本月精选 40 篇01:赵文婧/唐啸宇/牟相宇等Nature:拟杆菌如何保护心血管?关键代谢物被锁定02:广州实验室熊小哲团队Nature:锁定肠菌毒素元凶,揭示早产儿致命肠炎新机制03:Nature:抗生素治疗期间吃甜食,肠道菌群"伤上加伤"04:Nature:消失的肠道微生物,曾伴随史前人类全球迁徙05:Nature:几顿"坏"饮食足以恶化急性炎症,加剧顽固炎症记忆06:上海六院贾伟/李梦慈等Cell:为何女性肝脏更受保护?揭示肠道菌群与胆汁酸的关键作用07:Cell:饮食与肠道菌群如何引爆免疫治疗毒性08:Cell:红肉致炎新机制,左旋肉碱激活巨噬细胞Pyrin炎症小体09:Cell:二甲双胍减重,肠道转运体MCT6为何是关键?10:Science:为什么打疫苗容易发烧?肠道藏答案11:Science:母亲产后补充营养,婴儿究竟能吸收多少?12:Science:一组振荡的蛋白信号,如何指挥小肠细胞分化?13:Lancet:双免疫治疗助力,dMMR结肠癌患者实现五年100%生存14:Lancet:晚期大肠癌化疗做减法,减毒不减效15:NEJM:2期结果出炉,溃疡性结肠炎首款口服IL-23受体拮抗肽效果如何?16:NEJM:幽门螺杆菌防治,从经验用药到精准管理(综述)17:Nature Reviews:从母乳到衰老,双歧杆菌如何塑造人体健康?(综述)18:Nature Reviews:肠易激综合征全景解析,从肠脑轴机制到精准诊疗(综述)19:人类微生物组与慢病研究转化的十大战略优先事项20:港中大张翔团队Cell Metab:脂肪肝癌变新推手,真菌代谢物如何促癌?21:南中医王荣团队Cell Metab:携带代谢记忆的巨噬细胞,驱动肠→肝炎症传递22:浙大吕志民团队Cell Metab:菌群代谢物丙酸盐,让癌细胞乖乖举起免疫"通缉令"23:上海交大贺兼理/周金安等Immunity:一种肠道免疫细胞失灵,让致胖菌群失控24:江南大学孙嘉/潘礼龙等:一类特殊的大肠杆菌,推动慢性胰腺炎走向纤维化25:为何肠炎易致食物不耐受?微生态干预有望破解26:膳食纤维通过菌群-牛磺酸途径,促进IBD肠黏膜修复27:GUT:基因决定易感而肠道决定发病,脂肪肝干预新思路28:脂肪肝初显,肠道菌群已拉响警报29:吉林大学曹永国/屈琳凯等Cell子刊:AKK菌产酪醇,抵御子宫内膜炎30:匡正团队Cell子刊:肠菌如何踩准"饭点"调控宿主代谢节律?锁定关键分子与表观机制31:华西医院马学磊/江雨婷等Cell子刊:抑制巨噬细胞胞葬,Akk助冷肿瘤免疫转热32:上海药物所甘勇/潘超等Cell子刊:同步调控菌群与宿主的色氨酸代谢,纳米新药重塑抗癌免疫33:Cell子刊:从肠道定植到跨宿主传播,共生菌的快速适应性进化34:Cell子刊:从破坏屏障到DNA损伤,一种口腔菌如何促肠癌?35:Cell子刊:肠道菌如何利用胆汁酸代谢阻止耐药肠球菌定植?36:Cell子刊:菌群如何塑造胆汁酸谱影响肠道健康?(综述)37:中科院亚热带生态所周锡红/胡竑等:丁酸梭菌投递小RNA,抑制肠道脂肪吸收38:仁济医院洪洁团队Nature子刊:两种"坏"菌互作驱动持久肠道动力障碍,益生菌或可破局39:Nature子刊:肠杆菌与膳食纤维协同决定肠道优势菌群40:Nature子刊:无关菌群,抗生素可直接重塑肠道免疫节律该篇日报由R·base创作生成,人工审核校对。赵文婧/唐啸宇/牟相宇等Nature:拟杆菌如何保护心血管?关键代谢物被锁定Nature——[56.1]① 研究背景与设计:针对拟杆菌属减少与动脉粥样硬化相关但分子机制不明的问题,结合宏基因组分析、Apoe−/−小鼠模型与活性导向分离,解析单形拟杆菌的抗动脉粥样硬化机制。② 核心发现与意义:拟杆菌门来源的奇数链脂肪酸十五烷酸(PA)直接抑制HMG-CoA还原酶(HMGCR),经肠-肝轴重塑宿主胆固醇代谢,为菌群-代谢轴干预心血管疾病提供分子靶点。③ 锁定关键肠菌:队列分析鉴定出单形拟杆菌等心血管健康相关肠菌,高脂饮食Apoe−/−小鼠灌胃该菌12周,主动脉斑块、总胆固醇与LDL-C显著降低,巨噬细胞浸润减少,HDL-C不变。④ 宿主通路定位:肝脏游离胆固醇与新生固醇合成下降,激活SREBP2并上调Ldlr;肝细胞特异性敲除Ldlr后保护作用完全消失。⑤ 效应分子鉴定:热灭活菌无保护作用,采用活性导向分离方法从细菌培养上清中鉴定出效应分子PA,其单独补充使小鼠斑块负荷降低约50%并改善血脂。⑥ 直接靶点解析:表面等离子体共振与等温滴定量热证实PA直接结合HMGCR,酶动力学显示其以竞争性方式抑制该酶。⑦ 菌群来源与人群关联:敲除单形拟杆菌mutA或pta使其PA合成能力与保护作用同步减弱,100株菌筛查显示该能力集中于拟杆菌门;血脂异常者粪便与血清PA显著降低。原文信息 ▼A gut microbial odd-chain fatty acid alleviates atherosclerosis in mice2026-10-07 , doi: 10.1038/s41586-026-11142-x广州实验室熊小哲团队Nature:锁定肠菌毒素元凶,揭示早产儿致命肠炎新机制Nature——[56.1]① 研究背景与设计:针对早产儿坏死性小肠结肠炎及其并发脑损伤机制不明的问题,利用临床队列测序、CRISPR筛选及条件敲除小鼠模型探究了肠道菌源毒素的致病作用。② 核心发现与意义:产Delta毒素的产气荚膜梭菌是驱动严重坏死性小肠结肠炎的关键病原体,其通过靶向巨噬细胞引发全身炎症与脑损伤,为阻断多器官衰竭提供了精准干预靶点。③ 病理表型特征:在临床样本及动物感染模型中,Delta毒素阳性产气荚膜梭菌定植显著导致系统性凝血功能障碍、肠黏膜坏死、血脑屏障破坏及脑室扩大。④ 细胞毒理机制:Delta毒素优先靶向宿主巨噬细胞,通过诱导K+外流强烈激活NLRP3-Caspase-1-GSDMD焦亡通路,触发级联神经炎症风暴。⑤ 关键受体鉴定:全基因组CRISPR-Cas9筛选结合结构域突变分析锁定四跨膜蛋白CD9,其胞外结构域2决定了Delta毒素的特异性细胞结合与致死毒性。⑥ 体内干预验证:髓系或全身敲除Cd9基因以及施用抗Delta毒素中和单克隆抗体,均显著阻断了毒素介导的巨噬细胞耗竭并完全保护小鼠免受致命性多器官衰竭。原文信息 ▼Clostridium perfringens Delta toxin targets CD9 to drive NEC and brain injury2026-10-28 , doi: 10.1038/s41586-026-11211-1Nature:抗生素治疗期间吃甜食,肠道菌群"伤上加伤"Nature——[56.1]① 研究背景与设计:针对造血细胞移植患者肠道菌群失调问题,整合173例患者的高精度膳食记录与1009份纵向粪便样本,并建立小鼠抗生素干预模型进行验证。② 核心发现与意义:膳食简单糖与广谱抗生素暴露显著相关并伴随肠道菌群α多样性丧失及肠球菌扩张,提示在抗生素治疗期间限制糖摄入可能减轻菌群破坏。③ 人群关联分析:贝叶斯推断模型显示,广谱抗生素暴露期间每增加100 g甜食摄入,粪便菌群α多样性额外显著降低24.1%,且伴随屎肠球菌丰度显著升高。④ 动物模型验证:在碳青霉烯类抗生素处理的小鼠模型中,补充蔗糖驱动内源性肠球菌扩增峰值显著提高16.3倍,且该效应独立于膳食纤维。⑤ 机制特异性:葡萄糖与果糖干预可单独复现上述肠球菌扩张表型,但无菌小鼠单菌定植实验证实该糖类促生效应依赖于复杂的肠道菌群背景。⑥ 临床预后转归:临床生存分析揭示,在高糖摄入的患者群体中,广谱抗生素暴露时间延长与死亡率升高显著相关。