单细胞组学
1. An Extracellular Matrix-Producing Subset of Cancer-Associated Fibroblasts Drives Chemoresistance in Breast Cancer via SRC Activation and G0S2 Upregulation.
特定成纤维细胞亚群通过SRC-G0S2轴驱动乳腺癌耐药。三阴性乳腺癌的化疗耐药是临床难题,需明确驱动耐药的具体基质细胞亚群。研究通过单细胞测序和芯片技术鉴定出ECM-myCAF亚群,其通过激活SRC并上调G0S2促进癌细胞存活。该研究为克服三阴性乳腺癌耐药提供了精准的基质靶向策略。
三阴性乳腺癌 (TNBC) | ECM-myCAF, SRC/G0S2 | 单细胞RNA测序, 肿瘤芯片
Hofer Isabella · … · Parrini Maria Carla · · 2026/02/16
该研究由肿瘤学居里研究所Maria Carla Parrini团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-25-0966
2. Protumor Macrophage Polarization Mediated by BMP2/4-ACVR1 Signaling Orchestrates an Immunosuppressive Microenvironment during Tumor Initiation.
BMP2/4-ACVR1信号介导的巨噬细胞极化驱动肿瘤免疫抑制。了解肿瘤发生初期“冷”微环境的形成机制对于开发免疫治疗策略至关重要。研究发现肺腺癌细胞通过BMP2/4诱导巨噬细胞向促癌表型转变,抑制ACVR1可将“冷”肿瘤转变为“热”肿瘤。ACVR1被鉴定为治疗EGFR突变肺癌的潜在免疫靶点。
肺腺癌 | 巨噬细胞极化, ACVR1信号 | 单细胞RNA测序
Wang Mingchao · … · Lan Xun · · 2026/02/16
该研究由生命科学清华大学兰勋团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-24-4392
3. Cancer-Associated Fibroblasts Promote Imatinib Resistance in Gastrointestinal Stromal Tumors through PGK1-Mediated Metabolic Reprogramming.
成纤维细胞通过PGK1介导的代谢重编程促进GIST耐药。胃肠道间质瘤对伊马替尼的耐药机制多聚焦于遗传因素,忽略了微环境的作用。研究发现CAF分泌的TGFβ1通过CCN2/Rack1轴诱导PGK1磷酸化,引发代谢重编程以支持肿瘤存活。靶向CAF与肿瘤细胞的相互作用为克服GIST耐药提供了新途径。
胃肠道间质瘤 (GIST) | 代谢重编程, PGK1 | 单细胞RNA测序
Li Chao · … · Shen Kuntang · · 2026/02/16
该研究由普通外科学复旦大学附属中山医院沈坤堂团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-25-1404
4. Dissection of Gαs and Hedgehog Signaling Cross-talk Reveals Therapeutic Opportunities to Target Hedgehog-Dependent Tumors.
Gαs/PKA通路失活驱动基底细胞癌发生。基底细胞癌主要由Hedgehog通路激活驱动,探索其替代调节途径对治疗耐药肿瘤至关重要。研究发现Gαs通路失活诱导的肿瘤与典型Hedgehog驱动肿瘤高度相似,激活Gαs偶联受体可显著抑制肿瘤生长。该发现为Hedgehog依赖性肿瘤提供了新的治疗策略。
基底细胞癌 (BCC) | Hedgehog信号通路, Gαs/PKA | 单细胞RNA测序
Krantz Sarah · … · Iglesias-Bartolome Ramiro · · 2026/02/16
该研究由细胞与分子生物学美国国立卫生研究院Ramiro Iglesias-Bartolome团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-25-1109
5. Kitasamycin overcomes ferroptosis and immunotherapy resistance by targeting the HUWE1-NCOA4-FTH1 axis.
吉他霉素通过靶向HUWE1-NCOA4轴克服免疫治疗耐药。临床上常因担心抗生素降低免疫治疗疗效而限制使用,寻找能增强疗效的抗生素具有重要意义。研究鉴定出吉他霉素为铁死亡敏感剂,通过激活铁蛋白吞噬重塑T细胞免疫,有效克服黑色素瘤的ICB耐药。该研究为需要抗生素治疗的癌症患者提供了理想的辅助方案。
免疫治疗耐药 | 铁死亡, HUWE1-NCOA4 | 抗生素筛选, 单细胞转录组学
Li Daishi · … · Deng Guangtong · · 2026/02/15
该研究由皮肤病学中南大学湘雅医院邓光童团队完成 Autophagy
原文链接:https://doi.org/10.1080/15548627.2026.2623986
6. Age-associated differences in XBB.1.5 trivalent booster vaccine-induced adaptive responses revealed by single-cell RNA sequencing.
