单细胞组学
1. Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
炎症通过重塑骨髓微环境特定区域干扰造血功能。炎症如何通过改变骨髓微环境来影响造血干细胞的稳态尚不完全清楚。研究利用单细胞组学发现炎症诱导骨髓微环境发生空间特异性重塑并损害造血。该研究揭示了炎症性造血异常的微环境机制,为干预相关疾病提供了新思路。
造血干细胞稳态 | 骨髓微环境, 炎症重塑 | 单细胞转录组测序
Swann, James W. · … · Passegué, Emmanuelle · · 2026/02/12
该研究由干细胞生物学哥伦比亚大学Emmanuelle Passegué团队完成 Blood
原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006497125024498?dgcid=rss_sd_all
2. Tfam-mediated metabolic perturbation in RORγt+ lymphocytes impacts intestinal tissue homeostasis and promotes GATA3+RORγt+ innate lymphoid cells.
代谢扰动影响肠道免疫稳态与组织重塑。线粒体转录因子Tfam在RORγt+淋巴细胞中的作用及其对肠道稳态的影响尚待深入研究。研究发现Tfam缺失导致Th2介导的肠道延长,而高脂饮食通过重塑GATA3+RORγt+先天淋巴细胞群加重结肠炎。单细胞转录组分析显示该细胞群具有独特的代谢重编程和细胞因子分泌特征。该数据强调了免疫细胞代谢在肠道组织重塑和炎症中的核心作用。
肠道炎症与组织重塑 | Tfam, RORγt+淋巴细胞, 代谢重编程 | 单细胞转录组测序, 基因靶向缺失
Sun Na · … · Zhou Liang · Cell reports · 2026/02/10
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116952
3. A bone-derived hormone permits rapid visual escape via GPR37 receptor in a subpopulation of VTA GABAergic neurons.
骨源性激素调控视觉逃避行为。研究发现骨钙素(OCN)通过VTA GABA能神经元上的GPR37受体通路,增强神经元兴奋性以允许快速视觉逃避。通过单细胞转录组和电生理技术,揭示了OCN抑制THIK-1钾电流从而介导这一过程的机制。该研究为骨-脑代谢轴调节生存行为提供了全新的视角。
视觉逃避行为 | 骨钙素, GPR37, VTA神经元 | 单细胞转录组学, 电生理
Liu Xuemei · … · Wang Liping · · 2026/02/11
该研究由脑科学中国科学院深圳先进技术研究院王立平团队完成 Neuron
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.neuron.2025.12.048
4. Estradiol regulates osteoclast sialylation via ST3Gal1 in postmenopausal osteoporosis.
雌二醇通过ST3Gal1调节破骨细胞唾液酸化缓解骨质疏松。绝经后雌激素缺乏加速骨流失,但其调节破骨细胞的分子机制尚不完全。研究发现雌激素抑制RANKL诱导的ST3GAL1转录,从而减少破骨细胞形成。该研究揭示了骨质疏松的新分子机制,并提出了唾液酸酶治疗的新策略。
绝经后骨质疏松 | ST3Gal1, 破骨细胞唾液酸化 | 单细胞RNA测序, 唾液酸酶处理
Dou Ce · … · Luo Fei · · 2026/02/12
该研究由骨科学陆军军医大学第一附属医院Luo Fei团队完成 Bone research
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41413-025-00498-x
5. A macrophage-induced subpopulation of mesenchymal cells expressing Fcer1g contributes to wound-induced fibrosis.
巨噬细胞诱导的Fcer1g+间充质细胞亚群促进伤口纤维化。成人皮肤伤口愈合常伴随纤维化和瘢痕形成,但负责该过程的特定间充质细胞亚群尚不明确。研究发现早期巨噬细胞可诱导产生高增殖的Fcer1g+间充质细胞,靶向消减该亚群可显著减少瘢痕而不影响愈合。该研究揭示了促纤维化间充质状态的跨物种保守性,为临床干预皮肤瘢痕提供了新靶点。
皮肤伤口愈合, 纤维化 | Fcer1g, 巨噬细胞-间充质细胞相互作用 | 单细胞转录组分析, 细胞谱系追踪
Ma Xinyi · … · Alman Benjamin Aaron · · 2026/02/12
该研究由骨科手术杜克大学Benjamin Aaron Alman团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-69449-2
6. Single-Cell Atlas of Subchondral Bone Marrow Lesions Reveals Proteostasis Dysfunction as a Druggable Mechanism for Early Osteoarthritis.
蛋白稳态失调驱动早期骨关节炎病变。骨髓病变是骨关节炎的关键影像特征,但其分子机制尚不明确。研究通过单细胞图谱发现HSP70和USP19调节的蛋白酶体功能障碍导致胶原蛋白错误分泌,进而诱发病变。该发现揭示了骨髓病变形成的机制,并为早期骨关节炎干预提供了潜在的药物靶点。
骨关节炎, 骨髓病变 | 蛋白稳态, HSP70, USP19 | 单细胞转录组测序
Xu Hailun · … · Yang Liu · · 2026/02/13
该研究由骨外科学空军军医大学西京医院Yang Liu团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
原文链接:https://doi.org/10.1002/advs.202516720
7. Single-Cell RNA Sequencing of Human Lung Tissues Reveals Metallothionein-Positive T Cells as a Novel Potential Marker of Susceptibility to Chronic Obstructive Pulmonary Disease.
金属硫蛋白阳性T细胞可预测慢阻肺易感性。慢阻肺发病机制复杂,识别高风险人群对疾病预防至关重要。通过单细胞测序发现MT-high T细胞子集在慢阻肺患者中显著减少,且具有抑制CD8+ T细胞毒性的功能。该细胞子集有望成为慢阻肺早期诊断的生物标志物和治疗新靶点。
慢性阻塞性肺疾病 | 金属硫蛋白, 免疫调节 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术
Liu Zengqing · … · Wang Wei · · 2026/02/13
该研究由免疫学首都医科大学Wang Wei团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
原文链接:https://doi.org/10.1002/advs.202509332
8. The presence of CD11c+ B cells with potent effector memory phenotype in lung adenocarcinoma correlates with overall patient survival.
CD11c+ B细胞与肺腺癌患者生存率显著相关。肿瘤浸润B细胞被认为是良好的预后标志物,但其具体亚群的作用尚不明确。研究通过单细胞测序发现肺腺癌中CD11c+ B细胞增加,且能分泌增强抗肿瘤免疫的细胞因子。该发现确立了CD11c+ B细胞作为肺癌预后生物标志物和治疗靶点的潜力。
肺腺癌 | CD11c+ B细胞, 抗肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序
Sambanthamoorthy Sharmila · … · Baumgarth Nicole · · 2026/02/13
该研究由免疫学约翰霍普金斯大学Baumgarth Nicole团队完成 Cancer immunology research
原文链接:https://doi.org/10.1158/2326-6066.CIR-25-0635
9. Ex vivo expansion of melanoma tumor infiltrating lymphocytes leads to a dominant exhausted T cell population with lack of memory markers.
黑色素瘤TILs体外扩增导致耗竭性T细胞占主导。肿瘤浸润淋巴细胞疗法对黑色素瘤有效,但扩增过程中的细胞演变仍不清楚。单细胞测序显示,扩增后的TILs主要表现为终末分化和耗竭表型,缺乏记忆标志物。未来通过增加具有记忆表型的细胞亚群有望进一步提升TIL疗法的临床疗效。
黑色素瘤 | T细胞耗竭, 细胞可塑性 | 单细胞RNA测序, TCR测序
Coppola Gianfilippo · … · Katz Samuel G · · 2026/02/13
该研究由病理学耶鲁大学Katz Samuel G团队完成 Cancer immunology research
原文链接:https://doi.org/10.1158/2326-6066.CIR-25-0798
空间组学
1. Colonic spatial single-cell proteomics and murine models link mitochondrial dysfunction to dimeric IgA-secreting plasma cell deficiency in Crohn's disease.
