Teniposide

每日文献速览 PubMed 发布日期: 2026-10-15 | 共 61 篇1. A phenome-wide structural variant map from 467,152 UK Biobank genomes. 📰 Cell 第一完成单位：英国剑桥阿斯利康生物制药研发部发现科学基因组学研究中心 核心洞察：利用UK Biobank 467,152人全基因组测序数据，对160万个结构变异（SV）开展跨13,322个二分类、2,018个数量性状和2,923个血浆蛋白的全表型关联研究。82.25%的SV超出既往拷贝数变异研究检测范围；蛋白QTL将3,467个SV关联1,690种蛋白，SV-PheWAS发现28,184个健康结局关联及罕见强效应SV，已知GWAS位点中32.21%关联SV与功能区域重叠，凸显SV在人类遗传与药物发现中的潜力。2. Mitochondria-targeted tetraoxanes initiate lipid peroxidation to drive ferroptosis and tumor suppression. 📰 Cell 第一完成单位：西湖大学生命科学学院 核心洞察：该研究设计线粒体靶向的四氧杂环己烷化合物WMK-1/2，作为脂质过氧化代谢启动剂，诱导线粒体局部脂质过氧化和氧化磷酸化损伤，触发一种不依赖GPX4抑制的“线粒体铁死亡”新亚通路。其细胞死亡需不稳定铁，可被α-硫辛酸抑制，且逃避视黄醇保护。WMK-1/2具生物利用度，在多种癌症模型中抑制肿瘤并增强免疫检查点阻断疗效，为癌症治疗提供不依赖蛋白靶点的代谢性铁死亡诱导新策略。3. An opioid efficacy switch for reversible optical control of analgesia. 📰 Cell 第一完成单位：美国纽约威尔康奈尔医学院生物化学与生物物理学系 核心洞察：研究开发了可逆光开关吗啡喃类MOR激动剂AM-3，可在光照下由低效能转为高效能，实现阿片受体信号的光学调控。结构分析揭示其反式与顺式状态结合MOR的不同模式及独特配体-受体-G蛋白动态。小鼠中AM-3可逆、重复地光控镇痛，并因脑内蓄积低和局部激活而减少副作用，为精准镇痛及阿片机制研究提供新策略。4. Functional diversification of the cephalopod proteome by RNA editing. 📰 Cell 第一完成单位：加州大学旧金山分校定量生物科学研究所 核心洞察：该研究结合蛋白质组学与生化细胞实验，系统刻画了长鳍乌贼中ADAR介导的RNA编辑，在蛋白水平验证了7997个重编码位点。发现重编码可改变蛋白稳定性、亚细胞定位、翻译后修饰和酶活性，并可创建或破坏修饰位点，影响蛋白互作。以E3连接酶MARCHF5为例，重编码引起底物泛素化广泛变化并扰乱线粒体稳态，为理解RNA水平可塑性如何塑造蛋白功能与细胞生理提供了框架。5. A telomere-to-telomere map of somatic mutation burden and functional impact in a cancer. 📰 Cell 第一完成单位：美国华盛顿大学医学系医学遗传学部 核心洞察：研究利用供体黑色素瘤的近端粒到端粒二倍体组装，结合长短读深测序，绘制体细胞突变负荷与功能影响图谱。发现16%体细胞变异位于GRCh38缺失序列，卫星重复为紫外线诱变热点；着丝粒动粒结合域是染色体臂非整倍体断点及体细胞变异焦点，非癌组织亦存在，但广泛表观重塑为肿瘤特异。单分子端粒分析重建端粒侵蚀与端粒酶延伸循环，单倍型染色质图谱揭示影响调控元件的体细胞表观突变，建立人类嵌合T2T研究框架。6. Somatic epimutations cap genetic determinism in the human diploid chromatin epigenome. 📰 Cell 第一完成单位：美国华盛顿大学医学院医学遗传学系 核心洞察：该研究开发FIRE方法，利用Fiber-seq更全面、定量地刻画6 Gbp二倍体人类基因组的可及染色质，克服现有调控元件目录偏差；系统检测单倍型选择性染色质可及性，揭示印记元件、X染色体失活逃逸模块，并定位HLA位点中疾病相关变异破坏的转录因子结合。研究进一步发现常染色体体细胞染色质表观突变可经克隆扩增稳定传递，形成非遗传决定性的表观调控变异，对理解人类疾病和克隆演化具有重要意义。7. Comprehensive benchmarking of somatic mutation detection by the SMaHT Network. 📰 Cell 第一完成单位：未提供 核心洞察：SMaHT网络利用细胞系和供体组织，系统评测短读长、长读长、单细胞与双链测序在体细胞突变检测中的效果，产出>1000×短读长和100-400×长读长资源。研究发现供体特异及泛基因组推断的二倍体组装可改善检出并覆盖难比对区域，单细胞能解析细胞类型特异突变模式。三类分析互补，为全基因组体细胞嵌合研究提供路线图。