科学家找到了能够逆转骨质疏松的全新方法,而非仅仅延缓骨量流失。
来自莱比锡大学与山东大学的研究团队发现了GPR133,这是一种位于细胞表面的受体,是成骨细胞(负责骨骼生成的细胞)的核心调控开关。激活GPR133后,成骨细胞活性会大幅提升,骨密度显著增长。 小鼠实验证实:敲除GPR133基因的实验鼠,骨骼会变得脆弱疏松,症状与人类骨质疏松高度相似。研究人员使用经计算机筛选得到的小分子合成激活剂AP503对其干预后,小鼠骨骼强度快速恢复。令人惊喜的是,AP503不仅能提升健康小鼠的骨量,还能逆转老年、患病小鼠身上类似骨质疏松的骨骼损伤;若配合运动使用,修复效果会进一步增强。 GPR133调控骨密度的作用机制在人体同样存在,且该分子通路在哺乳动物中高度保守,这项发现为骨质疏松治疗带来突破性希望。现有治疗药物大多只能减缓骨质流失,常伴随副作用,药效还会随时间衰减;而激活GPR133的小分子药物可从根源主动重建骨骼。 该疗法对绝经后女性意义重大——这类人群骨折致残风险最高,新药物有望提供一种更安全、高效的方式恢复骨骼强度。 文献出处:《机械敏感性粘附G蛋白偶联受体133(GPR133/ADGRD1)促进骨形成》,《信号转导与靶向治疗》,2025年6月30日 专业术语注释 1. osteoporosis:骨质疏松症,骨量降低、骨微结构破坏,易发生骨折2. osteoblasts:成骨细胞,负责合成、构建骨组织的核心细胞3. GPR133(ADGRD1):粘附型G蛋白偶联受体133,骨骼合成关键靶点4. small molecule:小分子化合物,易吸收、适合口服药物开发5. postmenopausal women:绝经后女性,雌激素骤降是骨质疏松高发主要人群6. Signal Transduction and Targeted Therapy:《信号转导与靶向治疗》,国际权威生物医药期刊
Scientists just found a way to reverse osteoporosis – not just slow it.Researchers from the University of Leipzig and Shandong University have identified GPR133, a cell-surface receptor that functions as a master regulator of bone-building cells called osteoblasts. When GPR133 is switched on, osteoblasts ramp up activity and dramatically increase bone density.In mouse experiments, animals engineered without the GPR133 gene developed fragile, porous bones similar to human osteoporosis. However, treating them with a synthetic activator called AP503—a small molecule discovered through computational screening—rapidly strengthened their skeletons. Remarkably, AP503 not only boosted bone mass in healthy mice but also reversed osteoporosis-like damage in older or diseased animals, with even greater effects when paired with physical exercise.Because GPR133 influences bone density in humans and the underlying molecular pathways are highly conserved across mammals, the findings raise hope for a breakthrough osteoporosis therapy. Unlike existing drugs that merely slow bone loss (and often carry side effects or waning efficacy), a GPR133-activating compound could actively rebuild bone from within.This approach could be particularly transformative for postmenopausal women, who face the highest risk of debilitating fractures, offering a safer, more effective way to restore skeletal strength.["The mechanosensitive adhesion G protein-coupled receptor 133 (GPR133/ADGRD1) enhances bone formation." Signal Transduction and Targeted Therapy, 30 June 2025]
