更新于：2024-11-01

UBE2N

更新于：2024-11-01

基本信息

别名

Bendless-like ubiquitin-conjugating enzyme、BLU、E2 ubiquitin-conjugating enzyme N

+ [9]

简介

The UBE2V1-UBE2N and UBE2V2-UBE2N heterodimers catalyze the synthesis of non-canonical 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains. This type of polyubiquitination does not lead to protein degradation by the proteasome. Mediates transcriptional activation of target genes. Plays a role in the control of progress through the cell cycle and differentiation. Plays a role in the error-free DNA repair pathway and contributes to the survival of cells after DNA damage. Acts together with the E3 ligases, HLTF and SHPRH, in the 'Lys-63'-linked poly-ubiquitination of PCNA upon genotoxic stress, which is required for DNA repair. Appears to act together with E3 ligase RNF5 in the 'Lys-63'-linked polyubiquitination of JKAMP thereby regulating JKAMP function by decreasing its association with components of the proteasome and ERAD. Promotes TRIM5 capsid-specific restriction activity and the UBE2V1-UBE2N heterodimer acts in concert with TRIM5 to generate 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains which activate the MAP3K7/TAK1 complex which in turn results in the induction and expression of NF-kappa-B and MAPK-responsive inflammatory genes. Together with RNF135 and UB2V1, catalyzes the viral RNA-dependent 'Lys-63'-linked polyubiquitination of RIGI to activate the downstream signaling pathway that leads to interferon beta production (PubMed:28469175, PubMed:31006531). UBE2V1-UBE2N together with TRAF3IP2 E3 ubiquitin ligase mediate 'Lys-63'-linked polyubiquitination of TRAF6, a component of IL17A-mediated signaling pathway.

关联

项与 UBE2N 相关的药物

ML307

靶点

UBE2N

作用机制

UBE2N inhibitors

在研机构

Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute

原研机构

Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute

在研适应症

免疫系统疾病 [+2]

非在研适应症-

最高研发阶段临床前

首次获批国家/地区-

首次获批日期1800-01-20

UC-764865

靶点

UBE2N

作用机制

UBE2N调节剂

在研机构

Cincinnati Children's Hospital Medical Center

原研机构

Cincinnati Children's Hospital Medical Center

在研适应症

成人急性髓性白血病

非在研适应症-

最高研发阶段临床前

首次获批国家/地区-

首次获批日期1800-01-20

UC-764864

靶点

UBE2N

作用机制

UBE2N调节剂

在研机构

Cincinnati Children's Hospital Medical Center

原研机构

Cincinnati Children's Hospital Medical Center

在研适应症

成人急性髓性白血病

非在研适应症-

最高研发阶段临床前

首次获批国家/地区-

首次获批日期1800-01-20

100 项与 UBE2N 相关的临床结果

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100 项与 UBE2N 相关的转化医学

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0 项与 UBE2N 相关的专利（医药）

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506

项与 UBE2N 相关的文献（医药）

2024-10-28·Nucleic Acids Research

Polyubiquitinated PCNA triggers SLX4-mediated break-induced replication in alternative lengthening of telomeres (ALT) cancer cells

Article

作者: Park, Su Hyung ; Myung, Kyungjae ; Kim, Sangin ; Kang, Nalae ; Ra, Jae Sun ; Lee, Kyoo-young

AbstractReplication stresses are the major source of break-induced replication (BIR). Here, we show that in alternative lengthening of telomeres (ALT) cells, replication stress-induced polyubiquitinated proliferating cell nuclear antigen (PCNA) (polyUb-PCNA) triggers BIR at telomeres and the common fragile site (CFS). Consistently, depleting RAD18, a PCNA ubiquitinating enzyme, reduces the occurrence of ALT-associated promyelocytic leukemia (PML) bodies (APBs) and mitotic DNA synthesis at telomeres and CFS, both of which are mediated by BIR. In contrast, inhibiting ubiquitin-specific protease 1 (USP1), an Ub-PCNA deubiquitinating enzyme, results in an increase in the above phenotypes in a RAD18- and UBE2N (the PCNA polyubiquitinating enzyme)-dependent manner. Furthermore, deficiency of ATAD5, which facilitates USP1 activity and unloads PCNAs, augments recombination-associated phenotypes. Mechanistically, telomeric polyUb-PCNA accumulates SLX4, a nuclease scaffold, at telomeres through its ubiquitin-binding domain and increases telomere damage. Consistently, APB increase induced by Ub-PCNA depends on SLX4 and structure-specific endonucleases. Taken together, our results identified the polyUb-PCNA-SLX4 axis as a trigger for directing BIR.

