定性(CH2 Tm 留出余量)、降低聚集倾向、优化"疏水预算"
保守区突变、去糖基化工程
定点偶联兼容性
引入确定的偶联位点,实现 DAR 均一
工程化半胱氨酸(Thiomab)、非天然氨基酸、酶促偶联位点、糖基化位点工程
这六个维度不是串行而是并行迭代——一个 CDR 突变可能同时影响亲和力、表位和内化;一个 Fc 突变可能影响半衰期和免疫原性。因此工程化阶段必须是"设计-构建-测试-学习"的闭环。
1.3.2项目开展的标准流程
第一步:基线全面表征(Benchmarking)
在动手改造前,先把 lead 抗体的"家底"摸清楚:
•结合动力学:SPR/BLI 测 KD、ka、kd
•内化能力:pHrodo 流式或表面淬灭法测 ke 和 t1/2
•表位初步定位:竞争 ELISA 与已知表位的抗体竞争
•可开发性基线:DSF(Tm1/Tm2)、SEC(HMW%)、DLS(B22/kD)、HIC(疏水性)、icIEF(电荷异质性)
•原型偶联验证:用统一 DAR 的小量 ADC 测试细胞毒性 IC50 和旁杀效应
这一步是后续所有改造的"参照系"。没有基线数据,就无法判断某个突变是改善还是恶化了 ADC 性能。
第二步:计算机辅助设计(AI + 结构生物学)
这是近年变化最大的环节。现代抗体工程化已经不再是"盲突变+高通量筛选"的海选模式,而是计算预测指导下的精准突变:
① 结构建模
•AlphaFold2 / RoseTTAFold:预测抗体 Fv 区结构,特别是 CDR 环的构象
•分子对接:将抗体 Fv 与抗原结构对接,预测结合界面
•表位-构象关联分析:判断哪个表位更有利于内化
② 突变效应预测
•蛋白语言模型(ESM-2、ProtT5):从序列预测突变对折叠稳定性、表面暴露的影响
•ThermoNet / DDG 预测器:预测单个突变的 ΔΔG,筛选不会破坏结构的突变
•DeepAb 等专用模型:CDR 区突变对亲和力的影响预测
•免疫原性预测:用 AI 模型预测突变后是否引入新的 T 细胞表位
③ 定点偶联位点设计
•用 Rosetta 或深度学习模型扫描抗体表面,识别溶剂可及性适中、局部带正电荷(稳定 Maleimide 连接)、且远离 CDR 和抗原结合面的位点
•Genentech THIOMAB 研究的经验:LC-V205C 这种"部分溶剂可及+正电荷微环境"的位点最优;Fc-S396C 这种高溶剂可及位点血浆中最不稳定
④ 多目标优化
•用 Bayesian optimization 或遗传算法,在"亲和力↑、稳定性↑、聚集↓、疏水性↓、免疫原性↓"多个目标间找 Pareto 最优解集
•输出 10–50 个候选突变体(单点、双点、三点组合)
第三步:突变体构建与表达
实验手段:
•定点诱变:重叠 PCR 或合成基因片段,构建突变体质粒
•瞬转表达:Expi293/ExpiCHO 系统,96 深孔板小规模表达
•自动化高通量纯化:AKTA 高通量层析系统,Protein A 捕获
•前沿技术:无细胞蛋白合成(CFPS)系统可在微孔板规模快速表达数百个突变体,Sutro Biopharma 用此法对 Trastuzumab 框架做了系统性位点扫描,快速识别最优非天然氨基酸插入位点
第四步:体外筛选与表征
第一层:结合与内化快速分流
•BLI(Octet):高通量测 KD,每小时可测数十个突变体
•FACS:抗原表达细胞上的结合和解离
•pHrodo 内化流式:内化速率 ke 的快速评估
第二层:可开发性筛选
•DSF:Tm1/Tm2 热稳定性
•SEC-HPLC:HMW%
•DLS:B22、流体力学半径
•HIC:疏水性本底
第三层:原型偶联 + ADC 功能验证(最关键)
用统一 DAR(如 DAR4 的 vcMMAE)做小量柱上偶联
•SEC-HPLC:偶联后 HMW 变化(ΔHMW%)
•LC-MS:DAR 分布
•SPR:偶联前后 KD 保留率(目标 >70%)
•细胞毒性:Ag+ 细胞 IC50、Ag- 旁杀效应
•体外稳定性:40°C 加速 1–2 周,监测 ΔHMW%
这一层是工程化阶段的"终审"——一个裸抗状态完美的突变体,如果做成 ADC 后 HMW>10% 或 IC50 不降反升,必须淘汰。
第五步:Fc 工程与定点偶联位点整合
当 Fv 区优化到位后,进入 Fc 区和偶联位点工程:
