引言
在与传染病漫长的斗争史中,疫苗无疑是最伟大的发明之一。通过诱导特异性抗体的长效表达,传统疫苗在控制甚至消灭多种传染病方面取得了巨大成功。然而,面对艾滋病病毒(HIV)、流感病毒和疟原虫等高度变异或免疫逃逸能力极强的病原体,传统疫苗往往显得力不从心。
尽管极少数个体能够自然产生具有强大保护作用的广泛中和抗体 (broadly neutralizing antibodies, bNAbs),但通过常规疫苗接种来诱导普通人群产生这些抗体,面临着难以逾越的生物学障碍。
如果常规途径走不通,我们能否另辟蹊径,直接在人体内“安装”一个能够源源不断生产这些超级抗体的“兵工厂”?
4月16日,《Science》的研究报道“B lymphocyte protein factories produced by hematopoietic stem cell gene editing”,研究人员巧妙地将基因编辑技术与免疫系统的自然扩增机制相结合,通过改造极少量的造血干细胞,成功在动物体内构建了能够按需生产、自我扩增的B淋巴细胞蛋白质工厂。这项工作不仅为攻克HIV等顽疾提供了全新的思路,更可能彻底重塑我们预防和治疗重大疾病的底层逻辑。
免疫长城的隐忧:为何我们需要超越传统疫苗?
当我们接种疫苗时,疫苗中的抗原会激活体内庞大的多克隆B细胞库中极少数特异性识别该抗原的B细胞。这些被选中的B细胞随后经历克隆扩增 (clonal expansion),并在生发中心 (germinal centers, GCs) 内发生体细胞高频突变 (somatic hypermutation, SHM)。这是一个抗体亲和力成熟的过程,最终分化为长寿命的浆细胞,持续在血液中分泌高滴度的抗体。
对于像新冠病毒或麻疹病毒,这个自然系统运作良好。但HIV、疟原虫和某些流感毒株却截然不同。以HIV为例,病毒表面的关键表位往往被密集的糖基化修饰所掩盖。要产生能够中和多种HIV变异株的广泛中和抗体 (bNAbs),B细胞通常需要经历极其罕见且复杂的体细胞高频突变,有时突变率需要达到普通抗体的数十倍。此外,能够产生这些抗体的前体B细胞在人体内数量极其稀少。
直接注射人工合成的bNAbs(被动免疫)虽然有效,但抗体在体内的半衰期有限,需要频繁地静脉输注,这在广泛的公共卫生预防和长期治疗中是不现实的。
因此,研究人员提出了一个大胆的设想:造血干细胞 (hematopoietic stem cells, HSCs) 是所有血液细胞(包括B淋巴细胞)的源头。如果我们能在造血干细胞和祖细胞 (hematopoietic stem and progenitor cells, HSPCs) 阶段,就将编码bNAbs的基因“写入”其基因组,那么由这些干细胞发育而来的B细胞,生来就具备了产生超级抗体的能力。更重要的是,一旦遭遇同源抗原的刺激(例如接种简单的疫苗),这些改造后的B细胞就能利用免疫系统本身的机制进行指数级扩增,成为长效的抗体生产线。
深入基因组的精密手术:重写B细胞的命运
将设想转化为现实,需要极高精度的基因工程。造血干细胞本身并不表达抗体,抗体基因的表达是在细胞不可逆地向B细胞谱系定向分化后才启动的。为了确保外源抗体基因能够在成熟的B细胞中高效、精确地表达,研究团队进行了大量的构建优化。
研究人员利用CRISPR-Cas9核糖核蛋白复合物和重组腺相关病毒血清型6 (AAV6) 作为递送工具,将目标基因精准敲入到小鼠免疫球蛋白重链 (immunoglobulin heavy chain, IgH) 基因座的特定位置。具体而言,他们将抗体序列插入到Ighj4下游的第一个内含子中。
这个设计包含了几个非常关键的考量:首先,插入序列包含一个多聚腺苷酸化位点,用于阻止任何内源性重链基因的表达,从而确保被改造的B细胞只表达我们想要的抗体。其次,序列中引入了一个内源性IgVH绝缘子,其作用是引导内源性的IgH内含子增强子去激活外源插入的启动子。这种设计不仅指导了完整的免疫球蛋白轻链和重链的协同表达,还保留了B细胞发生类别转换重组 (class switch recombination) 的能力,这意味着改造后的B细胞可以根据免疫反应的需要,产生不同同种型(如IgG、IgA、IgM)的分泌型和膜结合型抗体。
