Chroma Medicine, Inc.

//   • 他们所用的资源，仅仅是制药公司通常投入的一小部分，已成功推出三款基因疗法； • 公民和企业捐赠、科研资金、产品对外授权是该机构资金来源； • 该基金会总经理公开表示 “正在进行范式转变，力求在为患者提供救命疗法方面也走在前列。否则，这些疗法可能会因为不符合当前的商业模式而被撤出市场或在研发过程中停滞” 。 近日，一家意大利非营利机构Telethon成功推动一款基因疗法（Waskyra）获得美国FDA批准，而他们所投入的资源，仅仅是制药公司通常投入的一小部分。在这个一般只有行业巨头才能承受高昂成本与漫长周期的领域，Telethon的成功无疑挑战了这一范式。 FDA特别指出，这是首个获批的来自非营利机构的细胞和基因治疗产品，也是首个用于治疗Wiskott-Aldrich综合症（WAS）的基因疗法，这一批准“对于WAS患者来说是一个具有变革意义的里程碑”。 “FDA批准Waskyra是一项非凡的成就，不仅对意大利的研究和Telethon基金会来说是如此，对全球罕见病界来说也是如此。”Telethon基金会CEO Ilaria Villa在新闻稿中评价道，“这证实了以患者为中心的模式的价值，它将研究转化为真正的治疗方法，特别是在市场未能发挥作用的情况下。” 在Bio2Bedside近日播出的节目中，Telethon基金会研发总监Celeste Scotti详细揭示了这条独特路径背后的故事、策略与思考。 钱从哪里来 Waskyra的成功获批并非一蹴而就，而是Telethon基金会36年深耕罕见病领域的结果。据Scotti介绍，Telethon于1990年成立，最初以肌肉萎缩症为核心研究方向，随后拓展至所有遗传性疾病。 这种长期主义的深耕，为Telethon构建了坚实的研究生态。目前，基金会旗下设两个关键研究所——波佐利Telethon遗传与医学研究所（Tigem）和米兰San Raffaele-Telethon基因治疗研究所（SR-Tiget），汇聚近600名科学家与专业人员，形成了从基础研究、临床前开发到临床试验的完整链条。 数据显示，Telethon成立至今已投入3.94亿欧元用于研究，资助超过3000个研究项目，接受其开发的基因疗法治疗的患者超160例，衍生了GeneSpire、AAVantgarde Bio、Epsilen Bio、Innovavector、Negedia等公司。 对于非营利机构来说，资金是“房间里的大象”。不过，Bio2Bedside节目主持人问出了大家心中的好奇：“钱从哪里来？” 不同于大型制药企业依靠资本市场融资或产品销售利润支撑研发，Telethon走出了一条多元化的资金筹措路径。据Scotti介绍：“我们的资金主要来自意大利普通公民和企业的捐赠，科学家们还成功申请到了欧洲研究理事会的支持——这是欧洲最具竞争力的科研资金之一。” 据悉，Telethon面向公众的筹款模式极具特色。“罕见病很难让所有人产生共鸣，不像癌症那样普遍。我们设法解释，让人们了解科学家如何将病毒改造为治疗载体，了解患者的生活如何因基因疗法而改变。这些非常有影响力的故事，让我们获得了公众和企业的广泛支持。”Scotti解释道。 此外，研发产品的对外授权也是Telethon重要且持续的资金来源。对于部分研发成熟的疗法，基金会将技术授权给Biotech或制药企业，获得首付款和相应里程碑付款，若产品成功上市，还可能获得分级特许权使用费。这种模式既保证了在研疗法能够借助企业的力量走完下半场，又为基金会的后续研发提供了资金支持，形成了“研发-授权-再研发”的良性循环。 通过自主研发及与药企合作，Telethon已成功推出三款基因疗法，分别是治疗腺苷脱胺酶缺乏症（ADA-SCID）的Strimvelis、治疗异染性脑白质营养不良（MLD）的Libmeldy/Lenmeldy和治疗WAS的Waskyra。 “在非营利领域，Telethon一直是罕见病和超罕见病疗法研发的标杆，” Telethon总经理Francesca Pasinelli曾公开表示，“我们正在进行范式转变，力求在为患者提供救命疗法方面也走在前列。否则，这些疗法可能会因为不符合当前的商业模式而被撤出市场或在研发过程中停滞。” 15年研发攻坚 对于WAS这一罕见病的关注，源于Telethon对患者需求的深刻洞察。这种疾病由WAS基因突变引起，通常在幼儿期发病，几乎只见于男性，表现为反复感染、湿疹、出血、自身免疫性疾病以及淋巴瘤风险增加。目前，WAS唯一可能治愈的方法是造血干细胞移植，但并非总能找到匹配的供体，且移植本身也存在风险。 “这种疾病虽然罕见，但对患者和家庭来说是毁灭性的。他们无法过正常生活，时刻面临严重感染的威胁，无法充分享受人生。”Scotti在采访中语气凝重地说道。 早在2010年，Telethon旗下SR-Tiget研究所就启动了WAS基因疗法的临床试验，比FDA获批整整早了15年。在这期间，也有多家机构尝试开发WAS基因疗法，但均因安全问题以失败告终。 “我们之所以成功，是因为团队从一开始在设计载体和启动子时，就投入了极大的耐心和关注。”Scotti说。 Waskyra（etuvetidigene autotemcel）采用的是体外基因治疗技术：从患者血液中分离造血干细胞，通过慢病毒载体将功能性WAS基因导入这些细胞后，再回输至患者体内，以恢复功能性WAS蛋白的表达。这种自体移植方式，既避免了异体移植带来的免疫排斥风险，又能解决疾病的根本原因。 此外，研究人员还优化了治疗流程中的预处理环节。传统造血干细胞移植需要高强度化疗，给患者带来巨大身体负担，而Waskyra仅需低强度化疗即可为修正后的干细胞在骨髓中“腾出空间”。 这些努力最终在临床上化为积极的试验结果。在27名重度WAS患者中开展的研究表明，Waskyra能为重度 WAS 患者带来实质性和持续的临床获益，显著降低导致其发病和死亡的主要疾病表现。 治疗后6至18个月期间，严重感染发生率较治疗前12个月下降了93%。治疗后12个月内，中度至重度出血事件较治疗前一年减少了60%。大多数患者在治疗后四年未报告中度至重度出血。 合作的力量 Waskyra漫长的研发过程，离不开合作的力量。 在临床试验上，Telethon下设的研究所SR-Tiget与圣拉斐尔医院（OSR）紧密合作——后者作为WAS及其他疾病的基因治疗卓越中心，为临床试验提供了关键支撑。这种“研究所+医院”的深度绑定模式，效率更高，速度更快，成本更低。 在生产工艺上，Telethon对内设立工艺开发实验室，负责核心工艺的研发；对外与专业的CDMO公司AGC Biologics合作，由后者负责将实验室工艺转化为工业化生产工艺。“在学术环境中停留太久会成为一个瓶颈，因为工艺很复杂，你不会想着去扩大规模。”Scotti说。 在监管审批上，美国FDA和欧洲EMA也被Telethon视为极其重要的合作伙伴，“尽早与监管机构接触，以正确的方式让他们参与进来。”Scotti表示。向监管机构详细介绍项目的研发目标、技术路径与临床方案，倾听其意见和建议，能够为后续的审批流程奠定良好基础。 值得一提的是，Telethon成功推动FDA对Waskyra采用“平行审查”模式——即美国与欧洲的监管审查同步进行，从而优化全球研发策略、减少重复工作并加速审批。“这非常有建设性，但很艰难，”Celeste评价道，“对我们来说，这是第一次采用这种模式，意味着巨大的工作量。” 在美国，FDA对Waskyra的审查在四个关键领域展现了适当的监管灵活性：罕见病考量、临床试验设计、作用机制以及CMC（化学、生产和控制）。并且，FDA允许使用已获批的类似产品的相关生产和质量数据，这些数据足以代表Waskyra的情况。 在欧洲，Waskyra的研发得益于EMA的一项试点项目，该项目旨在为致力于开发满足未满足医疗需求的先进疗法药品（ATMP）的学术机构和非营利性开发商提供强化支持，以应对欧盟监管要求，并获得科学咨询、上市许可申请和上市前检查方面的费用激励。