本期导读
Medicinal Chemistry Research第35卷第1期文章正式上线!本期共收录了 13篇论文,希望能为药物化学相关研究领域学者提供有价值的参考,欢迎阅读、下载和转发!
Review Article
1The evolution of Nutlins as p53-MDM2 inhibitors
p53-MDM2/MDMX 互作是肿瘤领域的关键治疗靶点,Nutlin-3a 的顺式咪唑啉母核更是首款纳摩尔级 MDM2 小分子拮抗剂。本综述系统梳理了 Nutlin 衍生物从先导化合物优化到临床转化的完整历程。
文章围绕结构修饰策略展开,深入探讨了提升代谢稳定性、溶解度及实现 MDM2/MDMX 双靶点抑制的合理设计思路,涵盖共价抑制剂及 MDM2 靶向降解 PROTACs 的研发。合成部分详述邻二胺构建、咪唑啉环成环、氮原子官能化及硝基曼尼希反应等核心技术路径。此外,综述还分析了药代动力学与药效学特征,明确 p53 状态对治疗疗效的决定性作用,总结其与 60 余种药物的协同联用方案。该类化合物在实体瘤与血液瘤中均完成临床前概念验证,于 MDM2 扩增型肿瘤中取得临床验证,非肿瘤领域的应用潜力也初现端倪。
Daniil R. Bazanov, Natalia A. Lozinskaya
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 1–40.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03492-4
2
Dual-target inhibitors based on brpf1: a review from medicinal chemistry perspectives BRPF1 作为 MOZ/MORF 组蛋白乙酰转移酶复合物的关键组分,通过溴结构域、PHD 指结构及 PWWP 结构域调控染色质重塑与基因表达。其表达失调与神经发育障碍及癌症密切相关,是极具潜力的治疗靶点。本文综述了 BRPF1 的结构域特征、生物学功能及疾病关联,重点阐述溴结构域抑制剂(1,3 -二甲基苯并咪唑酮衍生物GSK6853、N-甲基喹啉-2-酮类化合物NI-42、3-乙酰吲哚衍生物等)及双靶点抑制剂的研发进展,同时指出当前存在的药代动力学欠佳、选择性不足、体内验证不充分等局限。未来或可借助前沿技术解析作用机制、AI 辅助药物设计及推进临床转化,为 BRPF1 靶向疗法的突破提供支撑。
Xuan Guan, Dan Mei, Xinyu Chen, Xiaodiao Li, Hongmei Yuan, Dan Zhou
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35:41–60.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03503-4
3
Natural products in medicinal chemistry: targeting inflammatory pathways with plant-derived compounds 炎症是机体抵御外界刺激、促进组织修复的即时生理反应,但其失调状态可诱发多种慢性疾病。黄酮类、萜类、生物碱等植物源天然产物,能够调控 NF-κB、MAPKs 等关键信号通路及炎症小体,促进抗炎巨噬细胞极化、调节 T 细胞应答、抑制中性粒细胞活化,同时凭借抗氧化活性缓解氧化应激及下游炎症信号,具备潜在抗炎功效。然而这类物质存在溶解度差、代谢快、生物利用度低等药代动力学短板,限制了其治疗潜力。纳米粒、脂质体等先进递药系统,结合生物增强剂与前药技术,可有效提升其体内暴露量与疗效。组学技术与人工智能的整合,有助于加速新型抗炎植物活性成分的筛选与优化。当前,标准化、质量控制、监管审批及安全性评估等问题仍待解决。本综述系统梳理植物源抗炎剂的药理机制、药代局限与临床证据,展望未来发展方向,凸显其作为安全高效、经济易得的炎症相关疾病治疗方案的应用潜力。
Adnan Amin, Muhammad Saeed Akhtar, Atif Ali Khan Khalil, Sajid Ali, Wajid Zaman
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 61–84.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03508-z
4
Macrocyclization in medicinal chemistry: updated strategies and applications
大环化已成为药物化学领域一种灵活的设计策略,为解决传统小分子药物的局限性提供了独特思路。过去十年间,大环化技术的应用已拓展至多个治疗领域,其中肿瘤学领域进展尤为显著,在免疫学、炎症、神经退行性疾病及抗病毒研究中也取得长足进步。本综述系统梳理了大环化策略的最新研究进展,重点阐述其在活性优化、难靶向靶点选择性提升、突变特异性活性增强、细胞水平疗效改善及药代动力学优化等方面的作用。尽管大环化并非通用策略,且往往需要借助晶体学或分子建模提供结构支撑,但它已成为候选药物优化的主流手段,为创新疗法研发提供了重要选择。本文旨在厘清大环化设计的新兴原则,展望其在下一代治疗药物研发中的核心作用。
Om Darlami, Keunyoung Kim, Dongyun Shin, Seok-Ho Kim