深度解析:这篇关于GPR133(ADGRD1)逆转骨质疏松的报道基于真实前沿研究,整体可靠但属于早期 preclinical 阶段,需理性看待其临床转化潜力。b79cb6Nature1. 核心科学发现(真实性与关键证据)GPR133 的角色:这是一种黏附 G 蛋白偶联受体(adhesion GPCR),属于 mechanosensitive(力敏感)受体。它表达在骨祖细胞和成骨细胞(osteoblasts)上,是骨形成的“主调节器”。人类 GWAS(全基因组关联研究)早已将 GPR133 基因变异与骨密度(BMD)和身高关联。小鼠敲除实验(全身或成骨细胞特异性敲除):导致皮质骨变薄、骨小梁化增加、骨密度下降、骨强度减弱,表现为类似人类骨质疏松的骨脆性。成骨细胞功能受损,同时破骨细胞(osteoclasts)活性相对增加,打破骨形成-吸收平衡。bb5331Nature激活机制(双重信号整合):机械力 + 内源配体 PTK7(protein tyrosine kinase 7) 的细胞-细胞相互作用。激活后通过 Gs → cAMP → β-catenin 信号通路 促进成骨细胞分化、成熟和功能(上调 Runx2、Osterix、ALP、Col1a1、Osteocalcin 等)。间接抑制破骨细胞(可能通过成骨细胞分泌 OPG 掩蔽 RANKL,以及 cAMP 对破骨细胞的直接抑制)。737df2NatureAP503(AP-970/43482503):通过计算机结构辅助筛选发现的小分子特异性激动剂。在体外促进成骨分化和矿化。在体内(小鼠):每天腹腔注射 2 mg/kg × 4 周,能增加健康小鼠骨量/强度;在骨质疏松模型(如去卵巢 OVX 模拟绝经后骨丢失)中显著缓解/逆转骨丢失,恢复成骨细胞数目、降低破骨细胞、改善骨生物力学性能(三点弯曲测试)。9333c5Nature与运动协同:机械加载(跑台)+ AP503 效果更强,符合其 mechanosensitive 本质。论文发表在 Signal Transduction and Targeted Therapy(Nature 系列子刊,2025年6月30日),第一作者 Juliane Lehmann 等,通讯作者包括 Ines Liebscher(Leipzig)和 Jin-Peng Sun(Shandong)。前期已有 GPR133 在肌肉中的相关工作(同一团队发现 5α-DHT 也能激活它,并用 AP503 分离有益效应与雄激素副作用)。3b7e30Uni-leipzig2. 与现有治疗的对比(为什么“革命性”)方面现有药物(双膦酸盐、Denosumab、Teriparatide 等)GPR133/AP503 潜在优势机制主要抑制骨吸收(抗吸收)或间歇刺激成骨(PTH 类似物)同时促成骨 + 抑破骨;整合机械信号效果主要减缓丢失,部分促形成但有限;难以“逆转”严重丢失动物模型显示主动重建骨量/强度,甚至在老年/疾病模型副作用长期抗吸收药有颌骨坏死、异位钙化等风险;PTH 类有限疗程目前动物中未见明显问题(但需长期毒理)适用人群绝经后女性等高危人群特别适合绝经后女性;可能兼顾肌肉(抗肌少症)这确实是少数“主动重建”而非仅“阻止丢失”的路径之一。aa7a89Miamiherald3. 局限性与风险(必须强调)仍处于小鼠阶段:优秀的结果(OVX 模型逆转)但无灵长类/人体数据。药代动力学、安全性、长期效果未知。转化挑战:Adhesion GPCRs 药物开发较难(结构复杂、Stachel 序列自激活等)。AP503 是高选择性小分子,但需完成 IND-enabling 研究、I/II/III 期临床。潜在副作用:GPR133 在其他组织(如脑、肿瘤微环境)有表达,曾与胶质母细胞瘤相关;需警惕脱靶。虽与雄激素受体(AR)路径分离,但仍有肌肉-骨协同可能带来的全身效应。时间线:乐观估计 5-10 年可能进入临床,最快也需数年。许多“突破”停留在动物阶段。夸大风险:标题“逆转骨质疏松”在动物中成立,但人体“dramatically increase bone density”尚无证据。运动协同很重要,不能替代生活方式干预。eefce0Sciencealert4. 更广泛意义老龄化社会价值:同时强化骨骼 + 肌肉(先前研究),针对肌少症-骨质疏松共病。力学-生物学桥接:揭示骨如何“感知”运动并转化为分子信号,为“运动模拟药物”提供新靶点。Adhesion GPCR 家族:该领域正兴起,Leipzig-Shandong 合作是领先者之一。总结:这是一项扎实、高质量的机制研究 + 药物发现,GPR133/AP503 确实是极具潜力的新靶点,尤其对绝经后骨质疏松有针对性。报道准确捕捉了核心,但“just found a way to reverse”略带科普式乐观。目前最务实的行动仍是:保证钙/维生素 D、负重运动、筛查骨密度,期待未来临床试验数据。科研进展令人振奋,但从 bench 到 bedside 还有距离。如果需要论文全文细节、机制图解读或相关临床试验跟踪,随时补充提问。
