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扫码阅读 更多精彩 01 · 文中主要内容由AI生成，仅供参考 02 · 推荐长按右侧二维码访问日报官网 03 · 识别文中任意二维码内容更加丰富 本月精选40文 01 IF: 48.5 Nature Nature：寄生虫触发肠道细胞"对话"，向大脑发出厌食信号 02 IF: 48.5 Nature Nature：结肠炎给肠道干细胞留下表观"伤痕"，助燃癌症 03 IF: 48.5 Nature Nature：肠→脑"失联"，或是记忆衰退元凶 04 IF: 48.5 Nature Nature：肠道共生菌诱导的母体IgG，是预防新生儿败血症的关键 05 IF: 48.5 Nature Nature：膳食脂肪酸比例，T细胞铁死亡抵抗力的生理开关 06 IF: 48.5 Nature Nature重磅：低蛋白饮食如何通过肠道菌群燃脂 07 IF: 45.8 Science 中科大王育才/汪沁等Science：菌群-肠-肝对话决定药物全身递送效果 08 IF: 45.8 Science Science：肾病恶性循环，尿毒素如何催生肠菌产毒？ 09 IF: 42.5 Cell Cell：菌群代谢物调控结肠区域化，揭示IBD新机制 10 IF: 42.5 Cell Cell：肠道菌群与干扰素协同，锚定个体免疫设定点 11 IF: 42.5 Cell Cell：生酮代谢物BHB为CAR-T细胞"充能"，提升抗癌效果 12 IF: 232.4 CA - A Cancer Journal for Clinicians 2026年结直肠癌统计报告，年轻化趋势严峻 13 IF: 78.5 New England Journal of Medicine NEJM：dMMR结肠癌术后辅助治疗加入阿替利珠单抗，有效减少复发 14 IF: 55 JAMA JAMA：化疗联用减瘤手术激进策略，未能突破广泛转移性肠癌生存瓶颈 15 IF: 50 Nature Medicine Nat Med：万人队列，饮食如何精细塑造肠道菌群？ 16 IF: 50 Nature Medicine Nat Med：抗生素可长期影响菌群，1次用药或留8年"伤痕" 17 IF: 50 Nature Medicine Nat Med：大型RCT新证，每日补充复合维生素矿物质或可拨慢表观衰老时钟 18 IF: 41.7 Nature Biotechnology 北医三院梁晓龙团队NBT：工程菌持续输送NO重塑肿瘤微环境，克服免疫治疗耐药 19 IF: 51 Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology Nature Reviews重磅：代谢疗法开启肠道疾病精准干预新方向 20 IF: 40 Nature Reviews Endocrinology Nature Reviews：肠道菌群与衰老，从机制解析到精准干预 21 IF: 52.7 Signal Transduction and Targeted Therapy 中山一院王雪晶团队：2期临床证实，重复粪菌移植改善初治帕金森病核心症状 22 IF: 30.9 Cell Metabolism 厦大石秀林团队Cell Metab：食品添加剂麦芽酚，如何增加糖尿病骨折风险？ 23 IF: 30.9 Cell Metabolism 复旦黄立豪/吴嘉琪等Cell Metab：皮肤发炎肠遭殃，银屑病加剧IBD风险的免疫代谢机制 24 IF: 30.9 Cell Metabolism 中科院动物所刘光慧团队Cell子刊：长期补充维生素C抑制铁衰老，实现灵长类系统性"减龄" 25 IF: 30.9 Cell Metabolism 西湖大学郭天南/梁爽等Cell Metab：千人肠道宏蛋白质组，揭示衰老与代谢病背后的菌群功能转变 26 IF: 30.9 Cell Metabolism 上海交大贾伟/郑晓皎等Cell Metab：肠道菌群产乙醛，是脂肪肝纤维化的关键驱动因素 27 IF: 26.6 Nature Biomedical Engineering 李煜/戴磊等Nature子刊：蛋白质语言模型跨越序列鸿沟，解锁远源抗菌肽 28 IF: 26.3 Immunity Immunity：高脂饮食如何通过菌群和脂毒性，打击肠道免疫防线？ 29 IF: 25.8 Gut Gut：力量并非只靠练？一种肠菌或是增肌益生菌 30 IF: 25.8 Gut Gut：肠道菌群未必能预警大肠癌前病变 31 IF: 25.1 Gastroenterology 复旦肿瘤医院马延磊/孔程等：产毒菌促肠癌，普氏粪杆菌联手色氨酸如何对抗？ 32 IF: 25.1 Gastroenterology 童年压力重塑肠-脑轴神经，埋下长期肠胃隐患 33 IF: 20.8 Nature Metabolism Nature子刊：从蟒蛇到人类，一种肠菌衍生代谢物向大脑发出"停止进食"信号 34 IF: 19.4 Nature Aging Nature子刊：反直觉！移植衰老肠道菌群可改善年轻小鼠卵巢功能 35 IF: 19.4 Nature Microbiology Nature子刊："坏"菌中的"好"菌株，代谢母乳低聚糖守护早产儿 36 IF: 19.4 Nature Microbiology 上海交大杨琛/周海燕等Nature子刊：从应答者到标准化活菌药，15株肠菌联手增强肿瘤免疫治疗 37 IF: 19.4 Nature Microbiology Nature子刊：空间转录组学新技术，绘制宿主-肠菌对话高清地图 38 IF: 18.7 Cell Host and Microbe 华西医院袁勇/周建丰等Cell子刊：肠道菌群如何影响食管癌免疫治疗？锁定关键菌和代谢物 39 IF: 18.7 Cell Host and Microbe 仁济医院洪洁团队Cell子刊：肠菌如何"教唆"免疫细胞，驱动IBD肠神经损伤？ 40 IF: 18.7 Cell Host and Microbe 深圳先进院马迎飞/袁盛建等Cell子刊：肠道噬菌体的反击，解锁新型抗CRISPR蛋白家族 01 Nature：寄生虫触发肠道细胞"对话"，向大脑发出厌食信号 神经免疫寄生虫感染神经-上皮互作 IF: 48.5 Parasites trigger epithelial cell crosstalk to drive gut–brain signalling Kouki K. Touhara Jinhao Xu, Joel Castro, Hong-Erh Liang, Guochuan Li, Mariana Brizuela, Andrea M. Harrington, Sonia Garcia-Caraballo, Tracey O’Donnell, Daniel Neumann, Nathan D. Rossen, Fei Deng, Gudrun Schober, Yulong Li, Richard M. Locksley, Stuart M. Brierley Kouki K. Touhara, David Julius Article|2026-03-25| OA 10.1038/s41586-026-10281-5 研究背景与设计 针对寄生虫感染引发行为适应的机制，利用神经递质传感器、类器官及基因工程小鼠聚焦肠道上皮簇细胞与肠嗜铬细胞间的旁分泌互作。 核心发现与意义 簇细胞与肠嗜铬细胞间的胆碱能-血清素能级联构成了肠-脑轴通讯基础，在2型免疫反应期间驱动迷走神经激活并导致摄食抑制。 ACh释放模式 簇细胞虽缺乏突触小泡，但可通过TRPM5通道急性响应寄生虫代谢物释放乙酰胆碱（ACh），并在2型炎症期间转为持续的“渗漏样”释放。 细胞间通讯机制 簇细胞来源的ACh通过毒蕈碱型受体激活隐窝内的肠嗜铬细胞，诱导其释放足量血清素（5-HT）。 神经通路投射 肠嗜铬细胞释放的5-HT通过5-HT3受体激活迷走神经传入纤维，进而将信号投射至孤束核的特定神经元集群。 行为输出验证 在寄生虫感染模型中，缺失簇细胞或阻断肠嗜铬细胞递质释放，显著缓解了感染引起的摄食抑制表型。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 02 Nature：结肠炎给肠道干细胞留下表观"伤痕"，助燃癌症 结肠炎表观遗传AP-1转录因子 IF: 48.5 Epigenetic memory of colitis promotes tumour growth Surya Nagaraja Lety Ojeda-Miron, Ruochi Zhang, Ena Oreskovic, Conrad Hock, Yan Hu, Daniel Zeve, Karina Sharma, Roni R. Hyman, Qiming Zhang, Andrew Castillo, David T. Breault, Ömer H. Yilmaz Jason D. Buenrostro Article|2026-03-25| OA 10.1038/s41586-026-10258-4 背景与设计 为阐明慢性炎症促癌机制，利用小鼠慢性结肠炎模型、类器官及新开发的SHARE-TRACE技术，探究结肠干细胞在炎症消退后的表观遗传记忆及其促癌效应。 核心发现 结肠干细胞在炎症消退后保留了由转录因子AP-1驱动的可克隆遗传的长效表观遗传记忆，该记忆在致癌突变发生后被重新激活并加速肿瘤早期演进。 表观记忆特征 单细胞多组学显示，炎症消退后干细胞维持AP-1基序的高染色质可及性并持续超过100天，且约10%的细胞表现出强记忆特征，这种状态在分化后消失。 克隆遗传性 SHARE-TRACE技术证实AP-1记忆具有细胞内在性，通过干细胞分裂传递，且不同克隆间存在记忆强度的异质性；AP-1抑制剂T-5224可特异性阻断结肠炎类器官增殖。 分子协同机制 seq2PRINT分析发现FOX家族转录因子（如 FOXP1）作为协同因子稳定AP-1与DNA的结合；人类IBD样本验证了该AP-1/FOX互作的保守性。 促肿瘤效应 在Apc缺失诱导的腺瘤模型中，炎症记忆驱动早期肿瘤生长加速，该现象依赖AP-1介导的再生程序激活。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 03 Nature：肠→脑"失联"，或是记忆衰退元凶 肠道菌群衰老认知衰退记忆障碍 IF: 48.5 Intestinal interoceptive dysfunction drives age-associated cognitive decline Timothy O. Cox Ashwarya S. Devason, Alan de Araujo, Sydney Mason, Madhav Subramanian, Andrea F. M. Salvador, Hélène C. Descamps, Junwon Kim, Yixuan Zhu, Lev Litichevskiy, Sunhee Jung, Won-Suk Song, Adrián Cortés-Martín, Nathan T. Henderson, Kuei-Pin Huang, Thao Nguyen, Wisath Sae-Lee, Iboro C. Umana, Maria Sacta, Ryan J. Rahman, Stephen Wisser Maayan Levy, Christoph A. Thaiss Article|2026-03-11| OA 10.1038/s41586-026-10191-6 研究背景与设计 针对衰老伴随认知衰退的机制问题，结合宏基因组学、活体钙成像及小鼠行为学模型等方法，探究肠道微生物组老化对脑功能的影响机制。 