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本月精选40文
01
IF: 56.1
Nature
华东师大叶海峰/管宁子等Nature:口服活菌药,按需降血糖
02
IF: 56.1
Nature
Nature:母体肠道菌群,婴儿菌群与健康的"微生物蓝图"
03
IF: 56.1
Nature
Nature:应激状态下的细胞命运开关,ZFP36L2决定肠道再生与癌症转移
04
IF: 56.1
Nature
Nature:海洋细菌接力破解最难降解的碳封存多糖
05
IF: 47.3
Science
Science:超越常规炎症,肠上皮细胞死亡特征预测IBD复发
06
IF: 47.3
Science
Science:靶向菌群-宿主互作,延缓皮肤衰老(观点)
07
IF: 47.3
Science
Science:生成式AI"定制"噬菌体,有望破解细菌耐药难题
08
IF: 47.3
Science
Science综述:甜蜜的进化,膳食糖如何造就人类大脑?
09
IF: 45.1
Cell
Cell:肠菌合成新型信号分子,守护心血管代谢健康
10
IF: 45.1
Cell
Cell:母乳蛋白"训练"肠道菌群,为新生儿肺部铸造免疫护盾
11
IF: 45.1
Cell
Cell:孕期肠道可塑性,肌肉为何关键?
12
IF: 45.1
Cell
遗传发育所周俭民团队Cell:植物发出"缺磷信号",招募"友"菌互惠合作
13
IF: 45.1
Cell
复旦陈剑峰/温娅婷等Cell:唤醒肠道胶质细胞,打开抗肠癌免疫开关
14
IF: 45.1
Cell
Cell:膳食精氨酸不足,如何让癌细胞逃避免疫追杀?
15
IF: 65.4
JAMA
JAMA:补维生素D3抗肠癌,最新双盲试验给出否定答案
16
IF: 57.5
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology
Nature Reviews:15项最小标准,助破解微生物组临床研究可重复性危机(共识)
17
IF: 56.1
Cancer Cell
南京医大陈云/胡楚鹏等Cell子刊:瘤内蜡样芽孢杆菌重塑淋巴微环境,助力肝癌免疫治疗
18
IF: 44.5
Nature Biotechnology
康奈尔大学郭春君团队NBT:非模式肠道梭菌遗传操作工具,精准调控代谢物
19
IF: 44.4
iMeta
复旦郑琰/孙仲汉等iMeta:孕早期肠道菌群异常,如何推高妊娠糖尿病风险?
20
IF: 44.4
iMeta
浙大柳志刚团队iMeta综述:肠道微生物组,被忽视的"器官"
21
IF: 38
Nature Materials
Nature子刊:调控肠道菌群,让纳米抗癌药直达肿瘤
22
IF: 37.5
Nature Nanotechnology
Nature子刊:肠菌代谢物变身纳米前药,重塑T细胞抗癌力
23
IF: 37
Cell Metabolism
Cell Metab:同样减重10%,生酮饮食改善代谢效果翻倍
24
IF: 30.6
Immunity
Immunity:肠道代谢物重塑肿瘤微环境,胆汁酸如何操控免疫周期?(综述)
25
IF: 30.6
Immunity
Immunity:找不到"补给站"就难以存活,G蛋白信号如何决定肠道T细胞命运?
26
IF: 30.6
Immunity
Immunity:肠道炎症的胞质刹车,揭秘非编码RNA的免疫调控
27
IF: 29.7
Gastroenterology
30项临床试验揭秘,不同膳食纤维对IBS疗效迥异
28
IF: 28
Nature Cancer
复旦中山医院董玲团队Nature子刊:低蛋白饮食重塑肠菌,激活巨噬细胞抗胰腺癌
29
IF: 27.5
Nature Metabolism
Nature子刊:肠道菌群的代谢信使,短链脂肪酸如何影响全身健康?(综述)
30
IF: 27.5
Nature Metabolism
湘雅二院肖扬团队Nature子刊:免疫与代谢的博弈,肠道cGAS或是肥胖元凶
31
IF: 26.5
Nature Immunology
Nature子刊:克罗恩病治疗新靶点,基质细胞的"表观遗传记忆"
32
IF: 26.5
Nature Immunology
Nature子刊:揭秘肠道派氏结微环境,M细胞如何调控固有免疫?
33
IF: 25.5
Nature Genetics
Nature子刊:肠菌毒素如何篡改基因,揭秘年轻化肠癌的幕后黑手
34
IF: 25
Nature Aging
中国科学院北京基因组所张维绮团队Nature子刊:锁定抗衰老肠道益生菌
35
IF: 24.6
Gut
陈亮/耿杰杰等GUT:肠道菌群失调如何诱发全身炎症?
36
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
北医三院李蓉/李萌等Cell子刊:格氏乳杆菌后生元助力改善女性生殖衰老
37
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
Cell子刊:追踪口→肠细菌传播,无创筛查胃肠癌症
38
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
Cell子刊:活体生物药双管齐下重塑肠道微生态
39
IF: 21.9
Lancet Microbe
Lancet子刊:肠道缺氧警报,酵母过度生长或是结肠菌群失调关键信号
40
IF: 18.7
Nature Microbiology
Nature子刊:噬菌体联手粪菌移植,破解反复尿路感染难题
01
华东师大叶海峰/管宁子等Nature:口服活菌药,按需降血糖
工程益生菌活体生物药GLP-1血糖调控
IF: 56.1
Glucose-responsive probiotics for glycaemic modulation in mice and monkeys
管宁子, 孔德强, 高纤云
牛灵雪, 周阳, 余贵玲, 高天, 刘梦瑶, 马文博, 金昳雨, 尹剑丽, 赵善刚
叶海峰
Article|2026-08-12
10.1038/s41586-026-10909-6
研究背景与设计
针对糖尿病传统药物需频繁给药且易引发副作用的问题,基于假单胞菌葡萄糖响应因子HexR,以大肠杆菌Nissle 1917为底盘,构建口服葡萄糖响应性益生菌活体药物GIFT。
核心成果与意义
口服GIFT活体药物能够根据肠道葡萄糖浓度实时分泌GLP-1,在多种糖尿病模型中驱动安全长效的血糖控制并改善代谢并发症,为代谢疾病的无创智能治疗提供了新平台。
体外与小鼠验证
GIFT系统响应阈值与临床糖尿病诊断标准一致,在正常小鼠中呈低背景,并伴随可逆的开-关-开基因表达动力学。
小鼠血糖调控
口服GIFTGLP-1(分泌GLP-1的GIFT)后,db/db小鼠高血糖触发GLP-1分泌,显著降低血糖,改善糖耐量与胰岛素抵抗,并降低HbA1c。
代谢并发症改善
长期口服GIFTGLP-1使db/db小鼠体重减轻、脂质谱改善,并缓解肝肾及结肠并发症,伴随肠道菌群组成调节。
药物比较优势
与司美格鲁肽相比,GIFTGLP-1在控制血糖同时未引发急性炎症反应,且与胰岛素联用时未增加低血糖风险。
灵长类模型验证
在自发性2型糖尿病食蟹猴中,单次口服GIFTGLP-1导致GLP-1快速升高并降低血糖;5周疗程显著改善糖耐量与胰岛素抵抗,未观察到肝肾毒性。
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02
Nature:母体肠道菌群,婴儿菌群与健康的"微生物蓝图"
婴儿肠道微生物组母体肠道微生物组垂...
IF: 56.1
Maternal influences on infant gut microbiome and health
Trishla Sinha, Siobhan Brushett
Asier Fernández-Pato, Sanzhima Garmaeva, Sergio Andreu-Sánchez, Johanne E Spreckels, Cyrus Alexander Mallon, Nataliia Kuzub, Milla Brandão Gois, 吴佳斐, Marloes Kruk, S Jankipersadsing, Jackie Dekens, Ranko Gacesa, Arnau Vich Vila, Corinna Bang, Corine Perenboom, Andre Franke, Hanne L. P. Tytgat, Sara Colombo Mottaz, Lilian Peters, Ank de Jonge
Trishla Sinha, Alexandra Zhernakova
Article|2026-08-12|
OA
10.1038/s41586-026-10922-9
背景与设计
基于714对荷兰母婴队列的纵向宏基因组数据,整合粪便、乳汁、阴道菌群及24种人乳低聚糖定量,系统解析母婴菌株传递规律及其健康关联。
核心发现与意义
母体肠道菌群是婴儿定植菌株的主要来源,其多样性与婴儿湿疹风险显著相关,凸显了母体微生态在早期健康中的关键作用。
传递动态与来源
母婴菌株共享率随婴儿月龄显著下降,母体肠道贡献远高于阴道或乳汁,短双岐杆菌等菌株可经阴道垂直传递至婴儿肠道。
影响因素
阴道分娩与母乳喂养均伴随更高菌株共享率,母体肠道中单形拟杆菌等菌丰度升高显著伴随其向婴儿传递概率的增加。
功能特征
垂直传递菌株显著富集碳水化合物代谢及脂多糖修饰等相关功能基因,提示其在婴儿肠道定植中的适应性优势。
健康关联
母体肠道α多样性降低显著预测婴儿1年内湿疹发生,该关联独立于母亲吸烟史与家族过敏史。
主导驱动因素
分娩与喂养方式显著塑造婴儿菌群组成及碳水化合物活性酶功能谱,家庭分娩等其他产科参数影响甚微。
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03
Nature:应激状态下的细胞命运开关,ZFP36L2决定肠道再生与癌症转移
ZFP36L2RNA结合蛋白结直肠癌肿瘤转移
IF: 56.1
ZFP36L2 orchestrates stress-adaptive plasticity in regeneration and cancer
Qingwen Jiang
Manisha Raghavan, Aileen M. Rodriguez, Morgan Lallo, Cyrus L. Tam, Saskia Hartner, Britney Forsyth, Ahmed Mahmoud, Fabian Zincke, Huiyong Zhao, Andrew Moorman, S Balkaran, Kathleen A Luckett, Jura Pintar, Yevgeniy Romin, Eric Chan, Anthony Santella, Bernadette Mödl, Farheen Shah, Ilyes Baali, Michael G Kharas