线粒体功能障碍导致克罗恩病患者粘膜IgA分泌缺陷。分泌型IgA对维持肠道屏障至关重要,但克罗恩病中B细胞失调原因未知。研究结合空间蛋白组学和模型发现线粒体氧化磷酸化在IgA+浆细胞分化中起关键作用。该发现为克罗恩病的治疗提供了基于代谢干预的新方向。
克罗恩病, 肠道免疫 | 线粒体氧化磷酸化, IgA+浆细胞 | 空间单细胞蛋白质组学, 代谢组学
Raschdorf Annika · … · Derer Stefanie · · 2026/02/12
该研究由营养医学吕贝克大学Stefanie Derer团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-69069-w
2. Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals upregulation of glycolysis pathway genes before overt tauopathy in the PS19 mouse model
空间转录组揭示tau蛋白病早期代谢异常。tau蛋白异常堆积是阿尔茨海默病的核心病理,但区域易感性与早期转录变化的关系尚不明确。研究利用空间转录组技术发现,在tau蛋白缠结形成前,海马区糖代谢相关基因已显著上调。该研究揭示了代谢应激在神经退行性疾病早期的关键作用,为早期干预提供了新思路。
阿尔茨海默病, tau蛋白病 | 糖代谢通路, 区域易感性 | 空间转录组学, PS19小鼠模型
Wang, Shuai · … · Thinakaran, Gopal · · 2026/02/13
该研究由神经科学南佛罗里达大学Gopal Thinakaran团队完成 Experimental & Molecular Medicine
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s12276-026-01652-z
基因组或者转录组学
1. Chromosome X-wide association study in multiple system atrophy identifies sex-differential risk loci
X染色体全关联研究揭示多系统萎缩的性别差异位点。X染色体变异在人类疾病中的作用常被忽视,尤其是在多系统萎缩(MSA)等疾病中。研究通过全基因组测序识别出Xq28和Xp22.2两个性别特异性风险位点。该发现强调了性别差异遗传因素在MSA发病机制中的关键作用。
多系统萎缩 (MSA) | X染色体, 性别差异 | 全基因组关联研究 (GWAS)
Brain Advance Access · 2026/02/13
原文链接:https://academic.oup.com/brain/advance-article/doi/10.1093/brain/awag062/8482267?rss=1
2. Clonal hematopoiesis may precede the diagnosis of aplastic anemia by several years.
克隆性造血可能在再生障碍性贫血诊断前数年出现。再生障碍性贫血(AA)与克隆性造血(CH)存在关联,但两者发生的时间顺序尚不明确。基于UK Biobank的大规模队列研究发现,携带特定基因突变的CH个体患AA的风险显著升高。该研究揭示了CH与AA之间潜在的共同致病机制。
再生障碍性贫血 | 克隆性造血, TET2/DNMT3A | 全外显子组测序
Liu Qianwei · … · Liu Xinyuan · · 2026/02/14
该研究由血液病学中国医学科学院刘新元团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2024015776
3. Genome-wide copy number profiling enhances risk stratification in multiple myeloma by shallow whole-genome sequencing.
浅层全基因组测序提升多发性骨髓瘤风险分层。精确检测拷贝数变异对骨髓瘤预后至关重要,但传统方法存在局限。开发了LeukoPrint技术,其检测异常率显著高于核型分析,并能有效重分类高危患者。该研究证明了sWGS在骨髓瘤常规诊断和精准预后评估中的临床价值。
多发性骨髓瘤 | 拷贝数变异 | 浅层全基因组测序
Fang Baijun · … · Mao Mao · · 2026/02/14
该研究由基因组学SeekIn公司Mao Mao团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2025018133
4. MDS/AML and AML with myelodysplasia-related gene mutations: clinical and molecular similarities.
分子定义的继发型AML具有独特的临床特征。AML遗传背景复杂,需明确不同亚型间的分子与临床差异。研究通过大规模队列分析发现,特定基因突变定义的继发型AML预后较差,且NGS检测的非DTA突变残留具有显著预后价值。该研究支持将分子定义的继发型AML作为独立的临床类别进行管理。
急性髓系白血病 | 基因突变, MRD | 二代测序
Boertjes Emma L · … · Valk Peter J M · · 2026/02/14
该研究由血液病学伊拉斯姆斯大学医学中心Peter J M Valk团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2025018408
5. Flexibility and modulation of translation initiation in enterovirus genomes.
肠道病毒基因组翻译起始的灵活性与调节。部分肠道病毒拥有多个上游AUG,其在感染过程中的作用尚不清楚。研究利用核糖体分型证实CVA13可利用两个上游AUG起始翻译,且双AUG结构在生理相关组织中具有竞争优势。该研究揭示了肠道病毒翻译起始的复杂性及其对组织适应性的贡献。
肠道病毒感染 | 翻译起始, uORF | 核糖体分型
O'Connor Rhian L · … · Lulla Valeria · · 2026/02/09
该研究由病毒学剑桥大学Valeria Lulla团队完成 PLoS pathogens
原文链接:https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013967
6. Sialic acid-responsive Parabacteroides is linked to gut barrier integrity in older adults.
唾液酸响应的副拟杆菌与老年人肠道屏障相关。肠道屏障受损是老年慢性炎症的关键驱动力,但其与菌群的关系尚不明确。研究发现副拟杆菌丰度与屏障功能正相关,且唾液酸能促进其生长并增强屏障完整性。该发现揭示了宿主聚糖通过扶持益生菌维持肠道健康的机制,为防治衰老相关炎症提供了新思路。
衰老相关炎症 | 肠道屏障, 唾液酸 | 宏基因组分析
Fujiwara Shin · … · Kim Yun-Gi · · 2026/02/10
该研究由微生物学明治控股有限公司Yun-Gi Kim团队完成 Gut microbes
原文链接:https://doi.org/10.1080/19490976.2026.2627093
7. Dual resistance to carbapenems and colistin in Enterobacter: Taiwan surveillance of antimicrobial resistance, 2010-2020.
台湾肠杆菌属细菌对碳青霉烯和多黏菌素的双重耐药监测。携带双重耐药性的革兰氏阴性菌是全球健康威胁。通过对台湾十年间分离株的监测发现,双重耐药比例显著,且多黏菌素耐药主要由染色体操纵子激活介导。该研究强调了改进诊断技术和加强医院感染控制在应对此类耐药菌中的紧迫性。
抗生素耐药 | arnBCADTEF操纵子 | 全基因组测序
Huang Ying-Chi · … · Fang Chi-Tai · · 2026/02/10
该研究由流行病学台湾大学Chi-Tai Fang团队完成 Emerging microbes & infections
原文链接:https://doi.org/10.1080/22221751.2026.2623693
8. Pre-existing β-lactamase gene diversity is associated with lower risk of ESBL-producing Enterobacterales colonization in patients exposed to ceftriaxone.
预存β-内酰胺酶基因多样性降低ESBL-E定植风险。抗生素暴露增加耐药菌定植风险,但肠道抗性组的保护作用尚不明确。通过宏基因组分析发现,基线时具有更高β-内酰胺酶基因多样性的患者在头孢曲松治疗后更不易被ESBL-E定植。该研究证明了功能性抗性组多样性在维持定植抗性中的关键作用。
耐药菌定植 | 定植抗性, 抗性组多样性 | 宏基因组测序
Le Bastard Quentin · … · Ruppé Etienne · · 2026/02/10
该研究由微生物学巴黎大学Etienne Ruppé团队完成 Gut microbes
原文链接:https://doi.org/10.1080/19490976.2026.2627692
9. Heterogeneous associations of polygenic indices of 35 traits with mortality: a register-linked population-based follow-up study.
多基因指数与死亡风险的关联研究。虽然多基因指数(PGI)已被广泛应用,但其预测全因死亡风险的能力仍需深入探讨。研究分析了芬兰4万余人的数据,发现吸烟、自评健康和BMI相关的PGI对死亡率具有最强的预测作用。该研究揭示了遗传风险在年轻群体中影响更显著,为健康风险预测提供了参考。
全因死亡率 | 遗传风险因素 | 多基因指数(PGI), 流行病学分析
Lahtinen Hannu · … · Martikainen Pekka · · 2026/02/11
该研究由人口健康赫尔辛基大学Pekka Martikainen团队完成 eLife
原文链接:https://doi.org/10.7554/eLife.107496
10. Variation in antiviral immunity and inflammation pathways precedes HIV-1 infection in a high-risk African cohort.
感染前免疫差异影响HIV-1易感性。个体对HIV-1感染的易感性存在差异,但其背后的生物学决定因素仍不清楚。研究通过对比肯尼亚高危人群感染前后的血浆RNA,发现预先存在的抗病毒免疫减弱与感染风险增加相关。该发现强调了暴露前免疫微环境在决定病毒获取风险中的关键作用。
HIV-1易感性 | 抗病毒免疫, T细胞抑制 | 细胞外RNA测序, 嵌套病例对照研究
Kioko Mwikali · … · Abdi Abdirahman I · · 2026/02/12
该研究由免疫学肯尼亚医学研究所Abdirahman I Abdi团队完成 The Journal of clinical investigation
原文链接:https://doi.org/10.1172/JCI195172
11. RAB3GAP2 is a regulator of skeletal muscle endothelial cell proliferation and associated with capillary-to-fiber ratio.
