BGI Research

环球视野，深度视角 各位亲爱的股东，大家早上好中午好晚上好。 2024年12月6日，据Genomeweb报道ONT再次起诉BGI。 不熟悉这件事情的朋友可能并不熟悉，熟悉这件事情的朋友可能更加迷糊。 这里简单梳理一下事情来龙去脉。 #01 来龙去脉 2024年9月9日，华大发布其自研纳米孔测序仪CycloneSEQ-WT02和WY01。 其中CycloneSEQ-WT02可以立即下单，商业化发售，并可享受19.99万元全套设备的“早鸟价”。 以目前版本试剂，官方自己公布的单次碱基准确度达到97%，纳米孔数量4096... CycloneSEQ发布次日也就是2024年9月10日，ONT向美国加州南区法院递交了传票申请，以便送达给Complete Genomics Inc、Innomics Inc、MGI Americas Inc等公司。 ONT打算起诉华大基因集团（BGI Group）及其子公司，理由是违反合同和可能违反专利许可。 不出意外，ONT慌了 这事情我们在上文有详细分析，感兴趣可以看看。 2024年11月4日，ONT撤回了传票申请。 只是11月的这次撤回我们并没有跟进，其主要原因是我们之前在推演的时候第一点就提到了此前报道中的一个细节： 2024年12月6日，据Genomeweb报道ONT再次起诉BGI。 那么，这次有何不同？ #02 有何不同 首先，起诉地点，主场优势。 这次起诉的法院是英国英格兰和威尔士商业与产权高院，是ONT的主场。 别扯什么法的精神，我大不列颠自有国情在此。 第二，起诉的被告方堪称全面。 根据披露的信息，BGI Shenzhen、Beijing Tech Solutions、Wuhan BGI Clinical Laboratory、BGI Research、MGI Holdings和MGI Tech都被列入被告方。 第三，诉讼缘由。 ONT认为“BGI及其关联公司“不正当地使用”了其技术开发竞争产品Cyclone Seq测序仪及其相关耗材。” ONT声称，BGI及其关联公司“误导”并“反复提供明确的保证”，表示他们“对生产竞争的纳米孔测序技术没有兴趣”。 我们会在最后展开聊聊。 第四，诉讼请求。 请求法院颁发禁令，禁止BGI及其关联公司滥用保密信息和侵犯商业秘密，并禁止销售、许可或使用Cyclone Seq测序仪。 显然，后半段才是最重要的，也是我们推演中第一条提到的： “专利战一个重要的目的就是迟滞竞争对手的商业化步伐。” 这对于后来者，我想上图是比较克制的内心OS了。 好，那么，作为吃瓜群众我们最感兴趣的肯定是第三条咯。 华大真的对ONT做出过“对生产竞争的纳米孔测序技术没有兴趣”的保证吗？ #03 谁也别装小白兔 第一，关于承诺。 咱们首先要明白，商业上纸面上的承诺都可能撕毁（包括国家间的），何况嘴上的呢？ 我认为，华大有可能做出过上述的表述，但是很可能是在某个时间节点做出的。 除了恋爱中的头脑不清楚的两个生物个体能做出“一生一世”的承诺以外，其他任何承诺都是有时间限制的。 你总不能指望着跟我签一年合同，让我永远不开发相关技术吧？ 第二，华大不正当的使用了ONT的技术开发竞品吗？ 我们不是调查机构，也没有超能力并不清楚这一点。 不过，相信所有人都有一个朴素的认知： 任何一家公司不可能直接开放核心技术给任何其他非关联方。 你可能找ONT要马达蛋白的序列吗？还是你可能找他要basecalling算法源码？ 这显然是不可能的。 最多是拆解ONT相关产品，比较自己产品与ONT的产品性能等等。 日本都拆解研究BYD的车呢，咋没见BYD去告他们呢？ 现代社会，谁也别装纯情小白兔。 #04 最后-推演 最后略作一点推演。 第一，这可能是ONT维护自身垄断地位的手段之一。 后续，ONT依然存在在欧洲、美国起诉华大的可能。 