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本月精选45文
01
IF: 56.1
Nature
Nature:肠菌制造神经递质,塑造宿主免疫力
02
IF: 56.1
Nature
Nature:220万个单细胞揭开IBD遗传变异图谱
03
IF: 56.1
Nature
Nature:GPR15"导航"的CD8调节性T细胞,守卫肠道稳态
04
IF: 56.1
Nature
上海科技大学仓勇/逯小翠等Nature:BRAF突变肠癌迎来新疗法,首个HuR分子胶展现潜力
05
IF: 56.1
Nature
Nature:高胆固醇饮食如何破坏肝脏清脂功能?
06
IF: 47.3
Science
Science:母乳中的反式异油酸,如何"编程"婴儿终身免疫力?
07
IF: 47.3
Science
Science观点:别只让"超加工"背锅,高热量与低纤维才是长胖关键
08
IF: 109
Lancet
北肿季加孚/沈琳等Lancet:告别术后化疗,免疫单药重塑胃癌治疗格局
09
IF: 84.5
New England Journal of Medicine
NEJM:寻找肠炎突变基因的致病元凶,IL-10自身抗体成关键
10
IF: 65.4
JAMA
台大陈秀熙/李宜家等JAMA:算一笔健康经济账,胃肠双筛如何实现收益最大化
11
IF: 52.5
Nature Medicine
Nat Med:标准化活菌药vs粪菌移植,15株精选肠菌有效预防艰难梭菌复发
12
IF: 56.1
Cancer Cell
Cancer Cell:慢性压力促肿瘤,噬菌体成帮凶
13
IF: 41.3
Circulation
果糖的来源比总量更关键,含糖饮料与果汁关联长期高血压风险
14
IF: 37
Cell Metabolism
上海药物所谭敏佳团队Cell Metab:肠菌代谢物制造新型蛋白质修饰,损害线粒体功能,或促脂肪肝
15
IF: 37
Cell Metabolism
Cell Metab:既减脂又不掉肌肉,适度甲硫氨酸饮食助抗衰老
16
IF: 37
Cell Metabolism
华西医院陈海洋/叶金宝等Cell Metab:脂肪肝如何推高血糖?肝-肠对话揭示新机制
17
IF: 29.7
Gastroenterology
调节菌群并修护肠道屏障,特定纤维或可预防克罗恩病
18
IF: 29.7
Gastroenterology
突破传统肠镜评估局限,多维组学解锁IBD无创监测新路径
19
IF: 29.7
Gastroenterology
广州医科大张彦团队:肠道神经发育的基因组卫士,PRDM9缺失致巨结肠
20
IF: 29.5
Cancer Discovery
港中大于君/刘伟鑫等:肠道致病共生菌"偷渡"进肝脏,促进肝癌发生
21
IF: 29.5
Cancer Discovery
肿瘤微生物负荷决定免疫疗效,干扰素信号是关键
22
IF: 27.5
Nature Metabolism
Nature子刊:并非只有菌群能合成,宿主代谢是吲哚与酚类化合物的重要来源
23
IF: 26.5
Nature Immunology
Nature子刊:掌控肠道耐受的关键,Runx蛋白重塑调节性T细胞
24
IF: 25.5
Nature Genetics
华大陈晨/揭著业等Nature子刊:6.5万基因组!最大阴道菌群图谱揭示种族差异及遗传关联
25
IF: 25.5
Nature Genetics
Nature子刊:大肠癌的变形计,双面细胞状态如何逃避靶向治疗?
26
IF: 25.5
Nature Genetics
Nature子刊:小肠肿瘤的隐秘推手,COPA突变如何持续激活Wnt信号
27
IF: 25.5
Nature Genetics
Nature子刊:110万细胞图谱,揭示克罗恩病肠道"免疫伤疤"
28
IF: 25
Nature Aging
中国科学院动物研究所刘光慧/李静宜等Nature子刊:单细胞图谱揭示小肠衰老核心机制,二甲双胍可逆转
29
IF: 25
Nature Aging
Nature子刊:限时进食延长雄鼠寿命和两性健康寿命
30
IF: 24.6
Gut
湘雅三医院王晓艳/陈杰等GUT:喝酒如何影响肠炎风险?乙醛代谢基因说了算
31
IF: 24.6
Gut
GUT:抗菌肽GPR15L改善结肠炎,不靠免疫靠"养菌"
32
IF: 24.6
Gut
GUT:调节肠脑轴,神经调节剂与行为疗法改善IBS
33
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
浸大翟李翔团队Cell子刊:肠易激腹泻+胰岛素抵抗,一种肠菌代谢物带来双重缓解
34
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
东南大学姚红红/边亮等Cell子刊:不靠经典受体,靠肠菌!GLP-1药物抗抑郁新机制
35
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
北京安定医院王刚团队Cell子刊:调节菌群-胆汁酸-炎症轴,粪菌移植辅助加速抗抑郁
36
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
营养与健康所丁秋蓉团队Cell子刊:尿酸驱动肥胖的肝-肠轴新机制
37
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
Cell子刊:肠菌如何抵抗真菌定植?短链脂肪酸成为关键抑制分子
38
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
Cell子刊:肠道细菌指挥维生素A流向,重塑早期免疫
39
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
Cell子刊:破坏真菌酸碱平衡,肠菌产物戊酸成抗念珠菌感染新武器
40
IF: 23.2
Cell Host and Microbe
Cell子刊:探寻肠癌元凶,具核梭杆菌致病亚种展现全球地域差异
41
IF: 21.7
Journal of Extracellular Vesicles
中山六院李孟鸿/马宁等:肠道细菌跨界投毒,劫持关键通路催化肝癌
42
IF: 20.3
Nature Neuroscience
Nature子刊:肠菌酶唤醒雄激素,调控肠神经与肠道运动
43
IF: 18.7
Nature Microbiology
中国药科大学高向东团队Nature子刊:改造共生肠菌,诊疗一体治肠炎
44
IF: 18.7
Nature Microbiology
上海药物所谢岑团队Nature子刊:高脂饮食破坏大肠黏液微环境,如何导致小肠过度吸油?
