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BIO Integra：单细胞RNA测序分析揭示了不同的人类自身免疫性疾病中免疫细胞的异质性

2023-09-25

细胞疗法

来自中国中山大学等机构的科学家们通过研究成功整合了五种不同的自身免疫性疾病中的外周血细胞的scRNA-seq数据。

自身免疫性疾病是一类因健康细胞、组织或器官受到异常的免疫攻击所引发的一组疾病，单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）或能提供单细胞分辨率的转录组信息，从而为研究人类的自身免疫性疾病提供一种新方法，然而，大多数的单细胞RNA测序研究往往只关注一种自身免疫性疾病。

近日，一篇发表在国际杂志BIO Integration上题为“Single-Cell RNA-Sequencing Integration Analysis Revealed Immune Cell Heterogeneity in Five Human Autoimmune Diseases”的研究报告中，来自中国中山大学等机构的科学家们通过研究成功整合了五种不同的自身免疫性疾病中的外周血细胞的scRNA-seq数据，同时对这些数据中所有的免疫细胞进行了维度分类、细胞交流分析、单核细胞、NK细胞群的再聚类分析，以及不同的基因表达分析和功能富集分析。这五种免疫性疾病包括IgA肾病（IgAN）、川崎病（KD）、多发性硬化症（MS）、干燥综合症 (SS,Sjogren's syndrome)和系统性红斑狼疮（SLE）。

BIO Integra：单细胞RNA测序分析揭示了不同的人类自身免疫性疾病中免疫细胞的异质性

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来源: 生物谷

单细胞RNA测序分析揭示了不同的人类自身免疫性疾病中免疫细胞的异质性。

图片来源：BIO Integration (2023). DOI:10.15212/bioi-2023-0012

研究人员对这五种自身免疫性疾病中的外周血细胞的scRNA-seq结果进行了整合分析，所有样本包括18种不同的免疫细胞亚群，但这五种疾病中的细胞群数量各不相同。通过进行细胞间交流网络分析，研究人员发现，在IgAN和SLE患者中，经典和非经典的单核细胞的型号会明显增强，原始B细胞的信号在KD患者中也会增加；有意思的是，NK和NK-T细胞的信号在SS患者中会增强，但在IgAN和SLE患者中则会减弱。

对经典和非经典单核细胞亚群的转录组分析进一步揭示了，促炎性细胞因子和干扰素相关基因（包括CCL3、IL1B、ISG15和IFI6）在IgAN和SLE患者中都会明显增加；与单核细胞不同的是，NK细胞的数量和标志基因在IgAN和KD患者在红会减少，但在SS患者中却会增加，与此同时，两种NK-T细胞亚群仅在SS患者中能发现。

综上，本文研究中，基于单细胞RNA测序结果的整合，研究人员阐明了五种不同的自身免疫性疾病中的免疫细胞免疫景观蓝图在免疫细胞亚群、群体、差异表达基因和细胞间通讯网络方面的改变，相关研究数据进一步揭示了不同自身免疫性疾病的异质性和相似性。（生物谷Bioon.com）

原始出处:

Luo, Siweier，Wang, Le，Xiao, Yi, et al. Single-Cell RNA-Sequencing Integration Analysis Revealed Immune Cell Heterogeneity in Five Human Autoimmune Diseases, BIO Integration (2023). DOI: 10.15212/bioi-2023-0012

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