单细胞组学
1. Germ line LCP1 mutations cause immunodeficiency with neutropenia, monocytopenia, lymphopenia, and defective cytokinesis.
LCP1生殖系突变导致免疫缺陷及胞质分裂缺陷。严重先天性中性粒细胞减少症(SCN)具有高度遗传异质性,仍有大量患者缺乏明确的遗传诊断。研究在4个家系中发现LCP1基因功能增益突变,导致中性粒细胞减少、胞质分裂受阻及白血病风险增加。该研究确定了LCP1为一种新型常染色体显性遗传造血障碍的致病基因,扩展了先天性免疫缺陷的谱系。
严重先天性中性粒细胞减少症(SCN), 免疫缺陷 | LCP1基因, F-actin捆绑 | 单细胞转录组测序, iPSCs技术
van Bergen Thijs · … · Aalbers Anna M · · 2026/02/10
该研究由血液学伊拉斯姆斯大学医学中心Anna M Aalbers团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2025016507
2. Single-cell transcriptomics of the Drosophila ring gland identifies the SoxN-Vvl complex as a key regulator of juvenile hormone biosynthesis.
SoxN-Vvl复合物调控保幼激素合成。保幼激素(JH)对昆虫发育至关重要,但其生物合成的转录调控机制因缺乏细胞类型特异性分辨率而不明。研究通过单细胞转录组测序构建了果蝇环腺图谱,发现SoxN与Vvl结合直接调控JH合成限速酶Jhamt。该研究揭示了昆虫内分泌功能的转录控制机制,为变态发育和生殖研究提供了新靶点。
昆虫发育调控 | SoxN-Vvl复合物, Jhamt | 单细胞转录组测序
Luo Yuhan · … · Liu Suning · · 2026/02/06
该研究由昆虫科学华南师范大学刘素宁团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2520504123
3. HSCs/MPPs as cells of origin with altered differentiation hierarchy impairing immunomicroenvironment in PML::RARA and CBFα/β fusion AML.
HSC/MPP起源影响AML免疫微环境。白血病干细胞(LSCs)是否同时产生白血病细胞和功能障碍的免疫细胞尚待深入探讨。研究通过单细胞测序追踪三种融合基因AML患者,证实HSC/MPP作为起源细胞导致了包括免疫细胞在内的分化层级改变。该发现强调了根除LSC以恢复功能性免疫系统的重要性,并为AML预后评估提供了新模型。
急性髓系白血病 | 白血病干细胞, 融合转录因子 | 单细胞转录组测序
Qiao Niu · … · Chen Sai-Juan · · 2026/02/06
该研究由血液学上海交通大学瑞金医院陈赛娟团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2526334123
4. Single-cell profiling reveals diverse γδ T cell subsets in ulcerative colitis.
单细胞图谱揭示溃疡性结肠炎γδ T细胞异质性。γδ T细胞在维持肠道稳态中起作用,但其在人类溃疡性结肠炎(UC)中的具体贡献仍不清楚。研究利用单细胞测序和质谱流式发现,UC患者肠道中保护性IELs减少,而致病性效应子样亚群显著增加。该研究识别了不同生态位中γδ T细胞的保护或致病功能,为UC的精准免疫治疗提供了依据。
溃疡性结肠炎 | γδ T细胞, 肠道稳态 | 单细胞RNA测序, 质谱流式
Mayer Lena S · … · Hofmann Maike · · 2026/02/06
该研究由胃肠病学弗莱堡大学Hofmann Maike团队完成 Science immunology
原文链接:https://doi.org/10.1126/sciimmunol.adx8474
5. Divergent stem cell mechanisms govern the primary body axis and appendage regeneration in the axolotl.
蝾螈主轴与附肢再生的干细胞机制差异。探索器官再生的基本机制对再生医学至关重要,但主轴与附肢再生中干细胞潜能的差异尚不明确。研究发现尾部肌肉干细胞在再生时可逆转至胚胎中胚层状态并具有多向分化潜能,而肢部则不然,且受TGF-β信号调控。该发现揭示了不同解剖部位再生机制的根本差异,为组织工程和再生治疗提供了理论指导。
组织再生 | 肌肉干细胞, TGF-β信号 | 单细胞转录组测序
Wang Liqun · … · Fei Ji-Feng · · 2026/02/06
该研究由病理学广东省人民医院费继锋团队完成 Science advances
原文链接:https://doi.org/10.1126/sciadv.adx5697
6. Mesothelial cells promote peritoneal invasion and metastasis of ascites-derived ovarian cancer cells through spheroid formation.
间皮细胞通过球体形成促进卵巢癌转移。卵巢癌患者常伴有腹膜转移和腹水,但癌细胞与腹水中非恶性细胞在转移前的相互作用尚不明确。研究发现腹水中的间皮细胞与癌细胞形成聚集团块,通过TGF-β1诱导间皮细胞产生侵袭足,从而启动腹膜侵袭。该发现揭示了卵巢癌在腹腔内快速扩散的新机制,为阻断腹膜转移提供了潜在靶点。
卵巢癌腹膜转移 | 间皮细胞, TGF-β1 | 单细胞RNA测序, 多光子显微镜
Uno Kaname · … · Kajiyama Hiroaki · · 2026/02/06
该研究由妇产科学名古屋大学Kajiyama Hiroaki团队完成 Science advances
原文链接:https://doi.org/10.1126/sciadv.adu5944
7. Comparison with Ezh2 reveals the PRC2-dependent functions of Jarid2 in hematopoietic stem Cell lineage commitment.
Jarid2通过PRC2依赖机制限制造血祖细胞的髓系分化潜能。Jarid2在造血过程中的非规范功能此前尚不明确,其与PRC2核心组分Ezh2的关系待厘清。研究通过比较Jarid2与Ezh2缺失模型,发现Jarid2主要通过PRC2限制髓系分化,而Ezh2缺失则导致淋巴系发育受阻。该研究阐明了表观遗传因子在造血干细胞谱系决定中的精确分工。
造血发育 | Jarid2, PRC2, 髓系分化 | 单细胞转录组学, 基因敲除
Bjeije Hassan · … · Challen Grant A · · 2026/02/05
该研究由肿瘤学与造血干细胞华盛顿大学医学院Grant A. Challen团队完成 Stem cell reports
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2026.102793
8. Hypoxia-inducible factor signaling regulates embryonic interneuron development, GRIN2B expression and adult cortical function.