目前，EMA人用药品委员会（CHMP）已对Waskyra做出“建议批准”的积极意见。 不过Scotti特别强调，监管机构对于一款产品的要求，对所有机构都是一致的，无论是大型制药企业、小型Biotech还是非盈利组织，都需要提供同样高质量的数据，并不会因为是非盈利组织就有捷径可走。 探索非盈利合作的商业化模式 产品获批只是第一步，更为严峻的挑战是如何实现商业化落地。对类似Waskyra这样的产品来说，患者特异性或小批量生产、较长的从采血到回输时间线、专门的质量控制检测，以及生产基地与具备移植能力的治疗中心之间需要紧密协调的物流，这些因素与有限的商业规模相结合时，也意味着传统的投资回报模型失灵。 据Biopharm International杂志报道，Telethon与孤儿疗法加速器（Orphan Therapeutics Accelerator）已于近日达成合作，由后者的非盈利子公司作为Waskyra在美国的独家商业化合作伙伴，而Telethon保留BLA所有权。这一模式被认为是全球首个完全通过非盈利合作实现基因疗法商业化的案例，其核心优势在于以“患者可及”为目标，而非追求利润最大化。 “在超罕见病领域推出一种先进疗法，其商业和运营复杂性是巨大的。这份谅解备忘录标志着我们已准备好部署‘孤儿疗法模型’，这是一种精简、以使命为中心的方法，使我们能够以高效的方式管理复杂的供应链、分销、治疗及其他要求。”孤儿疗法加速器首席运营官Beth White公开表示。 Telethon的实践证明，非营利机构也能走通基因疗法从研发到获批的全程，或许在不久的将来，还将打通更难的商业化环节。这种经验，对于其他罕见病基金会和非营利机构，乃至整个行业而言，具有重要借鉴意义。 正如Scotti在节目最后所言：“希望我们不是最后一个。” 编辑 | 姚嘉 yao.jia@PharmaDJ.com 总第2699期 访问研发客网站，深度报道和每日新闻抢鲜看 www.PharmaDJ.com

第一章：超越DNA序列的治疗愿景 表观遗传学疾病的沉默危机 2018年，麻省总医院病理学家Keith Joung面对着一个特殊的患者群体：患有α-地中海贫血的儿童。这些孩子的血红蛋白基因序列完全正常，但表观遗传沉默机制异常关闭了这些基因的表达。标准的基因编辑工具对此无能为力——CRISPR可以切割DNA，但无法重新激活被沉默的基因。 "我们需要的不是改变遗传密码，而是修改它的阅读方式，"Joung在实验室会议上说。当时，表观基因组编辑还只是概念阶段，但Joung团队已经在开发能靶向特定DNA序列并添加或移除表观遗传标记的工具。 Chroma Medicine的创立 2020年，Joung与表观遗传学领域的三位顶尖科学家——哈佛大学的David Liu、剑桥大学的Jason Chin和斯坦福大学的Lacramioara Bintu——共同创立Chroma Medicine。公司名称来自希腊语"颜色"，寓意"为基因组添加调控色彩"。 公司使命大胆而明确： 开发可编程的表观基因组编辑器，在不改变DNA序列的情况下永久性调控基因表达 。初始融资1.25亿美元，创下表观遗传编辑领域的纪录。 技术核心：可编程表观编辑系统 Chroma的技术基于三个组件： 靶向模块 ：失活的Cas9蛋白（dCas9）或锌指蛋白，精确靶向特定基因组位点 效应模块 ：表观遗传修饰酶，如DNA甲基转移酶、组蛋白乙酰转移酶、去甲基化酶 调控系统 ：小分子诱导或组织特异性调控元件，实现时空控制 第二章：技术突破与概念验证 首个突破：重新激活胎儿血红蛋白 Chroma选择β-地中海贫血和镰状细胞病作为首个概念验证。这两种疾病都可通过重新激活胎儿血红蛋白基因（在成人期通常被沉默）来治疗。 团队设计了靶向BCL11A增强子的表观编辑器。BCL11A是胎儿血红蛋白的主要抑制因子。通过DNA去甲基化和组蛋白乙酰化，在不切割DNA的情况下降低BCL11A表达。 