武汉理工大学化学化工与生命科学学院秦华利课题组Bioorganic Chemistry综述:Chemical and biology of sulfur fluoride exchange (SuFEx) click chemistry for drug discovery。
武汉理工大学化学化工与生命科学学院秦华利教授综述了磺酰氟类化合物在各种治疗应用领域的最新研究成果。我相信,这篇综述文章将为大家提供新的思路,有助于研发出毒性更低、效果更佳的药物。
01
引言
以磺酰氟为基础的活性探针已成为化学生物学领域中非常有用的工具。由于磺酰氟在生理条件下的反应性与稳定性之间具有理想的平衡,这一官能团常被用作共价蛋白抑制剂和生物探针(见图 1)。最近,人们也在积极探索芳香族磺酰氟在有机化学中的新应用,这些应用包括用作氟化试剂、进行F放射性标记,以及利用硫交换“点击化学”反应来合成磺酰化化合物。
图 1. 一些具有代表性的生物活性磺酰氟衍生物。
磺酰氟能修饰大多数氨基酸侧链,但其与蛋白质的反应需要特定环境,所以只有当它结合到蛋白质的活性位点或结合口袋中时才会发生反应。这意味着磺酰氟不是随机、无差别地修饰蛋白质,而是具有靶向选择性。此外,芳基结构通过共轭效应稳定了磺酰氟基团,降低了其亲电活性,使其在含水生理环境中更耐水解。将磺酰氟基团连接到目标生物分子上,对分子整体亲脂性影响很小,不会显著改变分子的细胞通透性和其在生物体内的分布行为,因此磺酰氟是一个理想的生物共价弹头。
此外,磺酰氟结构单元是生物支架中的首选结构,其典型代表是广泛使用的(2-氨基乙基)苯磺酰氟(AEBSF)、其盐酸盐Pefabloc®,以及苯甲酰甲磺酰氟(PMSF)作为丝氨酸蛋白酶抑制剂,在细胞裂解液的制备中被广泛应用(图2)。磺酰氟还被用作化学生物学探针,用于靶向亲核氨基酸;例如,50-氟磺酰苯酰50-腺苷(FSBA)是一种ATP结合蛋白抑制剂,可共价结合到赖氨酸残基上。磺酰氟在氟化试剂方面也展现出良好的应用前景特别是Doyle等人近期的研究表明,2-吡啶磺酰氟(PyFluor)具有作为选择性、热稳定性好且成本低廉的脱氧氟化试剂的潜力。
图 2. 用作生物探针和化学试剂的磺酰氟。
对于这类磺酰氟化物,目前仅有少数几种制备方法。传统的制备方法是用氟离子取代磺酰氯的亲核取代反应,必须严格无水,否则磺酰氟会得到水解副产物磺酸。最近,Liskamp报道了将磺酸钠与二乙氨基三氟化硫(DAST)反应的新方法,然而,这种方法同样需要无水条件,因为DAST对水分极为敏感。
一种常用的方法是利用反应性极高的迈克尔受体乙烯基磺酰氟(ESF)通过 1,4-加成反应来实现合成。这类反应产率很高,但由于试剂本身的特性,产物仅限于乙基连接的磺酰氟(即 -CH₂CH₂-SO₂F 结构)(见方案 1a)。预先制备的磺酸酯(R-SO₂-OR')经 DAST(二乙氨基三氟化硫)处理,也可转化为磺酰氟,但产率中等。
另一种途径是通过磺酰氯(R-SO₂Cl)转化:与有毒的氟化氢钾(KHF₂)反应是最实用的方法;也可用 KF/18-冠-6 等替代试剂(见方案 1b)。不幸的是,磺酰氯本身往往难以制备,且其高反应活性导致它们即使在短合成序列中也无法保持完整。
此外,这些方法常与高功能化的生物活性分子不兼容,而这类分子正是磺酰氟常被修饰的对象。因此,迫切需要一种温和的、后期功能化策略可以解决这些问题,特别是能显著提高对敏感官能团的耐受性。
方案 1. 常见的磺酰氟化物合成路线代表性实例。
尽管对芳基磺酰氟的关注日益增加,但其合成仍面临诸多挑战。目前最常用的合成方法需要相应的磺酰氯和氟离子源(如KFHF、HF等)。然而,这种方法存在多个问题。第一是前体制备困难,合成磺酰氯需使用强酸、氧化剂或易爆的芳基重氮盐,这些试剂与多种官能团不兼容,限制分子后期修饰;第二是操作稳定性差,某些磺酰氯遇水快速分解,导致操作困难并产生副产物。现有方法对磺酰氯中间体的依赖是根本原因,因此迫切需要绕过磺酰氯的新型合成策略。
02
磺酰氟的合成方法
T. Davies 等人报道了一种一锅法合成芳基磺酰氟,该方法以钯催化剂、DABSO((1,4-二氮代双环[2.2.2]辛烷-双(二氧化硫))作为SO₂源,并在75°C下使用Et₃N碱,得到中间产物20,随后在室温下对生成的亚砜离子进行原位处理,加入亲电性氟源NFSI,最终得到目标产物21(方案 2)。此外,T. Davies等人还利用类似的反应条件和方法,通过格氏试剂合成了磺酰氟(方案 3)。
方案 2. 以芳基溴化物为原料,一锅法合成芳基磺酰氟。
方案 3. 以芳基溴化物为原料,一锅法合成芳基磺酰氟。