第二，ONT的专利战不一定能阻止华大们的崛起。 不要忘了，仅仅在中国就有齐碳、今是、安序源、梅丽、普译和孔确等等多家那么纳米孔测序企业。 在纳米孔测序领域，ONT已经占着这个生态位太久了，该动一动了。 更何况，华大智造此前对阵Illumina有着丰富的经验哦。 第三，存在和解的可能。 虽然，我们认为这种可能性不大。 但是，依然是存在的。 作为大股东之一的腾讯，你努努力？ 最后，我们应该学会接受中国的企业已经过了简单模仿的时代了。 我们高科技产品走向世界是必然，产生冲突也是必然。 这并不以你采用什么商业策略、生产什么产品为转移，只是时间早晚的问题。 做好准备吧，少年！ END 啊对对对对，扫描这货 能联系到我 至此，各位股东星标了么？点赞了么？转发了么？在看了么？谢谢！ 所有内容均不作为投资建议，信息均来自公开资料。 近期文章： FDA Warning|糊弄FDA奇葩行为大赏 Illumina：当ADC遇见NGS Senti|一支穿云箭，4500万 国产测序仪风云录|院士领衔的孔确基因纳米孔测序 Caribou Bio 390万美元买个清净 Cologuard 2.0：我们的医保很有钱呀 相关资料：注1：https://www.genomeweb.com/sequencing/oxford-nanopore-technologies-sues-bgi-affiliates-sequencing-technology-contract-breach注2：https://www.genomeweb.com/sequencing/oxford-nanopore-withdraws-application-serve-bgi-affiliates-subpoenas-intended-lawsuit注3：https://mp.weixin.qq.com/s/AbnWJ9oIewb_EbwGz8RgGw

编辑丨王多鱼 排版丨水成文 2024年11月22日，第十九届国际基因组学大会（ICG-19）在华大集团总部——华大时空中心召开。来自美国、英国、丹麦、澳大利亚、新加坡等国家和地区的100多位科学家、专家和行业领袖齐聚中国深圳，分享组学研究及应用的最新进展，共同探讨生物技术和生物产业的未来发展与合作方向。 今年是中国参与人类基因组计划25周年，自2006年以来，ICG秉承“基因科技造福人类”的主旨，发扬人类基因组计划“共有、共为、共享”的精神，倡导学术自由、激发创新精神、促进生命科学领域合作，已发展成为具有全球影响力的组学领域学术盛会。 传承与创新：为推动全球基因组学的深入发展贡献智慧和力量 大会学术委员会主席、华大集团联合创始人、监事长刘斯奇在开幕致辞中回顾了国际基因组学大会自首届在杭州举办以来的发展历程。历经18年的发展，ICG的足迹已经遍布中国深圳、武汉、青岛等城市，以及海外城市如美国费城、比利时根特、泰国曼谷等，这展现了ICG不断扩大的影响力。他强调，华大的使命不仅限于研究，还致力于推动基因组学在工业和医疗等领域的应用，期待本次大会能加速推动组学技术与应用的进一步融合，推动组学领域未来的创新发展。 在11月21日以“站在巨人的肩膀上看未来”为主题的预热会议上，作为大会组委会主席，中国科学院院士、华大集团联合创始人、理事长杨焕明回顾了包括人类基因组计划在内的基因组学领域重要里程碑，强调了伦理考量、数据开放共享以及全球合作的重要性，并表达了对科学先驱的致敬，以及对创新和跨学科合作的愿景。 中国科学院院士、西北大学教授舒德干以线上视频方式发表演讲，通过阐述其近60年间与达尔文进化论的五次交集，分享了其对达尔文进化论的理解，以及在破解“寒武纪生命大爆发”等谜题过程中的体会。 苏丹国家科学院教授Mohamed Hassan强调了国际合作在应对气候变化、疫情、粮食安全和社会不平等等全球性挑战中的重要作用。