Eragidomide

作者｜momo   01   靶向蛋白质降解领域的兴起与发展趋势 在过去十年中，靶向蛋白质降解剂逐渐走进人们的视野。最初，分子胶水和异双功能降解剂主要集中在经过充分验证的靶标上，这是一种相对稳健的研发策略，旨在确保技术的可行性和安全性。如今，该领域迎来了新的发展阶段，第二波研究正将目光投向更多新颖的靶标领域。越来越多的降解剂管线显示，传统上难以成药的靶标，如转录因子、GTP酶和鸟嘌呤核苷交换因子（GEFs）等，正变得越来越容易实现（图1）。这一转变标志着靶向蛋白质降解技术的应用范围正在不断扩大，为药物研发带来了新的机遇和挑战。 图1.新靶点邻域的蛋白降解剂   02   分子胶降解剂的研究进展与突破 分子胶降解剂是一种独特的小分子，它通过重塑E3连接酶，使其能够用泛素标记目标蛋白（POI），进而将致病蛋白被蛋白酶体识别并降解（图2）。这种作用机制赋予了分子胶降解剂超越肿瘤学起源进行拓展的能力。例如，BMS公司正在测试一款用于镰状细胞病的转录因子分子胶降解剂，Monte Rosa公司也已将其针对VAV1的鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）降解剂推进到自身免疫性疾病的临床阶段。这些成果展示了分子胶降解剂在不同疾病领域的应用潜力。 图2.分子胶降解剂诱导POI泛素化的示意图 早期临床项目靶点的探索与成果 早期临床项目中，不少分子胶降解剂的研究围绕来那度胺（lenalidomide）相关靶点展开。例如，BMS子公司新基（Celgene）医药利用来那度胺类似物发现并优化了CC - 92480，用于分解Lkaros（IKZF1）和Aiolos（IKZF3），目前该药物处于骨髓瘤的III期开发阶段。此外，激酶CK1ɑ也是一个相关靶点，同样被来那度胺降解（图3）。这些研究为分子胶降解剂在特定疾病中的应用提供了重要的参考和基础。 图3.MGDs for CRL4CRBN GSPT1作为一种GTP酶，是分子胶降解剂研究的重要靶点。它是在对CRBN和来那度胺类似物进行免疫沉淀试验时被发现的。GSPT1在翻译终止中起到重要作用，其终止作用可杀死癌细胞，为肿瘤学应用提供了可能。BMS于2016年将其GSPT1降解剂CC - 90009推进到临床，CC-90009是第一个选择性靶向 GSPT1 的临床候选药物（图3）。但后来因未公开原因终止。2023年，BMS从 Orum Therapeutics 收购了BMS-986497，BMS-986497是一种抗CD33抗体的GSPT1降解剂。最初用于治疗急性髓性白血病（AML）和其他CD33表达的恶性肿瘤，已获得FDA准用于急性髓性白血病或高危骨髓增生异常综合症患者的1期治疗。BMS-986497 采用分子胶与抗体偶联的策略改进了对癌细胞的递送，为该靶点的研究带来了新的希望。 靶点跳跃及新机会的涌现 Celgene开发了第一代的GSPT1分子胶CC9009，由于毒性和有效性不足选择了移出管线；Monte Rosa在CC-90009的基础上开发了MRT-2359，同时降解GSPT1和cMYC，MRT - 2359针对GSPT1在MYC驱动的实体瘤患者中显示出可行的治疗指数和可耐受的安全性。随着公司对降解剂平台的构建，为更多难成药的新靶标提供了更好的机会，其中VAV1项目备受关注。VAV1是一种鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF），与B细胞和T细胞信号传导密切相关。Monte Rosa通过蛋白质组学方法和对靶标结合表面的理解等多种方式确定了VAV1项目。其研发的VAV1降解剂MRT - 6160在自身免疫性疾病动物模型中显示出临床前疗效，与标准治疗的JAK抑制剂和鞘胺醇-1-磷酸受体 1调节剂效果可比。目前，该降解剂已进入临床I期试验，并计划在自身免疫性疾病中进一步试验（图4）。 图4. MRT-2359和MRT - 6160的活性数据 此外，转录因子IKZF1和IKZF3可作为CRBN的新底物依赖 G 环降解子与 CRBN结合，这为分子胶降解剂提供了更多潜在目标。同时，研究人员预测可能有1600多种蛋白质可被与CRBN结合的分子胶降解，这为未来的研究指明了方向。   03   双功能降解剂的探索之路 双功能降解剂是一种较大的哑铃状分子，一端结合POI，另一端结合E3连接酶（图5）。早期阶段，人们期望它能降解与配体结合的所有靶蛋白。但首批进入临床的项目大多针对已有药物作用的靶点，如首个进入临床的蛋白水解靶向嵌合体（PROTAC）针对前列腺癌的雄激素受体（AR），还有至少其他5种针对AR的降解剂也进入了临床试验。