核心发现与意义 衰老相关的肠道特定共生菌及其代谢物积累，通过驱动外周髓系细胞炎症，削弱迷走神经向大脑传递内感受信号，导致海马体记忆编码受损，提示刺激肠-脑通讯可对抗认知衰退。 微生物组致病性 将老年小鼠粪菌或富集的戈氏副拟杆菌定植于年轻小鼠，可抑制海马体对新异刺激的FOS响应并导致记忆缺陷。 代谢物介导机制 代谢组学证实戈氏副拟杆菌分泌的3-羟基辛酸等中链脂肪酸在老年肠腔中积累，口服该代谢物足以复制衰老表型，导致迷走神经激活减弱及海马功能障碍。 免疫神经互作 中链脂肪酸激活外周髓系细胞GPR84受体，驱动TNF和IL-1β释放，这些促炎因子作用于TRPV1+/PHOX2B+迷走传入神经元，阻碍肠道向大脑的内感受信号传递。 多靶点干预策略 通过噬菌体干预、抑制GPR84、中和促炎因子或使用迷走神经激动剂（如辣椒素、胆囊收缩素），均显著恢复了老年小鼠的认知功能。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 04 Nature：肠道共生菌诱导的母体IgG，是预防新生儿败血症的关键 新生儿败血症疾病易感性大肠杆菌感染 IF: 48.5 Natural maternal immunity protects neonates from Escherichia coli sepsis Raymond E. Diep Ujjwal Adhikari, Kubra Gokce Tezel, Giang Pham, Allison R. Burrell, Mary A. Staat, Nguyen Thi Khanh Nhu, Minh-Duy Phan, Kate M. Peters, Mark A. Schembri, Scott H. Saunders, David B. Haslam, John J. Erickson, Susana Chavez-Bueno Sing Sing Way Article|2026-03-11| OA 10.1038/s41586-026-10225-z 研究背景与设计 针对新生儿频繁暴露于大肠杆菌却极少发病的矛盾现象，利用小鼠模型与人类干血斑样本评估了母体垂直转移天然抗体的保护作用。 核心发现与意义 母体肠道共生菌定植诱导的IgG抗体经垂直转移赋予新生儿感染抵抗力，揭示天然免疫缺陷是侵袭性感染的核心风险因素。 定植诱导免疫 小鼠孕前肠道定植益生菌大肠杆菌Nissle 1917驱动产生针对多种临床分离株的交叉反应性IgG，且该免疫原性的建立依赖于外膜蛋白A（OmpA）。 调理吞噬机制 血清过继转移及基因敲除模型证实，母体IgG垂直转移显著逆转了新生鼠的固有易感性，该抗菌调理作用依赖于补体与IgG Fc受体（FcγR）的协同激活。 人类临床验证 100例新生儿败血症干血斑样本证实，患者针对临床分离株及OmpA的IgG滴度较对照显著降低10倍（IgG2降低超40倍），并伴随调理功能受损。 风险预测阈值 数据推算提示，出生早期抗大肠杆菌IgG滴度缺陷可能将败血症风险从千分之一推高至20%，为高危患儿筛查提供了量化指标。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 05 Nature：膳食脂肪酸比例，T细胞铁死亡抵抗力的生理开关 铁死亡膳食不饱和脂肪脂质代谢免疫代谢 IF: 48.5 Lipid metabolism drives dietary effects on T cell ferroptosis and immunity 王乃琪, Zhian Chen, 姚银, 孙成龙, 魏玮, 孙磊, 张浩, Feng Li Daniel Butcher, Shi-Ran Sun, Jialei Gong, Yingxin Celia Jiang, Yanfei Qi, Jingxuan Huang, Sam Nettelfield, Rui Liu, Xiaoyue Zheng, Chenyu Li, Yang Fu, Haoyuan Geng, Limin Zhao, Hongjian Sun, Yang Yang, Yexin Ge, Mehrdad Pazhouhandeh, Christopher K Barlow, Katherine Joanna Jeppe, Joseph Yunis 余迪 Article|2026-03-04 10.1038/s41586-026-10193-4 背景与设计 为探究T细胞铁死亡抵抗力的生理决定因素，通过膳食干预、基因工程小鼠模型、空间代谢组学及CAR-T疗法模型，探究脂质代谢对免疫的调控机制。 核心发现与意义 膳食脂质（PUFA/MUFA比例）通过ACSL4依赖的磷脂代谢影响T细胞铁死亡抵抗力，调控体液与抗肿瘤免疫，为优化疫苗效力及癌症免疫疗法提供了代谢干预靶点。 膳食调控效应 低PUFA/MUFA比例饲料不影响小鼠T细胞对凋亡的敏感性，但提升铁死亡抵抗力；在GPX4缺陷（缺乏铁死亡保护机制）小鼠中，该饮食提升CD8+ T细胞留存率，并促进TFH细胞分化。 代谢机制解析 高表达于T细胞的酰基辅酶A合成酶长链家族成员4（ACSL4）是介导此膳食效应的关键分子，其通过偏好性利用PUFA合成含PUFA的磷脂，导致T细胞对铁死亡敏感。 功能验证 在体液免疫模型中，低PUFA比例饮食通过保护TFH细胞显著增强了生发中心反应和抗体产生；在黑色素瘤模型中，该饮食促进了CD8+ T细胞的克隆扩增和抗肿瘤效应。 人类相关性 人类血浆PUFA/MUFA比例与循环T细胞铁死亡抵抗力呈负相关，且低PUFA饮食能显著提升人类CAR-T细胞在小鼠体内的持久性和抗白血病效能。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 06 Nature重磅：低蛋白饮食如何通过肠道菌群燃脂 肠道菌群低蛋白饮食白色脂肪组织 IF: 48.5 Microbiota-mediated induction of beige adipocytes in response to dietary cues Takeshi Tanoue, Manabu Nagayama, Ayumi J. A. Roochana, Samuel Zimmerman Orr Ashenberg, Tanvi Jain, Ryo Igarashi, Satoshi Sasajima, Kozue Takeshita, Nicola Hetherington, Nobuyuki Okahashi, Masahiro Ueda, Morichika Konishi, Yoshiaki Nakayama, Aki Minoda, Ashwin N. Skelly, Yasuhiko Minokoshi, Nicholas Pucci, Daniel R. Mende, Makoto Arita, Hironori Yamamoto, Shunji Watanabe, Kouichi Miura, Scott W. Behie Ramnik J. Xavier, Kenya Honda Article|2026-03-04| OA 10.1038/s41586-026-10205-3 背景与设计 为探究饮食-菌群互作调控能量代谢的机制，利用小鼠模型结合多组学技术，揭示低蛋白饮食（LPD）如何通过肠道菌群诱导脂肪褐变。 核心发现 LPD通过肠道菌群介导的胆汁酸-FXR轴和氨-FGF21轴两条平行且非冗余的代谢通路，驱动白色脂肪组织（WAT）米色化。 菌群依赖性 LPD和氨基酸限制饮食可诱导小鼠腹股沟WAT米色化（Ucp1表达上调），无菌小鼠中该效应显著减弱，证实其依赖肠道菌群。 胆汁酸-FXR轴 LPD改变菌群结构，提升血浆非结合型胆汁酸水平，后者通过激活脂肪祖细胞的FXR信号驱动米色化。 氨-FGF21轴 LPD促进携带nrfA基因的共生菌产氨，氨经门脉入肝诱导肝细胞分泌FGF21，远端调控脂肪重塑。 神经交互与整合 上述两条通路通过增强WAT交感神经支配和β3-肾上腺素能通路，实现代谢重编程。 菌群功能验证： 从小鼠和人类中分离鉴定出诱导该表型的最小菌株组合，兼具胆汁酸修饰和氨生成能力，其小鼠定植足以促进LPD诱导的WAT米色化和代谢益处。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 07 中科大王育才/汪沁等Science：菌群-肠-肝对话决定药物全身递送效果 药物递送肠道菌群肠-肝轴血清素 IF: 45.8 Commensal-driven serotonin production modulates in vivo delivery of synthetic and viral vectors 汪沁, 陈子琦, 张国荣 Jiale Yang, Runfan Hu, Tongyue Yao, Cici Zeng, Shugeng Zhang 蒋为, 朱书, 王育才 Article|2026-03-19 10.1126/science.adu7686 背景与研究设计 针对体内递送系统（IDS）易被肝脏清除而削弱疗效的问题，利用抗生素耗竭、条件性基因敲除小鼠及活体成像技术，探究肠道菌群对肝脏库普弗细胞（KCs）吞噬功能的调控机制。 核心发现与意义 肠道菌群通过肠上皮细胞衍生的血清素持续维持KCs的吞噬活性，靶向干预该肠-肝-免疫轴可广泛且显著提升多种IDS的全身递送效率与治疗结局。 菌群与清除表型 广谱抗生素耗竭肠道菌群显著降低了合成纳米颗粒及病毒载体的肝脏清除率，驱动IDS在肿瘤及肝外器官中的富集。 肠肝信号传导 革兰氏阴性菌通过激活肠上皮细胞的TLR4-MyD88信号通路，促进色氨酸代谢并维持血清素分泌，后者作为关键信使进入血液循环。 巨噬细胞激活机制 血清素结合KCs表面的HTR2c/7受体并触发ERK磷酸化，驱动细胞骨架重塑及Marco等吞噬相关基因表达上调。 靶向干预策略 药理学阻断HTR2c/7或短期限制饮食色氨酸摄入可显著抑制KCs活性，驱动化疗和溶瘤病毒疗效提升逾3倍，并使体细胞基因组编辑及mRNA疗法效率提升5至15倍。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 08 Science：肾病恶性循环，尿毒素如何催生肠菌产毒？ 慢性肾脏病硝酸盐大肠杆菌吲哚 IF: 45.8 Host-derived nitrate fuels indole production by Escherichia coli to drive chronic kidney disease progression Jee-Yon Lee Scott P. Mahan, Thaynara Parente de Carvalho, Henry Nguyen, Chonikarn Singai†, Lizbeth Camacho, Mert Tekeli, Yu-Jin Kwon, Ji-Won Lee, Renato L. Santos, Renée M. Tsolis, Sebastian E. Winter Andreas J. Bäumler Article|2026-03-19 10.1126/science.ady5217 背景与设计 为探究慢性肾病（CKD）中肠杆菌科增多及尿毒症毒素蓄积的机制，利用小鼠CKD模型、基因工程大肠杆菌及患者粪便样本，解析宿主与菌群的代谢互作。 核心发现与意义 CKD中累积的特定尿毒素会上调肠道酶iNOS，其产生的硝酸盐驱动大肠杆菌扩张及吲哚生成，进而加速肾脏病变，揭示了干预疾病进展的潜在代谢靶点。 毒素诱导硝酸盐生成 肾功能受损导致的硫酸吲哚酚蓄积，通过抑制肠道上皮Pgc1a/PPARγ信号，上调肠道Nos2（编码iNOS）表达，升高肠腔黏液层硝酸盐浓度。 硝酸盐驱动菌群失调 硝酸盐赋予大肠杆菌显著生长优势，而缺失硝酸盐呼吸基因（napA narG narZ）的突变株或使用iNOS抑制剂均可消除该优势。 