A. L. Tribby及其同事开发了一种一步法合成芳基磺酰氟的工艺。该工艺以芳基碘化物为原料,使用钯催化剂、DABSO作为 SO2的供给源,再通过Selectfluorto试剂来生成芳基磺酰氟。该方法的产率良好至优异(见方案 4)。
方案 4. 以芳基碘化物为原料,一锅法合成芳基磺酰氟。
Y. Chen及其同事报道了在90℃条件下,利用铜催化剂、DABSO作为 SO₄²⁻的来源,以及DMPU作为辅助试剂,能够实现从芳基硼酸一步合成芳基磺酰氟。首先得到中间体 33,然后将该中间体在室温下与亲电性氟源NFSI反应,最终得到目标产物 34(见方案 5)。
方案 5. 从芳基硼酸一步合成芳基磺酰氟。
M. Tanaka等人报告了在 0℃、大气压下,使用HSO3F-SbF5作为反应介质时,芳香化合物的甲酰化反应情况。通过该反应,生成了新的化合物:甲酰烷基苯磺酰氟(41)以及另一种副产物烷基苯甲醛(42)。其中,甲酰烷基苯磺酰氟的产率相当高(方案 6)。
方案 6. 芳基磺酰氟的合成方法。
H. Kogeyama及其同事报道了2,6-二氯甲苯(43)的氯磺酸化反应过程:在室温下,将氯磺酸逐滴加入2,6-二氯甲苯中,反应2小时后得到产物44。随后,将所得产物在氮气氛围中,于 180°C 下与干燥的K和Ph 4 PBr反应5小时,最终得到磺酰氟(45),收率良好(方案 7)。
方案 7. 芳基磺酰氟的合成方法。
H. Zhao等人合成了对甲苯磺酰氯46。在室温下,该物质与刚刚制备好的47反应,从而得到产物 48(方案 8)。这一反应非常迅速,能够在室温下高效地实现底物的氟化反应。
方案 8. 芳基磺酰氟的合成方法。
L. Tang等人报告称,他们通过自由基反应途径,首次实现了无需催化剂即可将磺酰肼(49)转化为磺酰氟的反应。该反应方法具有广泛的适用性,且不需要任何金属催化剂或添加剂。所有反应都在水中、温和的条件下顺利进行,从而实现了一种简单、实用且环保的S-F键形成方法。具体而言,磺酰肼在25°C下,以银催化剂和Selectfluor为反应试剂,在水中被转化为磺酰氟(见方案 9)。
方案 9. 芳基磺酰氟的合成方法。
J. A. H. Inkster 等人使用 N-磺酰二烷基氨基吡啶盐来合成芳基磺酰氟。不过,他们按照文献中的方法合成了N-磺酰二甲基氨基吡啶盐(59–61)实际回收率仅为37%,这一结果是由于62与DMAP发生了反应,导致DMAP未能完全从反应混合物中分离出来。实际上,59 的一种双功能衍生物炔基化DMAP盐61也被成功合成,其收率为98%;利用61 可以以84%的收率制备出63(方案 10)。
方案 10. 用N-磺酰二甲基氨基吡啶盐合成苯磺酰氟。
Kirihara等人采用了多种方法来合成磺酰氟。对于这类化合物来说,传统的合成方法是利用氟离子对磺酰氯进行亲核取代反应(使用nBu 4 NF或KF/18-Crown-6作为催化剂)(见方案 11)。不过,这种方法需要严格的无水条件;否则,主要生成的将是水解产物磺酸。Liskamp报道,将磺酸钠与 N,N-二乙氨基三氟化硫反应,可以高效地得到相应的磺酰氟67,这种方法同样需要无水条件,因为 N,N-二乙氨基三氟化硫对水非常敏感。因此,仍然需要一种更简单、对水不那么敏感的磺酰氟合成方法(见方案 11)。
方案 11. 磺酰氟的制备。
磺酰氟69是硫代硫酸盐68与Selectfluor™及水进一步反应的产物。硫代硫酸盐68与 2.5当量的Selectfluor™在水相乙腈中回流条件下,几乎可以定量地得到所需的磺酰氟69(见方案 12)。此外,二对甲苯基二硫化物70或对甲苯硫醇71与Selectfluor™在乙腈/水混合溶剂中回流反应后,也能有效生成磺酰氟 69(见方案 13)。
方案 12. 硫代硫酸盐与 Selectfluor™的反应。
方案 13. 用二硫化物或硫醇合成磺酰氟。
Selectfluor™的亲电氟化能力起着重要作用。此外,Selectfluor™对水具有良好的稳定性,因此可应用于水溶液中。其他耐水性亲电氟化试剂,如Accufluor™(1-氟-4-羟基-1,4-二氮杂双环[2,2,2]辛基双(四氟硼酸盐)铝氧化物)和FP-T300™(1-氟-2,4,6-三甲基吡啶inium三氟甲烷磺酸盐),也适用于硫代磺酸酯和磺酰氟的制备。事实上,在水性乙腈中,对位甲苯二硫醚(70)与Accufluor™或FP-T300™反应,可高产率地生成磺酰氟(73)(方案 14)。
方案 14. 70与亲电性氟化试剂的反应。
03
磺酰氟探针在生物医学领域的应用价值