•Fc 静默(如需):引入 LALA-PG 突变(Leu234Ala、Leu235Ala、Gly237Pro、Gly237Ala)消除 FcγR 结合
•半衰期延长(如需):引入 FcRn 结合增强突变(如 M428L/N434S)
•定点偶联位点引入:
•Thiomab 路线:在 CH3 或轻链 CL 区引入工程化半胱氨酸(如 lcK149C),实现 DAR2 均一偶联
•非天然氨基酸路线:在 CH3 区引入琥珀密码子 + 正交 tRNA/aaRS 系统,在发酵时掺入叠氮苯丙氨酸等,再用点击化学偶联
•酶促偶联路线:引入转谷氨酰胺酶识别位点(如 Q295 附近)或 Sortase 识别序列
•糖基化偶联路线:利用 N297 糖基化位点,通过糖工程引入叠氮基团,SPAAC 点击化学反应
第六步:PCC 确认与可生产性评估
最终候选(PCC)必须通过的门槛:
•亲和力:KD 0.1–1 nM
•内化:ke 足够高,t1/2 < 6 h
•偶联后稳定性:40°C 加速 2 周 ΔHMW < 5%
•DAR 均一性:定点偶联 DAR2 或 DAR4,单一主峰 >90%
•细胞毒性:IC50 达 pM–nM 级别
•旁杀效应:φ%Ag+_BE > 30%
•表达量:瞬转 >50 mg/L,稳定池 >1 g/L
•免疫原性:T 细胞表位预测阴性
•FTO:序列与现有专利不冲突
1.3.3必备的实验技术平台
如果要从零搭建 ADC 抗体工程化平台,核心模块包括:
1. 计算设计平台
•结构建模:AlphaFold2/3、RoseTTAFold、PyRosetta
•突变效应预测:ESM-2、ProtT5、ThermoNet、DDG 预测器
•表位-构象分析:分子对接(HADDOCK、ClusPro)
•多目标优化:Bayesian optimization 框架
2. 突变体构建与表达
•定点诱变:重叠 PCR、合成基因片段
•瞬转表达:Expi293/ExpiCHO,96 深孔板自动化
•无细胞蛋白合成(CFPS):Sutro 模式,微孔板规模快速表达
•自动化高通量纯化:AKTA 高通量层析
3. 分析表征
•结合动力学:SPR(Biacore 8K)、BLI(Octet)
•可开发性:DSF、SEC-HPLC、DLS、HIC、icIEF
•结构验证:CD 光谱、HDX-MS(表位/构象)
•质谱:Intact mass、肽图 LC-MS(DAR 位点 occupancy)
4. 小量 ADC 偶联与功能验证
•柱上偶联:Protein A/G 微球上直接偶联
•ADC 纯化:SEC 去除游离 payload
•ADC 分析:HPLC-SEC(纯度)、LC-MS(DAR)、HIC(异构体)
•细胞功能:CellTiter-Glo、高内涵成像旁杀、PDX 类器官验证
5. Fc 工程与定点偶联
•CHOK1 或 ExpiCHO 稳定池构建:用于非天然氨基酸掺入的正交 tRNA/aaRS 系统
•糖工程:EndoS 等糖苷酶处理 + 糖转移酶重塑 N297 糖链
•酶促偶联:转谷氨酰胺酶、Sortase A
1.3.4国内头部企业的实际做法
综合公开资料,国内头部 ADC 企业在抗体工程化与优化环节的打法各有特色,但共性明显:
1. 恒瑞医药:HRMAP 平台 + 定点偶联布局
•HRMAP 平台:实现抗体分子的精准高效筛选,自研技术覆盖抗体优化全生命周期
•定点偶联技术:积极搭建新一代定点偶联技术,已有 8 个 ADC 产品进入临床,数量国内领先
•双抗 ADC 平台:开发 E-cM-Topi(EGFR/c-Met)、EM-TOPi(EGFR/MUC1)等双抗 ADC
•特点:全产业链闭环,从抗体发现、工程化到 ADC 构建全程内部完成
2. 科伦博泰:OptiDC 平台
•全链条能力:OptiDC 平台具备抗体优化、有效载荷筛选、连接子修改和专有偶联技术的全链条能力
•三次牵手默沙东:累计交易超 118 亿美元,平台价值获全球验证
•特点:抗体优化与连接子-载荷优化深度耦合,强调"为特定生物靶点量身定制 ADC"
3. 荣昌生物:ThioBridge 专有偶联技术
•ThioBridge 技术:专有的桥接偶联方法,用一个或多个自由巯基共价偶联
•成功孵化:维迪西妥单抗(RC48)已获批,是首个中国自主研发上市的 ADC