单细胞测序揭示老年人对新冠加强针的免疫反应差异。老年人对新冠病毒仍高度易感,需明确其对新型加强疫苗的免疫协调模式。研究发现老年人B细胞分化主要源于记忆细胞,且T细胞受体多样性降低,导致抗体滴度增幅低于年轻人。该研究为优化老年人群的疫苗接种策略提供了细胞学证据。
新冠肺炎 (COVID-19) | 免疫衰老, B/T细胞分化 | 单细胞RNA测序
Chen Shixing · … · Chen Yuxin · · 2026/02/16
该研究由检验医学南京鼓楼医院陈雨信团队完成 Emerging microbes & infections
原文链接:https://doi.org/10.1080/22221751.2026.2627067
7. Endothelial Prolyl Hydroxylase 3 Mitigates Maladaptive Inflammation to Promote Post-Ischemic Kidney Repair.
内皮细胞PHD3通过抑制炎症促进缺血性肾损伤修复。急性肾损伤(AKI)中组织缺氧会重塑细胞行为,但内皮氧感知对肾修复的影响尚不清楚。研究发现内皮PHD3通过HIF依赖方式抑制干扰素-γ信号,从而减轻炎症并防止肾纤维化。该研究确定了PHD3是保护肾脏免受适应不良炎症影响的关键氧传感器。
急性肾损伤 | PHD3-HIF轴, 干扰素-γ信号 | 单细胞转录组测序
Sharma Rajni · … · Kapitsinou Pinelopi P · · 2026/02/13
该研究由肾脏病学西北大学Kapitsinou Pinelopi P团队完成 Kidney international
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.kint.2026.01.017
8. Computational Drug Repurposing for Alzheimer's Disease via Sheaf Theoretic Population-Scale Analysis of snRNA-Seq Data.
基于单核RNA测序的层论群体分析助力阿尔茨海默病药物重定位。药物研发需基于对分子机制的群体水平理解,单细胞技术为此提供了新契机。研究利用持续层拉普拉斯算子分析AD相关的蛋白质相互作用,并结合机器学习筛选出潜在的治疗靶点和候选药物。该模型为AD的精准医疗和可持续药物发现提供了新路径。
阿尔茨海默病 | 蛋白质相互作用网络 | snRNA-seq, 机器学习, 层论分析
Cottrell Sean · … · Wei Guo-Wei · · 2026/02/16
该研究由计算生物学密歇根州立大学Wei Guo-Wei团队完成 Journal of medicinal chemistry
原文链接:https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c02862
基因组或者转录组学
1. The NeuroBioBank whole-genome catalogue of human brain donors with central nervous system disorders
NeuroBioBank发布大规模脑疾病全基因组目录。深入了解中枢神经系统疾病的遗传风险和机制需要大规模的临床与基因组匹配数据。本研究对近万名脑组织捐赠者进行了全基因组测序,涵盖148种疾病,并验证了HTT和APOE等关键关联。该资源为神经基因组学研究提供了宝贵的数据支撑。
中枢神经系统疾病 | 遗传风险变异 | 全基因组测序, 神经生物学数据库
Brain Advance Access · 2026/02/16
原文链接:https://academic.oup.com/brain/advance-article/doi/10.1093/brain/awag057/8487749?rss=1
2. FLT3-ITD measurable residual disease from the QuANTUM-First trial.
Quizartinib显著改善FLT3-ITD突变AML患者预后。评估FLT3抑制剂在急性髓系白血病治疗中对微小残留病(MRD)的影响至关重要。QuANTUM-First试验分析显示,Quizartinib能诱导更深的MRD阴性缓解,且MRD水平与复发和生存率密切相关。该研究确立了MRD作为FLT3-ITD突变AML的重要预后指标。
急性髓系白血病 (AML) | FLT3-ITD | 微小残留病 (MRD) 检测, 临床试验
Levis Mark J · … · Perl Alexander E · · 2026/02/10
该研究由血液肿瘤学宾夕法尼亚大学Alexander E Perl团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2025016444
3. The Aging Microenvironment Is a Determinant of Immune Exclusion and Metastatic Fate in Pancreatic Cancer.
衰老微环境决定胰腺癌免疫排除与转移命运。衰老是胰腺癌的关键风险因素,但传统模型难以模拟老年机体的基质复杂性。研究发现衰老肿瘤基质中的成纤维细胞通过分泌组重塑促进免疫抑制和转移,而年轻基质可恢复免疫浸润。该发现揭示了针对基质衰老改善老年患者预后的潜力。
胰腺癌 | 衰老微环境, 癌症相关成纤维细胞 (CAF) | 转录组学, 骨科模型
Gupta Priyanka · … · Commisso Cosimo · · 2026/02/16
该研究由癌症代谢与微环境Sanford Burnham Prebys的Cosimo Commisso团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-25-1904
4. Dynamic and Ongoing De Novo L1 Retrotransposition Contributes to Genome Plasticity and Intrapatient Heterogeneity in Ovarian Cancer.
L1逆转录转座驱动卵巢癌基因组可塑性与异质性。L1转座子在正常细胞中沉默但在癌细胞中活跃,其对肿瘤内异质性的贡献需深入量化。研究发现高L1负荷与肿瘤高增殖相关,且L1插入谱在不同病灶间高度分化,显著增加了基因组不稳定性。L1活性可作为卵巢癌精准医疗的潜在分子漏洞。
高级别浆液性卵巢癌 (HGSC) | L1逆转录转座, 基因组不稳定性 | 基因组测序
Pradhan Barun · … · Kauppi Liisa · · 2026/02/16
该研究由系统肿瘤学赫尔辛基大学Liisa Kauppi团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-24-4419