在成功验证了针对小鼠细胞的体外编辑和培养条件后,研究人员将编码抗HIV广泛中和抗体 3BNC117 的基因植入了表达CD45.2标志物的小鼠HSPCs中。
将这些编辑后的HSPCs移植到受体小鼠体内6到7周后,外周血流式细胞术和微滴式数字PCR (ddPCR) 检测显示,成功表达3BNC117的B细胞比例在不同个体间存在差异,最高可达所有B细胞的 4%。尽管初始比例看起来并不高,但这正是该系统最具魅力的地方——免疫系统是一个强大的放大器。
当研究人员用3BNC117的同源HIV抗原(TM4 core)对这些小鼠进行免疫接种(Prime)后,所有小鼠的血液中均检测到了高水平的3BNC117 IgG抗体。数据显示,血清中3BNC117 IgG的几何平均浓度达到了 3.48 μg/ml,部分小鼠甚至高达 22.32 μg/ml。
更令人振奋的是其持久性。单次免疫后,3BNC117抗体水平在小鼠长达 273 天的生命周期内缓慢下降但始终维持在有效水平。当在首次免疫后第6周进行第二次加强免疫(Boost)时,3BNC117的滴度实现了跨数量级的跃升,几何平均值达到 16.72 μg/ml,并且这一高水平在随后超过 9 个月的时间里保持稳定。这种血清抗体浓度已经与非人灵长类动物模型中证实能够抵御HIV感染的保护水平相当。
星火燎原:探究激活系统的最低细胞阈值
上述结果引出了一个极其关键的临床转化问题:要启动这样一场持久的抗体风暴,我们到底需要移植多少个经过基因编辑的造血干细胞?在现有的骨髓移植或细胞治疗中,提高植入率往往需要对患者进行高强度的预处理(如大剂量化疗或放疗),这伴随着巨大的毒副作用。如果该系统能在极低的细胞植入量下运作,其安全性与临床适用性将得到极大的提升。
为了探究这一极限,研究人员设计了严谨的竞争性混合嵌合体实验。他们将未经编辑的野生型骨髓细胞作为基础,混入梯度递减的、经过3BNC117基因编辑的HSPCs进行移植。
ddPCR结果显示,在接受最高剂量培养HSPCs(270,000个细胞)的小鼠组中,外周血B细胞的等位基因中有 0.15% 携带了编辑后的抗体基因。而当移植的培养HSPCs数量降至 10,000个以下 时,外周血中编辑B细胞的基线水平已经低至无法被检测到。
然而,生物学的奇迹在抗原刺激后显现。在用TM4 core抗原进行免疫和随后的加强免疫后,即使是那些只接受了区区 370个培养HSPCs(据推算其中平均仅包含29个成功编辑的细胞)的小鼠,在首次加强免疫后第7天,依然能够产生几何平均值为 0.11 μg/ml 的特异性3BNC117 IgG抗体。在第二次加强免疫后,抗体水平得到补充。这一数据有力地证明,即使在体内只有数十个成功编辑的造血干细胞,其发育而来的微量B细胞依然保留了对同源抗原的敏锐反应能力。一旦遭遇抗原,这些极少数的细胞就能通过克隆扩增脱颖而出,提供可测量的持续免疫反应。
进一步的二级移植实验为这种长期免疫提供了最终的背书。研究人员从初次移植 18至19周 后的小鼠体内提取骨髓,去除掉已经发育成熟的B细胞,只保留早期的干细胞和祖细胞,然后移植给第二批受体小鼠。在二级受体小鼠重建免疫系统并接受抗原刺激后,15只小鼠中有12只产生了可检测的3BNC117抗体,其中3只的浓度在 0.2 至 1 μg/ml 之间,更有两只在加强免疫后分别达到了 4 μg/ml 和惊人的 48 μg/ml。这充分表明,产生这些抗体的B细胞确实来源于真正的长期造血干细胞 (long-term hematopoietic stem cells, LT-HSCs)。只要干细胞存活,这个被重写的B细胞兵工厂就会伴随宿主终生运转。
货物装载与多兵种协同:对抗变异病毒的策略
既然不仅可以编辑抗体基因,这个“工厂”是否还能同时生产其他我们需要的“货物”?又或者,面对像HIV这样极易突变逃逸的病毒,单一的抗体往往不够,我们能否建立能够同时分泌多种抗体的“联合防线”?