**Adhesion G protein-coupled receptors (aGPCRs or adhesion GPCRs)** form the second-largest class of the GPCR superfamily (33 members in humans). They are structurally and functionally distinct from the more commonly targeted Class A (rhodopsin-like) receptors and remain one of the most underexploited families for drug development.### Unique Structural and Activation FeaturesaGPCRs have:- A very large multi-domain **N-terminal extracellular region** (often containing adhesion domains such as EGF, cadherin, or immunoglobulin-like motifs) that mediates cell–cell or cell–matrix interactions.- A highly conserved **GPCR Autoproteolysis-Inducing (GAIN) domain**.- Autoproteolytic cleavage at a GPS site that separates the receptor into an N-terminal fragment (NTF) and C-terminal fragment (CTF) that remain non-covalently associated.- A short **Stachel (tethered agonist) sequence** that, upon mechanical force, ligand binding, or other triggers, can insert into the 7-transmembrane (7TM) domain and activate G-protein signaling (often preferring G₁₂/₁₃, though some couple to Gs, as with GPR133/ADGRD1).Activation can be *cis* (intramolecular) or *trans*, mechanical-force-dependent, or ligand-driven. Many remain orphan receptors (no confirmed endogenous ligands).### Why Drug Development Has Been ChallengingDespite GPCRs overall accounting for ~30–35% of approved drugs, **no aGPCR-targeted therapies are approved or (as of recent reviews) advanced in clinical trials**. Key barriers include:- **Structural complexity** — Large, flexible extracellular domains make crystallization/cryo-EM difficult; full-length structures have only recently become available.- **Orphan status and poorly understood signaling** — Limited knowledge of endogenous ligands and downstream pathways for many members.- **Assay difficulties** — Standard orthosteric ligand screens are harder; tethered-agonist mechanisms and constitutive activity complicate hit identification.