RAB3GAP2调控骨骼肌毛细血管密度。骨骼肌毛细血管密度与运动表现相关,但其遗传调控机制不明。通过GWAS研究发现RAB3GAP2与毛细血管/纤维比率显著相关,且其低表达变异体在精英耐力运动员中更为普遍。实验证明降低RAB3GAP2可促进内皮细胞增殖和管状形成,从而增加体内血管密度。该研究确定了RAB3GAP2是血管生成的负调节因子,为理解耐力表现提供了遗传学基础。
骨骼肌血管生成 | RAB3GAP2, 内皮细胞增殖 | 全基因组关联分析(GWAS), eQTL分析
Ström Kristoffer · … · Hansson Ola · Cell reports · 2026/02/11
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.celrep.2026.116961
12. Alternative splicing-triggered mRNA decay informs splice-switching targets for neurodevelopmental disorders.
剪接触发的mRNA降解调控神经发育。AS-NMD在调节基因表达中起关键作用,但其在神经元基因及神经发育障碍中的贡献研究不足。研究鉴定出3000多个受发育调控的AS-NMD外显子,发现其在发育过程中抑制突触基因并调节200多个致病基因。利用反义寡核苷酸成功干预了GRIA2等基因的降解并提升了功能异构体水平。该研究为自闭症等神经发育障碍提供了新的剪接切换治疗靶点。
神经发育障碍(NDDs) | AS-NMD, 剪接调控, GRIA2 | 转录组分析, 反义寡核苷酸(ASOs)
Hu Kaining · … · Zhang Xiaochang · · 2026/02/12
该研究由神经科学芝加哥大学张晓昌团队完成 The Journal of clinical investigation
原文链接:https://doi.org/10.1172/JCI197271
13. Driving forward the restoration of an American icon.
基因组育种助力美洲栗树复兴。美洲栗树因外来病原体侵害而濒临灭绝,亟需提高其抗病能力。研究提出利用基因组信息育种和新型转化方法来增强其抗病性。该研究对保护濒危物种和恢复生态系统具有重要意义。
植物抗病性, 物种恢复 | 遗传抗性 | 基因组育种, 基因转化
Strauss Steven H · Slavov Gancho T · Science (New York, N.Y.) · 2026/02/12
原文链接:https://doi.org/10.1126/science.aee8977
14. Poxvirus attack of antiviral defense pathways unleashes an effector-triggered NF-κB response.
痘病毒攻击诱发效应物触发的免疫反应。效应物触发免疫(ETI)是病原体感知的关键形式,但在哺乳动物中研究较少。研究通过筛选发现痘病毒蛋白M3.1攻击抗病毒复合物,进而解除对NF-κB的抑制并激活免疫反应。该研究揭示了免疫负调节因子在病原体感知中的新功能。
痘病毒感染 | NF-κB通路, ETI途径 | RNA测序, 表达筛选
Remick Brenna C · … · Vance Russell E · Science (New York, N.Y.) · 2026/02/12
⭐ 该研究由分子与细胞生物学加州大学伯克利分校Russell E Vance团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1126/science.adw4937
15. Mechanisms linking cytoplasmic decay of translation-defective mRNA to transcriptional adaptation.
ILF3连接细胞质mRNA降解与核内转录。转录适应(TA)是突变诱导的遗传稳态机制,但细胞质mRNA片段如何影响核内转录尚不明确。研究通过全基因组CRISPR筛选发现ILF3是连接两者的关键蛋白,并识别出激活基因的触发RNA片段。该发现深化了对TA分子机制的理解,为设计增强基因表达的可编程寡核苷酸提供了依据。
转录适应, 遗传稳态 | ILF3, mRNA降解 | CRISPR筛选, 寡核苷酸设计
El-Brolosy Mohamed A · … · Weissman Jonathan S · Science (New York, N.Y.) · 2026/02/12
⭐ 该研究由分子生物学Whitehead研究所Jonathan S. Weissman团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1126/science.aea1272
16. Taking the pulse of RNA polymerase II in intact tissue with PReCIS-seq.
PReCIS-seq技术捕捉完整组织中的RNA聚合酶II动态。了解组织发育和稳态中的转录调控需要高分辨率的聚合酶动态监测工具。PReCIS-seq能以细胞类型精度捕捉Pol II动态,揭示了皮肤发育中谱系身份与细胞保护的调控机制。该技术为研究复杂组织中的转录调控提供了强有力的工具,具有广泛的应用前景。
转录调控, 组织稳态 | RNA聚合酶II, 启动子暂停 | PReCIS-seq, 测序技术
Platt Sarah · Myung Peggy · · 2026/02/11
该研究由皮肤病学耶鲁大学Peggy Myung团队完成 Developmental cell
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.devcel.2026.01.008
17. How a coral holobiont stays in sync in nature.
珊瑚全生物体在自然环境中的昼夜同步机制。实验室环境难以模拟珊瑚、共生藻及微生物在野外复杂的昼夜节律互动。研究揭示了珊瑚全生物体在自然光暗循环下如何协调基因活动,建立了野外行为的基准。该研究超越了传统的实验室水箱实验,为理解珊瑚礁生态系统的稳定性提供了重要参考。
昼夜节律, 共生关系 | 基因表达同步, 珊瑚全生物体 | 野外原位研究, 转录组分析
Chan Cheong Xin · · 2026/02/11
该研究由生物信息学昆士兰大学Cheong Xin Chan团队完成 Cell host & microbe
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.chom.2026.01.010
18. Microbial communities in semi-mature oak trees are resilient to drought, nutrient limitation, and pathogen challenge.
成年橡树微生物群落对环境压力具有显著韧性。森林面临日益严重的干旱和病害威胁,了解成年树木相关微生物的响应对生态保护至关重要。研究通过两年跟踪发现,尽管面临干旱和病原体挑战,橡树各组织的微生物群落仍保持高度稳定。该发现揭示了森林生态系统的内在稳定性,强调了微生物群落在树木抗逆中的潜在作用。
森林生态系统稳定性, 树木抗逆性 | 微生物群落韧性, 橡树衰退 | 16S/ITS测序, 长期野外实验
Hussain Usman · … · McDonald James E · · 2026/02/11
该研究由环境微生物学班戈大学James E. McDonald团队完成 Cell host & microbe
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.chom.2026.01.009
19. Translation elongation as a rate-limiting step of protein production.
翻译延伸是蛋白质产量的关键限速步骤。传统模型认为翻译起始而非延伸限制了蛋白质产量,但同义密码子的影响对此提出了挑战。研究通过CRISPRi筛选和模拟证实,密码子选择能直接限制蛋白质产量,且起始与延伸间存在动态平衡。该研究修正了蛋白质合成的限速理论,为通过密码子优化调节基因表达提供了理论支撑。
蛋白质合成调控, 基因表达效率 | 翻译延伸, 密码子偏好性 | 全基因组CRISPRi筛选, 荧光报告系统
Lyons Elijah F · … · Lareau Liana F · · 2026/02/11
该研究由生物工程加州大学伯克利分校Liana F. Lareau团队完成 Cell systems
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.cels.2025.101490
20. Dispersal and isolation of the scaly-foot snail across abyssal insular habitats and through time.
鳞角腹足蜗牛的群体基因组学揭示深海扩散障碍。物种在深海热液喷口间的扩散模式是理解进化过程和遗传隔离的关键,但相关障碍尚不明确。研究通过对印度洋多个喷口的蜗牛进行群体基因组分析,发现深海流和转换断层是塑造其遗传结构的关键。该研究为深海采矿背景下的生物多样性保护提供了重要的基准数据和科学依据。
遗传隔离, 物种扩散 | 基因流, 深海环流 | 群体基因组学, 物理海洋建模
Chen Xi · … · Sun Jin · · 2026/02/11
该研究由海洋生物学中国海洋大学孙进团队完成 Current biology : CB
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.cub.2026.01.033
21. Tissue-scale mapping reveals a central role of hepatoblasts in the regulation of fetal liver hematopoiesis and stem cell maintenance.
成肝细胞调控胎肝造血微环境。研究通过3D显微成像和转录组测序,绘制了胚胎发育过程中胎肝造血干细胞(HSC)生态位的时空动态图谱。发现成肝细胞在空间上占据主导地位,通过产生KIT配体关键性地调节HSC扩张和红细胞生成。该研究阐明了胎肝重塑驱动造血生态位收缩及HSC迁移的分子机制。
造血干细胞维持 | 成肝细胞, KIT配体, 造血生态位 | 3D显微成像, mRNA测序
Vijaykumar Anjali · … · Nombela-Arrieta César · · 2026/02/11
该研究由血液学苏黎世大学César Nombela-Arrieta团队完成 Developmental cell
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.devcel.2026.01.011
22. 7,8-Dihydroxyflavone alleviates ulcerative colitis by binding keap1 to activate an slc7a11-dependent inhibition of NF-κB p65 signaling in macrophages.