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 85–96.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03506-1
Original Research Article
1
Anthranylhydrazide as simple, easily accessible and effective scaffold for scavenging 4-hydroxynonenal and 4-hydroxyhexenal in vitro 本研究合成邻氨基苯甲酰肼衍生物,开发潜在的 4 - 羟基烯醛清除剂。以多种取代靛红酸酐 1a-1c 为原料,与甲肼反应制备甲酰肼衍生物 Ia-Ic。采用薄层色谱与氢核磁共振技术,分别在有机相和水相体系中测定其对 4 - 羟基己烯醛(4-HHE)的清除活性。结果表明,化合物 Ia、Ib 无需催化即可与 4-HHE 形成稳定酰腙加合物,且结构经全面表征。其中 Ib 清除活性最优,在两相体系中均展现更快反应速率,其加合物 IIb 的稳定性也在水相体系中得到验证。结合计算机辅助构象分析进一步探究活性机制,发现加合物 IIa、IIb 的稳定构象由 NH/π 相互作用维系,为该类衍生物的清除活性提供了理论支撑。
Ruling Shi, Peixi Zhang, Ming Chen, Weiming Lu, Meng Xu, Huagong Zeng, Jie He, Yan Wang, Yirong Lin, Jieqing Liu
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 97–107.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03493-3
2
Indirubin derivatives bearing an oxirane moiety are promising chemosensitizers for combination treatment in pancreatic cancer 本研究发现,靛玉红衍生物 Epox/5-Br-Indc长时作用于人胰腺癌细胞 PANC-1 后,能显著增强其对 5 - 氟尿嘧啶(5-FU)和吉西他滨(Gem)的化疗敏感性。通过刃天青法检测结果显示:该化合物对 PANC-1 的IC50为 1.8 μM,而长期阻滞细胞增殖仅需 0.1 μM。流式检测结果表明,0.1 μM Epox/5-Br-Ind 长时处理可诱导细胞大量滞留于 S/G2/M 期,Annexin V阳性细胞比例升高,表明其通过细胞周期阻滞与凋亡诱导实现持续生长抑制。分子对接提示该化合物可能抑制周期蛋白依赖性激酶(CDKs),基因表达分析显示 Caspase-3/7 随处理时间上调,且 CDK2 代偿性高表达。长期处理后,PANC-1 对 5-FU 和 Gem 的 IC50 分别降至 1.2 μM 和 2.0 μM,约为对照组的 1/10。综上,Epox/5-Br-Ind 是极具潜力的化疗增敏剂,为胰腺癌联合治疗策略提供了新的候选药物。
Koushirou Sogawa, Koichi Kato, Makoto Sano, Tomoki Nakayoshi, Hiroki Yoshioka, Hideaki Kato, Akifumi Oda, Masahiko Funada, Tsutomu Suzuki, Masaaki Kurihara,, Yoshimi Ichimaru
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 105–117.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03499-x
3
An investigation of phosphinamides as a functional group for medicinal chemistry 本研究合成一系列代表性简单磷酰胺,对比其与配对苯甲酰胺、磺酰胺的理化及代谢性质,同时制备多款上市药物的磷酰胺类似物,并与原药展开性能比对。结果显示,磷酰胺具备适用于药物分子开发的优良理化特性,可降低化合物脂溶性,且普遍改善溶解度;其代谢稳定性、氢键供体强度及 Caco-2 细胞渗透性,与酰胺、磺酰胺类化合物相近。令人意外的是,二级与三级磷酰胺的实验极性表面积差异,显著小于对应的苯甲酰胺和苯磺酰胺。但该类化合物存在明显短板:在酸性介质中化学稳定性较差,即使储存于二甲基亚砜溶液中稳定性也不佳,这成为限制其在药物化学领域广泛应用的关键问题。
Virginie Meurillon, Paul Blanchart, Victoria Ullah, Diana Chan, Matthew Perry
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 118–134.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03498-y
4