K Ganesh
Article|2026-08-05
10.1038/s41586-026-10890-0
研究背景与设计
针对肠上皮应激重编程与结直肠癌转移机制不明的问题,整合小鼠再生模型与患者来源类器官探究了ZFP36L2的分子开关功能。
核心发现与意义
RNA结合蛋白ZFP36L2通过相分离机制驱动细胞去分化进入肠干细胞状态,决定了组织修复与经典转移播种的成败。
靶点发现
ZFP36L2在正常和肿瘤ISC样细胞中高表达,且与AP-1应激响应通路高度共表达。
肠道再生必需性
在小鼠结肠损伤模型中,肠上皮特异性敲除Zfp36l2会阻断祖细胞向LGR5+干细胞的去分化,导致隐窝结构修复障碍。
转移与可塑性
ZFP36L2缺失显著削弱了结直肠癌在小鼠体内的肝肺转移播种能力,但驱动存活的转移灶向预后不良的非经典谱系(如鳞状或神经内分泌样)发生重编程。
相分离机制
ZFP36L2结合含AU富集区的应激mRNA,形成动态的RNA依赖性生物分子凝聚体,驱动靶转录本(如GDF15、GADD45A)快速降解从而终止应激反应并启动去分化程序。
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04
Nature:海洋细菌接力破解最难降解的碳封存多糖
褐藻糖胶协同降解海洋微生物组
IF: 56.1
Synergistic degradation of fucoidans in the ocean
Andreas Sichert
Shaul Pollak, Taylor Priest, Akshit Goyal, Samuel Miravet-Verde, Shinichi Sunagawa
Otto X Cordero, Uwe Sauer
Article|2026-08-26|
OA
10.1038/s41586-026-10980-z
研究背景与设计
褐藻糖胶因难被微生物降解而参与海洋碳封存,其群落降解机制尚不清楚,研究结合宏基因组学、菌株分离培养与靶向代谢组学解析功能架构。
核心发现
褐藻糖胶的近完全降解依赖岩藻糖骨架特化菌与稀有单糖侧链特化菌协同,为复杂多糖周转提供可定量预测的生态代谢框架。
功能分化
骨架特化菌富含硫酸化岩藻糖裂解酶,侧链特化菌富含稀有单糖裂解酶,单菌最高降解率仅为69%。
酶级联协同
前序菌酶解暴露隐藏糖苷键,使后序菌的特异性酶继续切割,互补群落的最高降解率升至97.1%。
效能预测
依据菌株对岩藻糖和稀有单糖的降解偏好及底物组成构建的非线性模型,可预测127种群落组合对8种不同结构褐藻糖胶的降解效能。
全球分布证据
超万个海洋宏基因组样本显示功能互补的特化降解菌频繁共现,提示该协同机制可能广泛参与海洋复杂多糖周转。
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05
Science:超越常规炎症,肠上皮细胞死亡特征预测IBD复发
炎症性肠病坏死性凋亡细胞凋亡
IF: 47.3
A necroptotic-to-apoptotic signaling axis underlies inflammatory bowel disease
Jiyi Pang, Aysha Al-Ani
Komal M Patel, Yunzhuo Zhou, Samuel N Young, Jinjin Chen, Isabella Kong, Marilou Barrios, James A Rickard, Siqi Chen, Xiuquan Ma, Farzaneh Shojaee, Seong-Beom Kim, Siavash Foroughi, Wayne Cawthorne, Annette V. Jacobsen, Asha Jois, Ashley L. Weir, Lachlan Whitehead, Pradeep Rajasekhar, Christopher R Horne, Ruqian Lyu
Edwin D Hawkins, Britt Christensen, Andre L Samson, James E Vince, James M Murphy
Article|2026-08-27
10.1126/science.aeh7112
研究背景与设计
针对炎症性肠病(IBD)复发机制不明的问题,利用80例患者肠活检多组学及患者来源类器官模型,解析了肠上皮细胞死亡信号的时序性与治疗抵抗性。
核心发现与意义
坏死性凋亡-凋亡信号轴在黏膜病变早期即被激活,独立于组织学炎症与当前治疗持续存在,构成IBD分子层面的“未愈合”标志并预测临床复发风险。
早期死亡信号
即使在非炎性组织和接受先进治疗的患者中,坏死性凋亡(pRIPK3)和凋亡(裂解型caspase-3)信号也显著升高,且表现为不依赖RIPK1而伴随ZBP1表达上调的非经典激活。
上皮细胞重编程
空间转录组定位到一类分化晚期结肠细胞亚群特异性高表达包含NOS2及MLKL的M1巨噬细胞样基因簇,该亚群在重度炎症组织中扩增至上皮细胞总数的30%。
细胞因子驱动机制
利用类器官模型证实微环境中的IFNγ和TNF共刺激是驱动上皮细胞死亡的核心因素,二者通过上调诱导型一氧化氮合酶(由NOS2编码)驱动结肠细胞发生BAX/BAK依赖的线粒体凋亡,同时通过上调PUMA驱动肠道干细胞凋亡。
临床复发预测
通过2-3年的纵向随访队列证实,基线活检组织中升高的坏死性凋亡信号(pRIPK3)能够独立预测患者未来的临床复发。
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06
Science:靶向菌群-宿主互作,延缓皮肤衰老(观点)
皮肤微生物组皮肤衰老细胞衰老
IF: 47.3
Beyond wrinkles
Sasan Jalili-Firoozinezhad
Sasan Jalili-Firoozinezhad, Julia Oh
Perspective|2026-08-27|
OA
10.1126/science.aeh4348
科学问题与视角
衰老皮肤不仅发生组织结构退化,其微生态系统亦同步演变,提示靶向菌群-宿主互作是延缓皮肤功能衰退的潜在路径。
菌群动态特征
老年人群皮肤痤疮丙酸杆菌丰度下降且群落异质性增加,该演变与衰弱状态的生物学相关性显著优于自然年龄。
代谢与屏障调控
动物及体外模型显示,表皮葡萄球菌分泌鞘磷脂酶促进神经酰胺合成,痤疮丙酸杆菌与马拉色菌属的色氨酸代谢物通过AhR通路增强屏障修复。
免疫与衰老互作
早期共生菌定植训练皮肤免疫耐受,但在免疫耗竭与细胞衰老背景下,菌群代谢重编程易诱发促炎因子释放,加剧慢性低度炎症。
表观遗传调控
菌群代谢物可能通过表观遗传修饰反向调节宿主细胞衰老,与衰老相关分泌表型形成双向互作。
转化路径挑战
现有模型难以真实模拟衰老皮肤微环境,未来干预需兼顾微生态适配性与宿主衰老状态,以功能终点改善为核心。
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07
Science:生成式AI"定制"噬菌体,有望破解细菌耐药难题
基因组语言模型噬菌体噬菌体疗法
IF: 47.3
Generative design of bacteriophages with genome language models
Samuel H King
Claudia L Driscoll, David B Li, Daniel Guo, Aditi T Merchant, Garyk Brixi, Max E Wilkinson
Brian L Hie
Article|2026-08-06
10.1126/science.aec2657
研究背景与设计
针对全基因组从头设计难题,利用Evo 1与Evo 2基因组语言模型,以ΦX174为模板生成靶向E. coli C的完整噬菌体基因组。
核心发现与意义
首次实现人工智能驱动的可行噬菌体全基因组设计,生成的噬菌体兼具宿主特异性与抗性克服能力,为合成基因组学奠定基础。
计算与实验验证
经微调模型生成序列并多层级计算过滤后,化学合成285条序列,在宿主中获得16株具有宽谱裂解动力学与竞争适应性的活性噬菌体。
结构与序列创新
生成的噬菌体与已知自然界序列高度分化,冷冻电镜证实Evo-Φ36采用源自远缘噬菌体G4的截短J蛋白仍能适配ΦX174样衣壳。
克服细菌耐药性
16株生成噬菌体混合物通过衣壳与刺突蛋白的新发非同义突变及重组,显著克服waa操纵子突变导致的宿主耐药,而天然噬菌体混合物无此能力。
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08
Science综述:甜蜜的进化,膳食糖如何造就人类大脑?
人类演化膳食糖葡萄糖代谢脑演化
IF: 47.3
A central role for dietary sugars in human evolution
Jennie Brand-Miller
Karen Hardy, David Raubenheimer, Les Copeland
Jennie Brand-Miller
Review|2026-08-06
10.1126/science.aed8437
科学问题与方法
针对人类脑容量400万年间扩大5倍的代谢基础,整合代谢测算、古同位素、牙齿化石与基因变异,构建跨演化阶段膳食模型。
核心命题与意义
膳食糖类及后期熟淀粉是满足脑与生殖组织专性葡萄糖需求的关键,其可获得性驱动了脑扩容及多项适应性遗传选择。
专性葡萄糖缺口
成人日专性需糖量达150-200 g,育龄女性超200 g,糖异生及高蛋白产能有限,必须依赖外源性碳水化合物。
早期食谱证据
南方古猿 Australopithecus afarensis 牙釉质龋齿及同位素特征提示以果蜜为主的嗜甜食性,糖供能超65%。
演化转折与平衡
用火后熟淀粉替代部分糖源,虽动物性食物比例上升,但极端气候或高肉食比例下碳水缺乏易致育龄女性陷入负碳水平衡及酮症。
遗传适应印记
AMY1 拷贝数扩增、URICASE 失活及 LCT 持续表达等,均提示自然选择直接响应膳食碳水可获得性。
现代营养启示
演化塑造的糖代谢系统适配天然食物基质,而非现代游离添加糖,碳水波动曾是人口存续的关键选择压力。
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09
Cell:肠菌合成新型信号分子,守护心血管代谢健康
肠道菌群肠道菌群代谢物饮食-菌群-宿...