原文信息 ▼Sugar-rich foods exacerbate antibiotic-induced microbiome disruption2026-09-30 , doi: 10.1038/s41586-026-11077-3Nature:消失的肠道微生物,曾伴随史前人类全球迁徙Nature——[56.1]① 研究背景与设计:针对肠道微生物共进化历史难以解析的问题,对玻利维亚提斯曼人与坦桑尼亚哈扎人两个非工业化人群的粪便样本开展深度宏基因组测序。② 核心发现与意义:跨越地理隔离的人群共享大量在工业化社会中消失的肠道微生物,其遗传分化与史前人类全球迁徙时间线吻合,提示核心微生物组伴随人类存续超万年。③ 物种共享特征:两独立人群共享1231种微生物,其中60.2%在工业化人群中罕见或缺失,符合工业化易消失类群特征,少数如嗜黏蛋白阿克曼氏菌呈现跨人群近期株系共享。④ 遗传隔离证据:共享物种的平均核苷酸一致性约为98%,提示共同祖先距今约10万至20万年,且85.6%的物种无跨人群近期株系传播证据。⑤ 基因流时间推断:同义位点最长相同DNA片段分析推测,两人群微生物种群间的基因流在约1.7万年前显著减弱,远早于工业化人群间的隔离时间。原文信息 ▼Prehistoric global migration of vanishing gut microbes with humans2026-10-07 , doi: 10.1038/s41586-026-11106-1Nature:几顿"坏"饮食足以恶化急性炎症,加剧顽固炎症记忆Nature——[56.1]① 背景与核心设计:短暂高脂饮食(HFD)对组织免疫记忆的重塑机制,通过咪喹莫特诱导的小鼠皮肤炎症模型结合单细胞多组学及基因敲除得到解析。② 总体概述:疾病起始期短暂的HFD暴露足以驱动持久的组织特异性炎症记忆,特定时间窗内的代谢状态决定了长期的免疫轨迹。③ 关键时间窗 :仅在疾病起始前后4天内给予HFD显著加剧炎症,而在此窗口期外给予HFD或将肥胖小鼠切换为低脂饮食则完全阻断该效应。④ 中性粒细胞招募:HFD快速驱动皮肤中性粒细胞富集并特异性高表达Nlrp3与Il1b,耗竭中性粒细胞或敲除Nlrp3均消除HFD诱导的炎症放大。⑤ 炎症放大机制: NLRP3依赖的IL-1β成熟驱动CD4+T细胞显著上调IL-1 R1,T细胞特异性敲除Il1r1完全阻断HFD介导的辅助性T细胞17型活化。⑥ 表观遗传重编程:恢复期皮肤 中CD4+组织驻留记忆T细胞数量增加2.3倍,其Il1r 1与Il23r位点染色质开放度显著增强。⑦ 组织固有记忆:既往HFD暴露的炎症皮肤移植至正常小鼠后,对二次刺激仍呈现CD 4+T细胞依赖的强化复发。原文信息 ▼Diet at disease onset determines tissue inflammatory memory2026-10-28 , doi: 10.1038/s41586-026-11181-4上海六院贾伟/李梦慈等Cell:为何女性肝脏更受保护?揭示肠道菌群与胆汁酸的关键作用Cell——[45.1]① 背景与设计:针对女性对慢性肝病天然保护机制不明的问题,整合9254人代谢组及多队列宏基因组与小鼠模型解析了性二态性肝保护通路。② 核心发现与意义:雌激素重塑肠道微环境富集特定菌群并驱动异熊去氧胆酸(isoUDCA)生成,后者通过SREBP2-STARD4-CYP7B1轴重编程肝胆固醇代谢以缓解疾病。③ 人群队列关联:isoUDCA在女性中显著富集,中介分析显示其可解释约19.57%的女性肝脏保护效应。④ 上游菌群调控:肠类器官及小鼠模型证实,雌激素通过上调Muc2表达塑造黏液微环境,驱动具备完整酶系的六菌种女性保护菌群(FPBC)定植。⑤ 干预效果:将FPBC移植给雄性疾病小鼠可显著升高肝脏isoUDCA水平并改善脂肪变性与纤维化,直接补充isoUDCA同样具有保护功效。⑥ 下游分子机制:isoUDCA驱动SREBP2核转位及Stard4表达,以增强胆固醇向内质网转运,从而支持CYP7B1介导的非12α-羟基化胆汁酸合成。原文信息 ▼A microbiome-bile acid axis mediates protection from chronic liver disease in females2026-10-19 , doi: 10.1016/j.cell.2026.09.048Cell:饮食与肠道菌群如何引爆免疫治疗毒性Cell——[45.1]① 背景与设计:针对免疫检查点阻断引发免疫相关不良事件机制不明的问题,构建了由西方饮食诱导的易感性小鼠模型并结合单细胞多组学及人类患者数据进行解析。② 总体概述:饮食与肠道菌群改变通过驱动干扰素-γ依赖的调节性T细胞脆弱性及细胞毒性组织驻留T细胞应答,决定了多器官免疫毒性的发生,提示靶向该细胞稳定性可解耦毒性与疗效。③ 微生物与代谢:西方饮食导致嗜黏蛋白阿克曼氏菌过度增殖及结肠黏液层变薄,并伴随血清中植物源性代谢物棉子糖及柠檬酸水平显著降低。④ 免疫微环境重塑:受累组织中细胞毒性CD8+组织驻留记忆T细胞显著扩增,且调节性T细胞呈现Foxp3表达下调及干扰素-γ高表达的脆弱性表型,该表型在人类结肠炎患者中高度保守。⑤ 因果机制验证:在调节性T细胞中特异性敲除Ifng或Ifngr1显著恢复了谱系稳定性,导致细胞毒性T细胞浸润减少并缓解多器官炎症,且未损害抗肿瘤免疫。⑥ 干预策略:膳食回切、棉子糖补充或健康供体粪菌移植均显著逆转调节性T细胞脆弱性并减轻炎症。原文信息 ▼Lifestyle-induced regulatory T cell fragility primes adverse events after immune checkpoint blockade2026-10-22 , doi: 10.1016/j.cell.2026.09.055Cell:红肉致炎新机制,左旋肉碱激活巨噬细胞Pyrin炎症小体Cell——[45.1]① 研究背景与设计:针对红肉摄入及肌肉损伤驱动慢性炎症的机制不明问题,利用内毒素血症与横纹肌溶解小鼠模型及人源巨噬细胞,解析了左旋肉碱的促炎通路。② 核心发现与意义:左旋肉碱经OCTN2转运入巨噬细胞后通过抑制甲羟戊酸通路激活Pyrin炎症小体,提示其为饮食与组织损伤双重来源的代谢性危险信号及潜在抗炎靶点。③ 脓毒症表型:脓毒症小鼠血浆左旋肉碱呈适应性下降,外源补充左旋肉碱显著加剧脂多糖诱导的IL-1β与IL-17a分泌并导致依赖于IL-1β的死亡率上升。④ 炎性小体鉴定:基因敲除证实,左旋肉碱触发巨噬细胞发生依赖于caspase-1、ASC与GSDMD的经典炎症小体活化,且该过程不依赖NLRP3等其他传感器。⑤ 代谢重编程机制:转录组学与代谢拯救实验揭示,左旋肉碱显著抑制甲羟戊酸合成从而导致RhoA失活,最终驱动Pyrin去磷酸化及炎症小体组装。⑥ 转运体依赖性:髓系特异性敲除Slc22a5证实,高亲和力转运体OCTN2是左旋肉碱进入巨噬细胞并诱导Pyrin活化及全身性炎症的必需条件。⑦ 病理泛化验证:在横纹肌溶解模型中,坏死肌细胞释放的内源性左旋肉碱同样依赖OCTN2与Pyrin驱动全身性炎症与致死性病理损伤。原文信息 ▼The pyrin inflammasome senses OCTN2-mediated uptake of extracellular ʟ-carnitine from muscle injury or ingestion2026-10-19 , doi: 10.1016/j.cell.2026.09.015Cell:二甲双胍减重,肠道转运体MCT6为何是关键?Cell——[45.1]① 研究背景与设计:针对N-乳酰苯丙氨酸(Lac-Phe)系统性作用依赖其肠道释放机制不明的问题,结合单细胞筛选、基因敲除小鼠及体外转运验证,鉴定MCT6为关键出口转运体。② 核心发现与意义:MCT6介导肠道Lac-Phe入血,构成二甲双胍减重效应的必要环节;揭示代谢物“释放”本身是可靶向的遗传调控节点。③ 转运功能验证:Slc16a5过表达显著提升细胞培养基Lac-Phe水平并降低胞内浓度,而敲除则产生相反效应,且不改变乳酸或苯丙氨酸稳态。