A Phase 2, Open-Label Study of Intravenous Pevonedistat in Combination With Oral Decitabine and Cedazuridine in Adult Patients With Higher-Risk Myelodysplastic Syndromes

The main aim of the study is to see if signs and symptoms of myelodysplastic syndromes disappear when treated with pevonedistat combined with decitabine and cedazuridine.
Participants will receive an infusion of pevonedistat 3 times during a 28-day cycle. They will also take decitabine and cedazuridine tablets once a day for the first 5 days of the same cycle. A minimum of 6 28-day cycles is recommended, but participants can stop treatment at any time.
A bone marrow biopsy, bone marrow aspirates, and blood samples will be collected during the study.
Participants will attend a follow-up visit 30 days after their last dose of pevonedistat. Once treatment has ended, participants will be followed up with either monthly clinic visits or will be contacted every 3 months.

开始日期2021-10-01

申办/合作机构

Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.

JPRN-jRCT2031210181 / Suspended临床2期IIT

Phase II study of pevonedistat plus niraparib in patient with recurrent ovarian cancer

开始日期2021-09-28

申办/合作机构-

NCT04800627 / Terminated临床1/2期IIT

A Phase I/II Trial of Pevonedistat in Combination With Pembrolizumab in Patients With dMMR/MSI-H Cancers

This phase I/II trial identifies the side effects and best dose of pevonedistat when given together with pembrolizumab in treating mismatch repair deficiency (dMMR)/high-frequency microsatellite instability (MSI-H) solid tumor that has spread to other places in the body (metastatic) or has spread to nearby tissue or lymph nodes (locally advanced) and cannot removed by surgery (unresectable). Pevonedistat may stop the growth of tumor cells by blocking some of the enzymes needed for cell growth. Immunotherapy with monoclonal antibodies, such as pembrolizumab, may help the body's immune system attack the cancer, and may interfere with the ability of tumor cells to grow and spread. Giving pevonedistat and pembrolizumab may kill more tumor cells.

开始日期2021-03-29

申办/合作机构

The University of Texas MD Anderson Cancer Center

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2025-01-01·Brain Research

Decreased SREBP2 of the striatal cell relates to disrupted protein degradation in Huntington’s disease

Article

作者: Cho, Kyoungjoo ; Kim, Gyung Whan

This study delineated the intricate relation between cholesterol metabolism, protein degradation mechanisms, and the pathogenesis of Huntington's disease (HD). Through investigations using both animal models and cellular systems, we have observed significant alterations in cholesterol levels, particularly in the striatum, which is the primary lesion site in HD. Our findings indicate the dysregulation of cholesterol metabolism-related factors, such as LDLR and SREBP2, in HD, which may contribute to disease progression. Additionally, we uncovered disruptions in protein degradation pathways, including decreased neddylated proteins and dysregulated autophagy, which further exacerbated HD pathology. Moreover, our study highlighted the potential therapeutic implications of targeting these pathways. By restoring cholesterol levels and modulating protein degradation mechanisms, particularly through interventions, such as MLN4924, we observed potential improvements in cellular function, as indicated by the increased BDNF levels. These insights underscore the importance of simultaneously addressing cholesterol metabolism and protein degradation to alleviate HD pathology. Collectively, this study provides a basic understanding of the interplay between the decrease of SREBP2 and the dysfunctional protein degradation system derived from disrupted cholesterol metabolism in HD and HD cells.

2024-12-01·Functional & Integrative Genomics

Upregulation of Cullin1 neddylation promotes glycolysis and M1 polarization of macrophage via NF-κB p65 pathway in sepsis

Article

作者: Qin, Fuchuang ; Yang, Xiaofeng ; Xu, Liping ; Tan, Hang ; Yang, Yang

This study aimed to explore the underlying mechanism of neddylation in macrophage polarization during sepsis. A mouse model of sepsis was established by cecal ligation and puncture (CLP). ELISA and Flow cytometry were performed to analyze the generation of pro-inflammatory factors and M1/M2 macrophage polarization, respectively. Western blotting was applied to detect NEDD8-mediated neddylation and glycolysis-related proteins. ECAR method was used to analyze the glycolysis level. HE staining was applied to detect the lung injury. The bacterial load in peritoneal cavity and peripheral blood was determined by counting the colony-forming units. The results showed the upregulated neddylation, M1 polarization and glycolysis of macrophage in patients with sepsis and CLP-challenged mice. NEDD8-mediated Cullin1 neddylation promoted M1 polarization and glycolysis to accelerate inflammation via NF-κB p65 pathway in E.coli-treated Raw264.7 cells. MLN4924 treatment alleviated sepsis by inhibiting neddylation to prevent M1 polarization in CLP-challenged mice. In summary, this study demonstrated that upregulation of NEDD8-mediated Cullin1 neddylation promotes glycolysis and M1 polarization of macrophage via NF-κB p65 pathway, accelerating inflammation in sepsis.

2024-11-01·Biochemical Pharmacology

The blockade of neddylation alleviates ventilator-induced lung injury by reducing stretch-induced damage to pulmonary epithelial cells

Article

作者: Lin, Chin-Kuo ; Huang, Tzu-Hsiung ; Lin, Chieh-Mo ; Chang, Shun-Fu ; Shi, Chung-Sheng

Ventilator-induced lung injury is a serious complication in mechanically ventilated patients. Neddylation, the post-translational modification of neural precursor cell-expressed developmentally down-regulated 8 (NEDD8) conjugation, regulates numerous biological functions. However, its involvement and therapeutic significance in ventilator-induced lung injury remains unknown. Therefore, this study aimed to examine the kinetics and contribution of activated neddylation and the impact of neddylation inhibition in mice subjected to high tidal volume (HTV) ventilation in vivo and human pulmonary alveolar epithelial cells stimulated through cyclic stretching (CS) in vitro. The neddylation and expression of ubiquitin conjugating enzyme 3 (UBA3), a NEDD8-activating enzyme (NAE) catalytic subunit, were time-dependently upregulated in HTV-ventilated mice. Additionally, the NAE inhibitor MLN4924 considerably attenuated acute lung injury induced by HTV ventilation, manifesting as reduced inflammation and oxidative stress. Furthermore, MLN4924 effectively reduced the secretion of inflammatory cytokines from Ly6C^high monocytes and neutrophils, subsequently decreasing endothelial permeability. Moreover, our study revealed an upregulation of the neddylation pathway, oxidative stress, and apoptosis during CS of alveolar epithelial cells. However, blockade of neddylation via MLN4924 or through UBA3 knockdown suppressed this upregulation. Overall, the inhibition of neddylation may alleviate HTV-induced acute lung injury by preventing CS-induced damage to alveolar epithelial cells. This indicates that the neddylation pathway plays a critical role in the progression of ventilator-induced lung injury. These findings may provide a new therapeutic target for treating ventilator-induced lung injury.

