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研究背景由与E3泛素连接酶配体连接蛋白质靶向配体形成的蛋白水解靶向嵌合体（PROTAC）的靶向蛋白质降解已成为一种通过蛋白酶体介导的降解致病蛋白质的强大治疗方式。虽然有超过600个E3连接酶，但是大多数PROTAC只利用了Cullin-RING E3泛素连接酶的底物受体——cereblon和VHL。近年来，还发现了许多其他针对其他E3连接酶的募集蛋白，包括cIAP、MDM2、DCAF16、DCAF11、RNF114、RNF4、FEM1B、KEAP1和DCAF1。并不是所有的E3连接酶都对癌细胞活力至关重要，因此，癌细胞中可能会出现耐药机制，从而损害E3连接酶募集并使PROTAC无效。开发针对泛素-蛋白酶体机制核心成分的募集剂，例如针对对细胞活力至关重要的CUL1-CUL7 E3连接酶中的Cullin-RING E3连接酶复合接头蛋白（如DDB1、SKP1 或ELOB/ELOC）的募集剂，可以避免PROTAC可能产生的潜在未来耐药机制。加州大学伯克利分校Nomura课题组研究了CUL1-RING E3连接酶接头蛋白SKP1是否可以被募集用于PROTAC介导的新底物降解。研究内容该课题组在基于凝胶的基于活性的蛋白质分析（ABPP）中筛选了1284个半胱氨酸反应性共价配体，筛选了针对人SKP1-FBXO7-CUL1-RBX1复合物（图1）。该筛选产生的性能最良好的化合物是EN884（图2）。EN884显示了SKP1-FBXO7-CUL1-RBX1复合物中人SKP1蛋白的半胱氨酸反应性探针的剂量反应置换（图3）。   图1.半胱氨酸反应性共价配体库筛选结果（针对SKP1-FBXO7-CUL1-RBX1复合物）图2.EN884结构图3.EN884与半胱氨酸探针反应该课题组对与 EN884 一起孵育的SKP1-FBXO7-CUL1-RBX1复合物进行了串联质谱（MS/MS）分析，以确定修饰位点（图4），发现了一个被修饰的位点——SKP1上的C160（图5），该位点由于特定的F-Box结构域，表现出独特的构象。因此，该课题组假设EN884可能会利用SKP1和CUL1底物受体之间的集体界面并结合。图4.串联质谱分析图5.结合位点位置 接下来，该课题组合成了两个基于EN884的炔烃功能化探针SJH1-37-m、SJH1-37-p（图6）。基于凝胶的ABPP评估这些探针与SKP1复合物的结合，与对位相比，间位结合能力更佳（图7）。    图6.探针结构图7.探针结合能力值得注意的是，由于C160位置特殊，EN884和SJH1-37m不与单体SKP1结合（图8）。这表明，CUL1复合物的其余部分，或至少是底物受体，是配体与SKP1结合所必需的。图8.探针与单体SKP1结合       该课题组进一步证明，SJH1-37m通过SKP1的下拉在细胞中结合SKP1，而不是不相关的蛋白质，如GAPDH（图9）。   图9.SJH1-37m探针的SKP1下拉接下来，该课题组进行了基于质谱的ABPP，以使用先前建立的同位素脱硫生物素-ABPP（isoDTB-ABPP）鉴定HEK293T细胞中EN884参与SKP1的半胱氨酸。该课题组发现EN884在SKP1上与C160有7%的最小参与（图10）。这种最小参与与已应用在PROTAC（包括DCAF16、DCAF11和RNF114）中的其他共价E3连接酶募集剂观察到的最小参与一致。图10.HEK293T细胞中EN884的isoDTB-ABPP分析为了证明共价SKP1配体可用于PROTAC应用，该课题组合成了四种不同的PROTAC，通过C2、C4、C5或PEG3连接子将EN884的衍生物与BET家族抑制剂JQ1连接起来，分别生成SJH1-51A、SJH1-51B、SJH1-51C和SJH1-51D（图11）。所有四种PROTAC都降解了HEK293T细胞中BRD4的短亚型（图12），其中使用C4烷基接头的SJH1-51B观察到的降解最强。   图11.四种PROTAC结构图12.四种PROTAC降解效果并且，基于串联质量标记（TMT）的MDA-MB-231细胞中SJH1-51B的定量蛋白质组学分析显示BRD4中等选择性降解，其中16种蛋白质的水平显着降低>50%（图13）。   图13.SJH1-51B的定量蛋白质组学与蛋白酶体介导的降解一致，SJH1-51B介导的BRD4降解通过用蛋白酶体抑制剂硼替佐米预处理而减弱（图14）。它还显示出对活性Cullin RING E3连接酶所需的NEDD化的依赖性，NEDD化抑制剂MLN4924可减弱BRD4的降解（图15）。最重要的是，该课题组证明SKP1敲低完全减弱了SJH1-51B在HEK293T细胞中对BRD4的降解（图16）。图14.硼替佐米预处理结果图15.MLN4924预处理结果图16.SKP1敲低细胞结果BRD4是一种相对容易被PROTAC降解的蛋白质。因此，该课题组接下来测试了共价SKP1募集剂是否可用于降解另一种新底物蛋白——雄激素受体（AR）。该课题组合成了4种AR PROTAC，将共价SKP1募集剂与来自ARV-110的Arvinas AR PROTAC靶向配体连接起来，没有连接子或C4、C6或C7烷基连接子，分别产生SJH1-63、SJH1-62C、SJH1-62D和SJH1-62B（图17）。