从384孔高通量到PDO模型:NCI肿瘤药筛平台为何持续选择CellTiter-Glo®?
美国国家癌症研究所(NCI)的NCI-60药物筛选面板(NCI-60 drug screening panel),由60种不同的人类癌症细胞系组成,被广泛用于体外筛选大量小分子(合成或纯化天然产物),以鉴定潜在的抗癌药物。
这一药物筛选面板代表了人类癌症的多样化横截面,涵盖了白血病、黑色素瘤以及肺癌、结肠癌、脑癌、卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌和肾癌等。NCI-60面板的开发与应用在癌症研究和药物发现中发挥了举足轻重的作用,为揭示癌症的分子基础及治疗剂作用机制提供了宝贵见解。
然而,随着药物研发进入精准医疗时代,研究人员面临的新问题也越来越明显:
一方面,希望能够以更高效率筛选越来越庞大的化合物库;
另一方面,也希望体外实验模型能够更真实地反映患者体内的肿瘤状态。
围绕这两个目标,NCI近年来对药物筛选体系进行了两次重要升级。
升级高通量筛选:从96孔到384孔
NCI过去30多年一直在升级肿瘤药筛体系,其药物筛选的方法经过了一系列的优化演变:
NCI-60建立初期,NCI采用MTT类检测方法;
1990年代初,NCI长期采用磺酰罗丹明B(SRB)的蛋白质结合染料的方法;
2022年,NCI完成了现代化升级的NCI-60 S384平台。该平台由经典96孔SRB读数升级为384孔格式,并采用CellTiter-Glo® ATP发光法作为检测终点。
对于药物筛选而言,这不仅意味着筛选速度的提升,更意味着研究人员能够以更低成本处理更大规模的候选药物库。
升级更真实的肿瘤模型:从二维细胞走向PDO
然而,仅仅提升检测效率还不足以解决药物研发中的所有挑战。要提高体外筛选结果向临床转化的成功率,实验模型本身也需要不断升级。
高通量筛选(High-Throughput Screening,HTS)能够快速评估抗癌单药及联合用药在多种细胞肿瘤模型中的活性。然而,要使筛选结果成功转化至临床患者,所采用的肿瘤模型必须具有较高的生物学相关性。与传统二维细胞系相比,患者来源类器官(PDO)直接来源于患者肿瘤组织,能够在体外保留更多肿瘤的遗传特征、组织结构和药物反应特征,因此被认为更接近临床真实情况。
PART 01
自动化类器官HTS平台
2023-2024年间, NCI建立了基于患者来源模型库(PDMR)的患者来源类器官(PDO)的高通量药物筛选平台。研究团队评估了超过230个患者来源类器官模型,包括检测其:
冻存复苏后的恢复能力
生长与扩增的可重复性
在384孔板筛选格式中,以CellTiter-Glo® 3D细胞活力检测作为终点读数时的检测性能指标。
未来,该数据库预计将扩展至所有已获批准以及绝大部分在研肿瘤药物,覆盖约1000种小分子化合物。
PART 02
结直肠癌类器官高通量联合用药筛选
2025年,NCI采用32个PDMR结直肠癌类器官开展高通量联合用药筛选,并以CellTiter-Glo® 3D终点法评价细胞活力。研究识别出若干涉及RAS/MAPK及PI3K等信号轴的候选协同组合,显示了PDO平台用于抗肿瘤联合用药发现的可行性。
PART 03
罕见癌症患者来源类器官模型药物筛选
2026年,NCI利用25个罕见癌症患者来源类器官模型,使用包含166种FDA批准肿瘤药物的化合物库,经7天处理后,以CellTiter-Glo® 3D检测细胞活力。结果显示,该筛选体系具有良好的检测性能,并观察到不同模型间具有差异性的药物反应,为罕见癌症的药物再定位和候选治疗策略研究提供了实验依据。
为何两次升级都选择CellTiter-Glo®?
Promega的CellTiter-Glo® Luminescent Cell Viability Assay(简称CTG)是基于ATP的细胞活力检测,在国内外科研及制药企业中被广泛应用,是公认的细胞活力检测“金标准”。3D版的CellTiter-Glo®进行了优化,试剂裂解能力更强,可以更高效的渗透至打的3D培养物或细胞球内。
CellTiter-Glo®有以下优势:
CellTiter-Glo® 简单、更快、更灵敏
新实施的CellTiter-Glo®工作流程也克服了SRB测定的局限性。例如,CellTiter-Glo® Assay中测量的细胞内ATP提供了有活力细胞的直接度量,其发光输出在高密度和低密度细胞培养中都具有更高的稳定性和灵敏度。CellTiter-Glo® Assay还通过使用户能够测量非贴壁细胞的细胞存活和细胞毒性,扩展了样本选择,这是SRB测定无法实现的。
CellTiter-Glo® 更适合高通量筛选
CellTiter-Glo® Assay的某些特性使其更适合高通量筛选(HTS)工作流程。与需要固定和洗涤等多个步骤的SRB测定不同,CellTiter-Glo® Assay只需将试剂直接添加到细胞中,然后在测量发光结果之前进行短暂的孵育。
CellTiter-Glo® Assay的高灵敏度和信号背景比还允许使用更少的细胞和更低的样品体积,使得NCI能够为HTS筛选操作方案采用更高孔数的平板格式。此外,CellTiter-Glo® Assay产生的稳定发光信号半衰期超过五小时。这种延长的半衰期通过消除对试剂注入器的需求并提供批量处理多个平板的灵活性,进一步改善了HTS过程,减少了在多步方法(如SRB测定)中可能引入的移液错误。
总结
从NCI-60 HTS384平台采用CellTiter-Glo®,到PDO高通量筛选使用CellTiter-Glo® 3D,我们看到的不仅是一种检测方法的应用,更是现代药物筛选对于数据质量、实验效率和临床相关性不断提升的要求。
未来,随着患者来源类器官、罕见癌症模型以及标准化类器官平台的发展,药物筛选关注的将不仅是“筛得更快”,更是“筛得更准”。而可靠的细胞活力检测,也将持续成为连接高通量筛选与临床转化的重要基础。
参
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