HIF信号通路调控胚胎期中间神经元发育及成年皮层功能。低氧诱导因子(HIF)是细胞适应代谢波动的核心,但其在抑制性神经元发育中的作用知之甚少。研究发现HIF1A通过直接激活GRIN2B调控中间神经元前体的增殖与突触发生。HIF缺失会导致成年皮层PV神经元减少及突触功能受损,揭示了HIF在皮层环路发育中的非规范功能。
神经发育 | HIF1A, GRIN2B, PV神经元 | 单细胞转录组学, 免疫荧光
Lu I-Ling · … · Rowitch David H · · 2026/02/05
该研究由儿科学与神经生物学剑桥大学David H. Rowitch团队完成 Developmental cell
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.devcel.2026.01.007
9. CCL3 is produced by aged neutrophils across cancers and promotes tumor growth.
CCL3是泛癌种促癌中性粒细胞的关键驱动因子。肿瘤相关中性粒细胞在癌症中广泛存在,但其表型多样性和功能状态尚不明确。本研究通过单细胞测序分析发现一种保守的CCL3高表达终末状态,该状态通过CCR1信号维持缺氧区细胞存活并促进肿瘤生长。该发现确立了CCL3作为促癌中性粒细胞的保守标志物,为跨癌种中性粒细胞生物学研究提供了新框架。
肿瘤免疫微环境 | CCL3, CCR1, 缺氧适应 | 单细胞RNA测序, 细胞类型概率分类器
Bolli Evangelia · … · Pittet Mikaël J · Cancer cell · 2026/02/05
⭐ 该研究由肿瘤学日内瓦大学Mikaël J Pittet团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.ccell.2026.01.006
10. Mitochondria-targeted nanozyme system for psoriasis treatment.
线粒体靶向纳米酶系统有效缓解银屑病。银屑病是一种慢性炎症性皮肤病,中性粒细胞过度激活及氧化应激是其核心病理。研究开发了集成白藜芦醇与氧化铈纳米酶的凝胶平台,通过调节ROS/mTOR/HIF-1α轴抑制炎症。该多功能纳米疗法为银屑病及其他慢性炎症性疾病的治疗提供了新策略。
银屑病 | ROS/mTOR/HIF-1α轴, 中性粒细胞胞外陷阱 | 纳米酶, 单细胞RNA测序
Mou Yan · … · Wang Shuang · · 2026/02/07
该研究由皮肤科吉林大学第二医院Wang Shuang团队完成 Journal of nanobiotechnology
原文链接:https://doi.org/10.1186/s12951-026-04068-z
11. α-Synuclein aggregation and brain atrophy in SNCA-A53T transgenic monkeys correlate with parkinsonism.
SNCA-A53T转基因猴重现帕金森病病理。帕金森病(PD)病理演变漫长,亟需能模拟人类疾病进展的非人灵长类模型。研究通过多模态评估发现,该模型猴表现出α-突触共核蛋白聚集、多巴胺能变性及运动认知障碍。该研究证明了转基因猴模型在追踪PD病程及评估干预手段中的独特价值。
帕金森病 | α-突触共核蛋白, 多巴胺能变性 | 非人灵长类模型, 多模态影像
Wei Jingkuan · … · Niu Yuyu · · 2026/02/07
该研究由灵长类生物医学昆明理工大学牛昱宇团队完成 Brain : a journal of neurology
原文链接:https://doi.org/10.1093/brain/awag046
空间组学
1. In situ spatial transcriptomics reveals novel markers of the limbal stem cell niche and ocular surface epithelia.
空间转录组学揭示角膜缘干细胞生态位及眼表上皮的新标志物。角膜缘干细胞对角膜再生至关重要,但其空间定位在单细胞测序中易丢失,限制了对其身份的理解。研究利用原位空间转录组技术鉴定了Krt16和Nkiras1等新标志物,并证实Krt16与慢周期干细胞相关。这些数据为优化角膜缘干细胞移植治疗提供了精确的分子图谱。
角膜再生 | 角膜缘干细胞生态位 | 空间转录组学, 原位杂交
Nureen Lamia · … · Di Girolamo Nick · · 2026/02/05
该研究由生物医学科学新南威尔士大学Nick Di Girolamo团队完成 Stem cell reports
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2026.102792
基因组或者转录组学
1. Deciphering DST-associated disorders: biallelic variants affecting DST-b cause a congenital myopathy.
DST-b亚型双等位基因变异导致先天性肌病。营养不良蛋白基因(DST)变异已知与神经病和皮肤病相关,但其在肌肉疾病中的作用尚未完全阐明。研究发现DST-b特异性变异导致严重的先天性肌病和心肌病,而同时影响DST-a和DST-b则导致致死性挛缩综合征。该研究重新定义了DST的致病谱系,为先天性肌病的诊断和表型预测提供了依据。
先天性肌病, 扩张型心肌病 | DST基因, DST-b亚型 | 外显子组测序, 蛋白质组学
Jacob Maureen · … · Wagner Matias · · 2026/02/07
该研究由医学遗传学慕尼黑工业大学Matias Wagner团队完成 Brain : a journal of neurology
原文链接:https://doi.org/10.1093/brain/awaf227
2. Vulnerability of SRSF2-mutated chronic myelomonocytic leukemia to perturbation of the cGAS-STING pathway.
SRSF2突变型CMML对cGAS-STING通路具有依赖性。慢性粒单核细胞白血病(CMML)易进展为急性髓系白血病,但缺乏能模拟其临床特征及进展过程的动物模型。研究构建了SRSF2突变斑马鱼模型,发现突变通过诱导DNA损伤激活cGAS-STING通路,抑制该通路可显著缓解白血病表型。该发现揭示了SRSF2突变与炎症激活之间的致病联系,为CMML提供了潜在的治疗干预靶点。
慢性粒单核细胞白血病 | cGAS-STING通路, SRSF2突变 | 斑马鱼模型, 转录组分析
Chen Yanan · … · Sun Xuan · · 2026/02/10
该研究由血液病学香港大学Sun Xuan团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2025017005
3. Mechanistic insights and in vivo HIV suppression by the BRD4-targeting small molecule ZL0580.
BRD4靶向分子ZL0580实现体内HIV抑制。表观遗传抑制HIV是实现“封锁与释放”治愈策略的有前途方向,但BRD4选择性抑制剂的体内效力及机制仍需明确。研究证实ZL0580通过结合BRD4的BD1结构域诱导独特的基因表达程序,在人源化小鼠模型中能强效抑制病毒复制并延迟反弹。该研究确立了ZL0580作为体内HIV表观遗传抑制剂的地位,为开发新型HIV治愈候选药物提供了概念验证。
HIV-1感染 | BRD4, ZL0580 | 人源化小鼠模型, RNA-seq
Kumar Naveen · … · Hu Haitao · · 2026/02/02
该研究由免疫学德克萨斯大学医学分部Hu Haitao团队完成 PLoS pathogens
原文链接:https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013449
4. PTP1B inhibition promotes microglial phagocytosis in Alzheimer's disease models by enhancing SYK signaling.
抑制PTP1B通过增强SYK信号促进AD模型中小胶质细胞吞噬。小胶质细胞对Aβ吞噬功能受损是阿尔茨海默病的关键特征,增强这一先天免疫功能具有重要的治疗潜力。研究发现抑制PTP1B能通过激活SYK信号和AKT-mTOR通路,促进小胶质细胞向免疫激活和吞噬状态转变,从而减少Aβ负担。该研究确立了PTP1B作为小胶质细胞激活的关键调节因子,为AD治疗提供了新的潜在靶点。
阿尔茨海默病 | PTP1B, SYK信号通路 | 基因敲除, 转录组分析
Cen Yuxin · … · Tonks Nicholas K · · 2026/02/02
该研究由细胞生物学冷泉港实验室Nicholas K Tonks团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2521944123