该课题组观察到所有4种PROTAC的AR降解，其中带有C7烷基接头的SJH1-62B在LNCaP前列腺癌细胞中显示出最有效和最强大的AR降解（图17）。 图17.四种AR PROTAC结构与降解效果该课题组进一步证明，SJH1-62B介导的AR降解在蛋白酶体抑制剂预处理后减弱（图18）。定量蛋白质组学分析还表明，AR与其他11种蛋白质的选择性降解在5000多种定量蛋白质中也显著降低（图19）。图18.SJH1-62B的硼替佐米预处理结果图19.SJH1-62B的定量蛋白质组学研究总结 该课题组发现了一种SKP1募集物，它共价靶向位于SKP1和CUL1 F-box底物受体界面的SKP1的固有无序C160。这一观察结果为发现仅在含有IDR的蛋白质与其相互作用的蛋白质形成复合物时出现的可连接位点提供了概念证明。他们进一步证明，这种共价SKP1配体可用于PROTAC应用，以降解细胞中的新底物，如BRD4和AR。鉴于SKP1的重要性，SKP1的共价募集可能潜在地克服在癌症治疗中利用非本质E3连接酶的PROTAC的耐药性机制。虽然该课题组证明了在PROTAC中使用Cullin RING E3连接酶衔接蛋白的概念，但SKP1配体仍处于早期阶段，需要进行重大的药物化学优化，以提高效力、选择性和类药物特性。   该课题组的研究结果还强调了使用共价化学蛋白质组学方法来识别泛素-蛋白酶体系统中蛋白质的补充物的实用性，该系统可用于靶向蛋白质降解应用。作者：潘相奕校审：周金明编辑：郑一榕时间：2024年3月29日参考文献Exploiting the Cullin E3 Ligase Adaptor Protein SKP1 for Targeted Protein Degradation ACS Chemical Biology 2024 19 (2), 442-450. DOI: 10.1021/acschembio.3c00642    声明：发表/转载本文仅仅是出于传播信息的需要，并不意味着代表本公众号观点或证实其内容的真实性。据此内容作出的任何判断，后果自负。若有侵权，告知必删！长按关注本公众号   粉丝群/投稿/授权/广告等请联系公众号助手 觉得本文好看，请点这里↓

Researchers investigate the intricacies of various cellular processes and pathologies and identify compounds with untapped therapeutic potential XI'AN, China, March 29, 2024 /PRNewswire/ -- Understanding the underlying mechanisms of normal and pathological cellular processes is essential for developing new drugs. Fortunately, modern techniques and experimental methods have greatly accelerated progress. The latest issue of JPA features three articles in which candidate compounds for treating complex disorders were successfully identified, alongside their detailed mechanisms of action. Continue Reading Recent JPA studies identify, through detailed analyses of molecular mechanisms and cellular processes, three potential drug candidates for three different pathologies. The first study investigated the use of metformin (Met), a drug used to manage type II diabetes, for treating benign prostate hyperplasia (BPH). The article was published in Volume 14, Issue 1 of the journal in January 2024. The researchers first sought to shed light on how and which dysregulated sex steroid hormone-related pathways shape the pathological characteristics of BPH, and whether Met can restore these pathways. Through retrospective analysis of data from BPH patients and clinical assessment of serum and tissue samples, the researchers identified dihydrotestosterone (DHT) as a major contributor to BPH among dysregulated sex hormones. DHT promotes prostate cell proliferation by upregulating androgen receptors and forming YAP1-TEAD4 heterodimers. In vivo experiments showed that Met treatment restored sex hormone homeostasis and inhibited DHT-induced cell proliferation. "Our study provided strong evidence that Met might be a promising clinical therapeutic approach for the treatment of BPH," remark corresponding authors Prof. Qian Lu and Prof. Xiaoxing Yin. In the second study, scientists explored the role of epimedin B (EB), the main flavonoid in the Chinese herb Epimedium brevicornum Maxim., in melanogenesis. They expanded on previous findings showing EB's ability to induce melanogenesis and activate tyrosinase family of proteins (TYRs). Through comprehensive in vitro and in vivo experiments on human and animal cells, they uncovered how EB modulated TYRs, increased melanosome numbers, promoted maturation, and aided depigmentation and repigmentation. "Our data reveals that EB can stimulate the pigmentation function of TYRs, which might provide a novel rational strategy for hypopigmentation treatment in the pharmaceutical and cosmetic industries," comments corresponding authors Dr. Yiming Li and Prof. Huali Wu. Finally, in the third study, researchers investigated ferroptosis, a type of programmed cell death, and its role in nerve regeneration after peripheral nerve injury (PNI). They found that oxidative stress at the injury site not only triggered both apoptosis and ferroptosis in nearby neurons by increasing intracellular iron via the degradation of ferroportin by UBA52. Using the Drug Signatures Database, they identified hydralazine (HYD), a potent arterial vasodilator, as a potential UBA52 disruptor. Early HYD administration after PNI in vivo expedited axon regeneration and motor function recovery, partly by suppressing ferroptosis. "The potential clinical implementation of HYD may lead to a reduction in the prevalence of individuals with mild symptoms of nerve damage, consequently mitigating the societal burden," conclude corresponding authors Dr. Bing Xia, Prof. Zhuojing Luo, and Dr. Jinghui Huang. Further studies will hopefully clarify the intricate connections among cellular processes, diseases, and potential