磺酰氟类探针在化学生物学和药物化学领域有着广泛的应用价值,最近,研究人员用SF探针开发了一系列转甲状腺素蛋白(TTR)抑制剂,这些抑制剂能与甲状腺素结合位点中pKa值异常的赖氨酸发生共价反应。此外,基于AEBSF(一种常用的丝氨酸蛋白酶失活剂)也开发了SF反应性探针。基于以上研究,Hett等人以化合物D153249 (74)为先导结构,合理设计了三种位置异构体(邻、间、对位)的SF探针,旨在探索构效关系,开发DcpS的共价抑制剂(见图 3)。最终发现,77-yne(对位异构体77的炔基衍生物)是一种强效的DcpS抑制剂。
图 3. 磺酰氟类化合物作为 DcpS 的强效抑制剂。
Brouwer等人利用基于氨基酸的新型磺酰氟电负性捕获剂,成功合成了多种高效的蛋白酶体抑制剂。他们总共设计了24种肽基磺酰氟抑制剂,这些化合物的合成灵感来源于已知的蛋白酶体抑制剂——硼替佐米、环氧莫西菌素和Cbz-Leu3-醛的分子结构。那些含有新型氨基酸序列的肽基磺酰氟抑制剂表现出最强的抑制活性,其中Cbz-Leu4-SF(78)的效果最为出色,其抑制浓度仅为7纳摩尔,这一数值远远低于环氧莫西菌素的261纳摩尔。基于这些令人满意的结果,我们相信,基于氨基酸的磺酰氟结构单元在未来将得到广泛应用,不仅可以用于靶向蛋白酶体,还可以用于其他丝氨酸/苏氨酸蛋白酶的抑制。研究发现,多种肽磺酰氟类抑制剂对β5蛋白酶体亚基具有高度选择性。
图 4. 作为蛋白酶体抑制剂的磺酰氟类似物。
另一种新的分子结构(79):该结构包含了探针的三个关键组成部分:用于形成共价键的氟磺酰芳基结构单元、用于识别的碱基单元,以及作为细胞穿透性标记物的叠氮基团 (图 5)。赖氨酸核心是一种三功能化的连接器,它不仅将核碱和弹头单元置于适当的距离和方向,以类似于FSBA中的相应对,而且还允许在探针库的构建中进行可能的微调。这种分子是具有理想特性的探针(79):它们具有目标特异性、对相应酶活性的良好线性响应,同时还能顺利穿透细胞膜。另外研究者还成功开发出一种两步法检测方案:利用这种新开发的探针,并结合免疫沉淀技术,从而能够有效检测RK3E-v-Src细胞内的Src激酶活性。
图 5. 含有磺酰氟基团的 Src 激酶抑制剂。
转甲状腺素蛋白由127个氨基酸组成,这些氨基酸构成富含β折叠结构的亚单位,这些亚单位共同形成四聚体结构。这种结构使得转甲状腺素蛋白具有两个独特的二聚体-二聚体结合位点。其中较为不稳定的那个结合位点能够沿着z轴方向形成两个甲状腺素T4的结合位点(见图 6a和图 6b)。人类血液中超过99%的转甲状腺素蛋白T4结合位点都是空闲的。那些能够选择性地与特定蛋白质结合后通过快速化学反应形成共价结合物的分子,在药物研发中具有实用价值。
N. P. Grimster等人报道了一种由1,3,4-氧二唑构成的化合物库。其中,有80种化合物的2位被芳基磺酰氟取代,5位则被取代的芳基取代(见图 6c)。这些化合物被认为对转甲状腺素蛋白(TTR)中负责结合甲状腺素的部位具有很高的亲和力。这些化合物是根据结构设计原理合成的。当这些化合物与甲状腺素结合后,大部分芳基磺酰氟会与pKa值发生改变的K15残基发生快速且选择性的反应,从而稳定TTR的结构,进而防止淀粉样纤维的形成。这种淀粉样纤维的形成是导致多发性神经病变的罪魁祸首。该反应的半衰期仅为1到4分钟,比甲状腺素结合位点外的水解反应快约1400倍。X射线晶体学分析证实了这些化合物的结合方式,同时也解释了磺酰氟如何与TTR发生反应形成磺酰胺键。 其中几种芳基磺酰氟能够在血浆中与TTR有效结合形成复合物。所合成的11种TTR共价稳定剂在与其结合后都会发出荧光。由于这些荧光团对环境条件敏感,因此这些化合物有望被用于成像技术。这些共价修饰剂的作用原理是:利用被活化的酯基团,通过与TTR四聚体中T4结合位点顶端的K15 ε-氨基发生反应来实现共价结合。
图6a. (a) WT-TTR与T4(2ROX)复合物的晶体结构。(b) 两个相同的T4结合位点之一的放大视图,显示了一个由链色标记的四聚体状带状结构,其“康诺利”分子表面应用于距离T4 8 Å以内的残基。(c) T4结合口袋的示意图,标出了内外结合亚位点,并展示了在设计和优化芳环A和B取代基时所靶向的氨基酸。围绕1,3,4-氧杂二唑环连接体旋转,导致了对称T4口袋内具有对称相关性的结合模式。
图 6b. 磺酰氟衍生物(80)作为转甲状腺素蛋白的结合剂。
该芳香基磺酰氟化合物库旨在用于研究各种结构特征。在芳环B的3号和5号位置上的取代基,与内源性配体T4中的碘原子具有相似结构。预计这些取代基会与T4结合位点处的 HBP3/3′蛋白发生相互作用(见图 6b)。位于芳环B对位上的酚基团,是某些TTR动力学稳定剂的共同特征,但并非所有此类稳定剂都含有这一结构。