5. A genomically-tailored multi-agent precision medicine clinical trial for adults with recurrent glioblastoma.
复发性胶质母细胞瘤的基因组定制多药精准治疗试验。复发性胶质母细胞瘤(rGBM)疗效极差且具有高度异质性,单一靶点疗法在临床中屡遭失败。这项1期临床试验根据患者肿瘤的基因组谱定制包含多达4种药物的联合方案,结果显示中位生存期为12.7个月,但毒性限制了剂量。该研究证明了在rGBM中实施个体化多药方案的可行性,但也强调了克服药物毒性和耐药进化的巨大挑战。
复发性胶质母细胞瘤 | 基因组异质性, 耐药进化 | 精准医学, 临床试验
Chen Jiaying · … · Clarke Jennifer L · · 2026/02/06
该研究由神经肿瘤学加州大学旧金山分校Jennifer L Clarke团队完成 Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
原文链接:https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-25-4080
6. Clonal hematopoiesis after 177Lu-PSMA-617 radioligand therapy in prostate cancer.
177Lu-PSMA-617放射配体疗法促进前列腺癌克隆性造血。放射暴露可能加剧克隆性造血风险,但其在新型放射配体疗法中的影响尚不明确。研究发现177Lu-PSMA-617显著诱导PPM1D等基因突变及克隆扩张,频率高于化疗。这提示在临床应用中需加强对长期血液系统后遗症的监测。
前列腺癌, 克隆性造血 | PPM1D, DNA损伤反应 | 放射配体疗法, 深度靶向测序
Munzur Aslı D · … · Wyatt Alexander W · · 2026/02/06
该研究由肿瘤基因组学不列颠哥伦比亚大学Wyatt Alexander W团队完成 Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
原文链接:https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-25-4001
7. Telomere-to-telomere assembly detects genomic diversity in Canadian strains of Borrelia burgdorferi.
T2T组装揭示伯氏疏螺旋体基因组多样性。莱姆病病原体基因组复杂,传统方法难以完整组装其线性质粒和端粒。研究开发了结合长短读段的流水线,实现了加拿大菌株的端粒到端粒组装。这揭示了菌株间显著的基因多样性,为理解病原体快速进化提供了新视角。
莱姆病, 基因组多样性 | 线性质粒, 端粒 | T2T组装, 长读段测序
Amin Atia B · … · Langlais David · · 2026/02/04
该研究由基因组医学麦吉尔大学Langlais David团队完成 Cell reports
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116935
8. Porcine B cell receptor repertoire uncovers balanced recognition of antigenic structures on serotype Asia1 foot-and-mouth disease virus.
猪B细胞受体库揭示亚洲I型口蹄疫病毒的平衡抗原识别。口蹄疫病毒亚洲I型具有较强免疫原性,但其抗原识别特征尚不明确。研究通过分析猪BCR库鉴定出多种中和抗体,发现其对VP1、VP2及VP3上的多个表位具有平衡的免疫应答。这种多样化的抗体反应有助于实现有效的病毒中和与保护。
口蹄疫, 免疫原性 | B细胞受体, 中和抗体, 抗原表位 | BCR库测序, 冷冻电镜
Huang Shulun · … · Zhang Qiang · · 2026/02/06
该研究由动物疫病防控兰州兽医研究所Zhang Qiang团队完成 PLoS pathogens
原文链接:https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013893
9. Cohesin-mediated chromatin organization controls the differentiation and function of dendritic cells.
粘连蛋白介导的染色质组织控制DC分化。粘连蛋白复合物挤压染色质环以组织染色体,但该过程在免疫细胞分化中的生物学意义尚不明确。研究发现粘连蛋白与转录因子IRF8协同作用,通过调节染色质折叠来控制树突状细胞(DCs)的分化及IL-12分泌。该数据揭示了染色质高级结构与谱系特异性转录因子间的双向互作,深化了对免疫发育的理解。
树突状细胞分化 | 粘连蛋白, IRF8 | 染色质构象捕获, 基因表达调控
Adams Nicholas M · … · Reizis Boris · · 2026/02/06
该研究由病理学纽约大学Reizis Boris团队完成 Science immunology
原文链接:https://doi.org/10.1126/sciimmunol.adx4622
10. Animal-associated jumbo phages as widespread and active modulators of gut microbiome ecology and metabolism.
巨型噬菌体调节肠道微生物代谢。巨型噬菌体在生物圈中广泛存在,但在人类肠道中的流行情况和生态作用仍不清楚。研究在人和动物肠道宏基因组中发现了大量Jug巨型噬菌体,其具有高度的转录活性并能感染拟杆菌。该发现强调了巨型噬菌体在肠道生态系统中的重要地位。
肠道微生物群, 噬菌体生态 | 巨型噬菌体(Jug), 跨物种传播 | 宏基因组学, 转录活性分析
Chen LinXing · … · Li Hao · · 2026/02/06
该研究由环境科学中国科学技术大学李浩团队完成 Science advances
原文链接:https://doi.org/10.1126/sciadv.aeb6265
11. Convergence for Inactivation of TGF-β Signaling Is a Common Feature of Advanced Pancreatic Cancer.
TGF-β信号失活是晚期胰腺癌特征。研究通过对晚期胰腺癌患者进行多区域外显子组测序,发现TGF-β通路的趋同进化是其核心特征。研究揭示了SMAD4失活与远处转移、TGF-β受体失活与局部晚期病变之间的关联。这些发现为区分胰腺癌转移倾向及指导新辅助化疗提供了遗传学标志物。
胰腺癌, 肿瘤转移 | TGF-β通路, SMAD4失活, 趋同进化 | 全外显子组测序, 类器官模型
Hong Jungeui · … · Iacobuzio-Donahue Christine A · · 2026/02/09
该研究由肿瘤遗传学纪念斯隆-凯特琳癌症中心Christine A Iacobuzio-Donahue团队完成 Cancer discovery
原文链接:https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-24-0772
12. LDB1 represses fetal hemoglobin expression by enhancing BCL11A transcription.
LDB1通过增强BCL11A转录抑制胎儿血红蛋白。揭示血红蛋白转换机制对治疗相关血液病具有重要临床意义。研究鉴定出LDB1是β-珠蛋白转换的关键调节因子,其通过直接结合并增强BCL11A的转录来抑制胎儿血红蛋白。该发现阐明了LDB1在红细胞生成过程中沉默胎儿珠蛋白的必不可少的作用。
血红蛋白转换, 珠蛋白生成障碍 | LDB1, BCL11A转录, 胎儿血红蛋白(HbF) | CRISPR/Cas9, ChIP分析
Park Si-Won · … · Chun Taehoon · · 2026/02/04
该研究由生物技术高丽大学Taehoon Chun团队完成 Redox biology
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.redox.2026.104070
13. Validation and context-dependent effects of a prostate cancer polygenic risk score in the All of Us Research Program.