45
IF: 18.7
Nature Microbiology
仁济医院吴文广团队Nature子刊:产毒脆弱拟杆菌促进胆囊癌的双重机制
01
Nature:肠菌制造神经递质,塑造宿主免疫力
肠道菌群饮食-菌群-免疫互作胆碱
IF: 56.1
Commensal-derived acetylcholine enhances mucosal immune education
Deguang Song
Brianna Duncan-Lowey, Varnica Khetrapal, Randy Hamchand, Tong Deng, Hailey Brown, Anchi Wu, Anjelica L Martin, Kaylyn M. Bauer, Yanyu Zhao, Mytien Nguyen, Nicole D Sonnert, Shana Leopold, Qihao Wu, Jason M Crawford
Noah W Palm
Article|2026-06-03|
OA
10.1038/s41586-026-10592-7
背景与设计
为阐明体内菌群代谢组的生物活性,采用多重G蛋白偶联受体(GPCR)筛选技术,系统对比了100株共生菌在无菌小鼠体内与体外培养的代谢物对逾300种GPCR的激活作用。
核心发现与意义
肠道共生菌在体内以膳食胆碱为底物合成神经递质乙酰胆碱(ACh),从而驱动宿主黏膜免疫重塑并增强病原体抵抗力,揭示了饮食-微生物-免疫互作新机制。
代谢组差异机制
受宿主酶降解、微生物代谢重编程及膳食底物转化影响,共生菌体内外代谢组呈现显著GPCR激活差异,其中膳食胆碱特异性驱动共生菌激活毒蕈碱型受体。
ACh合成酶鉴定
短双歧杆菌(婴儿期优势菌)和戊糖片球菌等通过新型六肽重复乙酰转移酶(BbChAT和PpChAT)催化胆碱转化为ACh。
黏膜免疫调节
产生ACh的短双歧杆菌通过烟碱型受体驱动结肠固有层IgA浆细胞分化及IgA分泌,该效应在无法合成ACh的chat基因敲除株中完全丧失。
菌群调控与保护效应
产生ACh的短双歧杆菌可改变肠道菌群组成,并在单菌及复杂菌群背景下增强对鼠伤寒沙门氏菌感染的抵抗力。
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02
Nature:220万个单细胞揭开IBD遗传变异图谱
炎症性肠病单细胞RNA测序细胞图谱
IF: 56.1
Cell-type-resolved genetic variation shapes inflammatory bowel disease risk
Tobi Alegbe, Bradley T Harris
Laura Fachal, Lucia Ramirez-Navarro, Marcus Tutert, Monika Krzak, Mennatallah Ghouraba, Michelle Strickland, Matiss Ozols, Celeste E. Cohen, Saniya Khullar, Eleonora Khabirova, Nikolaos I. Panousis, David Ochoa, Noor Wana, May Xueqi Hu, Jason Skelton, Jasmin Ostermayer, Kimberly Ai Xian Cheam, D. Leland Taylor, Yong Gu, Claire Dawson
Tim Raine, Carl A Anderson
Article|2026-06-03|
OA
10.1038/s41586-026-10627-z
背景与设计
为解析炎症性肠病(IBD)非编码风险变异机制,利用421名个体(含125名患者)肠道与血液样本的220万个单细胞转录组构建了表达数量性状位点(eQTL)图谱。
核心发现与意义
单细胞分辨率eQTL作图显著提升了GWAS位点效应基因的鉴定率,揭示风险变异通过细胞类型特异性远端增强子调控,驱动疾病易感性。
基因组调控特征
细胞类型水平eQTL更远离转录起始点且显著富集于增强子区,其与IBD风险信号共定位的可能性高出3.5倍以上。
髓系细胞与免疫
共定位分析在超半数位点鉴定出419个效应基因,髓系细胞中MAML2与PSEN2等表达降低伴随风险增加,提示Notch信号减弱。
上皮细胞与屏障
上皮干细胞中IBD风险与MYC及RASGRP1等Wnt通路基因表达改变显著共定位,提示上皮更新受损加剧屏障破坏。
临床靶点与转化
效应基因图谱涵盖现有治疗靶点并提示了特定激酶抑制剂的药物重定位潜力,同时通过揭示特定基因的表达下降解释了部分药物的胃肠道副作用。
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03
Nature:GPR15"导航"的CD8调节性T细胞,守卫肠道稳态
GPR15CD8+ T细胞调节性T细胞
IF: 56.1
GPR15-guided CD8+ T regulatory cells control intestinal inflammation
Jing Cui, Zuojia Chen
Yan H. Cheng, Jia Nie, Maria H. Zhu, Chen Xiang, Samuel Chauvin, Wiem Lassoued, Can Liu, Kartika Padhan, Jian Song, Joy A. Pai, Borja Ocón, Yifan Yang, 姚依昆, Ann Y Park, Justin Q. Gabrielski, Lixin Zheng, Ping Jiang, Yu Zhang, Huie Jing, Leilei Xu
吴船, Michael J Lenardo
Article|2026-06-08
10.1038/s41586-026-10749-4
背景与设计
G蛋白偶联受体GPR15介导小鼠CD4+ 调节性T细胞肠道归巢,但其在人类肠道免疫稳态及炎症性肠病(IBD)中的作用不明,本研究结合患者遗传学、小鼠模型及单细胞测序,解析GPR15的免疫调节功能。
核心发现与意义
鉴定出一类黏膜内GPR15引导的调节性CD8+ T细胞(CD8+ TIGR)亚群,致病性GPR15变异导致该亚群归巢缺陷,从而促进巨噬细胞驱动的肠炎,为IBD提供了全新干预靶点。
遗传关联
人类GPR15有害变异损害受体功能及配体介导的细胞迁移,与严重早发性及散发性IBD显著相关。
归巢机制
单细胞转录组及功能实验证实,GPR15特异性决定CD8+ TIGR细胞向结肠黏膜归巢,而不影响CD4+ 调节性T细胞定位。
体内保护作用
小鼠CD8+ T细胞特异性缺失Gpr15导致DSS诱导的结肠炎加剧,并伴随促炎巨噬细胞大量积累。
免疫抑制机制
CD8+ TIGR细胞通过Fas配体和TNF相关弱凋亡诱导剂(TWEAK)接触依赖性途径,直接杀伤活化的巨噬细胞从而抑制肠炎。
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04
上海科技大学仓勇/逯小翠等Nature:BRAF突变肠癌迎来新疗法,首个HuR分子胶展现潜力
分子胶降解剂HuR蛋白BRAF突变
IF: 56.1
Molecular glue degraders of HuR suppress BRAF-mutant colorectal cancer
逯小翠, 王秀云, 杨正, 王旭升
Lin Wang, Chunhui Xu, I-Chung Lo, Chenlu Geng, Yisheng Pu, Keyu Zhang, Ziqiang Zhu, Lanxin Ye, Jiayuan Huang, Xiaofan Wei, Fang Bai, Yanan Zhu, Xiaobing Qian
窦好, Hexiu Su, 仓勇
Article|2026-06-10|
OA
10.1038/s41586-026-10613-5
靶点筛选与设计
针对BRAF突变型结直肠癌的耐药挑战,利用化学文库与蛋白质组学平行筛选鉴定出靶向RNA结合蛋白HuR的分子胶降解剂dHuR。
核心发现与意义
dHuR通过重塑CRBN泛素连接酶表面特异性降解HuR,驱动致癌性BRAF蛋白下调,为克服靶向耐药提供了全新干预策略。
结构机制解析
冷冻电镜结构证实dHuR的苯并呋喃核心结合CRBN后,招募HuR的G58环状降解子形成三元复合物,驱动HuR泛素化降解。
选择性抗癌效应
dHuR在体内外模型中显著且选择性地抑制BRAF突变型结直肠癌生长,且CRISPR筛选证实BRAF突变状态与HuR依赖性显著相关。
剪接调控机制
HuR降解阻断了其与BRAF前体mRNA内含子17的结合,驱动外显子18跳跃,产生低翻译效率的剪接变体并削弱MAPK信号。
克服耐药与联用
dHuR在BRAF抑制剂耐药模型中维持了显著抗肿瘤活性,且与EGFR或MEK抑制剂联用驱动了强烈的协同抗肿瘤效应。
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05
Nature:高胆固醇饮食如何破坏肝脏清脂功能?
