AIDD/CADD 全球日报|从构象路径到临床证据
生成式模型正在由“给出一个结构”走向“解释一段动力学路径”,而产业端的偶联药物、TCE 与长效肽也在用临床和监管节点校准各自的承诺。今天的重点不是把所有新消息等量齐观,而是辨认哪些结论已有可复现的证据底座,哪些仍只是公司披露或早期信号。计算与实验方法1. Gen-COMPAS 将生成模型接入稀有构象跃迁采样
Nature 发表的 Gen-COMPAS 以扩散模型提出起止态之间的中间构象,再用 committor 概率筛选过渡态区域,并从中发射短程无偏 MD 以重建路径、热力学和动力学。它的关键主张是无需人工预设集体变量,已在 Trp-cage、RBP、AAC 与 nAChR 等体系展示。
这让生成模型不再单独充当“构象画图器”,而是在物理模拟的约束下承担候选提出者。论文为同行评审成果,代码和输入文件已公开;不过公开审稿意见也指出缺少实验验证、TMD 可能带来松弛不足的偏置。复杂配体、膜蛋白和真实项目的规模化价值,仍应以独立复现检验。
来源名称:Nature 论文:https://www.nature.com/articles/s41586-026-11025-1
来源名称:Gen-COMPAS GitHub:https://github.com/Tangcyu/Gen-COMPAS
对药物设计团队而言,最实际的第一步不是直接把它用于大蛋白全空间采样,而是选择端点构象已知、可用短轨迹复核的多态靶点,比较路径分布与既有增强采样是否一致。只有在端点选择、力场、committor 模型变更后仍保持稳定,才值得把它接入先导优化或变构位点发现流程。2. ProteinTalks 用动态扰动蛋白质组构建“虚拟细胞”
ProteinTalks 的 Nature 论文以超过 3,800 万条时序蛋白丰度测量训练扰动蛋白质组模型,报告可预测药效、组合协同与耐药相关状态,并将部分结论迁移到类器官和临床活检样本。其价值在于把“药物作用后细胞如何变化”直接作为模型输入空间。
这是一项大规模实验—计算研究,而非临床决策试验。论文报道的未见药物性能依赖乳腺癌等特定数据域、切分方式与实验平台;回顾性患者样本上的排序不能直接推成可改善结局的选药能力。数据和部分分析代码可得,完整训练权重与复现边界仍需逐项核对。
来源名称:Nature 论文:https://www.nature.com/articles/s41586-026-11001-9
来源名称:ProteinTalks 数据库:https://db.prottalks.com
该路线的启发也在实验设计:若希望建立可行动的模型,数据不应只覆盖“处理或未处理”,而要保留剂量、时间、组合与表型的联动。不同实验室之间能否把这种扰动测量标准化,决定了它更像一套可迁移基础设施,还是一个高度依赖单一实验体系的强大案例。3. Mimotope-MD 用模拟肽和微秒 MD 回推抗体功能表位
JCIM 新工作将噬菌体展示/NGS 获得的 mimotope,与 AlphaFold 复合物建模、微秒级 MD 和 Folddisco 结构检索串成工作流,试图从能量学而非序列相似性映射抗体识别的天然表位。作者在四个有晶体结构或热点注释的体系中报告了残基级结果,并用实验支持一个最小四肽表位。
它为“先筛到结合肽、后解释功能表位”提供了很实际的物理精修路线。但基准规模有限,所报性能并不等于对任意抗体的通用保证;AlphaFold 初始构象、MD 采样充分性与检索库覆盖度都会影响结果。应将其视为同行评审的候选工作流,而不是替代实验表位扫描。
来源名称:JCIM 原文:https://doi.org/10.1021/acs.jcim.6c01562
对抗体项目,最合适的使用方式是将其放在已获得展示肽、竞争实验或突变提示之后,用于提出可检验的表位假设,再以定点突变、SPR 或细胞结合实验收敛。把单条 MD 轨迹或一次结构匹配直接写成机制结论,会放大该方法最容易被忽略的采样和模型依赖性。4. TRI-611 展示脑穿透 ALK 分子胶的结构设计路径
Nature 同日发表 TRI-611:该分子通过招募 CRL4–CRBN,在 ALK 激酶结构域形成新生界面并降解 ALK 融合蛋白,包括部分 TKI 耐药背景。论文给出了结构、蛋白质组与颅内/皮下模型证据,并报告与 lorlatinib 联用的临床前协同。