Disentangling the non-bonding interaction energy between KRAS oncoproteins and small-molecule non-covalent inhibitors helps clarifying how inhibition occurs 以往 RAS 癌蛋白非共价抑制剂的建模研究多聚焦于分子整体层面,导致诸多关键分子作用细节未被揭示。而抑制剂性能的持续优化,亟需此类相互作用的精细化认知。本研究针对这一问题展开探索,借助分子动力学及量子力学 - 分子力学(QM/MM)模拟技术,解析了 BI-2865、MRTX1133 等热门抑制剂与 KRAS-G12D 突变体残基的相互作用能,从残基层面量化了抑制剂的优势结合位点与不稳定排斥区域。此外,研究还针对新发现的非共价抑制剂 RCM-6236 与亲环蛋白 A、KRAS G12R 形成的三元复合物开展同类分析,为其抑制机制提供了关键线索。上述精细化研究视角,为新一代非共价 KRAS 抑制剂的结构优化指明了方向。
Francesco Pietra
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 135–146.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03500-7
5
Sulfonamide-substituted oxindoles as inhibitors of carbonic anhydrase II with potential antiglaucoma activity 本研究设计并合成了一系列含磺酰胺结构的 3 - 羟基 - 2 - 吲哚酮类化合物,合成路径为靛红与丙二酸或氰乙酸的缩合反应,并对其生物活性展开评价。所有目标化合物均为纳摩尔级强效碳酸酐酶 II 抑制剂,其中活性最优的 4a 与 4h 半数抑制浓度(IC50)分别达 20 nM、28 nM。研究采用大鼠、兔两种动物模型开展体内降眼压活性研究,结果显示:0.1% 受试化合物水溶液滴眼后,4a、4h、5i 可使兔眼压分别降低 17%、21%、25%;0.4% 水溶液滴眼时,多数化合物可使大鼠眼压中度下降,其中 4i 与 5i 活性最佳,眼压降幅分别达 30%、34%。此外,所有化合物对 Fe²⁺诱导的大鼠脑匀浆脂质过氧化均具有中度抑制作用,且无线粒体毒性。
Natalia Lozinskaya, Nikita Krylov, Daria Vinogradova, Alexander Efremov, Olga Beznos, Mariia Salykina, Lyudmila Naumenko, Alena Taran, Alina Cheban’ko, Ivan Veselov, Sergey Sosonyuk, Alexander Spasov, Elena Shevtsova
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 147–163.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03507-0
6
New structural scaffold discovery via fragment-based drug design: Hydroxymethyl indazole derivatives as XOR/URAT1 dual inhibitors
高尿酸血症源于尿酸代谢紊乱,黄嘌呤氧化还原酶(XOR)与尿酸转运蛋白 1(URAT1)分别是调控尿酸生成与重吸收的核心治疗靶点。本研究采用基于片段的药物设计结合虚拟筛选技术,获得候选化合物 A1-A4。其中 A4 对 URAT1 抑制活性较强,半数抑制浓度(IC50)为 33.10±7.82 μM,与阳性药苯溴马隆(21.67±7.31 μM)相当;对 XOR 亦有一定抑制作用(IC50=20.73±2.19 μM),但活性显著弱于别嘌醇(1.43±0.02 μM)。A4,通过分子对接技术开展首轮结构优化设计并合成了 B1-B13 系列化合物。其中 B8 的 XOR 抑制活性最优(IC50=10.14±1.43 μM),较 A4 提升约 1 倍,但其 URAT1 抑制活性较 A4 明显下降。研究提出后续可基于 B8 与 A4 的结构特征开展进一步优化。
Haiqing Ma, Hongming Chen, Lei Zhang, Jing Li
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 164–184.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03505-2
7
Design, synthesis and biological evaluation of novel hydroxamic acids bearing coumarin moieties as histone deacetylase inhibitors and cytotoxic agents
本研究成功设计并合成了一系列新型香豆素基异羟肟酸衍生物,将其开发为强效组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂。其中多款化合物对全细胞 HDAC 表现出强效抑制活性,且对 MCF-7、A549、SK-Lu-1 三种人癌细胞系展现中等到显著的抗增殖活性。值得关注的是,化合物 4c 与 4d 作为最优候选物对 HDAC 的半数抑制浓度(IC50)分别为 0.16 μM、0.33 μM,活性优于阳性药辛二酰苯胺异羟肟酸(SAHA,IC50=0.63 μM);对 MCF-7 细胞的细胞毒性显著强于 SAHA,活性提升 1.2 至 6.8 倍。分子对接模拟进一步阐明了这类化合物与 HDAC 亚型的相互作用模式,揭示了其结合机制。综上,化合物 4c 与 4d 作为极具潜力的 HDAC 抑制剂,在癌症治疗领域展现出重要治疗价值。