2024-09-01·European Journal of Pharmacology

Validating the temporal performance of genetic biomarkers in an animal model of recurrence/ non-recurrence myocardial infarction persuades by bioinformatics tools

Article

作者: Sharma, Arun K ; Singh, Jitender ; Kumar, Yash ; Mukherjee, Monalisa ; Khan, Mohd Faiyaz ; Kumar, Ashish ; Alamoudi, Mariam K ; Kansara, Samarth ; Akhtar, Md Sayeed ; Sharma, Vikash

With a global towering prevalence of index acute myocardial infarction (nonrecurrent MI, NR-MI), a high incidence of recurrent MI (R-MI) has emerged in recent decades. Despite the extensive occurrence, the promising predictors of R-MI have been elusive within the cohort of survivors. This study investigates and validates the involvement of distinct gene expressions in R-MI and NR-MI. Bioinformatics tools were used to identify DEGs from the GEO dataset, functional annotation, pathway enrichment analysis, and the PPI network analysis to find hub genes. The validation of proposed genes was conceded by qRT-PCR and Western Blot analysis in experimentally induced NR-MI and R-MI models on a temporal basis. The temporal findings based on RT-PCR consequences reveal a significant and constant upregulation of the UBE2N in the NR-MI model out of the proposed three DEGs (UBE2N, UBB, and TMEM189), while no expression was reported in the R-MI model. Additionally, the proteomics study proposed five DEGs (IL2RB, NKG7, GZMH, CXCR6, and GZMK) for the R-MI model since IL2RB was spotted for significant and persistent downregulation with different time points. Further, Western Blot analysis validated these target genes' expressions temporally. I/R-induced NR-MI and R-MI models were confirmed by the biochemical parameters (CKMB, LDH, cTnI, serum nitrite/nitrate concentration, and inflammatory cytokines) and histological assessments of myocardial tissue. These results underscore the importance of understanding genetic mechanisms underlying MI and highlight the potential of UBE2N and IL2RB as biomarkers for non-recurrent and recurrent MI, respectively.

2024-09-01·Alzheimer's & Dementia

Suppressing UBE2N ameliorates Alzheimer's disease pathology through the clearance of amyloid beta

Article

作者: Yin, Peng ; Zhang, Jiawei ; Tu, Zhuchi ; Yan, Xiao‐Xin ; Zhang, Chen ; Li, Xiao‐Jiang ; Wang, Xiang ; Zhang, Yiran ; Li, Dandan ; Li, Shihua ; Yang, Weili ; Hou, Junqi ; Jia, Qingqing ; Yang, Su ; Zhu, Longhong

AbstractINTRODUCTIONAging is one of the risk factors for the early onset of Alzheimer's disease (AD). We previously discovered that the age‐dependent increase in Ubiquitin Conjugating Enzyme E2 N (UBE2N) plays a role in the accumulation of misfolded proteins through K63 ubiquitination, which has been linked to AD pathogenesis. However, the impact of UBE2N on amyloid pathology and clearance has remained unknown.RESULTSWe observed the elevated UBE2N during the amyloid beta (Aβ) generation in the brains of 5×FAD, APP/PS1 mice, and patients with AD, in comparison to healthy individuals. UBE2N overexpression exacerbated amyloid deposition in 5×FAD mice and senescent monkeys, whereas knocking down UBE2N via CRISPR/Cas9 reduced Aβ generation and cognitive deficiency. Moreover, pharmacological inhibition of UBE2N ameliorated Aβ pathology and subsequent transcript defects in 5×FAD mice.DISCUSSIONWe have discovered that age‐dependent expression of UBE2N is a critical regulator of AD pathology. Our findings suggest that UBE2N could serve as a potential pharmacological target for the advancement of AD therapeutics.Highlights

Ubiquitin Conjugating Enzyme E2 N (UBE2N) level was elevated during amyloid beta (Aβ) deposition in AD mouse and patients' brains.