5. CRISPR-Cas9 Screening Identifies Resistance Mechanisms to KRAS Inhibition in Pancreatic Cancer.
CRISPR筛选揭示胰腺癌对KRAS抑制剂的耐药机制。尽管KRAS抑制剂已进入临床,但固有和获得性耐药仍是限制其疗效的主要障碍。通过对多种突变亚型进行全基因组筛选,研究鉴定了EGFR等关键耐药基因,并发现联合EGFR抑制剂可产生协同抗肿瘤效应。该研究为开发KRAS抑制剂联合疗法提供了遗传学依据。
胰腺癌 (PDAC) | KRAS突变, 耐药机制 | CRISPR-Cas9 筛选
Long Szu-Aun · … · Waters Andrew M · · 2026/02/16
该研究由外科学辛辛那提大学Andrew M Waters团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-25-1835
6. TSC-associated microglial hyperactivity: enhanced calcium signaling, metabolism, and phagocytosis.
结节性硬化症中小胶质细胞功能异常。TSC是一种常伴神经精神症状的遗传病,其小胶质细胞在病理中的作用尚不明确。研究发现TSC患者iPSC来源的小胶质细胞存在钙信号紊乱、代谢改变及吞噬增强,且与脑组织转录组特征吻合。该发现揭示了小胶质细胞在TSC病理中的关键作用,为理解其神经并发症提供了新视角。
结节性硬化症 | 钙信号传导, mTOR通路 | iPSC分化, 转录组测序
Kalf Rozemarijn S · … · Aronica Eleonora · · 2026/02/13
该研究由神经生物学阿姆斯特丹大学Eleonora Aronica团队完成 Acta neuropathologica
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00401-026-02986-8
7. Genetically predicted mannose binding lectin (MBL) levels and risk of future venous thromboembolism - The HUNT Study.
遗传预测的MBL水平与静脉血栓风险相关。甘露糖结合凝集素(MBL)水平升高与静脉血栓(VTE)风险增加有关,但其遗传调控影响尚不明确。研究通过对近7万人的队列分析发现,高遗传预测MBL水平显著增加中青年男性的VTE风险。该发现强调了MBL在特定人群血栓发病中的遗传易感性,揭示了性别与年龄的调节作用。
静脉血栓栓塞 | 甘露糖结合凝集素 | 遗传预测, 队列研究
Damoah Christabel Esi · … · Hansen John-Bjarne · · 2026/02/13
该研究由血栓研究特罗姆瑟大学John-Bjarne Hansen团队完成 Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.jtha.2026.01.028
8. Associations of tumour somatic mutations with cancer-associated venous thromboembolism.
肿瘤体细胞突变影响癌症相关血栓风险。癌症患者易发静脉血栓(VTE),肿瘤生物学与凝血系统的相互作用机制复杂。研究通过分析1.2万余名患者数据,发现CDKN2A、KRAS等基因突变与VTE风险升高显著相关。这些发现有助于深入理解癌症相关血栓的病理并优化临床风险预测,为精准医疗提供依据。
癌症相关血栓 | CDKN2A, KRAS, TP53 | 全基因组测序
Cornish Naomi · … · Haycock Philip C · · 2026/02/13
该研究由流行病学布里斯托大学Philip C Haycock团队完成 Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.jtha.2026.01.019
9. SETDB1 enables development beyond cleavage stages by extinguishing the MERVL-driven two-cell totipotency transcriptional program in the mouse embryo.
SETDB1通过熄灭MERVL驱动的转录程序确保小鼠胚胎发育跨越卵裂期。母源SETDB1缺失会导致胚胎植入前发育停滞,但其背后的分子机制此前不明。单胚胎转录组分析显示,SETDB1负责沉默定义全能态的MERVL逆转录转座子及其驱动的嵌合转录本。该研究确立了SETDB1作为从全能性向多能性转变的关键染色质调节因子。