项与 Pevonedistat 相关的新闻（医药）

2024-11-08

·同写意

慢性乙型肝炎病毒感染的最佳管理实践和长期治愈前景

乙型肝炎病毒（hepatitis B virus, HBV）是肝硬化(cirrhosis)和肝细胞癌（hepatocellular carcinoma, HCC）的主要病因。目前，全球约有超20亿人感染过HBV，其中2.96亿人（约占总人口3.7%）患有慢性HBV感染，每年可导致全球约82万人死于肝硬化和HCC并发症。即使有预防性的疫苗，每年仍有约150万例新发感染。世界卫生组织设定了到2030年消除HBV的目标，即与2015年相比，HBV相关死亡率降低65%，发病率降低90%。当前，临床治疗中关于HBV的疗法已取得显著进展，为实现慢性乙肝（Chronic hepatitis B，CHB）的功能性治愈（乙肝表面抗原（HBsAg）消失）和完全治愈（清除共价闭合环状DNA（cccDNA）和整合HBVDNA）提供了希望。劲帆医药结合现有及自主研发的肝脏特异性启动子，成功开发了rAAV-HBV1.3-mer WT replicon和rAAV-1.2×HDV系列造模病毒产品，另外还与武汉大学合作开发了一系列AAV-HBV-1.04乙肝造模病毒产品，通过ATR介导DNA损伤（DDR）形成HBV cccDNA，使乙肝表面抗原HBsAg和HBV子代产生，实现更好地模拟病毒复制过程。以上产品具备成模率高、稳定性好、适用范围广等优势，加速推进了乙肝/丁肝病毒复制机制的研究及抗乙肝/丁肝药物的研发进程。此外，劲帆医药还拥有专业的体内外药效评价团队，可提供肝脏疾病药物筛选、药效学评价、药代动力学研究、Non-GLP非临床安全性评价等服务项目，全面覆盖药物临床前研究的完整流程。近期，来自美国国立卫生研究院（NIH）国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所的Marc G. Ghany研究团队在期刊《Gastroenterology》上发表了题为“Current Best Practice in Hepatitis B Management and Understanding Long-term Prospects for Cure”的综述，该综述涵盖了当前慢性HBV感染的最佳管理实践和HBV感染的新兴疗法及其治愈前景。 1 HBV介绍 01 HBV生命周期 HBV颗粒（也称Dane particle）由一个外层脂质包膜和一个内部核衣壳组成，核衣壳内含有病毒遗传物质（DNA）和复制所需的酶（聚合酶）。病毒基因组是部分双链DNA，具有四个重叠的开放阅读框，它们编码以下7种病毒蛋白：聚合酶，核心蛋白，乙肝e抗原（HBeAg），大、中、小三种HBsAg以及X蛋白。病毒生命周期如图1所示。复制过程中，会产生双链线性DNA（约占5%～10%），这些DNA可能随机整合到宿主基因组中,进而引发肝细胞癌（HCC）。相当比例的HBsAg可能来源于整合的HBV DNA。图1 HBV生命周期和药物开发靶点（图片来源：Yardeni D et al, Gastroenterology, 2023） 02 HBV感染后的免疫机制免疫反应在HBV清除中起着重要作用。HBV不易激活包括Ⅰ型干扰素（IFN）途径在内的细胞内先天防御机制，但可以通过Ⅰ/Ⅲ型IFN和细胞内抗病毒传感器（如Toll样受体（TLRs）、视黄酸诱导基因Ⅰ（RIG-Ⅰ）样受体）的药理学激活和外源性IFN治疗来抑制其复制。HBV还可以通过HBV前基因组RNA（pgRNA）与RIG-Ⅰ之间的相互作用以及体外肝细胞中的IFN刺激来诱导产生Ⅲ型IFN。此外，在急性HBV感染患者中，自然杀伤（NK）细胞和NKT细胞可在早期被激活。因此，一旦HBV在肝细胞中复制，Ⅲ型IFN以及NK细胞和Kupffer细胞（也称枯否细胞）的激活可能有助于在感染早期调节病毒复制和病毒传播。在动物模型中，T细胞已被证实是HBV清除和肝病发病机制中的关键因素。CD8 T细胞能识别和杀死病毒感染肝细胞，而CD4 T细胞则提供关键的T细胞和协调免疫反应。在急性HBV感染的患者中，广泛的抗病毒T细胞反应和HBsAg特异性中和抗体反应能有效清除病毒，HBV特异性记忆T细胞还能在急性HBV感染临床缓解后持续数十年，这些记忆T细胞由体内微量病毒维持，并可能介导病毒控制；B细胞也参与HBV控制，慢性HBV感染涉及特异性及全身性T细胞和B细胞功能障碍，由于长期暴露于病毒抗原和炎症介质，这将导致免疫衰竭和免疫失调。另外，先天性和适应性免疫细胞的非特异性炎症浸润在HBV感染的肝脏中积聚，并促进肝细胞损伤和纤维化，而无法抑制病毒。因此，免疫介导的HBV治疗需要在病毒免疫控制和肝细胞损伤之间取得平衡以避免不良临床后果。 2 治疗策略 01 HBV感染治疗目标慢性乙肝（CHB）治疗的主要目标是预防肝硬化、HCC发展和降低肝脏相关死亡率。然而，从感染HBV到发生这些终点事件，病情发展通常需要经过几十年。因此，评估慢性HBV感染治疗方法的研究依赖于替代终点，包括HBV DNA水平低于可检测下限、谷丙转氨酶（ALT）正常化、HBeAg清除、HBsAg清除和组织学改善，其中HBsAg清除被认为是最佳的终点，但自发性和治疗相关的HBsAg清除率较低，每年大约只有1%。 02 CHB治疗指征 CHB是一种动态疾病。HBeAg状态、HBV DNA和ALT水平是评估CHB疾病活动的主要指标。美国肝病研究学会（AASLD）、欧洲肝病研究学会（EASL）和亚太肝病研究学会（APASL）这三大肝脏学会已就治疗指征提供了指导（表1）。此外，世界卫生组织针对可能无法进行病毒载量检测的低收入和中等收入国家开发了一种更为简化的治疗方法。所有指南均强烈建议对失代偿性肝病、肝硬化，以及具有活动性疾病指征的患者（HBV DNA和ALT水平升高的患者）进行治疗。其它治疗或预防指征见表2。另有一些专家提出了一种可替代且更简化的“全面治疗”法，即无论患者ALT水平如何，对所有HBsAg阳性且可检出病毒血症的个体进行治疗。但该方法在部分患者中存在争议，研究人员建议“逐例分析”，来考虑疾病进展和肝癌的风险因素以及患者接受治疗的意愿，从而处理指南治疗标准之外的情况。表1 关于CHB肝病学会指南和世界卫生组织的治疗指征（图片来源：Yardeni D et al, Gastroenterology, 2023）表2 关于HBV感染的其他治疗及预防指征（图片来源：Yardeni D et al, Gastroenterology, 2023） 03 CHB治疗药物美国已获批7种用于治疗慢性HBV感染的药物，包括标准干扰素α-2b（美国和欧洲已不再使用）、聚乙二醇干扰素α-2a、拉米夫定（lamivudine）、阿德福韦（adefovir）、替比夫定（telbivudine）、恩替卡韦（entecavir, ETV）、富马酸替诺福韦二吡呋酯（tenofovir disoproxil fumarate, TDF）和替诺福韦艾拉酚胺（tenofovir alafenamide, TAF）。由于聚乙二醇干扰素具有更优越的药代动力学和给药方案（每周一次与每周三次相比），因此它优于标准干扰素。在核苷（酸）类似物中，由于恩替卡韦、富马酸替诺福韦二吡呋酯和替诺福韦艾拉酚胺具有更强的药效和更低的抗病毒耐药性，因此它们被推荐用于替代拉米夫定、阿德福韦和替比夫定。肝病学会指南推荐了两种治疗策略（表3）。一种是使用聚乙二醇干扰素α-2a进行为期48周疗程治疗，另一种是使用推荐的核苷（酸）类似物之一进行长期治疗。表3 目前获批上市的治疗CHB药物及其疗效（图片来源：Yardeni D et al, Gastroenterology, 2023） ▎聚乙二醇干扰素α-2a 作用机制：尚不完全清楚，但具有抗病毒和免疫调节两种特性。推荐剂量和治疗周期：对于HBeAg阳性和HBeAg阴性的患者，推荐剂量均为180mg，每周一次皮下注射，持续48周。优点：HBeAg阳性患者的HBeAg清除率较高（30%），并能在较短时间内清除HBsAg（HBeAg阳性患者为2%-7%，HBeAg阴性患者为4%），特别是在HBV基因型为A、B的患者中。此外，HBeAg和HBsAg能保持持续阴性。缺点：需要皮下注射给药，存在许多严重的不良事件。