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前言 AIDD Pro 根据国内外各大网站以及人工智能药物设计主流新闻网站及公众号，从 AIDD会议、AIDD招聘，重大科研进展、行业动态、最新报告发布等角度，分析挖掘了每周人工智能辅助药物设计领域所发生的、对领域技术发展产生重大推动作用的事件，旨在帮助 AIDD领域研究人员和业内人士及时追踪最新科研动态、洞察前沿热点。如果您觉得符合以上要求的内容我们有遗漏或者更好建议，欢迎后台留言。 科研进展2024年11月1日【深度学习】J. Chem. Inf. Model. | 深度学习的挑战：配体诱导的变构和正构位点构象变化的蛋白质结构预测2024年11月1日【机器学习】ACS Med. Chem. Lett. | 机器学习预测白藜芦醇药物势能面：量子级计算2024年10月31日【蛋白质相互作用】Acc. Chem. Res. | 重新审视嵌入嘌呤的分子骨架，以探索蛋白质-蛋白质相互作用的未被探索的化学空间2024年10月31日【SARS-CoV-2】J. Med. Chem. | 靶向SARS冠状病毒甲基转移酶的药物发现前景：功能、结构和抑制2024年10月30日【AlphaFold】J. Chem. Inf. Model. | AlphaFold满足从头药物设计：在多靶点分子生成模型中利用结构蛋白信息2024年10月30日【小分子靶标】J. Chem. Inf. Model. | 3DSTarPred：一种基于三维形状相似性的生物活性小分子靶标预测Web服务器 具体信息，请滑动下方文字 1.【深度学习】 在生物医学研究领域，了解蛋白质的复杂结构至关重要，因为这些结构决定了蛋白质在我们体内的功能以及与潜在药物的相互作用。传统上，像x射线晶体学和低温电子显微镜这样的方法已经被用来解开这些结构，但它们通常具有挑战性，耗时且昂贵。最近，随着能够根据氨基酸序列预测蛋白质结构的深度学习算法的发展，计算生物学出现了一个突破。本研究的重点是预测蛋白质在配体结合时所经历的动态变化，特别是当它们结合到变构位点时，即与活性位点不同的口袋。变构调节剂对药物发现尤其重要，因为它们为设计更有效地靶向蛋白质且副作用更少的药物开辟了新的途径。为了研究这一点，我们整理了一个由578个x射线结构组成的数据集，这些结构由显示正构和变构结合的蛋白质组成，以及一个评估基于深度学习的结构预测方法的一般框架。我们的研究结果证明了深度学习方法的潜力和当前的局限性，不仅可以预测静态蛋白质结构，还可以预测动态构象变化。本文表明，预测变构诱导拟合构象仍然对深度学习方法提出了挑战，因为与变构诱导拟合构象相比，深度学习方法更准确地预测正构束缚构象。对于AlphaFold2，我们观察到通过改变MSA深度可以增加载脂蛋白和全息态之间的构象多样性，但这并没有增强生成接近变构诱导拟合构象的能力。为了进一步支持蛋白质结构预测领域的进展，整理的数据集和评估框架向公众开放。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.4c01475 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c01475 2.【机器学习】 在密度泛函数理论数据集上训练ANI-1x神经网络电位，作为量子级机器学习计算，研究了在极短的计算时间内预测白藜芦醇（3,5,4 ' -三羟基反式二苯乙烯）抗帕金森药物的势能面。利用密度泛函理论在wB97X/6-31G(d)理论水平上对ANI-1x深度学习技术在白藜芦醇分子上进行了全面验证。本研究的结果将为药物计算研究、药物化学、药物发现和设计提供重要的见解，从而做出宝贵的贡献。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsmedchemlett.4c00382 DOI：https://doi.org/10.1021/acsmedchemlett.4c00382 3.【蛋白质相互作用】 蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）在许多生物过程和疾病中是必不可少的，使其成为具有吸引力但具有挑战性的药物靶点。虽然在传统药物发现方面取得了许多进展，但由于缺乏专门设计用于调节这些相互作用的化学文库，靶向PPIs一直很困难。目前的文库主要集中在传统的靶蛋白，如酶或受体作为底物类似物，而不是靶向PPIs的小分子调节剂。这些传统药物靶点的行为与PPIs不同。传统的药物靶标具有相对较小的表面和结合袋，这使得它们能够被当前的文库靶向，但PPIs的行为与这些传统的药物靶标不同。为了解决这个问题，我们开发了一种基于子结构的多样性导向合成（pDOS）策略，旨在创造最大的骨骼多样性，以探索更广阔的生化空间。