IF: 45.1
Gut microbiota generate dinitrosyl iron complexes with cardiometabolic benefits
Andrei L Kleschyov
Miho Shimari, Ariela Boeder, Tomas A Schiffer, Sander van Riet, Gianluigi Pironti, Nadja I. Bork, Alexander Rotmann, Zhengbing Zhuge, Drielle D Guimarães, Gaia Picozzi, Chiara Moretti, Lucas Rannier R A Carvalho, Carina Nihlen, Ellen I. Closs, Viacheslav O Nikolaev, Magnus Ingelman-Sundberg, Eddie Weitzberg, Jon O Lundberg
Andrei L Kleschyov, Mattias Carlström
Article|2026-08-19|
OA
10.1016/j.cell.2026.07.055
研究背景与设计
利用无菌小鼠、心代谢病模型及人肝脏类器官等多尺度模型,解析了膳食硝酸盐与非血红素铁的肠道微生物转化机制。
核心发现与意义
表达硝酸盐还原酶的肠道菌群将硝酸盐和铁转化为具有生物活性的二亚硝酰铁配合物(DNIC),DNIC作为独立信号实体呈系统性分布并驱动心代谢保护效应。
菌群依赖性生成
电子顺磁共振波谱显示常规小鼠肝肾中存在基础DNIC,而无菌小鼠及缺乏硝酸盐还原酶的大肠杆菌突变体在硝酸盐与铁共孵育条件下无法生成该复合物。
系统性转运机制
肠道源DNIC以蛋白结合态稳定转运至外周组织,其生物活性由完整Fe(NO)2实体介导,独立于游离一氧化氮释放显著激活可溶性鸟苷酸环化酶。
代谢调控机制
细胞学实验证实DNIC显著抑制亮氨酸摄取,进而下调mTORC1-SREBP1-SCD1脂生成信号轴。
心代谢保护效应
在西式饮食联合L-NAME诱导的小鼠模型及人肝脏类器官中,补充硝酸盐与铁或合成DNIC显著缓解高血压、胰岛素抵抗及肝脏脂肪变性。
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10
Cell:母乳蛋白"训练"肠道菌群,为新生儿肺部铸造免疫护盾
母乳骨桥蛋白肠道菌群肠-肝轴
IF: 45.1
Milk osteopontin alters the infant microbiome to drive DC hematopoiesis and disease tolerance
Daniel R Howard
Ridwan B Rashid, Tufael Ahmed, Patricia Namubiru, Md. Sohel Rana, Tyler Wilkins, Joshua P Morrow, Darren J Creek, Rose Ann Franco, Mark C. Allenby, Declan L Turner, Rhiannon B Werder, Sam Manna, Catherine Satzke, Yenkai Lim, Jiarui Sun, Paul G Dennis, Anushka Yadav, Andrew J Kueh, Cheong Kwong Chung, Elizabeth Forbes-Blom
Simon Phipps
Article|2026-08-03
10.1016/j.cell.2026.07.022
研究背景与设计
利用OPN−/−母鼠交叉哺育构建乳源骨桥蛋白(OPN)缺失新生小鼠模型,联合宏基因组、代谢组与单细胞测序解析重症下呼吸道感染(sLRI)保护机制。
核心发现与意义
乳源OPN驱动肠道乳杆菌科丰度上升并增加血清D-3-苯基乳酸(D-PLA),后者经PPARγ介导气道微环境重塑,促进祖细胞肺归巢及局部DC造血。
微生物代谢轴
OPN缺失伴随乳杆菌科减少与D-PLA水平下降,体外实验证实乳杆菌通过ldhA酶催化生成D-PLA。
微环境依赖性
D-PLA显著恢复气道上皮PPARγ及Flt3L表达,气道上皮特异性缺失Flt3L完全阻断D-PLA对肺DC祖细胞及sLRI的保护作用。
祖细胞动态
肝源祖细胞高表达CCR9,依赖CCL25趋化迁移至肺,分化为浆细胞样树突状细胞(pDC)与Treg细胞,驱动肺局部DC造血。
干预与临床转化
口服D-PLA显著逆转母体抗生素暴露或OPN缺失导致的pDC造血障碍,阻断sLRI引起的体重停滞与气道炎症。
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11
Cell:孕期肠道可塑性,肌肉为何关键?
肠道肠道肌肉平滑肌肠道适应
IF: 45.1
The sex and reproductive plasticity of intestinal muscles instruct gut size
Alessandro Mineo
Laura Blackie, Alexandra Milona, Emily Strachan, Pedro Gaspar, Nuno Miguel Luis, Alvaro Castano-Medina, Tomotsune Ameku, Bryon Silva, Anadika R Prasad, Clara L. Essmann, Jake Jacobson, Todd Fallesen, Vanessa Dao, Sanjay Khadayate, George R Young, Filipe Cabreiro, Frank Schnorrer
Alessandro Mineo, Irene Miguel-Aliaga
Article|2026-08-11
10.1016/j.cell.2026.07.024
背景与研究设计
针对成年肠道尺寸可塑性是否仅由上皮干细胞驱动的问题,利用果蝇及小鼠模型探究肠道内脏肌肉的重塑机制。
核心发现与意义
肠道肌肉通过整合细胞内源性性别决定因子与生殖依赖的激素脱敏机制,指令性调控成年肠道器官尺寸与转运功能,确立了肌肉在器官适应性重塑中的核心地位。
现象发现与保守性
单核转录组和组织学层面,果蝇肠道肌肉表现出显著性别差异,交配后雌性肌节显著伸长,且小鼠妊娠和哺乳期小肠平滑肌细胞亦伴随增殖与肌层增厚。
性别二态性机制
特异性遗传操纵证实,肠道环形肌内源性Sxl-tra-dsx性别决定通路决定了肌节宽度基线差异,并从外部驱动了雌雄肠道器官尺寸的差异。
生殖重塑与激素
交配后雌蝇肠肌特异性下调保幼激素受体gce以引发局部激素脱敏,该过程受胰岛素信号许可,并直接导致肌节伸长与肠道体积扩张。
生理功能与适应
活体成像与肌节缩短基因sals敲降证实,肌节伸长显著降低了肠道蠕动频率,该转运减缓效应对于维持雌性脂质储存与繁殖力具有因果必要性。
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12
遗传发育所周俭民团队Cell:植物发出"缺磷信号",招募"友"菌互惠合作
植物-微生物互作根际微生物组互利共生
IF: 45.1
Mutually beneficial interactions between bacteria and Arabidopsis promote phosphorus nutrition and growth
Yongjin Wang, Chulei Gao
刘芳, Yiheng Liu, Zhaoyang Zhou, Qi Wang, Fengxia Zhang, Hangyuan Cheng, Xinwei Jiang, Wei Wang, Binglei Wang, Yuanjie Tang, Feng Zhou, Guodong Wang, Yi-Ping Wang, Weicai Yang, Paul Schulze-Lefert
刘栋, 白洋, 周俭民
Article|2026-08-18
10.1016/j.cell.2026.07.048
研究背景与设计
针对非菌根植物磷营养机制不清的问题,利用拟南芥突变体、根际细菌单关联及转录组分析解析了植物-细菌互惠机制。
核心发现与意义
超过20%的根系共生细菌能显著促进缺磷幼苗生长,其中植物分泌苹果酸招募不动杆菌至根表进行磷活化,揭示了非菌根植物获取磷的新范式。
信号招募
缺磷根系经STOP1-ALMT1通路分泌苹果酸,利用趋化作用显著驱动不动杆菌定殖于根分化区,该过程在stop1与almt1突变体中完全丧失。
根表特化生活方式
定殖于根表的细菌显著诱导溶磷基因gcd与phoD及磷摄取基因pstS,并依赖宿主提供的苹果酸、谷氨酸与γ-氨基丁酸维持代谢。
互惠功能验证
细菌gcd或pstS缺失显著导致溶磷与促生能力丧失,而植物pht1;1 pht1;4突变体无法利用细菌释放的磷,证实植物依赖PHT1通路直接吸收。
空间特异性
物理隔离或破坏苹果酸梯度显著阻断互惠效应,证明根表是高浓度底物交换与磷活化的不可替代关键微域。
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13
复旦陈剑峰/温娅婷等Cell:唤醒肠道胶质细胞,打开抗肠癌免疫开关
结直肠癌5-HT2A受体抗肿瘤免疫
IF: 45.1
Targeting peripheral 5-HT2AR enhances antitumor immunity in colorectal cancer
温娅婷, 唐凌杰, 段文文, 任清菲, 倪杨玥, 陈世阳, 陈俊
Lei Yang, Huan Wang, Yuan Chen, YunZhe Zheng, XingChao Pan, Hui Du, MengWen Huang, 曾安, 周兆才, Zhi-Gang Zhang, Hongbin Ji, GaoXiang Ge
温娅婷, 曾艺, 张卫, 王诗慧, 程建军, 汪胜, 陈剑峰
Article|2026-08-04
10.1016/j.cell.2026.07.028
研究背景与设计
针对结直肠癌免疫治疗抵抗问题,开发了非脑穿透性5-HT2AR激动剂IHCH-8110,并结合多种小鼠模型及人源样本解析了其外周靶向机制。
核心发现与意义
IHCH-8110通过激活肠胶质细胞上的5-HT2AR,促进CXCL10和IL-18表达,增强CD8+ T细胞浸润与功能,显著提升了PD-1阻断疗法的疗效。
靶向特异性
药代动力学及行为学测试证实,IHCH-8110具有外周选择性,无脑分布且不引发致幻效应,其抑瘤作用完全依赖于外周5-HT2AR。
机制验证
利用条件性敲除小鼠模型证实,肠胶质细胞特异性缺失Htr2a或Cxcl10可完全消除IHCH-8110诱导的CD8+ T细胞招募及抗肿瘤效应。
功能输出
体外共培养及流式分析显示,IHCH-8110处理的肠胶质细胞通过分泌IL-18,显著驱动CD8+ T细胞向高表达IFN-γ、TNF-α和GZMB的细胞毒性表型极化。
临床相关性
临床样本分析提示,人类结直肠癌中肠胶质细胞的5-HT2AR表达及CXCL10/IL-18水平与CD8+ T细胞浸润及患者良好预后显著相关。
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14
Cell:膳食精氨酸不足,如何让癌细胞逃避免疫追杀?