胚胎发育, 全能性转变 | SETDB1, MERVL | 单胚胎转录组测序
Zeng Tie-Bo · … · Szabó Piroska E · · 2026/02/16
该研究由表观遗传学范安德尔研究所Piroska E Szabó团队完成 eLife
原文链接:https://doi.org/10.7554/eLife.109248
10. One Health horsepower in hemostasis: SEL1Lecting stable platelet adhesion.
SEL1L变异导致马类血小板功能障碍。研究背景是血栓与止血机制的跨物种保守性。通过整合多物种调查与基因组探索,发现SEL1L在斑马鱼、小鼠及人类血小板中的关键作用。该发现为解释人类出血表型奠定了基础,展示了跨学科研究的价值。
出血性疾病 | SEL1L, 内质网相关降解途径 | 基因组关联分析, 跨物种比较基因组学
Schneider Caitlin D · Luyendyk James P · · 2026/02/16
该研究由药理学与毒理学密歇根州立大学Luyendyk James P团队完成 The Journal of clinical investigation
原文链接:https://doi.org/10.1172/JCI202267
11. Human immunodeficiency virus-associated gut microbiome impacts systemic immunodeficiency and susceptibility to opportunistic gut infection
肠道菌群失调加剧HIV感染者的系统性免疫缺陷。HIV感染者的肠道菌群特征及其对宿主免疫的影响尚不完全明确。研究发现菌群失调与外周CD4+ T细胞计数及肠道黏膜免疫受损密切相关。该研究揭示了肠道菌群在HIV致病机制中的关键作用,为改善患者免疫提供了新思路。
HIV, 肠道菌群 | CD4+ T细胞, 肠道黏膜免疫 | 宏基因组学, 粪菌移植
Bashiardes, Stavros · … · Elinav, Eran · Nature Microbiology · 2026/02/16
⭐ 该研究由免疫学魏茨曼科学研究所Eran Elinav团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41564-025-02253-8
12. Rapid genome modifications including chromosomal fusions and large-scale inversions are key features in Arctic codfish species
基因组快速重组驱动北极鳕鱼的寒冷适应。基因组演化涉及转座子激活导致的染色体融合与倒位。研究通过构建六种鳕鱼的高质量参考基因组,发现了北极鳕鱼特有的染色体重组及抗冻基因扩张。这些发现揭示了极端环境下物种分化与局部适应的分子遗传基础。
寒冷适应, 物种演化 | 染色体融合, 转座子 (TEs) | 比较基因组学, 染色体水平组装
Hoff, Siv N. K. · … · Jentoft, Sissel · · 2026/02/16
该研究由进化基因组学奥斯陆大学Sissel Jentoft团队完成 Genome Biology
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s13059-026-03975-6
13. Sequence bias in chromatin fragmentation leads to misinterpretation of protein-DNA interactions in vivo
染色质片段化序列偏好性可能导致蛋白质-DNA相互作用的误读。V-plots常用于评估转录因子在体内的结合,但其可靠性受到质疑。研究证明V-plots结果主要源于切割方法的序列偏好,而非真实的蛋白质结合。该发现提醒研究者在解释染色质图谱数据时需审慎对待序列基序的影响。
基因表达调控 | 蛋白质-DNA相互作用 | 染色质片段化分析, 生物信息学校验
Durán, Laura · … · Antequera, Francisco · · 2026/02/16
该研究由基因组学萨拉曼卡大学Francisco Antequera团队完成 Genome Biology
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s13059-026-04004-2
14. Distinct radial glia subtypes regulate midbrain dopaminergic neuron development
放射状胶质细胞亚型调控多巴胺神经元发育。帕金森病细胞替代疗法的发展亟需深入了解中脑多巴胺神经元的发育机制。研究通过分析小鼠和人类转录组数据,鉴定出Rgl1为祖细胞,并发现Rgl3分泌因子能促进神经元存活。该发现阐明了中脑发育的谱系关系,为优化临床相关的多巴胺神经元诱导提供了新靶点。
帕金森病 | 放射状胶质细胞, 多巴胺神经元 | 转录组分析, 细胞替代疗法
Ásgrímsdóttir, Emilía Sif · … · Arenas, Ernest · Nature Neuroscience · 2026/02/16
⭐ 该研究由神经生物学卡罗林斯卡学院Ernest Arenas团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41593-026-02200-8
15. A large-scale DNA methylation study of alcohol use identified robust associations and cell-type specific insights
大规模DNA甲基化研究揭示饮酒关联。饮酒影响健康的生物学机制尚不明确,表观遗传修饰可能发挥关键作用。本研究通过对近1.4万名参与者的全甲基组关联分析,在全血和特定免疫细胞中鉴定了1266个显著位点。这些发现揭示了Rho GTPase等新信号通路,为理解酒精暴露效应及开发治疗靶点提供了证据。
酒精使用, 成瘾 | DNA甲基化, Rho GTPase通路 | 全甲基组关联分析(MWAS)
Clark, Shaunna L. · … · Oord, Edwin J.C.G. · · 2026/02/16
该研究由生物标志物研究罗格斯大学Edwin J.C.G. Oord团队完成 Molecular Psychiatry
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41380-026-03477-8
16. Demographic and genetic factors shape the epitope specificity of the human antibody repertoire against viruses
人口与遗传因素塑造抗病毒抗体谱。了解内在与外部因素如何影响人类对病毒的体液免疫反应对疫苗设计至关重要。研究利用噬菌体免疫沉淀测序技术,分析了1212名健康成人对近10万种病毒肽的抗体反应。发现年龄、性别及HLA等遗传位点显著影响抗体特异性,揭示了免疫记忆随年龄演变的规律,为优化个性化疫苗策略提供了数据支持。
病毒感染, 免疫多样性 | 抗体库, 遗传变异(HLA) | 噬菌体免疫沉淀测序(PhIP-Seq)
Olin, Axel · … · on behalf of the Milieu Intérieur Consortium · Nature Immunology · 2026/02/16