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.accounts.4c00452 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.accounts.4c00452 4.【SARS-CoV-2】 严重急性呼吸综合征相关冠状病毒2型（SARS-CoV-2）是2019年冠状病毒病（COVID-19）的病原体，具有高度传染性，并引发了灾难性的大流行。它已经感染了全球数十亿人，死亡人数超过600万。随着有效疫苗和抗病毒药物的加速开发，SARS-CoV-2感染及其相关死亡率和发病率显著降低。该病毒与2003年出现的SARS冠状病毒密切相关，SARS冠状病毒感染了数千人，死亡率高达10%。由于病毒的持续进化和药物诱导的耐药性，以及未来出现新型冠状病毒的可能性，需要研究新的治疗方法。病毒甲基转移酶在SARS冠状病毒复制中发挥关键作用，因此是有希望的药物靶点。本文就SARS-CoV-2和SARS-CoV甲基转移酶的功能、结构和抑制作用作一综述。讨论了靶向病毒甲基转移酶治疗病毒感染的挑战和前景。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.4c01749 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c01749 5.【AlphaFold】 深度学习和生成模型的最新进展极大地扩展了药物类化合物虚拟筛选的应用。在这里，我们介绍了一个多靶点转换模型PCMol，它利用来自AlphaFold2的潜在蛋白嵌入作为一种手段，在不同的靶点上调节一个从头生成模型。结合丰富的蛋白质表示使模型能够捕获它们的结构关系，从而实现活性化合物的化学空间插值和基于嵌入相似性的靶侧推广到新蛋白质。在这项工作中，我们对其他现有的目标条件转换器模型进行基准测试，以说明在原始氨基酸序列上使用AlphaFold蛋白质表示的有效性。我们表明，这些蛋白质嵌入的低维投影基于目标家族适当地聚类，当这些表示被故意破坏时，模型性能下降。我们还表明，PCMol模型为广泛的蛋白质生成了多种潜在的活性分子，包括那些具有稀疏配体生物活性数据的蛋白质。所生成的化合物在保持新颖性的同时显示出较高的已知活性配体的相似性，并且具有可比较的分子对接分数。此外，我们证明了数据增强在支持低数据状态下生成模型的性能方面的重要作用。软件包和AlphaFold蛋白嵌入可在https://github.com/CDDLeiden/PCMol免费获得。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.4c00309 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c00309 6.【小分子靶标】 靶标识别在临床前药物开发中起着至关重要的作用。计算机方法已经发展并广泛应用于协助药物化学家和药理学家进行药物靶点鉴定。目前有许多目标预测web服务器，在实际应用中都显示出各自的优点和缺点。在这里，我们提出了3DSTarPred，一个基于小分子三维（3D）形状相似性的目标预测的web服务器。基准研究表明，3DSTarPred的目标预测成功率为76.27%，高于现有的目标预测web服务器。此外，3DSTarPred在不同子结构/上部结构的目标预测方面的性能也优于现有的目标预测web服务器。在案例研究中，3DSTarPred被用来识别两个小分子的潜在靶标，一个是山奈酚，一种治疗阿尔茨海默病（AD）的天然先导化合物，另一个是西地那非，一种用于阿尔茨海默病药物再利用的候选药物。实例研究进一步证明了3DSTarPred在实践中的可靠性和成功性。3DSTarPred服务器可以在http://3dstarpred.pumc.wecomput.com上免费获得。 链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.4c01445 DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c01445 上下滚动查看更多 药企动态2024年11月1日【华海药业】华海药业双抗新药在新西兰获批临床，治疗哮喘2024年11月1日【艾伯维】增强T细胞的肿瘤杀伤能力！艾伯维达成约15亿美元合作2024年11月1日【科济药业】科济药业美国临床试验暂停已被FDA解除2024年10月31日【科伦博泰】科伦博泰 TROP2 ADC 新药第3项适应症申报上市2024年10月30日【中国生物制药】正大集团首次试水收购A股上市公司2024年10月30日【UCB】遭罗氏退货，UCB抗tau阿尔茨海默病2期临床未达到主要终点各动态具体信息，请滑动下方文字 1.