单细胞组学
1. A Glucose-Responsive Intelligent Antibacterial and Oxygen-Producing Hydrogel Promotes the Healing of Diabetic Wounds by Regulating Cellular Heterogeneity.
葡萄糖响应型智能水凝胶通过调节细胞异质性促进糖尿病伤口愈合。糖尿病慢性伤口因持续感染和缺氧难以愈合，亟需智能给药系统。开发的CF-CPGaMPN水凝胶能响应高糖释放药物并持续供氧，单细胞测序揭示其通过抑制中性粒细胞胞外陷阱和改善缺氧环境发挥作用。该研究为糖尿病感染伤口提供了创新的治疗策略，并为定制化生物医学水凝胶的设计提供了参考。
糖尿病足溃疡, 伤口愈合 | 细胞异质性, 中性粒细胞胞外陷阱 | 智能水凝胶, 单细胞RNA测序
Liu Manxuan · … · Zhang Linglin · · 2026/01/31
该研究由口腔医学四川大学华西口腔医院Zhang Linglin团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
原文链接：https://doi.org/10.1002/advs.202517028
2. Runx1 transcription factor modulates opioid analgesia and withdrawal in humans and rodents.
Runx1转录因子调节人类和啮齿动物的阿片类药物镇痛与戒断。阿片类药物的疗效和副作用存在显著个体差异，其背后的遗传决定因素尚不明确。研究发现Runx1通过调节小胶质细胞转录组影响阿片类药物反应，其缺失会降低吗啡效力并加剧戒断症状，且人类RUNX1变异与临床表型相关。识别RUNX1易感基因型有助于理解阿片类药物反应的个体差异，为实现个性化疼痛管理提供了可能。
阿片类药物成瘾, 镇痛反应 | Runx1, 小胶质细胞 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫共沉淀测序
Leduc-Pessah Heather · … · Trang Tuan · · 2026/01/30
该研究由神经生物学卡尔加里大学Trang Tuan团队完成 Neuron
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.neuron.2025.11.018
3. A pan-cancer single-cell transcriptomic atlas of human bone metastases.
人类骨转移瘤泛癌单细胞转录组图谱揭示免疫治疗新靶点。骨骼是癌症转移的常见部位，但驱动骨转移的分子机制及微环境特征尚不明确。通过对62例骨转移瘤的单细胞测序，研究识别了与肿瘤增殖相关的基质细胞亚群及耗竭性T细胞，并证实联合免疫治疗能显著增强抗肿瘤效果。该研究为理解骨转移的分子基础提供了系统视角，并为优化骨转移患者的免疫治疗方案指明了方向。
骨转移, 肿瘤微环境 | T细胞耗竭, 免疫检查点 | 单细胞RNA测序, 联合免疫治疗
Wang Shuoer · … · Sun Yidi · · 2026/01/30
该研究由神经科学中科院脑科学与智能技术卓越创新中心Sun Yidi团队完成 Cell reports. Medicine
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2025.102583
4. Distinct tumor immune microenvironmental (TIME) landscapes drive divergent immunotherapy responses in glioblastoma.
胶质母细胞瘤免疫微环境景观决定免疫治疗响应。免疫疗法在胶质母细胞瘤（GBM）中效果有限，亟需根据肿瘤免疫微环境（TIME）进行精准分型。研究利用单细胞测序等技术将GBM分为三种具有独特血管-免疫特征的TIME亚型，并发现TIME-med型对免疫治疗最敏感。该研究为GBM的个体化免疫治疗策略提供了重要理论依据，强调了针对特定亚型逆转免疫抑制的重要性。
胶质母细胞瘤 | 肿瘤免疫微环境, 血管生成, 免疫抑制 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化
Weng Linqian · … · Bergers Gabriele · · 2026/01/31
该研究由肿瘤微环境VIB-KU鲁汶癌症生物学中心Gabriele Bergers团队完成 Neuro-oncology
原文链接：https://doi.org/10.1093/neuonc/noag018
空间组学
1. Microenvironmental niches dictate divergent fibroblast fates in reversible versus progressive lung fibrosis.
空间微环境生态位决定肺纤维化中成纤维细胞的不同命运。间质性肺疾病中可逆修复与进展性纤维化的转换机制尚不明确。利用空间转录组学，研究发现组织机化性肺炎与特发性肺纤维化具有截然不同的细胞生态位，分别对应成纤维细胞的凋亡敏感与耐受状态。这些空间微环境特征为区分肺疾病表型提供了分子依据，并为精准治疗纤维化提供了新靶点。
肺纤维化, 间质性肺疾病 | 细胞生态位, 成纤维细胞命运 | 空间转录组学
Song Licheng · … · Xie Lixin · · 2026/01/30
该研究由呼吸医学解放军总医院第八医学中心Xie Lixin团队完成 EBioMedicine
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2026.106142
2. Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial.
