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2026.02.25
近日,苏州勤浩医药(Genhouse Bio)Faridoon博士/张贵平博士团队在药物化学权威期刊Journal of Medicinal Chemistry上发表了一篇题为"MAT2A抑制剂的征程:从实验室到高级临床试验"的综述论文。该综述系统梳理了MAT2A抑制剂从早期底物竞争性分子到现代变构抑制剂的发展历程,重点阐述了其精准靶向MTAP缺失肿瘤的"合成致死"机制——通过耗竭S-腺苷甲硫氨酸(SAM)协同抑制PRMT5活性,最终导致肿瘤细胞死亡。文章详细回顾了从辉瑞PF-9366、Agios公司AG-270到Ideaya公司IDE397等代表性分子的结构优化策略与临床转化进程,特别介绍了勤浩医药自主研发的脑渗透型候选化合物GH31的最新进展。此外,综述还探讨了下一代抑制剂的理性设计方向,包括解决轴手性异构体问题、开发蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)等创新策略,为MTAP缺失型癌症(约占全部肿瘤的15%)的精准治疗提供了重要的理论指导与临床参考。
01
INTRODUCTION
研究背景
S-腺苷甲硫氨酸(SAM)是细胞转甲基反应的主要甲基供体,在表观遗传基因调控、细胞生长、分化和程序性细胞死亡中发挥关键作用。SAM由甲硫氨酸腺苷转移酶(MATs)通过ATP依赖反应利用甲硫氨酸(Met)为底物合成,对多胺和谷胱甘肽的生物合成以及核酸、蛋白质、磷脂、组胺和生物胺的甲基化至关重要。哺乳动物中MAT酶由三个基因编码:MAT1A和MAT2A编码催化亚基,MAT2B编码调节亚基。MAT1A主要在肝脏表达,而MAT2A和MAT2B在非实质肝细胞和肝外组织中广泛表达。尽管MAT1A和MAT2A具有85%的结构同源性,MAT2A对Met的亲和力更高,表现出不同的酶动力学特性。研究表明,通过RNA干扰沉默MAT2A可选择性抑制癌细胞增殖,特别是在缺乏甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的癌症中。MTAP在甲硫氨酸补救途径中降解多胺代谢副产物甲硫腺苷(MTA),在约15%的癌症中被缺失,在胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌和胰腺导管腺癌中频率较高。MTAP缺失导致细胞内MTA积累,抑制蛋白精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)。在MTAP缺失的癌细胞中,MAT2A抑制进一步降低PRMT5的甲基供体SAM水平,从而协同增强对PRMT5活性的抑制,破坏RNA剪接、转录调控和基因组稳定性等基本细胞过程,最终触发程序性细胞死亡。这种合成致死相互作用为药物发现提供了令人信服的依据,使MAT2A抑制剂成为针对MTAP缺失癌症特定脆弱性的靶向治疗方法。
02
RESULTS
①MAT2A功能与调控的结构洞察