④ 体内生理作用:Slc16a5−/−小鼠基础及二甲双胍刺激后血Lac-Phe均显著降低,且对二甲双胍诱导的体重下降产生抵抗。⑤ 组织特异性定位:肠道上皮特异性Slc16a5敲除足以复现全身敲除表型,证实其作用定位于肠道。⑥ 机制挽救:外源给予Lac-Phe完全恢复Slc16a5−/−小鼠对二甲双胍的减重反应,确立Lac-Phe缺乏为表型主因。⑦ 底物特异性:MCT6亦转运Lac-Tyr与Lac-Trp等N-乳酰氨基酸,但仅Lac-Phe具有抑制摄食与体重的生物学活性。原文信息 ▼MCT6 is an intestinal Lac-Phe exporter required for metformin-associated weight loss2026-10-22 , doi: 10.1016/j.cell.2026.09.058Science:为什么打疫苗容易发烧?肠道藏答案Science——[47.3]① 研究背景与设计:针对mRNA疫苗接种后发热反应个体差异大且机制不明的问题,整合171名健康成人纵向温度监测、多组学分析与无菌小鼠粪菌移植模型展开研究。② 核心发现与意义:肠道菌群通过持续高产鞭毛蛋白预致敏宿主先天免疫系统并驱动疫苗诱导的系统性炎症反应,通过饮食干预微生物免疫轴或可减轻疫苗不良反应。③ 人群特征关联:高发热个体基线伴随慢性低度肠道炎症,其肠道菌群显著富集毛螺菌科(特别是Waltera属)并高表达Toll样受体5(TLR5)激动型鞭毛蛋白。④ 饮食调控机制:体外培养及小鼠模型证实,羧甲基纤维素及西式饮食显著促进Waltera生长与鞭毛蛋白产量,并加剧小鼠疫苗接种后的体温下降与IL-6升高。⑤ 免疫致敏验证:高发热者粪便上清液显著激活人结肠类器官TLR5通路并诱导IL-8分泌,将其菌群移植给无菌小鼠后显著加剧疫苗反应且该效应部分依赖于TLR5与NLRC4受体。⑥ 代谢健康特征:观察性队列数据显示,高发热风险与植物性饮食习惯负相关,并伴随血清载脂蛋白E及乙基亚麻酸酯等代谢与炎症标志物的显著升高。原文信息 ▼The human gut microbiome primes fever after vaccination2026-10-08 , doi: 10.1126/science.aea7733Science:母亲产后补充营养,婴儿究竟能吸收多少?Science——[47.3]① 研究背景与设计:针对哺乳期干预对人乳成分影响不明的问题,采用多组学平台评估三国随机对照试验中产后平衡能量蛋白质(BEP)或烟酰胺补充的效应。② 核心发现与意义:产后营养干预特异性驱动人乳B族维生素增加并重塑脂质与蛋白质组,而宏量营养素、HMOs、生物活性蛋白及微生物组保持生理缓冲,为哺乳期营养补充提供了跨人群证据。③ 微量营养素响应:靶向代谢组学证实,干预导致B族维生素显著升高,其中烟酰胺补充使总维生素B3大幅增加183.7%。④ 宏量营养素与表型:除营养不良队列早期总能量短暂升高11.6%并驱动婴儿生长改善外,多数场景下宏量营养素及微生物组保持生理稳态。⑤ 脂质组学重编程:脂质组学分析揭示,干预驱动甘油三酯谱偏移,富含α-亚麻酸与γ-亚麻酸的多不饱和脂肪酸物种显著增加。⑥ 细胞内蛋白下调:非靶向蛋白质组学证实,干预导致糖酵解、分子伴侣及核糖体相关等细胞内蛋白丰度显著降低。⑦ 跨组织一致性:配对样本分析显示,母血、乳汁与婴儿血中特定代谢物变化方向一致,提示干预可能通过乳汁介导跨代传递。原文信息 ▼Nutritional interventions' impacts on human milk: Three trials in low-resource settings2026-10-08 , doi: 10.1126/science.aee9284Science:一组振荡的蛋白信号,如何指挥小肠细胞分化?Science——[47.3]① 背景与实验设计:针对小肠细胞谱系比例精确平衡调控机制不明的问题,基于Hes1-Achilles报告小鼠与类器官结合活体成像及微流控脉冲技术解析Hes1振荡动力学。② 核心发现与意义:证实Notch下游转录抑制因子Hes1振荡频率直接编码细胞分化指令,快慢周期指导特定谱系生成,揭示频率编码是维持组织细胞比例平衡的核心调控层。③ 空间振荡梯度:隐窝基底部细胞呈现约90分钟快速振荡,沿隐窝-绒毛轴分化渐进延长至约170分钟,该周期梯度受Notch与Wnt信号强度及细胞周期S期共同调控。④ 谱系命运驱动:微流控强制同步至90分钟超昼夜周期显著增加Lgr5+干细胞与Lyz1+潘氏细胞数量,而130分钟周期特异性促进除潘氏细胞外的分泌细胞分化。⑤ 动力学独立性:频率依赖的谱系特异性调控独立于Hes1振幅及总体蛋白丰度的改变,确立了转录因子振荡周期本身所携带的指令性分化功能。原文信息 ▼Frequency encoding regulates cell type composition in the small intestine2026-10-15 , doi: 10.1126/science.adt1928Lancet:双免疫治疗助力,dMMR结肠癌患者实现五年100%生存Lancet——[109]① 研究背景与设计:针对局部进展期错配修复缺陷(dMMR)结肠癌的高复发风险,NICHE-2试验纳入111例可切除患者,评估单剂量伊匹木单抗联合双剂量纳武利尤单抗新辅助治疗的长期疗效。② 核心发现与意义:中位随访约5年,患者3年无病生存率与5年总生存率均达100%,确立了新辅助双免疫治疗诱导持久临床缓解的潜力。③ 病理与生存结局:治疗诱导了极高的病理响应,95%患者实现主要病理缓解,且无患者出现复发或死亡。④ ctDNA动态监测:治疗后ctDNA清除率显著,手术前清除率达82%,且术后微小残留病灶检测全员阴性。⑤ 临床关联性:术前ctDNA清除深度与病理缓解程度呈现梯度关联,支持将其作为评估治疗响应及预后预测的分子学标志物。原文信息 ▼Disease-free survival and overall survival after neoadjuvant immunotherapy in mismatch repair-deficient colon cancer in the Netherlands: results of the single-arm, multicentre, phase 2, NICHE-2 trial2026-10-21 , doi: 10.1016/S0140-6736(26)01602-8Lancet:晚期大肠癌化疗做减法,减毒不减效Lancet——[109]① 研究背景与设计:针对难治性转移性结直肠癌标准方案毒性负担重的问题,日本开展多中心实用性III期非劣效试验PRABITAS,在970例患者中随机比较简化14天与常规28天曲氟尿苷/替匹嘧啶复方药物(FTD–TPI)联合贝伐珠单抗方案。② 核心发现与意义:14天方案的总生存期非劣效于28天方案,且血液学及胃肠道毒性显著降低,确立了晚期结直肠癌更耐受的给药新标准。③ 总生存期非劣效:14天组中位总生存期为11.3个月,28天组为10.3个月,分层风险比为0.93且CI上限未超过1.25的预设界值。④ 疾病控制结局:两组中位无进展生存期均为3.9个月,疾病控制率分别为52.1%与46.6%。⑤ 毒性负荷降低:14天组≥3级中性粒细胞减少症发生率显著低于28天组(13% vs 39%),≥2级食欲减退(15% vs 26%)、恶心及腹泻发生率亦显著下降。⑥ 剂量强度与连续性:14天组需减量或延迟给药的比例显著更低,相对剂量强度由77.0%提升至82.7%,同时粒细胞集落刺激因子使用率显著降低。