多血统前列腺癌多基因风险评分在多样化人群中得到验证。前列腺癌风险分层对临床至关重要,但多基因风险评分(PRS)在不同人口学和生活方式背景下的效用尚不明确。本研究利用All of Us项目数据验证了包含451个变异的PRS,发现其在不同血统中均有强关联,且受年龄、BMI和医疗获取情况调节。该发现强调了在临床应用PRS时需考虑个体背景因素,以提升预测精准度。
前列腺癌 | 遗传风险因素, 多基因风险评分 | 风险分层, 孟德尔随机化
Cheng Shuyan · … · Darst Burcu F · · 2026/02/05
该研究由流行病学与遗传学弗雷德·哈钦森癌症中心Burcu F. Darst团队完成 American journal of human genetics
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2026.01.002
14. Expanded chromatin accessibility mapping explains genetic variation associated with complex traits in liver.
肝脏染色质开放性图谱揭示血脂相关复杂性状的遗传机制。GWAS识别了大量性状相关位点,但其调控基因表达的具体分子机制仍待阐明。研究通过189份肝脏样本的ATAC-seq数据,鉴定出逾1.4万个caQTL,并将其与血脂GWAS信号共定位。该研究为理解复杂性状的遗传变异提供了分子假说,并强调了多组学整合的重要性。
血脂异常 | 染色质开放性, 基因表达调控 | ATAC-seq, caQTL
Wenz Brandon M · … · Voight Benjamin F · · 2026/02/05
该研究由遗传学与系统药理学宾夕法尼亚大学Benjamin F. Voight团队完成 American journal of human genetics
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2026.01.003
15. Systematic transcriptome analysis reveals the function of alternative promoters in hematopoietic lineages.
系统转录组分析揭示替代启动子在造血谱系决定中的关键作用。替代启动子对谱系特异性表达至关重要,但在造血系统中的系统性作用尚不明确。研究分析了532份RNA-seq数据,构建了高分辨率启动子活动图谱,并验证了Pou2f1和Ikzf1等基因的谱系特异性开关。该研究为理解造血调控及靶向特定启动子治疗疾病提供了理论基础。
造血谱系决定 | 替代启动子, 谱系特异性表达 | RNA-seq, CRISPRi
Zhang Tianzhe · … · Zhang Baojun · · 2026/02/05
该研究由病原微生物与免疫学西安交通大学张保军团队完成 Stem cell reports
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2026.102791
16. Symbiotic entrenchment through ecological Catch-22.
进化“第22条军规”解释了共生生物不可逆依赖性的起源。共生生物为何演化出对宿主的绝对依赖是一个进化难题。研究发现一种甲虫通过转录沉默停止合成自身信息素,从而完美模拟蚂蚁化学特征以渗透蚁群。然而,这种沉默是不可逆的,使甲虫陷入既无法离开宿主又必须维持模拟的困境。该发现揭示了性状间的上位性如何锁定共生演化路径。
共生演化 | 转录沉默, 化学模拟 | 转录组分析, 化学分析
Naragon Thomas H · … · Parker Joseph · Cell · 2026/02/05
⭐ 该研究由生物学与生物工程加州理工学院Joseph Parker团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.12.041
17. VPA targets Mid1 improves hippocampal neurons retrograde axonal transport function disruption in lithium manganate-induced mice learning and memory dysfunction through the ubiquitin-proteasome pathway.
丙戊酸通过调节Mid1改善锰酸锂诱导的学习记忆障碍。锰酸锂作为新型污染物对海马核心功能的神经毒性机制尚不明确。研究发现锰酸锂暴露通过上调E3泛素连接酶Mid1,经泛素-蛋白酶体途径降解动力蛋白,破坏海马神经元逆行轴突运输。丙戊酸(VPA)处理可显著减轻神经损伤并改善记忆功能,为防治锰酸锂诱导的神经毒性提供了潜在靶点。
学习记忆障碍 | Mid1, 泛素-蛋白酶体途径, 轴突运输 | 转录组测序, 活细胞成像
Wang Xinmiao · … · Deng Yu · · 2026/02/04
该研究由神经生物学中国医科大学邓宇团队完成 Journal of advanced research
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.jare.2026.01.081
18. The impact of adverse childhood experiences on gut microbiota and markers of inflammation is mediated by obesity and depression.
童年逆境通过肥胖和抑郁介导孕期炎症及肠道菌群改变。童年逆境(ACEs)与成年后的肥胖、精神症状及炎症水平升高密切相关。研究通过宏基因组测序发现,ACEs通过预测孕前BMI和孕期抑郁症状,分别影响血清炎症指标和肠道菌群组成。该研究揭示了ACEs影响孕期健康的双重风险路径,强调了心理健康与代谢状态在菌群调节中的作用。
童年逆境, 孕期健康 | 肠道菌群, 炎症标志物 | 宏基因组测序, 路径分析
Hantsoo Liisa · … · Tanes Ceylan · · 2026/02/04
该研究由胃肠病学费城儿童医院Ceylan Tanes团队完成 Brain, behavior, and immunity
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.bbi.2026.106479
19. Human pluripotent stem cell model of multiple epiphyseal dysplasia with MATN3 mutation identifies altered Matrix organisation and upregulation of the cholesterol biosynthesis pathway.
人多能干细胞模型揭示多发性骨骺发育不良的致病机制。MATN3突变导致的多发性骨骺发育不良(MED)缺乏有效的体外研究模型。研究利用hPSC分化及CRISPR基因编辑技术构建了MED软骨模型,通过转录组测序发现突变导致细胞外基质组织异常及胆固醇生物合成途径上调。该模型为理解MED发病机制提供了新见解,并确定了潜在的治疗靶点。
多发性骨骺发育不良 | MATN3突变, 胆固醇生物合成 | 人多能干细胞, CRISPR-Cas9
Woods Steven · … · Kimber Susan J · · 2026/02/04
该研究由再生医学曼彻斯特大学Susan J Kimber团队完成 Osteoarthritis and cartilage
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.joca.2026.01.633
20. Genomics of rafting crustaceans reveals adaptation to climate change in tropical oceans.
漂流甲壳动物基因组揭示热带海洋对气候变化的适应机制。沿海物种如何通过漂流扩散适应气候驱动的环境变化及洋流波动尚不明确。研究整合模拟、生态基因组学和压力实验,发现漂流种群通过渗透调节位点的选择性扫荡和基因家族扩增来应对盐度波动。该研究强调了漂流扩散与基因组变化之间的协同作用,揭示了物种适应快速变化海洋条件的能力。
气候变化适应 | 渗透调节, 基因家族扩增 | 生态基因组学, 扩散模拟
Liu Hongguang · … · Hou Zhonge · · 2026/02/06
该研究由进化生物学领域中国科学院动物研究所侯仲娥团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-69173-x
21. Heterogeneous multicopy of blaCTX-M variants on the same plasmid enhances evolutionary adaptability in clinical Klebsiella pneumoniae.
同一质粒上blaCTX-M变体的异质多拷贝增强了克雷伯氏菌的进化适应性。病原菌在抗菌压力下的进化策略是临床关注的焦点。研究在一株耐药肺炎克雷伯菌中发现,同一质粒上的两个不同blaCTX-M变体位点能根据抗生素压力动态调整比例。数学模型证明,这种单质粒异质排列比多质粒分布具有更高的稳定性和竞争优势。该发现揭示了细菌通过基因多拷贝异质性应对波动临床压力的进化新策略。
抗生素耐药性, 肺炎克雷伯菌 | blaCTX-M变体, 质粒进化 | 基因组分析, 数学建模
Weng Rui · … · Jiang Yan · · 2026/02/07
该研究由传染病学领域浙江大学医学院附属邵逸夫医院江燕团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-69266-7
22. Whole-genome sequencing analysis of anthropometric traits in 672,976 individuals reveals convergence between rare and common genetic associations.