结构分析已获得多种人源MAT2A晶体结构,捕获了不同的构象状态和配体结合形式,包括底物类似物、抑制剂和调节复合物,阐明了MAT2A的功能灵活性和可成药性。MAT2A与肝特异性同工酶MAT1A具有高度结构同源性,两者RMSD仅为0.41Å,均包含三个结构域,需要二聚化形成功能性活性位点,每个单体为两个活性位点提供必需残基,疏水界面支持二聚体形成和稳定性。MAT酶的一个关键保守特征是门控环(残基113-131),其表现出高构象灵活性:无配体时呈无序或开放构象,底物或产物结合时折叠覆盖活性位点,协助底物定位和过渡态稳定。MAT2A以同源二聚体形式存在活性状态,也可与调节亚基MAT2B形成功能相关的异源复合物,MAT2B以纳摩尔亲和力以2:1比例结合MAT2A同源二聚体,提供变构调节而不改变催化位点,虽不改变MAT2A的内在催化速率,但增加酶对SAM反馈抑制的敏感性。催化循环始于Met的硫原子对ATP的5'-碳进行亲核攻击形成SAM,随后三磷酸的β-γ磷酸键水解,快速释放焦磷酸后和无机磷酸,停流实验确定SAM形成为限速步骤。这些机制见解强调了底物结合口袋、过渡态稳定基序和调节界面作为抑制剂设计靶点的相关性,特别是门控环和MAT2A-MAT2B界面的构象变化为设计影响反馈调节或酶协同性的变构调节剂提供了支持。
②早期底物竞争性和二苯乙烯类MAT2A抑制剂
尽管MAT2A近期才成为治疗靶点,但甲硫氨酸类似物自20世纪60年代起即被研究。环亮氨酸(1)是一种弱效的不可代谢MAT抑制剂,对MAT同工酶的Ki值在209-1633 μM之间,虽效力不足但为后续抑制剂设计提供了参考点。后续类似物包括DL-2-氨基-4-己烯酸及其反式异构体,以及L-2-氨基-4-己烯酸(2)和(Z)-2-氨基-5-氯-反式-4-己烯酸(3)等衍生物,显示出MAT亲和力的适度改善,但对MAT2A的选择性差且亲和力有限,限制了其转化潜力。FIDAS-3的鉴定引入了更具成药性的二苯乙烯骨架用于MAT2A抑制,该化合物显示出中等MAT2A抑制活性(IC50 = 4.9 μM)和良好的药代动力学性质,对接模拟表明其占据MAT2A二聚体的SAM结合口袋。为提高效力和水溶性,后续构效关系研究探索了引入含氮杂环(如吡啶和嘧啶环)以及卤素等取代基的策略,优化得到FIDAS-5,其MAT2A抑制活性显著提高(IC50 = 2.1 μM)。FIDAS-3和FIDAS-5均能抑制c-Myc和Cyclin D1表达,增加p21WAF1/CIP1水平,并降低MAT2A驱动的结直肠癌类器官活力,但脱靶氧化还原活性限制了其进一步开发。这些二苯乙烯抑制剂虽本身不适合作为先导化合物,但为后续MAT2A靶向项目提供了框架,证明了小分子调控的可行性,指出了潜在的关键药效团特征,并提示了后续需避免的问题。
③辉瑞的变构抑制剂:一种新的机制策略
2017年辉瑞披露新型变构抑制剂PF-9366,显著改变了MAT2A抑制剂开发格局。辉瑞通过高通量筛选发现PF-9366,其结合模式经X射线晶体学确证(PDB: 5UGH)。PF-9366以IC50为420 nM抑制MAT2A,在癌细胞中抑制SAM产生,在H520细胞中以IC50为1.2 μM降低SAM水平。其结合二聚体特异性变构口袋的能力是关键优势,可在高度保守的ATP和Met底物位点(MAT同工酶共有)之外实现选择性抑制,避免直接竞争。除直接酶抑制外,PF-9366还破坏MAT2A-MAT2B相互作用,该调节配对可增强MAT2A活性,阻断此相互作用可能限制MTAP完整细胞中的代偿性MAT2A激活,提高对MTAP缺失癌症的功能选择性。然而,PF-9366也触发MAT2A表达上调,这种反馈反应抵消了其抑制效应,最终降低抗增殖效力。
④AG-270:首个进入临床的变构MAT2A抑制剂