8. Charting the silent variation within us. 📰 Cell 第一完成单位：贝勒医学院分子与细胞生物学系 核心洞察：人体每个细胞携带自身基因组，终生累积体细胞突变，但这类体细胞变异长期难以测量。SMaHT联盟推出经基准测试的工具，并绘制首个全身范围体细胞嵌合图谱，建立“正常”基线，从而使体细胞嵌合在发育、衰老和疾病中的作用得以被系统检验。9. Cellular scaling laws in the mammalian brain. 📰 Cell 第一完成单位：哈佛大学与麻省理工学院联合布罗德研究所 核心洞察：该研究基于全脑细胞图谱发现，离散神经元类型多样性最高的区域并非神经元数量最多的皮层和小脑，而是下丘脑、脑干等深部皮层下结构。作者提出脊椎动物脑存在“学习子系统”和“操控子系统”：前者（皮层、纹状体、小脑）通过重复模块复制扩展计算能力，类似机器学习模型参数扩容；后者（下丘脑、苍白球、脑干）通过定制化细胞类型多样化编码先天驱力和反射，构成高维生物“奖励函数”。该框架统一解释了脑架构进化差异，并为脑疾病病因和人工智能模型设计提供启示。10. Milking the niche: Microbial control of neonatal hematopoiesis. 📰 Cell 第一完成单位：法国图卢兹大学图卢兹感染与炎症性疾病研究所（Infinity）妊娠与泌乳免疫生理学实验室，法国国家科学研究中心（CNRS），法国国家健康与医学研究院（INSERM），图卢兹，法国 核心洞察：该研究揭示母乳糖蛋白骨桥蛋白通过塑造新生儿微生物组来调控造血，促进树突状细胞发育，并增强对严重呼吸道感染的防护。由此提出“母乳-微生物群-免疫”通路，将生命早期营养与免疫发育及远期疾病易感性联系起来，为靶向微生物组改善新生儿免疫提供新思路。11. Smartwatch health data are piling up. How can doctors keep pace? 📰 Nature 第一完成单位：未提供（非原始研究论文，无单位信息） 核心洞察：该文关注智能手表等消费级可穿戴设备产生的海量健康数据（心率、房颤、睡眠、活动等）正涌入临床，而医生缺乏解读时间、标准化工具与循证指南。核心挑战在于数据质量、算法透明度、临床验证、隐私监管及工作流整合；潜在意义是推动数字健康数据标准化、AI辅助分诊和支付/责任框架，使患者生成数据安全转化为临床决策依据。12. Biomedical engineering is growing rapidly, but will it help patients? 📰 Nature 第一完成单位：未提供 核心洞察：该文聚焦生物医学工程快速增长与临床获益之间的落差，指出从实验室创新到患者应用仍面临转化、验证、监管、成本和可及性障碍。其潜在意义在于呼吁以患者结局和临床需求为导向，强化跨学科协作、真实世界证据与转化研究，避免技术繁荣与临床价值脱节。13. Hydrogels and MRI: meet three biomedical engineers reshaping health care. 📰 Nature 第一完成单位：未提供 核心洞察：该文介绍三位生物医学工程师如何利用水凝胶与MRI等技术重塑医疗。水凝胶可用于组织工程、药物递送和再生医学，MRI则提供无创成像与诊断。通过跨学科工程方法，将材料科学、影像学与临床需求结合，推动精准诊疗和转化应用。因摘要缺失，具体科学发现与单位信息无法进一步核实。14. Nature Index reveals the four countries to watch in biomedical engineering. 📰 Nature 第一完成单位：未提供（原文无第一完成单位信息） 核心洞察：该文依托Nature Index的科研产出数据，识别出生物医学工程领域值得关注的四个国家，分析其论文份额、学科优势与国际合作态势。它并非提出新的实验方法或临床发现，而是从科学计量视角揭示全球生物医学工程力量格局的变化，为科研政策、资源投入和跨国合作提供参考。15. Intrinsic physicochemical activity at microplastic-water interfaces. 📰 Nature 第一完成单位：美国纽约州纽约市哥伦比亚大学化学系 核心洞察：该研究发现商品微塑料在水中并非化学惰性，其疏水界面可自发产生活性氧，且随界面疏水性增强并与界面静电相关；从头算表明疏水界面部分溶剂化与静电效应促进氢氧根氧化。该界面氧化化学可影响生物分子吸附、蛋白聚集和细胞损伤，揭示微塑料健康与环境风险的新机制，并为界面水构效关系及更安全塑料设计提供依据。16. Overlooked brown fat in our bodies linked to wide range of health benefits. 📰 Nature 第一完成单位：未提供 核心洞察：该论文聚焦人体内常被忽视的棕色脂肪组织，指出其与多种健康获益相关。棕色脂肪主要通过产热消耗能量，可能改善糖脂代谢、体重控制和心血管代谢健康，降低肥胖、糖尿病等风险。