全基因组测序揭示人体测量性状的罕见与常见变异收敛。GWAS通常关注常见变异,对罕见非编码变异的贡献了解不足。通过分析超67万人的WGS数据,识别出多个影响身高和BMI的罕见变异,并发现其多位于已知GWAS位点附近。该研究强调了罕见变异在复杂性状遗传架构中的作用。
身高, BMI, 肥胖 | 罕见变异, 遗传力 | 全基因组测序, 关联分析
Hawkes Gareth · … · Weedon Michael N · · 2026/02/06
该研究由临床与生物医学埃克塞特大学Michael N. Weedon团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-69208-3
23. Adipocyte-driven STAT3-ANGPT2-PTGIS axis promotes cutaneous metastasis in breast cancer and represents a targetable pathway.
脂肪细胞驱动的STAT3轴促进乳腺癌皮肤转移。乳腺癌皮肤转移(CMBC)具有侵袭性且临床研究有限。研究发现脂肪细胞信号通过激活STAT3上调ANGPT2等基因,促进血管生成和代谢重编程。该发现确定了STAT3通路是治疗CMBC的潜在靶点。
乳腺癌皮肤转移 | STAT3通路, 血管生成 | 转录组测序, 小鼠模型
Luo Chi-Wen · … · Pan Mei-Ren · · 2026/02/06
该研究由临床医学高雄医学大学Pan Mei-Ren团队完成 NPJ precision oncology
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41698-025-01184-1
24. Sleep deprivation disrupts lacrimal gland homeostasis via hypothalamic-pituitary-adrenal axis and gut dysbiosis in mice.
睡眠剥夺通过HPA轴和肠道菌群失调破坏泪腺稳态。睡眠剥夺驱动眼表疾病的机制尚不明确。研究发现慢性睡眠剥夺激活HPA轴并改变肠道菌群,导致泪腺萎缩和炎症。该研究建立了“HPA-肠道菌群-泪腺”轴,为治疗睡眠相关泪腺功能障碍提供了策略。
干眼症, 泪腺功能障碍 | HPA轴, 肠道菌群, IL-17 | 粪菌移植, 转录组学
Huang Shenzhen · … · Li Zhijie · · 2026/02/06
该研究由眼科学河南省眼科研究所李志杰团队完成 Communications biology
原文链接:https://doi.org/10.1038/s42003-026-09657-0
25. Therapeutic optimization of LIPA targeting to induce endoplasmic reticulum stress and cell death in ovarian cancer.
优化LIPA靶向治疗以诱导卵巢癌内质网应激和细胞死亡。卵巢癌是致死率最高的妇科恶性肿瘤,亟需新疗法。研究开发了高效类似物ERX-208,通过靶向LIPA触发强烈的内质网应激并诱导凋亡。该研究支持ERX-208作为卵巢癌临床治疗候选药物的进一步开发。
卵巢癌 | LIPA靶点, 内质网应激 | 药物优化, PDX模型
Viswanadhapalli Suryavathi · … · Vadlamudi Ratna K · · 2026/02/06
该研究由妇产科学德克萨斯大学圣安东尼奥分校Ratna K Vadlamudi团队完成 Oncogene
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41388-026-03689-w
26. A genetic atlas of relationships between circulating metabolites and liability to psychiatric conditions.
循环代谢物与精神疾病易感性关系的遗传图谱。观察性研究发现精神疾病伴随代谢改变,但因果关系不明。通过大规模GWAS分析,识别出多种代谢物与抑郁、厌食症等存在遗传相关性和因果联系。这些发现为精神疾病的生物标志物和治疗靶点开发提供了依据。
抑郁症, 厌食症 | 循环代谢物, 遗传相关性 | GWAS, 孟德尔随机化
Kiltschewskij Dylan J · … · Cairns Murray J · · 2026/02/06
该研究由生物医学纽卡斯尔大学Murray J Cairns团队完成 Molecular psychiatry
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41380-026-03464-z
27. METTL3-based epitranscriptomic editing screening identifies functional m6A sites in cancers.
基于METTL3的表观转录组编辑筛选识别癌症中的功能性m6A位点。m6A修饰调节 gene 表达,但其在癌症中的全转录组功能图谱仍不明确。开发了靶向m6A沉积筛选平台,识别出222个调节细胞增殖的位点,包括CHD9上的抑癌位点。该研究为系统探索RNA修饰在癌症中的功能建立了可扩展框架。
癌症增殖 | m6A修饰, CHD9, METTL3 | 表观转录组筛选, CRISPR
Xu Xin · … · He Housheng Hansen · Nature cancer · 2026/02/06
⭐ 该研究由抗体工程南方医科大学Housheng Hansen He团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1038/s43018-026-01117-2
蛋白质组学
1. Recurrent Immunogenic Neoantigens and Their Cognate T-cell Receptors in Treatment-Resistant Metastatic Prostate Cancer.
治疗耐药性转移性前列腺癌中的复发性免疫原性新抗原。转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)急需克服耐药性的新型免疫疗法。研究开发了SpotNeoMet管线,识别出源自AR H875Y突变的新抗原及其特异性TCR,并证实其能有效杀伤前列腺癌细胞。该研究为耐药性癌症提供了系统的新抗原识别框架和潜在的T细胞免疫治疗方案。
转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC), 治疗耐药 | AR H875Y突变, 新抗原 | 免疫肽组学, TCR-T疗法
Gumpert Nofar · … · Samuels Yardena · · 2026/02/06
该研究由分子细胞生物学魏茨曼科学研究所Yardena Samuels团队完成 Cancer discovery
原文链接:https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-24-1213
2. Molecular assemblies and pharmacology of cerebellar GABAA receptors.
小脑GABAA受体的分子组装与药理学特征。α1亚基GABAA受体广泛表达且具药理重要性,但其在特定脑区的多样性尚不明确。研究结合质谱与冷冻电镜,解析了小脑中八种天然受体复合物的结构,包括首个α6亚基结构。该研究揭示了亚基特异性调节剂的结合模式,为精准神经药理学奠定了基础。
抑制性神经传递 | GABAA受体, α6亚基, 变构调节 | 冷冻电镜, 质谱
Sun Chang · … · Gouaux Eric · · 2026/02/06
该研究由结构生物学俄勒冈健康与科学大学Eric Gouaux团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2524504123