Agios公司通过虚拟筛选鉴定MAT2A结合片段,化合物7显示出良好的MAT2A抑制活性(IC50 = 1.5 μM)。基于结构的优化提高了效力,通过用策略性定位的酚羟基取代Gly193附近的结构化水分子,获得低纳摩尔MAT2A抑制剂AGI-24512。然而,AGI-24512因哌啶取代基相关的氧化不稳定性而表现出较差的代谢稳定性。将该基团替换为苯环降低了肝脏清除率(人微粒体ER = 0.16),得到AGI-25696,该化合物表现出优异的代谢稳定性,转化为持续的体内暴露。在KP4细胞来源的异种移植(CDX)模型中口服给药300 mg/kg,实现68%的肿瘤生长抑制(TGI)且无显著体重下降。尽管体内疗效令人鼓舞,AGI-25696却存在不利的高血浆蛋白结合和有限渗透性,这些缺陷归因于核心骨架的互变异构体依赖性酸性。为解决这些问题,设计策略转向通过分子内氢键稳定单一、酸性较低的互变异构体。引入2-吡啶基取代基有效掩蔽了酸性N-H,提高了骨架pKa,增加了游离分数,同时保持强效的酶活性和细胞活性。这些综合设计元素产生了AG-270,一种口服生物利用度高、纳摩尔级MAT2A抑制剂,具有优化的理化性质、高代谢稳定性和选择性体内疗效,在200 mg/kg剂量下于KP4 MTAP缺失CDX模型中实现67% TGI。AG-270与MAT2A和SAM结合的共晶结构(PDB: 7KCC)证实了预期的结合模式和分子内氢键设计。尽管AG-270显示出令人鼓舞的临床前安全性特征,但其UGT1A1抑制(IC50 = 1.1 μM)和OATP1B1抑制(IC50 = 2.1 μM)两种脱靶风险提示潜在的高胆红素血症风险。尽管如此,AG-270作为首个临床MAT2A抑制剂获得推进,为靶向MTAP缺失癌症中SAM依赖性脆弱性的下一代疗法奠定了基础。
图片来源:ACS
⑤AG-270启发的MAT2A抑制剂的结构引导演化
Agios公司开展高通量筛选以鉴定具有脑渗透潜力的MAT2A抑制剂,作为下一代项目的一部分,鉴定出多个适合优化的骨架,化合物11成为早期先导化合物。将化合物11与AG-270进行结构叠合指导重新设计,将螺醚转化为螺内酰胺骨架,以容纳茴香醚基团,重现AG-270中观察到的极性相互作用,该修饰得到化合物12,效力提高20倍以上,但该类似物仅实现约50%的MAT2A最大抑制。为增强变构效力,设计策略接下来集中于配体轨迹的刚性化,用构象受限的芳基吡啶酮核心替换螺环恢复了最佳几何构型,得到AGI-41998,一种高效MAT2A抑制剂,具有强细胞活性,并首次证明该靶点类别的脑渗透能力。然而,其显著的人孕烷X受体(hPXR)激活需要通过调节亲脂性和极性表面积(PSA)来缓解。这一目标促使在右侧芳环上安装稠合杂环,其中2-甲基吲唑得到AGI-43192,具有平衡的效力和降低的PXR激活。尽管AGI-43192成为外周活性MAT2A抑制剂,但其升高的PSA降低了穿越血脑屏障的能力。最终的优化周期通过降低PSA和去除与外排识别相关的氢键供体来解决这一限制。从嘧啶转换为吡啶核心、引入O-连接侧链以及去除选定氟原子共同改善了渗透性,同时保持可接受的亲脂性。这些优化产生AGI-44131,一种强效、脑渗透性MAT2A抑制剂,具有可管理的PXR特征。然而,慢性给药显示所有测试剂量水平均出现剂量依赖性体重下降,表明全身毒性,最终阻碍了其进一步开发。从化合物11到AGI-44131的优化展示了如何系统调节效力、PXR风险和血脑屏障穿透。这些设计原则为开发针对外周或中枢神经系统应用的下一代MAT2A抑制剂提供了框架。利用Agios和先声药业(如化合物16)已发表的构效关系见解,武汉宇翔医药科技有限公司的研究人员设计了三环四氢苯并[4,5]咪唑并[1,2-a]吡嗪骨架作为新型MAT2A抑制剂。该骨架的优化得到化合物17,表现出强效的低纳摩尔酶抑制和稳健的MTAP缺失癌细胞抗增殖活性。分子模拟表明三环核心适合MAT2A变构口袋,与Gln190-Gly193残基形成π-π和疏水相互作用。