为了验证货物装载的可行性,研究人员在针对IgH基因座的编辑结构中,加入了一个荧光载体蛋白(mNeonGreen)的基因片段,与3BNC117抗体序列串联排布。通过流式细胞术追踪,他们观察到这两种蛋白质在B细胞中实现了同时表达。不仅如此,在利用同源抗原TM4 core免疫后,这些携带“双重货物”的B细胞大量涌入淋巴结的生发中心。数据表明,在免疫后的第14天,引流淋巴结生发中心内表达mNeonGreen的细胞比例从幼稚状态下的 0.18% 剧增至 15.4%,发生了接近两个数量级的富集。随后,这些细胞成功发育为脾脏和骨髓中的浆细胞以及类别转换记忆B细胞。这证实了被编辑的B细胞依然遵循自然的免疫分化路径,且完全具备装载额外功能性蛋白的能力。
对于应对HIV等复杂病原体,联合抗体策略至关重要。研究人员分别对两批HSPCs进行了基因编辑,一批植入3BNC117抗体基因,另一批植入识别HIV包膜蛋白另一个完全非重叠表位的bNAb 10-1074基因。随后,他们将这两种编辑后的HSPCs混合,共同移植给受体小鼠。
经过免疫系统重建后,研究人员使用一种对两种抗体都具有高亲和力的联合抗原(YU2 gp140)进行免疫。结果令人侧目:表达3BNC117和表达10-1074的B细胞均被成功招募进入生发中心,并在加强免疫后两周,两种抗体均在血液中实现了高水平表达。其中,10-1074的血清浓度中位数高达 1.2 mg/ml。此外,当随后仅使用对3BNC117具有特异性亲和力的TM4 core抗原再次进行加强免疫时,只有3BNC117的水平出现了特异性的进一步升高。
这一结果具有极高的临床应用潜力。它证明了我们可以通过组合不同批次编辑的干细胞,在患者体内建立一个多抗体防线。如果病原体发生变异,逃避了其中一种抗体的追踪,其他抗体依然可以发挥中和作用,从而实现对高度变异病毒的长期压制。
跨越物种的验证与更广泛的疾病防御网络
小鼠模型取得成功后,将技术向人类细胞的转化是必由之路。研究人员对用于小鼠的构建体进行了改造,以适应人类基因组的序列和结构。
在优化条件下,他们对来源于人类胎肝的 CD34+ HSPCs 进行了编辑。实验展现了极高的编辑效率:在针对人类B2M基因座的编辑测试中,四个不同捐献者的细胞实现了 56% 到 75% 的靶向敲入效率;而在更复杂的IgH基因座植入3BNC117或10-1074抗体的实验中,也达到了约 40% 的编辑效率。
随后,携带有3BNC117基因的人类HSPCs被移植到了高度免疫缺陷的 MISTRG6 人源化小鼠模型中。经过一段时间的重建,分析结果显示,在这些小鼠外周血循环的人类CD19+ B细胞中,平均有 21% 成功表达了外源植入的3BNC117抗体。虽然由于受体小鼠缺乏免疫排斥反应,这一植入和分化比例可能在一定程度上被放大了,但它确凿地证明了人类造血干细胞同样能够被高效编辑,并在体内成功跨越复杂的发育路径,分化为具有正常表型的功能性B细胞。
基于此,研究人员进一步拓宽了这项技术的应用边界,将其引入了另外两个全球性的公共卫生挑战:疟疾和流感。