若研究结合影像学或人群队列，则提示激活棕色脂肪可作为代谢病干预新靶点。但摘要与单位信息缺失，具体机制、样本和方法无法确认。17. Lead-tainted teeth reveal medieval mines' unequal toll. 📰 Nature 第一完成单位：未知（原始单位信息未提供） 核心洞察：该研究通过分析中世纪人群牙齿中的铅含量/同位素信号，重建矿场周边居民的铅暴露史，发现采矿活动对不同社会群体造成不均衡的健康负担。方法上，牙齿作为长期生物档案，可追溯个体从童年到成年的暴露轨迹，并结合考古与流行病学揭示环境不公。其意义在于为古代职业与环境健康风险、社会不平等提供直接生物学证据，并启示现代铅污染治理与弱势群体保护。18. Alveolar stem cells go beyond making gas-exchange cells to repair damaged airways. 📰 Nature 第一完成单位：未提供（原文单位信息为空） 核心洞察：该研究揭示肺泡干细胞（如AT2细胞等）具有超出生成气体交换细胞的分化潜能，在肺损伤后能够迁移或转分化为气道上皮细胞，参与修复受损气道。这一发现拓展了肺泡干细胞谱系可塑性的认识，为肺损伤修复及气道再生治疗提供了新的潜在靶点。19. Educational intervention can rewire village social networks. 📰 Nature 第一完成单位：耶鲁大学人类本性实验室，美国康涅狄格州纽黑文 核心洞察：该研究在洪都拉斯110个村庄开展22个月公共卫生干预随机试验，发现干预会重连村庄社会网络：低剂量村中受干预者倾向切断与未干预者的健康咨询联系，高剂量村中则增加联系；主要源于受干预者间联系形成与维持、受干预者与未干预者联系解散，且健康信息吸收促进联系形成。重连效应持续至干预结束三年后，并波及友谊和财务关系，但整体度分布稳定，提示健康干预可像社会制度一样重塑网络，需考虑其非预期社会后果。20. Sexual dimorphism in epidermal stem cell dynamics. 📰 Nature 第一完成单位：比利时布鲁塞尔自由大学干细胞与癌症实验室 核心洞察：研究采用活体延时成像追踪小鼠表皮基底层谱系标记细胞，定量克隆动态支持干细胞—短暂扩增细胞双区室层级模型。关键发现表皮稳态具性别二态性：雌鼠分裂、分化与脱落高度同步，加速伤口愈合；单细胞测序、转录组及去势实验显示雄激素促进干细胞分化脱落。该工作阐明表皮干细胞功能身份及性别特异调控机制。21. Engineered TYK2 dependence enables myeloid-selective IL-10 receptor agonism. 📰 Nature 第一完成单位：美国加利福尼亚州福斯特城吉利德科学公司 核心洞察：研究揭示髓系细胞与T细胞对IL-10信号中JAK激酶配对的依赖差异，据此设计四价纳米抗体髓系选择性IL-10受体激动剂，可抑制单核/巨噬/树突细胞而不激活T细胞。冷冻电镜显示其独特受体交联几何，使信号严格依赖TYK2且对受体丰度敏感。该激动剂在人源化小鼠中减轻炎症，人源化版本在非人灵长类中具IgG样药代、持续受体占据和30天髓系抑制，无T细胞激活或血液毒性，为髓系驱动炎症疾病提供新策略。22. Elp1 is required for myeloid differentiation and brain repopulation. 📰 Nature 第一完成单位：斯坦福大学医学院干细胞生物学与再生医学研究所 核心洞察：该研究利用体外扩增的原代造血干/祖细胞（cHSPCs）建立遗传筛选平台，发现其可分化为髓系细胞并经移植重建脑内微胶质细胞龛。新生儿星形胶质细胞可诱导髓系特化。通过筛选约2万个基因扰动，鉴定出Elp1等调控因子；Elp1通过抑制未折叠蛋白反应，对髓系细胞生成而非维持至关重要。该工作为脑髓系生物学及细胞替代疗法提供了高效研究平台。23. Modelling mouse embryogenesis from chemically induced totipotent stem cells. 📰 Nature 第一完成单位：清华大学药学院新基石科学实验室 核心洞察：研究建立体外培养条件，使化学诱导的类全能干细胞（ciTotiSCs）作为唯一起始细胞，自组织形成囊胚样胚胎模型，并连续发育跨越植入前桑椹胚、囊胚及原肠胚后阶段，包含胚胎与胚外谱系。该模型重现原肠形成、体轴建立、造血和早期器官发生，接近E8.5自然胚胎，延长培养可生成类似E10.5的功能心脏组织。该工作证明单一诱导细胞可自主重演早期小鼠胚胎发生，为哺乳动物发育研究和非生殖系细胞构建多细胞生物提供新平台。24. Targeted stimulation of motor cortex ensembles drives learned movements. 📰 Nature 第一完成单位：美国加州大学圣地亚哥分校神经生物学系 核心洞察：该研究在小鼠熟练杠杆按压任务中，结合双光子钙成像与全息光遗传学，靶向刺激初级运动皮层L2/3功能集群。