精氨酸膳食氨基酸I类组织相容性抗原
IF: 45.1
Dietary arginine drives codon-dependent MHC class I translation and improves immunity in colon tumorigenesis and respiratory viral infection
Qiushuang Wu
Lara M. Seydlitz, Vladislav Iakimov, Dennis J Hsu, Parham Habibzadeh, H. Heinrich Hoffmann, Philip B Paty, Charles M Rice
Sohail F Tavazoie
Short Article|2026-07-30
10.1016/j.cell.2026.07.020
研究背景与设计
针对病理状态下氨基酸波动如何调控宿主基因表达的问题,利用多种癌细胞系、小鼠结直肠癌及呼吸道病毒感染模型,探究了精氨酸限制对MHC I翻译及免疫反应的影响。
核心发现与意义
饮食中精氨酸的限制会特异性消耗精氨酰-tRNA,导致MHC I在精氨酸密码子处发生翻译停滞,从而削弱抗原呈递和免疫监视,揭示了营养代谢通过密码子依赖的翻译调控直接编程免疫识别的新机制。
翻译停滞证据
核糖体图谱与tRNA测序显示,精氨酸限制特异性减少多种精氨酰-tRNA,引发MHC I编码区核糖体堆积,且停滞强度随精氨酸密码子使用频率升高而增强。
密码子特异性验证
将MHC I基因中精氨酸密码子替换为耐受性高的AGG后,其蛋白表达与抗原呈递在精氨酸限制下部分恢复,证实调控严格依赖密码子身份。
RARS功能关联
敲低精氨酰-tRNA合成酶RARS模拟精氨酸限制效应,降低MHC I蛋白水平;患者结直肠癌组织中RARS与MHC I蛋白丰度呈正相关。
体内功能验证
饮食精氨酸补充或髓系特异性删除Arg1均提升组织MHC I水平,抑制结直肠肿瘤发生并增强流感/SARS-CoV-2清除;该效应在B2m−/−小鼠中完全消失。
免疫效应终点
精氨酸限制的肿瘤细胞呈现OVA抗原能力下降,OT-I CD8+ T细胞对其杀伤显著减弱,证实MHC I翻译调控直接决定细胞免疫识别效率。
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15
JAMA:补维生素D3抗肠癌,最新双盲试验给出否定答案
转移性结直肠癌维生素D3补充剂
IF: 65.4
Addition of High-Dose Vitamin D3 to Standard Treatment in Patients With Metastatic Colorectal Cancer: The SOLARIS Randomized Clinical Trial (Alliance A021703)
Kimmie Ng
Fang-Shu Ou, Tyler Zemla, Nadine A Jackson, Aparna Kalyan, Craig E Devoe, Michael Shusterman, Namrata Vijayvergia, Christina S Wu, Stacey A Cohen, Sydney Pulsipher, Ardaman Shergill, Yasmeem Watson, Barbara Kleiber, Myounghee Lee, Christine G Kohn, Jennifer S Thalappillil, Lawrence H Schwartz, Dan Zuckerman, Bruce W Hollis, Eileen M O'Reilly
Kimmie Ng
Article|2026-08-03
10.1001/jama.2026.9350
临床问题与设计
针对转移性结直肠癌预后不佳的问题,在一项随机双盲3期临床试验中评估了高剂量维生素D3联合标准一线化疗及靶向治疗的疗效。
核心发现与意义
在标准治疗基础上添加高剂量维生素D3未能显著改善初治转移性结直肠癌患者的生存结局,不支持将其作为常规联合治疗策略。
无进展生存期
高剂量组与标准剂量组的中位无进展生存期分别为11.8个月和10.3个月,组间未见显著差异。
客观缓解率
高剂量组的客观缓解率为51%,标准剂量组为44%,高剂量干预未显著提高肿瘤缓解水平。
总生存期
高剂量组的中位总生存期为25.6个月,标准剂量组为27.0个月,高剂量补充未显著延长患者总体生存时间。
安全性评估
两组患者发生3级或以上不良事件的比例相似,提示高剂量维生素D3未增加额外毒性。
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16
Nature Reviews:15项最小标准,助破解微生物组临床研究可重复性危机(共识)
临床微生物组德尔菲法共识临床元数据
IF: 57.5
Multidisciplinary Delphi consensus statement on minimal standards for clinical metadata and end points in microbiome studies
Robert Schierwagen, Federica Carraturo, Jonel Trebicka, Alessio Fasano
Anandhi Iyappan, Maximilian Joseph Brol, Celine Druart, Mads Israelsen, Zahra Hassani, Kevin Legent, Yolanda Godoy, Corrado Vecchi, Julie Rodriguez, Ida Falk Villesen, Alexander Jarde, Manimozhiyan Arumugam, Aleksander Krag, Emmanuelle Maguin, Peer Bork, Joel Doré
Robert Schierwagen, Jonel Trebicka
Consensus|2026-08-03|
OA
10.1038/s41575-026-01229-1
临床研究标准化共识
针对肠道及低生物量微生物组临床研究异质性问题,基于两轮德尔菲调查制定涵盖元数据、样本处理与临床终点的15项最小标准推荐。
元数据与膳食记录
推荐系统记录年龄、用药史等16项人体测量与生物临床特征,并建议采用含7项核心条目的标准化自评膳食问卷。
实验室预分析指标
基础评估强制要求纳入C反应蛋白、血常规、粪便钙卫蛋白及胆固醇,并建议根据疾病类型补充器官特异性标志物。
样本采集与质控规范
采样套件需含采集管及生物危害袋等组件,粪便性状需用Bristol量表记录,DNA提取环节需严格记录阴性对照与内参等10项参数。
多维临床终点体系
强制要求将微生物组组成、多样性及细菌载量列为核心终点,并推荐纳入宿主免疫标志物及患者报告结局量表。
领域挑战与未来展望
当前生物信息学分析流程的异质性仍是核心瓶颈,未来需通过跨学科协作进一步统一宏基因组数据处理规范。
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17
南京医大陈云/胡楚鹏等Cell子刊:瘤内蜡样芽孢杆菌重塑淋巴微环境,助力肝癌免疫治疗
肝细胞癌蜡样芽孢杆菌肿瘤菌群
IF: 56.1
Intratumoral Bacillus cereus orchestrates stem-like lymphoid niches to potentiate immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
胡楚鹏, Wenhua You
Yedi Huang, Yuhan Zhang, Jingying Lu, Jianzhou Yuan, Ruimin Shan, Songmao Li, Ran Li, Qing Li, Minghao Li, Yongqiang Gao
滕皋军, 陈云
Article|2026-08-17
10.1016/j.ccell.2026.07.016
背景与设计
针对肝癌免疫治疗响应异质性问题,利用空间多组学、临床样本及小鼠模型,揭示决定免疫治疗疗效的特定免疫微环境。
核心发现与意义
瘤内蜡样芽孢杆菌通过诱导内皮细胞释放IL-33,驱动特定2型固有淋巴细胞(ILC2)代谢表观重编程,促进干细胞样淋巴样微环境(SLN)形成并维持T细胞干性,为提升肝癌免疫治疗效能提供了新靶点。
生态位鉴定
通过空间多组学分析肝细胞癌患者样本,鉴定出与PD-1/PD-L1疗效相关的SLN,由CD70+ ILC2与TCF1+ 祖细胞样耗竭性T细胞(Tpex)共定位构成。
细菌调控机制
16S rRNA测序及荧光原位杂交数据提示,蜡样芽孢杆菌优先定植于SLN区域,活菌给药显著增加小鼠肝癌模型中SLN丰度并抑制肿瘤进展。
分子通路
蜡样芽孢杆菌分泌酶PI-PLC切割内皮细胞CD55,激活补体-Ca2+-钙蛋白酶信号,触发内皮细胞释放IL-33。
代谢表观重编程
IL-33信号通过促进谷氨酰胺代谢、降低α-酮戊二酸/琥珀酸比率、增加H3K4me3修饰,上调ILC2的CD70和淋巴毒素(LTα/β)表达,从而维持Tpex细胞干性并促进SLN形成。
治疗策略
PI-PLC与抗PD-L1联合治疗在肝癌小鼠模型中具有协同抗肿瘤作用。
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18
康奈尔大学郭春君团队NBT:非模式肠道梭菌遗传操作工具,精准调控代谢物
微生物组编辑肠道菌群梭菌遗传工程
IF: 44.5
Transferable genetic toolsets for nonmodel gut Clostridia enable in vivo reversible control of metabolite production
Ting-Ting Li, Xi Chen
Fangzhao Wang, Yuelin Angelina Tang, Marissa A R Sim, Leyi Xiao, 金文兵, Huiqing Shi, Jiayan Yoshii Ma, Xiaoyu Yang, Yaping Liu, Matthew T Sorbara
郭春君
Article|2026-08-25
10.1038/s41587-026-03269-z
背景与核心设计
针对非模式肠道梭菌缺乏通用遗传工具的问题,整合宏转录组数据与NanoLuc报告系统筛选强启动子,并开发了跨物种兼容的可诱导表达与CRISPR-Cas编辑平台。
总体科学意义
模块化遗传工具集实现了在体外及定植小鼠肠道内对多种梭菌代谢通路的精准可逆调控,为因果解析宿主-菌群互作机制奠定了方法学基础。
启动子筛选
宏转录组分析结合荧光素酶筛选鉴定出以fdx为代表的强组成型启动子,其截短核心序列在多种梭菌中维持显著的高转录活性。
可诱导系统
基于脱水四环素构建的可诱导启动子系统在17株非模式梭菌中实现了1,500至10,000倍动态范围的基因表达调控,并在小鼠肠道内表现出严密的可逆性。
基因编辑工具
将可诱导系统与微型Cas核酸酶结合构建的双质粒CRISPR-Cas编辑平台,成功驱动了12株非模式梭菌的靶向基因敲除。
代谢物可逆调控
在无菌小鼠及复杂菌群移植模型中,脱水四环素剂量依赖性地驱动工程化Enterocloster bolteae和Dorea ammoniilytica可逆地产生三甲胺与脱氧胆酸。
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19
复旦郑琰/孙仲汉等iMeta:孕早期肠道菌群异常,如何推高妊娠糖尿病风险?
妊娠期糖尿病肠道菌群脂质代谢妊娠早期
IF: 44.4
A gut microbiome-lipid axis in early pregnancy is associated with metabolic dysregulation and diabetes risk
孙仲汉
Chang He, Xiaonan Ma, Ping Wu, Tianlei Wang, Jiaying Yuan, 蒲彦霓, Xiaofeng Zhou, Zhendong Mei, Huiling Song, Yetong Wang, Haiyan Yue, 付元庆, 郑钜圣, 潘安
Da Chen, 洪尚宇, 潘雄飞, 郑琰
Article|2026-08-10|
OA
10.1002/imt2.70166
研究背景与设计
基于784例孕早期孕妇巢式队列,整合宏基因组与靶向脂质组学,解析肠道菌群与宿主脂质互作对妊娠期糖尿病(GDM)风险的影响。
核心发现与意义
鉴定出一条连接肠道菌群与宿主代谢失调的糖鞘脂代谢轴,为GDM早期风险分层与干预提供了全新的多组学生物标志物与靶点。
微生物群落特征
宏基因组显示,GDM高风险孕妇孕早期肠道菌群α多样性显著降低,包含Ruminococcus bicirculans在内的26个菌种及脂肪酸合成通路发生显著改变。
脂质组中介效应
跨组学及中介分析揭示,血浆脂质组变异介导了菌群与GDM的关联,其中二己糖基神经酰胺(DHC)24:1是核心潜在介导物。
体内外功能验证
厌氧培养证实R. bicirculans可生成乳糖神经酰胺(LacCer)24:1;在糖尿病小鼠模型中,定植该菌或补充LacCer 24:1均显著改善胰岛素耐量。
细胞分子机制
LacCer 24:1预处理显著增强原代肝细胞在胰岛素刺激下的AKT Thr308/Ser473磷酸化,从而调控胰岛素信号传导。
临床预测价值
联合孕早期微生物群与脂质组学特征构建的综合风险评分模型,显著提升了对GDM发病风险的预测效能。
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20
浙大柳志刚团队iMeta综述:肠道微生物组,被忽视的"器官"
肠道微生物组生物活性代谢物宿主-微...