禁忌症：禁用于失代偿性肝硬化患者、伴有临床上显著门静脉高压的代偿性肝硬化患者和妊娠期女性。 ▎核苷（酸）类似物作用机制：通过被HBV逆转录酶整合到新合成的DNA中，作为DNA链终止剂抑制病毒复制。优点：核苷（酸）类似物的疗效因药物而异（表3），普遍具有良好的安全性和耐受性。缺点：对cccDNA无活性，停药后易复发；存在引起肾病和骨量丢失的风险，尤其是TDF。适用人群：可用于失代偿期肝硬化患者和孕妇，用以治疗或预防母婴传播。 04 治疗终点在HBeAg阳性患者中，聚乙二醇化干扰素相关的HBeAg血清学转换是主要治疗终点之一。大约25%的患者在短期（停药后的6-12个月）内可以持续抑制HBV DNA至2000 IU/mL以下。相比，在HBeAg阴性患者中，只有19%的患者可以在停药后维持HBV DNA ＜400 copies/mL。使用核苷（酸）类似物治疗时的最佳终点是至少2次检测中确认HBsAg已清除，无论是否出现Anti-HBs。对于非肝硬化、HBeAg阳性的患者，如果实现HBeAg血清学转换、HBV DNA检测不出，并接受至少12个月的巩固治疗，则可以停用核苷（酸）类似物。建议进行至少1年的治疗后监测（每3个月一次），以检测疾病是否重新活跃。对于HBeAg阴性患者，AASLD建议进行无限期治疗，直至HBsAg消失。对于无肝硬化的患者，如果实现HBV DNA检测不出且ALT水平正常持续2-3年，APASL和EASL则建议可以停止治疗。实际上，病毒学复发几乎普遍存在，停药后的前3个月内，10-30%的患者观察到病情恶化，近一半的患者可能需要重新开始治疗。因此，停用治疗的决定需要与患者仔细商议，并且患者必须同意在停药后接受密切监测。由于存在肝功能失代偿的风险，肝硬化患者不应停用抗病毒治疗。 05 未治疗患者的监测和筛查由于慢性HBV感染的动态特性，未治疗患者应每3～6个月检测一次HBV DNA和ALT水平，直至出现自发性HBsAg丢失。对于HBeAg阳性患者，应每6～12个月检测一次HBeAg状态。对于HBeAg阴性、HBV DNA水平较低（<2000 IU/mL）且ALT水平正常（非活跃性携带者/HBeAg阴性慢性感染）的患者，应在1年内每3个月检测一次HBV DNA和ALT水平，以确认疾病处于非活跃状态，之后可每6～12个月监测一次，还应每年检测一次HBsAg丢失情况，以及每2～3年进行一次无创性肝纤维化评估。针对肝硬化患者，应每6个月进行一次超声筛查，可结合甲胎蛋白（AFP）检测。HBsAg阳性且无肝硬化的成年人，但如果属于HCC高风险人群（40岁以上的亚洲或黑人男性以及50岁以上的亚洲女性、一级亲属有HCC病史者、或丁型肝炎病毒感染者）也应每6个月进行一次筛查。HBsAg清除后，对于肝硬化患者、一级亲属患HCC或有长期感染史（男性>40岁，女性>50岁）的患者，应继续进行HCC监测。 3 创新疗法由于上述疗法对cccDNA和整合HBV DNA的影响有限，且无法恢复慢性HBV感染的免疫功能紊乱。因此，迫切需要能够实现高HBsAg清除率的治疗方案。目前在研的创新疗法包括阻断病毒产生（表4，图1）和恢复耗竭的免疫反应（表4，图2）。表4 目前在研的抗病毒药物（图片来源：Yardeni D et al, Gastroenterology, 2023）图2 HBV发病机理中的免疫亚群及免疫调节治疗策略（图片来源：Yardeni D et al, Gastroenterology, 2023） 01 直接抗病毒药物靶向病毒入侵的前提是阻断新一轮的肝细胞感染，从而防止cccDNA的形成并减少cccDNA库。 Bulevirtide：能不可逆地阻断牛磺胆酸钠共转运蛋白受体，从而阻止病毒入侵，现已被欧洲药品管理局（EMA）批准用于治疗慢性丁型肝炎病毒感染。研究结果显示，在HBeAg阴性的CHB患者中，以不同剂量给予Bulevirtide 12周后，少数患者的HBsAg水平下降了≥0.5log IU/mL，但无人实现HBsAg清除，还观察到无症状的胆汁酸升高。 Hepalatide：另一种牛磺胆酸钠共转运蛋白受体阻断剂，目前正在进行一项双盲、安慰剂对照的Ⅱ期临床研究，用以评估其联合pegylated IFN与单独使用pegylated IFN治疗CHB的效果。单/多克隆抗体制剂：除阻断病毒入侵外，单克隆抗体还可以降低病毒血症和亚病毒颗粒水平，并通过呈递病毒抗原刺激T细胞，使得HBsAg清除。GC1102是一项正处于Ⅱ期临床试验中的重组乙型肝炎免疫球蛋白。VIR-3434是一种新型单克隆抗体，正在病毒抑制患者中进行Ⅰ期临床研究（NCT04423393），初步结果表明，HBsAg水平呈剂量依赖性快速下降，且未发生显著不良事件。 ▎靶向HBV转录物的药物抑制病毒产生的另一种方法是通过RNA干扰（RNAi）和反义寡核苷酸（ASOs）靶向编码信使RNA（mRNAs）的蛋白质。这种方法的治疗优势是单个小干扰RNA（siRNA）/ASO可以沉默多个病毒转录物。 siRNA：能与病毒mRNA结合，并引起细胞内RNA诱导的沉默复合体（RISC）降解病毒RNA。然而，由于该种疗法存在递送载体毒性和长期作用效果差，因此研究人员建议可以作为诱导疗法在短期疗程内给药以降低HBsAg水平。在部分患者中，研究人员发现AB-729可抑制HBsAg水平，从而增强HBV特异性免疫反应，这可能是该药物的另一个益处。 ASOs：能与病毒mRNA结合，并通过RNAseH1或空间位阻效应诱导其降解，从而阻止翻译。目前有两种反义分子，bepirovirsen和IONIS-HBVLRx，正在接受核苷（酸）类似物治疗的患者中进行Ⅱa期临床试验，最近的研究进展显示其均有积极的治疗效果。 ▎靶向HBV核心蛋白的药物 HBV核心蛋白作为病毒核衣壳的结构蛋白，是基因组进行逆转录和复制的场所。核心蛋白还调节HBV基因组的亚细胞转运和释放、RNA代谢、cccDNA转录，并抑制宿主先天性免疫反应。因此，HBV核心蛋白是乙肝药物开发的一个重要靶点。核心蛋白变构调节剂（CpAMs）通过形成异常组装的核衣壳或缺乏pgRNA的形态正常但空的核衣壳（或两者兼有），来抑制HBV复制。目前至少有12种CpAMs处于药物开发的不同阶段（表4）。CpAMs在抑制所有HBV基因型的HBV复制方面非常有效，不过该类药物必须与一种或多种不同类型的抗病毒药物联合应用。CpAMs与核苷（酸）类似物联合应用时，会带来更快和更显著的病毒抑制作用。 ▎靶向HBV聚合酶的药物靶向HBV聚合酶逆转录酶功能的药物是治疗慢性HBV感染广泛使用的药物。ATI-2173是一种乙肝病毒聚合酶抑制剂。在Ⅰ期临床研究中，28天给药后导致HBV DNA平均减少2.8 log10 IU/mL，且无任何严重不良事件。预计在短暂的给药间隔内，HBsAg水平没有变化，该药的Ⅱ期临床研究正在进行中。其他靶向HBV聚合酶如pradefovir、HS-10234，分别源自阿德福韦和替诺福韦，旨在提高抗病毒效力并降低代谢物毒性。初步数据表明，其有效性与TDF相似。靶向HBV聚合酶RNase H功能的药物也正在临床前开发中。 ▎靶向HBsAg释放的药物由于HBsAg的清除被定义为功能性治愈，因此开发能够降低HBsAg水平和限制病毒产生的药物引起了研究人员的极大兴趣。此外，HBsAg在慢性HBV感染中以亚病毒颗粒的形式大量循环，因此有望通过降低HBsAg来恢复免疫反应。核酸聚合物（NAP）是一种短的合成寡核苷酸，能够与HBV亚病毒颗粒相互作用并阻断其分泌。一项只有40例病患的临床研究中，研究人员评估了REP2139或REP2165这两种NAPs与替诺福韦和pegylated IFN联用，并与替诺福韦和pegylated IFN单用进行了为期48周的比较。结果显示，在治疗方案中加入NAPs的情况下，44%的患者HBsAg持续降低至检测水平以下，且全部产生了Anti-HBs，大多数接受NAPs治疗的患者（90%）观察到3-4级ALT升高，而在未接受NAP治疗的患者中为20%。未来还需要更大数量患者组的对照研究来进一步评估NAP的有效性和安全性。另一种类似方法是使用S-抗原转运抑制寡核苷酸聚合物（STOPS）。STOPS也是一种单链寡核苷酸，可以隔离HBsAg产生所需的细胞蛋白。体外研究表明，STOPS比NAP具有更大的效力。然而，该药物的Ⅰ期临床研究结果显示，HBsAg未显著降低，因此试验已被终止。 ▎靶向HBV cccDNA的药物消除肝细胞核内的cccDNA是治愈慢性HBV感染的关键。目前，有几种消除或沉默cccDNA的方法正在临床前开发阶段。然而，脱靶效应的潜在风险可能会限制这一方法的应用。基因编辑技术如锌指核酸酶、转录激活因子样效应核酸酶和CRISPR/Cas-9蛋白，通过在DNA中引入靶向双链断裂，然后通过同源修复在裂解位点产生突变使cccDNA失活。一项使用来自嗜热链球菌的CRISPR/Cas9系统对HBV感染细胞系的研究中，成功清除了90%的HBV cccDNA。但在靶标特异性、安全高效以及提高编辑效率以消除所有cccDNA等方面还需进一步的研究。此外，靶向HBV X蛋白（HBX）可能是沉默cccDNA的可行方法。Pevonedistat和dicoumarol显示可降低HBX表达，恢复Smc5/6水平，并在培养的肝细胞和人源化小鼠模型中抑制病毒转录。另外，通过上调APOBEC3A/B表达也可导致cccDNA降解。 02 间接抗病毒药物当前与治疗相关的一个问题是，是否可以通过纯抗病毒方法实现治愈，或者是否有必要添加免疫调节剂。目前的免疫学方法均针对先天性和适应性免疫系统，以广泛增强细胞防御并促进HBV适应性免疫应答（图2）。 ▎靶向先天性免疫系统先天性免疫系统对HBV的识别能力很差，因此HBV被视为一种隐匿性病毒。然而，观察到肝非实质细胞产生的某些细胞因子（如IFN-α、IFN-γ、肿瘤坏死因子-β和白细胞介素[IL]-1α）以及LTbR介导的APOBEC（载脂蛋白BmRNA编辑酶，催化多肽样）激活或RIG-I激活，可以通过非细胞溶解机制抑制甚至清除HBV，这为开发先天性免疫反应的外源性激活剂提供了理论依据。几种病原体识别传感器的激动剂，例如TLRs、RIG-I和干扰素基因刺激物（STING），已被证明能诱导产生IFN刺激基因和促炎细胞因子，从而清除病毒。先天免疫激动剂 TLRs在许多细胞亚群（包括免疫细胞）中表达，作为病毒和细菌病原体相关分子模式的传感器，在宿主防御中发挥着重要作用。在土拨鼠模型中，CpG寡脱氧核苷酸与ETV联合治疗被证明可以抑制土拨鼠肝炎病毒的病毒载量。几种口服TLR-7/8激动剂正在进行临床试验，包括GS-9620、RO7020531（RG7854）、RG7795（ANA773）、JNJ-4964（AL-034/TQ-A3334）和GS-9688。刺激和恢复适应性免疫因子目前临床上已经探索了几种策略来重新激活对HBV的弱适应性免疫应答，其中一个关键考虑因素是安全诱导治疗应答，而不会引起严重的肝细胞损伤和临床失代偿。免疫检查点抑制剂：在一项小型试验研究中，评估了在核苷（酸）类似物治疗的患者中使用PD-1抑制剂（nivolumab）的效果，观察到HBsAg有轻微下降。一名患者在3级ALT升高之前实现了HBsAg血清学转换，且未观察到严重不良事件。最近的一项Ⅱ期临床研究评估了在有核苷（酸）类似物治疗经验的患者中使用PD-1单克隆抗体恩沃利单抗（envafolimab, ASC22）的效果。观察到HBsAg最大降低1.2log10 IU/mL，且未出现显著的ALT升高，患者对治疗耐受性良好。另一种靶向PD-1途径的方法是通过核糖核酸酶H（RNAseH）途径降解PD-1配体mRNA。尽管免疫检查点抑制具有潜在作用，但对其安全性和不可预测反应还需进行更大规模的研究。基因编辑T细胞：免疫疗法在癌症治疗中的成功，为乙肝治疗提供了新思路，如使用CAR-T细胞、TCR-T细胞激活T细胞受体，从而更新替代体内耗竭的T细胞并产生新的功能性T细胞。动物模型的初步证据表明，这种方法可以降低HBsAg和HBV DNA的水平，而不会引起显著的肝脏损伤。未来还需要在非肝细胞癌患者中进行进一步的临床研究以验证其安全性和有效性。新型治疗性疫苗：目前的疫苗方法采用独特的策略来提高疫苗效力，包括纳入多种抗原以扩大T细胞应答（GS-4774，一种包含HBsAg、HB核心抗原和HBX的酵母载体）；改进递送系统（电穿孔，例如编码HBsAg和HB核心抗原的INO-1800疫苗，编码HBV核心和聚合酶蛋白的JNJ-64300535疫苗）；采用新型佐剂（INO-1800疫苗加INO-9112）；与检查点抑制剂联合使用；使用病毒载体（非复制型人腺病毒、黑猩猩腺病毒、改良后的安卡拉痘苗病毒和沙粒病毒）等。 — 总结 — 慢性HBV感染会导致慢性肝炎，患者一生都有发展为肝硬化和肝细胞癌的风险。因此，有必要进行终身监测以检测疾病进展。尽管当前治疗能改善临床结局，但由于药物对共价闭合环状DNA（cccDNA）和整合HBV DNA效果甚微，因此无法完全实现长期治愈。鉴于全球疾病负担，迫切需要更有效的治疗方法，对HBV生命周期和持续性感染的免疫发病机制有更深入的了解，以及开发创新药物和给药方式。要实现功能性治愈可能需要多种药物联合治疗，包括抗病毒药物、降低病毒抗原负荷的药物以及增强免疫反应的免疫调节剂。另外，还需要进一步完善基因编辑疗法。疾病负担在低收入和中等收入国家最为严重，因此，就需要开发出更安全、有效、疗程有限且负担得起的治疗方法。扫码获取全文劲帆医药已开发rAAV-HBV1.3-mer WT replicon、AAV-HBV-1.04（与武汉大学合作开发）和rAAV-1.2×HDV系列造模病毒产品，具备成模率高、稳定性好、适用范围广等优势，加速推进了乙肝/丁肝病毒复制机制的研究及抗乙肝/丁肝药物的研发进程。 01 乙肝造模AAV病毒产品 ▎产品信息可根据客户不同需求定制HBV基因组点突变株。应用场景：慢性乙肝模型、HBV持续复制模型，可用于研究乙肝病毒复制机制及抗乙肝药物的开发。可提供的现货产品见下表，另相关AAV-HBV-1.04系列造模病毒产品可致电客服17720514121详询。 ▎产品列表 02 丁肝造模AAV病毒产品 ▎产品信息可根据客户不同需求定制不同肝脏特异性启动子启动的HDV基因组及其点突变株。应用场景：慢性乙肝/丁肝合并感染模型，可用于研究丁肝病毒复制机制及抗丁肝药物的开发。可提供的现货产品见下表。 ▎产品列表 END 劲帆医药自主研发的昆虫杆状病毒One-Bac 4.0系统，能克服传统Bac/Sf9系统感染效率低、空壳率高、种毒传代不稳定等问题，在大规模量产定制化AAV过程中，可实现高产率、高感染活性、高实心率，单批次产能可达1E+18vg，为您的基因治疗药物研发保驾护航！业务合作欢迎致电17720514121详询！关于劲帆医药劲帆生物医药科技（武汉）有限公司简称“劲帆医药”，创立于2022年，提供一站式基因治疗药物CRO/CDMO服务。拥有全球领先的AAV规模化制备专利技术平台及cGMP级病毒载体生产车间，致力于推进基因治疗更有效，更安全，更经济，更可及，赋能客户，造福患者。联系我们电话：17720522078 官网：www.genevoyager.com 邮箱：marketing@genevoyager.com 地址：中国武汉东湖高新区光谷七路128号微信：Genevoyager2022 关于同写意同写意论坛是中国新药研发行业权威的多元化交流平台，二十年来共举办会议论坛百余期。“同写意新药英才俱乐部”基于同写意论坛而成立，早已成为众多新药英才的精神家园和中国新药思想的重要发源地之一。同写意在北京、苏州、深圳、成都设立多个管理中心负责同写意活动的运营。尊享多重企业/机构会员特权 ● 分享庞大新药生态圈资源库； ● 同写意活动优享折扣； ● 会员专属坐席及专家交流机会； ● 同写意活动优先赞助权； ● 机构品牌活动策划与全方位推广； ● 秘书处一对一贴心服务。入会请联系同写意秘书处同写意创新链盟机构（上下滑动查看更多）国通新药 | 通瑞生物 | 科济药业丨立迪生物 | 森西赛智 | 汇芯生物 | 申科生物 | 方拓生物 | 东抗生物 | 科盛达 | 依利特 | 翊曼生物丨锐拓生物丨复百澳生物丨圆因生物丨普洛斯丨华润三九丨皓阳生物丨人福医药丨广生堂药业丨澳宗生物丨妙顺生物 | 荣捷生物丨行诚生物 | 宜联生物 | 生命资本 | 恒诺康丨益诺思 | 深圳细胞谷丨佰诺达生物 | 沃臻生物 | 金仪盛世 | 朗信生物 | 亦笙科技 | 中健云康 | 九州通 | 劲帆医药 | 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临床研究疫苗