这为“以结构设计分子胶、再用 TKI 组合”提供了一个完整案例。需要分清的是,论文疗效仍来自临床前模型;虽已有 Phase 1/2 研究,人体降解深度、CNS 暴露、CRBN 相关脱靶与组合安全窗尚无公开疗效结论。
来源名称:Nature 论文:https://www.nature.com/articles/s41586-026-10998-3
来源名称:ClinicalTrials.gov:https://clinicaltrials.gov/study/NCT07491497
从设计策略看,TRI-611 还提示分子胶项目不能只以体外降解量排序:新生界面的可塑性、耐药突变容忍度、脑内未结合暴露和与标准治疗的给药节奏,都可能决定能否跨越临床门槛。公开的结构与组学归档为外部团队提出这些问题并复查选择性提供了较好起点。5. Elix 与 Axcelead 联手做 TPD 的 AI—实验闭环
日本 Elix 与 Axcelead Drug Discovery Partners 宣布联合研究:后者提供结构、实验数据及药化经验,前者提供 AI 分子设计与预测,并将验证数据回流模型。这把难度很高的 TPD 优化放在三元复合物、连接臂几何和实验反馈共同约束的框架中。
公告没有披露靶点、具体分子、模型指标或交易金额,因此目前是合作节点而非平台性能证明。其行业意义在于,生成式设计的可落地形态越来越像高频实验闭环,而非脱离实验的通用软件展示。
来源名称:Axcelead 官方公告:https://axcelead-us.com/news/elix-and-addp-enter-into-collaborative-research-agreement
未来应观察双方是否披露可量化的闭环指标,例如从设计到 assay 的周期、成功率、三元复合物的可预测范围或进入候选优化的项目数。在这些数据出现前,这份协议更证明需求存在,而不是证明某一生成模型已经解决了 TPD 设计的核心瓶颈。6. Emulate Human Liver-Chip 进入 FDA ISTAND 的完整资格包阶段
Emulate 宣布提交 Human Liver-Chip 的 FDA ISTAND full qualification package,拟支持药物性肝损伤相对风险评估。若最终在限定 context of use 下获资格认定,器官芯片可能从单项目探索走向可复用的非临床决策工具。
必须避免将“提交资格包”写成“已获 FDA 认可”。本次是程序节点,性能数字主要来自公司相关验证;适用化合物范围、重复性、标准操作与最终 context of use 都要等待 FDA 结论。
来源名称:Emulate 公告:https://markets.financialcontent.com/pennwell.laserfocusworld/article/bizwire-2026-9-9-emulate-enters-final-stage-of-fda-istand-program-for-human-liver-chip-with-submission-of-qualification-package-covering-both-zo-and-ava-organ-chip-platforms
来源名称:FDA ISTAND 说明:https://www.fda.gov/drugs/innovative-science-and-technology-approaches-new-drugs-istand-program
对采用者而言,现阶段最稳妥的定位是把 Liver-Chip 作为候选物排序、机制补充和风险沟通工具,并保留传统毒理与暴露证据链。即使最终合格,也只能在资格文件限定的用途内使用;把单一芯片读数泛化为“可替代所有 DILI 评估”的叙述并不成立。临床、监管与资产推进7. Novartis 的 del-desiran III 期 HARBOR 未达主要终点
Novartis 披露,抗 TfR1 单抗—siRNA 偶联物 del-desiran 在 DM1 的全球 III 期 HARBOR 未达到 vHOT 主要终点。该资产来自其对 Avidity 的收购,是 TfR1 介导肌肉 RNA 递送的一次高等级临床检验;公司称次要与探索性分析存在活性信号,但未给出完整数值。