同步激活约20个运动前放电神经元可诱发类似习得运动的动作，并在其他M1神经元中重现习得活动模式；光遗传触发活动的试次间变异与运动变异相关，且可由刺激前M1初始状态预测。部分试次仅产生习得活动而无运动，提示其可内在生成；任务脱离时刺激失效。结果支持M1主动生成习得活动与运动。25. Capillary-selective vasodilation through myosin inhibition halts ischaemic cascades. 📰 Nature 第一完成单位：Motorpharma，匈牙利布达佩斯 核心洞察：该研究提出毛细血管无复流由周细胞平滑肌肌球蛋白过度收缩驱动，开发了肌球蛋白特异性、毛细血管选择性血管扩张剂R(+)2501。在心肌梗死和急性肾损伤再灌注动物模型中，该药快速恢复毛细血管血流，直接逆转周细胞收缩，清除滞留中性粒细胞并减轻再灌注损伤，同时保留冠脉自动调节和全身血流动力学，显著提高急性再灌注存活率。研究还发现心肌梗死可致肾毛细血管无复流并被R(+)2501逆转，提示靶向周细胞肌球蛋白抑制可终止跨器官缺血级联，为I型心肾综合征提供新策略。26. Divergent genomic evolution in astrocytomas and oligodendrogliomas. 📰 Nature 第一完成单位：美国康涅狄格州纽黑文市耶鲁大学神经外科系 核心洞察：本研究通过全基因组/外显子测序纵向分析183例IDH突变胶质瘤，揭示星形细胞瘤与少突胶质细胞瘤基因组进化轨迹分歧：复发性少突胶质细胞瘤获得PI3K/NOTCH1突变，与突变负荷增加相关；复发性星形细胞瘤则出现局灶性癌基因扩增和CDKN2A/B纯合缺失，伴随染色体不稳定（染色体碎裂、全基因组加倍）。两种亚型均显示获得性改变与不良预后趋同，提示治疗难治性克隆选择。替莫唑胺相关SBS11/SBS119及星形细胞瘤特异性ID8特征。这些发现为理解治疗耐药和精准干预提供依据。27. Computational design of metalloproteases. 📰 Nature 第一完成单位：美国华盛顿大学（西雅图）生物化学系 核心洞察：该研究利用RFdiffusion从头设计含锌水激活位点及底物结合口袋的金属蛋白酶。135个设计中36%可切割目标肽键，最佳设计将肽键水解加速超过10倍，四个突变通过改善活性位点预组织进一步提升催化效率。设计酶可选择性切割TDP-43、淀粉样β和血清淀粉样A，并激活笼状细胞因子或受体拮抗剂，实现生物正交细胞状态调控，具治疗与生物技术应用潜力。28. Keeping time in the crypt. 📰 Science (New York, N.Y.) 第一完成单位：奥地利维也纳生物中心马克斯·佩鲁茨实验室 核心洞察：该研究探讨了肠道隐窝中振荡信号动力学如何维持稳健的肠道健康。通过分析信号振荡（如Wnt、Notch等）的时空动态，揭示了其在协调肠道干细胞自我更新与分化、维持组织稳态中的关键作用。振荡信号可能通过增强系统的鲁棒性，防止异常增殖和肿瘤发生。这一发现为理解肠道疾病（如炎症性肠病和结直肠癌）的发病机制提供了新视角，并可能指导靶向信号振荡的治疗策略。29. Erratum for the Research Article "Enabling sustainable supply of the essential cancer medicines etoposide and teniposide in yeast". 📰 Science (New York, N.Y.) 第一完成单位：未提供 核心洞察：该勘误针对一项通过酵母实现抗癌药物依托泊苷和替尼泊苷可持续供应的研究。原文创新在于在酵母底盘重构鬼臼毒素类复杂天然产物合成途径，经酶筛选与途径优化发酵生产，降低对天然植物提取依赖，提升必需抗癌药供应稳定性与可及性；勘误对原文部分信息进行更正，不影响其生物制造意义。30. Frequency encoding regulates cell type composition in the small intestine. 📰 Science (New York, N.Y.) 第一完成单位：荷兰皇家艺术与科学学院胡布雷赫特研究所，乌得勒支大学医学中心，荷兰乌得勒支 核心洞察：该研究揭示小肠Notch靶蛋白Hes1呈振荡表达，并以频率依赖方式调控细胞命运。内源荧光报告显示Hes1振荡频率具细胞类型特异性，沿隐窝-绒毛轴形成梯度，并受细胞周期及Wnt、Notch信号调节。作者建立微流控类器官系统，证明改变Notch振荡频率可调节细胞类型组成平衡，提出细胞命运信息编码于振荡信号频率。31. Medications in addiction recovery-a clash of science and stigma. 📰 Science (New York, N.Y.) 第一完成单位：英国伦敦国王学院精神病学、心理学与神经科学研究所 核心洞察：论文聚焦成瘾康复中的药物治疗，揭示循证药物（如阿片类替代疗法）与污名化之间的冲突。