IF: 44.4
The gut microbiome organ
Yang Bi
Weibin Song, Maria Glymenaki, Jie Hu, Xiru Li, Heng Huang, Yousong Peng, Shuaishuai Ni, Ornuma Haonon, Zhu Liu, Krai Daowtak, 申小涛, Huadong Peng, Jutarop Phetcharaburanin, Huiru Tang, Yulan Wang, Jia V Li
江米足, Nick Powell, 钟文泽, Elaine Holmes, 鲜于运雷, 柳志刚
Review|2026-08-21|
OA
10.1002/imt2.70144
器官样框架重构
肠道微生物组具备空间异质性、代谢活性与系统调控潜能,已成为整合宿主生理网络的核心器官样系统
空间与生态架构
沿胃肠道纵轴与横轴形成高度分化的微生态位,受宿主氧梯度、黏液层及分泌型IgA塑造,其区室化破坏驱动疾病进展
代谢功能模块化
碳水化合物发酵与胆汁酸转化等核心模块生成短链脂肪酸及次级胆汁酸等关键信号分子,介导宿主-微生物共代谢
系统性信号调控
微生物代谢物作为类内分泌信使,通过结合宿主受体系统性调节能量稳态、免疫平衡及肠-脑轴神经递质传导
多组学与精准干预
整合多组学技术正推动研究从分类学转向功能回路解析,靶向特定微生物功能模块的工程化活体生物药成为精准医学新路径
领域挑战与展望
未来亟需建立基于纵向队列的健康微生物组功能基准,克服跨队列技术异质性,以实现从相关性向因果机制的临床转化。
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21
Nature子刊:调控肠道菌群,让纳米抗癌药直达肿瘤
肠道微生物组胆汁酸纳米药物库普弗细胞
IF: 38
A transferable gut microbiota-bile acid pathway programs nanomedicine pharmacokinetics and therapeutic response
Mengyu Chang, Yifan Wang, JongHoon Ha, Zoey R Neale, Nadim J Ajami
Laurence P Diggs, Ansel P Nalin, Yifan Ma, Shiyan Dong, Yasmine M Hoballah, Abderrahman Day, Seong Dong Jeong, Annette Wu, Benjamin R Schrank, Jared L Edwards, Tianyu Wang, Xiaotian Wang, Yen-Tzu Chang, Chaoyang Tang, Anthony J Lim, Michelle Najarro Torres, Weiye Deng, Timothy Peitsch, Maurice Dufilho, Sangeeta Goswami
Jennifer A Wargo, Wen Jiang, Yon Son Betty Kim
Article|2026-07-31
10.1038/s41563-026-02690-8
背景与核心设计
针对纳米药物易被肝脏清除的瓶颈,利用无菌小鼠、抗生素扰动及粪菌移植联合多组学技术解析肠道菌群对库普弗细胞吞噬功能的调控机制。
总体科学意义
鉴定出一条可转移的肠道菌群-胆汁酸-库普弗细胞代谢免疫轴,揭示了宿主内源性微生物状态决定纳米药物药代动力学及肿瘤递送效率的全新范式。
菌群依赖性清除
无菌小鼠肝脏CD11b+吞噬细胞对纳米颗粒的摄取显著低于特定无病原体小鼠,且该缺陷可通过粪菌移植完全逆转,证实微生物定植驱动肝脏基础吞噬状态。
代谢重编程机制
甲硝唑靶向清除厌氧菌导致肠源性胆酸与脱氧胆酸显著降低,该代谢转变驱动库普弗细胞由高吞噬的Marco高表达表型向静息表型偏移。
药代与疗效提升
甲硝唑预处理显著抑制肝脏对脂质体阿霉素的清除,使其表观消除半衰期从32.92小时延长至70.84小时,从而增强肿瘤蓄积与抑瘤效力。
表型可转移性
将甲硝唑扰动后的粪菌移植给无菌小鼠,足以传递低肝脏清除表型并提升抗肿瘤疗效,提示微生物组工程可作为优化药物递送的干预靶点。
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22
Nature子刊:肠菌代谢物变身纳米前药,重塑T细胞抗癌力
肠道微生物代谢物3,4-二羟基苯甲酸T...
IF: 37.5
Oral nano-delivery of a gut microbial metabolite enhances T cell stemness for cancer immunotherapy
韩凯, Young Seok Cho
Mariko Takahashi, Xingwu Zhou, Ting Chen, Kim Hutchings, Yuesong Wu, Youngseo Na, Fang Xie, Julia Crowther, Jinmei Wu, Jin Xu, Chuan Lee, Himani Jasewicz, Yujin Kim, Minal Nenwani, Olamide Animasahun, Fulei Wuchu, Anthony Andren, Harrison K A Wong, Emma Camp, Ziye Wan
韩凯, Young Seok Cho, James J Moon
Article|2026-08-10
10.1038/s41565-026-02235-9
背景与研究设计
针对肠道菌群代谢物成药性差及免疫调控机制不明的问题,体外筛选代谢物并结合纳米技术开发了口服前药配方。
核心发现与意义
3,4-二羟基苯甲酸通过代谢重编程驱动CD8+ T细胞干性,其口服纳米乳液显著放大了抗肿瘤免疫,为微生物代谢物转化为免疫疗法提供了通用策略。
干细胞样分化
3,4-二羟基苯甲酸体外处理显著增加中央记忆T细胞及Tcf1+与Foxo1+细胞比例,并维持白细胞介素-2撤除后的细胞存活。
代谢重编程机制
3,4-二羟基苯甲酸与还原型谷胱甘肽形成加合物以耗竭胞内水平,通过抑制Akt-mTORC1-Myc通路阻断糖酵解,驱动T细胞向代谢静息状态分化。
前药药代动力学
3,4-二羟基苯甲酸前药纳米乳液口服后,血浆半衰期延长至4.1小时且生物利用度较游离药物提升9.72倍。
体内抗肿瘤免疫
口服前药联合抗PD-1抗体在多种小鼠肿瘤模型中显著扩增微环境及引流淋巴结内的抗原特异性干细胞样CD8+ T细胞,并克服了免疫耐药性。
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23
Cell Metab:同样减重10%,生酮饮食改善代谢效果翻倍
肥胖体重减轻宏量营养素生酮饮食
IF: 37
Effect of diet macronutrient content on the cardiometabolic response to weight loss: A randomized clinical trial
Max C Petersen
Gordon I Smith, Sarah Farabi, Hector Palacios, Mahalakshmi Shankaran, Marc K. Hellerstein, Bruce W Patterson
Samuel Klein
Article|2026-08-27|
OA
10.1016/j.cmet.2026.07.020
研究背景与设计
针对代谢不健康型肥胖患者减重后心血管代谢获益是否受宏量营养素影响的问题,对42例匹配减重约10%的成人开展三臂随机对照试验,分别实施极低碳水化合物生酮、地中海或极低脂植物性饮食干预。
核心发现与意义
在同等减重10%的条件下,极低碳水化合物生酮饮食较其他两种饮食更显著改善肝脏代谢功能,提示宏量营养素构成是独立于热量限制的关键干预维度。
胰岛素敏感性
高胰岛素-正葡萄糖钳夹实验结合同位素示踪显示,三种饮食均驱动骨骼肌胰岛素敏感性提升约50%,但极低碳水化合物生酮饮食导致肝脏胰岛素敏感性提升幅度达其他两组的2至3倍。
肝脏脂质代谢
磁共振成像及代谢流分析证实,极低碳水化合物生酮饮食导致肝内甘油三酯显著降低67%(高于其他两组的45%),并伴随肝脏从头脂肪生成的最显著下降。
全身糖代谢
极低碳水化合物生酮饮食驱动24小时血浆葡萄糖和胰岛素曲线下面积最大幅度的下降,并导致50%的患者实现糖尿病前期缓解,显著高于地中海饮食的29%和极低脂饮食的7%。
心血管风险
三组在低密度脂蛋白胆固醇及载脂蛋白B的变化上无显著差异,证实极低碳水化合物生酮饮食在不增加致动脉粥样硬化脂质风险的前提下,特异性优化了肝脏及糖代谢指标。
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24
Immunity:肠道代谢物重塑肿瘤微环境,胆汁酸如何操控免疫周期?(综述)
胆汁酸肿瘤微环境免疫代谢肠道菌群
IF: 30.6
Bile acids in cancer: From metabolism to immunomodulation
Qian Fang
Kai Markus Schneider
Review|2026-07-29
10.1016/j.immuni.2026.07.003
三维调控框架
胆汁酸连接宿主代谢、肠道微生物组与肿瘤免疫,其免疫效应由化学性质、细胞感应系统和解剖暴露模式共同决定。
胆汁酸特性
初级或次级来源、游离或结合状态及疏水性共同塑造胆汁酸活性;结合型初级胆汁酸蓄积可伴随CD8+ T细胞氧化应激和耗竭,而熊去氧胆酸可拮抗细胞应激。
细胞感应信号
FXR、TGR5、VDR和RORγt等受体介导细胞特异性应答;其中,FXR激活可上调LAG3表达,TGR5则参与成纤维细胞和髓系细胞的趋化因子分泌调控。
区室暴露差异
胆道和肠道的局部高浓度暴露、门脉输送、异位反流及全身循环低浓度暴露,构成胆汁酸的空间梯度,并影响不同肿瘤中免疫细胞的可及性和应答。
免疫周期影响
胆汁酸可作用于抗原呈递、T细胞活化与杀伤及髓系细胞网络等多个环节;例如,脱氧胆酸可通过PMCA–NFAT2轴削弱T细胞钙信号与效应功能。
微生物参与调节
肠道菌群通过bai操纵子、胆盐水解酶等途径扩展胆汁酸化学空间,并可能经肠肝循环影响肝胆和结肠等区室的免疫抑制微环境。
转化方向与挑战
优化胆汁酸池、编辑微生物胆汁酸代谢、调控受体信号及开展区室匹配递送,均是潜在干预方向;其疗效、毒性剂量边界和暴露时序仍需在人体研究中验证。
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25
Immunity:找不到"补给站"就难以存活,G蛋白信号如何决定肠道T细胞命运?
肠道上皮内淋巴细胞CD8阳性T淋巴细胞...