战略性引入酰胺基团将化合物17转化为化合物18,使系统暴露量增加3倍以上,产生有利的药物代谢和药代动力学(DMPK)特征。化合物17和18说明了结构引导设计与药代动力学调节相结合如何增强靶点结合和暴露。这些发现强化了AG-270启发骨架作为下一代MAT2A抑制剂基础的潜力。从AGI-41998出发,Li等人应用骨架跃迁策略鉴定能够保留必需变构相互作用同时改善MTAP选择性细胞活性的替代MAT2A抑制剂核心。用7(8H)-蝶啶酮框架替换AGI-41998双环系统保持了与Arg313的关键氢键,并保留了外围取代基朝向疏水口袋和溶剂界面的取向。通过在蝶啶酮系列中进行系统的构效关系优化,引入1-甲基苯并咪唑取代基产生化合物19,保留了MAT2A抑制,并在B16F10 MTAP缺失与野生型细胞中实现了>64的高选择性指数。转换为2(1H)-喹喔啉酮骨架产生化合物20。化合物20保持了对MAT2A的高水平酶抑制,并在多种癌细胞系中表现出广泛的MTAP缺失选择性、持续的系统暴露,以及在MTAP缺失异种移植模型中清晰的体内抗肿瘤疗效。从AGI-41998到化合物19再到化合物20的进展突显了骨架跃迁在推动MAT2A抑制剂发现中效力、细胞选择性和体内活性改善方面的力量。以量子化学计算为设计指导,通过改变双环核心骨架中氮原子的数量和空间取向合成了化合物22。化合物22的特征是显著降低的HOMO-LUMO能隙为2.81 eV,相比之下化合物21为3.79 eV。这一电子变化赋予化合物22黄色荧光(λmax 585 nm),其荧光实现了活细胞成像。化合物22保持了对MAT2A的低纳摩尔抑制(IC50 = 26 nM),并选择性抑制MTAP缺失的HCT116细胞增殖,对HCT116野生型细胞毒性最小。化合物22是治疗诊断型MAT2A抑制剂的罕见例子,将功能成像与选择性抗肿瘤活性相结合。这种方法展示了电子结构引导设计如何将酶抑制剂扩展到实时肿瘤成像。
⑥来自阿斯利康片段骨架的MAT2A抑制剂
阿斯利康采用基于结构的片段合并策略,从低亲和力片段苗头化合物开发MAT2A抑制剂。初始筛选鉴定出三嗪酮23和喹唑啉24为弱MAT2A结合剂,结构分析将其整合为基于喹唑啉-2(1H)-酮的化合物25,显示出改善的结合亲和力和类药性质。晶体结构(PDB: 7BHT)证实化合物25结合MAT2A变构口袋,与关键残基Arg313形成双齿氢键。后续优化集中于从25的N1位点进行片段延伸,靶向MAT2A相邻的芳香侧链口袋。初始用小型烷基取代虽可耐受但未带来显著增益,关键突破是在该位置引入苯基,得到化合物26,这一修饰使生化效力提高约400倍(IC50 = 22 nM)。晶体结构揭示苯基环有效 displaces 两个高能水分子,与Phe333形成CH-π相互作用,并完美互补口袋的疏水环境。在细胞模型中,化合物26降低SDMA水平并抑制MTAP缺失HCT116细胞的增殖。然而,小鼠药代动力学评估显示高清除率,需要更高剂量才能实现体内疗效,皮下给药提供优越的全身暴露。在HCT116 MTAP缺失CDX模型中,每日一次皮下给药50 mg/kg使肿瘤SAM水平降低74%并实现显著TGI。化合物26的化学结构与Ideaya Biosciences已公布专利中的抑制剂匹配,这种针对Arg313药效团的特权骨架的结构趋同突显了其稳健性,并将26定位为MAT2A抑制剂理性演化的关键里程碑。为扩展其项目,阿斯利康利用差示扫描荧光法发现苗头化合物27,随后通过基于结构的设计和自由能微扰(FEP)计算优化,得到AZ'9567。结构数据确定了朝向Gly193的有效矢量,战略性地扩展到该区域产生双重收益:增强口袋填充并 displaces 桥接水网络,同时与Arg313形成直接氢键。AZ'9567在HCT116 MTAP缺失细胞中表现出强效抗增殖活性、平衡的极性、有利的亲脂性,以及在人肝微粒体(HLM <3 mL/min/mg)和大鼠肝细胞(RHeps <1 mL/min/10⁶细胞)中的低清除率。
