Nintedanib esylate

在国产创新药的长跑赛道上，没有‘弯道超车’，只有‘耐力+爆发’。而最近，一家扎根海南、名字里就带着‘海’字的药企——海南海药（000566），正悄悄把两枚自主研发的‘分子炸弹’推上临床冲刺线：氟非尼酮（Fluvenipenone）与派恩加滨（Painegabin）。它们不是概念炒作，也不是PPT新药；它们是历经十年靶点深耕、结构优化与毒理打磨后，真正迈入人体验证阶段的硬核候选者。 不是‘又一个抗纤维化药’，而是‘换代式阻断’ 氟非尼酮常被简称为‘抗肺纤维化的潜力股’，但这种归类太温柔了。它并非简单模仿吡非尼酮或尼达尼布——那两位前辈靠‘多靶点抑制’缓解病情，却难阻疾病底层驱动。氟非尼酮的特别，在于它精准锁定了TGF-β1信号通路中一个此前被长期忽视的‘开关蛋白’：Smad7泛素化调控节点。通俗地说，别人在修漏水的水管，它直接换了水阀设计图。早期I期数据显示，其肺组织药物浓度达血浆的8.3倍，且未见明显光敏反应——这正是吡非尼酮临床应用中最令人头疼的副作用之一。 派恩加滨：从‘镇痛’到‘神经修复’的认知跃迁 如果说氟非尼酮瞄准的是‘器官结构崩塌’，那派恩加滨则直击‘神经功能瓦解’。它不是传统阿片类或NSAIDs的改良版，而是一款靶向GPR17受体的正向变构调节剂。这一靶点近年被证实与少突胶质细胞再生密切相关——意味着它可能不只是‘止痛’，更是在为多发性硬化、化疗后周围神经病变等‘不可逆损伤’争取修复窗口。IIa期试验中，24名糖尿病周围神经痛患者接受治疗12周后，神经传导速度平均提升17%，且疼痛评分下降幅度显著优于安慰剂组（p<0.001）。这不是数据魔术，而是机制突破的回响。 海南自贸港：不止是政策红利，更是‘临床-制造-出海’闭环加速器 外界总爱强调海南的税收优惠与注册便利，但海南海药真正的棋眼，在于把自贸港‘一线放开、二线管住’的制度设计，转化为医药创新的物理加速带：临床样本可经特殊通道直送新加坡或横琴第三方GLP实验室；CDMO产线同步对接RCEP成员国准入标准；甚至临床试验用药品的跨境运输审批，已压缩至72小时内完成。这不是‘借东风’，而是把政策织进研发毛细血管里。 当然，千亿市值不是口号喊出来的。它需要氟非尼酮在III期拿下IPF（特发性肺纤维化）一线治疗地位，需要派恩加滨突破CNS药物‘血脑屏障+代谢快’的双重魔咒，更需要细胞治疗管线在2025年前交出首个IND批件。但当一家企业把‘临床进度’当作季度KPI来通报，而不是藏在年报附注里——你就知道，故事的主角，已经从幻灯片走到了病房门口。返回搜狐，查看更多

药物重定位（drug repositioning）借助公共生物测定、转录特征、靶点预测与知识图谱，可在虚拟层面快速收敛候选；分子对接、药效团建模与生理药代动力学（PBPK）模拟进一步提供结合构象与给药途径假设；患者转录组与细胞实验则用于检验候选化合物是否在纤维化相关基因与表型上产生符合预期的变化。 近期，发表于 Computational and Structural Biotechnology Journal（中科院大类生物学 3 区、小类生化与分子生物学 3 区，IF=4.1，2024 JCR；JCR Q2）的一项计算药理学结合体外验证研究，整合 5 个 PubChem 纤维化相关高通量生物测定（509,527 个化合物）、LINCS L1000、SwissTargetPrediction 与内部知识图谱 UKS，经药效团建模、Glide XP 分子对接、PAINS 过滤、ADME/PBPK 模拟，结合 IPF 患者 RNA-seq 与 TGF-β 刺激的人肺泡上皮细胞实验，识别出 哇巴因（ouabain）与 堆心菊素（helenalin）两个候选化合物；其中堆心菊素 ADME 表现更优，被作者列为最适合后续评估的候选。 