这不是对整个 AOC 平台的终局判决:功能终点的重测噪声、剂量与人群、肌肉递送深度均可能参与结果。但“分子层面救援不必然转化为功能获益”已成为平台开发的现实边界。完整数据和后续监管沟通比单日市场反应更值得追踪。
来源名称:Novartis 官方公告:https://www.novartis.com/us-en/news/media-releases/novartis-provides-update-delpacibart-etedesiran-del-desiran-phase-iii-harbor-study-treatment-myotonic-dystrophy-type-1-dm1
来源名称:SEC 6-K:https://www.sec.gov/Archives/edgar/data/1114448/000117184326005908/f6k_090826.htm
对 RNA 递送研发的直接问题是:肌肉内目标 RNA 的下降幅度、剪接纠正比例与功能终点之间是否存在足够陡峭且可重复的关系。若未来完整数据揭示生物标志物已强而功能无效,开发者需要重审机制;若提示终点或人群错配,则试验设计的教训同样重要。8. DeLLphi-305 报告一线维持治疗 OS 阳性
Amgen 与 AstraZeneca 公告称,DLL3×CD3 BiTE tarlatamab 联合 durvalumab 在广泛期小细胞肺癌一线维持治疗的 DeLLphi-305 中,于期中分析达到主要终点,OS、PFS 与 ORR 均显著改善。这是 TCE 向实体瘤前线推进的重要信号。
但目前公告尚未提供 OS 中位数、HR 和完整安全性细节,不能据“显著改善”推断绝对获益大小;更短监测时长对可及性的影响也仍有赖正式标签与实施数据。应等待会议或论文的完整读出。
来源名称:Amgen 新闻稿:https://www.morningstar.com/news/pr-newswire/20260908la42028/imdelltra-in-combination-with-imfinzi-demonstrated-landmark-improvement-in-overall-survival-in-first-line-extensive-stage-small-cell-lung-cancer
这个结果也会影响实体瘤 TCE 的开发优先级:DLL3 的表达选择、疾病场景和与 PD-L1 抑制的序贯关系可能比“任何靶点加 CD3”更具可迁移性。下一次完整披露应重点看获益是否跨亚组稳定,以及 CRS、神经毒性和停药率是否允许前线长期使用。9. TwoStep 完成 6,250 万美元 A 轮,TS-104 获 IND clearance
TwoStep Therapeutics 宣布超额认购的 6,250 万美元 A 轮,并称其多整合素靶向肽—MMAE 偶联物 TS-104 已获 FDA IND clearance,预计年内启动首次人体试验。该肽可结合五种肿瘤相关整合素,试图以多靶点肿瘤归巢覆盖异质性。
融资和 IND 代表开发资源与启动资格,并不验证广谱选择性或临床治疗窗。多整合素策略需要在人体验证肿瘤摄取、正常组织暴露、PK 与 MMAE 相关毒性;“first-in-class”仍是公司定位。
来源名称:TwoStep 官方公告:https://twosteptx.com/twostep-therapeutics-announces-oversubscribed-62-5-million-series-a-financing-and-fda-clearance-of-ind-for-first-in-class-peptide-drug-conjugate/
对肽偶联物赛道,这一项目的判读重点在于多靶点是否真的改善“肿瘤覆盖”而不把正常组织背景一并抬高。临床登记中的入组标准、整合素表达分层和影像/组织 PK 设计,会比融资金额更早回答这一差异化策略是否可执行。10. Gan & Lee 启动每周一次口服肽类 GLP-1RA 首次人体研究
Gan & Lee 宣布 GZC8072 Phase 1 首例给药。该每周一次口服肽类 GLP-1 受体激动剂采用 NovaPeptide 设计和 SupOraTide 递送平台,研究包括健康成人 SAD 与超重/肥胖受试者 MAD,计划入组 112 人。