IF: 30.6
GPCR-Gα13 signaling regulates survival of intestinal intraepithelial CD8+ lymphocytes through migration to cytokine-rich niches
Zachary M Earley
Anshul Rao, Longhui Qiu, Konrad Knöpper, Fanglue Peng, Norihide Jo, Ananya Krishnapura, Wioletta Lisicka, Hanna Taglinao, Jinping An, Ying Xu, Li V Yang, Dan Liu, Mark R Looney
Zachary M Earley, Jason G Cyster
Article|2026-08-17
10.1016/j.immuni.2026.07.021
研究背景与设计
针对肠道上皮内淋巴细胞(IEL)稳态调控机制不明的问题,利用条件性基因敲除小鼠、活体成像及CRISPR筛选探究了G蛋白偶联受体信号的作用。
核心发现与意义
Gα13-Arhgef1信号驱动CD8+ IEL向绒毛尖端迁移并定位于富含TGF-β与IL-15的生态位,从而决定其存活与组织驻留记忆功能。
迁移与定位缺陷
Gna13或Arhgef1缺失导致IEL数量减少约100倍,活体成像证实突变细胞基础迁移能力显著下降并滞留于绒毛基部。
细胞因子依赖机制
空间定位缺陷伴随TGF-β与IL-15通路活性降低及凋亡增加,外源性补充活化TGF-β或IL-15复合物可部分挽救突变细胞的存活。
上游受体鉴定
体内CRISPR筛选鉴定出GPR132为关键的Gα13偶联受体,其配体溶血磷脂酰胆碱介导了IEL迁移且Gpr132缺失重现了IEL减少表型。
病理生理后果
T细胞特异性Gna13缺失导致肠道屏障受损,加剧了右旋糖酐硫酸钠诱导的结肠炎,并显著削弱了对直肠原位肿瘤的免疫监视。
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26
Immunity:肠道炎症的胞质刹车,揭秘非编码RNA的免疫调控
炎症性肠病长链非编码RNA调节性T淋巴...
IF: 30.6
An inflammatory bowel disease-linked lncRNA suppresses transcription factor T-BET expression in T cells to limit intestinal inflammation
Ruxiao Yang-Fischer
Alyssa Shearer, Jingyao Zhao, Theodore Nelson, Izortze Santin, Felipe Batista Leão, Ainara Castellanos-Rubio, Govind Bhagat, Uttiya Basu
Sankar Ghosh
Article|2026-08-20
10.1016/j.immuni.2026.07.019
背景与核心设计
针对炎症性肠病非编码遗传风险位点功能不明的问题,利用小鼠结肠炎模型及多组学技术鉴定了保守的长链非编码RNA lnc15 的免疫调控功能。
总体机制与意义
lnc15 作为肠道炎症的胞质制动器,通过靶向降解 Tbx21 mRNA 限制 T-BET 驱动的炎症程序,为连接非编码遗传变异与黏膜免疫稳态提供了新机制。
表达与上游调控
lnc15 在调节性T细胞中高表达,其转录受 FOXP3 和 c-Rel 激活,而降解由依赖 Exosc3 的 RNA 外泌体介导。
分子作用机制
体外生化实验证实,定位于胞质的 lnc15 直接招募 CCR4-NOT 脱腺苷酸酶复合物至 Tbx21 mRNA,驱动其脱腺苷化与降解。
细胞功能表型
lnc15 缺失导致 CD4+ T 细胞中 Tbx21 表达显著升高约5倍,驱动效应T细胞致病性增强并削弱其抑制功能。
临床相关性
携带风险等位基因 rs194749-C 的患者结肠中 lnc15 表达显著降低,该变异改变了 RNA 二级结构并驱动其对降解的敏感性增加。
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27
30项临床试验揭秘,不同膳食纤维对IBS疗效迥异
肠易激综合征膳食纤维车前子麦麸
IF: 29.7
Fiber supplementation in irritable bowel syndrome: a systematic review and meta-analysis of randomized controlled trials
Heidi M Staudacher
Valeria Rucco, Sara Mancell, Eirini Dimidi
Kevin Whelan
Systematic Review & Meta-analysis|2026-08-14|
OA
10.1053/j.gastro.2026.07.027
背景与设计
针对肠易激综合征纤维补充疗法证据陈旧的问题,系统评价并荟萃分析了30项随机对照试验中1904例患者的临床数据。
总体概述
纤维补充剂显著提升肠易激综合征患者的临床应答率,且疗效具有高度的纤维类型特异性,为临床精准营养干预提供了循证依据。
临床应答
荟萃分析证实,纤维干预导致患者总体临床应答率显著增加(相对危险度为1.21),其中洋车前子亚组的获益最为显著(相对危险度为1.53)。
症状改善
连续性变量分析提示,纤维总体对胃肠道整体症状及单一维度无显著影响,但β-半乳寡糖亚组显著改善了整体症状评分。
无效干预
小麦麸干预未能显著提升临床应答率或改善特定症状,但亦未导致胃肠道不良反应加重。
安全性评价
各干预组间的不良事件发生率无显著差异,提示各类纤维补充剂在肠易激综合征患者中具有良好的临床耐受性。
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28
复旦中山医院董玲团队Nature子刊:低蛋白饮食重塑肠菌,激活巨噬细胞抗胰腺癌
蛋白质限制饮食胰腺导管腺癌抗肿瘤免疫
IF: 28
Low-protein diet enhances antitumor immunity in pancreatic cancer through microbiota-derived UDP-galactose
Yueying Chen, Fulin Nian, 吴盛迪, Tianli Yuan, Yifan Ma
Junyang Cao, Yuxiao Zhang, Wenfeng Liu, 唐文清, Danying Zhang, Zi Li, Wei Lu, Fengwanni Wang, Xiulong Xia, 刘占举, 张思
沈锡中, 胡小明, 董玲
Article|2026-08-17
10.1038/s43018-026-01222-2
研究背景与设计
针对胰腺导管腺癌(PDAC)免疫治疗抵抗难题,本研究采用雄性小鼠原位PDAC模型与PDAC患者队列,探究低蛋白饮食(LPD)通过菌群-代谢轴调控抗肿瘤免疫的机制。
核心发现与意义
LPD驱动肠道菌群中球状布劳特氏菌(B. coccoides)富集,其代谢产物UDP-半乳糖激活巨噬细胞P2Y14R–STAT1轴,诱导免疫刺激型肿瘤相关巨噬细胞(TAM),从而增强CD8+T细胞应答并协同提升抗PD1疗效。
菌群代谢机制
LPD显著增加粪便与肿瘤内球状布劳特氏菌丰度及UDP-半乳糖水平;同位素示踪证实球状布劳特氏菌可直接利用半乳糖合成UDP-半乳糖。
TAM重编程
UDP-半乳糖通过P2Y14R受体上调STAT1表达与磷酸化,驱动TAM向高MHC II、CD86及IFNγ分泌表型转化。
免疫执行通路
LPD或UDP-半乳糖处理的TAM显著增强CD8+T细胞增殖与IFNγ产生;该效应依赖P2Y14R–STAT1信号,敲低P2ry14可完全阻断。
临床转化价值
PDAC患者粪便球状布劳特氏菌丰度与血清UDP-半乳糖浓度均与早期分期及较好生存显著相关。
联合治疗效果
LPD、球状布劳特氏菌活菌或UDP-半乳糖单用即可抑制PDAC,与抗PD1联用进一步延长生存期。
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29
Nature子刊:肠道菌群的代谢信使,短链脂肪酸如何影响全身健康?(综述)
短链脂肪酸肠道菌群交叉喂养
IF: 27.5
Short-chain fatty acids
Aygul Dagbasi
Mingzhu Cai, Aanya Hirdaramani, Aylin Hanyaloglu, Douglas J Morrison
Gary Frost
Review|2026-07-29
10.1038/s42255-026-01579-9
菌群代谢来源
膳食纤维和抗性淀粉等底物经肠道菌群发酵,产生乙酸、丙酸和丁酸等短链脂肪酸(SCFAs);其生成依赖菌群间的交叉喂养网络,并在肠腔至肝脏间呈空间梯度分布。
信号调控机制
SCFAs可激活G蛋白偶联受体FFAR2、FFAR3和GPR109A,也可抑制组蛋白去乙酰化酶(HDAC),从受体信号与表观遗传两个层面调控宿主代谢和免疫稳态。
肠道屏障与免疫
丁酸是结肠细胞的重要能量来源,并可通过表观遗传调控增强肠道屏障、促进调节性T细胞分化;SCFAs还参与肠神经和肠内分泌信号调节,影响GLP-1和PYY等激素释放。
多器官代谢作用
丙酸经门静脉进入肝脏后可抑制脂质生成,乙酸进入体循环后影响脂肪组织脂解和下丘脑食欲中枢,提示SCFAs参与糖脂代谢与能量平衡的跨器官调控。
临床转化边界
靶向结肠递送SCFAs及受体药理调控,为肥胖和代谢性疾病干预提供了方向;但现有人体研究数量有限且结果存在异质性,仍需进一步明确不同递送策略和受体通路的实际获益。
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30
湘雅二院肖扬团队Nature子刊:免疫与代谢的博弈,肠道cGAS或是肥胖元凶
cGAS-STING通路肥胖肠道菌群
IF: 27.5
Intestinal cGAS–STING–IFN signalling promotes obesity by downregulating microbiota-derived IAA in male mice
Jiangming Deng, Wen Meng
Yuanqin Yang, Ting Xiao, Zhangliu Jin, Jing Wang, Qingxin Li, Lingxiang Xie, 胡婧宜, Rong Song, Yibo Hu, Yi Chu, Qing Li, Ping Jin, Zheng Wang, Irene Xy Wu
刘峰, 肖扬
Article|2026-08-19
10.1038/s42255-026-01562-4
研究背景与设计
肠道环状GMP–AMP合酶(cGAS)如何影响代谢尚不清楚,研究整合人类回肠活检、雄性高脂饮食(HFD)小鼠及肠上皮特异性Cgas敲除(CgasIKO)小鼠开展验证。
总体概述
肠道上皮cGAS–干扰素基因刺激蛋白(STING)–I型干扰素轴通过抑制鼠乳杆菌及其代谢物吲哚-3-乙酸(IAA),削弱脂肪组织产热,界定了连接肠道先天免疫、菌群代谢与饮食性肥胖的关键调控通路。
激活特征与表型
肥胖人群和HFD小鼠回肠上皮cGAS表达升高并伴随I型干扰素α和β上调,敲除上皮Cgas则增强能量消耗和脂肪产热,抵抗肥胖及代谢紊乱。
菌群代谢机制
CgasIKO小鼠肠道鼠乳杆菌增多,粪便和血清IAA水平升高,IAA激活脂肪细胞蛋白激酶A(PKA)–cAMP反应元件结合蛋白(CREB)通路并上调UCP1,从而促进产热。
因果链条验证
外源IFNα逆转CgasIKO小鼠的代谢获益并降低鼠乳杆菌丰度和IAA水平,广谱抗生素处理则完全消除其抗肥胖效应。
临床前干预潜力
口服或静脉给予IAA可减轻野生型HFD小鼠的肥胖、肝脂肪变及糖脂代谢紊乱,支持其作为抗肥胖候选干预物的临床前潜力。
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31
Nature子刊:克罗恩病治疗新靶点,基质细胞的"表观遗传记忆"
克罗恩病炎症性成纤维细胞收缩性基质...