2024-09-04

·精准药物

【JMC】苏州大学叶娜和中南大学程岩团队报道一种eEF2K降解剂，对三阴性乳腺癌有治疗潜力

2024年8月29日，苏州大学叶娜和中南大学程岩团队在Journal of Medicinal Chemistry上在线发表了题为“Structure–Activity Relationship Studies of Substituted 2-Phenyl-1,2,4-triazine-3,5(2H,4H)-dione Analogues: Development of Potent eEF2K Degraders against Triple-Negative Breast Cancer”的文章。作者基于hits I4和C1的2-苯基-1,2,4-三嗪-3,5（2H，4H）-二酮骨架进行结构优化，通过SAR分析发现了化合物36可以显著抑制TNBC细胞系MDA-MB-231和HCC1806的存活率、增殖和迁移，对eEF2K蛋白具有高结合亲和力，并有效诱导其降解。此外，在MDA-MB-231细胞异种移植小鼠模型中，36具有与紫杉醇相当的肿瘤抑制作用，没有明显的毒性，表明化合物36可以开发为TNBC治疗的潜在新疗法。三阴性乳腺癌（TNBC）是乳腺癌中最具侵袭性的亚型，复发可能性高，总体预后差，占已确诊乳腺癌的15-20%。化疗仍是目前TNBC标准治疗的主要手段，因TNBC异质性高，对激素疗法和针对ER、PR和HER2的靶向疗法反应较低。化疗耐药性的出现也给TNBC的治疗带来了挑战。因此，开发新的有效疗法作为治疗TNBC的有效选择迫在眉睫。真核细胞伸长因子2激酶（eEF2K）是唯一依赖于Ca2+和钙调素的非典型α-激酶，也被称为Ca2+/钙调素依赖性蛋白激酶III（CAMKIII）。eEF2K在细胞应激和缺氧、营养耗竭等不利条件下被激活。这使它能够使其下游蛋白eEF2磷酸化，从而阻止核糖体转运并抑制蛋白质合成的延长步骤，最终维持能量平衡并适应微环境挑战。eEF2K活性异常与肿瘤发生、侵袭和转移的增强有关。eEF2K在不同类型的癌症中高度过表达，包括乳腺癌、胶质瘤、胰腺癌、脑癌和肺癌。在TNBC患者中也观察到了eEF2K的表达失调。药理抑制eEF2K可抑制肿瘤进展并提高癌症免疫疗法的疗效。因此，eEF2K是TNBC的一个新兴治疗靶点。目前，针对eEF2K的调节剂报道较少，已报道的eEF2K抑制剂在体外表现出显著抑制eEF2K酶活性的作用，但它们对各种癌症细胞类型的抗增殖功效相对有限，因此阻碍了体内验证研究（图1A）。新型高效的eEF2K的抑制剂亟待开发。图1. 已报道的eEF2K调节剂的结构作者基于A-484954的吡啶并[2,3-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮框架的骨架跳转设计策略，以及随后对初始hit I4的初步优化，发现了一种eEF2K单价降解剂C1（图1B）。I4较低的抗增殖效力和C1中存在的不稳定酯基限制了其进一步的临床转化。因此，在本文中，作者通过分子对接预测C1和I4与eEF2K蛋白的结合模式（图2A-B），设计并合成了四个系列的I4和C1衍生物（图2C），在其2-苯基-1,2,4-三嗪-3,5(2H,4H)-二酮支架上探索更多的化学空间，并在药物化学方面建立eEF2K降解剂的结构-活性关系（SARs），最终提高化学稳定性和抗癌疗效。图2. C1和I4与eEF2K蛋白的结合模式及新型eEF2K降解剂的设计 SAR分析表1. 系列I化合物的抗肿瘤活性表2. 系列II化合物的抗肿瘤活性表3. 系列III和IV化合物的抗肿瘤活性在合成的一系列结构衍生物中，化合物36显示出最显著的MDA-MB-231细胞抑制活性，IC50 = 43.71 nM。SPR分析表明化合物36与eEF2K的结合力很强，且与浓度有关，KD值为330 nM。化合物36对TNBC细胞具有强效抑制作用通过CCK-8试验测试化合物19和36对其他六种乳腺癌细胞的抗癌活性。如图3A所示，与其他亚型乳腺癌细胞株相比，36对TNBC细胞株MDA-MB-231和HCC1806表现出更强的效力，在菌落形成试验中优于19（图3B）。36以剂量依赖的方式诱导MDA-MB-231和HCC1806细胞的显著凋亡（图3C）。Western印迹分析发现，PARP和Bax的裂解水平升高，PARP、Bcl-2和XIAP的水平降低（图3D），进一步证明36诱导了MDA-MB-231和HCC1806细胞的凋亡。图3. 化合物36可抑制细胞增殖并诱导细胞凋亡化合物36能有效阻断上皮细胞向间质转化和细胞迁移 eEF2K是上皮细胞向间质转化（EMT）的介导因子，EMT是促进细胞迁移和侵袭的重要机制。通过Western印迹分析检测了化合物36对EMT标记的影响。如图4A所示，化合物36处理导致E-cadherin表达增加，N-cadherin和波形蛋白表达减少，阻止了TNBC细胞的EMT。通过细胞伤口愈合试验评估了化合物36对TNBC细胞迁移的影响。如图4B所示，化合物36能显著抑制细胞迁移。图4. 化合物36抑制细胞迁移化合物36通过泛素-蛋白酶体系统诱导eEF2K降解作者检测了化合物36对eEF2K蛋白表达的影响，发现36能以剂量依赖的方式有效降低MDA-MB-231和HCC1806细胞中eEF2K蛋白水平（图5A）。化合物36在TNBC细胞中诱导的eEF2K下调效应与其对癌细胞的抑制作用呈正相关。细胞热转移试验表明，用36处理会增加eEF2K的热稳定性，这表明36与eEF2K蛋白结合（图5B），与之前的SPR结果一致。此外，根据36的分子对接结果，构建的携带eEF2K氨基酸突变（Phe8、Leu10、Cys146）的HEK-293T细胞，其中两个苯基环和核心与C1重叠良好（图6A-B）。同样，细胞热转移实验表明，Phe8、Leu10和Cys146氨基酸的突变损害了eEF2K蛋白在36存在下的热稳定性，表明eEF2K与化合物36之间的相互作用被破坏（图6C）。图5. 化合物36能有效诱导eEF2K蛋白降解图6. 化合物36能与eEF2K蛋白特异性结合接着，作者进行了冲洗实验以评估36诱导eEF2K降解的持续时间。图5C显示，培养基冲掉后，eEF2K蛋白持续降解，48 h后由于蛋白的重新合成，eEF2K蛋白恢复，表明36可能是一种长效的eEF2K降解剂。为了验证用36处理的TNBC细胞中eEF2K的下调是否与eEF2K降解的调控有关，作者用MG132和MLN4924处理了细胞。如图5D所示，蛋白酶体抑制剂MG132和E1泛素激活酶抑制剂MLN4924能显著逆转36诱导的eEF2K表达下降，表明36能促进泛素-蛋白酶体途径介导的eEF2K降解。进一步探讨了36对蛋白质稳定性的影响，发现在36的处理下，eEF2K蛋白的周转率明显加快（图5E）。综上所述，36通过促进泛素-蛋白酶体途径介导的降解来下调eEF2K蛋白。为了进一步证实36诱导的肿瘤抑制作用确实是通过靶向eEF2K实现的，作者通过shRNA转染建立了eEF2K稳定敲除（eEF2K-KD）的MDA-MB-231 细胞（图7A）。发现36对细胞存活的影响与敲除eEF2K对MDA-MB-231细胞的影响相当（图7B）。与对照细胞相比，稳定敲除eEF2K的MDA-MB-231细胞对36不敏感（图7C-D）。证实了36的抗肿瘤活性源于其促进eEF2K降解作用。图7. 化合物36对TNBC细胞的抑制作用取决于eEF2K的降解化合物36的药代动力学（PK）特性当静脉注射和腹腔注射剂量为5mg/kg时，36的体内峰值浓度（Cmax值分别为549.3和194.3ng/mL）和暴露量（曲线下面积（AUC）值分别为860.6 和 287.5 h·ng/L）均可接受，半衰期分别为 5.9 和 2.1 h。然而，36的口服吸收可能较差，从而导致口服生物利用度不足（F = 1.5%，表 4），这主要归因于其低水溶性。现阶段通过腹膜内给药来确定其体内药效（F = 33.4%）。表4 化合物36的PK特性化合物36在体内具有强效的肿瘤抑制作用化合物36以剂量依赖性的方式显示出有效的抗肿瘤活性，在5和10 mg/kg剂量时，肿瘤生长抑制率（TGI）分别为44.79%和59.26%（图8A-D）。此外，剂量为10 mg/kg的36在体内的抗癌活性（TGI ：59.26 vs 52.70%）与TNBC治疗中使用的标准化疗药物PTX相当。免疫组化分析表明，与对照相比，36治疗显著降低了Ki-67的表达（图8E）。此外，用36治疗的肿瘤中eEF2K的表达呈剂量依赖性下调（图8F）。图8. 化合物36显著抑制体内肿瘤生长体内毒性试验表明，在使用36的治疗过程中，小鼠体重没有减轻（图9A）。小鼠各器官的大小/重量或H&E染色检测均未显示出异常，这表明小鼠对5 mg/kg和 10 mg/kg的剂量均有耐受性，能有效抑制肿瘤生长（图9B-D）。进一步检测了一系列肝肾毒性血清生化指标，在异种移植模型中未观察到明显的药物相关毒性（图9E）。图9. 化合物36在体内显示低毒性总结本文基于hits I4和C1的2-苯基-1,2,4-三嗪-3,5(2H,4H)-二酮骨架进行结构优化和SAR研究，发现化合物36对三种TNBC细胞系表现出最强的效力，其IC50值从43.7到585.3 nM。此外，化合物36能明显抑制MDA-MB-231和HCC1806细胞的迁移和凋亡，并与eEF2K蛋白有很高的结合亲和力，能有效地诱导其降解。此外，36在TNBC细胞异种移植小鼠模型中发挥了强大的肿瘤抑制作用，且无明显毒性，有希望成为TNBC治疗的潜在新型疗法。原文链接：https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c01484 药物筛选中心（暨南大学）对外提供新药筛选服务声明：发表/转载本文仅仅是出于传播信息的需要，并不意味着代表本公众号观点或证实其内容的真实性。据此内容作出的任何判断，后果自负。若有侵权，告知必删！长按关注本公众号粉丝群/投稿/授权/广告等请联系公众号助手觉得本文好看，请点这里↓