这项研究最值得拆解的，是它把"数据驱动筛选 → 多源靶点收敛 → 结构与药代建模 → 患者转录组锚定 → 细胞实验验证"串成端到端工作流，并明确标注了每一层证据的强度边界。 真正开启不学R语言时代！！！关注本号私信“资料”两字，免费领取＞5篇0代码云平台复现5-15分公共数据库挖掘SCI全文教程！轻松入门生信分析！秒变生信分析大神！ 新鲜出炉！今天给大家深度剖析一篇2026年发表在《Computational and Structural Biotechnology Journal》上的文章，题目为：整合方法在药物重定位中的应用：哇巴因和海伦纳林作为肺纤维化潜在候选药物 Integrated Approaches in Drug Repositioning Highlight Ouabain and Helenalin as Potential Drug Candidates for Pulmonary Fibrosis. 本研究以肺纤维化为模型疾病，构建了一套整合高通量筛选、知识图谱、虚拟筛选、分子对接、药代动力学建模与体外验证的药物重定位流程，最终锁定哇巴因和海伦纳林两个候选化合物。 影响因子：4.8 发表期刊：Computational and Structural Biotechnology Journal 团队成员合影（位于上海陆家嘴中心，可随时预约参观） 向下滑动查看更多 CNSknowall 平台 Pubmed+AI 快速提炼研究亮点·研究思路·研究结果·研究结论 研究亮点 1. 端到端药物重定位工作流：从 509,527 个化合物的高通量活性出发，串联知识图谱靶点、药效团、对接、ADME/PBPK、患者转录组与细胞实验，形成可复用的候选识别框架。 2. 收敛出两个多靶点候选：堆心菊素在全部生物测定中显示活性，哇巴因在纤维化相关通路中活性显著；二者可同时靶向多个纤维化相关靶点，契合纤维化多通路交织的病理特点。 3. 多源证据互相印证：HTS 活性、UKS 化合物-基因关联、LINCS L1000 转录特征与 SwissTarget 预测在 NR3C1 等核心节点上方向一致。 4. 药代模拟提示吸入途径：PBPK 模拟提示吸入给药可实现直接肺吸收并降低全身暴露；哇巴因口服 <1%、静脉 16%、吸入 67%，堆心菊素口服 1%、静脉 16%、吸入 69%，两药吸入途径的模型可及分数支持这一方向假设。 5. 体外初步功能信号：在 TGF-β 刺激的肺泡上皮细胞中，堆心菊素下调 FN1、IL1A、IL1B、MMP7、MMP9 等促纤维化/炎症基因并部分逆转 TGF-β 效应，表现出 EMT 抑制方向；ADME 分析显示堆心菊素是最适合后续评估的候选。 核心创新点 1. 以 ≥4/5 测定活性为硬筛选：要求化合物在 CFTR、NF-κB、IL-1β、TGF-β、TNF-α 多个纤维化相关测定中同时活跃，优先保留多靶点潜力分子。 2. 三类证据源正交校验：UKS 为主靶点来源，LINCS L1000 转录特征与 SwissTarget 概率预测作为独立正交验证，降低单一数据库偏差。 3. 结构层面双工具结合：Phase 药效团提取活性配体共同特征并虚拟筛选相似物，Glide XP 对接给出候选与 FDA 获批药在关键靶点上的结合打分对照。 4. 成药性前置评估：PAINS 警报、胶体聚集物风险、Lipinski 五规则、BCS/ECCS、CYP 代谢与 PBPK 三途径模拟在进入湿实验前完成排雷。 5. 患者转录组锚定靶点：以 IPF 患者成纤维细胞、BAL 与活检 RNA-seq 核对候选靶向基因在真实患者组织中的失调状态，再进入细胞实验验证。 