膳食胆固醇低密度脂蛋白受体Ral GTP酶
IF: 56.1
Dietary cholesterol activates a Ral-dependent pathway driving LDLR turnover
Xue Feng
Shuo Zhang, Yuqi Wang, Twisha Kurlagunda, Allyssa Sit, Priyadarshini Jaishankar, Pusu Yang, Sadatsugu Sakane, Se Yong Park, Churaibhon Wisessaowapak, Kaylee Nguyen, Jamie Yan, Himani Pothulu, Catherine Dinh, Felicia Chu, Yuyao Ren, Bichen Zhang, Patrick Secrest, Linmeng Han, Chao-Wei Hung, Preethi Veeragandham
Xue Feng, Alan R Saltiel
Article|2026-06-24
10.1038/s41586-026-10697-z
背景与设计
针对高膳食胆固醇调控肝细胞LDLR周转机制不明的问题,整合小鼠模型、细胞生物学及人类遗传学分析探究了全新的翻译后调控网络。
核心发现与意义
由RAS–Ral轴驱动、独立于PCSK9的新信号通路通过促进LDLR溶酶体降解调控胆固醇稳态,为高胆固醇血症提供潜在干预靶点。
上游激活机制
长期高胆固醇饮食通过激活RAS,驱动RalA和RalB GTP酶在小鼠肝脏中持续激活,伴随LDLR蛋白水平显著下降。
内吞与分选
免疫共沉淀及荧光成像证实,活性Ral与RalBP1-REPS1内吞复合物结合,促进质膜LDLR内吞并导向溶酶体。
溶酶体降解
溶Ral激活驱动溶酶体蛋白酶CTSA成熟并限制其分泌,而肝细胞特异性敲除CTSA显著阻断了LDLR的降解。
临床转化潜力
人类遗传数据显示KRAS、REPS1、CTSA变异与血脂水平相关,且药理学抑制Ral或CTSA显著稳定了肝脏LDLR并降低小鼠血浆低密度脂蛋白胆固醇水平约40%。
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06
Science:母乳中的反式异油酸,如何"编程"婴儿终身免疫力?
母乳反式异油酸生命早期母体饮食
IF: 47.3
Maternal trans-vaccenic acid shapes neonatal T cell development and early-life immune imprinting
Hao Fan, Zhong Zheng
Kaitlyn Oliphant, Jiacheng Li, Ryan Mack, Cheng-Wei Ju, Brandon Trandai, Jiayi Tu, Freya Q Zhang, Rukang Zhang, Zhicheng Xie, Chunzhao Yin, Chufan Cai, Megan S Kennedy, Tess McNeely, Candace M Cham, Hardik Shah, Lei Dong, Rui Su, Camilia R. Martin, Brian Layden, Robert B Hamanaka
Erika C Claud, 何川, Jing Chen
Article|2026-06-18
10.1126/science.aea4041
研究背景与设计
针对母体饮食塑造新生儿免疫的具体机制,利用多组学与多种小鼠感染模型剖析了母乳反式异油酸(TVA)的单一分子干预效应。
核心发现与临床意义
母体来源的TVA足以独立驱动新生鼠幼稚CD4+ T细胞发育并向Th1偏移,从而增强早期抗感染能力并确立终身受益的免疫印记。
表型重塑与细胞扩增
TVA经母乳转移至幼鼠体内显著扩增了脾脏幼稚CD4+ T细胞群,并显著增加该细胞群中Gpr43启动子的染色质可及性。
受体介导的信号级联
TVA特异性靶向失活T细胞受体GPR43并触发cAMP-PKA信号,进而增强CTCF活性以协同TBX21重编程新生儿免疫向Th1偏移。
早期感染抵抗力增强
哺乳期TVA暴露显著降低流感病毒或沙门氏菌感染幼鼠的病原体负荷并提高生存率,受TVA编程的CD4+ T细胞具备显著增殖竞争优势。
窗口期限定与临床关联
仅生命早期的TVA暴露可产生持久的成年期抗病毒免疫印记,且早产儿队列中母乳TVA水平与Th1标志物正相关并伴随支气管肺发育不良风险降低。
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07
Science观点:别只让"超加工"背锅,高热量与低纤维才是长胖关键
超加工食品肥胖营养特性代谢健康
IF: 47.3
Ultraprocessed foods and obesity: Interpreting the evidence
Faidon Magkos
Ciarán G Forde, Eric Robinson
Faidon Magkos
Opinion|2026-06-04
10.1126/science.aef3495
核心观点与领域现状
现有随机对照试验(RCT)证据不支持超加工食品(UPF)存在独立于传统营养特性的“超加工”特异性致肥胖效应,公共卫生政策应回归食品营养质量本身。
随意进食试验解析
UPF饮食驱动的能量摄入与体重增加,可由其质地柔软导致进食加快及整体热量密度显著偏高完全解释,而非加工过程所致。
固定热量试验解析
等热量摄入下UPF饮食引发的体重增加,主要归因于极低膳食纤维导致可代谢能量吸收增加,以及高钠引发体液潴留。
蛋白质杠杆效应
UPF饮食中蛋白质占总热量比例偏低,这种营养稀释效应代偿性驱动碳水化合物与脂肪的过度摄入,进而打破能量平衡。
心血管代谢风险
UPF饮食伴随的总胆固醇升高关联于高饱和脂肪含量,空腹血糖及血压等其他代谢风险标志物未表现出一致性恶化。
领域挑战与未来方向
现有试验设计存在极端饮食对比及多变量混杂缺陷,未来需在控制基础营养特性前提下,分离测试特定加工属性对代谢的独立影响。
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08
北肿季加孚/沈琳等Lancet:告别术后化疗,免疫单药重塑胃癌治疗格局
胃肿瘤PD-L1斯鲁利单抗新辅助治疗
IF: 109
Perioperative serplulimab with neoadjuvant chemotherapy versus perioperative chemotherapy in PD-L1-positive gastric cancer (ASTRUM-006): a randomised, double-blind, multicentre, phase 3 study
沈琳, 张小田, 季科, 卢林芝, 王权
Quanlin Guan, Su Yan, Yanbing Zhou, Yan Yang, Zhibin Huo, Jun You, 巴一, 叶颖江, 陈晔, Shubin Wang, 吕国庆, Jingdong Zhang, Xuhui Hu, Futang Yang, Haoyu Yu, Jing Li, Qingyu Wang, Jun Zhu
沈琳, 季加孚
Article|2026-06-01
10.1016/S0140-6736(26)00974-8
背景与设计
针对PD-L1阳性(CPS≥5)局部晚期可切除胃或胃食管结合部腺癌,开展了一项评估新辅助斯鲁利单抗(serplulimab)联合SOX化疗序贯辅助斯鲁利单抗单药对比围手术期单纯化疗的III期随机双盲临床试验。
总体概述
围手术期免疫联合新辅助化疗及免化疗辅助免疫单药策略显著延长了患者的无事件生存期并提升了病理缓解率,同时伴随更优的安全性,为该适应症提供了精准的化疗减量新方案。
高表达群生存
在PD-L1 CPS≥10人群中,接受斯鲁利单抗治疗的患者中位无事件生存期显著长于对照组(未达到对比42.0个月,风险比为0.65)。
全人群生存
在意向治疗人群(CPS≥5)中,斯鲁利单抗组的中位无事件生存期同样显著优于对照组(未达到对比35.9个月,风险比为0.73)。
病理缓解
组织学评估证实,斯鲁利单抗组在CPS≥10人群及意向治疗人群中的病理完全缓解率均显著高于对照组(分别为26%对比6%,以及22%对比6%)。
安全性评估
斯鲁利单抗组发生3级及以上治疗相关不良事件的比例显著低于对照组(47%对比59%),提示免化疗辅助免疫单药阶段具有更好的耐受性。
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09
NEJM:寻找肠炎突变基因的致病元凶,IL-10自身抗体成关键
白细胞介素-10自身抗体炎症性肠病
IF: 84.5
Interleukin-10 Autoantibodies and HLA-DRB1*01:03 in Inflammatory Bowel Disease
Nima Gharahdaghi, Pai-Jui Yeh, Lourdes Ceron-Gutierrez, Helen R Griffin
Hannah Gordon, Chamara Jayamanne, Alice Fracchia, Amanda Y Chong, Alissa Walsh, Oliver Brain, Katherine Baker, Hannah Kockelbergh, Yang Luo, Martha Guevara Becerra, Katherine Vadakethala, Madeleine Coy, Ladan Kabiri, Martin Barnardo, Susanna J Dunachie, Barbara Kronsteiner, Anna Adams, Darren Fowler, Qian Zhang, Laura Fachal
Holm H Uhlig
Article|2026-06-11
10.1056/NEJMoa2513654
背景与设计
针对白介素10(IL-10)中和性自身抗体在炎症性肠病(IBD)中的致病角色,细胞IL-10报告基因及竞争性酶联免疫吸附试验被用于筛查4909例患者与1006例对照的血清样本。
流行率与意义