作者指出，尽管科学证据支持有效药物，社会偏见、政策限制和临床观念仍阻碍其可及性；需通过去污名化、教育及政策改革，将药物治疗整合进康复体系，改善成瘾者预后。32. NIH revives network to study emerging diseases-but its new restrictions baffle scientists. 📰 Science (New York, N.Y.) 第一完成单位：未提供 核心洞察：该报道指出，美国NIH重启新兴疾病研究网络，却同时禁止在野生动物中搜寻新病毒，与项目监测、发现和预警新发传染病的使命相悖，令科学家困惑。此事凸显大流行防范中病毒发现与生物安全、政策监管之间的张力，可能影响未来新发病原体监测、溯源及公共卫生准备。33. New tools may help decide who needs antidepressants. 📰 Science (New York, N.Y.) 第一完成单位：未提供第一完成单位信息 核心洞察：该文报道在美国推动抗抑郁药“减处方”背景下，研究人员正开发预测或决策工具，以帮助识别真正需要抗抑郁药的患者，并将其匹配至最优治疗方案。其意义在于减少不必要用药，同时避免漏治，推动精神科用药的精准化与个体化。但本文为新闻报道，无具体研究数据。34. Dendritic computation for abstract rule-based flexible decision-making. 📰 Science (New York, N.Y.) 第一完成单位：中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所），上海，中国 核心洞察：该研究结合小鼠规则化灵活决策任务、在体双光子成像与光遗传学，发现听皮层第5层端脑外投射神经元的顶树突优先编码推断出的抽象规则，胞体优先表征感觉刺激，而选择信号两者均有。抑制树突会削弱规则依赖的胞体选择编码，表明树突-胞体区室整合任务相关信息，揭示树突计算在灵活认知行为中的关键作用。35. Atomic functional site scaffolding in biopolymers with RFdiffusion3. 📰 Science (New York, N.Y.) 第一完成单位：美国华盛顿大学蛋白质设计研究所 核心洞察：该研究提出RFdiffusion3（RFD3），一种面向生物高分子的自由原子扩散生成式AI方法，能更快速、准确地满足复杂原子约束，适用于酶与RNA结构设计。实验上从头设计出含氨甲酰化赖氨酸配位双金属离子的磷酸三酯酶，以及靶向转甲状腺素蛋白的锌蛋白酶，并在96构建体零样本设计中获得活性催化剂，凸显原子级功能位点支架设计的潜力。36. Inherent electrochemical activity of extrachromosomal DNA hub shapes spatial redox environment in nucleus. 📰 Molecular cell 第一完成单位：南开大学药物化学生物学国家重点实验室和药学院 核心洞察：研究发现，染色体外DNA（ecDNA）枢纽具有内在电化学活性，可在核内构建活跃氧化还原微环境，通过非酶机制将GSSG还原为GSH，在枢纽周围形成保护性“云”，抵御氧化损伤并维持癌基因表达。用亚精胺破坏其界面环境可扰乱氧化还原平衡、诱导肿瘤死亡。该工作揭示ecDNA枢纽的非酶性自强化维持环路及空间氧化还原调控策略，为靶向ecDNA的肿瘤治疗提供新思路。37. Molecular mechanism of residue-specific nucleosome acetylation. 📰 Molecular cell 第一完成单位：慕尼黑大学医学院生物医学中心分子生物学系 核心洞察：本研究利用冷冻电镜解析了果蝇MSL复合体催化核小体乙酰化的动态结构，首次直接观察到乙酰基从辅酶A转移至H4K16的稳定产物状态。MSL亚基协同形成“分子标尺”决定残基特异性，且H3K36三甲基化识别加速反应，将MSL功能与转录活跃基因体关联。该机制在果蝇剂量补偿中具生理意义，揭示了组蛋白乙酰化特异性调控的分子原理。38. The binding of OTULIN restrains LUBAC activity to prevent TNF-driven immunopathology. 📰 Molecular cell 第一完成单位：哥本哈根大学免疫学与微生物学系，LEO基金会皮肤免疫学研究中心 核心洞察：该研究构建破坏OTULIN-LUBAC结合的OTULIN点突变小鼠，发现该互作是限制LUBAC活性的关键刹车：阻止LUBAC Met1链自泛素化，限制底物Met1泛素化。突变小鼠无自发病变，但TNF毒性和李斯特菌感染免疫病理加重；破坏结合增加TNF受体复合物Met1-Ub、稳定复合物、增强NF-κB并保护免受TNF诱导凋亡。39. Programming biological behavior with AI-guided de novo protein design. 