⑦阿斯利康喹唑啉-2(1H)-酮骨架:MAT2A抑制的通用模板
该化合物面临的一个重大挑战是其差的水溶性,通过小分子晶体学追溯至高度稳定的结晶固体形式。有趣的是,控制晶体堆积的分子间相互作用与高亲和力MAT2A结合所需的药效团 substantially 重叠。由于这些相互作用对药效团至关重要,优先采用制剂方法而非结构修饰来挽救生物利用度,从而实现稳健的体内暴露。该策略证明是成功的。AZ'9567显示出强效的靶点活性,以优异选择性降低MTAP缺失细胞内的SAM并抑制SDMA产生,最终在HCT116异种移植模型中实现显著的抗肿瘤疗效。AZ'9567项目作为现代抑制剂开发的典范,展示了基于片段的、结构引导的设计如何辅以FEP等计算工具,有潜力提供强效和选择性的先导化合物。此外,它突显了一个关键的务实决策点:当分子的固体形态挑战与其高亲和力药效团内在关联时,制剂驱动的挽救可能是比广泛且可能徒劳的分子重新设计更有效的体内概念验证路径。阿斯利康基于喹唑啉-2(1H)-酮的MAT2A抑制剂的发表标志着一个转折点,为该领域提供了首个稳健的化学探针,以严格评估MAT2A抑制的治疗潜力。在随后的几年中,该骨架作为关键起点,激发了学术界和生物技术领域的众多研究团体开展工作,优化效力、选择性和类药性质。勤浩医药的先导优化采用结构引导策略,设计了化合物29的更刚性吡唑并[3,4-c]喹啉-4-酮核心,与变构抑制剂26相比。分子对接证实该环化成功保留了与Arg313的关键双齿氢键相互作用,这是药效团的基石。该设计经生化验证,化合物29强效抑制MAT2A酶活性(IC50 = 31 nM),建立了有前景的骨架用于进一步开发。为解决预期的体内清除, 降低cLogP的策略。最终,用吡啶基替换吡唑上的乙基并取代苯环,不仅改善了代谢稳定性,还通过新获得的关键水介导相互作用增强了化合物30的效力。然而,对HCT116野生型细胞的选择性有限,突显了需要进一步改进。进一步努力得到化合物31,其在吡啶环上包含环丙基。化合物31显示出增强的MAT2A抑制(IC50 = 11 nM)、抗增殖效力(HCT116 MTAP缺失细胞中IC50 = 259 nM)和强选择性指数(SI >39)。环丙基的引入产生了位阻和旋转阻碍,显著改善了代谢稳定性。化合物31表现出高血浆暴露、良好口服生物利用度和长终末半衰期,在多种MTAP缺失CDX模型中导致显著肿瘤抑制。化合物31的一个关键区别特征是其有前景且意外的CNS渗透特性。脑渗透评估显示口服给药后6小时脑/血浆比为1.87(10 mg/kg,小鼠)。使用游离药物假说的进一步分析证实Kp,uu,brain = 0.64和Kp,uu,CSF = 0.67(30 mg/kg,口服,大鼠),表明高效且平衡的CNS渗透。该特征支持其治疗CNS受累癌症的潜力,并将31定位为迄今报道的最有效脑渗透性MAT2A抑制剂之一。来自MAT2A-26共晶结构的结构见解促使寻找替代稠合杂环,导致鉴定出3H-吡啶并[1,2-c]嘧啶-3-酮骨架。代表该新核心的化合物32被选中进行优化。随后的构效关系探索得到化合物33,显示出显著改善。吡啶基的引入提供了关键水介导相互作用,增强了效力。同时,用环丙基替换代谢不稳定的N-甲基改善了代谢稳定性。该化合物在HCT116 MTAP缺失CDX模型中显示出体内疗效,降低SAM水平并抑制肿瘤生长。化合物33代表具有差异化骨架和临床前特征的有前景的体内探针,其开发突显了MAT2A抑制剂在阿斯利康骨架之外的持续演化,扩展了用结构不同、性质良好的分子靶向MTAP缺失癌症的化学空间。受Agios开发的螺环MAT2A抑制剂12和Ideaya Biosciences专利中披露的化合物34启发,上海海燕医药科技有限公司设计了一系列结构优化的螺环类似物,旨在克服立体化学限制。