3.5%的IBD患者存在功能性IL-10中和自身抗体且在对照中完全缺失,该特异表型将已知最强遗传风险因子与后天自身免疫机制建立直接关联。
免疫功能重塑
高抗IL-10活性血清与外周血单个核细胞共培养直接驱动内源性IL-10分泌减少,并伴随IL-23、IL-1β、TNF及IL-6等促炎因子释放显著增加。
核心遗传关联
高分辨率测序及基因型插补模型共同将抗IL-10血清阳性与溃疡性结肠炎极强风险等位基因HLA-DRB1*01:03建立显著关联,阳性比值比高达24.7至50.0。
临床转化方向
自身抗体驱动的IL-10信号持续性阻断构成获得性免疫缺陷表型,携带特定人类白细胞抗原的患者亚群可能从B细胞耗竭疗法中获益。
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10
台大陈秀熙/李宜家等JAMA:算一笔健康经济账,胃肠双筛如何实现收益最大化
幽门螺杆菌粪便免疫化学检测胃肿瘤
IF: 65.4
Cost-Effectiveness of Fecal Immunochemical Testing Alone vs Co-Testing With Helicobacter pylori Stool Antigen
李宜家
Jui-Hsuan Liu, Duco T Mülder, Jeong Yun Yang, Tsung-Hsien Chiang, Wen-Feng Hsu, Han-Mo Chiu, Wei-Wen Su, Kun-Ching Chou, Sam Li-Sheng Chen, Jean Ching-Yuan Fann, Sherry Yueh-Hsia Chiu, Shu-Lin Chuang, Yi-Ru Chen, Teresa Cheng-Chieh Chu, Monal Yu-Hsuan Chang, Shih-Tien Chen, Tsung-Hui Hu, Yi-Jen Fang, 刘志铭, 吴明贤
严明芳, 陈秀熙
Article|2026-06-01
10.1001/jama.2026.6908
背景与设计
针对幽门螺杆菌人群筛查经济学价值未明的问题,基于台湾地区随机临床试验数据构建马尔可夫决策模型,评估了在粪便免疫化学检测基础上增加粪便抗原检测的终生健康收益与成本。
总体概述
联合筛查策略在不完全依从的真实世界场景下展现出显著的成本节约优势与长期健康获益,为制定胃肠道双癌人群联合防控政策提供了关键卫生经济学证据。
成本效益
决策分析模型推演证实,与单一粪便免疫化学检测相比,联合筛查策略每获得一个质量调整生命年可节省2094美元,并在65.7%的概率模拟中维持成本节约优势。
投资回报
净货币效益分析显示该策略的健康获益显著超过筛查成本,在目标人群中实现了5.08的成本效益比,伴随胃癌和结直肠癌死亡率的双重下降。
关键驱动因素
单因素及概率敏感性分析证实,人群H. pylori感染率决定了该策略的经济学表现,当感染率低于21.9%时联合筛查的增量成本效益比将超过支付意愿阈值。
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11
Nat Med:标准化活菌药vs粪菌移植,15株精选肠菌有效预防艰难梭菌复发
复发性艰难梭菌感染活体生物药合成群落
IF: 52.5
15-strain live biotherapeutic product or same donor fecal microbiota transplant for recurrent Clostridioides difficile infection: a randomized phase 1b trial
Lukas Bethlehem
Lorenza Bartu, Gina Marke, Phyu Mar, Sari Feldman, Joseph Eggers, Constantin Ruprecht, Graham J Britton, Varun Aggarwala, Gerold Bongers, Zhihua Li, Nancy Yang, Elizabeth Hohmann, Ilaria Mogno
Jeremiah J Faith, Ari Grinspan
Article|2026-06-02
10.1038/s41591-026-04442-2
背景与设计
为比较体外生产的活菌药(LBP)与粪菌移植(FMT)治疗复发性艰难梭菌感染(rCDI)的差异,开展首项头对头随机对照Ib期临床试验。
核心发现与意义
体外培养的15株菌LBP与来自同一供体的FMT在安全性、有效性及菌株定植方面表现相似,为LBP的临床转化提供了可扩展的制造平台与基于经验性定植数据的菌株筛选策略。
LBP制造与菌株筛选
使用新型可灭菌厌氧室平台,按GMP生产了15株专性厌氧菌LBP(MTC01),其菌株基于既往FMT治疗中高定植频率的经验数据筛选。
临床安全性与有效性
在18名rCDI患者中,LBP与FMT的不良事件发生率相似(各5起),无治疗相关严重不良事件;且在给药后8周分别有7/9和8/9的患者成功预防了感染复发。
菌株定植与剂量效应
MTC01菌株在LBP和FMT给药后均呈现高且持久的定植,高剂量LBP的定植菌株数量显著多于低剂量组,提示LBP存在剂量效应。
微生物群恢复模式
FMT能在1周内快速将患者肠道菌群多样性恢复至供体水平,而LBP仅提供部分菌群,其多样性恢复较慢,最终趋近供体。
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12
Cancer Cell:慢性压力促肿瘤,噬菌体成帮凶
慢性应激肠道菌群菌群易位肿瘤微生物组
IF: 56.1
Chronic stress unleashes an intratumor phage-fibroblast-B cell circuit to promote tumor growth
Hilal Bashir
Katherine Z Sanidad, Purnima Ravisankar, Kelly M. Banks, Avipsa Bose, Shui Yu, Joshua J C McGrath, Hannah C Carrow, Taeyul K Kim, Chloe Troxell, Julia A Brown, Lucy R Hart, Jeremy Goc, Mikala Egeblad, Jayanta Chaudhuri, Han Sang Kim, Patrick C. Wilson, David Lyden, Irina R Matei, Naohiro Inohara, Gregory F Sonnenberg
Melody Y. Zeng
Article|2026-06-25|
OA
10.1016/j.ccell.2026.06.004
背景与研究设计
针对慢性压力影响抗肿瘤免疫的机制问题,利用小鼠结直肠癌和黑色素瘤模型及人类肿瘤样本展开多组学与干预分析。
核心发现与意义
慢性压力通过破坏肠道屏障,驱动肠道共生菌鹑鸡肠球菌(Eg)易位至肿瘤,其释放的噬菌体DNA激活成纤维细胞产生局部糖皮质激素以抑制B细胞反应,为免疫治疗提供新靶点。
屏障受损与菌群易位
皮质酮损害肠道上皮干细胞与潘氏细胞功能导致肠道屏障完整性受损,导致携带特定突变的Eg易位并富集于肿瘤内部。
噬菌体DNA激活成纤维细胞
肿瘤内Eg释放的噬菌体DNA通过TLR9信号通路,显著驱动癌相关成纤维细胞合成并释放局部皮质酮
代谢重编程与免疫抑制
局部皮质酮直接阻断B细胞向氧化磷酸化的代谢转换,内在性抑制生发中心B细胞反应及抗体亲和力成熟从而加速肿瘤生长。
临床相关与靶向干预
在慢性压力荷瘤小鼠中,局部瘤内注射TLR9拮抗剂或氨苄西林,可显著降低瘤内皮质酮水平并抑制肿瘤生长。
人类癌症相关性
人类结直肠癌组织中皮质酮水平升高与GC B细胞减少呈负相关;脑转移瘤宏基因组数据显示噬菌体富集,提示该跨界级联反应可能广泛存在。
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13
果糖的来源比总量更关键,含糖饮料与果汁关联长期高血压风险
果糖含糖饮料果汁水果
IF: 41.3
Consumption of Fructose-Containing Food and Beverage Sources in Childhood Through to Adulthood and Risk of Hypertension: A Prospective Cohort Study
Michelle Nguyen
Hala B AlEssa, Andrea J Glenn, Deirdre K Tobias, Jorge E Chavarro, Walter C Willett, 胡炳长, Anthony J Hanley, Catherine S Birken, J L Sievenpiper
Vasanti Malik
Article|2026-06-22
10.1161/CIRCULATIONAHA.125.077666
队列设计
基于成长今日研究(GUTS)25749名参与者长达25年的随访数据,利用食物频率问卷(FFQ)和Cox比例风险模型评估儿童期至成年期含果糖饮食与自报高血压发病风险的纵向关联。
核心发现
含糖饮料和果汁摄入与高血压发病风险显著正相关,而总果糖当量和完整水果摄入无显著关联,提示果糖来源和食物基质比单一营养素总量更关键。
总果糖摄入
多因素调整及非线性剂量反应分析显示,总果糖当量的长期累积摄入量与高血压发病风险无显著关联。
液态糖风险
最高频次摄入含糖饮料者的高血压风险为最低摄入者的1.52倍,最高频次摄入果汁者的风险为1.35倍,且果汁摄入呈J型关联。
完整水果摄入
较高完整水果摄入量与高血压发病风险无显著关联,支持区分完整水果与果汁等液态糖源的健康效应。
替代效应
模型推测,每天用牛奶、水或完整水果替代1份含糖饮料分别伴随高血压风险降低13%、9%和22%,用完整水果替代1份果汁伴随风险降低19%。
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14
上海药物所谭敏佳团队Cell Metab:肠菌代谢物制造新型蛋白质修饰,损害线粒体功能,或促脂肪肝
肠道菌群代谢物饮食-菌群-宿主互作苯...