以磺酰氟为基团的探针对谷胱甘肽转移酶中功能性酪氨酸残基的高选择性,表明了这类探针可被用于研究粗提蛋白组中谷胱甘肽转移酶及其他蛋白质的功能。通过化学蛋白质组学方法,研究者发现,除了能靶向丝氨酸蛋白酶外(Shannon 等人,2012 年),以磺酰氟为基团的探针还能特异性地靶向功能性酪氨酸残基,该研究分析了植物和小鼠蛋白质组中不同类型的 GSTs 所结合的残基。研究中使用了多种基于 AEBSF 的探针(见图 7)。DS6B(83)含有生物素,DS6R(81)含有罗丹明,而 DAS1(82)则含有炔基,这是一种可用于点击化学反应的化学基团。这些探针最初是用于检测蛋白质组中的丝氨酸蛋白酶的,因为 AEBSF(84)是一种常用的丝氨酸蛋白酶抑制剂。在拟南芥叶片蛋白质组中进行测试时,发现许多被标记的蛋白质同时被 DS6R 和 DS6B 所识别,且两种探针的标记结果相似。当加入过量的 AEBSF 后,标记现象被抑制,这说明 DS6R 探针所识别的残基与 AEBSF 所识别的残基相同(见图 8)。
图 7. 基于磺酰氟的丝氨酸蛋白酶抑制剂。
图 8. 靶向赖氨酸的磺酰氟探针(85–87)。
蛋白激酶是一大类结构上相互关联的酶。在开发激酶抑制剂时,一个主要目标是能够有选择地作用于目标激酶,同时避免对其他激酶产生不良影响。然而,如何准确测定抑制剂与活细胞中多种内源性激酶的相互作用,仍然是一个尚未解决的难题。Zhao等人开发出了磺酰氟探针,这种探针能够高效地与细胞内的多种激酶发生共价结合。蛋白质结晶学和质谱分析证实,磺酰氟确实能与ATP结合位点上的一种保守性赖氨酸发生特异性反应。经过优化的86号探针(XO44)能够与多达133种内源性激酶发生共价结合,其效果甚至优于细胞内高浓度的ATP。他们利用86号探针以及无标记质谱技术,成功测定了已批准上市的达沙替尼与细胞内各种激酶的相互作用情况。研究数据显示,在临床相关的浓度下,达沙替尼只能与一小部分激酶靶点结合。这一结果进一步证明了,在复杂的化学生物学分析中,以赖氨酸为靶点的磺酰氟探针具有很高的实用价值。
腺苷受体广泛分布于哺乳动物的全身各处,它们在腺苷这种嘌呤核苷的各种功能中起着关键作用。不可逆的烷基化配体是研究受体结构和功能的有效工具,可用于测定受体的储备量、识别和定位配体结合位点。研究人员合成了氟磺酰基取代的黄嘌呤类化合物,其中化学活性较强的 4-(氟磺酰基)苯基基团通过酯键或酰胺键与黄嘌呤环的 N3 位点相连(见图 9)。所有这些化合物都对 A 1 腺苷受体具有高亲和力;与 A 2 腺苷受体相比,它们对 A 1 腺苷受体的选择性更高。此外,这些化合物还能不可逆地阻止[3H]-8-环戊基-1,3-二丙基黄嘌呤([3H]CPX)与 DDT1 MF-2 细胞中的 A 1 腺苷受体结合。据报道,FSCPX(88)及其酰胺衍生物(89)在体外实验中能够有效且选择性地阻断 A4 腺苷受体。为了获得稳定性更佳的不可逆性 A6 腺苷受体拮抗剂,研究人员设计了将化学活性基团 4-(氟磺酰)苯基与黄嘌呤结构通过酮键连接起来的 FSCPX 衍生物。化合物 90–92(见图 9)对 A7 腺苷受体的亲和力更强,并且能够以浓度依赖性方式不可逆地与 A8 腺苷受体结合。
图 9. 磺酰氟化合物(88–92)作为 A 1 AR 结合剂的应用。
作为SuFEx结构中的关键连接单元,磺酰氟具有独特的反应性,为不断丰富的SuFEx应用体系做出了重要贡献。磺酰氟的巨大价值在于其作为亲电试剂的优异性能,这类试剂在药物发现和化学生物学研究中有着重要应用。磺酰氟具备良好的生物相容性与蛋白质反应性,因此可被用作各种化学修饰的“武器”。众所周知,磺酰氟能够修饰赖氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、组氨酸等氨基酸残基,以及具有活性的丝氨酸残基,而这些氨基酸残基常被用作蛋白酶抑制剂。对磺酰氟的稳定性与反应性规律的理解,主要基于以下五个特征。
(1) 抗还原性:由于氟是最电负性的元素,且磺酰氟的断裂属于异裂反应,因此容易生成氟离子。相比之下,磺酰氯的断裂则属于均裂反应。对于各种亲核试剂来说,芳基磺酰氯很容易被还原为亚磺酸衍生物(ArS(O)OR),不过胺和醇除外。磺酰氯可以很容易地被还原为相应的硫醇。磺酰溴和磺酰碘则更易发生还原反应。磺酰氯是一种强氧化剂。在高压下的热SO₂-F₂液体中,金属钠可以被熔化,而各组分本身不会发生化学变化(图 10 和b显示了ArSO₂F对氧化和还原反应的抵抗能力)。