- **Safety and selectivity concerns** — Broad expression patterns and dual roles (adhesion + signaling) raise on-target/off-tissue risks.- **Technical hurdles for modalities** — Small-molecule screening against the 7TM pocket is possible but historically low-yield; antibodies face challenges with membrane proteins.### Recent Progress and Enabling TechnologiesAdvances since ~2019–2025 have dramatically improved the outlook:1. **Structural biology** — Cryo-EM structures of multiple aGPCRs (including ligand- and Stachel-bound states) have revealed activation mechanisms and orthosteric/allosteric pockets. This supports structure-based virtual screening and rational design.2. **Small-molecule modulators** — Several tool compounds now exist (e.g., dihydromunduletone as an antagonist/partial modulator for certain ADGRG members; peptide Stachel mimetics; and selective agonists such as **AP503** for GPR133/ADGRD1). AP503 was identified via computational screening, activates Gs/cAMP signaling, shows selectivity over other aGPCRs and the nuclear androgen receptor, and demonstrates efficacy in mouse models of muscle weakness and osteoporosis.3. **Antibodies and biologics** — The large, unique extracellular domains are attractive for highly selective monoclonal antibodies, nanobodies, or antibody–drug conjugates. Structural insights are enabling better antigen design.4. **Other modalities** — Peptide mimetics of the Stachel sequence, allosteric modulators, biased agonists (to favor specific pathways and reduce side effects), and emerging approaches such as targeted protein degradation or molecular glues.5. **Disease genetics and models** — Strong human genetic links and knockout phenotypes now connect ~17 of the 33 aGPCRs to diseases including cancer, neurological/psychiatric disorders, metabolic conditions, myelination defects, cardiovascular disease, bone/muscle loss, and autoimmunity.### Current Status and Therapeutic Potential- **Preclinical stage predominates**. Tool compounds and early leads (including AP503 for GPR133 in muscle and bone) validate target engagement and efficacy in animal models.