尼伏鲁单抗联合化疗用于交界可切除胰腺癌的新辅助治疗。评估免疫检查点抑制剂联合化疗在非晚期胰腺癌中的疗效与安全性。临床试验显示该方案具有良好的安全性及病理缓解率，并延长了患者生存期。空间转录组分析揭示了治疗后肿瘤微环境中免疫细胞的积极变化。
胰腺导管腺癌 | 肿瘤免疫微环境 | 新辅助治疗, 空间转录组学
Wainberg Zev A · … · Donahue Timothy R · · 2026/01/31
该研究由肿瘤外科加州大学洛杉矶分校Timothy R. Donahue团队完成 Nature communications
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-68976-2
3. Molecular signatures of resilience to Alzheimer's disease in neocortical layer 4 neurons.
大脑皮层第4层神经元对阿尔茨海默病的韧性分子特征。探索AD中神经元选择性易感性背后的分子韧性机制。通过单细胞和空间转录组学识别出一群上调突触维护和神经保护基因的韧性神经元，并发现关键因子KCNIP4。该研究为干预神经退行性疾病提供了潜在的保护性靶点。
阿尔茨海默病 | 神经元韧性, KCNIP4 | 空间转录组学, 单细胞核测序
Dharshini S Akila Parvathy · … · Cobos Inma · · 2026/01/31
该研究由神经病理学斯坦福大学Inma Cobos团队完成 Nature communications
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-68920-4
4. Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice.
空间转录组揭示多氯联苯对成年小鼠大脑的神经毒性。环境污染物多氯联苯（PCBs）与认知下降有关，但其对大脑特定区域的分子影响尚待深入评估。研究利用空间转录组技术发现PCB暴露导致小鼠空间记忆受损，并破坏了血脑屏障完整性及特定脑区的基因表达网络。该研究为PCB暴露影响大脑功能和认知的机制提供了分子层面的见解。
神经毒性, 认知下降 | 血脑屏障破坏, 紧密连接蛋白 | 空间转录组学, 行为学测试
Basu Budhaditya · … · Chatterjee Snehajyoti · · 2026/01/31
该研究由神经科学爱荷华大学Snehajyoti Chatterjee团队完成 Molecular psychiatry
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41380-026-03466-x
基因组或者转录组学
1. Large-scale metagenomic analysis reveals host genetics shapes microbiomes in wild freshwater fish gut and skin.
宿主遗传发育决定野生淡水鱼类皮肤与肠道微生物群。野生淡水鱼类微生物群对生态和经济具有重要意义，但其群落构建机制尚不清晰。通过对121种鱼类的大规模宏基因组分析，研究发现宿主系统发育是微生物变异的主导因素，并识别出具有益生潜力的鲸杆菌属。该工作扩展了鱼类微生物基因组资源，揭示了宿主-微生物共进化规律，为水产养殖提供了益生菌资源。
宿主-微生物共进化 | 宿主系统发育, 确定性选择 | 宏基因组测序, 宏基因组组装基因组
Tang Ruixiang · … · Song Zhaobin · · 2026/01/30
该研究由鱼类生物学四川大学Song Zhaobin团队完成 Cell reports
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116930
2. A genome-wide association meta-analysis of cholesterol synthesis intermediates identifies three associations for lanosterol.