UBE2N exacerbated Aβ generation in the AD mouse and senescent monkey.

Drug inhibition of UBE2N ameliorated Aβ pathology and cognitive deficiency.

项与 UBE2N 相关的新闻（医药）

2023-11-25

·生物制药小编

4大类Toll样受体和免疫通路

Toll样受体(TLR)在触发先天性和适应性免疫反应中发挥着至关重要的作用。它们不仅启动先天免疫反应，而且还是先天免疫和适应性免疫之间的重要连接器。 Toll样受体(TLR)可分为十个，除了TLR10与其他不同，被认为是Toll样信号传导的免疫调节剂。特异性免疫可分为四类，涉及不同的TLR组合。BiomedicinesTH1免疫反应TH1免疫反应是对抗细胞内细菌、原生动物和真菌的宿主免疫反应，涉及的免疫细胞包括M1样巨噬细胞、产生IFN-γ的CD4+ T细胞、细胞毒性CD8+ T细胞和iNKT1等。Biomedicines涉及TH1免疫通路的自身免疫性疾病包括1型糖尿病、多发性硬化症、接触性皮炎和结核病等。关键TLR：TLR7、TLR8和TLR9这三者都位于巨噬细胞的内体区室中。TLR7、TLR8 和 TLR9对应的配体分别是单链RNA、细菌核糖体RNA和未甲基化的CpG DNA寡核苷酸。这些配体是在巨噬细胞吞噬溶酶体中细菌或原生动物的消化过程中产生的。TLR7、TLR8和TLR9主要的信号通路涉及IRF5和IRF7，它们上调IL-12和IFN-γ等下游靶标。TLR8信号转导激活IRF5，而TLR7/9信号转导激活IRF7。TLR7和TLR9首先激活MyD88复合物，包含TRAF3、TRAF6、IRAK4、IRAK1、IKKα、OPNi 和 DOCK2等等。其激活顺序为：TLR7通过激活MyD88从而首先激活IRAK1，再影响IKKα，使其触发转录因子IRF7。IRF7也可以被IRAK1磷酸化。TLR8则通过激活MyD88首先激活TAK1，再影响IKKβ。TAK1还可以激活下游分子JNK。当IKKβ易位到细胞核中时，它会触发转录因子IRF5。IRF5和IRF7的协同作用以产生IL-12，从而引发TH1反应，上调IFN-γ。TH2免疫反应TH2免疫反应是应对寄生虫的免疫反应，分为TH2a和TH2b。TH2a涉及炎性嗜酸性粒细胞、产生IL-4/5的CD4 T 细胞、具有类胰蛋白酶活性(MCt)的肥大细胞、iNKT2细胞和IgG4 B细胞。BiomedicinesTh2b则涉及嗜碱性粒细胞、产生IL-13/4的CD4 T细胞、具有类胰蛋白酶/糜酶活性的肥大细胞(MCtc)、iNKT2 细胞和产生IgE的B细胞。BiomedicinesTH2免疫与1型IgE相关的过敏性疾病密切有关，如哮喘、过敏性鼻炎和特应性皮炎等。关键TLR：TLR1、TLR2和TLR6TLR2和TLR6在嗜碱性粒细胞或肥大细胞等APC的表面上表达。TLR2可以在细胞表面与TLR6或TLR1形成异二聚体，共同识别三酰基脂蛋白，从而触发MAL接头分子，其激活MyD88非依赖性通路，产生IL-4，触发TH2免疫反应。TLR2-TLR6异二聚体则激活下游PI3K和AKT通路。TLR2激活导致TPL2(MAP3K8)被激活，继而通过IKK2介导激活NFκB通路。TPL2还激活MEK1/2和ERK1/2信号转导，从而触发TH2免疫通路。除了IL-4之外，依赖TLR6而上调的IL-25和依赖TLR1/TLR6的IL-33也是驱动TH2免疫反应的关键细胞因子。Th22免疫反应Th22免疫代表宿主针对细胞外细菌、原生动物和真菌的免疫反应。涉及中性粒细胞N1、分泌IL-22的Th细胞、iNKT17细胞和IgG2 B细胞。