原文信息 ▼14-day versus 28-day trifluridine-tipiracil plus bevacizumab for refractory metastatic colorectal cancer (PRABITAS): a pragmatic, multicentre, open-label, randomised, phase 3, non-inferiority trial in Japan2026-10-24 , doi: 10.1016/S0140-6736(26)01782-4NEJM:2期结果出炉,溃疡性结肠炎首款口服IL-23受体拮抗肽效果如何?New England Journal of Medicine——[84.5]① 研究背景与设计:针对中重度活动性溃疡性结肠炎缺乏口服靶向生物通路的临床痛点,一项多中心、双盲IIb期随机对照试验评估了首创口服IL-23受体拮抗多肽icotrokinra在252例患者中的疗效与安全性。② 核心发现与意义:每日一次口服icotrokinra显著提高临床应答率并诱导黏膜内镜改善,安全性与安慰剂相当,证实了口服肽类精准阻断IL-23受体治疗炎症性肠病的可行性。③ 主要终点应答:治疗第12周,icotrokinra 400 mg、200 mg和100 mg组的临床应答率分别达到63%、58%和55%,均显著高于安慰剂组的27%。④ 多维临床获益:400 mg剂量组在第12周展现出显著优势,临床缓解率达30%(安慰剂组11%),症状缓解率达46%(安慰剂组19%),内镜改善率达37%(安慰剂组14%)。⑤ 安全性与耐受性:至第28周,各治疗组不良事件发生率(60%–66%)与安慰剂组(62%)相近,严重不良事件发生率低且未观察到严重感染及剂量依赖性毒性。原文信息 ▼Phase 2 Trial of Icotrokinra for Patients with Ulcerative Colitis2026-10-15 , doi: 10.1056/NEJMoa2604435NEJM:幽门螺杆菌防治,从经验用药到精准管理(综述)New England Journal of Medicine——[84.5]① 综述范畴:系统梳理幽门螺杆菌(H. pylori)感染机制、胃癌预防及治疗策略的全球进展。② 核心定位:H. pylori作为唯一I类细菌致癌物,根除治疗是预防胃癌的首选方案,防治核心在于传染病管理与抗菌药物精准管控。③ 致病机制:通过尿素酶中和胃酸并利用鞭毛定植,经脂质A修饰与O抗原伪装逃避免疫,联合VacA、CagA及HtrA等因子驱动上皮损伤与癌变。④ 筛查策略:主张高发区实施群体筛查,家庭联合检测是兼顾成本效益的关键策略,年轻群体根除治疗获益最高。⑤ 治疗演进:针对高耐药现状,淘汰传统三联疗法,推荐铋剂四联或高剂量双联疗法;提倡开展药敏试验,以优化个体化抗菌治疗。⑥ 未来方向:研发重点聚焦于P-CAB酸抑制优化、新型抗菌药物(如利福舒特尼唑)及针对免疫逃逸机制的糖缀合疫苗。原文信息 ▼Helicobacter pylori Infection - Advances, Challenges, and the Road Ahead2026-10-22 , doi: 10.1056/NEJMra2414530Nature Reviews:从母乳到衰老,双歧杆菌如何塑造人体健康?(综述)Nature Reviews Microbiology——[104.6]① 核心观点与全景概述:Bifidobacterium属作为人类肠道核心共生菌,通过代谢多能性、生态适应及宿主互作,在生命全周期内深刻塑造宿主的免疫、代谢与神经内分泌功能。② 生物地理与宿主适应:宿主特异性定植与饮食生态及垂直传播密切相关,不同宿主来源的菌株在碳水化合物降解及氨基酸代谢基因库上存在显著的适应性分化。③ 早期定植与代谢网络:母婴垂直传播与母乳寡糖(HMO)协同选择驱动婴儿期早期定植,不同菌种通过降解或摄取HMO形成交叉喂养网络,构建早期微生态基础。④ 肠道环境生存策略:肠道适应性依赖于特异性糖苷水解酶对宿主及植物聚糖的降解,并借助胞外多糖、菌毛及磷壁酸等表面结构抵抗应激并介导宿主黏附。⑤ 全生命周期免疫调控:早期通过产生吲哚-3-乳酸及乙酸激活芳香烃受体并促进调节性T细胞扩增,成年及老年期则通过强化上皮屏障及抑制促炎信号缓解炎性衰老。⑥ 临床标志物与转化前景:该菌属丰度降低与坏死性小肠结肠炎及炎症性肠病等风险相关,未来需整合多组学与人类中心模型,解析自然菌株多样性在精准微生态疗法中的转化潜力。原文信息 ▼Bifidobacteria: biogeography, host adaptation and ecological functions2026-09-28 , doi: 10.1038/s41579-026-01367-yNature Reviews:肠易激综合征全景解析,从肠脑轴机制到精准诊疗(综述)Nature Reviews Disease Primers——[79.8]① IBS全景与诊疗要点:肠易激综合征(IBS)是一类脑‑肠互动障碍,全球患病率约4–11%,女性多于男性,诊断采用基于症状的罗马V标准并有限排除器质性疾病。② 多重病理生理机制:IBS源于外周(胃肠动力异常、内脏高敏感、屏障功能障碍、神经免疫激活、微生物组与代谢物改变、胆酸失调)与中枢(脑网络重构、应激/自主神经失调)的交互失调,存在性别差异及感染后亚型。③ 阶梯式个体化管理:治疗以患者教育、生活方式调整为基础,依主要症状选择饮食(低FODMAP,需营养师指导)与药物(腹痛用解痉药(薄荷油)或三环类抗抑郁药,腹泻用利福昔明或5‑HT3拮抗剂,便秘用鸟苷酸环化酶C激动剂或氯通道激活剂),联合认知行为疗法(CBT)或肠道导向催眠疗法可改善整体症状。④ 生活质量与局限:IBS显著损害生活质量,病耻感加剧心理负担;现有治疗获益有限,需多组学整合、数字健康工具和精准医学以实现机制亚型分型和个体化治疗。⑤ 未来研究方向:应阐明病因异质性,发展纵向数字表型,完善性别特异性生物学,扩大对混合亚型及特殊人群的研究,并验证可推广的综合照护模式。原文信息 ▼Irritable bowel syndrome2026-10-01 , doi: 10.1038/s41572-026-00741-7Nat Med:人类微生物组与慢病研究转化的十大战略优先事项Nature Medicine——[52.5]① 战略定位:针对微生物组研究临床转化滞后的现状,美国HHS召集国际专家提出十大优先行动框架。② 核心路径:推动研究从关联描述向因果验证转型,通过宏转录组、宏蛋白组与代谢组整合,解析微生物的功能性影响。③ 基础设施构建:呼吁建立全球联合的计算平台与AI模型,打破跨国数据共享壁垒,弥补目前研究主要局限于高收入人群的通用性短板。④ 监管与创新转化:加速活体生物药(LBPs)与精准营养产品的监管审批,将微生物组相关终点纳入药物及食品毒理学评价体系。⑤ 关键应用窗口:聚焦生命最初1000天预防窗口,并以肠-脑轴为切入点,应对神经退行性疾病的全球性增长。⑥ 行业乱象与教育:警示缺乏循证支撑的商业化检测与补充剂,建议将抗生素管理与微生物组健康纳入医学教育及学校营养政策。原文信息 ▼The human microbiome and chronic disease: ten strategic priorities for research and public health2026-10-23 , doi: 10.1038/s41591-026-04730-x港中大张翔团队Cell Metab:脂肪肝癌变新推手,真菌代谢物如何促癌?Cell Metabolism——[37]① 研究背景与设计:针对MASLD向HCC进展机制不清的问题,整合小鼠多模型、人源细胞及三个人群队列系统解析肠道真菌的作用。② 核心发现与意义:机会致病真菌少根根霉(Rhizopus arrhizus)分泌犬尿喹啉酸(KYNA)直接结合肿瘤细胞IQGAP1蛋白从而驱动MAPK信号异常激活,揭示宿主-真菌代谢互作促癌新范式。