胆固醇合成中间体全基因组关联分析揭示羊毛甾醇相关新位点。胆固醇是冠心病的主因，但其生物合成前体物质的遗传基础研究尚不充分。通过对万余人的元分析，研究发现了4个与羊毛甾醇等相关的显著关联位点，并证实羊毛甾醇对冠心病的影响完全由总胆固醇介导。该研究通过中间表型分析完善了胆固醇遗传调控图谱，有助于深入理解冠心病的分子机制。
冠心病, 胆固醇代谢 | 羊毛甾醇, 遗传变异 | 全基因组关联分析 (GWAS)
Förster Franz · … · Scholz Markus · · 2026/01/30
该研究由遗传流行病学莱比锡大学Markus Scholz团队完成 EBioMedicine
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2026.106144
3. lncRNA LUCAT1 Regulates DNA Damage Response in Glioma Stem Cells Under Hypoxia.
lncRNA LUCAT1调控缺氧下胶质瘤干细胞DNA损伤修复。胶质母细胞瘤的耐药性与缺氧环境及胶质瘤干细胞（GSCs）的DNA损伤反应（DDR）密切相关。研究发现LUCAT1通过与DNA-PK全酶相互作用增强NHEJ修复，并调节HR通路关键蛋白。敲低LUCAT1可显著增强GSCs对放疗和DDR抑制剂的敏感性，并改善荷瘤小鼠预后。该研究揭示了LUCAT1是克服GBM耐药性的潜在治疗靶点。
胶质瘤干细胞 | LUCAT1, DNA-PK, DNA损伤修复 | RNA下拉实验, 异种移植模型
Huang Haidong · … · Yu Jennifer S · · 2026/01/31
该研究由肿瘤科学克利夫兰医学中心Jennifer S Yu团队完成 Neuro-oncology
原文链接：https://doi.org/10.1093/neuonc/noag017
4. Pcdh20 is a POU2F3 target gene required for proper tuft cell microvillus organization.
Pcdh20调控丛细胞微绒毛结构的形成与功能。丛细胞在感染和炎症中起保护作用，其独特的微绒毛结构被认为具有机械感觉功能，但机制不明。研究发现POU2F3靶基因Pcdh20编码的蛋白定位于微绒毛，通过同源二聚体连接相邻微绒毛以维持其刚性。该发现支持了丛细胞具有类似于耳蜗毛细胞的机械感觉能力的假设。该研究揭示了丛细胞结构形成的分子基础及其潜在的生理功能。
丛细胞结构 | Pcdh20, POU2F3, 微绒毛 | ChIP-seq, 电子显微镜
Ankenbauer Katherine E · … · DelGiorno Kathleen E · · 2026/01/29
该研究由细胞与发育生物学范德堡大学Kathleen E DelGiorno团队完成 Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
原文链接：https://doi.org/10.1016/j.jcmgh.2026.101742
5. Aeromonas in South Asia: genomic insights into an environmental pathogen and reservoir of antimicrobial resistance.
南亚气单胞菌基因组研究揭示其耐药性与致病潜力。气单胞菌是重要的人畜共患新兴病原体，但其在环境与临床间的传播规律尚不明确。通过对1853个基因组的分析，研究发现该属具有极高的物种多样性和广泛的抗生素耐药基因储备。研究强调了气单胞菌作为耐药基因库的风险，并指出其在霍乱流行区常被误诊。该成果为全球公共卫生监测和新兴病原体防控提供了重要基因组数据支撑。
气单胞菌感染 | 抗生素耐药性(AMR), 基因组多样性 | 全基因组测序, 系统发育分析
Singh Nisha · … · Thomson Nicholas R · · 2026/01/31
该研究由微生物基因组学萨格尔研究院Nicholas R Thomson团队完成 Nature communications
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-68712-w
6. BCL-xL as a therapeutic target in cetuximab-refractory colorectal cancer.
BCL-xL成为西妥昔单抗耐药结直肠癌的潜在治疗靶点。西妥昔单抗治疗KRAS野生型结直肠癌常因耐药而失败，亟需二线治疗策略。转录组分析发现耐药细胞保留了凋亡能力，抑制BCL-xL可有效诱导耐药PDX模型发生凋亡。研究表明BCL-xL抑制剂是一种强效的替代策略，且其疗效在很大程度上独立于肿瘤的突变谱。该发现为克服结直肠癌获得性耐药提供了极具前景的临床转化方向。