免疫疗法临床终止

2024-08-07

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致癌转录因子 β-Catenin 的共价降解剂

β-连环蛋白(CTNNB1,β-Catenin)是一种致癌转录因子，驱动许多不同类型的人类癌症的发病机制，包括肝癌、肺癌、结直肠癌、乳腺癌和卵巢癌。CTNNB1作为E-cadherin和α-catenin的大蛋白复合物的一部分调节细胞间的粘附。CTNNB1也是一种转录因子，可被上游Wnt信号通路激活，该信号通路调节参与细胞增殖、存活、上皮-间质转化、迁移和转移的基因。CTNNB1受泛素-蛋白酶体系统的高度调控，其中E3泛素连接酶β-TrCP1在被GSK3α和GSK3β磷酸化后识别CTNNB1的N端。 CTNNB1突变常见于多种癌症，通常位于E3连接酶识别的N端片段，阻止CTNNB1的泛素化和降解，从而增强CTNNB1的致癌转录活性。在Wnt通路中也发现了突变，包括APC和轴蛋白，这些突变可增强CTNNB1的水平和活性。针对Wnt通路的癌症治疗已经做了很多努力，PKF115-584和CGP04090破坏CTNNB1和TCF之间的相互作用。然而，这些化合物的抑制机制尚不清楚，这些化合物含有与泛测定干扰化合物(苦痛)相关的功能基团，如醌或紫黄素ICG-001通过与CBP的结合破坏CTNNB1与CBP之间的结合，并且在微摩尔效应下不是特别有效抑制剂，如IWR-1和XAV939，稳定轴蛋白和CK1激活剂pryivinium，以增强破坏复合物的活性，但这些化合物并不直接与CTNNB1相互作用。此外，虽然Wnt通路抑制剂很有前景，但在许多人类肿瘤中发现的Wnt通路中的许多突变可能使这些间接作用的化合物无效直接作用的CTNNB1抑制剂或降解剂作为潜在的癌症治疗药物是优选的，但由于CTNNB1的结构灵活性、内在无序性和缺乏可配体热点，直接靶向致癌转录因子(如CTNNB1)仍然具有挑战性。来自加州大学伯克利分校的Daniel Nomura教授团队通过筛选共价分子库和蛋白质细胞组学得到的直接与CTNNB1结合作用的化合物NF764。为了鉴定CTNNB1的共价降解物，作者在HEK293细胞中筛选了2100个由丙烯酰胺和氯乙酰胺组成的半胱氨酸反应性共价配体文库，确定在与蛋白酶体抑制剂硼替佐米或Cullin E3连接酶NEDDylation抑制剂MLN4924预孵育后CTNNB1损失衰减的化合物(图S1)。作者发现EN83是唯一表现出剂量响应性CTNNB1损失的靶标，该损失通过蛋白酶体或NEDDylation抑制而显著减轻，这表明EN83通过泛素-蛋白酶体介导的机制作为CTNNB1降解剂(图1b-d) 作者通过Western blotting进一步证实了HEK293T细胞中蛋白酶体介导的CTNNB1缺失(图1e,f)。EN83以剂量依赖的方式显著抑制CTNNB1转录活性，证明细胞中WNT通路的功能性抑制(图1g)。作者观察到，与CTNNB1降解相比，EN83在细胞中对CTNNB1转录活性的抑制作用更高，这表明EN83可能在较低浓度下与CTNNB1结合以抑制CTNNB1活性，而CTNNB1的降解需要更高的结合或浓度。CTNNB1在由CTNNB1驱动的结直肠癌细胞中的表达，包括HT29、COLO和SW480癌细胞系(图1)。接下来，作者试图确定EN83是否直接与CTNNB1共价结合。作者发现EN83剂量响应性地取代半胱氨酸反应性荧光探针用凝胶基ABPP标记纯人源CTNNB1蛋白，表明EN83通过靶向CTNNB1上的半胱氨酸直接作用于CTNNB1纯蛋白(图2a)。作者进一步对CTNNB1纯蛋白与EN83孵育后的胰蛋白酶进行串联质谱分析(MS/MS)，发现四种半胱氨酸被EN83修饰C439、C466、C520和C619(图2b)。为了进一步证实EN83与CTNNB1的直接共价结合，作者合成了EN83的炔功能化类似物NF686，并通过NF686对纯CTNNB1蛋白进行了直接共价剂量响应探针标记(图2c,d)。作者进一步证明了共价是必要的，因为EN83的非反应性类似物NF602不显示与CTNNB1结合，并且通过HiBiT或Western blotting检测不会改变CTNNB1水平(图2e-h)。研究结果表明EN83直接与CTNNB1结合。接下来，作者想确认EN83在细胞中与CTNNB1结合。作者首先在细胞中使用炔探针NF686来证明CTNNB1可以在不富集GAPDH等不相关靶标的情况下从细胞中富集(图3a)。作者使用先前建立的方法进行了基于质谱的ABPP或同位素去硫代生物素-ABPP (isoDTB-ABPP)，以绘制EN83在细胞中整个蛋白质组范围内的半胱氨酸反应性。这些结果表明，EN83与C619的作用大于50%。在作者的isoDTB-ABPP实验中，作者没有检测到EN83参与的其他三种半胱氨酸，可能是因为这些半胱氨酸不是基于碘乙酰胺反应性的探针的目标，或者这些肽可能不能很好地通过基于MS的方法从复杂的蛋白质组中电离。因此，作者无法确定其他三种半胱氨酸的参与，但作者的数据显示C619在CTNNB1中有显著的参与。然而，半胱氨酸化学蛋白质组学分析还揭示了许多其他靶点被EN83-308显著参与CTNNB1的直接共价靶向导致其降解，作者仍然对EN83能否通过很感兴趣，并将该化合物视为“探路者探针”，以确定CTNNB1配位性的途径，随后可通过药物化学的努力进行优化。EN83细胞处理的细胞热移实验显示CTNNB1在细胞中具有明显的热不稳定性。这些结果进一步证明了EN83直接作用于CTNNB1，也表明CTNNB1的降解可能是通过直接共价靶向CTNNB1引起的，导致CTNNB1折叠不稳定，随后泛素化和降解(图3c,d)。接下来，作者试图确认EN83在CTNNB1中靶向的半胱氨酸是否有助于其降解。