然而，疗效数据并不理想，这与早期的期望形成了鲜明的对比，蛋白质降解是否真的是一种变革性技术仍有待进一步验证。 图5.异双功能分子降解剂诱导POI泛素化的示意图 Kymera公司的探索尝试 Kymera公司在双功能降解剂研究中表现出积极的探索精神。其首个临床项目针对IRAK4，IRAK4在调节IL-1受体和Toll样受体（TLR）信号通路方面具有重要的作用，因为IRAK4的活性由其酶活性和作为骨架蛋白的活性介导，因此蛋白降解剂可能比酶活性抑制剂具有更好的效果。Kymera公司开发的潜在“first-in-class”蛋白降解剂KT-474目前处于IIb期试验中，正在测试阻断IRAK4的激酶活性和骨架蛋白的能力，8月16日，KT-474的临床前研究在Journal of Medicinal Chemistry上发表，科学家详细介绍了对IRAK4蛋白结构与功能之间关系的探索，最终导致发现KT-474这一强力，选择性，可口服的IRAK4蛋白降解剂。文章表示，这代表着在非肿瘤学适应症中，首个进入临床开发阶段的异双功能性（heterobifunctional）蛋白降解剂（图6）。  图6.KT-474的结构及生物活性 Kymera公司的下一个临床候选药物KT - 621针对STAT6，这是一个备受关注的项目。STAT6作为一种核心的节点转录因子，其在生物学过程中的角色尤为关键，具体表现为选择性地介导IL-4和IL-13的下游信号传导，这一特性为针对2型炎症性疾病的药物研发开辟了新的可能性。KT-621是一种针对STAT6的异双功能降解剂（PROTAC），目前正处于开发阶段，旨在应用于特应性皮炎（AD）、哮喘以及慢性阻塞性肺病等治疗领域。根据研究数据，KT-621已展现出与度普利尤单抗（dupilumab）相当的活性水平，并且在多种与TH2相关的疾病临床前模型中表现出良好的耐受性（图7）。10月9日，Kymera 正式对外宣布，其KT-621新药的临床试验（IND）申请已成功获得美国食品药品监督管理局（FDA）的官方批准。KT-621可能是第一个在疗效上无需妥协的口服免疫学药物，这为免疫学领域的药物研发带来了新的希望。  图7. KT-621的生物活性数据 BCL6 降解剂的研发 在B细胞淋巴瘤6（BCL6）方面，Arvinas 和BMS的 BCL6 降解剂为这个靶点提供了首次治疗测试。BCL6是一种转录抑制因子，通过BCL6的BTB结构域招募辅助抑制因子，调节B淋巴细胞的分化，介导生发中心（GCs）的形成。由于BCL6在转录抑制因子复合体中的不受调控的表达和支架作用，使其成为PROTAC的理想靶点。Arvinas公司研发的ARV-393是一种靶向BCL6蛋白的PROTAC药物，目前正在进行临床I期研究。前期研究表明，ARV-393在体内外均显示出深度的BCL6降解效果，在多种肿瘤异种移植模型中表现出优异的肿瘤生长抑制（TGI）作用（图8）。  图8.ARV-393的生物活性数据 BMS-986458则是由BMS研发的一种BCL6降解剂。目前该药物处于临床I期，用于治疗非霍奇金淋巴瘤，相关数据暂未披露。   写在最后   蛋白降解剂在进军新靶点领域取得了一定进展，但也面临诸多挑战。分子胶降解剂的发现方法局限，双功能降解剂在设计和疗效上存在问题。然而，科研人员不断探索新方法，努力突破局限。随着研究深入，蛋白降解剂有望在未来药物研发中发挥重要作用，为人类健康带来福音。无论是分子胶降解剂的靶点跳跃，还是双功能降解剂的勇敢尝试，都展现了该领域的无限潜力。我们期待这些技术能早日应用于临床，为患者带来实际治疗效果。同时，未来还需要进一步研究如何更好地利用各种降解剂的优势，提高药物研发的效率和成功率，以及如何更全面地评估它们的安全性和有效性，以确保患者能够受益于这些创新技术。 参考资料 [1]Mullard A. Protein degraders push into novel target space. Nat Rev Drug Discov. 2024 Oct 14. doi: 10.1038/d41573-024-00170-9. [2]Tan X, Huang Z, Pei H, Jia Z, Zheng J. Molecular glue-mediated targeted protein degradation: A novel strategy in small-molecule drug development. iScience. 