图片来源:ACS
⑧MAT2A抑制中的二聚体界面靶向策略
MAT2A的同源二聚体结构为变构抑制提供了独特机会,配体通常以对称对形式结合于二聚体界面。对化合物41共晶结构的关键分析提供了重要设计见解:41的N-苯基间位取代基来自相对单体,彼此朝向仅4.2 Å的间隙。这一观察为新型策略提供了清晰的几何学依据:通过共价 tethering 设计单一的二聚体桥接分子。Insilico Medicine首先实现这一概念,开发了化合物42,该分子通过连接两个26样骨架单元构建。共晶分析证实这一单一分子占据整个变构位点。连接子几何构型和骨架接触的迭代优化似乎得到化合物43,显示出个位数纳摩尔酶抑制与细胞试验中亚微摩尔抗增殖活性的结合。这一 tethering 方法经Zhou等人验证,并开发了不同的二聚体跨越抑制剂化学系列,其最有前景的化合物44显示出强效MAT2A抑制(IC50 = 20 nM)和在HAP1 MTAP缺失细胞中卓越的抗增殖活性(IC50 = 10 nM)。
图片来源:ACS
⑨MAT2A抑制剂的临床转化:当前格局与治疗进展
MAT2A抑制剂的临床开发已获得显著动力,多个候选药物包括AG-270、S095035、IDE397、ISM3412、BG-89894和NTQ3617已进入临床评估。近期GH31获得美国FDA和中国NMPA批准进入临床试验,进一步扩展了这一前景广阔的格局。当前临床项目集中于确立治疗窗口、优化安全性特征,并在MTAP缺失癌症患者中验证疗效。AG-270在I期试验(NCT03435250)中开创性地评估了MAT2A抑制,涉及40例MTAP缺失晚期实体瘤患者,研究确定200 mg每日一次为最大耐受剂量,较高暴露水平出现剂量限制性肝毒性。药效学评估证实靶点结合,血浆SAM水平降低高达70%,并通过肿瘤SDMA降低显示PRMT5通路调节证据。然而,临床疗效有限,仅5%患者观察到部分缓解,疾病控制率为17.5%。基于这些结果及其狭窄的治疗指数,Agios终止了其开发。该项目随后被Servier收购,正在推进下一代抑制剂S095035的I/II期评估。相比之下,IDE397已成为临床先进的候选药物,显示出更有前景的疗效和安全性特征。近期在MTAP缺失尿路上皮癌和非小细胞肺癌中的I期扩展数据确定30 mg每日一次为推荐的II期剂量。在该剂量下,IDE397在27例经重度预治疗患者中实现33%的客观缓解率(1例完全缓解,8例部分缓解)和93%的疾病控制率。其有利的安全性特征以可管理的外周神经病变和无治疗相关停药为特点,代表较早期候选药物的显著进步。一个显著发现是临床获益与分子反应之间的相关性,其中81%可评估患者显示循环肿瘤DNA降低,三分之一实现>90%的下降。从首个临床候选药物AG-270到更先进的IDE397等药物的进展,反映了该领域的重要演进。初步概念验证已确立,当前努力现集中于通过改进化合物设计和患者选择策略优化治疗指数。IDE397观察到的引人注目的疗效信号,特别是与分子反应数据相结合时,为MAT2A抑制作为MTAP缺失癌症中可行治疗策略提供了强有力的验证。
图片来源:ACS
总结与展望