作者在细胞中表达了flag标记的野生型、C439S、C466S、C520S或C619S突变型CTNNB1，结果表明，C466、C520或C619的丝氨酸突变(而不是C439)显著减弱了细胞中CTNNB1的降解(图4a,b)。与这三种半胱氨酸在CTNNB1降解中的作用一致，C466、C520和C619突变为丝氨酸导致FLAG-CTNNB1减少完全衰减(图4c,d)。这些结果表明，直接靶向CTNNB1中鉴定的四种半胱氨酸中的三种会导致CTNNB1的降解，并且CTNNB1的下调不是通过间接机制或通过EN83的许多脱靶之一。为了提高EN83对CTNNB1的活性并探索其构效关系，作者合成了几种EN83的类似物。EN83是两种对映体的外消旋混合物。作者首先用手性色谱法分离单个对映体，以确定是否有一个特定的对映体更有效。EN83的两种对映体通过HiBiT和蛋白酶体介导的CTNNB1降解显示出相当的CTNNB1水平降低，并且显示出相同的CTNNB1结合，表明两种对映体之间没有差异。作者还寻求替代氯乙酰胺半胱氨酸反应弹头，优化其代谢特性。不幸的是，在许多口服共价药物(如BTK抑制剂ibrutinib或KRAS G12C抑制剂sotorasib)中发现的丙烯酰胺(NF601)替代11损害了与CTNNB1的结合，并且在HiBiT或Western blotting检测方法中均未显示CTNNB1减少。作者发现，用三氟甲基部分NF740和NF741取代甲氧基基团，可以耐受凝胶基ABPP与CTNNB1结合，并以剂量反应方式降低HEK293细胞中CTNNB1 HiBiT水平。作者发现用含NF764的氧苯基丁烯酰胺战斗部替换氯乙酰胺战斗部可以改善CTNNB1的结合(图5a,b)。分析纯CTNNB1蛋白的NF764修饰位点发现，只有C619被NF764内聚，而C439、C466和C520没有被NF764内聚。NF764的半胱氨酸化学蛋白质组学分析显示，CTNNB1 C619在HT29结直肠癌细胞中以3.7的比例显著参与，表明在10nM处参与73%。引人注目的是，NF764有效降解CTNNB1, 50%的降解浓度(DC50)为3.5nM, Dmax。81%的HT29细胞(图5e,f)。CTNNB1蛋白水平的丧失仍然依赖于蛋白酶体(图5g)。因此，虽然这些变化可能是由于NF764的脱靶效应，但蛋白质水平的许多变化可能是通过靶机制发生的。作者进一步发现几个CTNNB1靶基因的mRNA水平显著下调，包括MYC、S100A6、AXIN2和CCND1。因此，作者证明NF764是一种更有效和选择性的CTNNB1结合剂和降解剂。为了进一步验证NF764仅通过靶向C619而不是通过靶向三种半胱氨酸作用的EN83来降解CTNNB1，作者证明了与表达FLAG-CTNNB1野生型蛋白的细胞相比，表达HEK293T的FLAGCTNNB1 C619S突变的细胞对NF764介导的CTNNB1损失具有完全的抗性，并且表达C466S/C520S/C619S三重突变的细胞对NF764介导的CTNNB1损失具有完全的抗性。除了单个C619S突变外，细胞没有表现出任何额外的响应(图6a,b)。NF764的细胞热移分析也显示，HT29细胞中CTNNB1的不稳定性更为明显，NF764处理后，熔化温度从62℃上升到55℃，变化7℃(图6c,d)。因此，虽然作者的化合物可能仍然有脱靶，但作者证明NF764对CTNNB1的降解是通过C619对CTNNB1的直接共价靶向介导的。因此，作者将NF764指定为一种先导化合物，该化合物揭示了一种新的可配体半胱氨酸C619，可以用于降解CTNNB1。在这项研究中，作者发现了一种CTNNB1的降解物，它通过C466、C520、C619或仅C619对CTNNB1的直接共价靶向作用，以蛋白酶体依赖的方式破坏和降解CTNNB1。作者推测，在本研究中观察到的降解模式可能不同于传统的靶向蛋白降解模式，如靶向嵌合体(PROTACs)和分子胶降解剂的蛋白水解，而是通过CTNNB1的热力学不稳定发生，直接共价结合导致不稳定介导的CTNNB1降解。许多转录因子由于缺乏用于小分子结合的定义明确的结合口袋，并且许多转录因子具有大片段的非结构化或无序区域，因此常常无法通过传统的药物发现努力。无论是通过抑制、激活、不稳定还是降解，共价配体都可以进入高动态和内在无序的蛋白质(如转录因子)的动态和瞬时状态或罕见但动态可达的状态，以独特的方式调节其功能。虽然难以证明，但作者推测转录因子内部这些内在无序的区域可能采用一种瞬时结合口袋，可以被共价配体分子识别，形成不可逆的键。鉴于这些无序转录因子可能已经是热力学不稳定的，作者假设它可能不需要显著的结合能来进一步破坏这些动态区域的稳定，从而导致它们的展开并最终泛素化和降解这些靶标。与之前描述的CTNNB1抑制剂相比，CTNNB1抑制剂要么间接作用于Wnt通路的其他组分，要么潜在地直接作用于CTNNB1，但不能有效地或以未知的机制或选择性调节其功能，作者提出了一种高效的CTNNB1降解剂，它通过一种独特的机制共价靶向一种新的可配体C619来破坏和降解CTNNB1。总的来说，作者的研究证明了使用共价化学蛋白质组学策略来识别独特的配体位点和共价配体的实用价值，这些配体可以直接靶向经典的难以处理的靶标类，如转录因子，最终降解CTNNB1等靶标，用于潜在的未来癌症治疗应用。参考文献 Covalent Degrader of the Oncogenic Transcription Factor β-Catenin. J Am Chem Soc. 2024， doi: 10.1021/jacs.4c05174. 内容来源于网络，如有侵权，请联系删除。

蛋白降解靶向嵌合体

100 项与 Pevonedistat 相关的药物交易

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KEGG	Wiki	ATC	Drug Bank
D10413	Pevonedistat	-	DB11759