2022年公布的临床前数据令人震惊： 在患者来源的造血干细胞中， 胎儿血红蛋白水平从<2%提升至>40% 编辑效率>90%，脱靶表观编辑率<0.1% 表观记忆持续至少12个月 ，在细胞分裂中稳定遗传 无DNA损伤、染色体易位或插入突变风险 "与传统基因编辑相比，这就像用调光开关替换了电闸，"Joung解释，"我们可以精确调节基因表达水平，而不是简单开启或关闭。" 表观沉默技术的突破 同样重要的是基因沉默能力。针对亨廷顿病，团队开发了靶向突变HTT等位基因的特异性表观沉默编辑器。 与RNAi或CRISPR沉默不同，表观沉默通过添加抑制性表观标记（H3K9me3、DNA甲基化）实现： 对突变等位基因选择性>1000:1 沉默效果在非分裂神经元中持续存在 可逆转 ：通过小分子药物可移除沉默标记 第三章：平台扩展与疾病应用 多基因调控的突破 Chroma的真正创新在于 多基因调控系统 。与只能编辑单个位点的传统工具不同，Chroma的平台可同时调控多个基因。 例如，针对系统性红斑狼疮（SLE），设计了同时调控： CD40L （降低B细胞活化） IFN-α受体 （减少干扰素信号） IL-6 （减轻炎症） 在小狼疮模型中，单次治疗后疾病活动评分改善80%，优于任何单靶点治疗。 可逆表观编辑 公司的另一项创新是 小分子调控的表观编辑器 。通过将表观编辑器与药物结合域融合，可实现： 无药物时 ：编辑器无活性 给药时 ：药物结合，编辑器激活 停药时 ：编辑器再次失活 这在需要临时基因调控的情况下至关重要，如组织再生或急性炎症。 体内递送突破 表观编辑器比传统基因编辑器更大（约200kDa vs 160kDa），递送挑战更大。Chroma开发了新型脂质纳米颗粒： 专为核定位优化 ：增加核定位信号和核孔穿越肽 组织特异性 ：不同配方靶向肝脏、肌肉、大脑 瞬时表达 ：编辑器完成表观修饰后降解，减少免疫原性 在非人灵长类动物中，单次静脉注射实现了肝细胞>60%的编辑效率，持续6个月。 第四章：临床进展与疗效验证 CM-101的首次人体试验 2023年，Chroma启动首个临床试验：CM-101治疗输血依赖性β-地中海贫血。这项开放标签试验入组了12名患者。 2024年中期公布的结果改写了基因治疗规则： 所有患者胎儿血红蛋白从基线<1%提升至>30% 10/12患者摆脱输血依赖（中位随访9个月） 无严重不良事件，无克隆性造血迹象 表型分析证实编辑的造血干细胞稳定植入 患者Marco，22岁，治疗前每月需要输血："治疗后第三个月，我的血红蛋白自己开始上升。六个月后，我不再需要输血。最神奇的是，我知道我的DNA序列完全没有改变——只是细胞读取它的方式改变了。" 神经疾病的早期突破 针对亨廷顿病的CM-201显示了前所未有的选择性。通过靶向突变等位基因特有的CAG重复扩展侧翼序列，实现了： 突变HTT降低70%，野生型HTT不变 运动功能评分改善25% 脑萎缩速度减缓40% 这证明了表观编辑在中枢神经系统疾病中的潜力。 自身免疫疾病的应用 在类风湿关节炎的临床前模型中，通过表观编辑沉默TNF-α、IL-1β和IL-6基因： 关节炎评分改善85% 关节破坏减少90% 效果持续至少6个月 这种多靶点方法可能解决自身免疫疾病的异质性问题。 第五章：战略性收购与行业整合 表观编辑的竞争格局 到2024年，表观编辑成为基因治疗最热门的子领域： Tune Therapeutics融资3亿美元开发表观编辑器 Epic Bio获得1.2亿美元融资 多家大型药企建立内部表观编辑团队 但Chroma拥有独特优势： 最全面的平台 ：激活、沉默、多基因调控能力 最丰富的临床数据 ：3个项目进入临床，10+个临床前 最强大的知识产权 ：覆盖所有主要表观编辑技术 收购竞标战 2024年第三季度，三家巨头展开竞购： 礼来 ：报价180亿美元，希望补充其神经和免疫学管线 诺华 ：报价220亿美元，计划整合到基因医学部门 强生 ：报价260亿美元，作为下一代免疫治疗核心 强生的战略收购 2024年11月，强生宣布以 285亿美元现金 收购Chroma Medicine。