BiomedicinesTH22主导的免疫通路与3型免疫复合物超敏反应有关，包括阿瑟氏反应和类风湿性关节炎等疾病。关键TLR：TLR2、TLR4和TLR5与TH22免疫通路相关的主要TLR是TLR2、TLR4和TLR5，在中性粒细胞、树突状细胞和单核细胞/巨噬细胞的表面表达。TLR2同型二聚糖可识别革兰氏阳性细菌细胞壁中的肽聚糖和脂磷壁酸，同时还与真菌细胞壁中的β-葡聚糖相互作用。TLR4则负责识别革兰氏阴性菌细胞壁中的 LPS 内毒素。此外，TLR5可识别在运动细菌中发现的鞭毛蛋白。TLR4 信号转导触发MyD88、IRAK1和IRAK4组成的复合物。IRAK4激活IRAK1导致IRAK1自磷酸化及其与MyD88复合物的解离。随后，IRAK1 与泛素结合酶UBC13和UEV1A结合，促进TRAF63/TAK6复合物的泛素化。IRAK1的激活也会诱导TAK1和TRAF6激活，诱导下游NFκB易位到细胞核中，从而触发炎症基因的表达，上调IL-1、IL-6和TNF-α。此外，TAK1激活也导致转录因子AP1依赖于MAPK的激活。Thαβ免疫反应THαβ免疫是宿主针对病毒和朊病毒等传染性分子的免疫反应，涉及NK1细胞、分泌IL-10的CD4 T细胞、iNKT10细胞、CD8 T细胞和IgG1 B细胞。BiomedicinesTHαβ 免疫与2型抗体依赖性细胞毒性超敏反应有关。涉及THαβ免疫通路的自身免疫性疾病包括Graves病、重症肌无力和系统性红斑狼疮等。关键TLR：TLR3、TLR7和TLR9TLR3、TLR7和TLR9主要在浆细胞样树突状细胞的内体区室中表达，内体区室为病毒和 TLR 之间的相互作用提供了理想的环境。TLR3可识别病毒复制过程中产生的dsRNA，而TLR7可检测该阶段也存在的ssRNA。TLR9则可识别在细菌和病毒基因组中未甲基化的CpG DNA。涉及TLR3、TLR7和TLR9的信号通路汇聚在IRF3和IRF7上，启动下游1型IFN信号通路，从而启动THαβ免疫应答。激活后，TLR3直接触发TRIF-IRF3信号通路，TLR7和TLR9激活IRAK1-IRF7信号通路。TRIF-IRF3信号通路触发涉及TRAF3、TBK1和IKKε的级联反应。另一方面，TLR7和TLR9激活MyD88通路，通过IRAK1进一步激活IKKα，在细胞核激活转录因子IRF7。IRF3和IRF7均能激活IFN-α和IFN-β的产生，从而启动THαβ免疫应答。此外，IL-27和IL-10也是驱动细胞因子之一。小结TLR不仅可以通过拮抗剂来治疗自身免疫性疾病，在其他领域也有应用。例如TLR激动剂可用于触发宿主对癌症的免疫反应，诱导癌细胞凋亡，从而作为肿瘤治疗的辅助药物。在疫苗开发中，配方里增加TLR激动剂也可以加强疫苗对致病原的效力。参考文献：1.Chu, Y.-T.; Liao, M.-T.; Tsai, K.-W.; Lu, K.-C.; Hu, W.-C. Interplay of Chemokines Receptors, Toll-like Receptors, and Host Immunological Pathways. Biomedicines 2023, 11, 2384. https://doi.org/10.3390/biomedicines110923842.Jang YH, Choi JK, et al.House Dust Mite Increases pro-Th2 Cytokines IL-25 and IL-33 via the Activation of TLR1/6 Signaling. J Invest Dermatol. 2017 Nov;137(11):2354-2361. doi: 10.1016/j.jid.2017.03.042.