7,8-二羟基黄酮通过激活Slc7a11缓解溃疡性结肠炎。研究发现生物活性黄酮7,8-DHF能通过结合Keap1激活Nrf2/Slc7a11轴,进而抑制巨噬细胞中的NF-κB信号通路。该作用有效调节了巨噬细胞极化并减轻了肠道炎症,同时改善了肠道菌群结构。该研究揭示了7,8-DHF在管理炎症性肠病中的治疗潜力。
溃疡性结肠炎 | Keap1, Slc7a11, NF-κB通路 | RNA测序, 16S rRNA测序
Wang Wei · … · Tang You-Zhi · · 2026/02/10
该研究由兽医学华南农业大学唐有志团队完成 Journal of advanced research
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.jare.2026.01.078
23. Natural variation in OsZIP10 promoter contributes to grain zinc accumulation in rice.
OsZIP10启动子自然变异促进水稻锌积累。研究鉴定出OsZIP10是影响水稻籽粒锌含量和耐锌缺乏的关键转运蛋白。发现启动子中的一个自然变异增强了转录因子F-bZIPs的结合,从而上调OsZIP10表达并促进锌向籽粒的分配。该发现为通过生物强化手段提高水稻营养价值提供了重要的基因资源。
锌缺乏, 营养强化 | OsZIP10, bZIP转录因子, 启动子变异 | 基因敲除, 启动子分析
Zhan Junhui · … · Ye Guoyou · · 2026/02/10
该研究由农业基因组学中国农业科学院深圳农业基因组研究所叶国友团队完成 Journal of advanced research
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.jare.2026.01.084
24. Chronic dental lighting disrupts blood-retinal barrier homeostasis via vascular and inflammatory pathways.
牙科照明环境破坏血视网膜屏障稳态。牙医面临高强度照明带来的视力受损风险,但慢性光损伤机制不明。研究通过大鼠模型发现LED照明通过炎症通路破坏屏障并减少视网膜血管。该研究为牙科从业人员选择光源及预防职业性眼病提供了重要指导。
职业性眼病, 血视网膜屏障 | NF-κB信号通路, 炎症反应 | RNA测序, 组织透明化技术
Sun Haiyang · … · Chen Junyu · · 2026/02/13
该研究由口腔医学四川大学华西口腔医院Chen Junyu团队完成 International journal of oral science
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41368-025-00414-3
25. FOXF2 regulates pericyte-endothelial signaling required for vascular homeostasis after neonatal hyperoxic lung injury.
FOXF2调控周细胞-内皮信号维持新生儿肺损伤后的血管稳态。支气管肺发育不良(BPD)与肺血管发育受阻密切相关,但周细胞支持内皮的转录机制尚不明确。研究发现FOXF2是调控周细胞成熟的关键因子,其缺失会导致血管生成因子表达下降并破坏周细胞-内皮对话。该研究揭示了周细胞功能障碍在BPD发病中的作用,为肺血管再生提供了新见解。
支气管肺发育不良, 肺血管发育 | FOXF2, 周细胞-内皮通讯 | 转录组测序, 基因敲除小鼠
Sun Fei · … · Kalinichenko Vladimir V · · 2026/02/12
该研究由儿童健康亚利桑那大学Vladimir V Kalinichenko团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-69525-7
26. Germline mutations and somatic mosaicism in steatotic liver diseases and related liver carcinogenesis.
脂肪性肝病及其相关肝癌中的生殖系突变与体细胞嵌合。脂肪性肝病是全球肝硬化和肝癌的主要原因,其个体间进展差异受遗传因素显著影响。综述总结了PNPLA3等常见变异及FOXO1等体细胞突变在脂毒性适应和癌症促进中的作用。该研究强调了多基因风险评分在风险分层中的潜力,并指出了实现其临床应用价值仍需解决的局限性。
脂肪性肝病, 肝细胞癌 | PNPLA3, 体细胞嵌合, 脂代谢 | 全基因组关联研究, 风险评分
Trépo Eric · … · Nault Jean-Charles · Nature reviews. Gastroenterology & hepatology · 2026/02/12
⭐ 该研究由肝脏疾病研究INSERM的Jean-Charles Nault团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41575-026-01175-y
27. CDK13 drives clear cell renal carcinoma through METTL16-mediated m6A modification of ACLY mRNA.
CDK13通过METTL16介导的ACLY mRNA m6A修饰驱动透明细胞肾细胞癌。CDK13是致癌代谢的关键调节因子,但其在肾癌脂质代谢重编程中的作用尚不明确。研究发现CDK13通过磷酸化METTL16增强其催化活性,进而稳定ACLY mRNA并促进从头脂肪生成。阻断该轴可显著抑制肾癌的生长与转移,为肾癌的精准治疗提供了CDK13-METTL16-ACLY这一潜在靶点。
透明细胞肾细胞癌 | CDK13, METTL16, m6A修饰, 脂质代谢 | 表观转录组分析, 激酶抑制剂
Chen Jinsuo · … · Yang Zhan · · 2026/02/12
该研究由肿瘤免疫与细胞治疗青岛大学附属医院杨展团队完成 Experimental & molecular medicine
原文链接:https://doi.org/10.1038/s12276-025-01634-7
28. Drug-induced gastrointestinal toxicity and barrier integrity: cytoskeleton-mediated impairment in a clinically relevant human intestinal epithelium model.
药物诱导的胃肠道毒性与屏障完整性:临床相关人类肠上皮模型中的细胞骨架受损。传统模型难以准确预测药物的胃肠道毒性,限制了新药研发的效率。研究利用人类多能干细胞衍生的肠上皮细胞构建了TEER检测平台,其预测准确率显著优于传统Caco-2模型。转录组分析揭示了化疗药物通过下调细胞骨架相关通路破坏肠屏障的机制,为早期识别药物毒性提供了强有力的工具。
药物诱导胃肠道毒性 | 肠屏障功能, 细胞骨架受损 | 人类肠上皮模型, 转录组测序
Yu Won Dong · … · Son Mi-Young · · 2026/02/12
该研究由干细胞研究韩国生命工学研究院Mi-Young Son团队完成 Experimental & molecular medicine
原文链接:https://doi.org/10.1038/s12276-025-01635-6
29. Chromosome X-wide association study in multiple system atrophy identifies sex-differential risk loci.
多系统萎缩的X染色体全关联研究鉴定出性别差异风险位点。X染色体变异在人类疾病中的作用常因其独特的遗传模式而被忽视,尤其是在多系统萎缩(MSA)中。研究通过对888例病例和7128例对照进行全基因组测序分析,发现了女性特有的Xq28位点和男性特有的TBL1X位点。这些发现强调了性别差异遗传因素在MSA发病机制中的关键作用,为理解该病的性别差异提供了新线索。
多系统萎缩, 性别差异 | X染色体变异, TBL1X | 全基因组测序, 关联研究
Ray Anindita · … · Scholz Sonja W · · 2026/02/13
该研究由神经退行性疾病研究NIH/NINDS的Sonja W Scholz团队完成 Brain : a journal of neurology
原文链接:https://doi.org/10.1093/brain/awag062
30. GAL3ST1-Mediated Histone Tyrosine Sulfation Induced by Cancer-Associated Fibroblasts Promotes Gastric Cancer Metastasis.