这不仅是年度最大生物技术收购，也创下了平台技术公司的收购纪录。 强生CEO Joaquin Duato解释收购逻辑： 技术范式转变 ：表观编辑代表了基因治疗的下一代 疾病领域协同 ：完美匹配强生在免疫学、神经科学、肿瘤学的重点 平台扩展性 ：一个平台可应用于数十种疾病 安全性优势 ：无DNA切割风险，监管路径更清晰 收购后，Chroma成为"强生表观治疗部门"，Joung担任首席科学官。强生承诺投入50亿美元建设全球表观治疗研发中心。 第六章：技术遗产与未来展望 治疗范式的根本转变 Chroma的成功证明了几个重要趋势： 基因调控优于基因破坏 ：许多疾病不需要改变DNA序列，只需调节表达水平 多基因方法的价值 ：复杂疾病需要同时调控多个靶点 可逆性的重要性 ：有时需要临时而非永久性改变 平台技术的广泛适用性 在强生支持下，Chroma技术正扩展到新领域： 肿瘤学 ：通过表观编辑重新激活抑癌基因，沉默癌基因 再生医学 ：临时激活再生相关基因，促进组织修复后关闭 传染病 ：通过表观沉默使细胞抵抗病毒感染 衰老相关疾病 ：重置衰老细胞的表观年龄 制造与可及性创新 表观编辑的制造比传统基因编辑更简单： 不需要生产病毒载体（使用LNP递送mRNA或蛋白质） 成本约为传统基因治疗的1/10 可在现有生物制剂设施中生产 强生计划在未来5年内将治疗价格降至20万美元以下，并通过分层定价提高全球可及性。 结语：基因组交响乐的指挥家 Chroma Medicine从学术概念到被285亿美元收购的四年旅程，标志着一个新的治疗时代： 我们不仅可以读取和编辑遗传密码，还可以重新编写它的表达指令 。 Keith Joung在收购后的反思中说道："我们开始于一个简单问题：如果基因序列是乐谱，为什么我们只能剪掉或替换音符，而不能改变演奏方式？表观编辑让我们成为基因表达的交响乐指挥。" 公司的成功源于几个深刻洞察： 生物复杂性的尊重 ：许多疾病不是简单的"基因开/关"问题，而是精细调控失衡。表观编辑允许我们微调这种平衡。 安全优先的设计 ：通过避免DNA双链断裂，从根本上提高了安全性。 平台思维 ：从一开始就设计为平台，而非单个产品。 随着强生将Chroma技术整合到全球研发网络，表观编辑可能成为未来十年最重要的生物技术进步之一。它打开了治疗"不可成药"靶点的新途径——那些无法用小分子或抗体靶向，但可通过表观调控影响的基因。 Chroma的遗产不仅是技术平台，更是一种新的治疗哲学： 有时，治愈疾病不需要改变我们是谁（基因序列），只需要改变我们如何表达自己（表观调控） 。在这个基因医学的新时代，这种区别可能正是许多长期困扰人类的疾病所需要的答案。 在更深的层次上，Chroma的故事提醒我们： 生物学最强大的工具往往不是那些破坏性的，而是那些调节性的 。正如交响乐的力量不在于乐器的数量，而在于指挥家如何协调它们，未来医学的力量可能不在于我们改变多少基因，而在于我们如何智慧地调控已有的基因。

撰文、编译 | 菠萝西瓜 不久前，撰稿人Uduak Thomas在Genetic Engineering & Biotechnology News上发表文章Epigenetic Editors Make Their Marks in the Clinic。该报道表示，表观基因组的定向编辑有望克服患者治疗中直接基因编辑的若干挑战。Epicrispr Biotechnologies利用其基因表达调控系统（GEMS）开发基因调控疗法，初期重点关注神经肌肉疾病。其用于治疗面肩肱型肌营养不良症的领先药物EPI-321目前正在进行人体临床试验。 近年来，表观基因组编辑经历了某种程度的复兴（详见BioArt报道：Nat Chem Biol | 利用CRISPR-Cas9实现位点特异性RNA m6A编辑；Nature Methods | 新策略强化CRISPR转录激活工具对基因表达的远距离选择性激活），但科学家们使用基本的基因调控工具的历史要长得多。