2024 Aug 21;27(9):110712. doi: 10.1016/j.isci.2024.110712. [3] Konstantinidou M, Arkin MR. Molecular glues for protein-protein interactions: Progressing toward a new dream. Cell Chem Biol. 2024 Jun 20;31(6):1064-1088. doi: 10.1016/j.chembiol.2024.04.002 [4]https://www.monterosatx.com/ [5]Zheng X, Ji N, Campbell V, et al. Discovery of KT-474─a Potent, Selective, and Orally Bioavailable IRAK4 Degrader for the Treatment of Autoimmune Diseases. J Med Chem. Published online August 16, 2024. doi:10.1021/acs.jmedchem.4c01305 [6]https://www.kymeratx.com/ [7]https://arvinasoncologymedical.com/ BiG近期会议 10月31日，BiG联合Citeline，将于10月底，举办自免小规模私董研讨会，聚焦：TCE vs. CAR-T，自身免疫开发策略，线上同步直播，敬请期待！ ▼ 共建Biomedical创新生态圈！ 如何加入BiG会员？

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Sci.及专利WO2021208787报道WBC100是一种口服Myc分子胶，靶向c-Myc的NLS1-Basic-NLS2区域，通过E3泛素连接酶CHIP介导的26S蛋白酶体途径降解c-Myc蛋白，诱导肿瘤细胞凋亡，对多种c-Myc过表达的血液瘤和包括PDAC、NSCLC、HCC及CRC在内的实体瘤细胞有增殖抑制作用。并在极低剂量（0.1mpk）抑制c-Myc过表达AML、胰腺癌和胃癌肿瘤生长[9]。 笔者并不质疑WBC100能够直接/间接/共价/非共价靶向c-Myc，但是从其结构来看，更相信Myc只是WBC100发挥抗肿瘤作用微不足道的靶点之一。WBC100结构中多个不稳定环氧丙烷结构的体内安全性也需慎重考虑。 GT-19077/GT-19715 苏州开拓药业管线中有两款靶向Myc的药物。其中，GT-19077是小分子Myc-Max蛋白-蛋白相互作用抑制剂，GT-19715是c-Myc/GSPT1双靶点降解剂，已经在IND阶段。 图6：开拓药业专利中代表性结构与来鲁华课题组筛选的Myc抑制剂[6]及结构相似性cIAP1配体[7] 推测GT-19077可能来源于专利（WO2021004391/ WO2022089556），为含有硼酸或硼酸酯类的小分子化合物（图6），其结构基础推测是北大来鲁华课题组虚拟筛选出来的PKUMDL-YC-1205[6]。PKUMDL-YC-1205是Fmoc/Trt保护的天冬酰胺，看起来很是奇怪的一个分子，开拓将其保护基和氨基酸部分进一步改造，获得硼酸或硼酸酯类化合物。但是仔细推敲这些小分子，又像是cIAP1的配体[7]。含有硼酸或硼酸酯的小分子抑制剂可能是通过共价靶向c-Myc上的特定氨基酸增强与c-Myc的结合而发挥作用。 图7：开拓药业专利中代表性结构及分子胶CC-885/CC-90009结构 GT-19715可能来源于开拓药业的降解剂专利（CN115504963/WO2022268066），分析其结构，似乎是在抑制剂基础上再加上Cereblon配体获得，但看起来更像是在GSPT1分子胶CC-90009/885的尾巴上加上Fmoc的类似基团（图7），不知是GT-19715降解谱筛选到了GSPT1，还是在分子胶的研发过程中加上了Myc抑制剂的结构。对于GT-19715是分子胶还是降解剂，开拓在不同的会议中定义不同，猜测GT-19715结构可能是CN115504963中化合物A153。 从抑制剂和降解剂结构上看，虽然是宣传靶向Myc蛋白，但是脱靶风险非常高，当然降解剂已经明确是c-Myc/GSPT1双靶点。从多次会议公布的临床前药效模型来看， GT19630 (DC50=1.5 nM / IC50= 0.33 nM in HL-60；GT19715是 GT19630的盐型) ip给药在HL-60异种移植模型中有效地降解GSPT1，同时完全降解c-Myc，并在低剂量0.3 mg/kg/bid时抑制肿瘤生长，未引起体重明显下降，显示出良好的治疗效果和安全性。 