GAL3ST1介导的组蛋白酪氨酸硫酸化促进胃癌转移。肿瘤细胞与癌相关成纤维细胞(CAF)的相互作用是胃癌转移的关键。研究发现CAF诱导的GAL3ST1作为组蛋白硫酸转移酶,在胞质中修饰H3Y99,进而入核激活β-catenin转录并驱动EMT。该研究揭示了组蛋白硫酸化这一新型表观遗传调控在肿瘤基质互作中的重要作用。
胃癌转移 | GAL3ST1, 组蛋白硫酸化, β-catenin | 转录组谱分析, 表观遗传调控
Lu Yifan · … · Su Liping · · 2026/02/13
该研究由肿瘤学上海交通大学医学院附属瑞金医院Su Liping团队完成 Cancer research
原文链接:https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-25-2452
31. The HUNT study identifies host genetic factors reproducibly associated with human gut microbiota composition
宿主遗传影响肠道菌群组成。肠道菌群与人类健康密切相关,但宿主遗传对其影响尚不完全清楚。研究通过大规模GWAS发现12个与菌群相关的遗传位点,并证实BMI对菌群的因果影响。该发现揭示了遗传与菌群的相互作用,助力疾病发病机制研究。
肠道菌群, 肥胖 | 宿主遗传因素, 因果关联 | 全基因组关联分析(GWAS), 孟德尔随机化
Moksnes, Marta Riise · … · Ohlsson, Claes · Nature Genetics · 2026/02/13
⭐ 该研究由遗传学哥德堡大学Claes Ohlsson团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41588-026-02502-4
32. Hidden in plain sight: illuminating the tRNA landscape by sequencing
高通量测序揭示tRNA调控景观。tRNA不仅是蛋白质合成的工具,更是基因表达的动态调节因子,其异常与多种疾病相关。本文综述了新兴的tRNA测序技术及其在癌症和免疫反应中的调控作用。该研究为开发基于tRNA的诊断标志物和治疗方案提供了新思路。
癌症, 神经功能障碍 | tRNA修饰, 基因表达调节 | tRNA测序技术
Marlow, Katherine · Su, Zhangli · Genome Biology · 2026/02/13
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s13059-026-03995-2
33. Genome-wide association analyses highlight the role of the intestinal molecular environment in human gut microbiota variation
遗传变异调节肠道分子环境与菌群。人类遗传变异如何塑造肠道微生物群组成的机制目前仍不完全清楚。研究通过大规模GWAS发现了与菌群丰富度相关的脂肪酸传感器位点及多个新遗传关联。该发现将菌群变异与肠道内分泌及粘膜功能联系起来,深化了对宿主-菌群互作的理解。
肠道菌群多样性 | OR51E1/E2, 短链脂肪酸感应 | 全基因组关联分析(GWAS), 宏基因组学
Dekkers, Koen F. · … · Fall, Tove · Nature Genetics · 2026/02/13
⭐ 该研究由流行病学乌普萨拉大学Tove Fall团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41588-026-02512-2
34. Cross-ancestry genome-wide association studies of liver function biomarkers uncover pleiotropic variants, systemic disease links and therapeutic targets
跨族群GWAS揭示肝功能遗传景观。肝功能生物标志物对评估代谢健康至关重要,但其跨族群的遗传基础研究仍不充分。研究通过大规模元分析识别了数千个遗传信号,并发现PEPD蛋白具有治疗脂肪肝的潜力。该研究为肝脏疾病的精准治疗和药物研发提供了重要靶点。
脂肪性肝病(MASLD), 肝硬化 | PEPD蛋白, 肝功能生物标志物 | 跨族群GWAS元分析, 孟德尔随机化
Yao, Wentao · … · Shen, Hongbing · · 2026/02/13
该研究由流行病学南京医科大学沈洪兵团队完成 Genome Medicine
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s13073-026-01606-0
35. Rethinking Alzheimer’s: novel miRNAs illuminate a disease beyond the brain
新型miRNA揭示阿尔茨海默病系统性特征。阿尔茨海默病是否仅局限于大脑,还是属于一种系统性疾病,目前仍存在争议。研究通过大规模元分析发现了194个在患者中发生广泛变化的miRNA,涉及多种外周信号通路。该发现挑战了传统认知,为开发新一代生物标志物奠定了基础。
阿尔茨海默病(AD) | 循环miRNA, 系统性炎症通路 | 元分析, 高通量测序数据整合
Novotný, JS · … · Stokin, GB · Molecular Psychiatry · 2026/02/13
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41380-026-03487-6
36. Allelic variation of Avr genes in highly virulent strains explains severe wheat stem rust epidemics
效应因子基因变异解释小麦秆锈病大流行机制。小麦秆锈病是威胁全球粮食安全的重大真菌病害,其高毒力菌株的致病机理亟待阐明。本研究通过构建高质量基因组图谱,鉴定了关键Avr基因的拷贝数变异及其对抗性基因的逃逸。该研究建立的Avr基因图谱为小麦抗病育种和病原菌监测提供了重要的分子依据。
小麦秆锈病 | 效应因子(Avr), 毒力变异 | 染色体级基因组组装, 效应因子库筛选
Spanner, Rebecca E. · … · Figueroa, Melania · · 2026/02/13
该研究由植物病理学CSIRO Melania Figueroa团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-69508-8
37. The interplay of sleep characteristics with health factors and gut microbiome
荷兰大规模队列揭示睡眠与肠道菌群关联。睡眠质量与肠道微生物群之间存在潜在的双向作用,但其在大人群中的关联仍需验证。通过对近七千名参与者的分析,研究发现睡眠质量及节律与菌群多样性及特定物种显著相关。该发现强调了饮食、菌群与睡眠的复杂互作,为通过干预微生物改善睡眠提供了可能。
睡眠质量, 昼夜节律 | 肠道微生物群 | 宏基因组学, 中介分析
Wu, Jiafei · … · Zhernakova, Daria V. · · 2026/02/13
该研究由人类遗传学格罗宁根大学医学中心Daria V. Zhernakova团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-68791-9
蛋白质组学
1. Novel CSF biomarkers for facilitating diagnosis of CNS-HLH from other neuroinflammatory disorders.
新型脑脊液生物标志物助力中枢神经系统HLH鉴别诊断。中枢神经系统噬血细胞性淋巴组织细胞增多症(CNS-HLH)易与其他神经炎症疾病混淆。研究通过蛋白质组学筛选出SerpinG1、溶菌酶等5种在CNS-HLH中显著升高的标志物。这些新型生物标志物为CNS-HLH的精准诊断提供了重要依据。
噬血细胞性淋巴组织细胞增多症 (HLH) | SerpinG1, CXCL9 | 蛋白质组学分析
Chandra Sharat · … · Davies Stella M · · 2026/02/14
该研究由骨髓移植辛辛那提儿童医院Stella M Davies团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2025016297
2. Identification of multiple Acinetobacter baumannii protein antigens as targets for potential immunotherapies using a novel protein microarray screening approach.
鲍曼不动杆菌免疫治疗新抗原筛选。鲍曼不动杆菌是关键的耐药病原体,目前尚无进入临床阶段的疫苗或抗体候选药物。研究利用新型蛋白质微阵列筛选出66个抗原,证实其中四种蛋白的抗体能促进调理吞噬并保护小鼠免受败血症感染。保护作用依赖于补体和中性粒细胞。该研究展示了蛋白质微阵列在快速鉴定耐药菌治疗靶点方面的潜力,为开发新型免疫疗法奠定了基础。
鲍曼不动杆菌感染, 耐药性 | 表面蛋白抗原, 调理吞噬 | 蛋白质微阵列, 被动免疫
Palethorpe Samantha · … · Brown Jeremy · PLoS pathogens · 2026/02/12
原文链接:https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013958
3. The UBC/SIRT5/DRP1 axis regulates mitochondrial dynamics to alleviate Staphylococcus aureus-induced oxidative stress and senescence in bovine mammary epithelial cells.
SIRT5调控金黄色葡萄球菌诱导的细胞衰老。金黄色葡萄球菌引起奶牛乳腺上皮细胞衰老,影响乳腺健康,但其分子机制尚不明确。研究发现感染通过UBC介导SIRT5降解,导致DRP1琥珀酰化增加并引发线粒体过度分裂和细胞衰老。过表达SIRT5能显著缓解线粒体压力和氧化损伤。该研究确定了SIRT5是维持线粒体稳态的关键调节因子,为缓解奶牛乳腺炎相关的氧化损伤提供了潜在靶点。
奶牛乳腺炎, 细胞衰老 | SIRT5, DRP1琥珀酰化, 线粒体动力学 | 质谱分析, 免疫共沉淀
Hu Huijie · … · Fu Shoupeng · · 2026/02/12
该研究由兽医学吉林大学付守鹏团队完成 PLoS pathogens
原文链接:https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013975
4. RAD51 succinylation regulates homologous recombination and contributes to the chemosensitivity in cancer.
RAD51琥珀酰化修饰调控同源重组及癌症化疗敏感性。基因组不稳定性与代谢重编程是癌症特征,但两者间的代谢-表观遗传联系尚不清晰。研究发现琥珀酰辅酶A通过调节RAD51琥珀酰化影响同源重组,且该修饰水平与PARP抑制剂敏感性密切相关。该研究揭示了代谢物调控基因组稳定性的新机制,为癌症精准治疗提供了潜在生物标志物和靶点。
基因组不稳定性, 化疗耐药 | RAD51琥珀酰化, 同源重组 | 质谱分析, 细胞穿透肽
Wang Zhe · … · Yuan Jian · Molecular cell · 2026/02/11
⭐ 该研究由转化医学同济大学袁健团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2026.01.020
5. FomA-Containing Outer Membrane Vesicles of Fusobacterium Nucleatum Facilitate Bladder Cancer Lymphatic Metastasis via IL-6-Dependent M2b Macrophage Polarization.