drugs, paving the way for precise and efficient therapies. Reference Titles of original papers Metformin: A promising clinSical therapeutical approach for BPH treatment via inhibiting dysregulated steroid hormones-induced prostatic epithelial cells proliferation Epimedin B exhibits pigmentation by increasing tyrosinase family proteins expression, activity, and stability Hydralazine represses Fpn ubiquitination to rescue injured neurons via competitive binding to UBA52 Journal: Journal of Pharmaceutical Analysis DOI 1. 2. 3. Media contact Mengjie Wang [email protected] +86-(0)29-88960092 SOURCE Journal of Pharmaceutical Analysis (JPA)

苏州 2024年3月29日 /美通社/ -- 北京时间2024年3月29日，开拓药业（股票代码：9939.HK），一家专注于潜在同类首创和同类最佳创新药物研发及产业化的生物制药公司，公布了近期业务亮点及截至2023年12月31日全年业绩。 2023年度业绩总览 业务概览 皮科双核心产品全球临床研发持续推进 在研多管线显露研发及商业合作价值 多项研究成果入选重要学术会议及于核心期刊发表 财务概览 资金使用效率有效提升，在手现金支持公司战略布局 奖项荣誉 斩获认可，屡次入选生科公司榜单 一、业务概览 作为专注于潜在同类首创和同类最佳创新药物研发及产业化的生物制药公司，开拓药业前瞻性布局了包含小分子创新药、生物创新药及联合疗法的多元化产品管线，目前拥有6款在中国和全球开展临床I-III期研究的新药项目。 1. 皮科双核心产品全球临床研发持续推进 我们在皮科领域拥有丰富的研发经验，目前两款核心药物KX-826及GT20029已分别推进至临床III期及临床II期，并正积极探索核心产品于皮科领域的商业化路径。此外，我们亦在开发更多化合物，拓展皮科领域的适应症布局。 KX-826 ，公司自主开发的外用雄激素受体（AR）拮抗剂，超千人使用显示良好的安全性和有效性，连续使用6个月后，患者目标区域内的平均非毳毛数（TAHC）较基线增加最高可达22.7根/cm 2 。 2023年，KX-826完成了中国男性脱发III期临床试验、美国男性脱发II期临床试验及中国痤疮II期临床试验，同时，我们启动了中国脱发长期安全性III期临床试验及KX-826与米诺地尔联合使用的中国脱发Ib/III期临床试验。针对脱发适应症，我们已验证KX-826在不同的人群中的良好安全性及有效性。长期安全性III期临床试验预计将为公司提供长期使用KX-826的安全性及有效性的数据支持。与米诺地尔联合疗法的探索将进一步挖掘KX-826于脱发领域的治疗效果。针对痤疮适应症，II期临床试验的结果为公司后续研究开展奠定了基础。 2024年2月1日，公司自主研发的KX-826和米诺地尔联合治疗中国男性患者雄激素性脱发Ib/III期临床试验获得中国国家药品监督管理局（NMPA）批准开展。 2023年11月27日，公司公布KX-826治疗男性脱发的中国III期临床试验顶线数据。分析结果显示，该试验整体安全性优良，KX-826展示了极佳的安全性能。治疗24周后，KX-826组TAHC结果显示，KX-826与基线相比促进了毛发生长，具有统计学意义（ p <0.0001）。与安慰剂相比，KX-826 0.5%BID组TAHC在各个访视点均有提高，显示疗效趋势，但差异在统计学上未达到显著性。 2023年11月15日，KX-826治疗脱发的长期安全性III期临床试验完成全部患者入组。该试验于2023年4月18日获得NMPA批准开展。 2023年8月28日，公司宣布KX-826治疗痤疮的中国II期临床试验已成功完成。结果显示KX-826具有良好的安全性和有效性。 2023年5月11日，公司宣布KX-826治疗男性脱发的美国II期临床试验已成功完成。与基线相比，治疗24周后的结果具有统计学和临床意义，且安全性良好。 GT20029 ，外用AR-PROTAC化合物，基于公司自有PROTAC平台开发，是全球首个进入II期临床试验的外用PROTAC化合物。 2023年，GT20029完成了美国脱发及痤疮的I期临床试验。其于中国开展的脱发II期临床试验预计将在近期读出顶线结果。基于GT20029治疗痤疮于中国及美国I期临床试验的结果，我们正在计划开展GT20029用于痤疮治疗的II期临床试验。 2023年8月22日，GT20029治疗男性脱发的中国II期临床试验完成全部180名患者入组，公司正在清理各个入组中心的数据，预计将在近期读出顶线结果，并据此确定后续的临床策略，如开展中国脱发男性III期临床试验等。 