•Seagen 26 亿美元授权:平台价值获国际认可
•特点:工程化半胱氨酸路线实现 DAR 均一控制
4. 百济神州:抗体工程平台
•全球多中心临床试验 6 项:国内 ADC 企业中最多
•专利申请 185 项:国际合作伙伴 10 家,出海最深
•特点:基于多层组学数据整合分析和生物学实验室验证,强调创新性靶点的 First-in-Class 策略,抗体工程与靶点验证深度耦合
5. 信达生物:αTAA 平台 + Synaffix 合作
•自研 αTAA 平台:差异化抗体发现
•双 payload ADC 平台:IBI3020 双 payload ADC 进入临床
•与 Synaffix 合作:引入临床阶段定点偶联技术(GlycoConnect 等),快速基于自有抗体开发均一 ADC
•特点:抗体自己发现 + 偶联技术合作引入,加速管线推进
6. 百利天恒:双/多特异性抗体 ADC 平台
•四大创新平台:包括"多特异性抗体新型分子结构平台"、"全链条一体化 ADC 药物研发核心技术平台"
•BL-B01D1:全球独家 HER3/EGFR 双靶 ADC,已有 4 款 ADC 进入临床
•特点:在抗体工程化阶段重度依赖 AI 辅助设计,优化双抗链配对、结合几何、Fc 沉默
7. 君实生物:自动化高效筛选
•自动化高效筛选平台:抗体偶联药高效平行合成技术
•特点:强调"自动化"和"快速筛选最优候选抗体",用机器人做大规模并行工程化突变体筛选
8. 三优生物等新兴力量
•模块化 ADC 平台:涵盖靶点验证、抗体筛选、连接子-载荷优化、体外药效评估
•强调高通量筛选和模块化设计:快速评估不同抗体、连接子、载荷组合的效果
1.3.5国内头部企业的共性规律
把上述企业的实践提炼出来,可以看到四条共性主线:
1. "内部核心能力 + 外部合作"的混合模式
•内部:单 B 细胞平台、噬菌体展示、杂交瘤、高通量筛选、小量 ADC 偶联、定点偶联技术自研
•外部合作:信达 + Synaffix、多家企业与药明 XDC 等 CRO 合作
2. 定点偶联技术成为核心竞争力
•恒瑞、荣昌、信达等头部企业均在积极布局定点偶联
•Thiomab 工程化半胱氨酸、糖基化位点偶联、酶促偶联是主流三条技术路线
•目的:实现 DAR 均一、提升 ADC 稳定性、改善 PK
3. 双抗 ADC 与双 payload ADC 是差异化突破口
•中国企业在双抗 ADC 和双 payload ADC 的研发投入占全球前列
•百利天恒 BL-B01D1 是全球首个获批临床的双抗 ADC
•信达 IBI3020 是双 payload ADC 代表
4. AI 辅助抗体工程化快速渗透
•百利天恒等企业在双抗 ADC 设计中重度依赖 AI
•AlphaFold2/3、蛋白语言模型、DDG 预测器等工具在国内头部企业中得到应用
•但 AI 预测仍需通过原型偶联和小量 ADC 功能验证来闭环
综上所述:把靶点评估、抗体发现、工程化改造三段串联起来,本质是构建一条递进式证据链:
靶点维度:肿瘤高表达 + 正常组织低暴露(特异性)→ 与肿瘤发生发展直接相关(必要性)→ 蛋白水平绝对定量(表达丰度)→ 内化能力确证(功能性)→ 可成药性 + FTO(可实施性)
抗体维度:能产生(杂交瘤/展示/单 B 细胞)→ 能结合(KD 0.1–1 nM)→ 能内化(ke 足够高)→ 能特异(种属交叉 + 脱靶评估)→ 可开发(表达、稳定性、疏水预算)→ 做成 ADC 后能杀伤(小量偶联直接筛选)
工程化维度:以 ADC 终产品性能为锚点 → 亲和力/表位/Fc/人源化/稳定性/定点偶联六大维度并行优化 → 原型偶联验证闭环 → PCC 确认
国内头部企业的共性模式可以归纳为"内部核心能力 + 外部 CRO 合作"的混合模式:内部负责靶点初筛、抗体发现、小量 ADC 偶联、定点偶联技术自研;外部与药明 XDC 等专业 CRO 合作重资产任务(靶向质谱、HDX-MS、PDX 构建等);同时通过医院合作获取临床样本。恒瑞、科伦博泰、荣昌、百济、信达、百利天恒、君实等企业虽各有侧重,但都在"自动化高通量筛选 + 定点偶联技术 + AI 辅助设计"三个方向持续投入,这是 ADC 发现阶段相对中小 Biotech 的核心壁垒。
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