具核梭杆菌FomA蛋白外膜囊泡促进膀胱癌淋巴转移。尿液微生物群在膀胱癌进展中的作用尚不明确,尤其是其衍生的外膜囊泡(OMVs)。研究发现具核梭杆菌通过其OMVs中的FomA蛋白激活TLR2/NF-κB通路,诱导巨噬细胞M2b极化并释放VEGF-C,从而促进淋巴转移。此外,研究还鉴定出天然黄酮松属素能有效阻断该相互作用,为膀胱癌治疗提供了新靶点和候选药物。
膀胱癌, 淋巴转移 | FomA, TLR2, M2b巨噬细胞极化 | 蛋白质组学, 微生物组分析
Shangguan Wentai · … · Cheng Bisheng · · 2026/02/13
该研究由泌尿外科南方医科大学程必胜团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
原文链接:https://doi.org/10.1002/advs.202523256
6. Distinct roles for MNK1 and MNK2 in social and cognitive behavior through kinase-specific regulation of the synaptic proteome and phosphoproteome
MNK1/2差异化调节社交与认知行为。MNK激酶是神经元翻译的关键调节因子,但MNK1与MNK2的具体功能差异尚不明确。研究通过敲除小鼠发现两者在调节突触蛋白组和行为特征方面具有高度功能特化。该发现为自闭症等神经系统疾病的精准药物干预提供了新靶点。
自闭症, 认知障碍 | MNK1, MNK2, 突触蛋白组 | 蛋白质组学, 行为学实验
Proce, Rosalba Olga · … · Hörnberg, Hanna · · 2026/02/13
该研究由神经生物学马克斯·德尔布吕克中心Hanna Hörnberg团队完成 Molecular Psychiatry
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41380-026-03483-w
7. Defining the reference proteomes for small extracellular vesicles and non-vesicular components
蛋白质组学研究定义小胞外囊泡参考标准。胞外囊泡(EVs)异质性高且常混有非囊泡成分,导致其分子特征界定困难。研究利用密度梯度蛋白质组学分析了九千余种蛋白,区分了sEVs的真实组分与外部关联蛋白。该工作为理解EVs生物发生及货物选择提供了权威资源,有助于提升生物标志物的开发精度。
胞外囊泡(EVs) | 货物选择加载机制 | 蛋白质相关分析, 密度梯度离心
Morales-Sanfrutos, Julia · … · Muñoz, Javier · Nature Cell Biology · 2026/02/13
⭐ 该研究由蛋白质组学西班牙国家癌症研究中心Javier Muñoz团队完成
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41556-026-01878-z
代谢组学
1. Guanine nucleotides drive ribosome biogenesis and glycolytic reprogramming in acute myeloid leukemia stem cells
鸟嘌呤核苷酸驱动急性髓系白血病干细胞代谢重编程。急性髓系白血病(AML)干细胞的代谢特征及其对核糖体生成的调控机制仍待深入研究。研究揭示鸟嘌呤核苷酸通过驱动核糖体生物合成和糖效重编程维持白血病干细胞。该研究为靶向AML干细胞代谢提供了新的治疗策略。
急性髓系白血病 | 鸟嘌呤核苷酸, 核糖体生成 | 代谢组学分析
Kawano, Gentaro · … · Kikushige, Yoshikane · · 2026/02/12
该研究由血液肿瘤学九州大学Kikushige Yoshikane团队完成 Blood
原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006497125037450?dgcid=rss_sd_all
2. Marine n-3 fatty acids protect against renal function deterioration in diabetic patients by modulating lipoproteins and promoting cholesterol efflux.
海洋n-3脂肪酸通过调节脂蛋白保护糖尿病肾功能。研究结合临床队列、随机对照试验和转基因小鼠模型,证实了n-3多不饱和脂肪酸对2型糖尿病患者肾功能的保护作用。机制上,n-3脂肪酸通过Sirt1-PGC1α-ABCA1通路促进胆固醇流出并调节特定HDL亚类。该发现为糖尿病肾病的预防和治疗提供了新的营养干预策略。
糖尿病肾病 | n-3脂肪酸, 胆固醇流出, Sirt1通路 | 随机对照试验, 代谢组学
Wan Xuzhi · … · Meng Denghui · Journal of advanced research · 2026/02/10
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.jare.2026.02.001
3. Prebiotic augmented nanozyme-armored probiotics reprogramme the gut microenvironment for synchronous treatment of colitis and sepsis via antioxidant defense.
纳米酶增强益生菌同步治疗结肠炎与败血症。研究构建了一种多功能益生菌递送平台,通过协同清除ROS和调节肠道菌群来修复肠道屏障。该平台能有效抑制细胞凋亡通路并减少内毒素易位,从而缓解肠外器官损伤。该代谢增强策略为炎症性肠病及其并发症的同步治疗提供了新思路。
溃疡性结肠炎, 败血症 | ROS清除, Nrf2通路, 肠道屏障 | 纳米酶, 功能代谢组学
Sun Rui · … · Yuan Yahong · · 2026/02/10
该研究由食品科学西北大学袁亚宏团队完成 Journal of advanced research
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.jare.2026.02.015
4. Reconstruction of arginine deiminase pathway sustains a higher-energy state in mammalian cells.
重建精氨酸脱亚胺酶通路提升细胞能量状态。研究通过在CHO细胞中表达细菌ADI通路,实现了胞质内精氨酸向ATP的直接转化,从而增强了细胞能量代谢。该系统显著提高了细胞生长性能和抗体产量,并伴随糖酵解下调和高能量状态指标。该研究为优化工业生物过程提供了一种不依赖线粒体的新型能量增强范式。
细胞工厂效率 | ADI通路, ATP生成, 能量代谢 | 代谢工程, 细胞系开发
Torres Mauro · … · Dickson Alan J · · 2026/02/10
该研究由生物技术曼彻斯特大学Alan J. Dickson团队完成 Metabolic engineering
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.ymben.2026.02.004
5. Novel deuterium metabolic imaging technique reveals distinct patterns of postprandial hepatic glucose homeostasis in individuals with type 1 diabetes and healthy control individuals: a case-control study.
氘代谢成像揭示1型糖尿病肝脏葡萄糖稳态异常。1型糖尿病患者皮下注射胰岛素会干扰生理性的肝脏葡萄糖调节,但缺乏非侵入性检测手段。研究利用氘代谢成像技术,发现患者在餐后肝糖原合成受阻且内源性葡萄糖产生抑制不足。该技术为深入理解糖尿病病理生理机制及评估治疗效果提供了新工具。
1型糖尿病, 肝脏糖代谢 | 肝糖原合成, 内源性糖产生 | 氘代谢成像(DMI), 磁共振波谱
Brunasso Alessandro · … · Bally Lia · · 2026/02/13
该研究由糖尿病与代谢伯尔尼大学Bally Lia团队完成 Diabetologia
原文链接:https://doi.org/10.1007/s00125-026-06677-7
6. Erythropoiesis–inosine metabolic axis failure underlying retinal neurodegeneration in glaucoma: novel diagnoses and therapies
红细胞生成-肌苷代谢轴功能衰竭驱动青光眼视网膜变性。青光眼常被视为眼部局部疾病,但眼压控制后病情仍可能恶化。研究揭示青光眼本质上是全身性红细胞代谢异常导致的缺氧综合征,肌苷补充可恢复氧递送并阻止神经变性。该发现重新定义了青光眼的病理机制,为该病的诊断和治疗提供了新靶点。
青光眼 | 肌苷代谢, 红细胞生成, 组织缺氧 | 代谢组学, 临床队列验证
Chou, Yuyu · … · Xia, Yang · · 2026/02/13
该研究由生物化学休斯顿德克萨斯大学健康科学中心Yang Xia团队完成 Experimental & Molecular Medicine
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s12276-026-01654-x
7. PanMETAI - a high performance tabular foundation model for accurate pancreatic cancer diagnosis via NMR metabolomics
PanMETAI模型利用核磁共振代谢组学实现胰腺癌精准诊断。胰腺癌早期诊断困难导致预后极差,亟需高灵敏度的检测方法。研究开发了基于AI和血清代谢组学的PanMETAI平台,在早期胰腺癌诊断中表现出卓越的准确性。该工具为胰腺癌的快速、无创早期筛查提供了强有力的临床应用方案。
胰腺癌早期诊断 | 血清代谢标志物 | NMR代谢组学, 人工智能模型
Wu, Dan-Ni · … · Hu, Chun-Mei · · 2026/02/13
该研究由肿瘤学中央研究院Chun-Mei Hu团队完成 Nature Communications
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41467-026-69426-9
8. Cross-Platform and cross-species lipidomic profiling identifies promising biomarkers for adolescent major depressive disorder
脂质组学识别青少年抑郁症生物标志物。青少年重度抑郁症缺乏客观的诊断标志物,给临床诊疗带来了巨大挑战。研究通过跨平台和跨物种脂质组学分析,鉴定出一组具有高预测准确性的脂质面板。该成果为青少年抑郁症的早期诊断和病理机制研究提供了重要依据。
青少年重度抑郁症(MDD) | 甘油磷脂代谢, 鞘脂代谢 | 脂质组学(UPLC-MS/MS), 机器学习
Gao, Yao · … · Liu, Zhi-Fen · · 2026/02/13
该研究由精神医学山西医科大学刘志芬团队完成 Molecular Psychiatry
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41380-026-03486-7
多组学
1. Myeloid landscape profiling identifies DLBCL-specific suppressive macrophages colocalized with blood endothelial cells.
