DB-2304

前言 AIDD Pro 根据国内外各大网站以及人工智能药物设计主流新闻网站及公众号，从 AIDD会议、AIDD招聘，重大科研进展、行业动态、最新报告发布等角度，分析挖掘了每周人工智能辅助药物设计领域所发生的、对领域技术发展产生重大推动作用的事件，旨在帮助 AIDD领域研究人员和业内人士及时追踪最新科研动态、洞察前沿热点。如果您觉得符合以上要求的内容我们有遗漏或者更好建议，欢迎后台留言。 科研进展2025年1月17日【虚拟筛选】J. Chem. Inf. Model. | 用于端到端盲对接和虚拟筛选的归一化蛋白质-配体距离似然评分2025年1月17日【蛋白质降解】Chem. Rev. | 基于蛋白质的降解剂：从化学生物学工具到新疗法2025年1月16日【SARS-CoV-2】J. Chem. Inf. Model. | 机器学习方法在发现SARS-CoV-2 PLpro抑制剂中的应用2025年1月16日【图神经网络】Ind. Eng. Chem. Res. | 基于图神经网络的高级迁移学习辅助高能材料性能预测2025年1月15日【药物-靶标相互作用】J. Chem. Inf. Model. | MVCL-DTI：利用异构图上的多视图对比学习模型预测药物-靶标相互作用2025年1月15日【药物发现】J. Med. Chem. | 一种新的基于人血清白蛋白的有效药物发现工具的开发：蛋白质质量和固定化的研究 具体信息，请滑动下方文字 1.【虚拟筛选】 分子对接是基于结构的虚拟筛选中的一项关键任务。最近的进展已经证明了基于扩散的生成模型在盲对接任务中的有效性。然而，这些模型并不固有地估计蛋白质与配体的结合强度，因此不能直接应用于虚拟筛选任务。蛋白质-配体评分函数作为一种快速、近似的计算方法来评估蛋白质与配体之间的结合强度。在这项工作中，我们引入了归一化混合密度网络（NMDN）评分，这是一种基于深度学习（DL）的评分函数，用于学习蛋白质残基和配体原子之间距离的概率密度分布。NMDN评分解决了在现有DL评分功能中观察到的局限性，并在姿势选择和虚拟筛选任务中表现稳健。此外，我们结合了一个相互作用模块来预测实验结合亲和力评分，以充分利用学习到的蛋白质和配体表征。最后，我们提出了一个端到端盲对接和虚拟筛选协议DiffDock-NMDN。对于每个蛋白质配体对，我们使用DiffDock对多个姿态进行采样，然后利用NMDN评分选择最佳结合姿态，并使用评分函数估计结合亲和力。我们的方案在LIT-PCBA数据集上实现了4.96的平均富集因子，证明在粘合剂信息有限的现实药物发现场景中是有效的。这项工作不仅提供了一个强大的基于dl的评分功能，具有优越的姿势选择和虚拟筛选功能，而且还提供了一个盲对接协议和基准，以指导未来评分功能的开发。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.4c01014 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c01014 2.【蛋白质降解】 由于降解分子有选择性地调节疾病相关蛋白的能力，靶向蛋白降解（TPD）这一新兴领域可能会给生物医学带来革命性的变化。TPD广泛应用的一个关键限制是它依赖于小分子配体来靶向感兴趣的蛋白质。这使得非结构化蛋白质或那些缺乏用于小分子结合的明确空腔的蛋白质超出了许多TPD技术的范围。使用蛋白质、多肽和核酸（也称为“生物制剂”）作为降解物中的蛋白质靶向部分解决了这一限制。在接下来的章节中，我们对使用蛋白质和肽介导降解的研究进行了全面和批判性的回顾，从而对其他具有挑战性的疾病相关蛋白质靶点进行了功能控制。我们描述了现有的基于蛋白质/肽的配体识别平台和可能用于递送生物基降解物的药物递送系统。在整个综述中，我们强调了使用基于蛋白质的降解物作为化学生物学工具的成功、挑战和机遇，以促进发现，阐明机制，并作为一种新的治疗方式。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.chemrev.4c00595 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.4c00595 3.【SARS-CoV-2】 鉴于有效药物的可得性有限，SARS-CoV-2的全球影响凸显了疫苗接种以外的治疗的必要性。辉瑞公司推出的Paxlovid是FDA批准的针对SARS-CoV-2主要蛋白酶（Mpro）的抗病毒药物，而这项研究的重点是设计针对另一种蛋白酶——木瓜蛋白酶（PLpro）的新抗病毒药物，这种蛋白酶对病毒复制和免疫抑制至关重要。