📰 Molecular cell 第一完成单位：加州大学旧金山分校生物工程与治疗科学系 核心洞察：该展望指出，AI驱动的从头蛋白质设计已能针对大分子靶标生成多样结合蛋白；未来应超越双分子相互作用，自下而上构建可编程、模块化、可控的蛋白质反应网络，以驱动信号放大、决策和纠错等复杂涌现行为。其关键挑战包括可设计蛋白动力学、多步功能及非平衡系统，突破后将推动合成生物学、生物技术和医学的精准系统级干预。40. Integration by parts: The multi-layered mechanisms of cis-regulatory control. 📰 Molecular cell 第一完成单位：英国伦敦弗朗西斯·克里克研究所 核心洞察：本文提出顺式调控元件（CRE）调控逻辑分为两层：结合层中转录因子协作调控DNA占据，并按特异/通用、对称/非对称分类；转录层中效应域和辅因子将结合构型转化为表达，产生加性、协同或拮抗逻辑。作者归纳出“乘法加饱和”这一重复定量模式，调和结合特异性与灵活性，解释短DNA基序如何生成精确且可演化的表达，并为合成生物学与治疗应用提供框架。41. Emerging frontiers for AI in single-cell genomics. 📰 Molecular cell 第一完成单位：美国纽约纪念斯隆凯特琳癌症中心计算与系统生物学项目 核心洞察：该综述梳理AI在单细胞基因组学的前沿：包括scRNA-seq与scATAC-seq的嵌入/基础模型、利用单细胞多组学的调控基因组学机器学习，以及从Perturb-seq学习“虚拟细胞”模型。作者指出早期模型在实验生物学家中应用有限，但随着大规模图谱和扰动技术发展，AI有望用于新数据解读与机制发现，并讨论了当前局限与未来方向。42. Beyond prediction: The evolving role of artificial intelligence in genome editing. 📰 Molecular cell 第一完成单位：韩国首尔大学医学院基因组医学研究所 核心洞察：该综述系统梳理了人工智能在基因组编辑中从预测到设计的演进：早期AI主要预测CRISPR-Cas、碱基编辑器和先导编辑器的gRNA活性、脱靶效应及编辑结果；近期基于Transformer的蛋白质语言模型和生成式AI进一步用于直接分子设计，可进化编辑蛋白、设计分子架构并生成全新基因组编辑酶，显著拓展基因工程能力。43. AI empowers scalable and programmable RNA design. 📰 Molecular cell 第一完成单位：香港中文大学计算机科学与工程系 核心洞察：该研究聚焦AI驱动的可扩展、可编程RNA设计。核心在于利用RNA三级结构解释功能并指导序列生成，以替代传统试错流程；同时通过AI辅助实验方法持续扩充结构数据基础，形成数据与模型互促闭环。潜在意义在于加速功能性RNA与RNA疗法的开发，推动合成生物学应用。44. Learning how single cells respond to perturbations. 📰 Molecular cell 第一完成单位：德国柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所计算分子生物学系 核心洞察：该文评述Adduri等提出的State模型：一种可跨不同细胞背景泛化的机器学习模型，能够预测单细胞转录组对遗传或化学扰动的响应。其创新在于将扰动响应预测推广到未见细胞环境，为虚拟细胞建模、功能基因组学和药物发现提供了通用框架。45. Hidden in plain sight: dsRNAscan shines light on the human dsRNAome. 📰 Molecular cell 第一完成单位：美国纽约州纽约市哥伦比亚大学瓦格洛斯内科与外科医师学院微生物学与免疫学系 核心洞察：该文评述Andrews与Bass提出的dsRNAscan，一种可计算识别人类基因组中潜在双链RNA形成序列的方法，能发现传统dsRNA鉴定方法遗漏的候选区域。基于此构建人类dsRNA组资源数据库，供检索和分析人类dsRNAome。该工作拓展了对dsRNA形成序列的图谱认知，为dsRNA相关调控、免疫识别及疾病研究提供工具和资源。46. The promise and perils of artificial intelligence in molecular biology. 📰 Molecular cell 第一完成单位：未提供 核心洞察：本文为观点文集，六位研究者探讨人工智能在分子生物学研究中的机遇与风险：AI可加速科学发现、增强数据分析并生成新假设；同时存在可靠性、偏差、可重复性不足及缺乏人类监督等问题。强调需审慎评估与负责任使用，以发挥其潜力并规避误导风险。47. Looking to the future of AI and molecular biology. 