淋巴瘤微环境分析鉴定出DLBCL特异性抑制性巨噬细胞。淋巴瘤微环境中巨噬细胞的异质性及其与内皮细胞的相互作用尚未得到充分探索。研究结合单细胞测序和空间成像,发现DLBCL中存在与血管内皮细胞共定位的抑制性巨噬细胞。该发现为DLBCL的预后评估和微环境干预提供了新靶点。
弥漫大B细胞淋巴瘤 | 肿瘤相关巨噬细胞, ANXA1-FPR1/2 | 单细胞转录组测序, 空间成像
Ferrant Juliette · … · Roussel Mikael · · 2026/02/14
该研究由免疫学雷恩大学Mikael Roussel团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2024015689
2. Reduced PRC2 function causes asparaginase resistance in T-ALL by decreasing WNT pathway activity.
PRC2缺失通过抑制WNT通路导致T-ALL耐药。PRC2功能丧失与T-ALL治疗反应差相关,但具体耐药机制不明。研究整合多组学发现PRC2缺失降低WNT/STOP通路活性,增加天冬酰胺储备,从而诱导左旋天冬酰胺酶耐药。该研究揭示了表观遗传改变驱动耐药的新机制,并提出蛋白酶体抑制剂为潜在对策。
T细胞急性淋巴细胞白血病 | PRC2, WNT通路, 耐药性 | 多组学整合分析
Lefeivre Thomas · … · Bond Jonathan · · 2026/02/14
该研究由系统生物学都柏林大学Jonathan Bond团队完成 Blood advances
原文链接:https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2024015408
3. A microenvironment-determined risk continuum refines subtyping in meningioma and reveals determinants of machine learning-based tumor classification.
微环境决定的风险连续体优化脑膜瘤分型。脑膜瘤分类目前依赖分子模式,但算法解释过程仍需明确。通过多组学分析发现,肿瘤微环境的增量变化显著影响表观遗传分类和预后,挑战了传统的离散亚群模型。该研究提出了一种基于免疫组化的简易诊断法,提升了临床预测的准确性。
脑膜瘤 | 肿瘤微环境, DNA甲基化 | 多组学分析
Maas Sybren L N · … · Sahm Felix · Nature genetics · 2026/02/09
⭐ 该研究由神经病理学海德堡大学Felix Sahm团队完成
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41588-025-02475-w
4. Integrated chromatin and transcriptomic profiling reveals sex-specific mechanisms of gene regulation in hepatic nutrient responses.
肝脏营养反应中的性别特异性调控机制。性别与饮食如何交互影响染色质组织并导致肝脏代谢差异,目前仍知之甚少。研究构建了不同饮食下的小鼠肝脏染色质可及性图谱,发现性别是驱动差异的关键因素,并揭示了睾酮对PNPLA3基因的抑制作用。通过四种核心基因型模型,研究成功分离了性腺和染色体对基因调控的影响。该研究建立了全面的转录组资源,为理解代谢性疾病中的性别差异提供了分子基础。
肝脏代谢性别差异 | 染色质可及性, PNPLA3, 睾酮调控 | ATAC-seq, 转录组测序, FCG模型
Zhang Zhengyi · … · Sallam Tamer · PLoS biology · 2026/02/12
原文链接:https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3003601
5. Genomic approaches to accelerate American chestnut restoration.
基因组学方法加速美洲栗树恢复。美洲栗树因病原体侵害损失惨重,传统的抗性育种进展缓慢。研究通过比较基因组、转录组和代谢组分析,结合大规模表型鉴定,提出了高效的育种策略。该研究为建立具有抗病性和竞争力的森林恢复种群奠定了基础。
植物抗病性 | 遗传多样性 | 比较基因组学, 代谢组学
Westbrook Jared W · … · Lovell John T · Science (New York, N.Y.) · 2026/02/12
原文链接:https://doi.org/10.1126/science.adw3225
6. Engineering Halomonas for low-salt, open, and unsterile production of polyhydroxybutyrate.
盐单胞菌实现低盐开放式生物制造。研究通过基因组编辑和代谢重组,改造了蓝氏盐单胞菌,使其在极低盐度下仍能保持稳健生长和抗污染能力。多组学分析揭示了其广谱盐度适应的形态学和代谢机制,并实现了高产量的聚羟基丁酸酯(PHB)生产。该技术显著降低了工业生物制造的成本和环境负担。
生物塑料生产 | 盐度适应, 代谢重连 | 基因组编辑, 多组学分析
Sun Simian · … · Chen Guo-Qiang · · 2026/02/11
该研究由合成生物学清华大学陈国强团队完成 Trends in biotechnology
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2026.01.002
7. Siderophore-producing Bacillus and free-living nematodes are associated with soil suppressiveness to banana root-knot nematodes.
产铁载体芽孢杆菌和自由生活线虫共同抑制香蕉根结线虫病。土传病害严重威胁粮食安全,但长期连作诱导的土壤抑病性机制尚不清楚。研究发现贝莱斯芽孢杆菌是抑病性的关键分类单元,其分泌的铁载体具有杀线虫活性。该研究整合多组学方法,为实现农业可持续发展提供了生态学见解。
根结线虫病, 土壤抑病性 | 铁载体, 贝莱斯芽孢杆菌 | 宏基因组学, 代谢组学
Lu Qiaofang · … · Zuo Yuanmei · · 2026/02/12
该研究由植物营养学中国农业大学左元梅团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-69647-y
8. Lack of MDA5 delays hematopoietic aging by modulating inflammaging and proteostasis in mice.
缺失MDA5通过调节炎性衰老和蛋白质稳态延迟小鼠造血衰老。慢性炎症如何驱动造血干细胞衰老仍不清楚。研究识别出先天免疫传感器MDA5是造血干细胞衰老的重要因子,缺失MDA5可保持干细胞的静止状态和再生能力。该发现揭示了通过抑制MDA5介导的炎症来维持代谢和蛋白质稳态,从而延缓衰老的潜力。
造血干细胞衰老, 炎性衰老 | MDA5, HSF1, 蛋白质稳态 | 多组学整合分析, 骨髓移植
Bergo Veronica · … · Trompouki Eirini · · 2026/02/12
该研究由免疫生物学马克斯·普朗克研究所Eirini Trompouki团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-69424-x
9. Identification of A p300-SP1-BRD4 Transcriptional Axis as a Key Driver of AR Hyperactivation in Polycystic Ovarian Syndrome.
p300-SP1-BRD4转录轴驱动多囊卵巢综合征中雄激素受体超激活。雄激素受体(AR)的持续激活是PCOS的关键特征,但其转录调控机制尚未完全阐明。研究发现PCOS模型中p300表达及组蛋白乙酰化显著增加,p300与SP1、BRD4形成复合物共同促进AR转录。敲除p300或使用抑制剂可有效减轻AR激活及卵巢纤维化,表明靶向p300/AR轴是治疗PCOS的潜力策略。
多囊卵巢综合征 | 雄激素受体, p300, 组蛋白乙酰化 | ATAC-seq, RNA-seq
Zhu Zhengquan · … · Wang Daojuan · · 2026/02/13
该研究由疼痛科南京大学附属鼓楼医院王道娟团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
原文链接:https://doi.org/10.1002/advs.202518185
10. Endothelial TBK1 Deficiency Inhibits Endothelial-to-Mesenchymal Transition and Atherogenesis Through Suppressing PAK1/ERK1/2 Signaling.
抑制内皮TBK1通过阻断EndMT缓解动脉粥样硬化。动脉粥样硬化治疗亟需针对内皮炎症和内皮-间质转化的新疗法。研究证明TBK1通过PAK1/ERK1/2信号通路驱动EndMT,而敲除TBK1或使用抑制剂可显著减少斑块形成。该研究确定了TBK1是治疗动脉粥样硬化血管疾病的潜在靶点。
动脉粥样硬化 | TBK1, EndMT, PAK1/ERK1/2 | 蛋白质组学, RNA测序
Pu Yujie · … · Huang Yu · · 2026/02/13
该研究由生物医学香港城市大学Huang Yu团队完成 Circulation research
原文链接:https://doi.org/10.1161/CIRCRESAHA.125.326815
11. CLK1 Promotes Myeloid-Derived Suppressor Cell Trafficking and Reprograms the Tumor Microenvironment by activating Hippo/YAP signaling in Colorectal Cancer.