图 10. (a和b)展示了ArSO2F在氧化作用和还原作用中的抗性。
(2) 热力学稳定性:在氧化态低于VI的硫原子上,取代反应进行得很快。也就是说,六价硫的卤化物如SOCl₂和SOF₂的反应速率很高。而六价硫原子上取代反应的缓慢进行,使得它们成为“点击化学”中的理想连接剂。与其他磺酰卤相比,磺酰氟在各种取代反应中都更为稳定,包括水解和热解反应(见图 11)。这些特性使得磺酰氟成为在恶劣条件下的理想反应试剂。
图 11. 磺酰氟在热分解过程中的稳定性要高得多。
(3) 硫原子上的特异性反应:在-SO2Cl结构中,氯原子的极高极化性使得该原子容易受到还原性攻击(具体是通过单电子或双电子途径,这取决于亲核试剂的性质和反应条件)。当以碳作为亲核试剂时,通常会同时发生磺酰化和氯化反应,从而生成混合产物。而磺酰氟则只会引发磺酰化反应。同样的原理也适用于磺酰亚胺氟化物相对于相应氯化物的应用情况(见图12a和b)。
图 12. (a, b)展示了在酯烯醇盐和胺类物质参与的反应中,氯化反应与所需的磺酰化反应之间的关系。
(4) 氟化物与质子相互作用的特殊性:对于磺酰氟的亲核取代反应来说,加成-消除反应路径和直接取代反应路径都是可行的。SO2中心在该反应中的具体作用机制虽然很重要,但至今尚未被完全理解。因此,使SuFEx反应具有独特性的关键因素之一,就在于如何稳定在取代过程中产生的氟离子。能够在合适条件下稳定氟离子、从而让SuFEx反应变得可控且适用于合成应用的物质,就是R3Si +和H +。虽然人们已经认识到水中氟离子的独特性质,但在合成过程中却很少加以利用。众所周知,将氯代芳烃转化为氟代芳烃的“Halex”反应,通常需要使用碱性的F -离子源。H-X在稳定氟离子方面的作用,恰恰体现了其优势所在。在加速SO2F反应的过程中,质子中心起着关键作用(见图 13)。[F -H -F] − 氢键的能量高达40千卡/摩尔,这一氢键是在氟化物与水中的酸发生反应时形成的。[F -H -F -H -F] − 则可以处于平衡状态。因此,氟离子是一种独特的碱:它通过将自己内部的H +原子捕获起来,从而在水中形成一种中心对称的、由4个电子和3个原子构成的结构,进而实现稳定的存在。
图 13. 水在磺酰氟的活化过程中的作用。
(5) 密切相关的官能团:与含有α-氢的原脂肪族衍生物相比,芳香族磺酰氟的抗水解性要强得多。此外,芳香环上的吸电子基团会增强S(VI)的亲电性,从而加快其反应速率。当α位上有酸性质子时,磺酰氟会通过消除反应生成硫烯类中间体(R1R2C=SO2)。例如,苯甲磺酰氟(PMSF)就是一种著名的丝氨酸蛋白酶抑制剂,常被用于细胞裂解液的制备中。不过,这种反应途径仅在碱性环境中才能快速进行。在碱性条件下PMSF和其他烷基磺酰氟才能保持稳定,并能在水溶液中选择性地修饰蛋白质。此外,烷基-SO2F的弗里德尔-克拉夫茨反应活性优于烷基-SO2Cl(见图14),因此,脂肪族衍生物也能从这种由SO2F基团所赋予的独特化学性质中获益。
图 14. 在弗里德尔-克拉夫茨反应条件下,氯化反应与所需的磺化反应之间的关系。
04
氟硫酸盐的合成
烷基氟硫酸盐在有机化学领域受到了广泛研究,因为氟硫酸根阴离子具有出色的离去基团和烷基化基团的功能,可以被用作供体碱。而芳香族氟硫酸盐则因为其极低的还原、水解、热解以及亲核取代反应性而显得十分有趣。芳氧基氟硫酸盐则具有极高的稳定性,这使得SO2F2可以与醇类化合物发生反应,从而实现芳香族反应物的理想转化效果。在芳香醇与胺的反应过程中,SO₂F2气体表现出选择性的反应特性,这一特性在生物过程中具有重要意义。Sharpless 及其同事展示了芳基氟硫酸盐的合成方法,如图 15 所示。
图 15. 在碱 Et 3 N 的存在下,利用取代酚与SO2F气体反应来合成芳基氟硫酸盐。
图 16(a–e)中展示的另一种有趣的杂芳基氟硫酸盐,是通过让吡啶醇类物质与 SO2F2气体在二氯甲烷溶剂中反应制得的。反应过程中还加入了1.5当量的Et3N,反应温度为室温,反应时间最长可达12小时。如果使用 2-吡啶酮作为原料,则需要采用不同的反应条件来制备相应的氟硫酸盐。而那些被取代的吡啶-2-基氟硫酸盐(f–j)则是通过在CH3CN溶剂中,使用3当量的DIPEA,在室温下反应 24 小时制得的。
图 16. 杂芳基氟硫酸盐的合成过程。