③ 真菌富集与临床关联:宏基因组证实少根根霉丰度随疾病进程逐级升高且在小鼠模型及三个独立临床队列患者粪便中均显著富集。④ 促瘤效应验证:口服定植少根根霉显著加速小鼠自发及致癌物诱导的MASLD-HCC,伴随甲胎蛋白升高、肿瘤负荷增加及肝细胞增殖增强。⑤ 关键效应分子:代谢组学鉴定KYNA为真菌条件培养基及门静脉血中显著升高的小分子,外源KYNA完全复现其促增殖、抗凋亡及促瘤表型。⑥ 分子机制解析:KYNA直接结合胞浆IQGAP1(KD = 2.2 μM)并触发B-RAF/MEK/ERK磷酸化级联,该作用独立于AhR或GPR35受体。⑦ 靶向干预效果:IQGAP1敲除或特异性抑制剂QGGP完全阻断KYNA驱动的MAPK激活及肿瘤生长,证实该信号轴为可干预治疗靶点。原文信息 ▼Fungus Rhizopus arrhizus promotes MASLD-associated hepatocellular carcinoma through generating kynurenic acid2026-10-02 , doi: 10.1016/j.cmet.2026.09.005南中医王荣团队Cell Metab:携带代谢记忆的巨噬细胞,驱动肠→肝炎症传递Cell Metabolism——[37]① 研究背景与设计:针对溃疡性结肠炎(UC)缓解期仍易发代谢相关脂肪性肝病(MASLD)的现象,整合人结肠活检与小鼠两击模型及单细胞多组学绘制了免疫代谢图谱。② 核心发现与意义:UC缓解期持续存在的LCN2+巨噬细胞携带糖酵解与H3K9la表观疤痕,作为移动载体经门静脉迁移至肝脏从而放大高脂饮食诱导的MASLD,揭示了肠肝轴记忆传递新范式。③ 代谢表观记忆:UC缓解期结肠CD14+巨噬细胞持续高表达HK2与PKM2等酶并富集H3K9la,该修饰与Lcn2和Pkm基因启动子区染色质开放状态共存。④ 细胞迁移致病:高表达CCL3与CCR1的LCN2+巨噬细胞具备自分泌趋化能力并可迁移至肝脏,清除该亚群或阻断CCR1显著减轻了高脂饮食驱动的肝脂质沉积与炎症。⑤ 表观执行机制:BRG1直接结合H3K9la修饰的组蛋白H3并与CEBPB共定位于Lcn2启动子形成正反馈环,髓系特异性敲除Smarca4则阻断了该记忆并保护肝脏免受损伤。原文信息 ▼Histone lactylation scarring transmits metabolic and epigenetic memory across the gut-liver axis2026-10-07 , doi: 10.1016/j.cmet.2026.09.008浙大吕志民团队Cell Metab:菌群代谢物丙酸盐,让癌细胞乖乖举起免疫"通缉令"Cell Metabolism——[37]① 背景与模型:针对肿瘤抗原呈递机制,利用人癌细胞系、Panc02小鼠模型及临床队列评估短链脂肪酸对MHCI类蛋白稳定性的调控。② 核心发现与意义:丙酸盐以非代谢途径直接结合E3连接酶STUB1的TPR结构域,竞争性抑制MHC I泛素化降解,驱动CD8+ T细胞抗肿瘤免疫及抗PD-1疗效。③ 靶点鉴定:质谱鉴定STUB1为MHC I特异性E3连接酶,介导HLA-A K168/K170位点泛素化,丙酸盐干预显著阻断STUB1与MHC I互作。④ 结合机制:表面等离子体共振证实丙酸盐通过氢键直接结合STUB1K30/N34残基(KD=67.2 μM),K30A/N34A突变彻底消除该结合及功能。⑤ 免疫效应:丙酸盐干预显著上调肿瘤细胞表面MHC I表达,驱动CD8+ T细胞浸润与IFN-γ分泌,并依赖CD8+ T细胞抑制肿瘤生长。⑥ 遗传验证:小鼠Stub1 K31A/N35A或H-2Kb K165R/K167R突变消除丙酸盐效应,证实STUB1-MHC I轴为核心功能靶点。⑦ 临床转化:患者基线血浆丙酸盐水平与抗PD-1应答正相关,联合丙酸盐或嗜黏蛋白阿克曼菌显著增强抗PD-1疗效。原文信息 ▼Propionate promotes MHC class I antigen presentation and anti-tumor immunity2026-10-21 , doi: 10.1016/j.cmet.2026.09.018上海交大贺兼理/周金安等Immunity:一种肠道免疫细胞失灵,让致胖菌群失控Immunity——[30.6]① 背景与研究设计:利用T细胞特异性Flt1或Vegfb敲除小鼠及人类肥胖队列,结合多组学技术,解析肠道免疫与代谢稳态的调控网络。② 核心发现与意义:VEGF-B/VEGFR-1信号轴通过维持肠道滤泡辅助性T(Tfh)细胞干性来保障IgA免疫,其功能缺失将驱动特定肠道菌群扩增与牛磺酸耗竭并最终导致肥胖。③ Tfh细胞衰老机制:Flt1缺失显著削弱肠道Tfh细胞内的AKT-MDM2信号传导,直接导致p53依赖性的细胞衰老与增殖停滞,进而显著减少生发中心B细胞及肠道分泌型IgA水平 。④ 菌群与代谢因果链:IgA缺乏解除了对Taurinivorans的免疫监视,该菌的过度扩增显著耗竭了宿主肠道牛磺酸,进而抑制白色脂肪组织中AMPK介导的脂解与产热基因表达。⑤ 临床特征与干预:肥胖人群呈现Taurinivorans富集伴随IgA与牛磺酸降低,而口服人源IgA、补充牛磺酸或靶向激活Tfh细胞AKT信号均能显著逆转小鼠的菌群失调与肥胖表型。原文信息 ▼Growth factor VEGF-B sustains intestinal Tfh cell stemness to restrict Taurinivorans outgrowth and microbiota-driven obesity2026-10-29 , doi: 10.1016/j.immuni.2026.10.004江南大学孙嘉/潘礼龙等:一类特殊的大肠杆菌,推动慢性胰腺炎走向纤维化Gastroenterology——[29.7]① 研究背景与设计:针对慢性胰腺炎(CP)纤维化机制及肠道菌群因果作用不明的问题,整合多中心CP患者宏基因组、小鼠模型与巨噬细胞实验解析致病菌群机制。② 核心发现与意义:高表达HtpG大肠杆菌(HHEC)通过CD91-PRMT5-KLF4轴驱动巨噬细胞M2极化促胰腺纤维化,确立了菌源蛋白调控宿主表观遗传修饰的全新机制。③ 菌群特征与致病验证:宏基因组显示CP患者肠道显著富集HHEC且伴随HtpG升高,FimH阻断剂TAK018清除HHEC显著减轻小鼠纤维化,而回补患者分离株PS718逆转保护效应。④ 受体识别与表观靶点:菌源HtpG经巨噬细胞CD91受体诱导PRMT5上调,巨噬细胞特异性敲除Prmt5或药理学抑制均显著抑制M2极化并减轻胰腺纤维化。⑤ 分子互作机制:PRMT5催化KLF4发生R387/R389位点对称二甲基化,抑制其泛素化降解并维持蛋白稳定性,从而决定巨噬细胞致纤维化表型。⑥ 微生态干预转化:在Prmt5敲除小鼠中回补KLF4重新恢复胰腺纤维化病理,补充嗜粘蛋白阿克曼氏菌竞争性拮抗HHEC定植并显著改善CP病程。原文信息 ▼HtpG-High-Expressing Escherichia coli Promotes Fibrosis in Chronic Pancreatitis2026-10-12 , doi: 10.1053/j.gastro.2026.09.025Gastroenterology:为何肠炎易致食物不耐受?微生态干预有望破解Gastroenterology——[29.7]① 研究背景与设计:整合化学诱导肠炎小鼠模型、无菌小鼠菌群移植、益生菌干预及临床队列分析,探究炎症性肠病患者高发食物不耐受的微生物机制。② 核心发现与意义:肠道炎症通过破坏共生菌群对食物抗原的代谢降解能力,驱动结肠肥大细胞介导的IgE免疫反应,为干预食物不耐受提供了微生物靶点。