“口服、肽类、每周一次”若能同时兑现,竞争意义很强;但此刻仅是 FIH 节点。人体生物利用度、食物效应、半衰期、胃肠道耐受性和体重相关 PD 均未披露,不能用临床前平台叙事替代 PK/PD 数据。
来源名称:Gan & Lee 公告:https://www.prnewswire.com/news-releases/first-participant-dosed-in-first-in-human-phase-1-study-of-gzc8072-a-novel-ultra-long-acting-once-weekly-oral-peptide-glp-1-ra-302873704.html
来源名称:ClinicalTrials.gov:https://clinicaltrials.gov/study/NCT07784699
口服肽项目的早期读数尤其需要同时报告绝对生物利用度与个体间变异,因为平均暴露好看并不等于给药可控。若需要苛刻的空腹窗口或表现出很强食物效应,每周一次的便利性会被真实使用场景部分抵消;这也是递送平台走向后期开发前必须解决的问题。11. Solstice 以 2.25 亿美元 A 轮推进 porustobart
Solstice Oncology 走出隐身阶段并获 2.25 亿美元 A 轮,核心资产是从 Harbour BioMed 获得大中华区外权益的 Fc 增强型抗 CTLA-4 抗体 porustobart。公司计划在微卫星稳定型结肠癌的新辅助场景联用 pembrolizumab,并预计第四季度开始入组。
这是“中国资产—海外 NewCo—全球开发”继续吸引大型早期资本的例子。但消息核心是融资和开发计划;既往晚线小样本信号并不能预测新辅助环境的病理缓解、生存获益或免疫毒性。
来源名称:Fierce Biotech 报道:https://www.fiercebiotech.com/biotech/solstice-rises-225m-advance-second-gen-ctla-4-immunotherapy
来源名称:Harbour BioMed 许可公告:https://www1.hkexnews.hk/listedco/listconews/sehk/2026/0223/2026022300013.pdf
该案例还把跨境资产交易的判断从“首付款和估值”拉回到开发能力本身:适应证迁移是否有扎实的机制依据、海外团队能否组织高质量围手术期试验、以及免疫相关不良事件如何管理,都会决定 NewCo 结构能否真正创造全球化价值。12. BioMarin 报告 vosoritide 的低软骨生成症 III 期详细结果
BioMarin 宣布 CANOPY-HCH-3 的 52 周随机、双盲、安慰剂对照 III 期结果发表于 NEJM Evidence:公司报告 vosoritide 相比安慰剂提升年化生长速度 2.33 cm/年,并已提交扩展适应证申请。
随机对照证据强于多数当日公告,但生长速度是替代终点。长期成人身高、功能、疼痛和生活质量的临床意义仍需延伸研究确认,不能只由厘米数推导全部患者获益。
来源名称:BioMarin 官方公告:https://www.biomarin.com/news/press-releases/biomarin-announces-positive-results-of-phase-3-voxzogo-vosoritide-study-in-hypochondroplasia-published-in-nejm-evidence/
来源名称:ClinicalTrials.gov:https://clinicaltrials.gov/study/NCT06455059
对罕见骨骼疾病,替代终点与患者真正关心的功能之间存在天然距离。监管审评若接受生长速度,也不等于长期获益已被充分解决;未来随访中应把比例、活动能力、疼痛、手术需求和生活质量与身高变化并列解读,而不是把单一数值当作全部临床价值。13. 恒瑞瑞普泊肽上市申请获受理
恒瑞披露,GLP-1/GIP 双受体激动剂瑞普泊肽注射液用于成人 2 型糖尿病的上市申请获受理。公司引述两项关键 III 期:在与司美格鲁肽 1 mg 的比较中,4 mg 组的关键次要终点达优效。
受理不是批准,且来自公司公告的对照、剂量、统计与安全性信息仍需审评材料或完整发表校验。其意义在于中国代谢多肽竞争开始更强调头对头数据,而非仅以同类机制进入拥挤市场。