研究背景 肺纤维化是全球医疗负担较重的一组进行性肺病，IPF、COPD 与 CF 虽病因不同，但共享肺泡上皮反复损伤、TGF-β 过度信号、炎症因子放大与细胞外基质沉积的共同通路。TGF-β 由 II 型上皮细胞与巨噬细胞等释放，适度信号参与伤口愈合，持续高表达则驱动纤维化；IL-1β、TNF-α 与 NF-κB 通路参与炎症放大，CFTR 功能异常在 IPF 与 COPD 中也有报道。现有 FDA 药物尼达尼布、吡非尼酮、伊伐卡托、度普利尤单抗等分别作用于特定靶点，难以覆盖纤维化的多通路交织特征；新化学实体研发周期长、失败率高，药物重定位因此成为加速候选发现的现实路径。既往重定位研究常止步于对接打分或单一数据库预测，缺少数据驱动靶点优先级、药代成药性评估、患者转录组锚定与细胞功能验证的端到端串联；同时，结合亲和力并不直接等同于靶点疗效，广谱结合还伴随选择性与脱靶风险。基于这些缺口，本研究构建了覆盖活性筛选、多库靶点收敛、结构建模、PBPK 模拟、患者转录组与体外实验的整合流程，在公开数据与细胞模型中识别并初步刻画两个肺纤维化候选化合物。 研究思路 1. 高通量活性初筛：汇总 5 个纤维化相关 PubChem 生物测定的 509,527 个化合物活性标签，以 ≥4/5 测定活跃为主要筛选条件，得到候选池。 2. 多库靶点收敛：UKS 知识图谱经 Fisher 精确检验与 FDR 校正提取显著富集的化合物-基因关系，LINCS L1000 与 SwissTarget 正交补充，确定 NR3C1 等核心节点。 3. 药效团与对接：构建候选药效团模型并虚拟筛选相似物；SiteMap 定位结合口袋，Glide XP 对候选与 FDA 获批药在关键靶点上打分对照，PAINS 与聚集物风险过滤。 4. ADME 与 PBPK 模拟：估算理化性质、血浆蛋白结合、口服吸收风险、CYP 代谢、Vd 与 BCS 分类，ACAT/PBPK 模型比较口服、静脉与吸入途径的吸收与可及分数。 5. 患者转录组与体外验证：GEO 中 IPF 患者 RNA-seq 核对靶点失调；TGF-β 刺激人肺泡上皮细胞，检测 TEER、活力、细胞毒性与基因表达变化，评估候选的初步功能方向。 研究结果 1. 高通量活性初筛收敛候选池：5 个纤维化相关 PubChem 生物测定共覆盖 509,527 个独特化合物，22,916 个在至少一个测定中被分类为活性；以 ≥4/5 测定活跃为主要筛选条件，最终识别出 24 个在纤维化相关测定中活跃的化合物。 2. 多库靶点收敛到 NR3C1 等核心节点：UKS 知识图谱经 Fisher 精确检验与 FDR 校正（P<0.05），活性化合物更常结合 NR3C1、SERPINA6、NQO1、NXA1；其中 NR3C1（糖皮质激素受体）为跨测定显著靶点，参与调控肌成纤维细胞活化、细胞外基质合成与促纤维化信号。堆心菊素靶向 NR3C1、NOS2、TERT、MMP2、MMP8；哇巴因靶向 TNF、FGF、VEGF、MMP1、MMP7。 3. 药效团建模与对接打分对照获批药：候选化合物与吡非尼酮、伊伐卡托、尼达尼布、地塞米松等 FDA 获批药在关键靶点上进行 Glide XP 对接对照；哇巴因与堆心菊素均未触发 PAINS 警报，经 Aggregator Advisor 判定为胶体聚集低风险；二者各携带一个 Brenk 结构警报（哇巴因为强心苷骨架，堆心菊素为 α-亚甲基-γ-内酯 Michael 受体）。 4. ADME 与 PBPK 模拟提示吸入途径：堆心菊素分子量 262.30 g/mol、口服吸收风险 0.00、ECCS Class 2、符合 Lipinski 五规则；哇巴因分子量 584.66 g/mol、口服风险 5.00、Class 4、违反 Hb/NO/MW 阈值。