GSPT1降解剂CC-90009的临床适应症也是AML/MS，临床前CC-90009对包括HL-60细胞在内的多种AML细胞具有亚纳摩级别抑制活性[8]。所以，在AML模型中GT19715发挥抑瘤作用究竟是降解Myc还是GSPT1所导致，抑或降解两个蛋白的协同作用，值得进一步探讨，毕竟在细胞增殖抑制中协同作用并不明显。开拓官方在多次会议中也披露GT19715能够抑制前列腺癌LNCap和耐药模型22RV-1肿瘤生长，并且能够促进AR-V7降解。同时，GT19715能够抑制小细胞肺癌细胞增殖和肿瘤生长，并促进c-Myc和N-Myc的降解。同一款分子胶或降解剂，在低浓度下，能够在不同肿瘤中促进包括c-Myc/N-Myc/GSPT1/GSPT2/CK1 alpha /IKZF1/AR-V7等多个蛋白的降解，笔者对这样一款超越分子胶或降解剂降解范围的分子的安全性不禁担忧。 另外，不同于其他蛋白，Myc与Max蛋白间相互作用被阻断后，稳定性变差而降解，GT19715究竟是通过抑制Myc-Max蛋白-蛋白相互作用还是通过泛素-蛋白酶降解系统发挥作用，抑或是共同发挥作用，也是值得进一步验证。但是从公开数据来看，加入蛋白酶体抑制剂MLN9708能够抑制GT19715对Myc的降解，似乎泛素化降解发挥了一定作用。 ICX-101 ICX-101是Incurix开发的一种口服小分子Myc抑制剂，阻断c-Myc-Max异二聚体与DNA-E-box结合。官网披露EMSA/转录组实验验证了ICX-101对Myc具有选择性。 Incurix是韩国国立癌症中心下属子公司，主要研究肿瘤相关转录因子。韩国国立癌症中心专利（WO2012093741/WO2018021810/WO2018021849）显示其结构可能如图8所示，化合物51/56对包括膀胱癌、前列腺癌、肺癌、乳腺癌、白血病、胰腺癌、结直肠癌等肿瘤细胞的增殖抑制在μM级别，在肺癌（NCI-H1299）、前列腺癌（DU145）模型中抑制肿瘤生长。目前正在进行GLP和生物标记物研究，计划于2022年底进行临床试验，当前检索官网，仍未见临床消息。 图8：WO2018021849专利中代表性分子 IDP-121/IDP-410 IDP Pharma 开发了两款肽类Myc抑制剂，其中IDP-121靶向c-Myc用于治疗c-Myc驱动肿瘤。IDP-410靶向N-Myc用于治疗脑胶，IDP-410能搜索到的数据较少。 IDP Pharma专利WO2019048679中披露了靶向c-Myc的拟肽S09、S14、IDP-P1708160和IDP-P1708161用于治疗多发性骨髓瘤（优选S09）。这些拟肽以c-Myc的一段基序为基础，通过“订书肽”形式维持野生肽的α-螺旋结构，增加其体内稳定性，阻断c-Myc与Max间形成复合物发挥抗增殖作用。专利数据显示这些拟肽在多种多发性骨髓瘤（MM）细胞系中具有μM水平的细胞毒作用，强于小分子抑制剂10058-F4，可作为单一药剂或与其他药物联合使用。体内外与标准疗法地塞米松和硼替佐米或环磷酰胺的药物的三联治疗中表现出协同抗肿瘤作用。 目前IDP-121处于IND申请阶段，相较于野生型序列，IDP-121提高了稳定性，但在多发性骨髓瘤模型中单药抑瘤效果较差，与地塞米松、硼替佐米或环磷酰胺的二联或三联疗法中显示出显著的增强效果，临床首选适应症可能会是联用标准疗法用于标准疗法治疗失败的多发性骨髓瘤。 图9：专利WO2019048679中代表性结构 c-Myc 蛋白表达抑制剂 由于 c-Myc 蛋白缺乏稳定的构象和适合的小分子结合口袋，理性设计直接结合Myc的抑制剂具有较高挑战性。因此，也有一些biotech另辟蹊径，从c-Myc的转录和翻译入手，如Arrakis Therapeutics有一款靶向c-Myc mRNA的小分子，通过抑制c-Myc蛋白的表达，从而阻断Myc的功能，目前该项目正处于lead发现阶段。 Anima Biotech同样有一款c-Myc mRNA调节剂，专利WO2022150316披露一系列含硫三环结构分子，能够在细胞水平抑制c-Myc蛋白的翻译，代表性化合物332对c-Myc 依赖性A549肿瘤生长具有显著较强的抑制作用（3 mg/kg twice weekly，ip），目前该项目也处于lead优化阶段。 图10：专利WO2022150316中分子332 c-Myc降解剂 针对Myc这一难成药靶点，直接靶向Myc很难获得高亲和力分子，因此基于弱结合的抑制剂开发降解剂似乎是一个思路。