【华海药业】 11月1日，华海药业发布公告称，该公司下属子公司华奥泰生物获得新西兰药品和医疗器械安全管理局（简称“MEDSAFE”）、健康及残疾伦理委员会（简称“HDEC”）批准，在绣新西兰开展HB0056注射液的1期临床试验。HB0056是一款同时靶向TSLP和IL-11的双特异性抗体，拟定适应症为哮喘。根据华海药业公告介绍，目前全球尚无其它同时靶向TSLP和IL-11的双特异性抗体进入临床。 链接网址请戳我 2.【艾伯维】 今日，艾伯维（AbbVie）和EvolveImmune Therapeutics宣布达成一项约15亿美元的合作和许可选择协议，旨在共同开发针对肿瘤学多个靶点的多特异性生物制品。此次发现合作将利用EvolveImmune的T细胞接合器平台开发针对实体和血液系统恶性肿瘤的新型抗体疗法。 链接网址请戳我 3.【科济药业】 2024年11月1日，科济药业（股票代码：2171.HK）宣布，美国食品药品监督管理局（“FDA”）已解除在美国的泽沃基奥仑赛注射液（zevor-cel，CT053，一种靶向BCMA的自体CAR-T细胞产品）、舒瑞基奥仑赛注射液（satri-cel，CT041，一种靶向Claudin18.2的自体CAR-T细胞产品）以及CT071（一种靶向GPRC5D的自体CAR-T细胞产品）的临床试验暂停。 链接网址请戳我 4.【科伦博泰】 10月31日，CDE官网最新公示，科伦博泰申报的注射用芦康沙妥珠单抗新适应症上市申请获得受理。根据科伦博泰公告介绍，本次申报上市的适应症为：用于经表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂（EGFR-TKI）治疗后进展的EGFR突变局部晚期或转移性非小细胞肺癌成人患者。 链接网址请戳我 5.【中国生物制药】 10月30日，浩欧博发布控制权拟发生变更的公告，正大集团旗下的港股上市公司中国生物制药拟采用“协议转让+部分要约”的方式进行收购，获得公司控制权。公告显示，中国生物制药拟采取“协议转让+部分要约”方式收购浩欧博约55%股权。中国生物制药拟由其境内全资子公司辉煌润康以协议转让方式受让浩欧博的控股股东海瑞祥天29.99%股份，协议转让价格均为33.74元/股，转让价约为6.3亿元。 链接网址请戳我 6.【UCB】 10月30日，UCB 公告称，其抗tau阿尔茨海默病项目bepranemab 2期 TOGETHER （AH0003）研究未达到其主要终点。Bepranemab是一种重人源化的IgG4亚型的tau抗体，可特异性靶向tau的中间区域（氨基酸235-250），靠近微管结合区（MTBR）。与针对tau蛋白其他区域（如N端）的抗体相比，针对中间区域的抗体会更有效地干扰致病性聚集的tau蛋白的细胞间传播。 链接网址请戳我 上下滚动查看更多 会议信息 2024年11月15-16日 中关村科技园区大兴生物医药基地管理委员会举办首届中国药谷 · 未来生物创新药论坛 2025年1月9-10日 举办ICGT第八届细胞与基因治疗深度聚焦峰会 2025年3月27-28日 上海恺默信息咨询有限公司举办SIT 2025第七届小分子药物创新峰会 各会议具体详情和参会方式，请滑动下方文字 首届中国药谷 · 未来生物创新药论坛 主办方：中关村科技园区大兴生物医药基地管理委员会 会议时间：2024年11月15-16日 会议地点：北京 会议主旨：本论坛汇聚行业专家及优秀企业家代表，共同探讨行业前沿趋势，促进医药健康产业发展要素深度融合，进一步提升大兴区在创新药领域的影响力。将全球首创的科技成果写在大兴的土地上！让大兴成为全球首创药落地首选地！ 链接网址请戳我 ICGT第八届细胞与基因治疗深度聚焦峰会 会议时间：2025年1月9-10日 会议地点：上海 会议主旨：共同探讨CGT产业链上中下游的关键环节，覆盖细胞免疫、眼科、罕见病和CMC热点议题，直面行业痛点，破解发展难点，共迎CGT产业的黄金十年。 链接网址请戳我 SIT 2025第七届小分子药物创新峰会 主办方：上海恺默信息咨询有限公司 会议时间：2025年3月27-28日 会议地点：上海 会议主旨：聚焦减重药物的突破性研究、多肽药物的最新进展以及不可成药靶点的攻克。将深入探讨小分子药物的创新路径，分享业内最前沿的技术与策略。共同探索小分子药物的无限可能，携手推动药物研发领域的持续进步。 链接网址请戳我 上下滚动查看更多 版权信息 本文内容均由小编收集于公开的各个网络平台，发布的目的仅为了方便大家一站式了解AIDD行业信息，并未对发布源头进行真实性验证。如您发现相关信息有任何版权侵扰或者信息错误，请及时联系AIDD Pro（请添加微信号sixiali_fox59）进行删改处理。 原创内容未经授权，禁止转载至其他平台。有问题可发邮件至sixiali@stonewise.cn 关注我，更多资讯早知道↓↓↓