他指出，加强全球伙伴关系，通过发达国家与发展中国家之间的合作，以及利用在线平台扩大知识获取范围，对于弥合教育差距至关重要，有助于构建一个更包容、更可持续的未来。 科学盛宴：100余场学术报告+科普嘉年华 本届大会涵盖了从组学突破到生物多样性基因组学、宏基因组学、脑科学与衰老、公共卫生和精准医学等一系列前沿科学主题，汇聚了包括10位院士在内的100余位来自全球不同国家和地区的专家学者，期待通过深入的交流与探讨，共同推动组学领域的发展。 目前，大会已聚焦人工智能、个性化医疗、国际科学与教育合作等当前热议话题举行了多场会议，围绕“妇幼健康和儿童教育”、“组学技术与科学突破”、“生物多样性”、“宏基因组学”主题开展了数十场学术报告。 肠道菌群及其在癌症发生中的作用是当前研究的热点领域。香港科学院院士、欧洲科学院外籍院士、香港中文大学于君教授发表了“肠道微生物组在胃肠癌中的作用”主题演讲。于君教授团队的研究不仅揭示了特定肠道菌群与结直肠癌和胃癌的关联，发现了新的病原体——咽峡炎链球菌与胃癌发生的关系，还率先利用粪便微生物作为非侵入性标志物检测结直肠癌，并在结直肠癌的免疫治疗方面取得重要进展。这些研究为胃肠道癌症的早期诊断、精准治疗和预后评估提供了新的方向。 丹麦自然科学院院士、哥本哈根大学教授Karsten Kristiansen强调了口腔和肠道微生物群在开发下一代益生菌方面仍有潜力。他的团队构建了人体肠道细菌基因组集（CGR2），提供了3324株人体肠道培养菌株的高质量基因组集合，其中包含的基因组数据涵盖人体肠道微生物中的527个物种，包括179个尚未被报道的细菌新物种。Kristiansen教授强调了这些新鉴定的细菌在对抗代谢紊乱方面的潜力，称其有望为下一代益生菌开发提供参考。 中国科学院和中国医学科学院荣誉教授Lars Bolund在演讲中介绍了目前再生医学领域的研究成果。他认为，大规模测序以及单细胞、空间组学技术的发展，开启了基于人工智能的比较进化研究，让我们能更好地理解体细胞进化。他强调，受遗传构成、生活方式和周围环境等的影响，衰老并不是一个严格按时间顺序发生的现象。我们可以通过对干细胞或组织、器官进行医学干预来改变衰老过程。 鼻咽癌在我国高发，但由于其病变部位隐蔽、早期症状不明显，临床上超过80%的患者被确诊时已处于中晚期，对后续治疗造成极大挑战。中国科学院院士、中山大学肿瘤防治中心常务副院长马骏在主题演讲中分享了其在鼻咽癌精准诊疗方向的研究进展，包括确立鼻咽癌临床分期标准，开发出新策略，在提高疗效的同时降低毒副作用等，让我们看到了鼻咽癌精准诊疗的希望。 斯坦福大学教授Dean Walton Felsher发表了“精准肿瘤学如何利用疾病弱点治愈人类癌症”主题报告，介绍了致癌基因MYC在治疗癌症中的潜力。MYC是人类癌症中最常见的致癌基因之一，已被证明是一种潜在的治疗靶点。在淋巴瘤、白血病、骨肉瘤和胰腺癌等各种癌症中，通过增殖停滞、细胞凋亡和免疫系统参与等机制，使MYC失活可导致肿瘤显著消退。Felsher教授强调，这可能为治疗多种癌症类型提供一种广泛有效的策略。 美国国家科学院院士、南方科技大学朱健康教授重点介绍了遗传学和表观遗传学领域的最新进展，强调了它们在医疗、衰老和农业中的重要作用。他认为，利用好DNA甲基化和基于CRISPR的工具靶向表观遗传变化，将有助于疾病管理和衰老干预。在农业领域，高油酸大豆、低GI大米以及富含营养的西红柿等基因编辑作物则是促进健康和可持续发展的重要创新。他强调，这些创新将尖端技术与实际应用相结合，将更好地应对健康和营养领域的全球性重大挑战，推动可持续发展。 全球数据分析服务公司科睿唯安（Clarivate）于11月19日正式公布2024年度“全球高被引科学家”名单，该名单旨在遴选全球高校、研究机构和商业组织中对所在研究领域具有重大且广泛影响的顶尖科研人才。