2023年2月10日，公司公布GT20029治疗脱发及痤疮的美国I期临床试验的顶线结果。结果显示，GT20029在健康受试者、脱发受试者和痤疮受试者中均展示良好的安全性、耐受性和药代动力学特征。 基于GT20029治疗痤疮于中国及美国I期临床试验的结果，我们正在准备开展GT20029用于痤疮治疗的II期临床试验，进一步拓展我们在痤疮治疗领域的研究范围。 2. 在研多管线显露研发及商业合作价值 通过多年积累，公司拥有另外4款处于临床阶段的产品，前期的临床试验已初步验证该等产品具有良好的安全性及疗效。公司亦开展多项临床前研究，潜在化合物展现出优异的开发及临床合作价值。 GT1708F ，公司自主开发的针对多种实体瘤的创新药物，并首次将适应症扩大至罕见病领域 2023年10月，GT1708F治疗IPF的中国II期临床试验获得NMPA有条件批准开展。 2023年5月8日，公司宣布GT1708F治疗恶性血液疾病的中国I期临床试验成功完成。结果显示，GT1708F展现出良好的安全性和耐受性，所有患者均未发生剂量限制性毒性（DLT）和与研究药物有关的严重不良事件（SAE）。在剂量递增阶段，自180mg剂量组起，在多线治疗失败的急性骨髓性白血病（AML）患者中观察到初步疗效，AML患者髓系原始细胞较基线最高下降了62%。 此外，我们还拥有公司license in的首款大分子药物，具有极佳的联合用药潜力的 ALK-1 ，公司自主开发的有潜力成为同类最佳药物的二代AR抑制剂的 普克鲁胺（ GT0918） ，公司自主开发的分子胶化合物，在多种癌细胞中表现出纳摩尔级别的抗肿瘤活性的 c-Myc分子胶 。 3. 科研学术影响力不断增强 2023年以来，开拓药业多个产品管线研究进展入选国际学术大会和在期刊上发表，公司创新能力持续提升，进一步验证公司产品管线First-in-Class的潜力。 KX-826和GT20029治疗雄激素性脱发和痤疮的临床进展在2023年美国皮肤病学会年会（AAD 2023）备受关注 Hedgehog/SMO抑制剂GT1708F治疗急性髓系白血病（AML）的最新临床前研究结果入选第65届美国血液学年会（ASH 2023）及2023年美国癌症研究协会年会（AACR 2023） 普克鲁胺治疗转移性乳腺癌Ic期临床试验结果于第46届圣安东尼奥乳腺癌研讨会（SABCS 2023）及2023年欧洲肿瘤内科学会年会（ESMO 2023）亮相 ALK-1联合Nivolumab治疗晚期肝细胞癌的Ib/II期临床研究获《BMC医学》（影响因子11.806)发表 c-Myc分子胶研究获《Nature》子刊《Nature Communications》（影响因子16.6）发表 c-Myc分子胶研究结果于ASH 2023亮相 二、财务概览 1. 研发费用 *：下降66.6% 截至2023年12月31日，撇除减值及跌价影响，公司的研发成本共计人民币245.8百万元，同比截至2022年12月31日人民币735.0百万元下降66.6%。研发成本减少主要是由于报告期内公司聚焦核心皮科管线，该等投入较其余管线有极大节约。 * 研发费用已撇除减值及跌价影响 2. 行政开支 *：下降34.6% 截至2023年12月31日，撇除减值影响，公司的行政开支共计人民币86.4百万元，同比截至2022年12月31日人民币132.2百万元下降34.6%。行政开支减少主要是由于报告期内员工薪酬及股权激励费用减少。公司已于2023年底进行雇员规模及薪酬调整，并将视乎业务推进情况采取进一步行动。 *行政开支已撇除减值影响 3. 在手现金 截至2023年12月31日，公司持有现金和现金等价物以及定期存款为人民币456.3百万元，另外，公司持有动用的银行授信为人民币110.5百万元。在手现金能够支持公司的临床和研发推进，以及为实现产品商业化的必要性支出。 三、奖项荣誉 斩获认可，屡次入选生科公司榜单 开拓药业凭借其在药物创新研发领域长期的钻研不懈，获得业界的广泛认可，荣膺多项行业和资本市场奖项，包括第十届港股100强"生物科技股15强"、入选"中国小分子药物企业创新力TOP30"排行榜（米内网2022年度中国生物医药企业创新力百强系列榜单）、智通财经评选"最佳中小市值公司"等。 四、董事长寄语 创始人、董事长兼首席执行官童友之博士表示：新药研发之路注定布满荆棘。2023年对于开拓而言，是在荆棘之路不断磨砺、在重重迷雾中坚定脚步的历程。虽然面临重重挑战，开拓药业始终没有放弃对新药研发的追求。公司上下怀揣着推出首款创新药物的共同目标，付诸自己的努力与汗水。 我们在皮科领域的探索始终处于前沿地位，两款皮科核心药物KX-826及GT20029具备优秀临床和商业化潜质。我们已在超1,000位受试者中验证了KX-826的安全性和有效性，得益于我们的药物，这些受试者的平均TAHC较基线增加最高可达22.7根/cm 2 。GT20029计划在近期披露中国脱发II期临床试验的顶线结果并准备开展用于痤疮的II期临床试验。此外，我们亦在开发更多化合物，拓展皮科领域的适应症布局。在非皮科领域，我们正通过联合开发或对外授权方式挖掘更高的药物价值，为患者提供更多的用药选择。 展望2024年，我们将继续发挥公司在皮科领域的独特优势，积极探索多方位的商业化路径。同时，我们会提高资金使用效率，期待通过长期可持续发展，为患者、股东创造更多价值。 * 详情请参阅公司于2024年3月28日发布的2023年度业绩公告