2015年,Sharpless及其同事也报道了芳香基氟硫酸盐的合成方法。在适量碱的存在下,芳香基硅醚可作为合成氟硫酸盐的理想底物,该反应使用SO₂F₆气体进行催化反应,反应体系为DCM溶剂中的BEMP催化剂,反应物为3,4-二氢萘-1-基氧基三甲基硅烷(见图 17a)。另一项反应则使用了DBU作为催化剂,以4-((叔丁基二甲基硅基)氧基)-N-甲基苯胺为原料,在CHCl₃溶剂中,利用SO₂F₆气体在室温下合成出了4-(甲基氨基)苯基硫氟酸盐(见图 17b)。
图 17. (a) 使用BEMP合成烯醇氟硫酸盐;(b) 通过DBU合成芳基氟硫酸盐。
在合成磺酰氟的过程中,使用SO2F 2气体以及各种仲胺类物质(见图 18)。相比之下,使用伯胺进行合成时,由于会生成HF分子,因此会得到不稳定的化合物。
图 18. 利用SO2F2气体和胺类物质合成磺酰氟的过程。
05
SuFEx 点击化学的应用
如今,药物发现的过程依赖于对化学库进行大规模筛选,以寻找那些能够与细胞内和细胞外分子靶点结合的新型化合物。通过使用高通量技术来合成各种化合物,同时利用自动化技术来分离天然产物,并从商业渠道获取各种化合物,制药和生物技术公司能够合成出更多种类、更大量的化合物。与此同时,随着人类基因组以及各种病原体如微生物、细菌和病毒的基因组被测序,人们发现了许多新的生物靶点。这些靶点往往没有现成的化学物质可以作为优化药物设计的起点。
正如Wu及其同事所证明的那样,磺酰氟点击化学技术在生物活性分子的后期功能化处理中起着重要作用。通过这种后期功能化处理,可以快速改变候选药物的物理性质和药代动力学特性。Wu及其同事利用96孔板技术,将美国国立卫生研究院批准的多种抗癌药物直接转化为磺酰氟衍生物。经过筛选后,他们得到了多种芳基磺酰氟化合物,这些化合物均具有抗癌活性。其中,磺酰氟衍生物combretastatin A4对HT-29结肠癌细胞系的抑制效果提升了70倍。此外,磺酰氟化的fulvestrant类似物(一种选择性雌激素受体下调剂)也表现出比原始化合物更强的结合亲和力(见图 19)。
图 19. Combretastatin A4和Fulvestrant经过氟磺酰化处理后,其抗癌效果得到了提升。
研究人员采用了SuFEx点击化学技术来制备了所需的双芳基硫酸盐核心结构。这一策略使得人们能够合成出既包括对称结构也包括非对称结构的双芳基硫酸盐类丙型肝炎病毒NS5A抑制剂。此外,该策略还适用于各种取代酚类化合物的合成。如图20所示,通过对该化合物库中的各种化合物进行测试,我们发现,那些具有对称结构的化合物(138)和非对称结构的化合物(137)都表现出良好的抑制效果,其抑制剂的 EC50 值都相当低。
图 20. SuFEx 在达卡他韦生物碱硫酸盐类似物的合成中的应用。达卡他韦是一种用于治疗丙型肝炎病毒的NS5A抑制剂。
最近的研究表明,可以利用“睡美人”探针来发现含有磺酰氟基团的共价药物。磺酰氟作为共价药物成分具有独特优势:它能够与特定的折叠状态下的蛋白质发生共价结合,而无法与变性的蛋白质发生反应。Wolan、Sharpless及其同事筛选了包含数千种磺酰氟化合物的化合物库,这些化合物都是针对人类中性粒细胞弹性蛋白酶设计的。其中,苯-1,2-二磺酰氟139被证实是一种有效的共价药物,其抑制人类中性粒细胞弹性蛋白酶的IC50值为3.3微摩尔。研究表明,磺酰氟通过磺酰化Ser195位点来抑制该酶的活性。通过X射线晶体学分析,研究人员还确定了这种共价药物与蛋白质的结合结构。SuFEx技术还被用于优化这些化合物,从而得到了更多新的候选药物。2-氟磺酰苯基三氟甲磺酸酯140的抑制浓度为1.1 μM(见图 21)。该化合物是通过Moses提出的SuFEx三氟甲基化反应制得的。另一种化合物是2-氟磺酰苯基氟磺酸酯141,其抑制浓度为0.24μM(见图 21)。与同类的中性粒细胞丝氨酸蛋白酶——组织蛋白酶G相比,2-氟磺酰苯基氟磺酸酯141的选择性高出约200倍。这两种化合物都比之前的化合物(苯-1,2-二磺酰氟)具有更高的选择性和活性。
图 21. 苯-1,2-二磺酰氟的优化过程:a) 当 IC 50 为 3.3 微摩尔时,该物质作为 hNE 的共价修饰剂所起的作用。