免疫疗法临床1期

2023-02-19

·生物制药小编

天然免疫核心STING的作用基础

cGAS–STING通路是一种进化上保守的免疫信号通路，对微生物防御至关重要（STING：天然免疫新核心，免疫治疗新靶点）。与其他主要依赖于固定信号事件的先天免疫途径不同，STING在细胞中具有高度的流动性，流动性异常与神经退行性疾病等相关。STINGSTING是一种跨膜蛋白，以二聚体的形式存在于内质网上，其CDN结合结构域面对细胞质。在配体结合之前，每个STING单体的连接区域被交叉，配体结合结构域位于各自的跨膜结构域的另一侧。cGAMP的结合诱导了连接体区域的结构重排，其中配体结合结构域被旋转到与跨膜结构域平行。这种旋转被认为是STING激活和内质网通过COPII囊泡离开的关键。然后STING易位到内质网中间室（ERGIC）和高尔基体，在那里它招募激酶TBK1，它磷酸化STING本身和转录因子IRF3。磷酸化的IRF3易位到细胞核，启动IFN-I基因和ISGs的转录。此外，在这一过程中，STING激活了其他IFN非依赖的信号通路，分子细节未知。STING囊泡然后退出反式高尔基网络（TGN），继续前往核内体和溶酶体，在那里，STING囊泡最终被降解以终止信号传导。STING转运三步1. STING在内质网上STING不包含将其引导到内质网的信号序列，但为什么STING定位于内质网，并保持在内质网?帮助内质网保持STING的过程包括Ca2+传感器基质相互作用分子1（STIM1）和逆行COPII囊泡运输。STIM1通过钙通道控制Ca2+进入内质网，这在淋巴细胞的激活和增殖中至关重要。STIM1也通过直接绑定STING的ER保留因子。使用2,3-cGAMP的刺激会破坏这种相互作用，从而允许STING内质网退出。STIM1的缺失从内质网释放出STING，导致tonic IFN-I信号。所以STIM1缺陷的患者同时出现淋巴细胞减少（由于淋巴细胞中的钙通量缺陷）和自身免疫病。高尔基体-内质网逆行穿梭也起着重要作用。STING不是简单地固定在静息状态下的内质网上；相反，它通过分泌途径不断移动。内质网保留因素和逆行穿梭的结合可能建立了STING内质网定位的“表象”。此外，还有其他的辅助因子负责调节内质网上的STING蛋白水平，包括toll相互作用蛋白（TOLLIP）、E3泛素连接酶三部分基序蛋白30α（TRIM30α）和PTPN1/ 2，它们分别调节稳态下STING的溶酶体和蛋白酶体降解。2. 从内质网转移至高尔基体配体结合后，STING开始从内质网易位到高尔基体，这个过程需要COPII囊泡的组装。Sar1、Sec13、和Sec31的丢失阻止了STING配体结合时离开内质网，并减弱了STING信号。除了经典的COPII囊泡装置外，内质网上的其他一些蛋白质和复合物对STING从内质网到高尔基体的运输也很重要。在没有转位子复合物成分TRAPβ的情况下，配体诱导的STING运输被阻止。内质网蛋白iRhom2促进TRAPβ和STING的相互作用。与TRAPβ缺陷类似，iRhom2的丢失也会阻止STING从ER离开。由于TRAPβ和iRhom2不影响COPII装置的蛋白质运输，它们可能调节内质网的横向移动，以到达ER出口位点。一旦STING到达高尔基体，就会引发一系列的生化事件：(1)通过CTT招募TBK1；(2) TBK1磷酸化STING（丝氨酸366）和自身；(3)STING使IRF3聚合并招募到ILxIS基序，TBK1磷酸化IRF3；(4) p-IRF3二聚并易位到细胞核以开启免疫基因表达。除了磷酸化，其他翻译后修饰对高尔基体上的刺信号至关重要。