③ 微生物代谢损伤:结肠炎显著降低小鼠粪菌α多样性并耗竭梭菌属与双歧杆菌属,伴随粪便降解β-乳球蛋白和β-酪蛋白能力显著下降。④ 因果验证:将炎症后小鼠粪菌移植至无菌小鼠,可复现食物致敏表型,导致结肠IgE升高、肥大细胞浸润增加及内脏高敏感。⑤ 益生菌干预:补充产孢梭菌或长双歧杆菌可恢复抗原降解能力,显著减轻肥大细胞脱颗粒、IgE产生及内脏疼痛。⑥ 临床队列关联:炎症性肠病患者自报食物不耐受率(克罗恩病85.3%,溃疡性结肠炎86.2%)显著高于健康对照(33.3%),且伴随粪菌多样性降低及抗原降解能力减弱。原文信息 ▼Gut inflammation favors adverse food reactions by disrupting the microbial metabolism of food triggers2026-10-07 , doi: 10.1053/j.gastro.2026.07.042Gastroenterology:膳食纤维通过菌群-牛磺酸途径,促进IBD肠黏膜修复Gastroenterology——[29.7]① 研究背景与设计:针对膳食纤维促进黏膜修复机制不明的问题,利用小鼠肠炎模型与溃疡性结肠炎患者粪菌移植随机对照试验评估了海藻酸钠的干预作用。② 核心发现与意义:海藻酸钠通过富集特定产牛磺酸菌群并上调肠上皮Cyp2c55表达驱动黏膜修复,为靶向微生物群落的饮食干预提供了机制依据。③ 菌群代谢枢纽:海藻酸钠显著富集产酸拟杆菌与鼠联合乳杆菌,其利用胆盐水解酶释放牛磺酸,抗生素清除菌群则阻断该效应。④ 上皮响应机制:牛磺酸直接诱导结肠上皮Cyp2c55表达,在缺乏牛磺酸转运蛋白的Slc6a6-/-或Cyp2c55-/-小鼠及类器官中,海藻酸钠丧失了修复作用。⑤ 临床转化证据:溃疡性结肠炎患者粪菌移植后补充海藻酸钠虽未达主要临床终点,但伴随粪便牛磺酸与结肠CYP2C18表达显著增加且与组织学改善相关。原文信息 ▼Microbiota–Taurine Pathway Links Dietary Fiber to Mucosal Healing2026-10-20 , doi: 10.1053/j.gastro.2026.09.028GUT:基因决定易感而肠道决定发病,脂肪肝干预新思路Gut——[24.6]① 研究背景与设计:探究PNPLA3I148M携带者肝病进展差异的环境机制,建立小鼠Pnpla3I148M/Nlrp6−/−双敲模型联合西式饮食,并整合多组学与三个人类队列分析。② 核心发现与意义:肠屏障破坏驱动菌源性长链神经酰胺与次级胆汁酸入肝,放大PNPLA3I148M相关的脂质蓄积与线粒体应激,确立菌群代谢轴为可干预的疾病修饰通路。③ 菌群代谢轴激活:Pnpla3I148M/Nlrp6−/−小鼠出现肠漏与细菌易位,门静脉神经酰胺及脱氧胆酸显著升高,驱动肝Cd36介导的脂质摄取与依赖性线粒体应激。④ 干预可逆性:抗生素清除、生态菌群移植或口服嗜黏蛋白阿克曼氏菌及其膜蛋白Amuc_1100,均显著改善肠屏障并抑制肝脂变与ALT升高。⑤ 人类转化证据:PNPLA3I148M携带者中,高甘油三酯亚组伴随菌群紊乱及神经酰胺升高,并与FIB-4、ALT及组织学纤维化显著相关。原文信息 ▼Microbiota-host genetic interactions modulate MASLD risk in PNPLA3I148M carriers via ceramides and are reversible by targeted microbial interventions2026-10-05 , doi: 10.1136/gutjnl-2026-338178GUT:脂肪肝初显,肠道菌群已拉响警报Gut——[24.6]① 背景与队列设计:为解析代谢功能障碍相关脂肪性肝病早期肠道特征并排除药物混杂干扰,整合欧洲三队列共134例排除质子泵抑制剂和二甲双胍的单纯肝脂肪变及对照者粪便宏基因组数据。② 核心发现与意义:单纯肝脂肪变阶段即已呈现特征性菌群失衡,表明肠道微生态紊乱在尚无脂肪性肝炎或显著纤维化时已存在,并非仅见于疾病晚期。③ 物种组成重构:脂肪变人群微生物基因丰富度显著降低,跨队列一致表现为丁酸产生菌Clostridium sp L2-50耗竭,伴随口腔与肠道机会致病菌具核梭杆菌及产酸克雷伯菌显著富集。④ 代谢潜能转变:脂肪变患者菌群的脂多糖生物合成遗传潜能在奥地利和瑞典队列中显著增强,而丁酸合成关键酶基因丰度在三个队列中均显著下降,且在奥地利队列中与脂肪肝活动度评分呈显著负相关。⑤ 生态网络失衡:共丰度网络鉴别出呈负相关的菌群模块,其中奥地利和瑞典队列的丁酸菌与纤维降解菌模块与丙氨酸氨基转移酶及体质指数负相关,而意大利队列的口腔致病菌模块与脂肪变严重程度呈显著正相关。原文信息 ▼Gut microbiome profiles associated with simple liver steatosis in MASLD2026-10-27 , doi: 10.1136/gutjnl-2025-337572吉林大学曹永国/屈琳凯等Cell子刊:AKK菌产酪醇,抵御子宫内膜炎Cell Host and Microbe——[23.2]① 研究背景与设计:针对生殖系统子宫内膜炎的菌群调控机制不明问题,结合临床患病奶牛样本、粪菌移植、小鼠大肠杆菌感染模型及非靶向代谢组学展开机制探究。② 总体概述与意义:肠道共生菌嗜黏蛋白阿克曼氏菌(AKK)通过代谢物酪醇经肠-子宫轴抑制子宫炎症,为生殖系统感染性疾病提供了微生态靶向干预策略。③ 菌群关联与致病因果:患病奶牛肠道菌群紊乱且AKK显著耗竭,移植其粪菌可诱导小鼠子宫内膜屏障受损并加重感染,而回补活菌AKK或其上清显著减轻炎症损伤,热灭活菌无效。④ 代谢合成机制:代谢组学与同位素示踪证实,AKK依赖保守的醇脱氢酶ADH1与ADH2催化4-羟基苯乙醛生成酪醇,肠源酪醇经血液循环蓄积于子宫组织发挥抗炎作用。⑤ 下游客观通路:在子宫上皮细胞中,酪醇通过上调SIRT1激活PI3K/AKT信号通路并抑制NF-κB转录活性,其保护效应可被SIRT1特异性抑制剂EX-527完全逆转。原文信息 ▼Akkermansia muciniphila protects against endometritis through a tyrosol-mediated gut-uterus axis2026-10-15 , doi: 10.1016/j.chom.2026.09.012匡正团队Cell子刊:肠菌如何踩准"饭点"调控宿主代谢节律?锁定关键分子与表观机制Cell Host and Microbe——[23.2]① 研究背景与设计:针对肠道菌群转化摄食信号至宿主代谢节律的机制,利用无菌小鼠、多形拟杆菌(Bt)单定植及肠上皮特异性Hdac3敲除模型进行多组学分析。② 核心发现与意义:Bt来源的肌醇三磷酸(InsP3)节律性驱动HDAC3–NCoR互作,通过去乙酰化PGC-1α激活营养转运基因,在营养不良时改善发育,在营养过剩时加剧肥胖。③ 节律性信号传导:Bt的Minpp酶水解膳食植酸产生InsP3,其肠内水平呈摄食依赖性昼夜振荡,该节律在无菌小鼠中消失,并可被Bt定植或外源InsP3恢复。④ 表观遗传调控:InsP3增强HDAC3–NCoR结合,驱动HDAC3节律性染色质招募及Slc36a1与Cd36等转运体表达,该过程完全依赖Hdac3。⑤ 代谢表型双刃剑:Bt或InsP3显著提升摄食期氨基酸与脂质吸收,在低营养幼鼠中通过HDAC3改善体长与血糖稳态,在高脂饮食下则加剧体重增长与胰岛素抵抗。