结直肠癌耐药 | BCL-xL, 细胞凋亡 | PDX模型, 组织切片培养
Asmanidou Stella · … · Olayioye Monilola A · · 2026/01/31
该研究由细胞生物学斯图加特大学Monilola A Olayioye团队完成 Cell death & disease
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41419-026-08434-5
7. Discover the maze-like network for glabridin biosynthesis.
揭示光甘草定生物合成的复杂代谢网络。类黄酮多样性源于复杂的酶促修饰，解析其进化代谢网络对生物制造具有重要意义。研究通过基因组与转录组分析，在酵母中重建了光甘草定合成途径，揭示了动态甲基化循环调节机制。该研究建立的代谢冗余与互联模型显著提升了合成效率，优于单路径设计。这为天然产物发现和高效生物制造提供了新的范式和理论指导。
天然产物合成 | 光甘草定, 代谢网络 | 酵母异源表达, 基因组组装
Zhang Zhen · … · Li Chun · · 2026/01/31
该研究由合成生物学清华大学李春团队完成 Nature communications
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-68881-8
8. Early detection of aberrant cell fate and repair using circulating progenitor cells in patients with heterotopic ossification.
利用循环祖细胞早期检测异位骨化中的异常细胞命运。针对异位骨化（HO）诊断滞后、缺乏早期干预机会的临床痛点。通过微流控技术分离循环间充质祖细胞并进行转录组分析，建立了高灵敏度的早期风险预测模型。该液态活检平台为HO及相关间充质疾病的早期监测提供了非侵入性手段。
异位骨化 | 间充质细胞命运 | 液态活检, RNA测序
Nunez Johanna · … · Karabacak N Murat · · 2026/01/31
该研究由生物医学工程马萨诸塞州总医院N. Murat Karabacak团队完成 Nature communications
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-68857-8
9. Metastatic progression of pheochromocytoma and paraganglioma occurs via parallel evolution.
嗜铬细胞瘤和副神经节瘤的转移通过平行演化发生。旨在阐明这种罕见神经内分泌肿瘤在转移过程中的基因组演变。通过对配对样本的全外显子组测序，发现原发灶与转移灶共享突变率低，呈现单克隆播种和平行进展特征。该研究揭示了染色质重塑等潜在治疗靶点，助力精准医疗。
嗜铬细胞瘤与副神经节瘤 | 平行演化, 染色质重塑 | 全外显子组测序
Pregnall Andrew M · … · Wachtel Heather · · 2026/01/31
该研究由肿瘤外科宾夕法尼亚大学Heather Wachtel团队完成 NPJ precision oncology
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41698-026-01291-7
10. Architectural and evolutionary features of TE-derived TSSs shape tissue-specific promoter activity in the human genome.
转座因子衍生启动子的结构与演化特征塑造组织特异性活性。探讨转座因子（TE）作为人类基因组替代启动子的贡献及其调控机制。通过整合高分辨率转录起始位点数据，揭示了TE衍生启动子的窄峰结构及随演化时间变化的活性梯度。该研究深化了对灵长类谱系特异性调控创新的理解。
组织特异性基因表达 | 转座因子, 启动子演化 | RAMPAGE测序
Zhang Ya · … · Zhang Xiao-Ou · · 2026/01/31
该研究由遗传学同济大学张晓鸥团队完成 Nature communications
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-68934-y
11. Rhizosphere microbial functions drive ecological stoichiometry in soils across an elevational gradient of a temperate mountain ecosystem.
根际微生物功能驱动山地生态系统土壤化学计量。根际微生物组与土壤生态化学计量特征之间的关系在海拔梯度上仍不明确。研究通过分析20个优势植物种群的根际微生物组，发现功能基因是预测土壤碳、氮、磷及其比例的最强驱动因素。该发现强调了根际微生物作为生物过滤器，在调节气候影响与土壤养分平衡中的关键作用。
土壤生态化学计量 | 碳氮磷循环基因 | 宏基因组测序, 结构方程模型
Yang Yi · … · Xie Yingzhong · · 2026/01/31
该研究由生态学宁夏大学Xie Yingzhong团队完成 Communications biology
原文链接：https://doi.org/10.1038/s42003-026-09553-7
12. Gut microbial signatures expose the westernized lifestyle of urban Ethiopian children.
肠道微生物特征揭示埃塞俄比亚城市儿童生活方式西化。城市化进程改变了非洲儿童的生活方式，但其对肠道菌群的具体影响相较于欧美人群研究较少。通过对约200名埃塞俄比亚儿童的宏基因组分析，发现城市儿童菌群更接近欧洲人群，且传统发酵食物摄入可部分抵消西化影响。研究结果表明城市化生活显著改变了肠道菌群构成，为理解环境因素对儿童健康的影响提供了新视角。
肠道微生物多样性, 生活方式西化 | 菌群组成演变 | 16S rRNA测序, 宏基因组学
Kirsche Lydia · … · Müller Anne · · 2026/01/31
该研究由分子癌症研究苏黎世大学Anne Müller团队完成 Communications biology
原文链接：https://doi.org/10.1038/s42003-026-09639-2
13. eIF6 deficiency alleviates colorectal cancer by modulating the gut microbiota and related metabolites.