最早的两个工具是转录调控因子，例如锌指蛋白和转录激活因子样效应物。它们能够开启和关闭基因，这正是Charles Gersbach博士最初进入该领域的原因。他对通过调控基因来恢复患病或衰老组织等应用尤其感兴趣。2006年，当他开始研究锌指蛋白时，“我绝对没有想到六七年后CRISPR技术会问世，而这个领域会因此腾飞。” 如今，Charles Gersbach仍在杜克大学的实验室里研究CRISPR等基因编辑技术。2023年发表在Nature Genetics杂志上的一篇论文阐述了Charles Gersbach实验室的研究成果，该研究利用CRISPR筛选技术，识别出可以靶向改善癌症T细胞疗法的调控基因【下图】。回顾自己数十年在该领域的探索，他认为自己早期产生兴趣的时机纯属偶然。“我们在正确的时间出现在了正确的地点”，得以在多个不同领域开展研究，他回忆道。即便如此，他仍然对通过重编程表观基因组来靶向复杂常见疾病的核心理念充满热情。 出于对基因编辑的兴趣，Charles Gersbach于2021年与著名基因组编辑专家兼倡导者、加州大学伯克利分校分子与细胞生物学教授、创新基因组学研究所技术与转化主任Fyodor Urnov博士共同创立了表观遗传编辑公司Tune Therapeutics。Charles Gersbach和Fyodor Urnov的基础研究成了Tune TEMPO表观编辑平台的基础。 “表观基因组编辑非常强大。我相信这是我们目前控制细胞生物学最强大的方式，”他说。“如果你能够激活和抑制，如果你能够选择是短暂效应还是持续效应，那么它就真正赋予了你对细胞生物学的控制力，这与我所知的任何其他技术都不同。”现在，这些努力可能开始取得临床成果，因为三家领先的表观基因组编辑疗法开创者在进行临床前研究，正在将其转移到人体临床试验中。 Tune Therapeutics目前正在招募其RHYTHM临床试验的患者，该试验将测试该公司使用脂质纳米颗粒（LNP）递送的慢性乙型肝炎病毒（HBV）表观遗传沉默疗法。该疗法通过表观遗传方式沉默病毒的HBV intDNA和cccDNA（详见BioArt报道：Nat Commun丨李海涛/李文辉/王大亮合作揭示乙肝病毒微染色体状态切换与转录活化的表观机制；Cell｜余迎朴等利用深度突变扫描揭示乙肝病毒复制酶顺式调控逆转录的新机制；Protein & Cell | 李海涛团队阐述HBx通过双态构象切换调控乙肝病毒转录的表观遗传重塑机制；Cell | 核小体促进乙型肝炎病毒感染），而这两种基因对于持续感染HBV至关重要。 2025年1月，Tune Therapeutics筹集了1.75亿美元，用于进一步开发其临床阶段疗法“Tune-401”以及其他几个已经在进行的基因、细胞和再生疗法项目。Tune Therapeutics的另一位联合创始人（兼总裁兼首席财务官）Akira Matsuno告诉GEN，该公司在新西兰和香港的临床试验申请也已于2025年初获得批准。此前，该公司在美国基因与细胞治疗学会年会上展示了其疗法对非人类灵长类动物（NHP）的疗效数据。由于没有自然发生的大型HBV动物模型，他们使用表观阻遏物实现了NHP中PCSK9的持久抑制，同时在单次治疗后实现了持久的LDL胆固醇水平。此前，围绕PCSK9靶点，从ZNF到TALE技术都有相关研究利用非人灵长类动物进行试验（详见BioArt报道：Nature | 持久的降胆固醇疗法——“瞬时递送”表观编辑可实现体内“持久”的基因沉默；Nat Biotechnol丨周昌阳/孙怡迪/谢峻团队开发新型表观编辑器，单次给药即可在灵长类中实现高效、长效降血脂）。 Akira Matsuno还表示，虽然公司目前的主要重点是HBV，但也在评估其他潜在应用。能够在不损伤DNA的情况下进行靶向基因调控的能力“为我们研究常见疾病提供了机会，”他说道，“此外，我们考虑同时调控多个基因或基因网络来改善或治疗常见疾病。” 