- **Priority targets** include members of the ADGRG subfamily (GPR56/ADGRG1, GPR64/ADGRG2, GPR126/ADGRG6, etc.) and receptors such as GPR133/ADGRD1.- **Opportunities** are particularly strong where aGPCRs act as mechanosensors or integrate adhesion with signaling (e.g., bone formation under load, myelination, immune cell interactions).- Reviews (including a 2026 *Nature Reviews Drug Discovery* article co-authored by key groups working on GPR133) emphasize that structural breakthroughs + small-molecule/antibody strategies now make systematic drug discovery feasible.### OutlookaGPCR drug development has shifted from “largely intractable” to “emerging frontier.” Success will depend on:- Better deorphanization and signaling maps.- Robust, high-throughput functional assays tailored to tethered-agonist and mechanical activation.- Selective orthosteric or allosteric modulators that exploit the unique extracellular domains for precision.- Careful safety evaluation given widespread expression.In short, adhesion GPCRs represent a high-risk, high-reward class. The combination of new structures, computational screening successes (exemplified by AP503), and growing disease associations positions them as one of the last major untapped GPCR families with significant therapeutic potential across multiple disease areas.
黏附 G 蛋白偶联受体(Adhesion GPCRs,简称 aGPCRs)药物开发黏附 G 蛋白偶联受体(aGPCRs 或 adhesion GPCRs)是 GPCR 超家族中的第二大类(人类共有 33 个成员)。它们在结构和功能上与更常被靶向的 A 类(视紫红质样)受体明显不同,目前仍是药物开发中最未被充分开发的家族之一。独特的结构与激活特征aGPCRs 具有以下特点:非常大的多结构域 N 端细胞外区域(常包含 EGF、钙黏蛋白或免疫球蛋白样等黏附结构域),介导细胞-细胞或细胞-基质相互作用。高度保守的 GPCR 自水解诱导(GAIN)结构域。在 GPS 位点发生自水解切割,将受体分成 N 端片段(NTF)和 C 端片段(CTF),两者以非共价方式结合。一段短的 Stachel(拴系激动剂)序列,在机械力、配体结合或其他触发下可插入 7 跨膜(7TM)结构域,激活 G 蛋白信号(常偏好 G₁₂/₁₃,部分如 GPR133/ADGRD1 也可偶联 Gs)。激活可以是 顺式(分子内)或 反式,依赖机械力或配体驱动。许多成员仍是孤儿受体(尚无确认的内源性配体)。药物开发为何困难尽管 GPCR 整体约占已批准药物的 30–35%,但 目前尚无针对任何 aGPCR 的疗法获批或(根据近期综述)进入临床试验。主要障碍包括:结构复杂 — 大而灵活的细胞外结构域使结晶/冷冻电镜解析困难;全长结构直到近年才陆续获得。孤儿状态与信号通路理解不足 — 许多成员的内源性配体和下游通路知识有限。检测难度 — 标准正构配体筛选较难;拴系激动剂机制和本底活性使命中发现复杂。安全性与选择性担忧 — 广泛表达模式以及双重作用(黏附 + 信号)带来靶上/组织外风险。模态技术障碍 — 针对 7TM 口袋的小分子筛选可行但历史上产量低;抗体面对膜蛋白也有挑战。