硝酸盐增强吲哚生产 体外实验中，硝酸盐呼吸直接增强大肠杆菌的色氨酸分解代谢，依赖其tnaA基因显著提升盲肠内吲哚水平，且在添加硝酸盐的患者粪便体外培养中得到验证。 加速疾病进展 在CKD模型鼠中，定植产吲哚的野生型大肠杆菌显著加剧肾功能损伤及肾脏病理。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 09 Cell：菌群代谢物调控结肠区域化，揭示IBD新机制 肠道菌群烟酸结肠肠道区域化 IF: 42.5 Microbiome-produced nicotinic acid controls colon regional identity and injury susceptibility Jérémie Rispal Jasmine R. Garcia, Brisa Palikuqi, Manasa Vegesna, Dedeepya Vaka, Seung Woo Kang, Coralie Trentesaux, Juan Du, Nicola R. Realini, Paige N. Spencer, James M. Gardner, Annika Hausmann, Michael G. Kattah, Ken S. Lau, Dario Boffelli Ophir D. Klein Article|2026-03-10 10.1016/j.cell.2026.02.007 背景与设计 针对结肠上皮区域化机制不明的问题，整合单细胞测序、代谢组学及Ppara条件性缺失模型等方法，探究菌群的调控作用。 核心发现 结肠区域身份由菌群而非干细胞内在程序驱动，近端菌群产生的烟酸通过激活PPARα建立结肠近端区域身份并赋予抗损伤能力，此通路在人类中保守且在克罗恩病炎症区域丢失。 菌群驱动区域化 单细胞测序揭示小鼠结肠细胞存在近端、中段、远端三种身份特征，无菌或抗生素处理破坏区域特征，尤其削弱近端标记，微生物定植可恢复区域化。 外源信号决定 类器官分化实验表明，在无微生物环境下结肠干细胞分化趋于同质化，提示区域身份主要依赖外源信号。 NA–PPARα轴 代谢组学显示近端菌群特异性产生高浓度烟酸，类器官与体内给药表明烟酸上调Pparα，条件性敲除及功能实验证实PPARα 是赋予近端区域身份（如上调Hmgcs2）的核心调控因子。 损伤易感性 DSS模型中正常小鼠近端对损伤相对耐受，抗生素破坏菌群显著加剧近端损伤，而补充烟酸可增强屏障功能并减轻炎症。 保守性与临床关联 人类结肠同样呈现近端富脂代谢、远端富黏液的区域化特征，类器官实验支持“烟酸/PPARα-近端特征”在人类中保守，活动性克罗恩病炎症区域则表现出近端特征丢失。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 10 Cell：肠道菌群与干扰素协同，锚定个体免疫设定点 免疫-菌群互作干扰素免疫设定点 IF: 42.5 Immune-microbiome coordination defines interferon setpoints in healthy humans Joel Babdor, Ravi K. Patel Brittany Davidson, Kelvin Koser, Cecilia Noecker, Maha K. Rahim, Jordan E. Bisanz, Iliana Tenvooren, Diana Marquez, Maria Calvo, Vrinda Johri, Elizabeth E. McCarthy, Avneet Shaheed, Christina Ekstrand, Allison M. Weakley, Feiqiao B. Yu, Kristen Krip, Kashif A. Shaikh, Hajera Amatullah, Oliver Fiehn, Peter J. Turnbaugh, Alexis J. Combes Joel Babdor, Gabriela K. Fragiadakis, Matthew H. Spitzer Article|2026-03-09 10.1016/j.cell.2026.02.003 背景与设计 为解析健康人稳态免疫差异及其与肠道菌群的关系，对110名健康成年人整合CyTOF、CITE-seq、宏基因组、粪便代谢组与血浆炎症因子开展多组学分析。 核心发现 健康人免疫变异存在两个以干扰素（IFN）程序为主的免疫变异轴，其中免疫与微生物组共变轴（IMCV）定义了与肠道菌群及其代谢物协同变化且在个体内长期稳定的免疫设定点。 免疫变异轴 多组学因子分析识别出两个IFN相关免疫变异轴，其中IIV反映免疫系统内部变异，而IMCV连接免疫特征、菌群功能与代谢物共变。 IFN设定点 IMCV对应增强的稳态IFN程序及IFNGR2、IRF7、IRF9表达，并与血浆IFN-γ、CXCL10、CXCL11相关；外部数据中该IFN特征伴随更强流感疫苗反应及特定癌症免疫治疗响应模式。 细胞状态 IMCV对应SIGLEC-1high单核细胞、PD1highICOShigh记忆T细胞及CD69high MAIT/NK细胞，并伴随单核细胞炎症与TNF-α/NF-κB程序下调，而特定单核细胞TGF-β信号增强。 菌群功能 IMCV与短链脂肪酸、多胺、LPS/肽聚糖及胆汁酸代谢相关通路等菌群功能和代谢物相关，且功能通路与代谢物的对应强于单一菌种丰度。 长期稳定 约20个月纵向随访显示IMCV相关IFN特征、免疫细胞频率、菌群功能通路与代谢物在个体内保持稳定，支持免疫-菌群干扰素设定点的存在。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 11 Cell：生酮代谢物BHB为CAR-T细胞"充能"，提升抗癌效果 β-羟基丁酸生酮饮食CAR-T细胞 IF: 42.5 β-hydroxybutyrate enhances the metabolic fitness of CAR T cells in cancer Shan Liu, Puneeth Guruprasad Ranjani Ramasubramanian, Bhoomi Madhu, Luca Paruzzo, Kecheng Han, Andre Kelly, Alexander Shestov, He N. Xu, Alberto Carturan, Chaoting Zhou, Kevin R. Amses, Amichay Afriat, Lev Litichevskiy, Jason Lin, Ezra Dubowitz, Neil Tangal, Jing Zhang, Alana McSween, Melody Tan, Federico Stella, Andrew Lee Maayan Levy, Marco Ruella Article|2026-03-06 10.1016/j.cell.2026.02.004 背景与设计 为解析饮食因素对CAR-T疗效的影响，在B细胞淋巴瘤小鼠模型中系统比较6种饮食，并结合血清代谢组学、代谢功能分析及人体研究解析关键代谢物作用。 核心发现与意义 生酮饮食产生的酮体β-羟基丁酸（BHB）增强CAR-T细胞代谢适能和抗肿瘤效应，提示代谢补充可能成为提升过继性T细胞疗效的干预策略。 关键增效分子 饮食筛选显示生酮饮食显著增强CAR-T肿瘤控制能力，血清代谢组学鉴定BHB为主要功能代谢物，其在多种肿瘤异种移植模型中均增强CAR-T抗肿瘤功能。 代谢驱动机制 BHB被CAR-T细胞利用进入TCA循环，增强氧化磷酸化和ATP生成，从而促进增殖、细胞因子产生及肿瘤杀伤，该效应依赖于经BDH1酶介导的酮解。 转录与表观调控 BHB诱导CAR-T细胞发生全局表观遗传重塑，从而增强效应和代谢表型，减少耗竭。 人体验证及临床关联 健康志愿者口服BHB后外周T细胞氧耗率、线粒体膜电位及ATP生成显著增强，且患者血清BHB浓度与CAR-T细胞体内扩增量正相关。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 12 2026年结直肠癌统计报告，年轻化趋势严峻 结直肠癌早发性结直肠癌发病率死亡率 IF: 232.4 Colorectal cancer statistics, 2026 Rebecca L Siegel Nikita Sandeep Wagle, Jessica Star, Tyler B Kratzer, Robert A Smith Ahmedin Jemal Article|2026-03-02| OA 10.3322/caac.70067 背景与设计 利用SEER、NCHS、NHIS及BRFSS等多源登记与调查数据，分析美国2026年结直肠癌（CRC）预估负担、趋势演变及筛查现状。 核心发现与意义 CRC负担呈现显著年轻化趋势，1950年后出生人群面临更高的代际风险（出生队列效应），凸显了病因探索与强化早期筛查的重要性。 发病率趋势 20-49岁人群发病率年均显著上升3%，主要受远端结肠及直肠肿瘤驱动，且50-64岁群体发病率亦转为增长。 解剖部位分布 直肠癌发病率年均增长1%，在总体CRC中的占比由2000年代中期的27%显著提升至32%。 死亡率动态 差异与筛查现状：45-49岁组筛查率仅37%，且美国印第安人/阿拉斯加原住民的发病率与死亡率在各族群中处于最高水平。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 13 NEJM：dMMR结肠癌术后辅助治疗加入阿替利珠单抗，有效减少复发 阿替利珠单抗结肠癌错配修复缺陷 IF: 78.5 Atezolizumab plus FOLFOX for Stage III Mismatch Repair-Deficient Colon Cancer Frank A Sinicrope Fang-Shu Ou, Dirk Arnold, Walter R Peters, Robert J Behrens, Christopher H Lieu, Khalid Matin, Deirdre J Cohen, Samara L Potter, Andrew B Nixon, Lisa A Kottschade, Emily Kathol, Wendy L Frankel, Ardaman Shergill, Dennis Hsu, Anke Reinacher-Schick, Paul Mehan, Philip J Gold, Maged F Khalil, Tyler Zemla, Clare Gatten Frank A Sinicrope Article|2026-03-26 10.1056/NEJMoa2507874 背景与设计 针对III期错配修复缺陷（dMMR）结肠癌辅助治疗的优化需求，开展了一项随机对照III期临床试验，以评估在改良FOLFOX6（mFOLFOX6）方案中加入阿替利珠单抗的疗效。 核心发现与意义 在标准辅助化疗基础上联合阿替利珠单抗显著延长了患者的无病生存期，为该特定分子亚型结肠癌确立了新的术后辅助治疗标准。 主要疗效 中位随访40.9个月的生存分析显示，联合治疗组的3年无病生存率达86.3%，显著高于单用化疗组的76.2%，疾病复发或死亡风险显著降低50%（HR=0.50）。 化疗暴露 预设的化疗暴露亚组分析提示，接受超过6个周期mFOLFOX6治疗的患者从联合方案中获得的无病生存获益更为显著。 生存与安全 两组的总生存期目前无显著差异，联合治疗组伴随更高的3至4级不良事件发生率（84.1%对71.9%），主要表现为非血液学毒性及中性粒细胞计数下降。