IF: 37
Gut microbiota-derived lysine phenylacetylation impairs mitochondrial function and is alleviated by SIRT3
Wei Du, 徐骏宇, Yufeng Li, Mingya Zhang, Yidan Huang, Shaoqian Zhao
Ying Zhou, Lei Zhao, Kexin Xu, Linhui Zhai, Wensi Zhao, Jia Liu, Jiahui Ni, Junxiao Dai, Tianxian Liu, 洪洁, Haowen Jiang, Shuliang Zhao, 张健, Lu Zhou, 王计秋, Bin-Cheng Yin, 刘瑞欣
徐骏宇, 李静雅, 叶邦策, 谭敏佳
Article|2026-06-24
10.1016/j.cmet.2026.05.016
背景与设计
为探究肠道菌群在代谢功能障碍相关脂肪性肝病/炎(MASLD/MASH)中的作用机制,结合高脂饮食小鼠模型、多组学及同位素标记等方法,解析菌群代谢物的作用机制。
核心发现概述
膳食苯丙氨酸经肠道菌群代谢产生的苯乙酸(PAA)驱动一种新型宿主蛋白质翻译后修饰——赖氨酸苯乙酰化(Kpaa),其通过损伤线粒体功能关联MASLD发病机制。
Kpaa发现与鉴定
高脂饮食小鼠PAA及其活性形式PAA-CoA在肝脏中积累,质谱与同位素标记证实存在由PAA驱动的Kpaa修饰。
修饰合成与消除
PAA经宿主肝脏合成酶ACSF2转化为PAA-CoA,从而驱动Kpaa修饰;线粒体去乙酰化酶SIRT3特异性催化该修饰的去除。
线粒体功能损伤
Kpaa底物富集于线粒体;PAA暴露以浓度依赖方式降低细胞耗氧率和线粒体膜电位,伴随活性氧积累与胰岛素信号受损。
关键分子机制
PAA诱导分子伴侣HSP60第481位赖氨酸发生Kpaa修饰,破坏其与HSP10互作,损害线粒体未折叠蛋白反应;过表达SIRT3可逆转此损伤。
临床病理关联
肥胖伴MASH患者及高脂饮食小鼠肝脏中Kpaa水平显著升高且伴随SIRT3表达下降;小鼠肝脏特异性敲低Sirt3加剧高脂饮食诱导的肝脂肪变性。
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15
Cell Metab:既减脂又不掉肌肉,适度甲硫氨酸饮食助抗衰老
长寿饮食法甲硫氨酸胰高血糖素样肽1
IF: 37
Methionine-supplemented longevity diet increases growth hormone, GLP-1, and FGF21; reduces frailty; and promotes healthspan
Maura Fanti
Sebastian Brandhorst, Gerardo Navarrete, Arnold Diaz, Giacomo Giuliani, Dolly Chowdhury, Gabriel Calheiros Antunes, Todd E Morgan, Louis Dubeau, Valentina Villani, Laura Perin, Vasanti Malik, 胡炳长
Valter D Longo
Article|2026-06-23
10.1016/j.cmet.2026.05.015
背景与设计
针对低蛋白饮食易导致老年衰弱的问题,在老年小鼠中对比多种饮食模式,并结合人类流行病学数据评估补充适度甲硫氨酸的长寿饮食(LDMM)的效应。
核心发现与意义
适度甲硫氨酸补充的低蛋白长寿饮食在不限制热量且不引起瘦体重流失的前提下显著改善心脏代谢健康并减少衰弱,提示特定氨基酸配比是平衡健康寿命与肌肉功能的关键。
表型与代谢
长期喂养LDMM显著降低老年小鼠的脂肪量、改善胰岛素敏感性并延缓衰弱指数上升,而西方饮食和生酮饮食导致脂肪量和衰弱显著增加。
分子图谱
肝脏转录组及血清学分析显示,LDMM显著上调循环中的GH、GLP-1和FGF21水平,同时降低IGF-1水平。
核心机制
利用Fgf21敲除小鼠证实,FGF21是驱动LDMM诱导脂肪减少和胰岛素敏感性改善的必需分子。
信号串扰
离体肝细胞及基因敲除模型证实,适度甲硫氨酸通过调节肝脏mTOR-PPARα信号串扰,决定GH驱动FGF21而非IGF-1的分泌。
人群队列
流行病学数据重新分析提示,最高动物蛋白(高甲硫氨酸)摄入人群的2型糖尿病患病率约为最低摄入人群的两倍,伴随超重风险显著增加。
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16
华西医院陈海洋/叶金宝等Cell Metab:脂肪肝如何推高血糖?肝-肠对话揭示新机制
脂肪肝血糖稳态肝-肠轴肝细胞
IF: 37
Hepatocyte-to-intestinal stem cell remote communication regulates blood glucose homeostasis
叶金宝, 万谦益, 刘兴柱, 邓雅文, 张泽宏
陈海鸥, 高朝欣, 张诗语, 朱月丹, 严进华, 袁宇
陈亿, 陈海洋
Article|2026-06-17
10.1016/j.cmet.2026.05.012
背景与设计
针对脂肪肝加剧高血糖的肝外机制不明的问题,利用单细胞转录组测序、谱系追踪及多种小鼠模型解析了肝-肠远程通讯网络。
核心发现与意义
肝源性碱性磷酸酶(ALP)通过抑制肠干细胞向L细胞分化来减少降糖肠肽分泌,靶向抑制肝脏ALP合成可协同增强二甲双胍的降糖疗效。
表型与关联
临床队列与小鼠模型数据显示,脂肪肝伴随血浆ALP水平显著升高及肠道L细胞数量显著减少,且循环ALP与GLP-1水平呈显著负相关。
受体与钙信号
免疫共沉淀及质谱分析证实,肝源性ALP直接结合肠干细胞膜蛋白α2δ-1,驱动电压门控钙通道CaV1.2膜转位并显著升高胞内Ca2+浓度。
转录调控网络
升高的钙信号激活钙调磷酸酶-NFATC2通路,促使活化的NFATC2入核并转录抑制Sox21,进而下调Bmp7表达以阻断肠干细胞向L细胞分化。
干预与治疗
在脂肪肝小鼠中特异性敲除肝脏Alpl显著恢复了L细胞丰度与降糖激素分泌,该策略独立降低了血糖并与二甲双胍产生显著的协同增效作用。
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17
调节菌群并修护肠道屏障,特定纤维或可预防克罗恩病
β-葡聚糖菊粉克罗恩病肠道屏障
IF: 29.7
β-Glucan and Inulin Estimated Intake Are Associated With Reduced Risk of Crohn's Disease, Improved Gut Barrier and Systemic Inflammation Markers, and Multi-Omic Signatures in a High-Risk Cohort
Mingyue Xue, Cathy McShane, Jeongseok Kim
Reihane Khorasaniha, Haim Leibovitzh, Jingcheng Shao, Rirong Chen, Sean Jeong, Karen L. Madsen, Anne M. Griffiths, Thomas D. Walters, A. Hillary Steinhart, Levinus A. Dieleman, Hien Q. Huynh, Remo Panaccione, Guy L. Aumais, Alain Bitton, David Mack, Kevan Jacobson, Brian Bressler, John K. Marshall, Paul Moayyedi, Luba Plotkin
Williams Turpin
Article|2026-05-28