NCATS/NIH从内部分子文库中对~ 15,000个分子进行高通量筛选，以0.5%的成功率确定初始命中。为了提高命中率并识别有效的抑制剂，基于机器学习的虚拟屏幕应用于约150,000种化合物，产生125种预测命中。生化评价发现了25种有前途的化合物，13种化学型的命中率为20%，IC50值在1.75 μM至<36 μM之间。进一步的模拟筛选这些化学型，作为结构-活性关系的一部分，产生了20个额外的命中。此外，化学型7的hit-to-lead优化产生了10多个类似物。这些PLpro抑制剂为开发针对COVID-19的抗病毒药物提供了有希望的模板。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.4c02126 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c02126 4.【图神经网络】 在这项研究中，我们探索了使用迁移学习来预测含能材料的性质，使用力场启发的变压器图神经网络（FFiTrNet）。我们首先在CHNOF化合物的大数据集上对模型进行预训练，然后在含能材料的实验生成焓数据的小数据集上对模型进行微调。我们的研究结果表明，与在较小的数据集上直接训练相比，迁移学习显著提高了预测生成焓的准确性，减少了平均绝对误差和均方根误差。此外，我们证明了迁移学习在预测含能材料的其他特性方面的有效性，强调了它在提高机器学习模型对一系列含能材料特性的预测能力方面的潜力。结果是最准确的最先进的模型预测高能材料的性质。微调中使用的数据集丰富了含能材料属性数据库，使这些有价值的数据可以公开用于未来的研究。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.iecr.4c03566 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.iecr.4c03566 5.【药物-靶标相互作用】 准确预测药物-靶标相互作用（DTIs）是加速药物发现和药物再利用过程的关键。MVCL-DTI是一种利用异构图预测dti的新模型，它解决了来自不同生物子网络的综合信息的挑战。它集成了邻居视图、元路径视图和扩散视图来捕获语义特征，并采用基于注意力的对比学习方法，以及多视图注意力加权融合模块，有效地集成和自适应加权来自不同视图的信息。在各种条件下对基准数据集进行测试，包括改变正负样本比、进行硬负抽样实验、屏蔽不同比例的已知dti以及具有各种相似度量的冗余dti， MVCL-DTI表现出很强的鲁棒泛化能力。然后将该模型用于预测新型dti，特别关注与covid -19相关的药物，突出了其实用性。最终，通过特征可视化和计算特性分析，我们确定了关键元素，包括基因本体和取代节点，以及适当的初始化策略，强调了它们在DTI预测任务中的重要作用。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.4c02073 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c02073 6.【药物发现】 人血清白蛋白（HSA）与活性药物成分（api）的结合能力是药物发现早期最重要的参数之一。在本研究中，开发了一种基于固定化hssa的工具，用于快速简便地体外筛选API的结合。这项工作探讨了在过去五年中发表的用于体外筛选的HSA鉴定的严重不完整性。为了缓解这一问题，对最常用的HSA类型进行了全面的分析和固定研究。在一组选定的原料药上，观察到HSAs的胶体稳定性及其与原料药的结合能力存在严重差异。以戊二醛（GDA）或环己基-二甘油酯醚（CDGE）为连接剂，将HSA固定在磁性纳米颗粒上，这两种连接剂以前从未用于固定化HSA。HSA-MNP-CDGE复合物具有较高的固定化产率和保持原料药结合能力；然而，HSA的酯酶样酶活性明显降低。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.4c02136 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c02136 上下滚动查看更多 药企动态2025年1月17日【再鼎医药】再鼎医药抗精分药KarXT申报上市2025年1月17日【费米子】国内首个！SSTR4靶点镇痛药物，先声药业与费米子达成合作2025年1月16日【礼来】礼来：IL-23单抗Mirikizumab的CD适应症获FDA批准上市！