来源名称:恒瑞公告转载:https://vip.stock.finance.sina.com.cn/corp/view/vCB_AllBulletinDetail.php?CompanyCode=10000223&gather=1&id=12592406
该申请还提示代谢赛道的比较维度正在改变:在基线治疗、剂量滴定和耐受性管理不同的情况下,单项 HbA1c 优效不能自动外推为长期综合优势。完整审评资料若公开,应同时看体重、低血糖、停药率、胃肠道事件以及对实际临床剂量的可达性。14. 石药 SYH9102 获 NMPA 临床批准
石药集团公告称,戈舍瑞林长效制剂 SYH9102 获 NMPA 批准开展临床试验。其定位为即用型、皮下注射后形成原位储库的月制剂,意在减少传统微球制剂所需的配制或植入操作。
这一节点的价值主要在递送与剂型工程,而不是新的 GnRH 生物学。所谓全球首创、临床前优于市售制剂等表述均是公司披露;人体释放曲线、局部耐受性、疗效等效性和长期依从性尚待临床数据。
来源名称:石药港交所公告:https://www1.hkexnews.hk/listedco/listconews/sehk/2026/0909/2026090900746_c.pdf
长效肽的竞争也提示,分子发现与制剂工程不应被割裂。即使活性成分成熟,针头规格、即用性、注射体积、释放初期峰值与供应链稳定性都可能决定真实差异;这些属性必须在人体验证而非由临床前对照或营销语言预先定论。15. Ratio 与 RayzeBio 展开放射性药物发现合作
Ratio Therapeutics 与 BMS 旗下 RayzeBio 达成研究合作和许可协议,围绕两个未披露肿瘤靶点推进放射性药物。Ratio 负责发现、转化及候选评估,RayzeBio 负责后续开发、生产和商业化;具体金额与靶点均未公开。
在放射性药物中,核素供给之外的真正差异化越来越取决于靶向配体和药代调控。由于未披露候选物、体内数据或条款,这仍是早期合作,不足以判断平台的命中质量或临床可行性。
来源名称:PR Newswire:https://www.prnewswire.com/news-releases/ratio-therapeutics-enters-into-research-collaboration-and-license-agreement-with-rayzebio-to-advance-a-novel-radiopharmaceutical-program-302872946.html
对早期放射性药物项目,最需要看到的是靶点内化、肿瘤/器官剂量、螯合稳定性和可制造性之间的折中,而不仅是某个体外结合常数。合作能否产生可转化候选物,要等到这些数据以及核素选择、治疗窗和供应计划开始出现后才能判断。16. tozorakimab COPD 进展需等待一手全文确认
二手中文报道援引 ERS 信息称,阿斯利康抗 IL-33 抗体 tozorakimab 的两项 COPD III 期降低急性加重风险,并称其 BLA 获 FDA 优先审评。这一潜在节点值得行业关注,因为 COPD 生物制剂长期缺少稳定的后期验证。
不过当前来源不是公司公告、FDA 文件或 ERS 原始摘要,且尚未在本轮获得独立一手回读。因此本文只按“报道所称”记录,不将具体降幅或批准时间当作已验证事实。正式数据、终点定义和安全性应以一手材料为准。
来源名称:腾讯新闻转载:https://view.inews.qq.com/a/20260909A0D4H600
保留这条低证据等级信息的意义,是提醒读者关注 IL-33 轴可能重新获得后期验证;但它不应改变任何研发或投资判断。若后续没有一手公司材料、会议摘要或 FDA 文件支持,本文的保守记录应被视为待证线索,而非已经确认的临床与监管事实。关键趋势与未来展望
今日的共性是“生成—验证”两条链在同步变硬:Gen-COMPAS 与 ProteinTalks 把模型更深地放入动力学和扰动响应,但仍必须接受物理、数据切分和外部复现的检验;AOC 的 III 期挫折、BiTE 的 OS 信号及多种肽类制剂推进,则提醒产业端真正决定价值的是组织暴露、终点质量和人体证据。模型与模态都不缺概念,稀缺的是可复核、可转移、可临床兑现的证据链。