IF: 26.5
Epigenetic modulation of stromal cell states underpins pathological tissue niches in Crohn’s disease
Simon Koplev
Osheen Sharma, Simon Woelfel, Ni Huang, Mathilde Pohin, Adrian Feile, Maria Warschinke, Mikel Rezola Artero, Sharujan Suthakaran, Ioannis Sarropoulos, J Patrick Pett, Julia Nyman, Tom Thomas, Duy Pham, Bin Li, Moustafa Attar, Julia Pakpoor, Kate Milosevic-Hutton, Alistair Easton, Matt Butler, James Dunford
Matthias Friedrich
Article|2026-08-12
10.1038/s41590-026-02617-0
背景与设计
针对克罗恩病(CD)中基质细胞状态起源与表型稳定性未知的问题,利用单细胞空间转录组、RNA测序及ATAC测序,绘制了人类全层CD肠道组织中基质细胞状态的图谱。
核心发现与意义
炎症性成纤维细胞(IF)定植于免疫细胞密集的黏膜溃疡区,其状态由多细胞因子暴露驱动并受表观遗传调控,为CD的治疗提供了基于表观修饰的潜在干预靶点。
空间分布与特征
空间转录组及单细胞分析显示,高表达COL7A1的IF富集于黏膜溃疡区,而高表达GREM1和TNC的收缩性基质细胞(CS)则主导免疫细胞较少的黏膜下纤维化区,两者具有截然不同的开放染色质构型。
状态诱导与维持
体外实验证实,IL-1β、OSM、IL-17A和TNF的联合刺激驱动肠基质细胞向IF状态转变,该状态由GLI3、TWIST1等转录因子稳定维持,且在撤除细胞因子后不会自发逆转。
表观干预效果
组蛋白去乙酰化酶抑制剂belinostat显著降低了IF中GLI3和TWIST1位点的染色质可及性,导致IF分泌CXCL5等趋化因子的能力显著下降。
功能验证
在肠芯片模型中,经belinostat处理的IF条件培养基显著削弱了中性粒细胞的跨上皮迁移及激活,提示表观遗传干预可有效破坏IF的病理状态。
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32
Nature子刊:揭秘肠道派氏结微环境,M细胞如何调控固有免疫?
派尔氏结M细胞白细胞介素-22上皮生态位
IF: 26.5
Peyer's patch M cells organize an epithelial niche that sustains group 3 innate lymphoid cells and IL-22
Wang H J Cao
Yue You, Nancy Wang, M Zeeshan Chaudhry, Huiyang Yu, Peter T Bell, Ellesandra C Noye, Renae Denman, Byungchul Lee, Abbey Waddington, Junpeng Ye, Jaring Schreuder, Qiutong Huang, Julie Tellier, Sophie Curio, James Santiago, Daniela Amann-Zalcenstein, Nicolas Jacquelot, Peter Hickey, Stephen L Nutt, Cyril Seillet
Gabrielle T Belz
Article|2026-08-14|
OA
10.1038/s41590-026-02606-3
研究背景与设计
针对派氏结M细胞在先天免疫微环境组织中的作用未明问题,整合SPI-B报告小鼠、单细胞转录组及遗传敲除模型解析了肠道上皮细胞网络。
核心发现与意义
派氏结M细胞构建了空间限定的上皮-ILC3生态位,驱动ILC3定位、增殖及IL-22产生,将M细胞功能从抗原转运拓展至先天免疫稳态维持。
M细胞异质性
单细胞测序揭示M细胞包含富集抗原呈递、增殖黏附及组织修复基因的三个亚群,且其转录程序伴随组织定位与病原体感染发生特异性重塑。
ILC3稳态维持
骨髓嵌合及基因敲除模型证实,上皮源性而非造血源性Spib缺失导致派氏结ILC3数量显著减少、穹顶下定位缺失及IL-22产量显著降低。
空间定位机制
Spib缺失导致上皮Ccl20表达显著下降,而Ccr6敲除小鼠中ILC3无法在穹顶下富集,证实CCL20-CCR6趋化轴决定ILC3的空间归巢。
丰度调控机制
尽管ILC3来源的RANKL对其增殖具有抑制作用,但上皮SPI-B依赖的RANK-RANKL双向信号通路在建立支持ILC3扩增的组织生态位中发挥主导驱动作用。
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33
Nature子刊:肠菌毒素如何篡改基因,揭秘年轻化肠癌的幕后黑手
结直肠癌大肠杆菌colibactin突变特征
IF: 25.5
Prevalence and chronology of colibactin-associated mutational processes and their microbiome spectra in Japanese colorectal cancer
Satoshi Shiba, Shinichi Yachida, Sayaka Mizutani, Yasushi Totoki, Hiromi Nakamura
Natsuko Hama, Norikatsu Miyoshi, Yasuhiko Arai, Mihoko Saito-Adachi, Hirokazu Kimura, Yoshito Hayashi, Hiroyuki Takamaru, Koji Tanaka, Rie Hayashi, Hirofumi Rokutan, Shoko Ikuta, Yukihide Kanemitsu, Yuichiro Doki, Hidetoshi Eguchi, Satoshi Hattori, Yutaka Saito
Shinichi Yachida, Takuji Yamada, Tatsuhiro Shibata
Article|2026-08-10
10.1038/s41588-026-02692-x
研究背景与设计
针对日本早发型结直肠癌发病率上升现象,整合600例日本人群的肿瘤全基因组、转录组及粪便宏基因组数据,利用人工智能构建了基于肠道菌群的疾病分型。
总体核心发现
细菌毒素colibactin暴露是驱动日本结直肠癌高发的重要早期克隆事件,其特异性突变印记与特定微生物亚型及免疫抑制微环境显著相关。
微生物亚型特征
宏基因组数据将结直肠癌分为四类亚型,其中缺乏具核梭杆菌的亚型3患者发病年龄显著更年轻,且其拷贝数中性杂合缺失事件发生更早。
突变印记富集
colibactin相关的突变印记SBS88和ID18在44.8%的非高突变患者中富集,且在1965年后出生的年轻队列中发生率显著攀升。
驱动基因突变
突变特征分析证实,colibactin暴露直接导致了APC基因内含子8剪接位点及BRAF D594G等关键驱动基因的热点突变。
免疫微环境重塑
转录组及免疫组化分析提示,亚型3肿瘤中调节性T细胞浸润显著增加,呈现出高突变负荷与低炎症表达的免疫冷表型。
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34
中国科学院北京基因组所张维绮团队Nature子刊:锁定抗衰老肠道益生菌
假小链双歧杆菌益生菌5-氨基戊酸甜菜碱
IF: 25
A geroprotective probiotic and its functional metabolite counteract inflammaging to extend healthspan
Xiaoyong Lu, Jun Ping, Zichu Han, Shuo Zhang, Lixiao Liu, 范艳玲, 李嘉明
Muzhao Xiong, Xiaoyan Sun, Peng Yang, Kejie Zheng, Zheng-Kai Wang, Jiale Ping, Yu Xiong, Yuesheng Zuo, Min Zhang, 李静宜, Qi Wu, Qiaoran Wang, Dan-Dan Gao, Beier Jiang, Shuhui Sun, Shuai Ma, Si Wang
曲静, 杨运桂, 张峰, 刘光慧, 张维绮
Article|2026-08-25
10.1038/s43587-026-01181-4
研究背景与设计
基于1,740例中国健康人群多组学队列与自然衰老小鼠模型,解析肠型特异性菌群衰老轨迹,并构建微生物衰老时钟MicroAge。
核心发现与意义
假小链双歧杆菌及其代谢物5-氨基戊酸甜菜碱(5-AVAB)可系统性对抗炎性衰老、延长健康寿命,为基于微生物组的抗衰老干预提供了全新的靶点和机制。
肠型与衰老轨迹
普雷沃菌主导的肠型与加速衰老相关,伴随心血管代谢风险升高、系统性炎症相关。
候选菌鉴定
构建基于微生物的衰老时钟MicroAge,鉴定出假小链双歧杆菌是在不同性别和多个队列中随年龄一致减少的候选抗衰老菌种。
小鼠干预验证
在自然衰老的小鼠模型中,口服补充该菌种能够恢复肠道稳态、改善认知和运动功能、减轻多器官的炎性衰老,从而延长健康寿命。
关键代谢物
5-AVAB是该菌衍生的关键效应代谢物,其在人体内随年龄生理性下降;通过体外细胞衰老模型和体内自然衰老小鼠模型,证实补充5-AVAB可部分重现假小链双歧杆菌干预的系统性抗衰老益处。
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35
陈亮/耿杰杰等GUT:肠道菌群失调如何诱发全身炎症?