📰 Molecular cell 第一完成单位：未提供（原文无单位信息） 核心洞察：该文展望人工智能与分子生物学交叉融合的未来方向，可能涉及深度学习/大模型在基因组、转录组、蛋白结构与功能预测、分子互作网络及药物发现中的应用，强调AI加速从海量生物数据到机制理解与临床转化的潜力，同时需关注可解释性、数据偏差与实验验证。由于缺少摘要，具体发现无法确认。48. Genetic modulation of NAD(P)H homeostasis reveals distinct redox-coupled metabolic vulnerabilities. 📰 Nature metabolism 第一完成单位：美国加利福尼亚州圣迭戈市Scintillon研究所氧化还原生物学与代谢实验室 核心洞察：该研究揭示线粒体呼吸链抑制可引发NADH还原应激并伴随NADPH耗竭。用EcSTH模拟氧化还原耦合发现，原代成纤维细胞仅纠正NADH/NAD不足恢复增殖，因其更依赖NADPH驱动的还原性羧化，而HeLa细胞可恢复。开发组成型SaNADK扩大NADP(H)池后，可恢复还原性羧化和嘧啶从头合成，逆转增殖停滞与衰老；在老雄鼠肝脏表达可部分缓解炎症和代谢紊乱。该工作提供解析NAD(P)H耦合的异源工具及抗衰老代谢干预框架。49. Reframing cancer therapy through tumor plasticity. 📰 Nature cancer 第一完成单位：美国加利福尼亚州南旧金山基因泰克公司研究肿瘤学部 核心洞察：论文指出靶向治疗耐药常源于肿瘤细胞通过可逆的细胞可塑性进入药物耐受状态，类似发育与再生过程，撤药后可恢复敏感性，但遗传突变积累可致永久耐药。该视角将治疗焦点从单纯靶向遗传机制扩展到非遗传易感性，提出预防或清除可塑性及转化细胞群的临床策略，并综述相关机制与应用。50. Stroke-induced astrocyte memories promote glioma progression. 📰 Nature cancer 第一完成单位：美国马萨诸塞州波士顿市哈佛医学院布莱根妇女医院安·罗姆尼神经疾病中心及Gene Lay免疫学研究所 核心洞察：该研究揭示脑卒中可在星形胶质细胞中诱导持久性“记忆”，这种细胞状态改变在损伤后长期保留，并促进胶质瘤进展。它建立了卒中与脑肿瘤之间的跨疾病联系，提示神经损伤后的反应性星形胶质细胞微环境可被肿瘤利用；靶向这类星形胶质细胞记忆或相关通路，可能为胶质瘤治疗提供新思路。51. Lactate dehydrogenase A-dependent redox control of selective mRNA translation directs monocyte fate commitment. 📰 Immunity 第一完成单位：美国俄亥俄州克利夫兰市凯斯西储大学生物化学系 核心洞察：该研究用CRISPR代谢筛选和细菌性肺炎单核细胞扰动，发现LDHA是单核细胞向NOS2巨噬细胞命运定向的关键代谢调控因子。LDHA依赖的胞质NAD再生通过HIF1α mRNA 5'UTR及RNA结构重塑促进HIF1α选择性翻译，进而驱动NOS2命运；GM-CSF为上游代谢预刺激信号。该工作揭示代谢氧化还原状态经选择性mRNA翻译决定单核细胞命运，为免疫代谢干预提供靶点。52. Skin fibroblast lineage tracing reveals layer-specific cooperation in wound repair. 📰 Cell stem cell 第一完成单位：西湖大学生命科学学院 核心洞察：研究用双重组酶策略建立乳头层、网织层、皮下、肉膜肌和筋膜五层皮肤成纤维细胞谱系追踪工具，发现深部创面修复分三阶段、浅表分两阶段；早期成纤维细胞占据闭合期创床，后期参与重塑和瘢痕形成，并重建损伤前层级空间分布。该时空协同互作机制为皮肤愈合治疗提供新靶点。53. Genome-wide CRISPR screen reveals that Wnt signaling regulates lipid accumulation in APOE4 oligodendrocytes. 📰 Cell stem cell 第一完成单位：麻省理工学院皮考尔学习与记忆研究所 核心洞察：该研究利用全基因组CRISPR筛选和ATAC测序，在APOE4人iPSC来源少突胶质细胞中发现Wnt信号减弱与GSK3B过度激活驱动脂滴积聚。遗传或药物抑制GSK3B可减少脂滴，并在3D脑类器官及APOE4;PS19 tau小鼠中改善髓鞘化。研究揭示Wnt/GSK3B连接APOE4与少突胶质细胞脂质代谢和髓鞘形成障碍，提示GSK3B是APOE4相关阿尔茨海默病的潜在治疗靶点。54. Making AI work in healthcare. 📰 Nature medicine 第一完成单位：未提供 核心洞察：该论文标题为《Making AI work in healthcare》，主题属于医疗健康与人工智能交叉领域。由于摘要和单位信息缺失，无法提取具体研究发现、方法创新或第一完成单位。