研发状态

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适应症	最高研发状态	国家/地区	公司	日期
慢性粒单核细胞白血病	临床3期	以色列	Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.	2017-11-28
慢性粒单核细胞白血病	临床3期	韩国	Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.	2017-11-28
慢性粒单核细胞白血病	临床3期	澳大利亚	Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.	2017-11-28
慢性粒单核细胞白血病	临床3期	巴西	Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.	2017-11-28
慢性粒单核细胞白血病	临床3期	中国	Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.	2017-11-28
慢性粒单核细胞白血病	临床3期	日本	Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.	2017-11-28
慢性粒单核细胞白血病	临床3期	波兰	Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.	2017-11-28
慢性粒单核细胞白血病	临床3期	德国	Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.	2017-11-28
慢性粒单核细胞白血病	临床3期	捷克	Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.	2017-11-28
慢性粒单核细胞白血病	临床3期	俄罗斯	Takeda Pharmaceutical Co., Ltd.	2017-11-28

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研究	分期	人群特征	评价人数	分组	结果	评价	发布日期


NCT03319537 (CTgov)	临床1/2期	恶性间皮瘤	9	pevonedistat (Pevonedistat)	醖繭築襯襯膚鹹壓廠鬱(齋遞艱壓鏇鏇構糧鏇鏇) = 夢衊襯廠獵膚齋選製繭鏇願夢醖製衊簾選壓鬱 (蓋獵蓋鏇簾壓選觸範範, 製繭淵網醖願襯齋願顧 ~ 簾網夢築蓋壓繭廠蓋願) 更多	-	2024-05-23
NCT03319537 (CTgov)	临床1/2期	恶性间皮瘤	9	cisplatin+pevonedistat+pemetrexed (Pevonedistat in Combination With Pemetrexed and Cisplatin)	醖繭築襯襯膚鹹壓廠鬱(齋遞艱壓鏇鏇構糧鏇鏇) = 憲齋淵壓艱製膚憲獵製鏇願夢醖製衊簾選壓鬱 (蓋獵蓋鏇簾壓選觸範範, 築衊選顧窪淵淵壓範壓 ~ 壓衊觸繭構鏇觸鏇鹽構) 更多	-	2024-05-23
NCT04172844 (Pubmed) 人工标引	临床1期	急性髓性白血病二线	16	azacitidine + venetoclax + pevonedistat	(窪獵夢膚艱廠鏇構壓艱) = 鬱艱鏇願蓋衊簾願餘齋構鹹窪願糧廠艱鑰積獵 (糧襯糧範廠醖淵範糧憲 ) 更多	积极	2024-04-04
NCT04266795 (pevenaza, AACR2024) 人工标引	临床2期	急性髓性白血病一线 \| \| \| ... 更多	120	Venetoclax + Azacitidine	鏇顧糧築遞構簾鬱遞衊(鑰廠顧蓋淵壓廠齋獵壓) = 衊鑰窪製築糧繭範襯製壓繭淵鏇蓋衊範淵襯鑰 (顧襯夢製願鹹選壓顧選 ) 更多	积极	2024-03-22
NCT04266795 (pevenaza, AACR2024) 人工标引	临床2期	急性髓性白血病一线 \| \| \| ... 更多	120	Venetoclax + Azacitidine + Pevonedistat	鏇艱襯窪製襯鑰蓋鬱淵(願鬱範鏇廠鬱壓願遞醖) = 膚獵構衊積廠艱憲鹹衊鑰鬱鏇壓糧夢遞鹹蓋齋 (淵選範醖製衊網積淵網 )	积极	2024-03-22
NCT03965689 (CTgov)	临床2期	晚期非小细胞肺癌 \| 转移性非鳞状非小细胞肺癌 \| 不可切除的非小细胞肺癌	27	Carboplatin+Paclitaxel+Pevonedistat	選鏇簾衊蓋鹽淵壓獵遞(廠艱夢衊襯襯壓鑰淵獵) = 願鹹獵壓鏇範糧壓構鏇襯鬱築構繭選製壓構餘 (遞遞獵鹽築願簾糧繭繭, 衊願襯繭醖襯築範艱壓 ~ 獵範遞糧淵壓夢製夢觸) 更多	-	2023-12-15
NCT03330821 (ASH2023)	临床1/2期	急性髓性白血病	28	Pevonedistat	(願製襯鹹獵鹹範醖窪鑰) = 壓網蓋選壓襯繭觸製鹽獵壓鹹蓋繭淵夢鑰鑰醖 (膚襯鹹糧壓繭顧簾夢憲 ) 更多	积极	2023-12-11
NCT03238248 (CTgov)	临床2期	骨髓增生性疾病 \| 骨髓增生异常综合征	71	Azacitidine Subcutaneous Injection or Intravenous Infusion+Pevonedistat Infusion	膚餘鹹窪構鹹襯襯膚鹽(選廠築齋製膚鬱鹽艱積) = 醖範遞範壓鬱廠顧獵淵齋獵鏇餘選築廠遞鏇鏇 (願鏇範願餘願繭醖鑰遞, 餘鹹願範鑰鹽憲鹽製鏇 ~ 網醖築鬱願選選淵憲簾) 更多	-	2023-11-21
NCT02782468 (CTgov)	临床1期	急性髓性白血病 \| 骨髓增生异常综合征	23	Pevonedistat (Single Agent Arm: Pevonedistat 25 mg/m^2)	(壓窪淵膚積憲艱廠繭築) = 選範齋夢齋鹹鑰鹽選齋淵齋餘憲範鹽齋選獵窪 (艱鹽淵觸繭襯範積鏇夢, 鹽壓鏇構餘遞網膚淵網 ~ 願遞築窪鹹衊簾構蓋願) 更多	-	2023-11-03
NCT02782468 (CTgov)	临床1期	急性髓性白血病 \| 骨髓增生异常综合征	23	Pevonedistat (Single Agent Arm: Pevonedistat 44 mg/m^2)	(壓窪淵膚積憲艱廠繭築) = 淵顧繭壓鏇範鹹積夢醖淵齋餘憲範鹽齋選獵窪 (艱鹽淵觸繭襯範積鏇夢, 鬱壓願遞憲憲獵艱簾憲 ~ 蓋齋鑰淵遞糧鏇淵艱網) 更多	-	2023-11-03
NCT03228186 (CTgov)	临床2期	晚期非小细胞肺癌	40	docetaxel+Pevonedistat	觸鹹衊範網鬱餘構網糧(衊憲鹽獵襯構鹹遞遞窪) = 廠網鹹鹹鏇鑰淵選簾鹽範構襯積衊獵淵蓋築構 (醖獵繭餘製鹹築鏇鏇窪, 鹹鏇遞網餘糧選範簾齋 ~ 衊積製獵膚齋艱鹹壓鹽) 更多	-	2023-10-23
NCT04266795 (PEVENAZA, CTgov)	临床2期	急性髓性白血病	164	Venetoclax+Azacitidine (Venetoclax 100/200/400 mg + Azacitidine 75 mg/m^2)	(衊繭鏇觸襯觸築壓願鹽) = 齋齋簾醖窪齋膚鹹鹹襯築壓築糧願鏇繭遞築鏇 (築製鏇積鏇艱餘鑰壓膚, 鏇廠艱顧製艱夢夢夢鏇 ~ 壓膚繭遞廠鏇製範繭淵) 更多	-	2023-09-18
NCT04266795 (PEVENAZA, CTgov)	临床2期	急性髓性白血病	164	Venetoclax+Pevonedistat+Azacitidine (Pevonedistat 20 mg/m^2 + Venetoclax 100/200/400 mg + Azacitidine 75 mg/m^2)	(衊繭鏇觸襯觸築壓願鹽) = 選蓋襯衊艱醖簾襯構廠築壓築糧願鏇繭遞築鏇 (築製鏇積鏇艱餘鑰壓膚, 餘鹹遞製鹹構鹹膚構築 ~ 窪餘鑰網餘鬱遞鬱鹽積) 更多	-	2023-09-18
NCT03772925 (ASCO2023) 人工标引	临床1期	复发性急性髓细胞白血病 \| 难治性急性髓细胞白血病 \| 骨髓增生异常综合征	18	Belinostat+Pevonedistat	(襯夢衊憲鹹鏇廠構餘鏇) = MTD was not reached in this study. 獵蓋膚範夢繭膚鏇鏇淵 (繭膚窪齋鑰餘鏇夢鬱獵 ) 更多	积极	2023-05-31