近期进展与使能技术约 2019–2025 年以来的进展显著改善了前景:结构生物学 — 多个 aGPCR 的冷冻电镜结构(包括配体结合和 Stachel 结合状态)揭示了激活机制以及正构/别构口袋,支持基于结构的虚拟筛选和理性设计。小分子调节剂 — 已出现多个工具化合物(例如针对部分 ADGRG 成员的拮抗剂/部分调节剂 dihydromunduletone;Stachel 肽模拟物;以及针对 GPR133/ADGRD1 的选择性激动剂 AP503)。AP503 通过计算筛选发现,激活 Gs/cAMP 信号,对其他 aGPCR 和核雄激素受体具有选择性,并在肌肉无力和骨质疏松小鼠模型中显示疗效。抗体与生物制剂 — 大而独特的细胞外结构域非常适合开发高选择性单克隆抗体、纳米抗体或抗体-药物偶联物。结构洞见正在帮助更好的抗原设计。其他模态 — Stachel 序列的肽模拟物、别构调节剂、偏向激动剂(优先激活特定通路以减少副作用),以及靶向蛋白降解或分子胶等新兴方法。疾病遗传学与模型 — 强有力的人类遗传关联和敲除表型,已将约 17 个 aGPCR 与癌症、神经/精神疾病、代谢疾病、髓鞘形成缺陷、心血管疾病、骨/肌肉丢失及自身免疫等疾病联系起来。当前状态与治疗潜力以临床前阶段为主。工具化合物和早期先导物(包括 GPR133 在肌肉和骨骼中的 AP503)已验证靶点结合与动物模型疗效。优先靶点 包括 ADGRG 亚家族成员(如 GPR56/ADGRG1、GPR64/ADGRG2、GPR126/ADGRG6 等)以及 GPR133/ADGRD1 等受体。机会尤其突出于 aGPCR 作为机械感受器或整合黏附与信号的场景(如负重下的骨形成、髓鞘形成、免疫细胞相互作用)。多篇综述(包括 2026 年 Nature Reviews Drug Discovery 中由研究 GPR133 的关键团队合著的文章)强调,结构突破 + 小分子/抗体策略现已使系统性药物发现成为可能。展望aGPCR 药物开发已从“基本不可及”转向“新兴前沿”。成功将取决于:更好的去孤儿化与信号图谱。针对拴系激动剂和机械激活的稳健高通量功能检测。利用独特细胞外结构域实现精准性的选择性正构或别构调节剂。鉴于广泛表达,需进行仔细的安全性评估。简而言之,黏附 GPCRs 是一个高风险、高回报的类别。新结构、计算筛选成功案例(以 AP503 为代表)以及不断增长的疾病关联,使其成为最后一个主要尚未充分开发的 GPCR 家族,在多个疾病领域具有显著治疗潜力。
AP503 药物开发细节AP503(全称 AP-970/43482503,CAS 767299-99-0)是目前针对黏附 GPCR 家族中最有效、选择性最高的小分子激动剂之一,专门靶向 GPR133(ADGRD1)。它由山东大学孙金鹏团队与莱比锡大学 Ines Liebscher 团队合作发现,并通过结构生物学与计算化学手段优化。1. 发现与设计过程起点:团队先解析了 5α-DHT(双氢睾酮)与 GPR133-Gs 复合物的冷冻电镜结构,确认 GPR133 是雄激素的膜受体。筛选策略:以该结构为模板,采用结构基础虚拟筛选(structure-based virtual screening) + 正向/反向筛选策略,从化合物库中找到先导物。优化:对先导物 AP-970/43482499 进行类似物合成与测试,最终确定 AP-970/43482503(AP503)为最优化合物。关键论文:2025 年发表于 Cell(《Identification, structure, and agonist design of an androgen membrane receptor》)。2. 化学与药理特性项目数据分子式C₂₄H₃₁N₃O₄分子量425.53EC₅₀1.21 ± 0.06 nM(激活 GPR133-Gs/cAMP 通路)选择性优先激活 Gs 通路,几乎不激活 G₁₂ 或 Gᵢ;对核雄激素受体(AR)无活性;对其他 aGPCR 无明显交叉活性结合口袋比 5α-DHT 更大的 Y 形口袋,分为 3 个子口袋;关键残基突变会显著削弱活性化学名称:methyl 3-(2-(2,4-dimethylphenoxy)acetamido)-4-(4-ethylpiperazin-1-yl)benzoateSMILES:CCN1CCN(C2=CC=C(C(OC)=O)C=C2NC(COC(C(C)=C3)=CC=C3C)=O)CC1目前已有商业供应商(如 MedChemExpress、Probechem)提供研究级纯品(>98–99.8% HPLC),仅限科研用途。3. 体内药效数据(小鼠)给药方式:腹腔注射(i.p.),常用剂量 2 mg/kg/天,连续 4 周。肌肉:快速升高趾长伸肌(EDL)cAMP 水平,增强强直收缩力;效果不受 AR 拮抗剂影响。与 5α-DHT 相比,保留肌肉增强作用,同时显著降低前列腺等雄激素相关副作用。