针对恶性疟原虫(Plasmodium falciparum),研究人员设计了编码抗疟原虫环子孢子蛋白 (PfCSP) 抗体(如 317、2541 和 iGL-CIS43.D3)的编辑载体。在获得编辑HSPCs重建的小鼠中,经过同源抗原的初次和加强免疫后,特异性抗体滴度飙升。其中抗体317的浓度超过了 100 μg/ml,而 iGL-CIS43.D3 更是达到了高达 1000 μg/ml 的惊人水平。体外实验证实,从这些小鼠体内提取的血清,能够强效抑制疟原虫子孢子穿越人类肝细胞的能力,且这种抑制效果在加强免疫后依然保持高度稳定。
在流感病毒防御方面,研究人员植入了一种针对流感病毒血凝素 (HA) 茎部的广泛中和抗体 MEDI8852。小鼠在免疫系统重建后,外周血中约有 0.1% 的B细胞表达该抗体。利用一种包含特定HA抗原 (H3 HK68) 的疫苗进行免疫后,初次免疫产生了 11.5 μg/ml 的几何平均浓度,而加强免疫后滴度跃升至 141 μg/ml。
更深入的基因测序揭示了一个极其重要的生物学现象:对淋巴结生发中心内单细胞分选的编辑B细胞进行分析发现,这些表达外源MEDI8852的细胞不仅发生了克隆扩增,其基因序列还发生了真实的体细胞高频突变 (SHM)。突变主要富集在靠近启动子的区域,整体突变率约为 10^-4 突变/核苷酸。这意味着,这些“人造”的B细胞并没有脱离免疫系统的监管,它们依然能够通过自然进化机制去进一步适应和识别抗原。
为了检验这种防御能力的上限,研究人员进行了极端条件下的致死性病毒挑战实验。他们使用了两种在系统发育上与免疫用抗原 (H3 HK68) 距离较远的异源流感毒株。在面对致死剂量(10倍半数致死量,10^3 PFU)的 A/Puerto Rico/8/1934 (H1N1) 毒株挑战时,对照组小鼠全部出现严重体重下降,60%的小鼠死于感染;而体内运行着 MEDI8852 兵工厂的编辑组小鼠,不仅体重持续增加,且生存率达到了完美的 100%。
在更加严苛的实验中,研究人员使用了致病性更强的 A/Vietnam/1203/2004 (H5N1) 毒株(9倍半数致死量,10^4 PFU)进行挑战。对照组小鼠体重迅速暴跌,死亡率高达 85%;而表达 MEDI8852 的小鼠组则展现出了强大的抗打击能力,体重平均仅出现约 10% 的中度下降,并且最终 70% 的小鼠成功存活下来。统计学数据强有力地证明了,基于干细胞编辑产生的B细胞,能够分泌普遍有效的保护性抗体,跨越亚型界限,抵御致命的流感病毒感染。
开启细胞治疗的新纪元:从干预病症到改写机制
这项由 Hartweger 等人发表在《科学》杂志上的研究,与其说是一次疫苗技术的改良,不如说是一次疾病预防和治疗底层逻辑的范式转移。
传统的基因治疗往往聚焦于肌肉或肝脏等组织,试图通过大量的细胞实现治疗蛋白的持续分泌。这种策略最大的局限在于其不可控性和逐渐衰减的表达量;一旦蛋白浓度低于治疗窗口,往往需要重新进行复杂的基因递送。
而这项研究所展示的“B细胞蛋白质工厂”,充分利用了适应性免疫系统独有的记忆与扩增属性。在平静状态下,只有极少数静息状态的编辑B细胞在体内巡逻,几乎不消耗多余的代谢资源;而一旦通过简单的疫苗加强针引入目标抗原,这些B细胞就会迅速被唤醒,经历指数级的细胞分裂,并在几天内演变成数以万计的微型加工厂(每秒可分泌多达上万个抗体分子),将血液中的抗体或治疗蛋白浓度瞬间推向巅峰。如果未来治疗蛋白水平下降,只需要再打一针极其便宜且成熟的疫苗,就能再次激活这一内置的生产线。