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 14 JAMA：化疗联用减瘤手术激进策略，未能突破广泛转移性肠癌生存瓶颈 转移性结直肠癌多器官转移肿瘤细胞减... IF: 55 Tumor Debulking in Combination With Chemotherapy in Multiorgan Metastatic Colorectal Cancer: The ORCHESTRA Randomized Clinical Trial Elske C. Gootjes Lotte Bakkerus, Anviti A. Adhin, Barbara M. Zonderhuis, Kathelijn S. Versteeg, Jurriaan B. Tuynman, Martijn R. Meijerink, Cornelis J. A. Haasbeek, Johannes H. W. de Wilt, Dirk J. Grunhagen, Ewoud J. Smit, John M. Primrose, John Bridgewater, Esther van Meerten, Jan-Willem B. de Groot, Mathijs P. Hendriks, Esther Oomen-de Hoop, Tineke E. Buffart, Cornelis Verhoef Henk M. W. Verheul Article|2026-03-16 10.1001/jama.2026.1929 研究背景与设计 多中心随机对照试验纳入多器官转移性结直肠癌患者，对比了单纯姑息性化疗与化疗联合肿瘤减瘤术的生存获益。 核心发现与意义 在姑息性化疗基础上增加肿瘤减瘤干预未能改善患者的总生存期，反而导致严重不良事件增加，此阴性结果提示该局部干预不应作为标准治疗。 总生存期评估 意向性治疗分析证实，单纯化疗组与化疗联合减瘤组的中位总生存期分别为27.5个月和30.0个月（风险比为0.88），两组间无显著差异。 无进展生存期 单纯化疗组与化疗联合减瘤组的中位无进展生存期分别为10.4个月和10.5个月（风险比为0.83），联合局部减瘤未能显著延缓疾病进展。 安全性与毒性 临床毒性评估证实，化疗联合减瘤组发生严重不良事件的患者比例（53%）显著高于单纯化疗组（39%），驱动了更高的治疗相关毒性负担。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 15 Nat Med：万人队列，饮食如何精细塑造肠道菌群？ 饮食-菌群互作肠道微生物组微生物多... IF: 50 Diet–microbiome associations in 10,068 individuals from the Human Phenotype Project to guide personalized nutrition Tomer Segev Daniel Barak, Liron Zahavi, Anastasia Godneva, Michal Rein, David Krongauz, Dorit Samocha-Bonet, Hagai Rossman, Adina Weinberger Eran Segal Article|2026-03-23 10.1038/s41591-026-04312-x 研究背景与设计 为解析饮食对肠道微生物组的精细影响，研究基于10,068人队列的应用程序膳食日志与宏基因组数据构建预测模型。 核心发现与意义 饮食能显著预测大部分肠道微生物物种丰度、多样性及功能通路，且关联具时间稳定性，为个性化营养干预提供了数据基础。 特定食物关联 饮食显著预测了724个物种中669个的丰度，识别出特定食物-物种关联，如咖啡与丁酸产生菌Lawsonibacter asaccharolyticus、酸奶与嗜热链球菌呈强相关。 膳食模式作用 在各类膳食模式中，食物加工程度是影响微生物α多样性的最主要因素，超加工食品（UPF）摄入与多样性降低显著相关。 关联的稳定性与普适性 基线建立的饮食-微生物组关联在长达4年的随访中保持稳定，并在澳大利亚与以色列的独立队列中得到验证。 个性化模拟框架 通过串联饮食-微生物组-宿主表型模型，构建的个性化膳食模拟框架预测，减少加工食品并增加水果坚果可优化微生物组并改善心脏代谢健康指数（CMI）。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 16 Nat Med：抗生素可长期影响菌群，1次用药或留8年"伤痕" 抗生素暴露肠道微生物组长期影响 IF: 50 Antibiotic use and gut microbiome composition links from individual-level prescription data of 14,979 individuals Gabriel Baldanzi Anna Larsson, Sergi Sayols-Baixeras, Koen F. Dekkers, Ulf Hammar, Diem Nguyen, Tíscar Graells, Shafqat Ahmad, Camila Gazolla Volpiano, Guillaume Meric, Josef D. Järhult, Thomas Tängdén, Jonas F. Ludvigsson, Lars Lind, Johan Sundström, Karl Michaëlsson, Johan Ärnlöv, Beatrice Kennedy, Marju Orho-Melander Tove Fall Article|2026-03-11| OA 10.1038/s41591-026-04284-y 研究背景与设计 针对抗生素对肠道微生物群长期影响未知的问题，整合瑞典处方药登记册与14979名成年人的粪便宏基因组数据，评估了过去8年内口服抗生素的长期生态效应。 核心发现与意义 特定类别抗生素的使用伴随长达8年的肠道菌群多样性降低及物种丰度改变，提示抗生素暴露对肠道微生态具有长期深远的重塑作用。 菌群多样性轨迹 多变量校正回归模型显示，粪便采样前1年内使用抗生素与物种多样性的最大降幅显著相关，且采样前1至8年的既往使用史仍伴随显著的多样性降低。 抗生素类别差异 克林霉素、氟喹诺酮类和氟氯西林与个体物种丰度改变的关联最为显著，其在采样前4至8年的使用伴随10%受试物种丰度的改变；青霉素V、广谱青霉素及呋喃妥因等影响较小。 单疗程长期效应 即使在过去8年内仅接受过单一疗程的上述高影响抗生素治疗，仍显著伴随特定肠道菌群丰度及整体多样性的长期改变。 宿主健康关联 与抗生素使用呈显著正相关的Enterocloster bolteae等菌种丰度升高，伴随较高的体重指数及血清甘油三酯水平。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 17 Nat Med：大型RCT新证，每日补充复合维生素矿物质或可拨慢表观衰老时钟 膳食补充剂复合维生素矿物质维生素 IF: 50 Effects of daily multivitamin–multimineral and cocoa extract supplementation on epigenetic aging clocks in the COSMOS randomized clinical trial Sidong Li Rikuta Hamaya, Haidong Zhu, Brian H. Chen, Alexandre C. Pereira, Kerry L. Ivey, Pamela M. Rist, JoAnn E. Manson, Yanbin Dong Howard D. Sesso Article|2026-03-09 10.1038/s41591-026-04239-3 研究背景与设计 基于COSMOS随机对照试验，在958名健康老年人中评估连续2年每日复合维生素矿物质（MVM）或可可提取物补充对五种DNA甲基化表观遗传时钟的影响。 核心发现与意义 MVM（而非可可提取物）轻度减缓了第二代表观遗传时钟的衰老速率，为营养干预影响生物学衰老提供随机试验证据。 MVM干预效应 与安慰剂相比，每日MVM显著减缓第二代表观遗传时钟PCPhenoAge与PCGrimAge的年增长速率（分别为−0.214与−0.113年/年），两年累计相当于约2.5–5个月生物年龄减缓。 衰老加速亚组 基线生物年龄加速衰老人群在MVM干预下获得了更强的表观遗传衰老减缓效应，而生物年龄正常或减缓者未观察到明显变化。 营养与分子变化 MVM伴随叶酸与叶黄素等营养指标升高，并改变DNAm端粒长度等衰老相关生物标志物。 临床关联探索 表观遗传年龄偏差的改善可部分解释MVM相关认知改善及炎症标志物下降，但中介效应未达统计学显著。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 18 北医三院梁晓龙团队NBT：工程菌持续输送NO重塑肿瘤微环境，克服免疫治疗耐药 工程菌活体生物药抗肿瘤药一氧化氮 IF: 41.7 Sustained nitric oxide production by engineered E. coli remodels the tumor microenvironment and potentiates immunotherapy Shuyu Xu, Tianjiao Zhang Yang Song, Mengxin Wang, Ruiqi Wu, Mofan Li, Haonan Wang, Xinxin Xie, Qingfeng Chen 马晓途, 梁晓龙 Article|2026-03-18 10.1038/s41587-026-03054-y 背景与设计 针对免疫抑制性微环境限制免疫检查点阻断疗效的困境，通过重塑精氨酸合成通路构建可持续原位释放一氧化氮（NO）的工程化大肠杆菌Nissle 1917（ECN-NO）。 核心发现与意义 ECN-NO通过持久的NO释放诱导肿瘤血管正常化并重塑免疫微环境，与抗PD-L1疗法协同，在多种实体瘤模型中驱动了完全、持久的肿瘤消退并建立免疫记忆，为克服免疫治疗耐药提供了微生物代谢干预新范式。 工程菌功能与定植 通过删除argR并表达反馈抑制不敏感的argAfbr、精氨酸再生酶及BsNOS，ECN-NO实现了持续NO生成，并特异性定植于多种小鼠肿瘤组织。 驱动血管正常化 ECN-NO治疗显著增强了血管周细胞覆盖，减少了血管渗漏，并改善了肿瘤灌注和缺氧，其诱导的血管正常化窗口期持久。 重编程免疫微环境 ECN-NO上调血管内皮粘附分子，促进树突状细胞和CD8+ T细胞浸润，同时降低T细胞耗竭标志物表达并增加记忆T细胞比例。 协同疗效与免疫记忆 在MC38、CT26等多个肿瘤模型中，ECN-NO与αPD-L1联合治疗诱导了CD8+ T细胞依赖性的肿瘤消退，并使治愈小鼠能够抵抗高剂量肿瘤细胞的再挑战。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 19 Nature Reviews重磅：代谢疗法开启肠道疾病精准干预新方向 代谢疗法肠道代谢物肠道微生物群 IF: 51 Metabotherapy for intestinal disease: using metabolites to prevent and treat disorders of the gut Shan Liu, Marina Domingo-Vidal, Bhoomi Madhu, Dana Binyamin Christoph A. Thaiss Maayan Levy Review|2026-03-02 10.1038/s41575-026-01178-9 核心观点概述 本文提出肠道代谢产物可作为预防和治疗肠道疾病的代谢疗法（Metabotherapy），通过调节免疫、上皮及神经细胞功能，针对炎症性肠病（IBD）等六类主病症制定精准干预策略。 代谢产物来源与病理 肠道代谢产物源于饮食、宿主及微生物群，其多样性与IBD和结直肠癌（CRC）等病理过程密切相关，短链脂肪酸（SCFAs）、色氨酸衍生物及胆汁酸是关键的化学信使。 