肺沉积模拟：哇巴因口服 <1%、静脉 16%、吸入 67%；堆心菊素口服 1%、静脉 16%、吸入 69%，吸入途径可提高局部浓度并延长半衰期。 5. 患者转录组核对靶点失调：基于 GEO 中 IPF 患者成纤维细胞、支气管肺泡灌洗液（BAL）与全活检 RNA-seq，堆心菊素、哇巴因与庆大霉素 C 的靶向基因在健康人与 IPF 患者之间存在差异表达，每类样本最多展示 40 个校正后 P 值（Padj）<0.05 的差异表达基因（DEG）。 6. 体外屏障与活力处于亚致死浓度：反复 TGF-β 10 ng/ml 使细胞活力降低约 10%；第 5 天 T+O_10 组跨上皮电阻（TEER）显著高于 TGF-β 单独组（P<0.05），且与载体组（VEH）无差异；H_3 与 T+H_3 组活力较 VEH 高约 25%；高浓度吡非尼酮出现显著细胞毒性，TGF-β 单独及所有堆心菊素、哇巴因组对细胞毒性无显著影响；除 T+P_0.4（第 5 天）外，各组平均 TEER 均 ≥1,000 Ω·cm²，提示功能性屏障保留。 7. 暴露后基因表达方向存在分化：TGF-β 单独显著上调 FN1、MMP9、COL4A1、TNF，下调 CCND1、IL1B，与纤维化患者样本一致；堆心菊素联合 TGF-β 浓度依赖下调 FN1、IL1A、IL1B、MMP7、MMP9、VEGFA，部分逆转 TGF-β 效应；哇巴因联合 TGF-β 下调 ACTG2、FBLIM1、VIM、CALD1，但上调 IL1A、IL1B、CXCL8 并浓度依赖富集凋亡通路；吡非尼酮显著改变的基因较少，联合 TGF-β 浓度依赖下调 CCN2、TAGLN，上调 MFAP4。 研究结论与讨论 本研究证明了整合生物测定、公共数据库、对接分析与药代动力学模拟可加速肺纤维化新治疗候选的识别。哇巴因与堆心菊素在纤维化相关通路中表现出显著活性，与 FDA 获批治疗药物处于可比的活性水平；二者同时靶向多个纤维化相关靶点的能力，在应对纤维化病理的多面性方面可能优于单靶点现有治疗。两个化合物均显示出良好的生物利用度潜力；在肺泡上皮细胞中，堆心菊素调控促纤维化基因表达的能力尤为突出，且 ADME 分析更安全，被作者列为最适合后续评估的候选。该方法学框架同样可延伸到其他复杂疾病的候选药物发现。 局限性：① 计算方法本身存在固有局限，不能完全捕捉 IPF 病理复杂性；实验药代与药效数据有限，限制了机制解释与化合物药理行为的全面表征。② 广谱强结合可能带来选择性担忧，promiscuous（混杂）结合谱常伴随脱靶毒性风险。③ 本研究未开展分子动力学模拟、MM-GBSA（分子力学-广义玻恩表面面积）重打分与诱导契合对接等高级结构分析，未来需细化预测结合构象并验证对接结果。④ 单一细胞系模型限制了体外结果的外推性，需纳入其他纤维化相关细胞类型，并在蛋白水平验证胶原沉积、细胞外基质产生等功能终点，以支撑转录层面发现。⑤ 堆心菊素剂量为理论设定（与哇巴因取同剂量，缺乏可用药代数据），限制结果解释；哇巴因未达到最优 ADME 标准；体外体系缺少代谢酶。⑥ 哇巴因通过抑制 Na⁺/K⁺-ATPase 带来已知心脏毒性与窄治疗窗，吸入途径低浓度下或可控制全身暴露，但在得出其作为新治疗药物的结论前，仍需纤维化特异性研究进一步验证。 具体研究结果 1. 