⭐ 该研究由进化基因组学巴斯德研究所Etienne Patin团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41590-026-02432-7
17. H3K4me1 directs H3K36me2 and H3K36me3 deposition in land plants
H3K4me1引导陆生植物H3K36甲基化修饰。在动物中H3K4me1标记增强子,但在植物中的功能尚不明确。研究发现陆生植物中存在特异性识别H3K4me1的阅读器蛋白Ehd3,它能招募并激活甲基转移酶SDG724。这一机制协同介导了H3K36me2/3的沉积,揭示了植物独特的表观遗传调控网络。该成果完善了对植物基因表达调控的理解,具有重要的进化生物学意义。
植物表观遗传 | H3K4me1, Ehd3, H3K36me | ChIP-seq, 蛋白质结构解析
Wu, Jiabing · … · Dong, Aiwu · · 2026/02/16
该研究由植物生物学复旦大学董爱武团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-69632-5
18. Global genetic rewiring during compensatory evolution in the yeast polarity network
酵母极性网络补偿进化中的全球遗传重组。基因缺失导致的缺陷常通过补偿突变修复,但其对分子相互作用网络和适应性景观的影响尚不清楚。研究发现BEM1缺失后的补偿突变改变了全基因组13%基因的转座子耐受性,揭示了功能重叠在进化中的作用。该发现强调了分子网络互连性在介导功能恢复和遗传多样性中的核心地位。
补偿进化, 细胞极性 | 遗传重组, 功能重叠 | 转座子诱变筛选
Kingma, Enzo · … · Laan, Liedewij · · 2026/02/16
该研究由生物物理学代尔夫特理工大学Laan, Liedewij团队完成 EMBO Reports
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s44319-026-00709-4
19. Quantitative analysis of small RNA pseudouridylation reveals interplay of PUS enzymes in tRNA anticodon stem-loop
小RNA假尿苷化定量分析揭示酶间相互作用。假尿苷是RNA中丰富的修饰,但人类假尿苷合酶(PUS)的底物特异性及其调控机制仍不明确。研究利用PRAISE技术绘制了小RNA修饰图谱,发现多种PUS酶在tRNA修饰中存在意想不到的协同作用。该发现深化了对RNA修饰调控网络的理解,为相关生物学过程研究提供了新视角。
RNA修饰, 假尿苷化 | 假尿苷合酶 (PUS), tRNA修饰 | PRAISE定量检测
Liu, Wenqing · … · Yi, Chengqi · · 2026/02/16
该研究由化学生物学北京大学伊成器团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-69177-7
20. Acute NIPBL depletion reveals in vivo dynamics of loop extrusion and its role in transcription activation
NIPBL急性缺失揭示染色质环挤压的体内动力学。三维基因组结构的动态调节机制及其对转录的影响是当前基因组学研究的核心问题。研究通过急性耗减NIPBL,发现其对维持细胞身份基因的局部构象和超增强子邻近性至关重要。该成果阐明了NIPBL介导的环挤压在基因组组织和谱系定义基因表达中的核心作用。
基因组三维结构, 转录调控 | NIPBL, 染色质环挤压, 超增强子 | 急性蛋白质耗减, Hi-C
Popay, Tessa M. · … · Dixon, Jesse R. · Nature Genetics · 2026/02/16
⭐ 该研究由基因组学索尔克生物研究所Dixon, Jesse R.团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41588-026-02516-y
蛋白质组学
1. Population-scale analysis reveals inherited C1-inhibitor deficiency is a polyphenotypic thrombotic disorder.
C1抑制剂缺乏被证实为多表型血栓性疾病。传统认为C1INH缺乏仅与遗传性血管水肿相关,其在普通人群中的血栓风险尚不明确。通过对63万余人的基因组和蛋白质组分析,研究发现SERPING1变异显著增加静脉血栓和缺血性中风风险。这一发现为血栓风险评估提供了新的遗传标志物。
血栓性疾病 | C1抑制剂 (C1INH) | 群体规模分析, 蛋白质组学
Rodriguez Espada Alfonso · … · Bendapudi Pavan K · · 2026/02/10
该研究由心血管疾病Broad Institute的Pavan K Bendapudi团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2025017220
2. Tumor-derived S100A14 targeted astrocytes via TLR4 to Recruit myeloid-derived suppressor cells promoting brain metastasis and Curdione reversal effect.
S100A14介导星形胶质细胞重塑促进脑转移。肿瘤脑转移死亡率极高,其免疫抑制微环境的构建机制亟待阐明。研究发现肿瘤分泌的S100A14通过TLR4激活星形胶质细胞,招募髓系抑制细胞构建免疫抑制生态位,而姜黄二酮可有效抑制此过程。该研究为脑转移的早期检测和治疗提供了新靶点。
脑转移 | S100A14, TLR4, 星形胶质细胞 | 蛋白质组学, 动物模型
Feng Qian · … · Zhang Rong-Rong · · 2026/02/11
该研究由中药药理学广州中医药大学张荣蓉团队完成 Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.phymed.2026.157965
3. Structure-corona-function engineering of micelles enables rapid hepatic bioactivation of clopidogrel for emergency antiplatelet therapy.
胶束工程化促进氯吡格雷肝脏快速活化。氯吡格雷口服起效慢,限制了其在急诊冠脉介入治疗中的应用。研究通过调节聚乳酸链段长度优化胶束蛋白冠,实现了药物在肝脏的特异性摄取与快速代谢活化。该策略为急诊抗血小板治疗提供了一种起效快且可逆的转化平台,显著缩短了起效时间。
急诊抗血小板治疗 | 蛋白冠, 肝脏生物活化 | 纳米胶束, 蛋白质组学
Chen Qinying · … · Sun Chunmeng · · 2026/02/13
该研究由药剂学中国药科大学孙春萌团队完成 Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.jconrel.2026.114727