正如 Sharpless、Wilson 和 Kelly 及其同事所证明的那样,氟硫酸盐能够更好地与细胞内的脂质结合蛋白结合。如图22所示,这种作用机制可以被看作是“逆向药物发现”技术的一种应用。所谓“逆向药物发现”,指的是让弱亲电试剂直接与细胞内的蛋白质结合。由于氟硫酸盐在细胞环境中不具反应性,它们与蛋白质的反应是在特定活性位点上发生的。iLBPs可作为模型,因为其蛋白质中的结合位点含有酪氨酸残基以及能够催化硫氟交换的侧链官能团。图22中的三种氟硫酸盐化合物(142–144)结构较为复杂,但它们能够与特定的蛋白质结合。所有这些探针都含有炔烃官能团,可用于铜催化的叠氮化物-炔烃环加成反应。图22中的145-147号化合物被证明是相应氟磺酸酯类化合物的竞争性抑制剂。当这些竞争性抑制剂存在时,会阻碍含有炔烃的分子的共轭反应。这一现象可以通过铜催化的叠氮化物-炔烃环加成反应后荧光强度的下降来观察。相比之下,当芳基氟磺酸酯与蛋白质发生部分反应时,荧光强度则保持不变。研究人员研究了11种重组蛋白与芳基氟磺酸酯之间的反应情况,这些芳基氟磺酸酯具有明确的结合位点。 这些结构域中含有多个阳离子侧链残基。当这些残基位于酪氨酸或赖氨酸附近时,它们要么能够调节亲核试剂的pK值,要么通过稳定离去氟离子来催化SuFEx反应。
图 22. 用于体现“逆向药物发现”策略的化学探针。化学生物学领域的相关研究。
含少量磺酰氟的分子大约在100年前就被发现有杀虫作用。20世纪60年代,Myers 和Kem在磺酰氟抑制蛋白酶的作用机制方面取得了重要研究成果。随后,哥伦比亚大学的Gold和Fahrney进一步研究了磺酰氟抑制酯酶的机制。为了使磺酰氟发挥其作用,必须先激活其氨基酸侧链。已知磺酰氟能够作用于丝氨酸、酪氨酸、赖氨酸、苏氨酸、组氨酸和半胱氨酸等氨基酸残基。不过,磺酰氟与亲核试剂的反应过程存在较高的动力学障碍,同时热力学驱动力也较弱。加州大学圣塔芭芭拉分校的Bernard R. Baker在研究中发现,磺酰氟基团对热水和酒精呈惰性,与蛋白质的反应也非常缓慢,甚至可能根本不发生反应。它们能与含有SO2F基团的分子可逆地形成复合物。相比之下,当含有SO2F基团的化合物与酶或纤维素等大分子结合时,会迅速形成共价键。根据 Baker 及其同事的研究,磺酰氟类化合物能够与特定蛋白质结合位点上的氨基酸残基形成共价键。图23展示了各种抑制剂:鸟嘌呤脱氨酶(GAH)的抑制剂148、胰凝乳蛋白酶的抑制剂49、黄嘌呤氧化酶(XO)的抑制剂150、二氢叶酸还原酶(DHFR)的抑制剂159、150、雌二醇脱氢酶的抑制剂151和152、脂蛋白脂肪酶(LPL)的抑制剂153,以及脂肪酸酰胺水解酶(FAAH)的抑制剂 152。 属于甲基磺酰氟类化合物的MSF-154,作为一种选择性的、不可逆的乙酰胆碱酯酶抑制剂,已在阿尔茨海默病患者的记忆功能改善方面取得了良好的效果。贝克等人研究的著名磺酰氟类抑制剂NSC-127755,后来被发现能够改变鸡肝中 DHFR 酶的酪氨酸-31 位点。那些不易发生化学变化的磺酰氟类化合物,最近被用于生产带有18 F 标记的放射性示踪剂。
图 23. 一些非共价抑制剂以及经过SO2 F修饰的类似物具有生物活性,并且对图中用红色标出的靶标具有稳定性。
为了使蛋白质发生磺酰化反应,必须通过各种非共价结合作用来延长磺酰氟基团在蛋白质表面的停留时间。若想将这些非共价配体转化为不可逆的抑制剂,则需要引入SO2F单元。当磺酰氟被酶的活性位点上的某些残基所吸引时,Baker将这种抑制作用分为“内型”和“外型”两种类型,具体取决于亲核试剂所在的位置与活性位点的相对位置。这种机制使得磺酰氟能够选择性地修饰酶的别构位点、受体、离子通道以及各种结构蛋白。结合位置和停留时间对于确定磺酰氟试剂的修饰位置至关重要;同时,氟离子离去基团的稳定性也很重要,如图24所示。
图 24. 氟稳定和双氟化合物在SuFEx化学中的作用。
Van der Hoorn、Weerapana及其同事证明了磺酰氟可以作为探测剂,用于检测丝氨酸蛋白酶的活性。他们合成了泛丝氨酸蛋白酶抑制剂的炔基化类似物,即(4-(2-氨基乙基)苯磺酰氟)(见图 25)。他们研究了这种化合物作为探测剂的性能。实验结果表明,炔基化合物163能够有效帮助从复杂的蛋白质组中识别出相应的丝氨酸蛋白酶。随后,他们还利用质谱技术对这类化合物进行了鉴定和分析。
图 25. Van der Hoorn、Weerapana及其同事所使用的炔基磺酰氟化合物163和164。
Robinson、Jones 及其同事在图26中展示了各种经功能化的芳基磺酰氟探针。他们强调了以磺酰氟为基础的探针在化学生物学中的重要性。这些探针具有三个活性位点:一个是炔基取代基,另一个是磺酰氟基团(165–173),可用于与蛋白质形成共价键;第三个则是用于连接功能性药物的位点。他们还制备了表皮生长因子受体抑制剂厄洛替尼的衍生物,以研究该药物在活细胞中的作用机制。厄洛替尼与其靶点——表皮生长因子受体之间存在着特定的相互作用关系。化合物175是一种经过设计的磺酰氟探针,能够与表皮生长因子受体结合。该探针的磺酰氟基团能够与厄洛替尼-表皮生长因子受体结构中的赖氨酸残基发生相互作用。