代谢疗法分类体系 干预手段分为增强有益途径的补充剂、稳定剂、功能模拟剂，以及遏制有害途径的生产抑制剂、降解剂和拮抗剂，旨在通过恢复代谢稳态来控制疾病。 炎症性肠病调控机制 SCFAs通过抑制组蛋白脱乙酰酶（HDAC）活性缓解炎症，色氨酸代谢物激活芳香烃受体（AhR）增强屏障功能，硒通过清除活性氧抑制炎症反应。 结直肠癌双向作用 次级胆汁酸脱氧胆酸（DCA）与三甲胺-N-氧化物（TMAO）促进肿瘤发生及免疫逃逸，而SCFAs与酮体通过诱导细胞周期停滞及增强CD8+T细胞功能发挥预防作用。 代谢紊乱干预靶点 10-羟基-顺-12-十八碳烯酸（HYA）通过游离脂肪酸受体（FFAR）调控肠脑轴抑制食欲，N-乳酰苯丙氨酸（Lac-Phe）等代谢物有助于减重，而TMAO则会损害胰岛素分泌功能。 未来技术与临床挑战 代谢疗法需开发响应肠道环境的靶向递送系统，克服区域特异性与个体化差异，并开展长期临床安全性验证，以实现从实验室发现向精准医疗的转化。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 20 Nature Reviews：肠道菌群与衰老，从机制解析到精准干预 肠道微生物组衰老炎性衰老衰弱 IF: 40 The gut microbiome and ageing trajectories: mechanisms and clinical implications Andrea Ticinesi Stefania Maggi, Antonio Nouvenne, Giovanni Zuliani, Claudio Franceschi Andrea Ticinesi Review|2026-03-03 10.1038/s41574-026-01236-x 核心主旨 本综述系统探讨肠道菌群作为关键调节者，如何通过肠-跨器官轴影响衰老模式及疾病，并强调环境与遗传塑造的个体差异是定义健康菌群的核心难点。 微生态失衡恶性循环 衰老触发菌群重组并减少普拉梭杆菌等益生菌，诱发炎性衰老及衰弱，且此过程与肠道细胞衰老互为因果形成循环。 肠-器官轴调控机制 菌群产生的短链脂肪酸及代谢物通过肠-脑、肠-肝等轴线调控功能，表现出保护性或致病性的高度个体化特征，其代谢效应受宿主内环境制约。 长寿人群适应性特征 百岁老人的菌群显示出卓越适应性，保留了阿克曼氏菌等抗炎菌种并增强了解毒代谢通路，通过微生态重组成功平衡了系统性炎症并维持功能稳定。 个性化干预策略挑战 益生菌与地中海饮食干预效果受初始菌群背景限制，需结合代谢型（metabotypes）实现精准营养，以克服多酚等生物活性成分转化能力的显著个体差异。 临床转化与预测潜力 独特性指数等指标在预测死亡率方面展现潜力，未来需整合表型数据构建精准衰老时钟，推动临床层面的虚弱评估与心血管风险预测。 前瞻研究与伦理考量 未来应推动菌群分析标准化及全球数据库建设，探索合成菌群移植等前沿疗法，同时审慎处理精准干预带来的医疗资源可及性与社会公平性问题。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 21 中山一院王雪晶团队：2期临床证实，重复粪菌移植改善初治帕金森病核心症状 帕金森病粪菌移植肠道菌群肠-脑轴 IF: 52.7 Gut microbiota modulation via repeated donor fecal transplantation improves motor and gastrointestinal symptoms in drug-naïve Parkinson’s disease: a randomized phase 2 trial Rui Zhang, Renyi Feng Jiuqi Wang, Yongkang Chen, Han Liu, Qingyong Zhu, Haiyan Tian, Chi Qin, Junfang Teng, Beisha Tang, Min Wu 曾进胜, Erxi Wu, 丁雪冰, 王雪晶 Article|2026-03-13| OA 10.1038/s41392-026-02604-9 研究背景与设计 针对肠道菌群调节在未用药帕金森病治疗中的作用不明，本研究对72名患者进行随机双盲对照2期临床试验，评估经内镜肠道植管的重复供体粪菌移植（dFMT）的疗效与安全性。 核心发现与意义 重复dFMT安全且耐受性良好，可显著改善初治帕金森病患者的运动及胃肠道症状，伴随肠道屏障修复与病理蛋白沉积减少，为神经退行性疾病的微生物靶向干预提供临床与机制证据。 临床症状改善 dFMT组在35周时运动症状评分较对照组（自体FMT）显著改善，便秘严重程度及胃肠道相关生活质量评分亦获得更大提升。 微生物组成转变 肠道菌群分析显示，dFMT组微生物谱与供体更相似，且致病相关的大肠杆菌-志贺菌属丰度显著降低。 分子与病理关联 dFMT组粪便多巴胺及其代谢物DOPAC水平升高，结肠磷酸化α-突触核蛋白聚集减少，上皮屏障完整性标志物E-钙粘蛋白表达增加。 安全性评价 所有不良事件均属轻微且自限性，未观察到严重的治疗相关事件。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 22 厦大石秀林团队Cell Metab：食品添加剂麦芽酚，如何增加糖尿病骨折风险？ 2型糖尿病骨质疏松性骨折麦芽酚 IF: 30.9 Maltol induces diabetic fragility fractures by disrupting the balance of bone remodeling Jinyang Wang, Ziyuan Wang, Jinyi Feng Ying Zhang, Lizheng Yao, Yiran Zhang, Ruijie Zhang, Jingyi Cai, Hao Yu, Songhan Deng, Xinrui Chen, Rui Liang, Caoxin Huang, Jia Li 李学军, 李勤喜, 石秀林 Article|2026-03-27 10.1016/j.cmet.2026.03.001 背景与研究设计 针对2型糖尿病（T2DM）骨脆性机制不明的问题，整合临床代谢组学、小鼠模型及细胞实验，评估了食品添加剂麦芽酚（MA）的骨骼效应。 核心发现与意义 MA在特定代谢背景下通过破坏骨重塑平衡驱动糖尿病骨脆性，提示食品添加剂的安全评估必须考虑机体的代谢状态。 临床队列关联 代谢组学及血清分析显示，伴发脆性骨折的T2DM患者股骨颈组织及血清中MA显著富集，且血清MA每增加一个标准差伴随骨折风险显著升高149%。 体内骨骼表型 长期饮水暴露于MA显著降低了高血糖db/db小鼠及STZ诱导小鼠的远端股骨骨密度与骨小梁数量，而对野生型小鼠无显著损害。 双向细胞机制 高糖微环境中，低剂量MA通过抑制Wnt/β-catenin通路阻断成骨细胞分化，同时通过增强IKK磷酸化激活NF-κB信号以促进破骨细胞成熟。 靶向干预挽救 在小鼠模型中，药理学激活β-catenin或使用胰岛素纠正高血糖，均显著逆转了MA诱导的骨小梁丢失与骨微结构破坏。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 23 复旦黄立豪/吴嘉琪等Cell Metab：皮肤发炎肠遭殃，银屑病加剧IBD风险的免疫代谢机制 银屑病炎症性肠病肠-皮肤轴IL-1β IF: 30.9 Psoriasis modulates inflammatory bowel disease risk and intestinal epithelium lipid metabolism via IL-1β-producing macrophages 吴嘉琪, 刘双双, 但维 Xiao Tong, Jingyi Gong, Zimeng Li, Yu Gu, Jindian Xu, Weiwei Chen, Shupei Wang, Xue-Yang Luo, Huanya Yang, Yingli Jia, Chih-Hao Chang 颜克香, 王嘉希, 黄立豪 Article|2026-03-18 10.1016/j.cmet.2026.02.014 背景与设计 为阐明银屑病与炎症性肠病共病机制，整合患者队列、小鼠模型及新型光转换APOB报告基因小鼠（ApobKikGR），聚焦肠道脂质代谢。 核心发现与意义 银屑病通过扩增肠道IL-1β+巨噬细胞，驱动肠上皮细胞载脂蛋白B48（APOB48）降解与脂质积累，增加肠上皮铁死亡易感性，揭示了连接皮肤与肠道炎症的免疫代谢轴。 临床与模型表型 银屑病严重程度与患者餐后血浆APOB48及乳糜微粒数量负相关；小鼠模型同样显示脂质输出减少和肠上皮脂质积聚。 关键免疫细胞 单细胞RNA测序显示银屑病小鼠肠道固有层中单核细胞来源的IL-1β+巨噬细胞显著扩增，而TNF-α影响较小。 干预验证 中和IL-1β抗体部分恢复小鼠脂质输出并减少脂质积累；敲除趋化因子受体CCR2未能挽救表型，提示巨噬细胞局部增殖参与。 分子机制 利用ApobKikGR小鼠肠道类器官证实，IL-1β通过蛋白酶体途径加速APOB48降解并损害其分泌，导致脂质潴留。 病理后果 肠上皮细胞脂质积累上调铁死亡相关基因（如Acsl4），破坏肠道屏障并加剧炎症。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 24 中科院动物所刘光慧团队Cell子刊：长期补充维生素C抑制铁衰老，实现灵长类系统性"减龄" 维生素CACSL4铁衰老铁过载 IF: 30.9 Vitamin C inhibits ACSL4 to alleviate ferro-aging in primates Lixiao Liu Zikai Zheng, Wanbang You, Peng Yang, Yifan Wen, Yicheng Qiao, Shuai Ma, Hui Zhang, Shuo Zhang, Gang Xu, Chencan Ma, Ao Tian, Mengmeng Jiang, Tongtong Zhang, 耿令令, Jingyi Li, Xiaoyan Sun, Feibo Wang, Muzhao Xiong, Yuanhan Yang, Xiaoyong Lu 张维绮, 曲静, 刘光慧 Article|2026-03-11 10.1016/j.cmet.2026.02.010 背景与设计 针对衰老与氧化应激的关联机制不清的问题，本研究在人类细胞、小鼠及食蟹猴模型中，通过多组学、基因编辑及长期干预实验，探究了铁积累驱动的衰老轴。 总体概述 该工作定义了一个由ACSL4介导、铁过载触发的“铁衰老”通路，并发现维生素C是其直接抑制剂；长期补充维生素C能系统性地减轻非人灵长类的衰老标志并逆转生物年龄。 铁衰老特征 人类衰老细胞及老年灵长类多组织中均存在铁积累、ACSL4表达上调及脂质过氧化产物增加，构成独特的“铁衰老”特征。 核心机制验证 铁处理或过表达ACSL4驱动人细胞衰老；反之，敲低ACSL4或在小鼠肝脏中靶向敲除Acs14可缓解铁过载诱导的衰老表型及全身功能衰退。 维生素C作用机制 筛选发现维生素C能直接结合并抑制ACSL4酶活性；分子对接与实验验证其结合于ACSL4的Thr278/Ser279/Thr469口袋。 非人灵长类干预 对中年食蟹猴进行为期40个月的维生素C干预，显著降低了多组织铁衰老标志、减轻了器官病理并改善了代谢参数与脑结构。 生物年龄逆转 多维表观遗传、转录组及代谢组衰老时钟分析显示，维生素C处理显著逆转了老年灵长类多个器官及特定细胞类型的生物年龄。