代谢组学
1. Osteoblastic USP26 regulates B lymphopoiesis by endogenous tryptophan metabolites.
成骨细胞USP26通过色氨酸代谢调节B细胞生成。骨丢失常伴随免疫功能下降,但成骨细胞退化导致免疫衰退的分子机制仍待阐明。研究发现USP26下调通过降解IL4I1破坏色氨酸代谢,减少IAA产生并抑制B细胞发育,增加败血症风险。靶向USP26/IL4I1轴为治疗骨丢失相关的免疫缺陷提供了新思路。
骨质疏松相关免疫下降 | USP26, 色氨酸代谢 | 骨靶向外泌体, 代谢组学
Ye Wenkai · … · Li Changwei · · 2026/02/11
该研究由骨科学上海交通大学医学院附属瑞金医院李昌伟团队完成 Journal of advanced research
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.jare.2026.02.010
2. Gut microbiota-derived deoxycholic acid mediates the exercise performance-potentiating efficacy of gypenosides.
肠道菌群代谢物DCA增强运动表现。绞股蓝皂苷能提高运动能力,但其通过肠道菌群发挥作用的具体机制尚不清楚。研究发现绞股蓝皂苷通过抑制肠道FXR信号,增加次级胆汁酸DCA水平,进而激活TGR5通路增强肌肉功能。该研究揭示了肠道菌群作为提高身体机能靶点的巨大潜力,为开发运动模拟物提供了依据。
运动表现增强 | 肠道菌群, 脱氧胆酸, TGR5 | 16S rRNA测序, 靶向代谢组学
Yin Xiangchang · … · Ma Baiping · · 2026/02/11
该研究由药理学军事医学研究院马百平团队完成 Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.phymed.2026.157950
3. Novel bacterium Enterocloster sp. M3 promotes colorectal tumorigenesis via the production of the carcinogen styrene.
新型肠道细菌M3通过产生致癌物苯乙烯促进结直肠癌。细菌标记物m3与结直肠癌相关,但其致病机制及菌株特性此前尚未明确。研究成功分离出M3菌株,证实其能通过新型酶类将苯丙氨酸转化为苯乙烯,并在小鼠模型中显著促进肿瘤生长。该研究揭示了肠道菌群致癌的新机制,为结直肠癌防治提供了新靶点。
结直肠癌, 肠道菌群 | 苯乙烯, 苯丙氨酸代谢 | 代谢组学, 厌氧培养
Zeng Yao · … · Liang Jessie Qiaoyi · · 2026/02/16
该研究由内科学香港中文大学Jessie Qiaoyi Liang团队完成 Gut microbes
原文链接:https://doi.org/10.1080/19490976.2026.2630481
多组学
1. Catalytic Inhibition of p300 Preferentially Targets IRF4 Oncogenic Activity and Tumor Growth in Multiple Myeloma.
p300催化抑制精准打击多发性骨髓瘤IRF4致癌活性。致癌转录因子IRF4是多发性骨髓瘤的关键依赖项,但目前尚无直接靶向药物。研究通过多组学鉴定出p300是IRF4的核心伙伴,开发的新型KAT抑制剂能特异性调节其转录网络并抑制肿瘤生长。该发现推动了p300抑制剂在骨髓瘤临床治疗中的应用。
多发性骨髓瘤 | IRF4, p300 KAT抑制 | 转录调控网络映射
Lenoir W Frank · … · Rahl Peter B · · 2026/02/16
该研究由肿瘤学Kronos Bio的Peter B Rahl团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-25-3440
2. GCN5 drives MASLD progression through LXRα/SREBP1c signaling pathway–mediated de novo lipogenesis
GCN5通过LXRα/SREBP1c通路驱动代谢性脂肪肝。代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)影响全球约四分之一人口,但其进展机制仍不明确。研究发现组蛋白乙酰转移酶GCN5在患者和模型小鼠中显著激活,通过促进脂质合成基因转录加速疾病恶化。药理学抑制GCN5可有效缓解病情,为MASLD治疗提供了极具前景的代谢干预策略。
代谢性脂肪肝(MASLD) | GCN5, SREBP1c, 脂质合成 | 转录组测序, 代谢组学
Xiao, Hai-Tao · … · Zheng, Zu-Guo · · 2026/02/16
该研究由代谢疾病南京大学郑祖国团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-69736-y
3. Melatonin's Sex‐Specific Protection Against High‐Salt Diet and Irradiation‐Induced Multi‐Organ Injury Through Microbiota–Metabolite Interactions
褪黑素通过菌群-代谢物轴发挥性别差异性多器官保护作用。高盐饮食和辐射暴露是现代公共健康的重大挑战,其诱导的损伤机制及干预手段亟待研究。研究发现褪黑素能显著减轻多器官损伤,且其对肠道菌群和色氨酸代谢的调节具有明显的性别差异。该发现为制定个性化的辐射防护和饮食干预策略提供了重要的实验依据。
辐射损伤, 高盐饮食危害 | 褪黑素, 肠道菌群-代谢轴, 性别差异 | 多组学分析, 动物模型
Xudong Ding · … · Saijun Fan · · 2026-02-16
该研究由放射医学中国医学科学院樊赛军团队完成 Journal of Pineal Research
原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/action/fedSearchRedirect?doi=10.1111%2Fjpi.70116