10.1053/j.gastro.2026.05.006
背景与队列设计
针对克罗恩病(CD)发病机制不明的问题,前瞻性追踪3314名无症状一级亲属,利用食物频率问卷评估了总纤维及特定亚型摄入与未来CD风险的关联。
核心发现与意义
较高水平的β-葡聚糖与菊粉摄入与较低的CD风险相关,此关联伴随肠道屏障功能改善、炎症标志物降低及特定多组学特征,提示特定发酵型纤维或可通过调节微生态与肠道屏障成为高危人群的预防靶点。
发病风险评估
中位随访8.5年期间,较高摄入量的β-葡聚糖(风险比0.70)和菊粉(风险比0.68)均与克罗恩病风险降低显著相关。
屏障与炎症标志物
多变量回归模型显示,这两种纤维的高摄入量与较低的血清C反应蛋白和乳果糖-甘露醇比值(肠道屏障功能标志)显著相关。
肠道菌群特征
较高纤维摄入与Ruminococcus torques等致病菌丰度降低相关,且基线Erysipelotrichaceae UCG-003高丰度显著增强该保护性关联,而Colidextribacter高丰度则减弱了该关联。
血清蛋白质组学
较高纤维摄入伴随多种炎症与屏障破坏相关蛋白浓度显著降低,包括髓系细胞触发受体-1、制瘤素M和基质金属蛋白酶-9等。
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18
突破传统肠镜评估局限,多维组学解锁IBD无创监测新路径
炎症性肠病克罗恩病溃疡性结肠炎
IF: 29.7
IBDome: An integrated molecular, histopathological, and clinical atlas of inflammatory bowel diseases
Christina Plattner, Gregor Sturm, Anja A. Kühl, Raja Atreya, Sandro Carollo
Dietmar Rieder, Raphael Gronauer, Michael Günther, Steffen Ormanns, Claudia Manzl, Stefan Wirtz, Asier Rabasco Meneghetti, Ahmed N Hegazy, Jay V Patankar, Zunamys I Carrero, Felix Grabherr, Moritz Meyer, TRR241 IBDome Consortium, Timon E Adolph, Herbert Tilg, Markus Friedrich Neurath, Jakob Nikolas Kather
Christoph Becker, Britta Siegmund, Zlatko Trajanoski
Article|2026-06-10|
OA
10.1053/j.gastro.2026.05.023
背景与设计
针对炎症性肠病(IBD)异质性解析难题,整合1002名患者及对照的多中心全外显子、转录组、血清蛋白质组学及组织病理图像构建了多模态数据图谱。
总体概述
IBDome图谱揭示了克罗恩病(CD)与溃疡性结肠炎(UC)的部位特异性分子特征,并构建出客观评估疾病活动度的无创血液标志物与AI病理学模型。
血清蛋白特征
基于差异丰度开发的包含42种因子的炎症蛋白严重程度特征与内镜活动度评分显著正相关,其中抑瘤素M呈系统性富集升高。
组织转录特征
转录组聚类提示UC结肠伴随MUC17上调,而IL12A等白介素-12信号通路分子特异性驱动结肠CD的局部组织炎症。
疾病定位标志物
多组学交叉比对提示,基质金属蛋白酶-10、IL-17A特异性伴随UC结肠炎症,而干扰素-γ水平显著相关于CD组织炎症严重程度。
AI病理评估
利用视觉基础模型分析H&E染色切片,精准预测了组织学活动度评分(最高R值为0.933),并以0.93的AUROC实现CD与UC的高精度鉴别。
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19
广州医科大张彦团队:肠道神经发育的基因组卫士,PRDM9缺失致巨结肠
PRDM9先天性巨结肠嵌合体启动子缺失
IF: 29.7
PRDM9 Deficiency Drives Mosaic Promoter Deletions in Sporadic Hirschsprung Disease and Supports Blood-based Molecular Stratification
Yun Zhu, Xiaoyu Zuo, Kai Song, Yongxuan Yao, Lihua Huang
Qiuming He, Zipeng Liu, Yi Zheng, Xiaoli Xie, Xinying Zhao, Ye He, Weiyong Zhong, Tuqun Hu, Zhihai Liu, Jiazhang Chen, Shenwei Huang, Xingqiang Lai, Xiaogang Xu, Wei Zhong, Jixiao Zeng
周文浩, 夏慧敏, 张彦
Article|2026-06-05
10.1053/j.gastro.2026.05.020
研究背景与设计
针对散发型先天性巨结肠(HSCR)分子机制不明的问题,整合患者组织多组学、斑马鱼及小鼠和人肠神经嵴细胞(ENCCs)模型探究了非经典致病机制与血液生物标志物。
核心发现与意义
PRDM9缺陷通过驱动发育期DNA双链断裂重定位诱导嵌合启动子缺失(MPDs),损害肠神经元分化,为HSCR提供了基于血液的分子分层新策略。
临床组织观察
多数散发型HSCR患者无神经节肠段伴随神经发生程序协同抑制,且PRDM9启动子显著高甲基化及表达下调。
动物模型表型
斑马鱼和小鼠模型中prdm9/Prdm9敲低导致HuC/D+分化肠神经元显著减少及肠道运动障碍。
体外机制验证
敲除人ENCCs中PRDM9导致DNA双链断裂向启动子和增强子重定位,驱动神经发生基因位点产生MPDs,从而抑制基因表达并损害神经元分化。
临床转化应用
血液MPD分数能显著区分HSCR患者与对照,其与多基因风险评分联合构建的诊断模型性能显著优于PRS单独应用。
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20
港中大于君/刘伟鑫等:肠道致病共生菌"偷渡"进肝脏,促进肝癌发生
肠道菌群致病共生菌肝细胞癌肠-肝轴
IF: 29.5
Gut pathobionts translocate into liver and reshape intrahepatic microbiome to facilitate hepatocellular carcinoma
刘伟鑫, Xueliang Wang
Ying Zhang, Jin-Kai Liu, Meiyi Li, Qianying Zhou, Lina Wang, Shimao Liu, Weikang Chen, Eagle Chu, Harry Cheuk Hay Lau, Qian Song, Xingyu Zhou, Hongyan Gou, Jennifer Xiang Zhang, 田国宝, 王良静, 李晓星, Sui Peng, 黄子隽, Ming Kuang
许丽霞, 于君
Article|2026-06-04|
OA
10.1158/2159-8290.CD-25-1355
背景与设计
整合人类肝细胞癌多区域活检的宏基因组与转录组分析,并利用无菌及特定病原体无特定动物模型,探究肝内微生物组的来源与促癌机制。
核心发现概述
肠道致病共生菌通过受损的肠道屏障易位至肝脏,重塑肝内微环境,驱动促炎与致癌信号通路激活,从而促进肝细胞癌发生。
临床特征
肝细胞癌患者肠道与肝内菌群相似性显著增加,以脆弱拟杆菌为代表的肠道致病共生菌在肝内肿瘤区域显著富集,并与宿主促炎细胞因子及癌基因表达正相关。
动物模型验证