肠道菌群失调鞭毛蛋白系统性炎症长新冠
IF: 24.6
Intestinal flagellin drives multisystem inflammation through TLR5-IL-15-ARA axis
耿杰杰
Yu-Meng Zhu, Siyu Chen, Xiyu Song, Qiang Huang, Hongyan Ma, Hongjiao Liu, Xu Yang, Xiang Zhang, Jinxin Zhang, Lingjie Luo, Yanwei Wu, Shuhui Dai, Jie Cheng, Cui Zhang
陈亮
Article|2026-08-19|
OA
10.1136/gutjnl-2026-339112
研究背景与设计
针对多种系统性炎症疾病共有的多器官表型,通过宏基因组、单细胞转录组与代谢组联合分析鉴定肠道鞭毛菌扩张,并利用共感染小鼠模型解析机制。
核心发现与意义
肠道鞭毛蛋白驱动TLR5+中性粒细胞形成胞外诱捕网并释放IL-15,继而激活巨噬细胞合成花生四烯酸及促炎类花生酸,构成肠源性系统炎症轴。
鞭毛菌共扩增特征
宏基因组显示四种炎症疾病患者粪便鞭毛组装通路显著富集,且血浆鞭毛蛋白水平显著升高,提示其为跨疾病肠道生态失调标志。
中性粒细胞分泌机制
长新冠患者中性粒细胞高表达TLR5与IL-15,鞭毛蛋白刺激伴随胞外诱捕网形成及IL-15与CitH3共定位,且对应抑制剂显著阻断IL-15释放。
巨噬细胞代谢重编程
巨噬细胞高表达IL-15受体及代谢酶;IL-15刺激M1巨噬细胞上调PLA2g7等合成,且长新冠患者血浆花生四烯酸及类花生酸显著升高。
因果验证与干预
共感染小鼠再现肺纤维化与肠淋巴聚集;髓系Pla2g7或中性粒细胞Il15敲除、PLA2g7抑制剂或庆大霉素均显著缓解肺纤维化,且庆大霉素特异性改善肠炎。
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36
北医三院李蓉/李萌等Cell子刊:格氏乳杆菌后生元助力改善女性生殖衰老
格氏乳杆菌益生菌后生元胞外多糖
IF: 23.2
Lactobacillus gasseri postbiotics ameliorate age-related decline in endometrial receptivity
李萌, 李商琪, 郑丹蕾
Baoying Liao, Hongjuan Niu, Yue Wang, Xiyao Liu
潘恒, 于洋, 周平, 李蓉
Article|2026-08-06
10.1016/j.chom.2026.06.018
背景与设计
针对高龄女性子宫内膜衰老导致生育力下降的问题,利用人类横断面队列、菌株功能筛选及小鼠模型评估了子宫内膜微生物组重塑的干预潜力。
核心发现与意义
随生殖年龄增长而流失的格氏乳杆菌及其外多糖通过抑制Hippo-YAP信号通路缓解子宫内膜衰老并恢复容受性,为生殖衰老提供了潜在的后生元干预策略。
临床关联
临床队列测序证实,子宫内膜有益乳杆菌丰度随年龄增长而显著下降,且该丰度降低与胚胎着床结局不佳及容受性标志物表达减少相关。
功能筛选
体外功能筛选证实,格氏乳杆菌在多种生殖道分离株中表现出最强的抗氧化、抗炎与上皮黏附活性,且其外多糖(EPS)产量最高。
表型改善
阴道给予格氏乳杆菌或其纯化EPS显著降低了衰老小鼠子宫内的衰老标志物水平,并显著提升了小鼠胚胎着床率。
机制解析
转录组学及体外实验揭示,EPS通过抑制LATS1/YAP磷酸化驱动YAP核转位,进而上调HOXA10和HAND2等容受性关键基因的表达。
因果验证
敲除EPS合成基因的突变菌株丧失了抗衰老保护作用,且在小鼠子宫内特异性敲低Yap1阻断了EPS对内膜衰老与容受性的改善效应。
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37
Cell子刊:追踪口→肠细菌传播,无创筛查胃肠癌症
口-肠微生物传播口-肠轴口腔微生物组
IF: 23.2
Mouth-to-gut microbial transmission signatures enable robust, non-invasive diagnosis of gastrointestinal cancers
Lae-Guen Jang, Ji-Won Huh
Seolah Kim, Ji-Young Lee, Hee-Soo Hwang, Jaekyung Yoon, Hyeon Gwon Lee
Tae Il Kim, Yong Chan Lee, Sun Ha Jee, Jihyun F. Kim
Article|2026-08-20|
OA
10.1016/j.chom.2026.07.007
研究背景与设计
针对胃肠道癌症缺乏非侵入性诊断工具的问题,基于507名受试者的配对口腔-粪便样本建立口腔至粪便(MF)微生物传输指数,以量化口腔菌群向肠道的传播比例。
核心发现与意义
胃肠道癌症伴随口腔-肠道微生物区隔化破坏,基于MF传输特征的分类器在七个独立队列中实现了高精度的癌症分类,为无创癌症检测提供了新框架。
传播特征
胃癌与结直肠癌患者的MF指数较健康对照显著升高2.6至3.0倍,且传播的微生物丰度与白细胞计数及胆固醇等宿主代谢和炎症指标相关。
菌群组成
胃癌肠道富集咽峡炎链球菌等细菌,结直肠癌富集具核梭杆菌等已知癌相关菌,且传播强度随肿瘤分期递增。
诊断效能
仅利用口腔样本中扩增子序列变异(ASV)级别的二元存在特征构建随机森林模型,即可跨队列实现稳健的癌症分类。
临床优势
在匹配队列中,基于MF-ASV的诊断模型敏感性达0.929,显著优于传统粪便潜血试验的0.610,同时保持极高的特异性。
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38
Cell子刊:活体生物药双管齐下重塑肠道微生态
炎症性肠病梭菌活体生物药色氨酸代谢物
IF: 23.2
Defined human Clostridia consortia reverse colitis via dual effects of tryptophan metabolites on microbiota and immunity
Akihiko Oka, Gerold Bongers, Yoshiyuki Mishima
Andrew J Baltus, Simon M Gray, Bo Liu, Jeremy W Herzog, John R. Benedetto, Ting-Jia Fan, Jisun Jang, Muyiwa Awoniyi, Esmat Rousta, Ling-Yang Hao, Raad Z Gharaibeh, Anthony A Fodor, Toshifumi Ohkusa, Koji Atarashi, Shinji Fukuda, Kenya Honda, Lani R San Mateo
R Balfour Sartor
Article|2026-08-26|
OA
10.1016/j.chom.2026.08.003
研究背景与设计
针对炎症性肠病中菌群失调与免疫失衡并存的问题,在多种人源化小鼠结肠炎模型中评估了两种定义型人源梭菌群落的治疗效果。
核心发现与意义
梭菌群落通过色氨酸代谢物驱动的双重机制逆转结肠炎,不仅直接抑制致病共生菌,还激活宿主保护性信号通路,为活体生物药设计提供了新策略。
微生态调控
在T细胞转移及白细胞介素10缺陷小鼠模型中,梭菌群落显著降低肠道内肠杆菌科与梭杆菌门丰度,并增加具有益生特性的Bacteroides ovatus。
代谢机制
靶向代谢组学显示梭菌群落显著升高吲哚丙酸及吲哚水平,体外实验证实这些色氨酸代谢物直接抑制Klebsiella pneumoniae及Escherichia coli等致炎菌生长。
免疫机制
使用芳烃受体拮抗剂显著削弱了梭菌群落的保护作用,导致粪便脂质运载蛋白升高及组织学炎症加重,提示该保护效应部分依赖于宿主芳烃受体信号通路。
转化价值
剔除潜在万古霉素耐药菌株的11株梭菌群落在定植与功能上与原始17株群落高度重叠,作为临床候选药物展现出不依赖调节性T细胞的独立抗炎潜力。
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39
Lancet子刊:肠道缺氧警报,酵母过度生长或是结肠菌群失调关键信号
酵母菌过度生长念珠菌肠道微生物组
IF: 21.9
Assessment of relationships between faecal yeast overgrowth and yeast species, protozoan parasites, and bacterial population dynamics: a Dutch retrospective, single-centre, cohort study
Jason J Biemond
Robert F J Kullberg, Mèlanie V Bénard, Hannah P Savage, Derek J Bays, Alje P van Dam, Aldert Bart, Patricia Broekhuizen-van Haaften, Ellen Wentink, Cyriel Y Ponsioen, Bastiaan W Haak, Tom van Gool
W Joost Wiersinga
Article|2026-08-06
10.1016/j.lanmic.2026.101432
研究背景与设计
针对肠道酵母菌过度生长发病机制不明的问题,利用2848份人类粪便样本及体外培养模型,系统评估了酵母菌过度生长与真菌、寄生虫及细菌种群动态的关联。
核心发现与意义
肠道酵母菌过度生长伴随专性厌氧微生物的丢失及兼性厌氧菌的扩张,提示结肠腔氧气水平升高可能是驱动这一跨界微生物群失调的核心机制。
临床用药关联
临床数据回顾分析证实,过去3个月内的抗生素暴露及质子泵抑制剂使用与粪便酵母菌过度生长(≥105CFU/g)显著相关。
真菌种群演替
酵母菌过度生长状态下,光滑念珠菌的流行率从2%显著飙升至33%,而近平滑念珠菌显著减少。
跨界微生物失调
酵母菌过度生长伴随专性厌氧寄生虫脆弱双核阿米巴和芽囊原虫的流行率分别下降62.2%和43.8%,同时肠道细菌α多样性显著降低且兼性厌氧菌大量富集。
氧气驱动机制
体外不实验证实,白色念珠菌在严格厌氧条件下无法生长但富氧环境中增殖旺盛,而芽囊原虫仅在严格厌氧环境中存活,直接支持了氧气浓度决定特定微生物生长的推测。
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40
Nature子刊:噬菌体联手粪菌移植,破解反复尿路感染难题
复发性尿路感染噬菌体疗法粪菌移植
IF: 18.7
Combined phage therapy and faecal microbiota transplantation to treat recurrent urinary tract infection: a case series
Shawna McCallin, Lorenz Leitner, Lena M Biehl
Annika Y Classen, Simone C. Lieberknecht-Jouy, Fatih Abdula, Sarah Dugas, Oliver Gross, Hendrik Koliwer-Brandl, Swenja Lassen, Jens Scheidegger, Matthew Dunne, André Kahles, Jonas Eigler, Fedja Farowski, Paul G Higgins, Sonja Milek, Oksana Chemych, Jiemin Du, Martin J Loessner, Thomas M Kessler, Maria J. G. T. Vehreschild
Shawna McCallin
Short Article|2026-07-30
10.1038/s41564-026-02409-0
研究背景与设计
针对复发性尿路感染(rUTI)难题,对3例女性患者实施口服联合膀胱内噬菌体治疗(PT),其中2例后续接受粪菌移植(FMT)。
核心发现与意义
PT联合FMT干预伴随患者24个月内感染发作减少及症状减轻,提示临床获益独立于病原体的绝对根除。
病原体与药代动态
膀胱内滴注噬菌体2小时内驱动尿液E. coli载量下降达3 log10,且噬菌体滴度在给药间期得以维持,而单纯口服未在尿中检出噬菌体。
菌株演化事件
全基因组测序显示1例患者发生系统发育独立的克隆替换,新菌株缺失氟喹诺酮耐药基因与fimB并获得铁摄取基因簇,提示噬菌体干预可能驱动病原体毒力特征改变。
微生态重塑
宏基因组测序证实接受FMT的患者肠道菌群向供体组成偏移,提示供体微生物群成功定植。
临床结局
干预后患者尿路感染发作频率降低或症状严重程度减轻,伴随抗生素使用显著减少及生活质量改善。
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