过去十年,MAT2A抑制剂的开发已从概念性合成致死观察推进到正在临床评估的复杂变构化学类型。这些重要工作共同确立了MTAP缺失升高细胞内MTA并抑制PRMT5活性,创造对通过MAT2A抑制进一步耗竭SAM的选择性脆弱性。结构生物学和理性药物设计已鉴定出在不靶向高度保守催化位点的情况下实现同工酶选择性抑制的变构抑制剂。这些方法使得AG-270和IDE397成为首个进入临床的MAT2A抑制剂,以及若干具有改善效力、药代动力学和中枢神经系统渗透潜力的下一代分子。实现MAT2A抑制剂全部治疗潜力的一个关键挑战是需要更精确的预测性生物标志物。虽然MTAP基因缺失是患者选择的关键靶点,但使用细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A(CDKN2A)缺失等替代生物标志物已被证明不可靠。在AG-270早期临床试验中,依赖纯合CDKN2A缺失推断MTAP缺失导致与免疫组织化学(IHC)评估的确定性MTAP蛋白缺失直接比较时仅72%的一致性率。这一显著差异表明28%的患者会基于替代标志物被错误分类,突显了在临床试验中使用直接MTAP评估方法(如IHC和下一代测序)进行准确患者分层的必要性。肿瘤可以重定向甲基基团通量或 engage 替代的一碳代谢途径以维持甲基化稳态并逃避MAT2A依赖性。适应性反应如MAT2A表达上调或替代甲硫氨酸补救途径的激活可能进一步损害长期疗效。这些观察表明单药治疗不太可能跨肿瘤类型产生持久反应,并强调需要针对互补生存途径的理性联合治疗。虽然MAT2A靶向治疗显示出潜力,但其长期安全性特征必须仔细评估。由于SAM和SAH调节全局甲基化,持续的MAT2A抑制可能影响非肿瘤组织,特别是那些具有高周转或表观遗传可塑性的组织。在临床前和早期人体试验中进行严格药理学安全性评估对解决这些问题至关重要。在化学方面,新方向正在出现。虽然迄今尚未报道传统异双功能PROTAC介导的MAT2A降解剂,但超越传统PROTAC的创新方法如超声激活降解剂已显示出靶向MAT2A消除的概念验证。例如,通过计算辅助的空穴-电子分析鉴定出一个小分子降解剂,在低强度超声激活下产生活性氧,促进MAT2A氧化损伤和随后的蛋白酶体降解,在人结肠癌细胞系中实现高达87%的蛋白耗竭。该策略可能提供持续抑制、潜在耐药性缓解和MAT2A驱动通路(包括SAM生物合成和肿瘤生长关键的下游表观遗传甲基化事件)更深抑制的途径。通过消除蛋白而非瞬时阻断,这些降解剂可能改善药效学控制并扩展MTAP缺失癌症中的治疗机会。早期化学生物学努力,包括用于降解剂设计的计算空穴-电子分析,可能产生有用的探针并最终产生临床候选药物。然而,虽然这些创新降解策略前景广阔,但其通往临床的路径需要仔细考虑。完全蛋白消除的不可逆和强效性质提高了在依赖MAT2A进行基本细胞功能的健康组织中脱靶效应和毒性的潜力。超声激活提供的精确空间控制将至关重要,其在治疗深部肿瘤中的实际应用必须彻底评估。此外,与任何新型治疗方式一样,对这些降解剂的潜在耐药机制和持续MAT2A耗竭的长期后果仍未知,需要广泛研究。总之,MAT2A抑制剂的征程展示了结构洞察、化学创新和转化生物学如何共同推进一个曾经难以捉摸的代谢靶点进入临床现实。随着药物化学、机制生物标志物和理性联合治疗的持续整合,MAT2A导向疗法有望成为MTAP缺失癌症精准肿瘤学的基石,并可能扩展到更广泛的甲基化依赖性疾病领域。
文献详细全面信息请跳转原文阅读:
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c02185
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