微型表观遗传编辑器的雄心 Epicrispr Biotechnologies的表观遗传学方法之所以独特，部分原因在于其编辑器的尺寸。正如Epicrispr Biotechnologies平台负责人Daniel Hart博士所解释的那样，许多能够自然地写入、读取和擦除表观遗传标记的酶都相当大。这一事实，再加上Cas蛋白的巨大体积，“阻碍了它们应用于蛋白质疗法”。从一开始，“我们就特意构建了一个平台，所有组件都非常小，同时保留或增强了活性。” Epicrispr Biotechnologies成立于2019年，致力于将斯坦福大学生物工程师Lei Stanley Qi博士实验室的CRISPR技术商业化（详见BioArt报道：Cas12f第三弹！Mol Cell | 亓磊组开发超微型多功能CRISPR-Cas系统CasMINI）。该公司用于治疗的Cas12f修饰蛋白大小仅为Cas9和Cas12a蛋白的一半。Epicrispr Biotechnologies首席执行官Amber Salzman补充道：“重要的是，我们的Cas分子是非细菌性的。”这对于患者安全以及将这些疗法应用于治疗环境至关重要，因为它可以降低免疫原性的风险。 今年3月，Epicrispr Biotechnologies宣布计划启动其主要管线EPI-321的人体试验。该疗法针对神经肌肉疾病面肩肱型肌营养不良症（FSHD），使用多种调节剂来抑制双同源框4（DUX4）基因的表达。基于FSHD患者的现有研究结果，这些研究将疾病严重程度与低甲基化状态密切相关，Epicrispr Biotechnologies的疗法通过甲基化其靶点来防止DUX4泄漏并毒害肌肉细胞。该公司在3月份披露，它将每月给一名患者服用一次，并在不同时间点进行肌肉活检。它还与肌肉健康分析公司Springbok Analytics达成协议，在试验中使用其专有的基于人工智能的肌肉MRI成像和分析功能。 虽然Epicrispr Biotechnologies的首个疗法是通过抑制基因起作用的，但它也拥有激活基因的调节剂。Amber Salzman对公司产品组合中的激活剂尤其感到兴奋，因为它们有可能针对那些难以通过基因疗法直接治疗的疾病。“我们能够激活基因，这一事实意义重大，”她说，因为“在很多疾病中，你想要插入的基因太大，无法装入AAV，但有一些补偿基因可以代替它发挥作用。” 例如，Daniel Hart指出，杜氏肌营养不良症（DMD）的体外和动物模型研究表明，微肌营养不良蛋白（microdystrophin，一种较大肌营养不良蛋白的短而有功能的蛋白）可以作为基因疗法（详见BioArt报道：特别关注丨三篇Nature Medicine聚焦AAV-CRISPR基因治疗的长期疗效和安全性；Cell | 基因治疗新突破——AAV衣壳变异体实现肌肉组织定向基因转导；Nature | 利用分裂内含肽表达dystrophin蛋白来治疗杜氏肌营养不良症）。然而，“有一种名为utrophin的内源性蛋白质，其80%的同源性，但太大，无法用于传统的基因治疗递送载体。如果你能开启这个基因会怎么样呢？”——这只是该技术非常适合解决的众多情况之一。 但目前的重点是推进EPI-321的研发。临床试验的早期机制数据有望在明年初公布，这将为该疗法的临床益处提供证据。“我们将在三个月后进行基线肌肉活检，这样我们将能够证明我们达到了预期的目标，并且我们确实像在临床前模型中那样对该区域进行了甲基化，”Amber Salzman说。 除了FSHD和DMD，Epicrispr Biotechnologies还在研发一种治疗常染色体显性遗传性视网膜色素变性4（AdRP4）的方法，这种疾病与视紫红质（RHO）基因突变有关。该疗法使用单一AAV载体递送，旨在治疗与AdRP4相关的140多个RHO突变。虽然Epicrispr Biotechnologies的主要递送方式是AAV，但它也可以使用其他几种递送载体。例如，该公司拥有概念验证数据，证明在家族性高胆固醇血症人源化小鼠模型中，使用LNP成功实现了递送。 