蛋白降解领域的两家先驱Arvinas和Nurix Therapeutics均有一款靶向Myc的药物在临床前研发阶段，目前暂无专利披露。开拓GT19715究竟是Protac还是PPI抑制剂，抑或是c-Myc的分子胶，也还是值得进一步验证。 笔者有个小疑问，c-Myc蛋白或mRNA半衰期低于半个小时，抑制剂干扰Myc-Max的相互作用后即可使Myc蛋白不稳定，促进降解，而在此基础上设计降解剂的有何更深层次的考虑？ 其他小分子 10074-G5和10058-F4是最早一批通过实验筛选发现的直接结合c-Myc蛋白的小分子，也是经分子水平、细胞水平和体内药效验证的c-Myc直接抑制剂。虽然存在荧光或典型的PAINS结构，这些化合物在分子水平通过FP、STD-NMR、2D-NMR、EMSA、CD等结合或竞争性实验验证能够直接结合在c-Myc上，并且明确10074-G5结合在c-Myc的aa363-481，10058-F4结合在aa404-412区域。通过直接结合在c-Myc蛋白上，进一步阻断Myc-Max的相互作用及Myc/Max复合物和DNA的相互作用。在细胞水平，这些分子能够抑制c-Myc依赖性的细胞增殖，下调c-Myc的转录活性，使细胞周期阻滞在G0/G1期等。由于筛选得到分子活性和理化性质不佳，研究者对10074-G5和10058-F4系列进行了多轮改造，3jc48-3的靶标活性和细胞活性略有提高，但是在体内药效并未体现出较优的抗肿瘤效果。但10074-G5和10058-F4结构简单，分子量较小，可作为苗头化合物进一步优化。 化合物MICMI-6/7也经过分子、细胞及体内药效的验证，但是体内抗肿瘤效果一般，从其结构来看，都具有较大的刚性平面，且质子化能力较强，假阳性概率较高，不太适合进一步优化。 KDJ-Pyr-9这类联芳环结构与10074-G5结合在相同c-Myc蛋白序列，通过阻断Myc/Max-DNA相互作用抑制下游基因转录及细胞增殖，但分子刚性太强，分子量过大，有待于进一步优化。 Mycro1系列分子是基于Myc/Max-DNA的FP方法筛选出的化合物，对Myc-Max蛋白-蛋白相互作用具有较强的抑制作用，但对其他转录因子如CEBP/CEBP等的选择性较差。 MYCi361/975是基于已知c-Myc抑制剂构建药效团虚拟筛选、并进一步优化获得的c-Myc抑制剂，结合位点与10074-G5类似，这类分子是目前验证的较为充分的Myc抑制剂，从靶点结合到细胞增殖抑制、周期阻滞、Myc蛋白降解、下游基因转录抑制，系统验证了分子功能。但是此类分子的溶解度极差，单药抗肿瘤活性不强，成药性较差，有待于进一步优化。 KSI-3716是通过EMSA筛选得到的干扰c-Myc-Max复合物与DNA相互作用的小分子，同样能够抑制c-Myc的转录活性、细胞增殖及诱导细胞周期阻滞。KSI-3716本身具有较强的心脏毒性，因此后续开发了WO2018021849专利结构类似的含硫类分子。 Insilico在JPM2023最新披露的管线中也有一款在研c-Myc抑制剂，用于治疗肝癌，目前还处于discovery阶段。 纵观这些早期研究中的小分子，整体上在靶标水平的结合能力不强，都在μM级别，细胞水平对多种c-Myc驱动肿瘤细胞增殖有抑制作用，但活性也不高，多数分子的溶解度、稳定性等理化性质不佳，这些分子多以iv或ip方式给药研究体内药效，在不同的肿瘤模型中，虽然展现出一定的抑瘤作用，但是效果一般，并未见到能消退肿瘤，多数分子的成药性较差。 总结 c-Myc在多种肿瘤中表达异常，应用前景广阔。目前c-Myc直接抑制剂和间接抑制剂的开发尚处于早期阶段，已经发现的小分子抑制剂的成药性差，不足以支撑临床研究，亟待发现成药性更优的抑制剂。无序蛋白的药物开发有很大困难，许多biotech/AI制药公司把c-Myc这类难成药靶点作为管线开发，利用自家的平台优势，挑战难成药靶点药物的开发，一定会推动c-Myc抑制剂的研究进展。 不过换个角度来看，虽然c-Myc在70%的肿瘤中表达失调，但是异常表达的c-Myc是肿瘤的直接驱动因素还是肿瘤发生发展的一个表现？开发c-Myc抑制剂能否在临床上对多种c-Myc失调的肿瘤有治疗效果？c-Myc抑制剂开发的高难度是否与其临床价值所匹配？相信随着越来越多的企业开始关注c-Myc抑制剂的开发，上述问题终将得到解答。 参考文献 [1] Mullard A. Climbing cancer's MYC mountain. Nat Rev Drug Discov. 