eIF6缺失通过调节肠道菌群及其代谢物缓解结直肠癌。eIF6在多种癌症中高表达，但其通过肠道菌群失调影响结直肠癌（CRC）的机制尚不清楚。研究发现eIF6缺失可富集有益菌D. newyorkensis及其代谢物3-ICA，从而增强肠道屏障功能并抑制肿瘤增殖。该研究揭示了eIF6-菌群-代谢物轴在CRC中的作用，为结直肠癌的预防和治疗提供了新靶点。
结直肠癌 | eIF6, 肠道菌群, 3-ICA | 16S rDNA测序, 粪菌移植
Yang Shuai · … · Chen Renjin · · 2026/01/31
该研究由生物学徐州医科大学Chen Renjin团队完成 Cell death and differentiation
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41418-026-01674-0
14. "SHANK3 deficiency alters early progenitor dynamics and reveals shared pathways with neurodegeneration".
SHANK3缺失改变早期神经祖细胞动态并关联神经退行。Phelan-McDermid综合征（PMS）具有复杂的神经发育特征，但其发育倒退的分子机制仍不明确。通过iPSC诱导神经元测序和脑电图分析，发现SHANK3缺失导致祖细胞过度增殖及神经元兴奋性异常，且与神经退行通路重叠。研究确定了PMS发育轨迹的紊乱，并为该病的治疗方案提供了分子和神经生理学标志物。
Phelan-McDermid综合征, 发育倒退 | SHANK3, 神经祖细胞增殖 | iPSC, RNA测序, 脑电图
Varella-Branco Elisa · … · Dos Santos E Passos Bueno Maria Rita · · 2026/01/31
该研究由人类基因组圣保罗大学Maria Rita Passos-Bueno团队完成 Molecular psychiatry
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41380-025-03433-y
15. Splitting schizophrenia: divergent cognitive and educational outcomes revealed by genomic structural equation modelling.
基因组结构方程模型揭示精神分裂症的异质性路径。精神分裂症与智商及受教育程度之间的遗传关系复杂，且常受到与双相情感障碍遗传重叠的影响。研究通过基因组SEM区分了精神分裂症特有及与双相障碍共享的遗传组分，发现两者在认知和教育结局上表现出截然相反的关联。这些发现支持精神分裂症存在两种不同的遗传路径，为剖析神经精神疾病的异质性提供了重要工具。
精神分裂症, 认知异质性 | 遗传相关性, 多基因风险评分 | 基因组结构方程模型 (Genomic SEM)
Watson Cameron James · … · Vassos Evangelos · · 2026/01/31
该研究由精神医学伦敦国王学院Evangelos Vassos团队完成 Molecular psychiatry
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41380-026-03444-3
16. Comprehensive profiling of CRISPR/dCas9 epigenome editors indicates a complex link between on and off target effects.
全面评估CRISPR/dCas9表观基因组编辑器的脱靶效应。CRISPR/dCas9表观编辑技术虽具潜力，但其脱靶效应和编辑稳定性仍是临床应用的主要障碍。研究系统比较了多种DNA甲基化编辑工具，发现增强编辑效力的同时往往伴随广泛的脱靶甲基化及转录组改变。该研究为优化表观遗传编辑工具的设计提供了关键见解，强调了在效力与特异性之间取得平衡的重要性。