其潜在意义可能在于探讨AI在医疗场景落地应用的关键障碍与实现路径，如临床工作流整合、数据质量、监管、公平性和评估等。55. Editorial Expression of Concern: Thyroid hormone inhibits lung fibrosis in mice by improving epithelial mitochondrial function. 📰 Nature medicine 第一完成单位：美国康涅狄格州纽黑文市耶鲁大学医学院内科学系呼吸、重症监护与睡眠医学科 核心洞察：该文为针对原研究的编辑关注声明，原研究显示甲状腺激素可改善肺泡上皮细胞线粒体功能，从而抑制小鼠肺纤维化。其潜在机制涉及促进线粒体生物发生、恢复上皮能量代谢并减少上皮损伤，提示靶向上皮线粒体代谢可能成为肺纤维化治疗策略；但当前声明提示需谨慎看待原研究结果。56. Talazoparib plus enzalutamide in high-volume metastatic hormone-naive prostate cancer: a randomized phase 2 trial. 📰 Nature medicine 第一完成单位：西班牙巴塞罗那瓦尔德希伯伦肿瘤研究所（VHIO），瓦尔德希伯伦巴塞罗那医院园区 核心洞察：该随机2期试验评估他拉唑帕利联合恩扎卢胺治疗高瘤负荷转移性激素初治前列腺癌。联合组12个月PSA<0.2应答率73%，超过预设阈值，但对照组64.7%，未显示明确额外获益；≥3级不良事件68%（贫血41%），并出现2例致命性髓系肿瘤。配对活检提示AR抑制诱导转录重编程，抑制增殖和HRR相关基因表达，但未损害同源重组功能。57. Personalized neoantigen-targeting cancer vaccines in ovarian cancer: a phase 1 trial. 📰 Nature medicine 第一完成单位：美国波士顿丹娜-法伯癌症研究院肿瘤内科 核心洞察：该1期试验评估个体化新抗原疫苗NeoVax（靶向患者特异性新抗原的合成长肽联合poly-ICLC）联合延迟抗PD-1治疗高级别上皮性卵巢癌，在铂类化疗后辅助/复发场景中显示可行且安全。多数靶抗原在诊断后6.5个月仍可经cfDNA检出；6/10患者出现疫苗生物学活性，伴血液和肿瘤中更广谱免疫应答。耐药克隆涉及抗原呈递机制，提示疫苗诱导免疫选择压力；肿瘤抗原库与诱导免疫广度共同影响临床疗效。58. Author Correction: Histone H3 proline 16 hydroxylation regulates mammalian gene expression. 📰 Nature genetics 第一完成单位：北卡罗来纳大学教堂山分校医学院莱恩伯格综合癌症中心 核心洞察：本文为作者更正，针对组蛋白H3第16位脯氨酸羟化（H3P16oh）调控哺乳动物基因表达研究中的问题进行修正。原研究揭示H3P16oh是一种新型表观遗传修饰，可由特定羟化酶催化并被识别蛋白读取，参与转录调控与染色质状态维持，为基因表达调控及相关疾病机制提供了新视角。59. Integrating sex as a biological variable into one's science. 📰 Nature methods 第一完成单位：《自然-方法》 核心洞察：该文强调将‘性’作为生物学变量整合入研究设计与分析。它可能提出在细胞、动物和人体研究中纳入两性、区分性别与性别认同、合理统计检验与报告性别分层结果等建议，以避免偏倚、提升可重复性与转化价值，推动精准医学和性别差异研究规范化。60. LoL-align: sensitive and fast probabilistic protein structure alignment. 📰 Nature methods 第一完成单位：德国哥廷根马克斯·普朗克多学科科学研究所定量与计算生物学研究组 核心洞察：LoL-align是一种基于蛋白质内部Cα-Cα距离、通过最大化局部对数几率同源评分来对齐蛋白质结构的概率方法。它在单域和多域基准上比TM-align和Dali更灵敏地检测远缘同源物，且速度快5–20倍并具更优对齐质量，已集成至Foldseek，有望提升大规模结构搜索与注释的灵敏度与效率。61. A context-dependent framework for targeting NAD metabolism in cancer. 📰 Cell metabolism 第一完成单位：美国宾夕法尼亚州费城福克斯蔡斯癌症中心癌症信号与微环境项目 核心洞察：该综述聚焦肿瘤NAD代谢重编程：NAD既是能量/氧化还原辅因子，也是PARP、sirtuins和CD38等酶底物，调控DNA修复、表观遗传和炎症信号。癌细胞常通过NAMPT增强NAD合成以应对生物合成与基因毒性压力，获得增殖、应激耐受和免疫逃逸优势，使NAD持续供应成为可靶向脆弱点。文章评述NAMPT抑制剂、PARP抑制剂及靶向NAD消耗型胞外酶的策略，并讨论其背景依赖性与临床转化障碍。