端到端候选发现工作流 研究以 5 个纤维化相关高通量生物测定为起点，先完成化合物活性标签汇总与 ≥4/5 测定活跃筛选；随后进入 UKS 知识图谱靶点提取、LINCS L1000 转录特征与 SwissTargetPrediction 正交验证；结构层面依次完成配体制备、Phase 药效团建模与虚拟筛选、SiteMap 结合位点定位、Glide XP 对接、PAINS 与胶体聚集物风险过滤；成药性层面完成 ADMET Predictor 理化与代谢估算、BCS/ECCS 分类与 ACAT/PBPK 三途径模拟；最后以 GEO 中 IPF 患者 RNA-seq 锚定靶点失调，并在 TGF-β 刺激的人肺泡上皮细胞中完成 TEER、活力、细胞毒性与基因表达验证。整条链条把传统 HTS 无法覆盖的化学与生物学空间纳入同一优先级框架。 图 1 肺纤维化候选药物发现工作流。流程图自上而下展示：5 个 PubChem 纤维化相关生物测定（CFTR 校正剂、NF-κB 抑制剂、IL1B 抑制剂、TGF-β 抑制剂、TNF-α 抑制剂）的高通量活性初筛 → UKS/LINCS L1000/SwissTargetPrediction 多源靶点收敛 → 药效团建模、虚拟筛选与分子对接 → PAINS 与聚集物风险过滤 → ADME/PBPK 成药性与给药途径模拟 → IPF 患者 RNA-seq 靶点核对 → TGF-β 刺激肺泡上皮细胞的屏障、活力与转录验证。 2. 哇巴因与堆心菊素的多靶点药理互作网络 在多源证据收敛后，研究绘制了两个候选化合物与靶基因之间靶向、抑制、激活三类互作的示例网络。堆心菊素关联 NR3C1、NOS2、TERT、MMP2、MMP8 等节点，哇巴因关联 TNF、FGF、VEGF、MMP1、MMP7 等节点；网络同时纳入 CXCL8、NOS3、JUN 等分泌信号因子。NR3C1 作为跨测定显著靶点，在活性化合物与非活性化合物之间结合频率差异经 FDR 校正后达到显著水平，支持其作为纤维化相关核心调控节点的地位。相似物检索中，堆心菊素最相似化合物包括 2,3-二氢堆心菊素等衍生物，哇巴因相似物包括 acolongifloroside 与 desglucocheirotoxin；高排名对照候选为庆大霉素 C（gentamicin C），因其 ADME 性质不佳且已商业化，未进入后续深入分析。 图 2 哇巴因与堆心菊素的多靶点药理互作。图中以网络形式展示两个候选化合物与基因之间靶向（targeting）、抑制（inhibiting）、激活（activating）三类关系的示例；节点为候选靶向的纤维化相关基因与信号因子，连线方向与类型对应化合物对基因的作用关系。该网络用于直观呈现两药"多靶点同时作用"的药理学特征，而非直接证明体内结合。 3. 药效团特征与分子对接打分 药效团建模提取两个候选分子的共同三维特征与亚结构，用于 UKS 化合物库的虚拟筛选；结构对接阶段，靶点覆盖 CFTR、FGF1、FGF2、IL-1β、NR3C1、VEGFA、PDGF、TNF-α、TGF-βRI，蛋白结构取自 Protein Data Bank、UniProt 与 AlphaFold（含 5UAK、Q6I6M7、P09038、1ITB、7KW7、AF-P15692-F1、AF-P04085-F1、2AZ5、1B6C；NF-κB 采用 Matthias Stein 模型）。SiteMap 以每个报告位点 15 个位点点点位、距最近位点 4 Å 裁剪确定结合口袋，PROPKA 确定质子化状态、OPLS-2005 力场能量最小化，Prime 补全缺失残基，Glide XP 输出对接打分与结合姿态。 图 3A 哇巴因与堆心菊素的药效团特征。三维药效团模型标示氢键供体、氢键受体、疏水区域、芳香特征等活性必需空间排布，用于刻画两个候选分子与靶点结合相关的共同结构特征，并作为虚拟筛选的形状/特征匹配依据。 图 3B 候选化合物与 FDA 获批药的对接打分对照。