3. Variable thresholds for phosphorylation targets of the ERK signaling pathway.
ERK信号通路磷酸化靶点的可变阈值机制。ERK调控的细胞命运取决于信号强度,但其上游磷酸化响应的阈值机制不明。磷酸化蛋白质组学研究发现,大多数靶点呈线性响应,但部分位点存在非线性阈值,分别对应增殖抑制或DNA修复。这证明信号阈值存在于磷酸化组水平,决定了细胞的差异化响应。
细胞命运决定, 信号转导 | ERK通路, 磷酸化阈值, DNA修复 | 磷酸化蛋白质组学, 质谱
Hayashi Kristyn · … · Ahn Natalie G · · 2026/02/06
该研究由生物化学科罗拉多大学Ahn Natalie G团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2517889123
4. A near-complete map of human cytosolic degrons and their relevance for disease.
人类胞质降解子近乎完整的图谱。降解子是引导蛋白质降解的关键片段,但其在人类蛋白质组中的分布及与疾病的关系尚不全面。研究通过大规模筛选20万个肽段,绘制了覆盖99.7%胞质蛋白的降解子图谱,并利用机器学习预测了致病变异。该研究揭示了蛋白质稳态调控的深层机制,为理解生殖细胞编码变异的致病性提供了新工具。
蛋白质稳态 | 降解子, 泛素-蛋白酶体系统 | 大规模肽段筛选, 机器学习
Voutsinos Vasileios · … · Hartmann-Petersen Rasmus · · 2026/02/06
该研究由蛋白质科学哥本哈根大学Hartmann-Petersen Rasmus团队完成 Science advances
原文链接:https://doi.org/10.1126/sciadv.adz3483
5. Proximity proteomics reveals OTUD6B regulation of stress granule dynamics through coalescence with VCP/p97.
邻近蛋白质组学揭示OTUD6B通过与VCP/p97结合调节应激颗粒动态。应激颗粒(SGs)的失调与神经退行性疾病密切相关,但其动态调节机制尚不明确。研究通过邻近蛋白质组学发现去泛素化酶OTUD6B与SG解聚因子VCP结合,并调节SGs的早期组装与清除。该发现建立了OTUD6B作为SG动态关键调节者的地位,为理解应激反应及相关疾病机制提供了新线索。
应激颗粒动态 | OTUD6B, VCP/p97 | 邻近蛋白质组学
Yang Dian · … · Liu Han · · 2026/02/06
该研究由细胞生物学大连医科大学刘涵团队完成 Cell death & disease
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41419-026-08451-4
6. Photosensitizer proximity labeling captures the lipid and protein interactomes.
光敏剂邻近标记捕获脂质和蛋白质相互作用组。表征细胞膜上动态的分子相互作用具有挑战性。开发了基于单线态氧的光催化邻近标记平台POCA,可同时报告蛋白质和脂质的相互作用。该平台为系统研究细胞内复杂的相互作用组提供了通用工具。
膜蛋白相互作用 | 胆固醇结合蛋白 | 邻近标记, 蛋白质组学
Becker Andrew P · … · Backus Keriann M · Nature chemical biology · 2026/02/06
⭐ 该研究由生物化学加州大学洛杉矶分校Keriann M Backus团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41589-026-02140-1
代谢组学
1. Targeting lipid droplets in FUS-linked amyotrophic lateral sclerosis mitigates neuronal and astrocytic lipotoxicity.
靶向脂滴缓解FUS相关肌萎缩侧索硬化症的脂毒性。肌萎缩侧索硬化症(ALS)存在代谢重编程,但脂质代谢异常对神经病理的具体影响仍不清楚。研究发现FUS突变导致神经元和星形胶质细胞中脂滴积聚,而Arimoclomol通过增强线粒体β-氧化减少脂毒性并改善表型。该研究揭示了线粒体脂质代谢在ALS发病中的新作用,并确定了缓解脂毒性的潜在治疗途径。
肌萎缩侧索硬化症(ALS), 脂毒性 | FUS蛋白, 脂滴/线粒体代谢 | 代谢组学, Arimoclomol干预
Marcadet Laetitia · … · Sephton Chantelle F · · 2026/02/07
该研究由神经科学拉瓦尔大学Chantelle F Sephton团队完成 Brain : a journal of neurology
原文链接:https://doi.org/10.1093/brain/awaf328
2. Metformin induces ferroptosis associated with lipidomic remodeling in AML.
二甲双胍通过脂质组重塑诱导急性髓系白血病细胞铁死亡。急性髓系白血病(AML)高度依赖氧化磷酸化,寻找安全有效的代谢抑制剂是临床关注的重点。研究发现二甲双胍能诱导AML细胞铁死亡,且该效应在脂质代谢紊乱的样本中更显著,并与DGAT1抑制具有协同作用。该研究揭示了二甲双胍抗白血病的新机制,为利用代谢脆弱性进行AML个性化治疗提供了依据。
急性髓系白血病(AML), 代谢脆弱性 | 铁死亡, 二甲双胍/DGAT1 | 脂质组学, 蛋白质组学
Sternadt Dominique · … · Schuringa Jan Jacob · · 2026/02/10
该研究由血液学格罗宁根大学Jan Jacob Schuringa团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2025016155
3. Indole-3-Propionic Acid Improves Alveolar Development Impairment via Targeting VAMP8-mediated SNAREs Complex Formation in Bronchopulmonary Dysplasia.
吲哚-3-丙酸改善支气管肺发育不良。支气管肺发育不良(BPD)严重损害肺泡发育,目前缺乏有效的代谢干预手段。研究发现色氨酸代谢物吲哚-3-丙酸(IPA)水平在BPD中显著降低,补充IPA可促进自噬体-溶酶体融合并减轻肺泡损伤。该研究为BPD的治疗提供了潜在的代谢靶点。
支气管肺发育不良(BPD), 肺泡发育 | 吲哚-3-丙酸(IPA), VAMP8磷酸化, 自噬 | 代谢组学, 分子对接
Wang Beibei · … · Cheng Rui · · 2026/02/06
该研究由新生儿医学南京医科大学程锐团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
原文链接:https://doi.org/10.1002/advs.202502610
4. Mendelian randomization linking metabolites with enzymes reveals pathway regulation and therapeutic avenues.
孟德尔随机化揭示人类代谢网络中的酶促反应与通路调节。人类生化反应网络复杂且调节机制研究不足,限制了代谢相关疗法的开发。研究结合蛋白质与代谢物QTL数据,利用遗传变异评估了945种酶-底物关系,并识别出多个药物靶点关联。该工作证明了MR技术在探索代谢调节及发现新治疗途径方面的巨大潜力。