表观遗传编辑, 脱靶效应 | DNA甲基化, 转录调控 | CRISPR/dCas9, 甲基化测序
Pahlevan Kakhki Majid · … · Jagodic Maja · · 2026/01/31
该研究由临床神经科学卡罗林斯卡学院Maja Jagodic团队完成 Genome biology
原文链接：https://doi.org/10.1186/s13059-026-03967-6
17. MER57E3 transposable elements regulate gene expression in a human cell model of neural development.
MER57E3转座子调节人类神经发育中的基因表达。转座子（TEs）曾被视为基因组寄生虫，但其作为细胞特异性顺式作用元件在神经发育中的作用尚不明确。研究发现灵长类特异性TE亚家族MER57E3富集活性组蛋白修饰，并通过调节PAX6和NEUROG2等关键基因影响神经发生。该成果揭示了TE表观遗传失调在神经发育障碍发病中的潜在作用，为理解基因组演化提供了新视角。
神经发育障碍 | 转座子, PAX6, NEUROG2 | CRISPRi, RNA测序
Almeida da Paz Michelle · … · Taher Leila · · 2026/01/31
该研究由生物医学信息学格拉茨理工大学Leila Taher团队完成 Genome biology
原文链接：https://doi.org/10.1186/s13059-026-03946-x
18. Dynamic involvement of the core gut microbiome XNP_Guild1 in the evolution of gestational diabetes mellitus.
核心肠道菌群XNP_Guild1参与妊娠期糖尿病演化。妊娠期糖尿病（GDM）的发生及其对母婴健康的影响与肠道微生物组密切相关，但其动态演化过程仍需深入研究。研究通过多中心队列分析识别出处于“灰色地带”的过渡态人群，并发现核心菌群XNP_Guild1与疾病进展及早期风险显著相关。该发现为GDM的早期预警和母婴微生态干预提供了潜在的靶点和理论基础。
妊娠期糖尿病 | 肠道菌群演化, XNP_Guild1 | 宏基因组测序, 多层网络建模
Du Hualongyue · … · Ou Zihao · · 2026/01/31
该研究由检验医学南方医科大学欧自豪团队完成 Gut microbes
原文链接：https://doi.org/10.1080/19490976.2026.2623353
19. Two worlds beneath: Distinct microbial strategies of the rock-attached and planktonic subsurface biosphere.
地下生物圈附着与游离微生物采取不同生存策略。地下含水层中附着微生物数量远超游离微生物，但其在生态系统功能中的作用常被忽视。研究发现附着菌群在分类和功能上与游离菌群显著分离，富集了生物膜形成和化能自养相关基因，具有极高的固碳潜力。该发现表明碳酸盐含水层可能是巨大的无机碳汇，强调了将附着菌群纳入地下生态系统模型的重要性。
地下生态系统功能 | 碳固定, 生物膜形成 | 宏基因组学, 基因组组装 (MAGs)
Sharma Alisha · … · Taubert Martin · Microbiome · 2026/01/31
⭐ 该研究由水生地球微生物学耶拿大学Martin Taubert团队完成
原文链接：https://doi.org/10.1186/s40168-025-02325-1
蛋白质组学
1. Plasma proteome mediates the associations between air pollution exposure and disease risk.
血浆蛋白质组介导空气污染暴露与疾病风险的关联。系统探讨空气污染影响健康的生物学机制及个体易感性。通过大规模蛋白质组数据识别出数百种介导疾病风险的蛋白，并开发了空气污染蛋白风险评分（APPRS）。该研究为个性化风险评估和精准公共卫生干预提供了工具。
环境暴露健康风险 | 免疫通路, 代谢介导 | 蛋白质组学, 风险评分模型
Li Wenran · … · Wang Sijia · · 2026/01/31
该研究由遗传学中科院上海营养与健康研究所王思佳团队完成 Nature communications
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-68972-6
多组学
1. Targeting hypoxic exosomal IGFBP2 overcomes CD47-mediated immune evasion in glioblastoma.
靶向缺氧外泌体IGFBP2克服胶质母细胞瘤免疫逃逸。缺氧和CD47高表达是胶质母细胞瘤（GBM）免疫逃逸的关键，但两者间的协调机制尚不明确。研究发现缺氧诱导外泌体IGFBP2分泌，通过激活STAT3信号上调CD47并抑制巨噬细胞吞噬。联合阻断IGFBP2和CD47可显著抑制肿瘤生长并延长小鼠生存期。该研究揭示了缺氧驱动免疫逃逸的新轴线，为提高GBM免疫治疗效果提供了新方案。