本次大会上，科睿唯安为入选2024年度“全球高被引科学家”名单的华大集团联合创始人、理事长杨焕明，华大集团执行董事、华大生命科学研究院院长徐讯，丹麦自然科学院院士、哥本哈根大学教授Karsten Kristiansen以及杜克-新加坡国立大学医学院副教授陈金妙进行颁奖，以表彰他们在各自研究领域作出的重要贡献。 在未来的两天，大会还将围绕“生命前沿与智能计算”、“公共卫生、人口遗传学与精准医学”、“基因编辑与生物制造”等主题进行探讨，并以“科普嘉年华”为主题，邀请生命科学及科普领域的专家学者与学生代表，畅谈生命科学的多姿多彩，探索其向教育场景转化的前景与应用。同时，举办青年科学家论坛，为来自世界各地的青年学生学者搭建平台，提供最新的生命组学研究洞察、助力职业生涯发展、构建学术交流网络。 今年5月，举办的ICG-19泰国分会场，以“组学、健康与长寿”为主题，深入探讨了如何通过基因科技揭开衰老的奥秘，探索有效应对衰老挑战的路径等。据悉，ICG-19三亚专场将于2024年12月4日至6日在海南三亚崖州湾科技城举行，届时将以“组学引领更深更远的蓝色生命经济”为主旨，特别关注农业种质资源与可持续发展、深海生物研究与资源挖掘等关键议题。 设置星标，不错过精彩推文 开放转载 欢迎转发到朋友圈和微信群  微信加群  为促进前沿研究的传播和交流，我们组建了多个专业交流群，长按下方二维码，即可添加小编微信进群，由于申请人数较多，添加微信时请备注：学校/专业/姓名，如果是PI/教授，还请注明。 点在看，传递你的品味

编辑丨王多鱼 排版丨水成文 胶质母细胞瘤（GBM）是脑肿瘤中的“绝症”，以其高度侵袭性和耐药性闻名。尽管目前的标准治疗手段包括手术、放疗和化疗，但复发几乎不可避免，患者的中位生存期仅为15个月。其复杂的肿瘤异质性和强侵袭性是导致治疗失败的关键原因。 GBM的异质性体现在细胞状态的动态切换能力上，包括神经前体样（NPC-like）、少突胶质细胞前体样（OPC-like）、星形胶质细胞样（AC-like）及间充质样（MES-like）四种状态。这些状态具有高度可塑性，使肿瘤细胞能够适应治疗压力，产生耐药性。而GBM的侵袭性表现为肿瘤细胞向周围脑组织扩散并潜伏，为复发埋下隐患。然而，周围浸润区域的肿瘤细胞数量稀少，与正常细胞混杂，给深入研究带来了挑战。 2024年11月22日，华大生命科学研究院陈亮、顾颖团队与武汉大学刘宝辉团队合作，在 Science 子刊 Science Advances 上发表了题为：Single-cell multi-omics sequencing uncovers region-specific plasticity of glioblastoma for complementary therapeutic targeting 的研究论文。 该研究利用华大的单细胞多组学技术，首次揭示了GBM核心区（TC）和周围脑组织区（PTB）的显著分子差异，提出联合靶点治疗的精准策略，为攻克GBM复发提供了新希望。 相关研究数据已上传至CNGB网站（https://db.cngb.org/cnsa/; CNP0003766）。此外，研究团队构建了交互版的在线网页，方便研究人员进行探索。 https://db.cngb.org/cdcp/visualization?project=CNP0003766 深入挖掘肿瘤的区域特性 研究团队从GBM患者中分别采集TC区和PTB区样本，利用单细胞RNA测序（snRNA-seq）和单细胞染色质可及性测序（snATAC-seq）技术对细胞的基因表达和染色质开放状态进行了全面解析。 