代谢调节 | 酶-底物关系, 药物靶点 | 孟德尔随机化, QTL分析
van der Graaf Adriaan · … · Kutalik Zoltán · · 2026/02/05
该研究由统计遗传学洛桑大学Zoltán Kutalik团队完成 American journal of human genetics
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2025.12.013
5. Microglial Metabolic Reprogramming in Alzheimer's Disease: Pathways, Mechanisms, and Therapeutic Implications.
小胶质细胞代谢重编程在阿尔茨海默病中的作用及治疗意义。中枢神经系统细胞的免疫代谢在阿尔茨海默病(AD)进展中扮演关键角色。本文综述了小胶质细胞在AD中针对葡萄糖、脂肪酸和氨基酸的代谢重编程过程及其分子调节通路。文章探讨了代谢组学在早期诊断中的潜力,并提出了靶向代谢调节与神经保护相结合的创新药物研发方向。
阿尔茨海默病 | 小胶质细胞, 代谢重编程 | 代谢组学分析
Yang Feng-Ge · … · Li Hong-Lin · · 2026/02/04
该研究由神经生物学黑龙江中医药大学李鸿林团队完成 Ageing research reviews
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.arr.2026.103050
多组学
1. Micro- and nanoplastics facilitate the propagation of antimicrobial resistance in mixed microbial consortia.
微/纳米塑料促进微生物群落抗生素耐药性传播。塑料污染与抗生素耐药性的相互作用机制尚不清晰。研究发现纳米塑料通过诱导氧化应激和膜损伤,显著上调水平基因转移及耐药基因丰度。这表明纳米塑料是耐药性传播的热点,对生态安全具有重要影响。
抗生素耐药性, 塑料污染 | 水平基因转移, 氧化应激 | 多组学分析, 微宇宙实验
Zhen Jianyuan · … · Ni Bing-Jie · · 2026/02/04
该研究由环境工程新南威尔士大学Ni Bing-Jie团队完成 Cell reports
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116946
2. Evolutionary bioenergetics of sporulation.
细菌孢子形成的进化生物能量学成本。孢子形成是细菌在极端环境下的生存策略,但其精确的能量消耗尚不清楚。研究通过整合多组学数据,量化发现孢子循环是最高耗能过程之一,主要源于翻译和膜合成。这种高额的前期投资与长期生存收益间的权衡,塑造了孢子形成的进化效率与策略。
细菌生存策略, 孢子形成 | ATP消耗, 能量代谢, 进化权衡 | 多组学整合, 代谢建模
Karakoç Canan · … · Lennon Jay T · · 2026/02/06
该研究由生物学印第安纳大学Lennon Jay T团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2524274123
3. Ufd2p promotes efficient crossover formation by destabilizing Top2p during meiosis.
Ufd2p通过降解Top2p促进减数分裂重组。减数分裂中交叉(CO)形成的调节机制尚不完全清楚,尤其是泛素-蛋白酶体系统在其中的具体作用。研究发现E3酶Ufd2p通过介导拓扑异构酶II(Top2p)的降解来维持DNA超螺旋稳态,从而确保正常的CO频率。该研究揭示了从酵母到哺乳动物保守的CO调节机制,为理解遗传多样性产生提供了分子基础。
减数分裂重组 | Ufd2p, Top2p | 遗传筛选, 多组学分析
Tan Taicong · … · Liu Chao · · 2026/02/06
该研究由生殖健康广州市妇女儿童医疗中心刘超团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2517398123
4. NRF2 deficit prevents pathologic Tau seeding and spreading in an induced tauopathy mouse model.
NRF2缺失阻碍Tau蛋白播散。NRF2通常被认为具有神经保护作用,但其在tau蛋白病早期阶段的影响尚不明确。研究意外发现,NRF2缺失导致的代谢和星形胶质细胞重塑环境反而阻碍了tau蛋白的播散。该发现揭示了NRF2在调节细胞成熟度和tau蛋白传播中的复杂作用,为治疗提供了新视角。
阿尔茨海默病, Tau蛋白病 | NRF2, Tau蛋白播散, 氧化应激 | 磷酸化蛋白质组学, 转录组学
López-Sampere Yaiza · … · Andrés-Benito Pol · Redox biology · 2026/02/03
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.redox.2026.104068
5. Male-biased Yap1-Cd276/B7-H3 axis for immune evasion in medulloblastoma.
Yap1-Cd276轴介导男性偏向性的髓母细胞瘤免疫逃逸。癌症发病率和治疗反应中性别差异的分子机制仍待深入研究。研究通过多组学分析发现,Yap1缺失能显著延长男性而非女性髓母细胞瘤模型的生存期,其机制在于YAP1激活Cd276表达以抑制CD8+ T细胞。该研究揭示了癌症免疫相互作用中的性别差异,为性别特异性治疗提供了重要依据。
髓母细胞瘤 | Yap1, Cd276/B7-H3, 性别差异 | 整合多组学分析, 免疫抑制评估
Abdelfattah Nourhan · … · Yun Kyuson · Cancer cell · 2026/02/05
⭐ 该研究由肿瘤学休斯顿卫理公会研究所Kyuson Yun团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.ccell.2026.01.005
6. Sarcoidosis: Disease mechanisms, diagnostic pathway and treatment.
结节病的发病机制、诊断路径与治疗进展。结节病是一种病因不明的多系统肉芽肿性疾病,常累及肺部。本文综述了单细胞测序等新技术对发病机制的揭示,讨论了诊断中的挑战及排除法原则。文章评价了皮质激素、甲氨蝶呤及新型JAK抑制剂的疗效,强调了开发更有效且耐受性更好的治疗方法及预后生物标志物的紧迫性。
结节病 | 肉芽肿形成, JAK通路 | 单细胞测序, 空间转录组
Miedema Jelle · … · Spagnolo Paolo · · 2026/02/04
该研究由呼吸病学帕多瓦大学Paolo Spagnolo团队完成 Autoimmunity reviews
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.autrev.2026.103993
7. Analysis of the transcriptomic and metabolomic landscape of prostate cancer with different anatomical origins using snFLARE-seq and mxFRIZNGRND.
利用snFLARE-seq和mxFRIZNGRND分析不同解剖来源前列腺癌的转录组和代谢组特征。前列腺癌细胞在不同解剖位置表现出显著异质性,影响了临床诊疗效果。研究开发了适用于FFPE样本的新型单核测序和代谢物提取技术,揭示了外周带与移行带样本在细胞分布和信号通路上的差异。整合分析发现了与疾病侵袭性相关的关键代谢途径,为前列腺癌的精准医疗提供了新视角。
前列腺癌异质性 | 代谢重编程, 激素治疗响应 | 单核RNA测序 (snFLARE-seq), 代谢组学
He Dongyin · … · Li Zhenfei · · 2026/02/07
该研究由分子细胞科学领域中国科学院上海营养与健康研究所李振斐团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-69347-7
8. Disruption of androgen receptor-cofactor interactions by the RNA-binding protein FUS/TLS alters androgen signalling in prostate cancer.
RNA结合蛋白FUS/TLS通过改变雄激素信号影响前列腺癌。雄激素受体(AR)的活性受多种辅助因子的调节。研究发现FUS在早期前列腺癌中抑制AR活性,但在晚期侵袭性阶段表达上调并失去调节控制。该研究揭示了FUS在前列腺癌进展中复杂的阶段特异性作用。
前列腺癌 | 雄激素受体, FUS/TLS | 转录组学, 蛋白质组学
Brooke G N · … · Bevan C L · · 2026/02/06
该研究由肿瘤学伦敦帝国理工学院Charlotte Bevan团队完成 Oncogene
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41388-026-03682-3
9. MIF-CD74 signaling drives immune modulation in medulloblastoma.
MIF-CD74信号轴驱动髓母细胞瘤免疫调节。复发性髓母细胞瘤预后极差,亟需阐明其肿瘤微环境中的免疫逃逸机制。研究通过整合单细胞与大体转录组数据,鉴定并验证了MIF-CD74这一关键的促免疫抑制受配体对。该发现为开发针对复发性髓母细胞瘤的新型免疫治疗靶点奠定了基础。
髓母细胞瘤 | MIF-CD74信号轴, 免疫逃逸 | 单细胞RNA测序, 受体-配体分析
Draper Benjamin · … · Donovan Laura K · · 2026/02/06
该研究由神经肿瘤学伦敦大学学院Donovan Laura K团队完成 Neuro-oncology
原文链接:https://doi.org/10.1093/neuonc/noag020
生物信息软件
1. Identifying genome-by-childhood trauma interactions for depression using a forest-based approach in the UK Biobank and Adolescent Brain Cognitive Development Study.