例如，STING在半胱氨酸88和91处被顺式高尔基体定位的酰基转移酶DHC3/7/15棕榈酰化。用硝基呋喃衍生物C-178、C-179和H-151阻断刺棕榈酰化，可以防止STING寡聚和信号体组装。多种蛋白（AMFR、INSIG1、ZDHHC1、RNF26、TRIM32和TRIM56）对STING的泛素化对高尔基体的信号转导也很重要。此外，一些蛋白质辅助因子直接或间接地促进高尔基体上刺信号体的形成。S6K和SREBP裂解激活蛋白（SCAP）促进IRF3招募到STING-TBK1。而核心自噬蛋白ATG9a在膜扩张中负调控STING-TBK1复合物的形式和下游IFN信号传导，蛋白磷酸酶Mg2+/Mn2+依赖的1a和蛋白磷酸酶6催化亚基通过去磷酸化抑制信号传导。IFN-高尔基体易位也是抑制独立活性所必需的。例如，STING介导的NF-κB信号通路需要TBK1与高尔基体上的刺c端结合，但不需要STING磷酸化。STING介导的自噬需要STING从内质网转移到ER-GIC，这是自噬膜的一个已知来源。STING介导的UPR和细胞死亡需要STING从内质网退出。有趣的是，STING介导的UPR和自噬活性都被定位到相同的基序上（一个包含氨基酸322-343的α-螺旋），这表明这两种活性可能依赖于一个尚未确定的共同过程。STING内质网单独退出（在到达ERGIC或高尔基体之前）是否诱导任何细胞信号也不清楚。3. 后高尔基体穿梭和溶酶体降解虽然有许多已知的STING辅助因子在内质网到高尔基体阶段起作用，但已知的高尔基体后STING转运的辅助因子要少得多。后高尔基体的STING运输减弱了IFN信号。因此，这些辅助因子的功能缺失将延长STING信号。一旦STING在高尔基体上被磷酸化，STING降解的过程就开始了。适配器蛋白复合物1（AP-1）结合一个双亮氨酸基序以及在STING CTT结构域磷酸化的S366残基。然后，AP-1将磷酸化的STING分类到clathrin蛋白包被的囊泡中，运输到内溶酶体。AP-1的抑制增强了STING信号。STING高尔基体出口也需要反式高尔基GRIP和包含蛋白2的螺旋-螺旋结构域2（GCC2/ GCC185）。GCC2属于TGN上的Golgin蛋白家族，通过APs将囊泡转移到RAB GTPases。TGN是一个主要的分拣枢纽，在这里各类物质被分类到各种运输工具，以贩运到细胞的不同区室)。一旦STING到达核内体，它再次被UBE2N泛素化。HGS、VPS37A、UBAP1、Tsg101和Vps4是STING辅助因子。C9ORF72和UNC93B1也能促进STING溶酶体降解，尽管分子细节仍有待确定。STING还驱动非经典的自噬，这可能有助于其自身被自噬小体降解。目前还不清楚STING囊泡是与溶酶体融合还是被溶酶体吞噬，以及膜拓扑结构在每种情况下是如何工作的。参考资料Chu, T.-T., X. Tu, K. Yang, J. Wu, J.J. Repa, and N. Yan. 2021. Tonic primeboost of STING signalling mediates Niemann-Pick disease type C. Nature. 596:570–57Decout, A., J.D. Katz, S. Venkatraman, and A. Ablasser. 2021. The cGAS-STING pathway as a therapeutic target in inflammatory diseases. Nat. Rev. Immunol. 21:548–569

免疫疗法