图1、胶质母细胞瘤的多组学图谱 分析结果显示，GBM核心区和周围脑组织区域在肿瘤细胞状态和分子调控机制上存在显著差异： 细胞状态的动态转换：核心区的肿瘤细胞主要呈现星形胶质细胞样（AC-like）状态，而周围区域的肿瘤细胞则更偏向少突胶质细胞前体样（OPC-like）状态。这表明肿瘤细胞在扩散过程中会发生状态转变，以适应新的环境。 关键转录因子的活性差异：激活蛋白1（AP-1）在核心区域活性显著，而在周围区域活性下降；而BACH1则相反，其在周围脑组织中活性显著增强。 图2、胶质母细胞瘤的区域异质性 这些结果揭示，GBM肿瘤细胞的异质性不仅体现在不同状态的共存，还受到区域特异性分子机制的调控。这些发现为探索新的治疗靶点提供了重要线索。 联合靶点治疗显著提升疗效 为了验证AP-1与BACH1在GBM治疗中的潜力，研究团队设计了体外实验和小鼠模型进行功能验证。 体外实验：研究团队利用ERK1/2抑制剂ulixertinib抑制AP-1，基因敲降BACH1。结果显示，联合抑制AP-1和BACH1比单一靶点治疗更显著地抑制了肿瘤细胞的增殖和迁移，同时诱导了更强的细胞凋亡。 体内实验：在小鼠异种移植模型中，使用ulixertinib抑制AP-1，并通过基因敲降或FDA批准的小分子药物hemin降解BACH1。联合治疗显著延缓了肿瘤的生长速度，降低了周围脑组织中侵袭性肿瘤细胞的存留，并大幅延长了小鼠的生存期。 研究团队指出，AP-1与BACH1的联合抑制能够全面覆盖GBM核心区和周围区域的肿瘤细胞，有效克服肿瘤异质性和侵袭性带来的治疗难题。 图3、胶质母细胞瘤的联合靶点治疗 探索精准治疗新方向 这项研究不仅揭示了GBM肿瘤细胞的区域特性及其分子调控机制，还提出了一种双靶点联合治疗的精准策略，为未来GBM的治疗提供了全新思路。 未来，研究团队计划结合空间转录组学技术，进一步探究GBM肿瘤细胞的动态变化，绘制更精细的时空分子图谱，以推动个性化治疗方案的开发。 华大生命科学研究院陈亮研究员、武汉大学人民医院刘宝辉主任医师、华大生命科学研究院顾颖研究员为论文共同通讯作者。武汉大学生命科学学院博士研究生王昕、武汉大学人民医院博士研究生孙前、华大生命科学研究院联合培养博士研究生刘田宾为论文并列第一作者。 陈亮研究员现为杭州华大生命科学研究院细胞组学技术中心负责人，中心基于华大单细胞、时空组学与单分子纳米孔测序平台，专注于新一代组学技术研发及其在生命科学研究与临床实践中的应用。华大生命科学研究院是华大集团下属的非盈利板块，是华大集团创新科技的核心力量与发动机。杭州华大生命科学研究院是研究院在杭州的重要布局，搭建“五中心三平台”，即新一代组学技术、合成生物学、衰老与再生、细胞治疗、脑科学五大研究中心，单细胞时空组学、高通量测序、高通量基因操控三大平台。自2022年落地以来，已发表44篇高水平论文，其中CNS系列16篇，部分成果相继入选“2022年中国生命科学十大进展”、“2023年中国神经生物学六大进展”，并获批省级新型研发机构、全省空间组学重点实验室。现已初步形成“研学产”一体化发展布局，未来研究院将围绕基因组学核心技术突破、前沿科学发现、产业应用孵化、国际标准建立、国际一流人才高地等建设打造全球基因组学研学产战略高地。杭州研究院热切期待组学技术研发专家、青年学者加盟，共同推动生命健康新一轮产学研的创新科技升级，如感兴趣，请投递简历至：shenyunya@genomics.cn 论文链接： https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adn4306 设置星标，不错过精彩推文 开放转载 欢迎转发到朋友圈和微信群  微信加群  为促进前沿研究的传播和交流，我们组建了多个专业交流群，长按下方二维码，即可添加小编微信进群，由于申请人数较多，添加微信时请备注：学校/专业/姓名，如果是PI/教授，还请注明。 点在看，传递你的品味