森林算法识别童年创伤与抑郁症的基因-环境交互。抑郁症受遗传与环境共同影响,但传统方法难以检测复杂的交互作用。研究利用森林机器学习算法分析大规模人群数据,发现童年创伤显著调制遗传风险,并识别出多个关键基因位点。这突显了童年创伤在抑郁症多基因遗传背景中的核心作用。
抑郁症, 童年创伤 | 基因-环境交互, 遗传力 | 随机森林, 机器学习
Hu Yue · … · Zhang Heping · · 2026/02/06
该研究由生物统计学耶鲁大学Zhang Heping团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2527955123
2. Probabilistic mapping and automated segmentation of human brainstem white matter bundles.
人脑干白质束的概率映射与自动分割。脑干白质束对维持生命和意识至关重要,但因结构复杂难以在影像中精确映射。研究开发了基于深度学习的BSBT工具,实现了八条脑干纤维束的自动分割,并证实其在多种神经退行性疾病诊断中的稳健性。该工具为研究脑干功能及临床导航提供了新平台。
意识障碍, 神经退行性疾病 | 脑干白质束, 结构连接组 | 扩散磁共振成像, 深度学习
Olchanyi Mark D · … · Edlow Brian L · · 2026/02/06
该研究由神经病学麻省总医院Edlow Brian L团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2509321123
3. Bridging unpaired single-cell multimodal data for integrative analyses with SuperMap.
SuperMap实现非配对单细胞数据整合。单细胞多模态数据大多缺乏细胞级对应关系,给跨模态数据集成和生物学解释带来巨大挑战。研究开发了统计学习方法SuperMap,通过直接学习跨模态映射来桥接不同模态,显著提升了细胞类型识别和轨迹推断性能。该工具为整合异构单细胞数据集提供了高效方案,有助于深入揭示复杂的基因调控网络。
单细胞多模态整合 | 跨模态映射 | 统计学习, SuperMap
Deng Chao · … · Wang Tao · · 2026/02/06
该研究由生物信息学上海交通大学王涛团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2505182123
4. Reliable detection of Host-Microbe Signatures in cancer using PRISM.
PRISM框架提升癌症微生物组分析的可靠性。从人类基因组数据中精确检测低生物量微生物信号是当前癌症研究的难点。研究开发了PRISM计算框架,实现了对25种癌症类型的微生物特征谱分析,并发现胰腺癌微生物与宿主蛋白糖基化路径相关。该工具显著提高了微生物分析的准确性,为利用现有基因组数据探索宿主-微生物相互作用提供了新途径。
癌症微生物组 | 宿主-微生物相互作用, 蛋白糖基化 | PRISM计算框架, 宏基因组去污染
Ghaddar Bassel · … · De Subhajyoti · Cancer cell · 2026/02/05
⭐ 该研究由肿瘤学罗格斯大学Subhajyoti De团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.ccell.2026.01.007
5. Counting cells can accurately predict small-molecule bioactivity benchmarks.
细胞计数可准确预测小分子生物活性基准。在药物开发中,利用表型谱预测化学品活性至关重要,但现有基准数据集的有效性受到质疑。研究发现许多生物活性测定与细胞毒性直接相关,仅通过细胞计数即可在基准测试中获得极高表现。研究建议在评估mRNA或图像表型谱的附加价值时,应排除此类干扰并包含细胞计数基线。该工作为改进机器学习预测生物活性的基准测试提供了实用建议。
药物活性预测 | 细胞毒性干扰 | 机器学习基准测试, Cell Painting
Seal Srijit · … · Carpenter Anne E · · 2026/02/06
该研究由计算生物学领域Broad研究所Anne E. Carpenter团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-68725-5
6. Learning neuroimaging models from health system-scale data.
利用医疗系统规模数据学习神经影像模型。神经影像需求增长给医疗系统带来了巨大压力。开发了AI基础模型Prima,在超22万项MRI研究上训练,实现了极高的诊断准确率。该研究展示了大规模AI训练在提升医疗效率和公平性方面的变革潜力。
神经系统疾病诊断 | 影像特征提取 | 深度学习, 磁共振成像
Lyu Yiwei · … · Hollon Todd · Nature biomedical engineering · 2026/02/06
⭐ 该研究由计算机科学密歇根大学Todd Hollon团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41551-025-01608-0
7. A large language model for complex cardiology care.
用于复杂心脏病护理的大语言模型。心脏病亚专科专家的稀缺是医疗交付的重大挑战。研究评估了AI系统AMIE在辅助诊断遗传性心肌病方面的潜力,发现其辅助下的诊断准确率显著提升且错误更少。该成果展示了AI在增强临床决策和优化心脏病管理方面的价值。
遗传性心肌病 | 临床决策支持 | 大语言模型, 随机对照试验
O'Sullivan Jack W · … · Tu Tao · Nature medicine · 2026/02/06
⭐ 该研究由人工智能Google DeepMind团队Tao Tu完成
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41591-025-04190-9
8. Single-round evolution of RNA aptamers with GRAPE-LM.
GRAPE-LM实现RNA适配体单轮进化。传统RNA适配体筛选依赖多轮实验,耗时耗力且效率受限。本研究开发了集成语言模型与条件自编码器的AI框架GRAPE-LM,利用单轮CRISPR筛选数据生成高性能适配体。该技术显著提升了适配体研发效率,在疾病诊疗领域具有广阔应用前景。
RNA适配体筛选 | c-Myc, CD3ε | 生成式人工智能, 语言模型
Zhang Jun · … · Wang Yu · Nature biotechnology · 2026/02/06
⭐ 该研究由定量合成生物学中国科学院深圳先进技术研究院Wang Yu团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41587-026-03007-5
9. Identifying unmeasured heterogeneity in microbiome data via quantile thresholding (QuanT).
QuanT算法有效识别微生物组数据异质性。微生物组数据常受未知技术偏倚影响,导致下游分析出现假阳性结论。研究提出了一种基于分位数回归的非参数方法QuanT,用于捕捉并校正数据中的潜在异质性。该工具显著提升了微生物组数据整合与预测分析的准确性,具有重要的应用价值。
微生物组异质性 | 潜在变量识别 | 分位数回归, 生物信息学算法
Lu Jiuyao · … · Zhao Ni · Microbiome · 2026/02/07
⭐ 该研究由生物统计学约翰霍普金斯大学Zhao Ni团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1186/s40168-025-02282-9
声明:本文使用了AI进行翻译和总结