特别是研究中证明的“极低数量干细胞即可启动反应”这一结论,为未来的活体内 (in vivo) 直接基因编辑铺平了道路。也许在不远的将来,我们不再需要在体外繁琐地提取、编辑和回输细胞。只需要通过一次精确的靶向递送,在体内编辑极小比例的造血干细胞,就足以赋予一个人终身抵御HIV、各种突变流感,甚至通过携带不同功能蛋白,为患有遗传性酶缺乏症的个体提供终身的蛋白质替代治疗。
生命科学的魅力,往往在于顺应自然机制而非单纯对抗。当最前沿的CRISPR基因编辑工具,与经历了亿万年进化打磨的B细胞免疫应答系统结合时,我们或许已经找到了对抗那些最狡猾病原体的终极防线。这不仅仅是一个科学构想的实现,更是我们在掌控自身免疫系统、重构生命健康图景的征途上,迈出的无比坚实的一步。
参考文献
Hartweger H, Ruprecht C, Yao KH, Laffont P, Lima Dos Reis G, Zhou P, Hägglöf T, Binet L, Loewe M, Hong JP, Xiao T, Sefik E, Hernandez B, Gazumyan A, Jankovic M, Seaman MS, Costa G, Nelson SA, Clark J, Kanatani S, Wilson PC, Krammer F, Levashina EA, Julien JP, Wardemann H, Sinnis P, Stamatatos L, Flavell RA, Nussenzweig MC. B lymphocyte protein factories produced by hematopoietic stem cell gene editing. Science. 2026 Apr 16;392(6795):eadz8994. doi: 10.1126/science.adz8994. Epub 2026 Apr 16. PMID: 41990179.
声明:本文仅用于分享,不代表平台立场,如涉及版权等问题,请尽快联系我们,我们第一时间更正,谢谢!
往期热文:
Nature | 颠覆经典认知:研究解构慢性痛网络,揭示被长期忽视的皮层-上丘促痛通路
Nature | 破译人类基因组的“隐藏副本”:1116人泛基因组图谱如何重塑我们对遗传机制的认知?
Nature Methods | 人工智能如何重塑我们对基因调控的认知
Cell | 跨界“群聊”:噬菌体间的隐秘通讯如何重塑微观生态?
Nature Genetics | 不仅是单基因突变:大数据实锤渐冻症的“阶梯式”累积遗传风险
Cell | 放弃靶向细胞“身份”,uPAR CAR-T如何通过锁定“病理状态”破局实体瘤?
Nature Medicine | 自闭症的遗传密码受血统影响吗?从新发变异(De novo)视角给出“大一统”答案
Nature Methods | 数字孪生生命:当跨物种基因组学与AI基础模型在三维空间中“折叠”
Nature Genetics | 别再漏掉那些处于“边缘”的因果变异!全新遗传学算法精准打捞“阈值下”的疾病变异
Science | 为什么有些伤痛身体能记一辈子?揭开炎症记忆的“长寿”密码