Tran Duy Thanh, Luu Van Chinh, Do Thi Thao, Thach Lien Nguyen, Hai Pham–The, Tran Khac Vu
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 185–202.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03509-y
8
Discovery of novel nuciferine-based URAT1 inhibitors for hyperuricemia: synthesis, biological evaluation, and computational insights 尿酸转运蛋白 1(URAT1)是治疗高尿酸血症的关键靶点。然而现有 URAT1 抑制剂存在毒性高、不良反应明显等局限,开发安全有效的新型药物刻不容缓。本研究通过修饰荷叶碱衍生物的 N7 位取代基,合成 9 种新型化合物以增强其 URAT1 抑制活性。CCK-8 实验显示,多数化合物在浓度高达 60 μM 时,对人肾小管上皮细胞(HK-2)无显著细胞毒性,具备深入研究价值。蛋白质印迹实验表明,多数衍生物可下调 HK-2 细胞中 URAT1 蛋白的表达水平,其中化合物 3-4 的抑制活性最强,与阳性药苯溴马隆效力相当。构效关系分析显示,磺酰基取代可提升 URAT1 抑制活性,芳香酰胺取代则会降低活性。分子对接结果表明,化合物 3-4 与 URAT1 的结合作用更强,结合亲和力达 - 6.794 kcal/mol;分子动力学模拟证实两者可形成稳定复合物。ADME 分析验证,该化合物符合类药五原则,脂溶性均衡且药代动力学性质优良。上述结果表明,N7 位是荷叶碱类抗高尿酸血症药物的关键可修饰位点,为高效药物研发提供了新思路。
Yan-fei Liu, Ze-sheng Hao, Xu Guo, Shu-tao Sun, Mu-xuan Wang, Meng-qi Zhang, Ying-ying Chen, Jin-yue Sun, Chao Liu
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 203–214.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03510-5
9
Synthesis and evaluation of symmetric (1,4-diazepane-1,4-diyl)bis(phenylmethanone) derivatives as amyloid-beta aggregation inhibitors 本研究设计并合成 16 种含 1,4 - 二氮杂䓬母核的对称型(1,4 - 二氮杂䓬 - 1,4 - 二基)二苯甲酮衍生物(3a–p),并评价其抑制Aβ42与Aβ40蛋白聚集的活性。体外荧光聚集动力学实验显示,化合物 3k和 3o对 Aβ42 聚集的抑制作用呈浓度依赖性;25 μM 浓度下,3k 的抑制率达 50%,3o 为 33%。Aβ40 聚集抑制实验中,3c 与 3o 活性突出,抑制率为 60%–63%。透射电镜结果进一步验证,3c、3k、3o 可显著降低 Aβ42 与 Aβ40 的纤维生成量。双靶点抑制剂 3o 展现出良好安全性:25 μM 浓度下对小鼠海马 HT22 细胞的存活率无显著影响(约 96%),且可将 Aβ42 诱导损伤的细胞存活率从 37% 提升至 48%;同时对过氧化氢诱导的细胞毒性具有神经保护作用,体外血脑屏障渗透实验证实其可穿透血脑屏障。分子模拟研究表明,3o 可结合于 Aβ42 五聚体与 Aβ40 二聚体 N 端和 C 端残基构成的狭窄通道,通过稳定肽链组装体抑制聚集进程。综上,构象灵活的 sp³ 杂化 1,4 - 二氮杂䓬母核,是开发 Aβ42/Aβ40 双靶点抑制剂的优良新型模板。
Rahul C. Karuturi, Ahmed A. Hefny, Yusheng Zhao, Arash Shakeri, Samala Venkateswarlu, Praveen P. N. Rao
Medicinal Chemistry Research, 2026, 35(1): 215–233.
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00044-025-03512-3
期刊简介
Medicinal Chemistry Research 创刊于1991年,涵盖多种药物化学领域的主题,包括但不限于新药物的发现、药物代谢、药物作用机制、构效关系研究、生物化学和药物安全性评估等。
主编由美国罗格斯大学胡龙勤教授担任。副主编由四川大学柯博文教授、布卢菲尔德州立大学Young Kim教授、意大利帕尔马大学Marco Pieroni教授担任。
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