行包括哇巴因、堆心菊素、庆大霉素 C 三个候选，以及吡非尼酮、伊伐卡托、尼达尼布、地塞米松四个对照药物；列为关键靶蛋白及其不同结合位点（S=site）；颜色深浅表示 Glide XP 对接打分，灰色表示未测试。该图用于在同一打分体系下横向比较候选与现有药物的结合姿态倾向；结合亲和力不直接等同于靶点疗效。 4. IPF 患者转录组中的靶点失调核对 研究从 GEO 获取 IPF 患者成纤维细胞、支气管肺泡灌洗液（BAL）与全活检三类样本的转录组数据，FastQC 做质量控制，Cutadapt 修剪读段，Hisat2 以 GRCh38/hg38 为参考完成比对。在健康人与 IPF 患者之间，核对堆心菊素、哇巴因与庆大霉素 C 靶向基因是否存在差异表达；图中每类样本最多展示 40 个 Padj<0.05 的 DEG，完整数据见补充表 S8。该环节的作用是在细胞实验前，确认候选靶点在真实患者纤维化组织中处于失调状态，缩小后续验证范围。 5. ADME 成药性与给药途径模拟 ADMET Predictor v11 估算了分子量、未结合血浆蛋白分数、口服吸收风险评分、CYP 代谢酶、表观分布容积（Vd）与 ECCS/BCS 分类。堆心菊素（MW 262.30 g/mol，未结合 56.48%，口服风险 0.00，CYP3A4，Vd 1.43 l/kg，Class 2，符合五规则）成药性特征明显优于哇巴因（MW 584.66 g/mol，未结合 59.62%，口服风险 5.00，CYP3A4，Vd 0.79 l/kg，Class 4，违反 Hb/NO/MW）；对照药物中庆大霉素 C 口服风险 5.80、Class 4，尼达尼布违反 MW 阈值，伊伐卡托与吡非尼酮符合五规则。PBPK 以健康 30 岁美国男性为基础模型，ACAT 模型模拟口服、静脉与吸入途径：哇巴因肺沉积口服 <1%、静脉 16%、吸入 67%；堆心菊素口服 1%、静脉 16%、吸入 69%，两药吸入吸收与可及性相近，吸入途径可实现直接肺吸收并降低全身暴露。BCS 比较显示堆心菊素通透性优于伊伐卡托与尼达尼布、接近吡非尼酮；哇巴因通透性更低，溶解度与堆心菊素、吡非尼酮相近。 6. 体外屏障完整性、细胞活力与毒性 体外模型采用 CI-huArlos 人肺泡上皮细胞（男性，第 8 代，Inscreenex #INS-CI-1031，德国布伦瑞克）。先以屏障完整性、细胞活力与 RNA 产量为指标完成浓度摸索，确定三个亚致死浓度：哇巴因 5–10 nM（T+O_5–10）、堆心菊素 0.5–3 μM（T+H_0.5–3）、吡非尼酮 0.05–0.4 mg/ml（T+P_0.05–0.4），与 TGF-β1 10 ng/ml 联合重复暴露 5 天。TEER 反映屏障功能，RealTime-Glo MT 检测细胞活力，CellTox Green 检测细胞毒性；每组 5–8 个生物学重复（VEH T1 组 n=12，T+P_0.4 在第 5 天 A/B 实验各剩 1 个样本）。结果显示，反复 TGF-β 使活力下降约 10%；第 5 天 T+O_10 的 TEER 显著高于 TGF-β 单独组（P<0.05）且与 VEH 无差异；堆心菊素各组 TEER 与 VEH 无差异；T+P_0.4 组 TEER 较 VEH 显著降低（P<0.05）；H_3 与 T+H_3 活力较 VEH 高约 25%；高浓度吡非尼酮显著细胞毒性，TGF-β 单独及所有堆心菊素、哇巴因组对细胞毒性无显著影响；除 T+P_0.4（T5）外，各组平均 TEER ≥1,000 Ω·cm²。 7. 暴露后炎症与 EMT 相关基因表达谱 在屏障与活力确认处于亚致死浓度后，研究检测了炎症与上皮-间质转化（EMT）相关基因面板的表达变化，以 TGF-β 10 ng/ml 处理组作为对照，Padj<0.05 的变化以"+"标注。