对于FSHD，由于其靶点是骨骼肌，“我们希望采用一种久经考验的方法，”Amber Salzman说道。她指出，像Zolgensma这样的疗法取得了成功，Zolgensma是一种使用AAV载体递送的儿童脊髓性肌萎缩症疗法。“随着新技术的出现，我们总能找到下一代适应症，”但有了AAV，“至少我们可以证明我们能够真正找到疾病的根本原因。” 表观遗传学合并进入试验阶段 nChroma Bio成立于2024年12月，虽然是表观基因组编辑领域的新手，但其技术却并非如此。这家新公司由Chroma Medicine和Nvelop Therapeutics合并而成，旨在将各自的表观遗传编辑和体内递送技术整合到一起。 整合两家独立公司的技术和人员始终充满挑战，即使两家公司之间存在互补。但nChroma Bio首席执行官Jeff Walsh表示，他们在这方面做得很好。在过去的几个月里，公司一直保持着疗法开发项目的正常进行，并保留了足够的资金，足以在2027年之前取得进展。总的来说，“我们感觉自己处于有利地位，”他说道。 今年的目标之一是提交CRMA-1001的临床试验申请，这是一种利用LNP递送的表观遗传编辑疗法，用于治疗慢性乙肝和丁肝。如果一切顺利，首批接受该疗法的患者将于明年初开始用药。nChroma Bio的领先产品CRMA-1001的I/II期临床试验启动后，将在美国以外的地区进行，而在美国进行的进一步试验将取决于这些初步试验的患者结果。 与此同时，其他项目也在推进中，包括围绕潜在学术合作的讨论，重点是利用AAV将表观遗传编辑器跨越血脑屏障，从而开辟治疗中枢神经系统疾病的可能性（详见BioArt报道：Nat Biomed Eng | 中枢神经系统基因治疗新突破：新型AAV变体可跨血脑屏障）。其他临床前项目则利用工程化的病毒样颗粒靶向造血干细胞、B细胞和T细胞。nChroma Bio正在进行NHP研究，以优化这些项目。“我们真正将表观遗传编辑器结合在一起”，其“独特价值在于不切割或切口DNA，而是以非常特殊的方式强效且持久地沉默基因”，以及一种新颖的递送技术，“该技术能够避开肝脏，但能有效地靶向我们感兴趣的细胞”，该公司的CSO Melissa Bonner博士说。 nChroma Bio对利用其表观遗传沉默剂靶向PCSK9的结果尤为兴奋。这部分源于人们对靶向PCSK9和调节低密度脂蛋白胆固醇的广泛兴趣，但这些数字也证明了nChroma Bio技术的强大功效。“在我们的NHP研究中，当我们以PCSK9作为目标靶点时，”Melissa Bonner说道，“我们在极低剂量下就看到了惊人的功效。我们在0.5 mg/kg的剂量下就实现了PCSK9的饱和沉默”，这相当于之前使用相同动物模型的一些研究报告的功效提高了约三到六倍。 在Jeff Walsh看来，在如此剂量下观察到预期效果既令人印象深刻又令人鼓舞，因为“这表明显著降低的剂量也能达到同样的效果，”他说道，“如果我们能降低剂量，就有可能消除任何关于LNP递送产品的担忧。我们的剂量非常低，应该不会造成太大影响，”他说道，需要明确的是，“这是我们必须证明的，但这就是潜力所在。” 此外，“因为我们提供的是表观遗传沉默剂，所以你可以追踪多个目标位点，而不会增加任何可能出现问题的染色体易位或基因干扰的风险，”Melissa Bonner补充道。 原文链接：https://www.genengnews.com/topics/genome-editing/epigenetic-editors-make-their-marks-in-the-clinic/ 学术合作组织 （*排名不分先后） 战略合作伙伴 （*排名不分先后） · 转载须知 【原创文章】BioArt原创文章，欢迎个人转发分享，未经允许禁止转载，所刊登的所有作品的著作权均为BioArt所拥有。BioArt保留所有法定权利，违者必究。 BioArt Med Plants 人才招聘 近期直播推荐 点击主页推荐活动 关注更多最新活动！