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 25 西湖大学郭天南/梁爽等Cell Metab：千人肠道宏蛋白质组，揭示衰老与代谢病背后的菌群功能转变 肠道微生物组宏蛋白质组学代谢疾病衰老 IF: 30.9 Large-scale metaproteomics of human gut microbiota reveals microbial functions in metabolic diseases and aging 梁爽, 孙莹莹, 苗泽蕾, 黎帮燕 Ziyuan Xing, Yuting Xie, Enci Cai, Sainan Li, Pu Liu, Min Yang, Menglei Shuai, Wanglong Gou, Wenhao Jiang, Youming Wang, Huanhuan Gao, Ke Zhang, Jing Yu, Xue Cai, Xingbing Wang 朱怡, 陈裕明, 郑钜圣, 郭天南 Article|2026-03-13 10.1016/j.cmet.2026.02.012 研究背景与设计 为解析肠道菌群蛋白质功能与宿主健康的关联，对1399名中老年人的1967份粪便样本进行了基于diaPASEF的大规模宏蛋白质组学分析。 核心发现概述 鉴定超9.2万种微生物蛋白，揭示与衰老、代谢性疾病及药物相关的菌群功能转变，并发现埃氏巨球菌可能是药物调节血糖的潜在介质。 衰老相关功能转变 衰老伴随碳代谢和能量生产相关微生物蛋白的显著变化，包括厚壁菌门能量获取功能增强及拟杆菌门营养转运功能减弱。 代谢疾病共同特征 2型糖尿病（T2D）、高血压和血脂异常患者均显示普氏粪杆菌等厚壁菌门物种及其碳水化合物、短链脂肪酸代谢相关蛋白丰度一致性耗竭。 药物相关特征 多种代谢性疾病药物与微生物蛋白质组改变显著相关，其中普氏粪杆菌的功能表达呈现药物依赖性的恢复模式。 枢纽物种验证 埃氏巨球菌（Megasphaera elsdenii）被鉴定为T2D相关网络枢纽物种，在T2D患者中丰度升高，体外证实二甲双胍等降糖药直接驱动该菌增殖；高脂饮食无菌小鼠定植该菌可提高肠道丁酸水平并降低空腹血糖。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 26 上海交大贾伟/郑晓皎等Cell Metab：肠道菌群产乙醛，是脂肪肝纤维化的关键驱动因素 肠道菌群肠道菌群代谢乙醛 IF: 30.9 Targeting microbiota-generated acetaldehyde to prevent progression of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease 唐雅珺, 况俊良 Xixi Xia, Changliang Yao, Zile Zhou, Jiajian Liu, Zhenxing Ren, Keke Ding, Mengci Li, Yang Li, Fuxin Jiao, Dan Zheng, Tianlu Chen, Aihua Zhao, Xinjian Wan, Guang Ji, Shan Zhang 郑晓皎, 贾伟 Article|2026-03-02| OA 10.1016/j.cmet.2026.01.021 背景与设计 针对代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）向脂肪性肝炎（MASH）及纤维化进展机制不明的问题，综合临床队列、小鼠模型及多组学技术，探究膳食糖摄入对病理转化的影响。 核心发现 果糖通过重塑肠道菌群，促进产生内源性乙醛，驱动肝纤维化，用工程益生菌靶向清除乙醛能有效缓解疾病进程。 临床关联与验证 UK Biobank队列21万人数据显示，糖摄入与肝病死亡风险显著正相关，果糖尤甚（HR 1.86）；小鼠中，果糖加速肝纤维化，且菌群起介导作用。 菌源乙醛积累 MASH患者肠道菌群的丙酮酸发酵产乙醛/乙醇通路富集，体外及小鼠模型证实MASH状态下菌群内源性乙醛产量增加，导致其在肠-肝轴大量堆积，且该蓄积独立于宿主乙醇氧化通路。 纤维化机制 转录组学及基因敲降小鼠模型分析表明，肝脏蓄积的乙醛上调肝星状细胞中基质金属蛋白酶7（MMP7）表达，驱动纤维化。 益生菌治疗策略 结合表型筛选和基因工程，构建高效降解乙醛的工程益生菌唾液联合乳杆菌HAM，口服该菌显著降低MASH小鼠肝内乙醛水平、下调Mmp7，遏制肝纤维化进展。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 27 李煜/戴磊等Nature子刊：蛋白质语言模型跨越序列鸿沟，解锁远源抗菌肽 药物发现抗菌肽蛋白质语言模型深度学习 IF: 26.6 Uncovering evolutionarily remote and highly potent antimicrobial peptides with protein language models 余沁泽, 刘红宾, Haimei Shi Yerzhan Abdrakhmanov, Junbo Shen, Chunhe Zhang, Zhihang Dong, Licheng Zong, Longlong Si 戴磊, 李煜 Article|2026-03-03 10.1038/s41551-026-01630-w 背景与核心设计 针对现有方法难以识别远源抗菌肽的挑战，开发了基于蛋白质语言模型的HMD-AMP框架，用于从哺乳动物宿主和肠道微生物组中大规模挖掘潜在候选分子。 总体发现与意义 该模型突破了序列相似性限制，识别出大量结构多样、低毒且具有强效广谱抗菌活性的远源抗菌肽，极大拓展了对抗抗生素耐药性的候选药物空间。 核心算法优势 通过在短肽数据上微调模型并结合深度森林分类器，HMD-AMP在靶标注释及预测准确率上显著优于现有基线，在低于40%序列相似度的远源测试集中仍维持优异的分类性能。 宏基因组挖掘 应用该模型对猪宏基因组及宿主基因组进行筛选，并在排除冗余后通过化学合成验证了62条高置信度多肽，其中52条表现出强效抗菌活性。 序列与结构特征 在74条经验证的有效多肽中，48条属于远源序列，但结构预测证实它们仍保留了经典的两亲性α螺旋或β折叠拓扑特征，反映了抗菌机制的高度趋同进化。 广谱抑菌与药效 极效肽（如Swine_2和Swine_7）在体外对多种致病菌展现出极低的最低抑菌浓度且无显著细胞毒性，其中Swine_2在小鼠腹腔大肠杆菌感染模型中显著延长了动物存活期。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 28 Immunity：高脂饮食如何通过菌群和脂毒性，打击肠道免疫防线？ 肠道免疫细胞3型固有淋巴细胞免疫代谢 IF: 26.3 High-fat diet causes rapid loss of intestinal group 3 innate lymphoid cells through microbiota-driven inflammation and mitochondrial stress Eva C. Torrico, Paulien Kaptein, Fatiha Laalouhmi Vanessa Mitsialis, Sara El Guendouzi, Abdellatif El Khayari, Chaymae El Baha, Elly D. Htite, Sophie Chawluk, Christian D. Gauthier, Nadhir M. Djekidel, Patrick Da Silva, Toby B. Lanser, Ankur Gupta, Kisha Sivanathan, Marilia Garcia De Oliveira, Amir H. Maghzi, Ali Tavakkoli, Mozhdeh Sojoodi, Motaz Qadan, Shirong Liu, Rafael M. Rezende, Laura M. Cox Selma Boulenouar Article|2026-03-30 10.1016/j.immuni.2026.02.014 背景与设计 针对短期高脂饮食如何改变肠道免疫的问题，利用无菌小鼠、饮食干预及人类肠道样本绘制了饮食与微生物互作图谱。 核心发现与意义 高脂饮食协同微生物群驱动的炎症，诱导脂质负载的肠道3型固有淋巴细胞（ILC3）发生线粒体脂毒性死亡，揭示了可逆的代谢机制。 表型与驱动因素 猪油基高脂饮食在数小时内导致小鼠和超重人群肠道ILC3显著丢失，该过程由脂肪吸收驱动且完全独立于肥胖及糖耐量受损。 微生物与炎症 高脂饮食诱导的肠道通透性增加促使微生物产物移位，进而驱动CX3CR1+单核吞噬细胞大量富集并持续分泌核心炎症因子。 细胞特异性机制 炎症信号显著抑制脂质负载的ILC3而非Th17细胞中依赖于PPARα的脂肪酸氧化，导致线粒体脂质过氧化及细胞死亡。 干预与临床转化 抗氧化剂N-乙酰半胱氨酸或恢复正常饮食可显著逆转ILC3丢失，且人类肥胖患者肠道ILC3同样表现出该保守的代谢拮抗特征。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 29 Gut：力量并非只靠练？一种肠菌或是增肌益生菌 Roseburia inulinivorans益生菌肠-肌轴 IF: 25.8 Roseburia inulinivorans increases muscle strength Borja Martinez-Tellez Milena Schönke, Artemiy Kovynev, Esther Garcia-Dominguez, Lourdes Ortiz-Alvarez, Aswin Verhoeven, Ranko Gacesa, Arnau Vich Vila, Quinten Raymond Ducarmon, David Jimenez-Pavon, Maria Del Carmen Gomez-Cabrera, Rinse K Weersma, Wiep-Klaas Smits, Martin Giera, Jonatan R Ruiz, Patrick Cn Rensen Borja Martinez-Tellez Article|2026-03-10| OA 10.1136/gutjnl-2025-336980 背景与设计 针对肠道菌群与肌肉力量的关系，整合人类队列宏基因组关联分析、小鼠灌胃干预及代谢组学，探究特定肠菌对肌肉力量的因果调控及代谢机制。 核心发现与意义 Roseburia inulinivorans被鉴定为一种特异性且因果性增强肌肉力量的肠道菌，其机制涉及氨基酸代谢重编程和肌肉能量通路激活，为针对肌肉衰减的益生菌干预提供了新靶点。 人群关联 在年轻及老年人群中，R. inulinivorans（而非其他Roseburia物种）丰度与握力、腿部推举等多项肌肉力量指标正相关，且该菌丰度伴随衰老而降低。 因果与表型 小鼠模型中，口服补充R. inulinivorans导致前肢握力显著提升约30%，并伴随骨骼肌纤维横截面积增大及II型纤维比例增加。 机制与年龄差异 该处理降低了盲肠和血浆氨基酸浓度，同时激活了骨骼肌嘌呤代谢和磷酸戊糖途径，提示该菌通过重塑宿主代谢网络维持肌肉功能。