骨骼:在野生型、杂合敲除及去卵巢(OVX,模拟绝经后骨质疏松)模型中,显著增加骨量、骨小梁数量、皮质骨厚度和生物力学性能(三点弯曲测试)。同时促进成骨细胞、抑制破骨细胞,并与运动产生协同效应。其他:改善前庭平衡功能障碍模型小鼠的平衡能力。4. 开发状态与知识产权最高阶段:临床前(Preclinical)。主要适应症探索:肌萎缩/肌肉无力、骨质疏松、前庭功能障碍相关疾病。起源机构:山东大学(主要专利与合成工作),与莱比锡大学深度合作。专利:中国专利 CN118146176B(已授权),覆盖化合物、制备方法及其作为 GPR133 激动剂在肌肉、骨骼、前庭相关疾病中的应用。公开数据库:Synapse 等平台标注为“Muscular Atrophy – Preclinical”,暂无临床试验注册信息。5. 优势与待解决问题优势:极高的效价与选择性(目前 aGPCR 中最强合成激动剂之一)。分离了 GPR133 介导的有益效应与传统雄激素的副作用。同时作用于肌肉与骨骼,对老年相关肌少症-骨质疏松共病具有潜在双重价值。待解决/未知:人体药代动力学(吸收、分布、代谢、排泄)、安全性、毒理学数据尚未公开。口服生物利用度、长期给药副作用、组织分布等需进一步评估。从临床前到 IND(临床试验申请)仍需完整的 GLP 毒理、CMC(化学制造与控制)等工作。总结:AP503 是基于结构的理性药物设计成功案例,已在多种小鼠模型中验证了明确的靶点相关疗效,并具备较好的选择性与安全性迹象。目前仍处于早期临床前阶段,距离人体试验和上市还有较长路径,但为 aGPCR 药物开发提供了重要工具分子与概念验证。
GPR133 (ADGRD1) 结构生物学研究方法总结GPR133 的结构研究主要依赖单颗粒冷冻电镜(cryo-EM single-particle analysis),这是目前解析黏附 GPCR(aGPCR)最成功的方法。以下是关键结构与方法细节。1. 主要已解析结构(PDB / EMDB)结构分辨率复合物关键配体/状态发表年份PDB / EMDBGPR133-CTF–Gs~2.8–3.1 ÅC-末端片段 + GsStachel 拴系激动剂激活态2022 (Nature)7EPT / EMD-31232;7WU2GPR133–Gs + 5α-DHT2.75–3.53 ÅGAIN 或 CTF 构建体 + Gs5α-DHT 或 methenolone (MET)2025 (Cell)8X9S, 8X9T, 8X9U, 9IV1, 9IV2GPR133–Gs + AP503~2.75 Å含 GAIN 的构建体 + Gs小分子激动剂 AP5032025 (Cell)相关条目GPR133-GAIN–miniGα133.51 ÅGAIN 域 + miniGα13自激活 / G13 偶联2025 (BBRC)9V0U / EMD-64672这些结构揭示了:Stachel(拴系激动剂)如何插入 7TM 口袋。5α-DHT / MET / AP503 在正构口袋中的结合模式。Gs 与 G13 偶联界面的异同。2. 核心方法流程(以 2025 Cell 论文为主)表达系统常用昆虫细胞(Sf9)或哺乳动物细胞,共表达受体 + Gαs / miniGαs + Gβ1 + Gγ2。为提高稳定性,常使用 scFv16 纳米抗体或 miniG 蛋白。构建体设计CTF(C-terminal fragment):去除大部分 N 端,保留 Stachel 序列,用于捕获拴系激动剂激活态。GAIN 域保留构建体:包含完整 GAIN 域,用于研究配体结合与自激活。有时使用截短 N 端或突变体以改善表达与稳定性。纯化与复合物组装膜蛋白用去垢剂(如 LMNG、GDN)或纳米盘(nanodisc)提取。与 G 蛋白在体外组装,必要时加入激动剂(5α-DHT、MET、AP503)稳定活性构象。尺寸排阻色谱(SEC)纯化复合物。冷冻电镜样品制备与数据收集样品在石墨烯或碳支持膜网格上冷冻(vitrification,常用液态乙烷)。高分辨率数据通常在 300 kV 透射电镜(如 Titan Krios)上采集,配备 K3 或类似直接电子探测器。使用自动数据收集软件(EPU 等)。数据处理与模型构建软件主流:RELION、cryoSPARC。流程:粒子挑选 → 2D/3D 分类 → 非均一 refinement → 局部 refinement → 最终重建。分辨率评估使用 FSC 0.143 标准。原子模型用 Coot、Phenix 或类似工具搭建与 refinement。3. 早期与相关结构生物学方法2022 年 Nature 系列论文:首次解析 GPR133-CTF–Gs 结构,使用类似的昆虫细胞表达 + cryo-EM 策略,重点阐明 Stachel 激活机制(“finger model” 等)。G13 偶联结构(2025):体外重组 GPR133-GAIN–miniGα13 复合物,比较 Gs 与 G13 界面差异。其他辅助方法:AlphaFold 预测作为初始模型参考。