2022 Dec;21(12):865-867.  [2] Madden SK, de Araujo AD, Gerhardt M, Fairlie DP, Mason JM. Taking the Myc out of cancer: toward therapeutic strategies to directly inhibit c-Myc. Mol Cancer. 2021 Jan 4;20(1):3.  [3]http://www.peptomyc.com/results-revealed-from-phase-i-clinical-trial-of-the-first-drug-to-successfully-inhibit-the-myc-gene-which-drives-many-common-cancers/ [4] http://www.zkbymed.com/Index/Index/zixuncont/id/133 [5] Haque R, Song J, Haque M, Lei F, Sandhu P, Ni B, Zheng S, Fang D, Yang JM, Song J. c-Myc-Induced Survivin Is Essential for Promoting the Notch-Dependent T Cell Differentiation from Hematopoietic Stem Cells. Genes (Basel). 2017 Mar 6;8(3):97.  [6] Yu C, Niu X, Jin F, Liu Z, Jin C, Lai L. Structure-based Inhibitor Design for the Intrinsically Disordered Protein c-Myc. Sci Rep. 2016 Mar 2;6:22298.  [7] Shibata N, Nagai K, Morita Y, Ujikawa O, Ohoka N, Hattori T, Koyama R, Sano O, Imaeda Y, Nara H, Cho N, Naito M. Development of Protein Degradation Inducers of Androgen Receptor by Conjugation of Androgen Receptor Ligands and Inhibitor of Apoptosis Protein Ligands. J Med Chem. 2018 Jan 25;61(2):543-575.  [8] Surka C, Jin L, Mbong N, Lu CC, Jang IS, Rychak E, Mendy D, Clayton T, Tindall E, Hsu C, Fontanillo C, Tran E, Contreras A, Ng SWK, Matyskiela M, Wang K, Chamberlain P, Cathers B, Carmichael J, Hansen J, Wang JCY, Minden MD, Fan J, Pierce DW, Pourdehnad M, Rolfe M, Lopez-Girona A, Dick JE, Lu G. CC-90009, a novel cereblon E3 ligase modulator, targets acute myeloid leukemia blasts and leukemia stem cells. Blood. 2021 Feb 4;137(5):661-677.  [9] Xu Y, Yu Q, Wang P, Wu Z, Zhang L, Wu S, Li M, Wu B, Li H, Zhuang H, Zhang X, Huang Y, Gan X, Xu R. A Selective Small-Molecule c-Myc Degrader Potently Regresses Lethal c-Myc Overexpressing Tumors. Adv Sci (Weinh). 2022 Mar;9(8):e2104344.  END 免责声明：本文仅作知识交流与分享及科普目的，不涉及商业宣传，不作为相关医疗指导或用药建议。文章如有侵权请联系删除。 TIS2024第四届免疫细胞疗法与干细胞疗法论坛重磅来袭，合作详询：王晨 180 1628 8769