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 30 Gut：肠道菌群未必能预警大肠癌前病变 结直肠肿瘤癌前病变肠道微生物组 IF: 25.8 Gut microbiome signatures in colorectal neoplasia: a cross-sectional study across neoplasia stages and subtypes Panayiotis Louca, Sarah Manning Eleanor Hackney, Linda Sharp, Mark A Hull, Sara Koo, Gregory R Young, Guy S Taylor, Yashvee Dunneram, Suparna Mitra, James S Hampton, Christina Dobson, Laura J Neilson, Caroline Addison, Emad M El-Omar, the COLO-COHORT research team, Christopher J Stewart Colin J Rees Article|2026-03-06| OA 10.1136/gutjnl-2025-337478 背景与设计 围绕结直肠癌前病变是否存在稳健粪菌标志物，对1762名结肠镜受试者进行粪便宏基因组分析，结合饮食、临床和生活方式因素校正混杂。 核心发现与意义 结直肠癌前病变与肠道菌群的分类学和功能学关联整体微弱且不稳定，未见稳健微生物特征，提示先前报道的菌群改变可能更多出现在疾病较晚阶段。 群落差异微弱 存在肿瘤性病变者的β多样性差异虽显著但效应极小，α多样性无差异，群落层面未形成清晰分群。 分类及功能关联有限 Mediterraneibacter faecis等少数物种，以及氨基酸合成、β-内酰胺抗性通路与早期病变存在正相关，但效应量小，且在校正混杂因素后大多不显著。 分期分型 非进展期病变出现有限群落变化，进展期病变中Prevotella信号较持续，无蒂锯齿状病变检出多种关联菌，但整体一致性仍有限。 预测价值 联合菌群与临床特征仅将高风险病变识别能力从AUC 0.58提升至0.64，提示粪菌谱的独立临床应用价值有限。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 31 复旦肿瘤医院马延磊/孔程等：产毒菌促肠癌，普氏粪杆菌联手色氨酸如何对抗？ 普氏粪杆菌产肠毒素脆弱拟杆菌肠道菌群 IF: 25.1 Revealing the Antagonistic Interactions of Faecalibacterium prausnitzii and Bacteroides fragilis in Colorectal Cancer 孔程, Yutao Jin 郭凡英, 杨永志, 刘光, 陈梓滢, 李金铭, Qinying Wang 马延磊 Article|2026-03-06 10.1053/j.gastro.2025.12.030 背景与设计 为阐明肠道菌群失调在结直肠癌中的作用机制，研究整合了人群队列多组学、类器官及小鼠模型。 核心发现与意义 普氏粪杆菌（F. prausnitzii）驱动的色氨酸→吡啶甲酸（PIA）代谢轴，下调宿主促癌基因TCERG1和CKAP2，从而拮抗产肠毒素脆弱拟杆菌（ETBF）促癌作用，为CRC的膳食与菌群干预提供了新靶点。 菌群与代谢失调 CRC患者肠道中脆弱拟杆菌富集而普氏粪杆菌减少并呈负相关，同时色氨酸显著积累而其代谢终产物PIA显著耗竭。 代谢机制验证 普氏粪杆菌通过其ACMSD酶，利用色氨酸生成PIA；其培养上清或PIA能抑制CRC类器官存活，并抵消ETBF的促增殖效应。 宿主基因调控 ETBF上调与肿瘤低分化和复发相关的基因TCERG1和CKAP2表达并增强凋亡抵抗，而PIA下调这上述基因并诱导凋亡。 体内功能与干预 小鼠模型中，普氏粪杆菌或富色氨酸饮食提升血清PIA水平，显著抑制ETBF驱动的肿瘤生长，该效应可被ACMSD抑制剂逆转。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 32 童年压力重塑肠-脑轴神经，埋下长期肠胃隐患 早期生活压力肠神经系统交感神经系统 IF: 25.1 Enteric and Sympathetic Nervous System Pathways Mediate Early Life Stress Effects on Gut Motility and Pain: Mechanistic Findings with Human Correlation Sarah A. Najjar Helene Kildegaard, Ardesheer Talati, Priscila Dib Goncalves, Andrew Del Colle, Zixing Huang, Yan Tong, Daniel Juarez, Rahi Shah, Erfaneh Barati, Taeseon Woo, Melissa Medina, Narek Israelyan, Marguerite Bernard, Ruxandra Tonea, Michelle Ovchinsky, Noa Pesner, Roey Ringel, Luisa Valdetaro, Mette Bliddal, Martin Thomsen Ernst Kara G. Margolis Article|2026-03-16 10.1053/j.gastro.2026.02.030 研究背景与设计 针对早期生活压力诱发肠脑互作障碍的机制问题，利用小鼠母婴分离模型及两大人类儿童队列，评估肠神经与交感神经系统的结构及功能改变。 核心发现 早期生活压力驱动肠道神经、感觉及交感神经通路的持久重塑，导致内脏高敏感性与性别特异性动力障碍。 动物模型表型 母体分离诱导小鼠产生内脏痛觉过敏，并引起性别特异性肠道运动改变（雄性减慢，雌性加快），同时伴随肠神经系统中5-HT能神经支配增加及亚型比例改变。 性激素机制 促性腺激素释放激素拮抗剂地加瑞克介导的性激素抑制，可逆转母体分离诱导的内脏痛觉过敏与性别特异性运动缺陷，提示性激素参与编程长期肠道功能。 交感神经机制 母体分离增强肠神经系统的交感神经支配，而6-羟基多巴胺介导的化学交感神经切除术可恢复正常的肠道运动功能，但不影响痛觉过敏。 人类队列关联 在丹麦登记数据库和美国青少年脑认知发育研究队列中，产前或产后母亲抑郁等早期压力暴露，均与儿童肠脑互动障碍或其相关症状的风险增加显著相关。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 33 Nature子刊：从蟒蛇到人类，一种肠菌衍生代谢物向大脑发出"停止进食"信号 对酪胺-O-硫酸盐餐后肠道菌群衍生代... IF: 20.8 Python metabolomics uncovers a conserved postprandial metabolite and gut-brain feeding pathway Shuke Xiao, Mengjie Wang, Thomas G Martin Barry Scott, Xing Fang, Xinming Liu, Yongjie Yang, Sipei Fu, Steven D Truong, Jack F Gugel, Gregory L Maas, Marcus P Mullen, Jennifer Hampton Hill, Veronica L Li, Andrew L Markhard, Mingming Zhao, Wei Qi, Saranya C Reghupaty, Meng Zhao, Jan Spaas, Wei Wei, Trine Moholdt, John A Hawley Leslie A Leinwand, 徐勇, Jonathan Z Long Short Article|2026-03-19| OA 10.1038/s42255-026-01485-0 背景与模型 针对哺乳动物进食波动微弱难以捕捉代谢信号的问题，利用具有极端摄食-禁食周期的蟒蛇，通过非靶向代谢组学筛选血浆代谢物。 核心发现 鉴定出保守的餐后厌食代谢物对酪胺-O-硫酸盐（pTOS），它依赖于肠道菌群生成，通过激活下丘脑腹内侧核（VMH）神经元抑制进食。 pTOS的发现与保守性 蟒蛇餐后血浆pTOS浓度显著升高>1000倍，该现象在人类餐后同样显著，但在小鼠中基础水平极低。 生物合成途径 膳食酪氨酸经肠道细菌依赖性脱羧生成酪胺，再经肝脏磺基转移酶SULT1C4磺化生成pTOS，抗生素处理可消除其餐后诱导。 抑制摄食功能 外源性给予pTOS显著抑制小鼠进食量（24小时进食量从4.39±0.28g降至3.58±0.16g），并驱动肥胖小鼠体重显著减轻 9%。 神经调控机制 pTOS能进入小鼠中枢神经系统；化学遗传学与电生理证据证实，pTOS直接激活VMH神经元，且抑制该神经元群可完全阻断pTOS的厌食效应。 跨物种通路验证 pTOS同样激活蟒蛇VMH神经元，证实该神经调控通路在物种间保守。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 34 Nature子刊：反直觉！移植衰老肠道菌群可改善年轻小鼠卵巢功能 肠-卵巢轴卵巢衰老肠道菌群 IF: 19.4 Estropausal gut microbiota transplant improves measures of ovarian function in adult mice Minhoo Kim Justin Wang, Steven E. Pilley, Ryan J. Lu, Alan Xu, Younggyun Kim, Minying Liu, Xueyan Fu, Sarah L. Booth, Peter J. Mullen Minhoo Kim, Bérénice A. Benayoun Article|2026-03-03| OA 10.1038/s43587-026-01069-3 背景与设计 为探究肠道微生物群在卵巢衰老中的作用，对年轻、自然绝经及化疗诱导卵巢衰竭（VCD）小鼠的粪便菌群进行比对分析，并通过粪菌移植（FMT）和转录组学等方法评估菌群对卵巢健康的直接影响。 核心发现与意义 卵巢衰老伴随独特肠道菌群特征，移植绝经期菌群可通过降低炎症和重塑转录组显著改善年轻受体小鼠的卵巢功能，揭示了衰老肠道微环境可能触发的代偿性生殖保护机制。 菌群与卵巢衰老关联 自然绝经小鼠肠道菌群的α多样性显著升高，其典型特征为毛螺菌科特定属丰度改变且磷脂酶通路下调，不同于VCD模型小鼠的菌群变化。 卵巢转录组重塑 相较于移植年轻肠道菌群，移植绝经期肠道菌群的年轻受体小鼠（FMT-EF）的卵巢内炎症相关通路显著下调，关键衰老标志物Cd38显著降低，全局转录组特征向年轻化偏移。 生殖表型改善 FMT-EF组小鼠的卵巢健康指数显著升高，生育力增强，初产间隔期缩短6.7%，表明卵巢功能改善。 潜在介质与机制 多组学及因果中介分析提示，肠道菌群中特定菌种（如Bacteroides stercoris）和代谢途径（如NAD和维生素K2生物合成）的富集以及血清中特定代谢物的变化（如3,4-DHPPA和乳酰胺减少），共同介导了卵巢功能改善。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 35 Nature子刊："坏"菌中的"好"菌株，代谢母乳低聚糖守护早产儿 母乳低聚糖微生物代谢婴儿肠道微生物组 IF: 19.4 Clostridia from preterm infants metabolize human milk oligosaccharides to suppress pathobionts and modulate intestinal function in organoids Jonathan A. Chapman, Andrea C. Masi Lauren C. Beck, Hannah Watson, Gregory R. Young, Hilary P. Browne, Yan Shao, Raymond Kiu, Andrew Nelson, Jennifer A. Doyle, Pawel Palmowski, Márton Lengyel, James P. R. Connolly, Christopher A. Lamb, Andrew Porter, Trevor D. Lawley, Lindsay J. Hall, Nicholas D. Embleton, John D. Perry, Janet E. Berrington Christopher J. Stewart Article|2026-03-16| OA 10.1038/s41564-026-02297-4 背景与设计 为探究早产儿肠道中母乳低聚糖（HMOs）代谢菌的多样性，结合多组学、体外培养及源自早产儿的肠道类器官模型，系统评估了分离菌株的功能。 