生物信息软件
1. Deep-Learning Tool ScVital Enables Species-Agnostic Integration of Cancer Cell States.
深度学习工具scVital实现跨物种癌症细胞状态整合。跨物种单细胞数据比较常受生物批次效应干扰,限制了小鼠模型向临床的转化。scVital利用变分自编码器将数据嵌入物种无关空间,成功识别了胰腺癌和肺癌中跨物种共享的细胞状态。该工具显著增强了小鼠模型在肿瘤转化研究中的应用价值。
细胞状态异质性 | 跨物种生物学保守性 | 深度学习, 单细胞数据整合
Rub Jonathan · … · Betel Doron · · 2026/02/16
该研究由生物信息学威尔康奈尔医学院Doron Betel团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-24-4889
2. CanSig Benchmarks Methods for Reproducible Cancer Cell State Discovery from Single-Cell Transcriptomic Data.
CanSig为单细胞转录组发现癌症细胞状态建立基准。缺乏标准化的计算方法阻碍了癌症基因表达特征检测的可重复性。CanSig整合了多种指标评估13种方法,发现Harmony等在识别具有临床相关性的共享转录状态方面表现最优。该框架为发现可靠的癌症临床生物标志物提供了标准化工具。
癌症细胞状态 | 转录特征重复性 | 基准测试, 单细胞转录组学
Barkmann Florian · … · Boeva Valentina · · 2026/02/16
该研究由机器学习苏黎世联邦理工学院Valentina Boeva团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-25-0940
3. eccDNA2Ca: an ensemble deep learning framework for interpretable prediction of cancer-associated extrachromosomal circular DNA.
eccDNA2Ca实现癌症相关染色体外环状DNA的精准预测。eccDNA是驱动癌症异质性和耐药的关键,但缺乏评估其功能和临床意义的计算工具。该框架整合深度学习与集成学习,能从原始序列预测癌症相关eccDNA,并揭示了重复序列和转录因子结合位点的贡献。该工具为eccDNA功能研究和生物标志物发现提供了重要资源。
肿瘤异质性 | 染色体外环状DNA (eccDNA) | 深度学习, 集成学习
Zhou Lina · … · Zou Lingyun · · 2026/02/12
该研究由临床数据研究重庆大学附属中心医院邹凌云团队完成 Journal of advanced research
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.jare.2026.02.014
4. GutMIND: A multi-cohort machine learning framework for integrative characteristics of the microbiota-gut-brain axis in neuropsychiatric disorders.
GutMIND框架助力神经精神疾病肠脑轴的整合研究。肠脑轴研究面临样本量小、异质性高和方法不统一等挑战。研究构建了涵盖3492个样本的最大肠脑微生物数据库,并开发了MetaClassifier诊断模型和健康指数。该框架为神经精神疾病的微生物组诊断和个性化治疗提供了有力工具。
神经精神疾病, 肠脑轴 | 肠道菌群, 代谢产物 | 机器学习, 宏基因组学
Ju Yanmei · … · Guo Ruijin · · 2026/02/16
该研究由生物信息学华大基因Guo Ruijin团队完成 Gut microbes
原文链接:https://doi.org/10.1080/19490976.2026.2630563
5. Adjoint propagation of error signal through modular recurrent neural networks for biologically plausible learning.
模块化循环神经网络的伴随传播框架实现生物学合理的学习。理解大脑学习机制并构建智能系统需要克服传统反向传播算法在生物学上的局限。研究引入伴随传播(AP)框架,使误差信号随前向推理同步传播,在多项任务中达到与反向传播相当的准确率。该框架为神经科学实验提供了理论指导,并为能效智能系统开发奠定了基础。
生物学习机制 | 循环神经网络 | 伴随传播算法
Liu Zhuo · … · Chen Tao · · 2026/02/16
该研究由微电子学中国科学技术大学Chen Tao团队完成 eLife
原文链接:https://doi.org/10.7554/eLife.108237
6. Prediction of SARS-CoV-2 transmission dynamics based on population-level cycle threshold values: An epidemic transmission and machine learning modeling study.
基于群体Ct值的机器学习模型可准确预测新冠病毒传播动态。PCR循环阈值(Ct)反映病毒载量,可用于估算群体感染趋势。研究结合流行病传播模型与机器学习,利用真实世界数据成功预测了奥密克戎时期的发病率和再生数。这种建模方法可作为实时监测的补充工具,指导公共卫生干预。
新冠肺炎, 病毒传播 | 病毒载量 (Ct值) | 机器学习, 流行病学建模
Khan Afraz Arif · … · Hogan Catherine A · · 2026/02/16
该研究由公共卫生不列颠哥伦比亚疾病控制中心Hogan Catherine A团队完成 eLife
原文链接:https://doi.org/10.7554/eLife.95666
7. Accurate Physics-Based Flexible Docking of Macrocyclic Ligands.
基于物理的新型柔性对接协议提升大环配体模拟准确性。大环化合物因其尺寸和受限构象空间,在计算建模和药物发现中面临巨大挑战。研究开发了结合构象采样与小分子对接的新协议,在240个多样化系统中实现了82%的结合模式预测准确率。该方法显著优于现有工具,为大环类药物的结构化设计提供了有力支持。
药物设计 | 大环化合物 | 柔性对接, 分子动力学
Robson-Tull Jacob · Rodrigues João P G L M · · 2026/02/16
该研究由计算化学薛定谔公司Rodrigues João P G L M团队完成 Journal of medicinal chemistry
原文链接:https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c03392
8. The BIOPREVENT machine-learning algorithm predicts chronic graft-versus-host disease and mortality risk using posttransplant biomarkers.