原文信息 ▼Microbial inositol phosphates orchestrate host diurnal metabolism and energy homeostasis via HDAC32026-10-22 , doi: 10.1016/j.chom.2026.09.021华西医院马学磊/江雨婷等Cell子刊:抑制巨噬细胞胞葬,Akk助冷肿瘤免疫转热Cell Host and Microbe——[23.2]① 研究背景与设计:针对微卫星稳定型结直肠癌对抗PD-1治疗固有耐药的难题,整合荷瘤小鼠模型与I期临床试验探究嗜粘蛋白阿克曼氏菌(Akk)的抗肿瘤免疫机制。② 核心发现与意义:Akk通过抑制巨噬细胞胞葬激活cGAS-STING通路,增强CD8+ T细胞效应功能并逆转免疫耐药,为冷肿瘤微生态免疫治疗提供新范式。③ 巨噬细胞调控:小鼠模型口服活Akk显著抑制肿瘤生长并诱发肿瘤坏死,Akk外膜蛋白Amuc_1100经TLR2/NF-κB通路下调肿瘤相关巨噬细胞(TAM)胞葬基因Gas6和Axl,减少凋亡癌细胞清除并导致微环境dsDNA累积。④ 免疫级联激活:对胞葬的抑制可触发TAM内cGAS-STING信号活化与IFN-β释放,显著促进瘤内GZMB+和IFN-γ+ CD8+ T细胞浸润及杀伤活性。⑤ 临床转化效果:I期试验显示含巴氏灭活Akk制剂联合抗PD-1安全可行,在晚期MSS结直肠癌患者中达到19.0%客观缓解率,且应答者外周免疫显著活化。原文信息 ▼Akkermansia muciniphila attenuates macrophage efferocytosis to enhance anti-PD-1 efficacy in microsatellite-stable colorectal cancer2026-10-16 , doi: 10.1016/j.chom.2026.09.014上海药物所甘勇/潘超等Cell子刊:同步调控菌群与宿主的色氨酸代谢,纳米新药重塑抗癌免疫Cell Host and Microbe——[23.2]① 研究背景与设计:针对色氨酸代谢失衡驱动肿瘤免疫耐受的问题,构建口服酶响应纳米平台TrNG@GMS以在结肠靶向共释放色氨酸与IDO抑制剂NLG919。② 核心发现与意义:TrNG@GMS同步增强菌群吲哚通路与抑制宿主犬尿氨酸通路,协同重塑肿瘤免疫微环境,为代谢指导的癌症免疫干预提供有效策略。③ 靶向递送与代谢:纳米平台在结肠经琼脂糖酶与酯酶双重响应释放药物,显著提升粪便吲哚-3-乳酸及吲哚-3-丙酸水平并降低血清犬尿氨酸。④ 免疫微环境重塑:肿瘤内CD8+ T细胞比例显著升至12.1%且Foxp3+调节性T细胞降至2.4%,抗生素清除肠道菌群后该免疫激活效应完全消失。⑤ 抗肿瘤疗效机制:在原位结直肠癌模型中实现94.2%的显著肿瘤抑制率并延长生存期,芳烃受体蛋白下调提示吲哚代谢物通过该通路激活T细胞。⑥ 广谱性与安全性:在黑色素瘤模型中实现79.0%的显著抑瘤率,该干预未引发肠道益生菌毒性、肝肾损伤或血清5-羟色胺异常升高。原文信息 ▼An enzyme-responsive nanoplatform rewires host-microbe tryptophan metabolism for cancer immunotherapy2026-09-30 , doi: 10.1016/j.chom.2026.09.011Cell子刊:从肠道定植到跨宿主传播,共生菌的快速适应性进化Cell Host and Microbe——[23.2]① 背景与核心设计:为解析肠道共生菌脆弱拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron, Bt)的宿主内进化与跨宿主传播互作,利用含约70,000条基因组条形码的Bt库在无菌小鼠中开展了多尺度追踪。② 核心发现与意义:Bt的快速适应性突变驱动其突破定植抗性并实现跨宿主传播,而复杂菌群多样性在不减缓进化速率的前提下重塑了其适应性景观。③ 传播动力学:日传播率在宿主间存在超10倍的显著波动,该过程主要伴随宿主行为(如食粪)差异,而非由菌株固有传播性决定。④ 定植特异性:传播菌株能否在受体中成功定植取决于其适应性特征,呈现菌株特异性的可重复定植轨迹。⑤ 空间偏好演化:近期分化的适应性谱系在盲肠与粪便间演化出可遗传的空间富集偏好,且不损害其跨宿主传播能力。⑥ 群落重塑景观:49菌种合成群落显著降低了Bt的跨宿主传播率并改变了单菌特有的适应性突变模式,但未减缓整体进化速率。⑦ 体内外选择差异:29种碳源的体外进化部分重现了体内适应性优势,但突变靶点无重叠,提示体内营养微环境远较单一碳源复杂。原文信息 ▼Within-host evolution and transmission of a human gut symbiont across ecological scales2026-10-05 , doi: 10.1016/j.chom.2026.09.002Cell子刊:从破坏屏障到DNA损伤,一种口腔菌如何促肠癌?Cell Host and Microbe——[23.2]① 研究背景与设计:针对口腔菌麻疹孪生球菌(Gm)促结直肠癌机制不明的问题,结合患者多组学、多种小鼠模型、类器官及体外细胞共培养展开探究。② 核心发现与意义:Gm通过破坏肠道屏障并介导侵袭依赖性DNA损伤促进小鼠结直肠肿瘤发生,支持其作为候选致癌病原体。③ 屏障损伤机制:Gm抑制3型固有淋巴细胞(ILC3)分泌白细胞介素-22(IL-22),增加肠通透性并促进细菌易位,分泌的高分子量非脂质组分可能参与其中。④ 细胞侵袭途径:类器官与细胞实验显示,Gm依赖膜联蛋白A2(ANXA2)与网格蛋白介导的胞吞途径侵入癌细胞。⑤ 代谢重塑与基因毒性:非靶向脂质组学与彗星实验表明,Gm显著促进多不饱和脂肪酸积累与脂质过氧化,与细胞侵袭共同诱发DNA双链断裂,伴随DNA损伤标志γH2AX升高,热灭活细菌或用隔膜阻断接触后损伤消失。⑥ 干预效果验证:细胞实验中,使用ferrostatin-1阻断脂质过氧化可显著减轻Gm诱导的DNA损伤。原文信息 ▼Gemella morbillorum promotes colorectal tumorigenesis through barrier disruption and invasion-dependent DNA damage2026-10-15 , doi: 10.1016/j.chom.2026.09.016Cell子刊:肠道菌如何利用胆汁酸代谢阻止耐药肠球菌定植?Cell Host and Microbe——[23.2]① 研究背景与设计:针对万古霉素耐药肠球菌(VRE)肠道定植机制不明的问题,结合小鼠模型、代谢组学与基因编辑技术,探究胆汁酸代谢菌群互作的分子机制。② 核心发现与意义:拟杆菌目来源的分泌型T5亚类胆汁酸盐水解酶(BSH2)通过未剪切的N端信号肽介导胞外释放,驱动脱氧胆酸(DCA)生成,从而抑制VRE定植并重塑肠道生态位。③ 代谢枢纽作用:粪便代谢组分析显示DCA浓度与VRE负荷显著负相关;DCA以显著效应抑制VRE生长,而初级胆汁酸(CA)作用微弱。④ BSH2特异性机制:卵形拟杆菌中的T5-BSH2通过脱偶联反应转化TDCA为DCA;N端25氨基酸信号肽决定酶的胞外分泌能力,缺失该片段会导致酶虽具活性但丧失体内抑菌功能。⑤ 体内功能验证:在小鼠肠道中,BSH2缺陷型细菌定植导致DCA显著降低且VRE负荷升高,证实该酶介导的胆汁酸重编程是抵御VRE定植的关键防御机制。原文信息 ▼Secretory bile salt hydrolases regulate niche displacement and gut colonization of vancomycin-resistant Enterococcus2026-10-23 , doi: 10.1016/j.chom.2026.09.020Cell子刊:菌群如何塑造胆汁酸谱影响肠道健康?