核心发现与意义 梭菌属（尤其缺乏毒素基因pfoA的产气荚膜梭菌）是一类新的HMOs代谢菌，能产生有益代谢物、抑制病原体并调节肠道炎症，拓展了对HMOs代谢微生物的认识。 HMOs代谢与产物 多种梭菌可利用HMOs生长，其无细胞上清（CFS）产生的短链脂肪酸（SCFAs）和色氨酸分解代谢物显著高于双歧杆菌。 微生物互作 pfoA-产气荚膜梭菌的CFS在体外能抑制常见肠道病原体生长，并促进天然存在的双歧杆菌（B. breve, B. longum）增殖，该抑制作用与酸性pH及SCFAs相关。 宿主调节与保护 在类器官模型中，该菌CFS能抑制炎症细胞因子分泌且自身无促炎性；活菌共培养显示，预先定植该菌可保护肠道屏障免受携带pfoA菌株的损害。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 36 上海交大杨琛/周海燕等Nature子刊：从应答者到标准化活菌药，15株肠菌联手增强肿瘤免疫治疗 肿瘤免疫治疗肠道菌群免疫检查点抑制剂 IF: 19.4 A clinic-responder-derived defined microbial consortium enhances anti-PD-1 immunotherapy efficacy in mice 周海燕, 孙睿铭, 聂小群, 夏立亮 Hui Dong, Yujie Liu, Shurui Hou, Wenyue Dong, Xiaokuan Zhu, Yaxian Yao, Guo-Ping Zhao 陆舜, 王颖, 杨琛 Article|2026-03-09 10.1038/s41564-026-02279-6 背景与设计 针对菌群异质性限制免疫治疗疗效的问题，基于非小细胞肺癌患者宏基因组分析与代谢模型模拟，设计构建了源自临床应答者的含15种细菌的确定性群落（RCom）。 核心发现与意义 RCom通过跨门代谢互作实现稳定定植，通过重塑肠道代谢物驱动依赖于树突状细胞的CD8+ T细胞抗肿瘤免疫，为克服免疫耐药及个体间菌群差异提供了标准化的活菌干预策略。 临床预后相关性 独立队列分析证实，RCom高丰度与患者接受免疫治疗后更长的中位总生存期相关。 群落内代谢互作 同位素示踪蛋白质组学证实，拟杆菌门细菌分泌的氨基酸显著支持了厚壁菌门细菌的蛋白质合成，维持了群落的稳定共生。 免疫与代谢重塑 在异质性基线菌群小鼠中，口服RCom显著促进丁酸和肌苷等代谢物产生，并驱动树突状细胞活化及CD8+ T细胞的肿瘤浸润与细胞毒性。 克服临床耐药 在多种同基因肿瘤模型中，联合RCom显著提升了抗PD-1疗效，并成功逆转了无响应患者粪菌移植介导的小鼠免疫治疗耐药。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 37 Nature子刊：空间转录组学新技术，绘制宿主-肠菌对话高清地图 方法学空间转录组学聚腺苷酸化 IF: 19.4 Spatial transcriptomics maps host–gut microbiome biogeography at high resolution Ioannis Ntekas, Lena Takayasu, David W. McKellar Benjamin Grodner, Chase Holdener, Peter Schweitzer, Young Seo Park, Maya Sauthoff, Qiaojuan Shi, Ilana L. Brito Iwijn De Vlaminck Article|2026-03-06| OA 10.1038/s41564-026-02286-7 技术开发 为解析肠道宿主-微生物互作，构建基于原位聚腺苷酸化（PAP）的空间总RNA测序流程，并在Visium及Stereo-seq平台中应用于野生型与ApcMin/+小鼠肠道组织。 核心发现 该策略显著提升微生物RNA捕获效率（最高约100倍），实现宿主与微生物转录组的微米级空间解析，揭示肠道微生物空间生物地理学及肿瘤相关结构重塑。 技术性能 PAP处理显著增强细菌RNA及多类宿主非编码RNA捕获，包括lncRNA、miRNA与未剪接RNA，同时保持宿主基因表达检测一致性。 微生物空间结构 肠道菌群组成沿小肠至结肠呈显著梯度变化，并在组织-管腔轴形成空间分层，多种菌属在微米尺度形成半径约30 μm的聚集结构。 肿瘤界面变化 在ApcMin/+肿瘤组织中，梭菌属等菌属显著靠近肿瘤边界富集，同时肿瘤相关上皮与免疫细胞空间分布发生重构。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 38 华西医院袁勇/周建丰等Cell子刊：肠道菌群如何影响食管癌免疫治疗？锁定关键菌和代谢物 食管鳞状细胞癌癌症免疫治疗抗PD-1 IF: 18.7 Gut microbiota-derived indole-3-lactic acid suppresses anti-PD-1 efficacy in esophageal squamous cell carcinoma 周建丰, 曾筱茜, 孙隽, 杨玉赏, 王健, 肖鑫 Pinhao Fang, Yixin Liu, Manjiangcuo Wang, Yijing Long, Fei Fu, Wanmeng Li, Jiajia Du, Zhiwen Liang, Shiqing Nie, Siyuan Luan, Xiaokun Li, Haowen Zhang, Yuhao Peng, Shangwei Sun, Weitao Zhu, Lingyun Zhang, Qixin Shang, Yueyun Chen, Yuyang Xu, Longqi Chen 丁振宇, 杜丹, 郭安源, 魏霞蔚, 袁勇 Article|2026-03-24 10.1016/j.chom.2026.02.019 背景与设计 为解析食管鳞状细胞癌（ESCC）患者PD-1抑制剂疗效个体差异的肠道菌群机制，整合患者多队列临床样本、人源化菌群小鼠模型及单细胞转录组等多组学技术。 核心发现与意义 唾液联合乳杆菌（L. salivarius）及其代谢产物吲哚-3-乳酸（ILA）通过AhR/NF-κB轴驱动抗PD-1治疗抵抗，为克服免疫治疗耐药提供了微生物-代谢干预靶点。 临床关联 在接受新辅助免疫治疗的ESCC患者中，非应答者肠道菌群富集唾液联合乳杆菌；将其菌群或纯菌株移植给ESCC小鼠，显著削弱PD-1抑制剂疗效。 关键代谢物 非应答者及菌株定植小鼠的血清和粪便中ILA水平升高；敲除该菌的ILA合成基因ildh后，其诱导的免疫抵抗表型消失。 靶细胞与分子机制 单细胞测序揭示ILA导致肿瘤内NKG7+CD8+祖细胞样耗竭T细胞（Tpex）减少；机制上，ILA激活芳基烃受体（AhR），抑制CD8+ T细胞内NF-κB信号通路，从而驱动其终末耗竭。 临床验证与价值 在两个独立验证队列中，唾液联合乳杆菌丰度、血清ILA水平与免疫治疗反应负相关，肿瘤内NKG7+CD8+ Tpex细胞比例是预测疗效的独立因素。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 39 仁济医院洪洁团队Cell子刊：肠菌如何"教唆"免疫细胞，驱动IBD肠神经损伤？ 炎症性肠病肠神经元肠道菌群 IF: 18.7 Gut pathogen Clostridium symbiosum rewires macrophage succinylation to drive enteric neuron loss in inflammatory bowel disease Ying Zhao, Lijun Ning, Yuqing Yan, Jinmei Ding, Bin Yu, 杨朋洁, Nan Shen Baoqin Xuan, Zhenyu Wang, Yue Zhang, Yi-Lu Zhou, Yuqi Shao, Yi Jiang, Yanru Ma, Xiaoqiang Zhu, Xiaowen Huang, Muni Hu, Chaoqin Shen, Danfeng Sun, Jianyong Sun, Ruogu Li, Shengzhong Duan, Weihong Jiang, Zhe Cui, Zhenhua Wang, Qiang Zou, Jing-Yuan Fang 陈豪燕, 陶悦, 洪洁, 莫茜 Article|2026-03-24 10.1016/j.chom.2026.03.001 背景与研究设计 针对炎症性肠病中肠神经元丢失的微生物驱动机制，整合患者多组学队列、小鼠结肠炎模型及细胞体系展开探究。 核心发现与意义 肠道病原体共生梭菌（C. symbiosum）通过琥珀酸重编程巨噬细胞代谢并驱动肠神经元丢失，靶向该菌或补充神经肽为干预神经免疫互作提供了新策略。 菌群与表型关联 多队列分析显示该菌丰度与患者神经元减少显著相关，在小鼠模型中定植该菌显著加剧肠道炎症及神经元丢失。 代谢重编程机制 该菌衍生的琥珀酸经SLC13A3转运入巨噬细胞，通过KAT2A催化组蛋白H3K79琥珀酰化上调HK2，驱动糖酵解并维持IL-1β分泌。 神经元死亡通路 条件性敲除模型证实，巨噬细胞来源的IL-1β结合神经元IL-1R，激活神经元特异性NLRP3炎性小体，导致肠神经元死亡。 靶向干预策略 利用特异性噬菌体内溶素phiCS-1清除该菌或外源补充神经肽β-CGRP，均显著减轻小鼠肠神经元丢失并改善结肠炎表型。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考 40 深圳先进院马迎飞/袁盛建等Cell子刊：肠道噬菌体的反击，解锁新型抗CRISPR蛋白家族 肠道噬菌体噬菌体-细菌互作肠道菌群 IF: 18.7 Discovery of human gut phage-encoded anti-CRISPR proteins unveils diverse mechanisms for phages to evade type II CRISPR immunity 袁盛建 Heng Zhu, Menghao Yu, Huizhen Jia, Shiwen Peng 马迎飞 Article|2026-03-18 10.1016/j.chom.2026.02.017 背景与设计 为探索人类肠道噬菌体抗CRISPR（Acr）蛋白的多样性，结合生物信息学与高通量功能筛选，挖掘靶向II型CRISPR系统的Acrs。 核心发现与意义 揭示了肠道噬菌体编码大量Acr，并发现广泛分布、结构趋同的GutAcraca家族具有抑制CRISPR与转录自调控的双重功能。 Acr的鉴定 从肠道噬菌体基因组中鉴定出651个阳性Acr候选物，功能验证包括首个有效抑制II-B亚型CRISPR的Acr（AcrIIB-1）。 GutAcraca家族特征 213个序列多样但结构相似的Acr构成GutAcraca家族，成员普遍较小，在温和噬菌体中富集。 双重功能与机制 该家族蛋白既能作为转录抑制因子自我调控表达，也能通过靶向Cas9的PAM识别域或sgRNA等不同机制抑制CRISPR活性。 分布与意义 GutAcraca在约26%的肠道物种中被检测到，其结构趋同与双重功能可能利于噬菌体在肠道建立溶原状态。 长按更精彩 识别二维码提交纠错解锁更多深度解读 AI解读仅供参考