胶质母细胞瘤 | IGFBP2, CD47, 外泌体 | 单细胞测序, 蛋白质组学
Qi Yanhua · … · Xue Hao · · 2026/01/31
该研究由神经外科山东大学齐鲁医院薛皓团队完成 Cell death & disease
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41419-026-08430-9
2. A spatiotemporal atlas of cerebrovascular development in zebrafish.
斑马鱼脑血管发育时空图谱。脑血管发育的分子动力学及其与血脑屏障成熟的关系尚不完全清楚。结合空间测序与单细胞转录组学，识别了6种内皮亚型并发现关键基因对血管模式的影响。该研究为理解脑血管发育演化及血脑屏障功能提供了多维视角。
脑血管发育 | 血脑屏障成熟 | 空间转录组学, 单细胞转录组学
Li Xiaoyu · … · Zhang Jingjing · · 2026/01/31
该研究由发育生物学广东医科大学张晶晶团队完成 Nature communications
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-026-68995-z
3. Targeting glycerophospholipid biosynthesis overcomes chemoresistance driven by SLFN11 loss in Ewing sarcoma.
靶向甘油磷脂生物合成克服尤文肉瘤中SLFN11缺失导致的化疗耐药。探讨尤文肉瘤复发中SLFN11表达降低引发耐药的代谢机制。通过多组学分析发现SLFN11缺失驱动代谢重编程，增强甘油磷脂合成，靶向该通路可恢复化疗敏感性。该研究揭示了克服肉瘤耐药的潜在代谢靶点和诊断标志物。
尤文肉瘤化疗耐药 | 甘油磷脂生物合成, SLFN11 | 转录组学, 代谢组学
Chakraborty Kasturee · … · Bagga Puneet · · 2026/01/31
该研究由肿瘤代谢圣裘德儿童研究医院Puneet Bagga团队完成 Cell death & disease
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41419-026-08432-7
4. ACACA modulates R-loop homeostasis to enhance lipid metabolism and microenvironmental interactions in ccRCC.
ACACA调节R-loop稳态促进肾透明细胞癌进展。R-loop结构在肾透明细胞癌（ccRCC）微环境中的作用及其与代谢重编程的关系尚不清晰。研究整合多组学数据发现ACACA通过减少R-loop积累、增强脂肪酸代谢来促进肿瘤增殖并重塑微环境。该研究揭示了ACACA作为连接基因组压力与脂质代谢的关键驱动因子，是潜在的预后标志物和治疗靶点。
肾透明细胞癌 | ACACA, R-loop稳态, 脂质代谢 | 单细胞转录组, 空间转录组
Zhang Dong · … · Zhai Xinyu · · 2026/01/31
该研究由泌尿外科上海中医药大学附属曙光医院Zhai Xinyu团队完成 NPJ precision oncology
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41698-026-01319-y
生物信息软件
1. Characterising nanobody developability to improve therapeutic design using the Therapeutic Nanobody Profiler.
TNP工具助力纳米抗体成药性表征与设计。纳米抗体结构独特，现有的单克隆抗体计算方法难以直接应用，限制了其成药性优化。研究开发了开源计算工具TNP，专门针对纳米抗体特性进行校准，并结合临床阶段及实验数据验证了其评估效能。该工具的推出将显著提高新型治疗性纳米抗体的开发效率，优化生物药物设计流程。
药物开发, 成药性表征 | 纳米抗体结构 | 生物信息学工具, 治疗性纳米抗体分析器
Gordon Gemma L · … · Deane Charlotte M · · 2026/01/31
该研究由生物信息学牛津大学Charlotte M Deane团队完成 Communications biology
原文链接：https://doi.org/10.1038/s42003-026-09594-y
2. PolyAseqTrap: a universal tool for genome-wide identification and quantification of polyadenylation sites from different 3' end sequencing data.
PolyAseqTrap工具实现多物种多聚腺苷化位点精准鉴定。选择性多聚腺苷化（APA）是增加转录组多样性的关键机制，但从不同测序数据中精准识别位点仍具挑战。研究开发了R包PolyAseqTrap，利用深度学习模型和加权密度峰聚类策略，有效解决了内部启动和微异质性问题。该工具在多种测序技术和物种数据中表现出极高的稳健性，为APA研究提供了强有力的分析平台。
转录组多样性 | 选择性多聚腺苷化 (APA) | 深度学习, R软件包
Ye Wenbin · … · Wu Xiaohui · · 2026/01/31
该研究由血液学苏州大学附属儿童医院吴晓辉团队完成 Genome biology
原文链接：https://doi.org/10.1186/s13059-026-03963-w
声明：本文使用了AI进行翻译和总结