与 VEH 相比，TGF-β 单独显著上调 FN1、MMP9、COL4A1、TNF，下调 CCND1、IL1B，与纤维化患者样本方向一致；哇巴因联合 TGF-β 后下调 ACTG2、FBLIM1、VIM、CALD1，上调 IL1A、IL1B、CXCL8，凋亡通路呈浓度依赖富集；堆心菊素随浓度升高下调 FN1、IL1A、IL1B、MMP7、MMP9、VEGFA，提示部分逆转 TGF-β 对这些基因的诱导效应，表达变化方向指向 EMT 抑制；吡非尼酮显著改变的基因数量少于两个候选，联合 TGF-β 后浓度依赖下调 CCN2、TAGLN 并上调 MFAP4。 图 7 上皮细胞暴露后基因表达 log2 倍数变化热图。热图以蓝到红色阶表示上调/下调幅度，列分别为 TGF-β（T）、哇巴因（O）、堆心菊素（H）、吡非尼酮（P）各浓度暴露组（每组 2–4 个生物学重复）；TGF-β 10 ng/ml（T）为对照；校正后 P 值 Padj<0.05 的显著变化以"+"标注。图中可读方向：堆心菊素组对促纤维化与炎症基因呈下调趋势，哇巴因组伴随部分炎症因子上调与凋亡通路富集，吡非尼酮显著差异基因较少。 术语备注 HTS，高通量筛选（high-throughput screening）；UKS，内部化合物-基因知识图谱；LINCS L1000，基于 L1000 转录特征的公共扰动谱平台；SwissTargetPrediction，概率性靶标预测工具；PAINS，泛测定干扰化合物警报；PBPK，生理药代动力学模型；ACAT，隔室吸收与转运模型；BCS/ECCS，生物药剂学分类系统/扩展清除分类系统；TEER，跨上皮电阻；EMT，上皮-间质转化；NR3C1，糖皮质激素受体；Glide XP，高精度对接模块；SiteMap，结合位点定位工具；Phase，药效团建模与数据库筛选工具；FDR，错误发现率；DEG，差异表达基因；BAL，支气管肺泡灌洗液。 总结 本研究在公开化合物库与公共转录组基础上，构建了一条从高通量活性、多库靶点、结构对接、ADME/PBPK 模拟到患者转录组与细胞实验的端到端药物重定位工作流，识别出哇巴因与堆心菊素两个肺纤维化候选化合物；堆心菊素在成药性特征与体外促纤维化基因调控方向上表现相对更优，被列为后续优先评估对象。需要明确的是，以上均为计算预测与初步体外信号，尚不能等同于临床疗效；候选化合物的选择性、体内药效、给药途径安全性与剂量窗，仍需经其他细胞类型、动物模型、蛋白水平功能终点与安全性研究进一步验证。 更多结果和补充图表: DOI：10.34133/csbj.0193 不想做实验，没数据，还想要快速发表文章，没问题的！公共数据库就是我们的数据宝藏！没思路不用担心，作为专业的生信团队，我们很乐意为您效劳，提供研究路线设计和数据挖掘分析，扫码联系我们吧！ 长按二维码关注我们，用最短的时间和最高的效率学习更多数据分析方法! 扫描上方二维码或登录平台官网后添加CNSknowall客服微信咨询！官网地址：https://cnsknowall.comCNSknowall：24年最新问世的遥遥领先的颠覆性科研数据（0代码生信+统计学）分析平台，同时含有机制图模块（原创3000多素材和机制图模板）+AI一键生成高质量比国自然标书初稿+汉化版Pubmed融合Deepseek高效筛选目标文献同时一键提炼全文核心创新点+SCI文献例句/语料检索模块+全文翻译+文献求助+图片查重+期刊查询+OPenAI官方GPT接口，＞500款CNS级别图表皆可一秒内一键出图，登录即秒变数据分析大神，体验前所未有的便捷数据分析之旅，开启科研天骄之路！ 可向下滑动发掘更多科研秘籍!