将患者粪便或脆弱拟杆菌灌胃至无菌小鼠可破坏肠道屏障完整性,导致活菌易位定植于肝脏并加剧肝损伤,且在多种肝细胞癌小鼠模型中,脆弱拟杆菌灌胃显著加剧肝脏肿瘤发生。
分子机制
脆弱拟杆菌表面蛋白烯醇酶(Enolase)与肝细胞膜受体波形蛋白(Vimentin)高亲和力结合,驱动MAPK及Ras等致癌信号通路激活以促进肿瘤细胞增殖。
靶向干预
在小鼠皮下移植瘤模型中,敲除宿主细胞Vimentin或使用Vimentin抑制剂可显著消除脆弱拟杆菌驱动的促肿瘤生长效应。
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21
肿瘤微生物负荷决定免疫疗效,干扰素信号是关键
肿瘤菌群微生物负荷干扰素信号通路
IF: 29.5
Tumor microbial burden drives immune responses through regulation of Interferon signaling
Haoyue Liu, Jeong-Hoon Jang, 彭付端, Hajar Rajaei
Vidhi Chandra, Le Li, Dhwani N Rupani, Sedigheh Taghinezhadsaroukalaei, Yuehui Zhao, Erika Y Faraoni, Thais F Bartelli, Olivereen Le Roux, Virginia Tahan, Fernando Jimenez-Arancon, Seyda Baydogan, Amir Hossein Mohseni, Javier A Gomez, Mitesh Patel, Jared K Burks, Barbara Miño Galvez, Daniel E Carvajal-Hausdorf, Erika Ruiz-García, Edith A Fernández-Figueroa, Scott Kopetz
王凌华, L A Diaz, Florencia McAllister
Article|2026-06-26|
OA
10.1158/2159-8290.CD-24-1908
背景与设计
针对肿瘤内微生物负荷(ITMB)如何影响免疫治疗反应的问题,整合多组学队列、单细胞测序及同基因小鼠模型解析了其作用机制。
核心发现与意义
ITMB通过直接上调肿瘤细胞内的干扰素相关基因(IRGs)驱动免疫微环境重塑,是决定免疫检查点阻断(ICB)疗效的关键因素。
人群队列证据
泛癌分析提示,高ITMB的结直肠癌(CRC)和胃癌伴随显著的免疫通路激活与活化肥大细胞浸润,并与晚期CRC患者更长的总生存期相关。
单细胞转录组
人CRC单细胞DNA与RNA联合测序证实,含有微生物的肿瘤细胞特异性上调IRGs及干扰素α响应通路。
体内干预验证
在ICB敏感的小鼠模型中,局部注射抗生素清除肿瘤微生物导致干扰素信号显著下调,并彻底逆转了PD-1抗体的抗肿瘤疗效。
细胞亚群角色
尽管肥大细胞伴随ITMB增加而浸润肿瘤,但利用基因工程缺陷小鼠证实其缺失并不导致ICB抵抗。
分子机制拯救
在肿瘤细胞中敲低ADAR1以强制激活IRGs表达,显著恢复了微生物耗竭状态下小鼠对PD-1阻断的敏感性。
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22
Nature子刊:并非只有菌群能合成,宿主代谢是吲哚与酚类化合物的重要来源
吲哚代谢酚类代谢同位素示踪
IF: 27.5
Host metabolism can produce many indoles and phenols independently of the microbiome
Jenna E AbuSalim
Kellen Olszewski, Salma Youssef, Sarah J Mitchell, Craig Hunter, Jessica Little, Ashley Sidebottom, Jacob A Boyer, Steve D. Knutson, Laith Z. Samarah, Michael R MacArthur, Alessa L Henneberg, Christiane A Opitz, David W C MacMillan, Mohamed S. Donia, Eric G. Pamer, Sabrina Imam, Christopher J Lehmann, Olatoyosi Odenike, Joshua D Rabinowitz
Rolf-Peter Ryseck
Article|2026-06-23|
OA
10.1038/s42255-026-01550-8
研究背景与设计
针对吲哚和酚类代谢物来源不明的问题,本研究采用稳定同位素示踪技术,于小鼠、大鼠及人细胞模型中系统解析其宿主与微生物群来源。
核心发现与意义
哺乳动物宿主代谢独立合成多种重要吲哚和酚类代谢物,挑战其完全依赖微生物群合成的传统观点,为理解其生理调控提供新框架。
宿主合成能力鉴定
短时(2h)无扰13C-氨基酸输注显示,吲哚-3-丙酮酸、吲哚-3-乳酸、苯丙酮酸、苯乳酸及肉桂酸等在循环和组织中被快速标记,证实宿主细胞自主合成。
微生物依赖型代谢物
吲哚-3-丙酸、吲哚硫酸盐、3-苯丙酸、苯酚硫酸盐和对甲酚硫酸盐的标记需长时输注或对抗生素敏感,表明其合成依赖微生物群。
细胞与分子机制
人源细胞系及小鼠肝裂解体能产生上述宿主源性代谢物;转氨酶抑制可阻断合成;谷氨酸草酰乙酸转氨酶1(GOT1)被鉴定为催化起始转氨步骤的关键酶。
临床验证
人临床队列中,宿主源性代谢物的血清水平对抗生素引起的微生物群扰动不敏感,而微生物依赖性代谢物则显著下降。
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23
Nature子刊:掌控肠道耐受的关键,Runx蛋白重塑调节性T细胞
Runx–CBFβ复合物Thetis细胞RORγt+ pT...
IF: 26.5
Runx–CBFβ regulates the development of tolerogenic Thetis cells
Chihiro Ogawa, Chengcheng Zou
Yoselin A Paucar Iza, Motoi Yamashita, Tyler Park, Junji Harada, Naoko Satoh-Takayama, Masahiko Kuroda, Chrysothemis Brown
Ichiro Taniuchi
Article|2026-06-19|
OA
10.1038/s41590-026-02566-8
研究背景与设计
针对肠道耐受性抗原呈递细胞分化机制不明的问题,利用多种基因工程小鼠模型及单细胞表观遗传学技术剖析了Thetis细胞(TC)的发育轨迹。
核心发现与意义
Runx-CBFβ转录复合物驱动关键耐受性TC亚群的分化及RORγt+外周诱导调节性T细胞(pTreg)的产生,为干预肠道炎症提供了新靶点。
基因缺陷表型
Cbfb或Runx3突变小鼠自发结肠炎并伴随肠道RORγt+ pTreg细胞显著减少,其淋巴结中TC II、III和IV亚群几乎完全缺失。
表观遗传调控
染色质可及性分析提示,Runx-CBFβ复合物可能通过结合Rorc基因的+11-kb增强子及Prdm16基因座来调控TC的发育。
靶向挽救效应
在缺陷小鼠的CD11c+细胞中特异性转基因表达CBFβ2或Runx显著恢复了TC IV的分化,并驱动RORγt+ pTreg细胞的重新诱导。
非依赖性机制
经转基因挽救的TC IV缺乏转录因子PRDM16的表达,提示TC IV维持其诱导pTreg细胞的功能并不依赖于PRDM16。
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24
华大陈晨/揭著业等Nature子刊:6.5万基因组!最大阴道菌群图谱揭示种族差异及遗传关联
阴道微生物组宿主遗传学与基因组学宏...