(综述)Cell Host and Microbe——[23.2]① 研究背景与全景:综述肠道微生物对胆汁酸(BA)的修饰机制、空间代谢特征及其调控黏膜免疫稳态与肠道疾病的分子网络。② 空间代谢与化学修饰:回肠富集BSH催化BA解离,结肠厌氧菌经bai操纵子催化7α-脱羟基化生成次级BA;涵盖母核修饰及侧链氨基酸结合形成新型MCBA。③ 受体介导的免疫调控:次级BA通过FXR、TGR5与VDR调控免疫;3-oxo-LCA抑制Th17分化,isoalloLCA促进Treg分化,DCA则抑制CD8+ T细胞并诱导M1巨噬细胞。④ 重大疾病病理枢纽:IBD伴随抗炎次级BA匮乏;CRC微环境中DCA异常蓄积促进免疫逃逸;艰难梭菌感染受初级结合型BA促芽孢萌发,但被次级BA抑制生长及毒力。⑤ 膳食重塑与转化瓶颈:西式饮食促产DCA并加剧炎症,地中海饮食有助于改善稳态;需结合AI与多组学挖掘新型BA,并构建双人源化模型推进靶向酶干预。原文信息 ▼Pleiotropic roles of microbial bile acid metabolism in intestinal health and diseases2026-10-14 , doi: 10.1016/j.chom.2026.09.010中科院亚热带生态所周锡红/胡竑等:丁酸梭菌投递小RNA,抑制肠道脂肪吸收Journal of Extracellular Vesicles——[21.7]① 背景与设计:针对微生物调控脂质代谢的非代谢物机制尚不清楚的问题,利用仔猪、小鼠及肠道类器官,探究丁酸梭菌(Clostridium butyricum)及其细胞外囊泡的作用。② 核心发现与意义:丁酸梭菌分泌含微小RNA样分子milRNA-3020179的囊泡,靶向抑制过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)信号通路,从而抑制肠道脂质吸收,为微生物RNA介导的代谢调控提供新范式。③ 菌群与表型关联:仔猪回肠黏膜中丁酸梭菌丰度与粗脂肪表观消化率呈负相关,低消化率组的脂质转运基因CD36、FABP2表达及脂肪酸氧化活性较低。④ 囊泡与靶向机制:丁酸梭菌来源的囊泡被肠上皮细胞摄取后,其携带的milRNA-3020179直接靶向并显著下调PPARα和Rxra表达,抑制脂质吸收与氧化。⑤ 体内外功能验证:在高脂饮食小鼠中,野生型菌株或其囊泡显著减轻脂质沉积,在肠道类器官中,敲除milRNA-3020179编码序列的突变菌株及其囊泡丧失抑制脂质吸收的能力。原文信息 ▼Extracellular Vesicle-Encapsulated Small RNAs From Clostridium Butyricum Modulate Host Intestinal Lipid Metabolism2026-09-28 , doi: 10.1002/jev2.70381仁济医院洪洁团队Nature子刊:两种"坏"菌互作驱动持久肠道动力障碍,益生菌或可破局Nature Microbiology——[18.7]① 背景与核心设计:针对产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)定植后肠动力障碍持续存在的机制不明问题,利用小鼠模型及多组学分析解析了细菌互作驱动的神经损伤通路。② 总体概述:具核梭杆菌(Fn)通过分泌代谢物放大ETBF的神经毒性,驱动肠肌间神经元凋亡与持久性动力障碍,为阻断感染后遗症提供了微生物干预靶点。③ 神经损伤机制:ETBF分泌的脆弱拟杆菌毒素(BFT)直接结合并激活肠肌间神经元NOD1受体,触发RIPK2–CASP9–CASP3级联反应导致神经元凋亡及胃肠传输时间显著延长。④ 菌群互作放大:Fn共定植伴随粪便BFT水平显著升高,其乳酸脱氢酶生成的2-羟基丁酸直接结合转录抑制因子RprY,解除对bft启动子的抑制从而放大神经毒性。⑤ 临床与功能后果:溃疡性结肠炎便秘患者结肠中bft表达与神经元密度呈负相关,且早期定植诱导的神经损伤显著加剧了后续结肠炎严重程度。⑥ 治疗干预效果:补充含长双歧杆菌的益生菌(Bifico)显著抑制Fn定植与2-羟基丁酸生成,下调bft表达并缓解神经元凋亡、动力障碍及结肠炎。原文信息 ▼Fusobacterium nucleatum enhances enterotoxigenic Bacteroides fragilis-mediated neuron loss and intestinal motility dysfunction2026-10-01 , doi: 10.1038/s41564-026-02497-yNature子刊:肠杆菌与膳食纤维协同决定肠道优势菌群Nature Microbiology——[18.7]① 背景与核心设计:针对工业化与非工业化人群肠道优势菌群(普雷沃菌科vs拟杆菌科)差异之谜,在包含21种分离株的合成肠道群落中筛选94种膳食成分以解析细菌间的营养竞争机制。② 总体发现与意义:肠杆菌科细菌与特定植物多糖协同驱动普雷沃菌科的Segatella copri的竞争优势,揭示了饮食与微生物互作塑造特定肠道生态型的系统级动力学机制。③ 多糖依赖性竞争:在阿拉伯聚糖等特定多糖存在时,S. copri相对丰度显著增加约35倍并压制拟杆菌科,但该优势在去除群落其他成员的两两竞争中完全消失。④ 肠杆菌科驱动作用:向竞争模型中单独引入大肠杆菌足以逆转竞争劣势,使S. copri在阿拉伯聚糖存在下主导拟杆菌目生态位。⑤ 非营养性信号机制:无法代谢阿拉伯聚糖衍生单糖的大肠杆菌突变体仍能促进S. copri扩张,提示单糖通过细菌间信号传导而非单纯交叉喂养发挥作用。⑥ 复杂群落与验证:该协同效应在人源粪便及无特定病原体小鼠盲肠群落中保守存在,且非工业化人群肠道及植物性食物中肠杆菌科的丰度与多样性均显著更高。原文信息 ▼Synergy between Enterobacteriaceae and diet mediates competition between dominant Bacteroidales in the human gut2026-10-02 , doi: 10.1038/s41564-026-02500-6Nature子刊:无关菌群,抗生素可直接重塑肠道免疫节律Nature Microbiology——[18.7]① 研究背景与设计:针对抗生素对宿主生理影响中菌群依赖性与非依赖性难以区分的问题,整合无特定病原体及无菌小鼠的多组学数据开发了CompoRes计算工具,并系统评估了不同给药途径的效应。② 核心发现与意义:万古霉素通过直接作用于肠神经系统触发摄食减少,进而扰乱葡萄糖驱动的结肠上皮抗原递呈节律,为抗生素重塑宿主免疫与代谢提供了非微生物途径的直接证据。③ 算法预测与验证:CompoRes算法分析显示,腹腔注射万古霉素显著改变了结肠核心生物钟基因的表达,且该转录重编程与肠道菌群的组成变化无显著关联。④ 神经内分泌机制:免疫荧光及转录组数据显示,系统性给药的万古霉素富集于肌间神经丛,驱动神经肽Nmu及其受体Nmur2表达上调,导致小鼠摄食量显著下降。⑤ 代谢与免疫互作:摄食减少导致的肠道葡萄糖水平降低,直接取消了无菌小鼠结肠上皮中主要组织相容性复合体II类分子H2-Ab1和H2-Aa的昼夜节律性高峰表达。⑥ 跨物种进化保守:在果蝇模型中,万古霉素同样显著上调了摄食调控基因klu及其下游同源物hug和受体PK2-R1的表达,提示该神经代谢调控通路具有高度保守性。原文信息 ▼Disentangling microbiota-dependent and -independent impacts of antibiotics on host physiology2026-10-19 , doi: 10.1038/s41564-026-02453-w