图 26. Robinson 和Jones开发的可点击操作的磺酰氟相关工具箱。
2,4-二氨基喹唑啉类化合物中的DAQ1(176)能够抑制mRNA去帽作用相关的酶Dcps。目前,人们正在研究这类化合物是否具有治疗脊髓性肌萎缩症的潜力。Jones及其同事将磺酰氟类化合物作为该酶的不可逆抑制剂,因为这类化合物能与活性位点中的酪氨酸残基形成共价键。在图27中,研究人员合成了相应的氟硫酸盐化合物SF-p1yne(178),但该化合物与酪氨酸残基的反应产生了非预期的产物。这是因为氧气的影响阻碍了酪氨酸残基与亲电性的氟硫酸盐之间的反应。相反,附近的丝氨酸残基则容易与氟硫酸盐发生反应,从而形成含有脱氢丙氨酸残基的脱水蛋白质,随后再经过β-消除反应。为了测定酶中目标物质的结合情况,就需要使用这种可点击的共价探针。诸如SF-p1(177)这样的完整细胞。经过炔基标记的磺酰氟抑制剂(SF-p1-yne)能够检测出那些被该抑制剂处理过的细胞中所涉及的Dcps靶点。
图 27. 2,4-二氨基喹唑啉(DAQ1)与磺酰氟、氟硫酸盐在Dcps抑制剂作用下的结构。
由于磺酰氟在水中的化学和热力学性质稳定,且其氟离子基团无毒、不具反应性,Kelly及其同事证明了磺酰氟和氟硫酸盐作为化学探针的实用性——这些探针可以用来识别特定分子中的氨基酸残基。磺酰氟在转铁蛋白的甲状腺素结合位点上发生选择性反应,从而阻止了淀粉样纤维的形成。而那些能够识别转铁蛋白上Lys15位点的磺酰氟配体则有助于稳定转铁蛋白的四聚体结构,因为它们能与Lys15形成共价键。此外1,3,4-氧二唑-182 这种芳基氟硫酸盐则能与转铁蛋白的结合位点形成非共价键。
图 28. 磺酰氟探针179–180和氟硫酸盐探针181–182的结构。
Taunton及其同事证明了芳基磺酰氟对Src家族蛋白激酶活性位点上的亲核试剂具有选择性。图29显示,经过标记的磺酰氟分子183和184与催化位点上的赖氨酸(Lys295)发生了反应;而经过标记的乙烯基磺酸盐分子则与非催化位点上的半胱氨酸(Cys277)发生了反应。这些探针能够在活细胞中区分不同类型的激酶。
图 29. 磺酰氟探针在SrC家族蛋白激酶的活性位点上的反应性。
Linus Pauling提出,酶通过与反应过渡态高度互补来实现高效催化,这一理论奠定了基于结构的药物设计基础,即通过优化药物与靶蛋白结合位点的空间构象及非共价相互作用,提高结合亲和力和选择性。然而,共价抑制剂虽然能够增强药物作用强度和持续时间,但其活性代谢物可能与蛋白质发生不可逆共价结合,形成蛋白质加合物,引发免疫介导的不良反应甚至器官毒性(如对乙酰氨基酚相关肝毒性)。由于这类毒性机制复杂、预测困难,且常在药物研发后期或上市后才被发现,制药企业通常会在候选药物优化过程中筛除具有形成活性代谢物风险的化合物。此外,共价修饰发生于细胞内蛋白时通常免疫原性较低,而作用于细胞外蛋白则更容易诱导免疫反应,因此共价药物设计需要在疗效与安全性之间取得平衡。
药物发生特异性不良反应的风险与给药剂量密切相关,每日剂量越高,反应性代谢物导致毒性的可能性越大。目前尚无每日剂量低于10 mg仍引发特异性不良反应的药物报道,因此降低给药剂量是减少此类毒性的有效策略。此外,不可逆抑制剂由于其活性官能团可能与非靶蛋白发生共价反应而产生脱靶毒性。针对细胞外靶点时,可通过降低药物跨膜转运、限制其作用范围,提高靶向选择性,从而减少非特异性毒性反应。
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结论
SuFEx点击化学因其高效、选择性高且无需金属催化的特点,在药物发现和化学生物学领域展现出广阔的应用前景。尽管利用SuFEx构建共价抑制剂仍需关注潜在的安全性问题,但其良好的生物相容性和适用于无法使用传统点击化学体系的优势,使其成为发展新型生物偶联和共价药物的重要技术平台,未来具有广阔的发展和应用潜力。
参考文献
[1] Wilson Lucas S, Zijian Qin R, Rakesh KP, Sharath Kumar KS, Qin HL. Chemical and biology of sulfur fluoride exchange (SuFEx) click chemistry for drug discovery. Bioorg Chem. 2023 Jan;130:106227.
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撰稿:王新宇
排版:王烁英