突变验证关键残基(尤其是配体口袋与 G 蛋白界面)。功能测定(cAMP、GTPγS 结合)与结构结果交叉验证。4. 方法上的挑战与创新点aGPCR 的大细胞外结构域高度灵活,全长结构解析难度大,因此多采用截短构建体或聚焦于 7TM + GAIN。使用 miniG 蛋白和 scFv 显著提高了复合物稳定性与分辨率。结构指导的虚拟筛选直接催生了 AP503,是“结构→药物”闭环的成功案例。总结:GPR133 结构生物学几乎完全建立在单颗粒 cryo-EM 基础上,通过精心设计的构建体、G 蛋白工程与稳定策略,成功获得了高分辨率激活态结构。这些结构不仅阐明了拴系激动剂、类固醇和小分子的识别机制,也直接推动了选择性激动剂的发现。未来全长受体在脂质环境中的结构以及不同构象动态的解析,仍是重要方向。
GPR133 (ADGRD1) 配体结合机制详解GPR133 的配体结合机制主要通过高分辨率 cryo-EM 结构阐明,涵盖内源性拴系激动剂(Stachel)、类固醇激素(5α-DHT、methenolone) 以及合成小分子激动剂 AP503。以下按配体类型分别说明。1. Stachel(拴系激动剂)结合机制(自激活)结构基础:2022 年 Nature 解析的 GPR133-CTF–Gs 结构显示,自水解后暴露的 Stachel 序列(约 15 个残基,核心为 TNFAILMQVVPLELA)采取 α-螺旋-凸起-β折叠 构象,插入 7TM 结构域形成的口袋。关键相互作用:疏水相互作用基序(Hydrophobic Interaction Motif, HIM)主导与 TM 螺旋的接触。“手指模型”(finger model):Stachel 中的疏水残基(F、I/V、L、L/M、L)像手指一样伸入 5 个互补的疏水口袋。保守的 toggle switch 残基 W6.53 感知 Stachel 并结合,触发构象变化。氢键网络(Q/Y7.49 与 P/V6.47 φφG6.50 基序)稳定 TM6 和 TM7 的弯曲,促进 G 蛋白偶联。激活结果:诱导 TM6 向外移动,形成 G 蛋白结合界面,优先激活 Gs(也可偶联 G13)。机械力或细胞外配体(如 PTK7、PLXDC2)可促进 Stachel 暴露,实现力敏感激活。2. 类固醇激素(5α-DHT 与 methenolone)结合机制口袋位置:位于 7TM 结构域,由 TM1–TM3、TM5–TM7 和 ECL2 共同围成,比某些其他 aGPCR(如 GPR97 的皮质醇口袋)更大。两种结合模式(在含 GAIN 的构建体中观察到):垂直模式(5α-DHTV):亲和力更高,与细胞膜垂直。水平模式(5α-DHTH):平行于膜平面,亲和力较低。关键识别基序(高度保守,提示许多 aGPCR 可能识别类固醇):Φ(F/L)2.64 – F3.40 – W6.53(ΦFW 基序):识别疏水四环核心。W6.53(toggle switch)直接接触 A 环或 D 环。Φ(F/L)2.64 和 F3.40 通过疏水或 π-π 堆积作用稳定类固醇骨架。F7.42 ×× N/D7.46 基序:识别极性基团(如 C3 位羰基)。F7.42 形成 π-π 相互作用。N/D7.46 形成氢键或极性接触。特异性残基:Q1.36、L2.64、F2.68、F3.40、W6.53 等对 5α-DHT 选择性重要。效能:5α-DHT 的 EC50 约 15.4 nM(Gs 通路),显著强于 Stachel 肽或 PLXDC2。3. 小分子激动剂 AP503 结合机制口袋特征:Y 形口袋,比 5α-DHT 口袋更大,分为三个子口袋:DP(5α-DHT pocket):甲基苯甲酸酯部分,结合模式类似 5α-DHT。EPP(ethylpiperazine pocket):乙基哌嗪部分,由 TM3、TM5、ECL2 的疏水残基构成。DMAP(dimethylanisole pocket):2,4-二甲基苯甲醚部分,深入由 TM3、TM5–TM7 和 W6.53 组成的深疏水口袋。选择性基础:EPP 和 DMAP 中的多个残基(如 F2.68、I5.36、V5.40 等)在 aGPCR 家族中保守性低,赋予 AP503 对 GPR133 的高选择性。效能与信号偏向:EC50 约 1.21 nM,优先激活 Gs,几乎不激活 G12 或 Gi,对核雄激素受体(AR)无活性。4. 共同激活机制与功能意义所有配体最终通过稳定活性构象(TM6 向外移动、形成 G 蛋白界面)激活下游信号:主要通路:Gs → cAMP → PKA / β-catenin。在成骨细胞中,与机械力和 PTK7 协同,促进骨形成并抑制破骨。在肌肉中,增强收缩力。总结:GPR133 展现了灵活的配体识别策略——Stachel 提供本底/力敏感激活,类固醇和小分子利用重叠但可扩展的正构口袋。两个保守基序(ΦFW 和 F7.42××N/D7.46)为其他 aGPCR 的类固醇配体发现提供了框架,而 AP503 的 Y 形口袋设计则为高选择性药物开发树立了范例。