CLK1通过Hippo/YAP信号通路重塑结直肠癌免疫微环境。结直肠癌微环境的复杂性限制了免疫治疗效果,其调节机制尚不明确。研究揭示CLK1激活Hippo/YAP通路促进CXCL1表达,进而招募髓系来源抑制性细胞(MDSC)导致免疫逃逸。靶向CLK1轴联合抗PD1治疗可显著增强CD8+ T细胞浸润,为提升结直肠癌免疫疗效提供了新途径。
结直肠癌 | CLK1, Hippo/YAP通路, MDSC招募 | 单细胞分析, RNA测序, 免疫联合治疗
Li Peisi · … · Wang Xiaolin · · 2026/02/13
该研究由肿瘤学中山大学附属第六医院Wang Xiaolin团队完成 Cancer immunology research
原文链接:https://doi.org/10.1158/2326-6066.CIR-25-0766
12. Supplementation of L-aspartate corrects MASLD and MASH in mice by inhibiting platelet–hepatocyte interaction-mediated mitochondrial fragmentation via the ATP–P2X7–NEK7–DRP1 axis
L-天冬氨酸通过抑制血小板互作改善脂肪肝。代谢相关脂肪性肝病(MASLD)患病率高,但目前缺乏有效的治疗药物。研究发现L-天冬氨酸通过ATP-P2X7轴抑制血小板激活,进而减轻肝细胞线粒体碎片化和脂质堆积。该研究揭示了血小板在脂肪肝进展中的关键作用,并证实L-天冬氨酸是潜在的治疗药物。
MASLD/MASH | 血小板-肝细胞相互作用, 线粒体碎片化 | 转录组与代谢组联合分析, L-天冬氨酸补充
Cao, Wen-Jie · … · Huang, Ling · · 2026/02/13
该研究由代谢病学武汉大学黄玲团队完成 Experimental & Molecular Medicine
原文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s12276-026-01648-9
生物信息软件
1. Leveraging probabilistic forecasts for dengue preparedness and control: The 2024 Dengue Forecasting Sprint in Brazil.
概率预测助力巴西登革热疫情应对。巴西登革热病例的空前增长对公共卫生预警系统提出了更高要求。IMDC24挑战赛汇集了多个国际团队,利用机器学习和统计模型生成了针对2024-2025季节的预测。该集成模型已被巴西卫生部门采用,为疫情规划和资源分配提供了科学依据。
登革热流行 | 流行病传播动力学 | 机器学习, 概率预测模型
Araujo Eduardo Correa · … · Coelho Flávio C · · 2026/02/12
该研究由应用数学巴西热图利奥·瓦加斯基金会Flávio C Coelho团队完成 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2508989123
2. SynLiTS: Phase Prompting-Driven Diffusion Synthesis and Context-Aware Fusion for Unaligned Liver Tumor Segmentation.
基于扩散合成的肝肿瘤分割新框架。多期CT影像对肝癌诊断至关重要,但相位未对齐和高质量数据集匮乏限制了分割性能。研究提出SynLiTS框架,利用相位提示驱动的扩散模型合成完美对齐的多期肝肿瘤CT数据,并结合上下文感知融合模块进行训练。该方法在多个数据集上显著优于现有技术,有效解决了数据稀缺问题。该研究为多期医学影像分析提供了高效的合成与分割方案。
肝肿瘤分割 | 多期CT影像融合 | 扩散模型(Diffusion Model), 深度学习
Chen Shiyun · … · Tang Xiaoying · · 2026/02/12
该研究由生物医学工程南方科技大学唐晓颖团队完成 IEEE transactions on medical imaging
原文链接:https://doi.org/10.1109/TMI.2026.3663583
3. Benchmarking in vivo and in vitro gene co-expression networks enables efficient β-like cell differentiation.
基因共表达网络基准测试优化β样细胞分化。干细胞衍生胰岛的分化效率受限于对人类胚胎胰腺内分泌谱系规范机制的理解不足。研究重建了人类胚胎基因共表达网络,通过对比发现分化偏差并设计出更高效的β样细胞生产方案。该研究为糖尿病细胞疗法提供了更精准的分化策略,提升了干细胞衍生胰岛的质量。
糖尿病, 胰岛分化 | 基因共表达网络, 谱系规范 | 干细胞分化, 生物信息学分析
Liu Jifeng · Grapin-Botton Anne · · 2026/02/11
该研究由发育生物学马克斯·普朗克研究所Anne Grapin-Botton团队完成 Developmental cell
原文链接:https://doi.org/10.1016/j.devcel.2026.01.004
4. OmiGA for ultra-efficient molecular quantitative trait loci mapping.
OmiGA工具实现超高效的分子数量性状位点映射。molQTL映射是理解复杂性状调节机制的关键,但现有工具在处理复杂亲缘关系时效率和效力不足。研究开发了基于线性混合模型的OmiGA工具包,显著提升了发现效力和计算效率。该工具推荐用于人类及家畜等具有复杂亲缘关系群体的遗传分析。
复杂性状遗传基础 | 基因表达调节, molQTL | 线性混合模型, 生物信息学工具
Teng Jinyan · … · Zhang Zhe · · 2026/02/12
该研究由动物遗传育种华南农业大学张哲团队完成 Nature communications
原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-68978-0
5. NanoLoop: A Deep Learning Framework Leveraging Nanopore Sequencing for Chromatin Loop Prediction.
NanoLoop实现纳米孔测序预测染色质环。染色质环对基因调节至关重要,但现有预测方法在利用长读段测序优势方面存在局限。本研究开发了深度学习框架NanoLoop,利用纳米孔测序数据同时检测序列和甲基化模式来预测染色质相互作用。该工具为理解表观遗传修饰与三维基因组结构的复杂关系提供了新视角。
三维基因组结构 | 染色质环, DNA甲基化 | 纳米孔测序, 深度学习
Huang Wenjie · … · Li Min · · 2026/02/13
该研究由计算机科学中南大学Li Min团队完成 Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
原文链接:https://doi.org/10.1002/advs.202517692
6. Unlocking Multiscale Allosteric Mechanisms: Advanced Computational Strategies for Drug Discovery.
计算策略加速多尺度变构药物研发。系统识别变构位点并解析其复杂的调节路径是当前药物发现面临的重大挑战。本综述总结了分子动力学模拟、机器学习等计算方法在揭示蛋白质变构机制中的应用。计算与实验的结合将显著加速新型变构疗法的理性设计与优化。
变构调节机制 | 变构位点, 信号传导网络 | 分子动力学模拟, 机器学习
Zhu Ruidi · … · Zhang Jian · · 2026/02/13
该研究由药物研发上海交通大学医学院Zhang Jian团队完成 Medicinal research reviews
原文链接:https://doi.org/10.1002/med.70036
7. Pocket-Based Generative Diffusion Model Accelerates Potent Influenza A Hemagglutinin Inhibitor Discovery.
基于口袋的生成式扩散模型加速流感病毒抑制剂发现。深度生成模型在药物发现中常难以平衡靶标亲和力与结构合理性。研究开发了双条件扩散模型DCDM,成功优化出亲和力提升26倍的流感血凝素抑制剂C2e。该模型证明了AI在加速现实世界药物开发和优化先导化合物方面的巨大价值。
流感病毒感染 | 血凝素(HA) | 生成式扩散模型, AI药物设计
Gai Wenrui · … · Li Dehai · · 2026/02/13
该研究由海洋药物中国海洋大学Li Dehai团队完成 Journal of medicinal chemistry
原文链接:https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c03787
8. AI Co-Scientists Move to the Front Lines of Cancer Research.
AI“共同科学家”正深度参与癌症研究前沿。人工智能系统已从单纯的数据分析演变为能够生成药物候选物和指导实验设计。综述指出新兴平台正直接参与实验室工作流,标志着癌症研发模式的重大转变。AI增强的发现过程将贯穿整个肿瘤学研发管线,显著提升研发效率。
癌症研发管线 | 药物生成, 靶点优先化 | 人工智能, 自动化实验室
Cancer discovery · 2026/02/12
原文链接:https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-NW2026-0015
9. TiRank prioritizes phenotypic niches in tumor microenvironment for clinical biomarker discovery
TiRank框架识别肿瘤微环境关键空间位点。在复杂的肿瘤微环境中识别具有临床意义的细胞亚群和空间位点仍具挑战。研究开发了TiRank分析框架,通过整合单细胞与空间转录组数据精准预测药物敏感性。该工具为癌症生物标志物发现和精准肿瘤学研究提供了有力支持。
肿瘤微环境, 药物敏感性 | 空间生态位, 癌症相关成纤维细胞 | 单细胞转录组, 空间转录组, 迁移学习
Lin, Yuxiang · … · Tong, Mengsha · · 2026/02/13
该研究由生物信息学厦门大学童蒙莎团队完成 Genome Medicine
原文链接:http://dx.doi.org/10.1186/s13073-026-01604-2
声明:本文使用了AI进行翻译和总结