2025年1月16日【映恩生物】首创自免ADC！映恩生物BDCA2 ADC新药申报临床2025年1月15日【第一三共】全球首款！第一三共抗肿瘤新药「吡昔替尼」国内报上市2025年1月15日【勃林格殷格翰】疾病控制率达93%！靶向HER2肺癌新药在中国申报上市各动态具体信息，请滑动下方文字 1.【再鼎医药】 1月17日，再鼎医药宣布KarXT（呫诺美林+曲司氯铵）用于治疗成人精神分裂症的新药上市申请（NDA）已获国家药品监督管理局（NMPA）受理。 链接网址请戳我 2.【费米子】 2025年 1月 17 日，先声药业（2096.HK）和广州费米子科技有限责任公司共同宣布，双方已就一款靶向SSTR4的临床阶段镇痛候选创新药FZ002-037达成合作。根据协议，先声药业将获得大中华地区（中国大陆、香港、澳门和台湾）开发和商业化FZ002-037的独家权利。费米子科技将获得首付款及里程碑付款，以及基于未来销售额的分层特许权使用费。 链接网址请戳我 3.【礼来】 1月16日，礼来宣布，美国FDA已批准其药品Omvoh（mirikizumab）用于治疗成人中度至重度活动性克罗恩病（CD）。临床试验结果显示，在关键的 3 期 VIVID-1 试验中，第一年达到临床缓解和内镜缓解的患者，在开放标签扩展试验中接受治疗一年后（即连续治疗两年），近90%的患者维持了临床缓解。根据新闻稿，Omvoh是15年来首个在获批时公开两年3期克罗恩病疗效数据的生物制品疗法。 链接网址请戳我 4.【映恩生物】 1月16日，CDE官网公示，映恩生物申报的“注射用DB-2304”临床试验申请获受理。据公开资料，DB-2304拟用于系统性红斑狼疮（SLE）等自身免疫性疾病。DB-2304是映恩生物研发的一款BDCA2靶向ADC。此前官方新闻稿指出，DB-2304不仅是全球首款靶向BDCA2靶点的免疫调节型ADC，也是全球首款针对SLE的ADC。 链接网址请戳我 5.【第一三共】 1 月 15 日，CDE 官网显示，第一三共新药盐酸吡昔替尼胶囊（PLX3397,Pexidartinib）报上市，适应症为治疗伴有重度病变或功能受限且无法通过手术改善的症状性腱鞘巨细胞瘤（TGCT）成年患者，此前已正式纳入优先审评。这是目前全球首个也是唯一一个获批治疗 TGCT 的药物。 链接网址请戳我 6.【勃林格殷格翰】 今日（1月15日），中国国家药监局药品审评中心（CDE）官网公示，勃林格殷格翰（Boehringer Ingelheim）申报的宗格替尼片上市申请已经获得受理。该产品近期已经被CDE正式纳入优先审评，适应症为治疗携带HER2（ERBB2）激活突变且既往接受过系统治疗的不可切除或转移性非小细胞肺癌（NSCLC）成人患者。 链接网址请戳我 上下滚动查看更多 会议信息 2025年3月27-28日 上海恺默信息咨询有限公司举办SIT 2025第七届小分子药物创新峰会 2025年6月27-28日 美国华人生物医药科技协会中国分会（CBA-China）主办，苏州云程万川（盛杰）承办2025美国华人生物医药科技协会CBA-China中国年会 各会议具体详情和参会方式，请滑动下方文字 SIT 2025第七届小分子药物创新峰会 主办方：上海恺默信息咨询有限公司 会议时间：2025年3月27-28日 会议地点：上海 会议主旨：聚焦减重药物的突破性研究、多肽药物的最新进展以及不可成药靶点的攻克。将深入探讨小分子药物的创新路径，分享业内最前沿的技术与策略。共同探索小分子药物的无限可能，携手推动药物研发领域的持续进步。 链接网址请戳我 22025美国华人生物医药科技协会CBA-China中国年会 主办方：美国华人生物医药科技协会中国分会 会议时间：2025年6月27-28日 会议地点：苏州 会议主旨：立足国际视野及产业高度，以创新为引领，围绕全球最新监管动态、新技术/AI革新及成果转化、先进治疗技术、药物创新开发、全球药物开发策略、新兴市场出海布局等前沿热门话题，共同探索前沿技术创新与全球医药合作，促进新质生产力培育及未来产业发展，推动全球健康事业新发展。 链接网址请戳我 上下滚动查看更多 版权信息 本文内容均由小编收集于公开的各个网络平台，发布的目的仅为了方便大家一站式了解AIDD行业信息，并未对发布源头进行真实性验证。如您发现相关信息有任何版权侵扰或者信息错误，请及时联系AIDD Pro（请添加微信号sixiali_fox59）进行删改处理。 原创内容未经授权，禁止转载至其他平台。有问题可发邮件至sixiali@stonewise.cn 关注我，更多资讯早知道↓↓↓