血浆蛋白质组学提升早期疾病诊断:从骨髓瘤到肺纤维化的精准预测

2024-07-29
在疾病诊断的过程中,因缺乏客观的生物标志物,常导致诊断延迟。精准医学的重要挑战之一是开发临床工具以识别高风险个体,从而实现及时诊断和早期治疗,并改善患者预后。当前,心脏病中风的风险预测工具已被广泛使用,但其他疾病的预测工具尚未普及。从症状初现到确诊,许多疾病的诊断可能需要几个月甚至数年。近年来,一些单一血浆蛋白被确立为特定疾病的诊断标志物,如B型钠尿肽(BNP)用于心力衰竭,肌钙蛋白用于急性冠状动脉综合征泛素C末端水解酶L1(UCH-L1)胶质纤维酸性蛋白(GFAP)用于创伤性脑损伤。血浆蛋白质组学技术能捕获数千种蛋白质,并进行不局限于单一疾病的无偏发现研究,被认为是应对这一挑战的有前景技术。

7月22日,Nature Medicine发表了题为“Proteomic signatures improve risk prediction for common and rare diseases”的研究,研究团队在英国生物银行的Pharma Proteomics项目中,整合了41,931名个体的约3,000种血浆蛋白数据与临床信息,建立了针对218种常见和罕见疾病的10年发病率预测模型。结果显示,包含5到20种蛋白质的模型在67种疾病中,其预测性能优于仅使用基础临床信息的模型。对于包括多发性骨髓瘤非霍奇金淋巴瘤运动神经元疾病肺纤维化扩张型心肌病在内的52种疾病,蛋白质模型的预测性能也优于结合临床检测数据和基础信息的模型。

该研究使用了UK Biobank的EDTA血浆样本,通过Olink Explore 1536和Explore Expansion平台进行蛋白质组学分析。通过LASSO回归和正则化Cox模型,研究团队开发了包含5至20种蛋白质的预测模型,并进行了1,000次自助法估计。

为了验证模型的普遍性,研究还在EPIC-Norfolk研究中进行了外部验证。结果表明,蛋白质模型在67种疾病中优于仅使用临床信息的模型。例如,多发性骨髓瘤的单细胞RNA测序显示,新诊断患者的骨髓中,预测蛋白FCRLBQPCTSLAMF7TNFRSF17主要在浆细胞中表达,与其预测能力一致。

研究还发现,某些蛋白质在多个疾病中可作为预测因子,显示其广泛适用性。研究结果表明,血浆蛋白质组学在疾病风险预测、早期诊断和干预中具有巨大潜力,并有望成为精准医学的重要工具。未来,随着技术进步和数据积累,蛋白质组学在临床实践中的应用将不断扩展和深入,为疾病早期预测和诊断提供新动力。

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