生物序列

轻松搞定工作中序列信息的储存、分析和管理

2023-07-19
阅读时长 3分钟

在生物技术领域的日常研发工作中会和大量的生物序列信息接触,不仅有自己设计创新的序列,还包含从专利文献搜索到的具有参考意义的序列。由于生物序列的特殊性,需要借助相关工具才能进行深入分析获取相关的技术信息,所以管理工作中涉及的生物序列并对其进行搜索分析是研究人员的一个痛点。

对于生物序列检索,智慧芽推出Bio生物序列库产品,涵盖7.1亿+序列和6.5亿+专利与序列关系数据,支持抗体CDRs片段、Motif、序列片段等多种特定场景搜素入口、多维度序列信息筛选方式,可以助力研发人员一键获取序列信息,有效降低研发成本、规避研发风险。

下面给大家介绍Bio生物序列库新发布的序列管理平台几个重要功能,通过它轻松搞定工作中序列信息的储存、分析和管理。

生物序列储存

序列管理平台和Bio生物序列库及专利数据库完美打通。Bio收录了全球专利以及各大生物信息中心公开的的生物序列信息。用户在Bio中通过相似序列、基因、靶点、药物检索后获取的生物序列都能快速保存到序列管理平台中,并支持对序列功能的自定义注释。基于此,用户在检索和阅读过程中获取的关键序列,就能快速储存并记录序列描述信息,以便后续进行序列分析。针对用户本地的序列,Bio提供了序列上传入口,可以通过FASTA文件、序列ID、输入框等方式上传,上传后系统能快速判断是否为专利公开序列,并合并相同序列信息。这样通过统一的平台保存所有的序列信息,而且序列专利文献信息实时同步,就不用线下再通过Excel表格去保存大量序列并花费大量时间去维护了。

图形用户界面, 文本, 应用程序, 电子邮件

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序列自定义比对分析

序列比对是研发和IP人员进行序列信息分析的常用方法,序列管理平台支持用户针对平台内保存的序列进行自定义比对分析,获取对应的比对报告结果。并根据不同的需求选择对应的序列比对方式如:多序列比对分析、双序列局部比对、双序列全局比对、双序列半全局比对等,再通过自定义的比对高亮方式,快速定位序列的差异位点和保守片段,了解多条比对序列之间的关系。比如在以下场景,IP人员去分析创新序列和专利要求序列的同一性,可以通过全局比对算法去获取精准的相似度数值;研发人员比对文献中披露的创新序列与野生型的差异,去挖掘序列可创新位点等;序列管理平台提供了足够的灵活性帮助用户进行序列比对分析。

序列多文件项目管理

在生物企业创新过程中,会涉及很多的项目和管线,并且会涉及到多人协同工作。序列管理平台不仅支持多重文件夹子文件夹设置,还可以支持文件夹搜索,转移和定位等功能。这样用户可以根据实际场景,对不同项目或管线的生物序列分别进行存储,同时序列所涉及的专利文献都可以统一进行保存。多个序列文件夹进行逻辑(交并非)集合并,快速找到多个文件夹中的共有序列和差集序列,序列管理平台还具有分享功能,将你和其他工作伙伴的信息进行打通,更加方便的进行协同办公,提高效率。

用户保存的大量序列数据,如何快速搜索到符合条件的目标序列是用户本地序列管理的面临的最大问题。平台提供基于序列描述的关键词检索、序列比对算法(Blast , motif)检索、序列类型特征检索,在大量的序列文件中快速搜索到目标序列,进行后续工作。同时序列管理平台和Bio生物序列库打通,一键就能搜索序列的专利和文献信息,直接获取序列公开的技术信息。

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