BIOPREVENT算法精准预测移植物抗宿主病风险。慢性移植物抗宿主病(cGVHD)是造血干细胞移植后的主要死亡原因。研究开发了整合血浆蛋白与临床变量的机器学习模型,显著提升了预测准确性。该工具可指导临床预防性治疗,降低移植后死亡率。
慢性移植物抗宿主病 | MMP3, CXCL9 | 机器学习, 生物标志物预测
Martens Michael J · … · Paczesny Sophie · · 2026/02/16
该研究由免疫学南卡罗来纳医科大学Paczesny Sophie团队完成 The Journal of clinical investigation
原文链接:https://doi.org/10.1172/JCI195228
9. Bridging technical innovation and computational advances in studies of RNA–protein assemblies
技术创新与计算进步助力RNA-蛋白质复合物研究。RNA依赖的蛋白质组装体在剪接和翻译等核心生命过程中发挥关键作用。本文综述了实验技术与人工智能算法在解析这些复合物结构与动力学方面的最新进展。通过整合高通量实验数据与机器学习模型,研究者能够更精准地预测功能并设计新型核糖核蛋白,为疾病治疗和药物研发提供了闭环研究新范式。
RNA-蛋白质组装 | 剪接体, 核糖体 | 人工智能, 机器学习
Ducoli, Luca · … · Khavari, Paul A. · Nature Reviews Genetics · 2026/02/16
⭐ 该研究由皮肤病学与遗传学斯坦福大学Paul A. Khavari团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41576-026-00931-9
10. Deciphering DEL pocket patterns through contrastive learning
对比学习助力识别DNA编码化合物库靶点口袋。DNA编码化合物库(DEL)是药物筛选的重要技术,但靶点兼容性限制了其成功率。研究开发了名为ErePOC的口袋表示模型,利用对比学习捕捉蛋白质结合口袋的结构与功能特征。该模型能以98%的准确率预测适合DEL筛选的人类蛋白,为提高药物研发效率和优化靶点选择提供了强有力的计算工具。
药物发现, 靶点选择 | 结合口袋, 蛋白质表示 | 对比学习, DNA编码化合物库(DEL)
Zhang, Wenyi · … · Huang, Jing · · 2026/02/16
该研究由计算生物学西湖大学黄晶团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-69663-y
11. Environment, taxonomy, and socioeconomics predict non-imperilment in freshwater fishes
机器学习预测全球淡水鱼类的受威胁状态。淡水鱼类是受威胁最严重的类群之一,但许多物种仍缺乏完整的保护评估。研究构建了一个整合环境、社会经济和物种内在特征的机器学习框架,对全球万余种淡水鱼的受威胁风险进行了预测。结果显示生殖生境和分类学特征是关键预测因子。该方法为全球生物多样性风险评估提供了一个可扩展且高精度的科学工具。
生物多样性保护 | 物种受威胁状态 | 随机森林, 机器学习
Murphy, Christina A. · … · Dunham, Jason · · 2026/02/16
该研究由生态学俄勒冈州立大学Jason Dunham团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-025-68154-w
12. Graph neural networks for computational nephrology
图神经网络在计算肾脏病学中的应用前景。肾脏疾病涉及复杂的组织架构和器官间相互作用,传统人工智能模型难以有效表征这些几何关系。本文探讨了图神经网络在模拟肾脏组织病理学及多器官网络交互中的统一框架作用。该技术为精准肾脏病学建模和复杂疾病机制研究提供了强有力的计算工具。
肾脏疾病 | 组织架构建模, 器官间相互作用 | 图神经网络 (GNN)
Schaub, Michael T. · Boor, Peter · Nature Reviews Nephrology · 2026/02/16
⭐ 该研究由肾脏病理学亚琛工业大学Boor, Peter团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41581-026-01059-z
13. Computation and deep-learning-driven advances in CRISPR genome editing
计算与深度学习驱动CRISPR基因编辑进化的综述。CRISPR系统正变革生物医学,但其工程化优化和分子机制的深入理解仍面临巨大挑战。本综述探讨了深度学习结构预测、物理模拟及大语言模型在优化CRISPR系统中的关键贡献。该研究强调了计算建模工具在开发下一代可编程基因编辑工具中的转型作用。
基因编辑优化 | CRISPR-Cas系统 | 深度学习, 结构预测, 蛋白质工程
Pindi, Chinmai · Palermo, Giulia · Nature Structural & Molecular Biology · 2026/02/16
⭐ 该研究由计算化学加州大学河滨分校Palermo, Giulia团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41594-025-01739-7
14. Machine learning-predicted insulin resistance is a risk factor for 12 types of cancer
机器学习预测的胰岛素抵抗增加多种癌症风险。胰岛素抵抗被认为是癌症的重要风险因素,但此前缺乏大规模流行病学证据的直接支持。研究利用机器学习模型AI-IR分析英国生物库数据,证实其能显著预测糖尿病及12种癌症的发生风险。该模型为识别癌症高危人群和开展针对性临床筛查提供了强有力的预测工具。
胰岛素抵抗, 癌症风险 | 代谢紊乱与肿瘤发生 | 机器学习, 流行病学分析
Lee, Chia-Lin · … · Hiraike, Yuta · · 2026/02/16
该研究由代谢病学东京大学Hiraike, Yuta团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-68355-x
声明:本文使用了AI进行翻译和总结