IF: 25.5
Genomic landscape of the human vaginal microbiome is linked to host genetics and population of origin
揭著业, 梁卫婷, 丁秋霞, 刘小敏, 张韵红, 陈娜, 李胜辉
Xin Tong, Hongqin Gao, Ruike Lu, Xincheng Huang, 郭若纯, Junhong Chen, Jie Zhu, Zhe Zhang, Na Liu, Zhangwei Xie, Xiaman Wang, Le Qi, Yumei Li, 肖亮, Shaoqiao Zhang, Xin Jin, 徐讯, Huanming Yang, Jian Wang, 赵方庆
张涛, 郝梨岚, 朱兰, 陈晨
Article|2026-06-11|
OA
10.1038/s41588-026-02639-2
背景与研究设计
整合10665份中国人群及全球公开阴道宏基因组与分离株数据,构建包含65055个基因组的全球阴道宏基因组组装基因组目录,并开展宏基因组全基因组关联分析。
核心发现与意义
全球阴道宏基因组组装基因组目录极大扩展了阴道微生物组参考资源,揭示了显著的种群特异性遗传与功能变异,并鉴定出宿主遗传变异与特定阴道微生物的强关联。
病毒细菌互作
病毒与原核生物共现网络分析提示,疾病相关噬菌体倾向于避开Lactobacillus,而特异性靶向特定病理状态下的优势致病菌。
种群特异性变异
比较基因组学分析证实,美国人群来源的BVAB1菌株较中国人群显著富集毒素产生及抗菌防御等生物合成基因簇,且Bifidobacterium vaginale基因种内存在显著的唾液酸酶与溶细胞素基因分布差异。
宿主遗传关联
宏基因组全基因组关联分析鉴定出7个与阴道物种显著相关的宿主遗传位点,其中最强关联位于宿主OPRK1基因变异与潜在病原体Ureaplasma urealyticum丰度之间。
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25
Nature子刊:大肠癌的变形计,双面细胞状态如何逃避靶向治疗?
结直肠癌Wnt信号通路MAPK信号通路
IF: 25.5
Dynamic transitioning between MAPK-driven and WNT-driven cell states drives intestinal cancer and shapes therapy response
Amanda R Moore
Brian Biehs, Noelyn Kljavin, Thi Thu Thao Nguyen, Akansha Shah, Jeremy Burton, Honglin Jiang, Jenille Tan, Deepankar Chakroborty, Lisa Wang, Nayan Chaudhary, Dongze He, William Lin, Kathryn Mesh, Xin Ye, Kamakoti P. Bhat, Lisa Tai, Shiqi Xie, Weilan Ye, Lisa McGinnis, Shiva Malek
Sandra P. Melo, Frederic J de Sauvage
Article|2026-06-11
10.1038/s41588-026-02611-0
研究背景与设计
针对结直肠癌中KRAS突变与WNT通路协同机制不明的局限,利用不同强度Kras突变模型及类器官,结合单细胞多组学追踪细胞演化轨迹。
核心发现与意义
MAPK与WNT通路分别定义了驱动肿瘤生长与启动的两种可塑性细胞状态,其动态转换介导靶向治疗耐药,联合靶向双通路成为克服耐药的关键。
MAPK驱动再生
强效Kras突变驱动肠道上皮进入高可塑性的MAPK/YAP激活再生状态,同时显著耗竭Lgr5+干细胞,但此状态不足以单独启动肿瘤。
WNT启动肿瘤
在强效Kras突变背景下,肠道肿瘤启动仍绝对依赖于额外的WNT通路激活突变(如Apc缺失),以维持必备的干细胞样状态。
双状态可塑性
多组学证实WNT驱动的干细胞样状态与MAPK驱动的增殖状态在肿瘤内呈空间互斥,抑制单一通路显著驱动细胞向另一状态发生自适应转换。
双重干预机制
在原位小鼠模型中,联合应用APC功能恢复与KRAS抑制剂协同阻断上述两种细胞状态,显著抑制肿瘤生长并克服单一疗法的获得性耐药。
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26
Nature子刊:小肠肿瘤的隐秘推手,COPA突变如何持续激活Wnt信号
COPA突变Wnt信号通路R-spondin
IF: 25.5
Recurrent COPA mutation drives R-spondin-independent Wnt activation in intestinal tumors
Masayuki Fujii, Naoko Abeto
Shotaro Kishimoto, Kouya Shiraishi, Taiki Hashimoto, Nobuyoshi Hiraoka, Satoru Nonaka, Motohiro Kojima, Mami Matano, Sirirat Takahashi, Gabriele Colozza, Bon-Kyoung Koo, Yasushi Yatabe, Motohiko Kato
Toshiro Sato, Shigeki Sekine
Article|2026-06-12|
OA
10.1038/s41588-026-02616-9
背景与设计
多数小肠腺癌缺乏经典Wnt通路驱动基因突变,临床样本测序、患者来源类器官和CRISPR基因编辑被用于解析替代性致瘤机制。
核心概述
COPA复发性框内缺失通过稳定Wnt共受体LRP6,使小肠肿瘤细胞在缺乏R-spondin时仍可维持Wnt信号和生长,揭示了外被体复合物参与肿瘤发生的新机制。
突变特征
外突型小肠腺瘤和腺癌中存在复发性COPA第13外显子框内缺失,并常伴随USP9X截短突变及染色体1q拷贝数中性杂合性缺失。
类器官表型
携带COPA突变的患者来源及基因编辑小肠类器官仍依赖Wnt3A,却不再依赖R-spondin和Noggin,并在去除R-spondin后维持LGR5表达和Wnt信号活性。
分子机制
COPA突变降低细胞表面RNF43蛋白水平,促进LRP6稳定,从而增强细胞对有限Wnt配体的响应并支持R-spondin非依赖性生长。
协同作用
单独敲除USP9X不足以产生相同表型,但在COPA突变背景下可进一步降低RNF43水平,增强LRP6稳定性及类器官的R-spondin非依赖性。
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27
Nature子刊:110万细胞图谱,揭示克罗恩病肠道"免疫伤疤"
克罗恩病单细胞RNA测序细胞图谱回肠
IF: 25.5
Single-cell RNA sequencing of terminal ileal biopsies identifies signatures of Crohn’s disease pathogenesis
Monika Krzak, Tobi Alegbe, D. Leland Taylor, Gareth-Rhys Jones
Mennatallah Ghouraba, Michelle Strickland, Bradley T Harris, Reem Satti, Kenneth Arestang, Lucia Ramirez-Navarro, Nilanga Nishad, Kimberly Ai Xian Cheam, Marcus Tutert, Matiss Ozols, Guillaume Noell, Steven Leonard, Moritz J Przybilla, Ciro Ramirez Suastegui, Eleonora Khabirova, Tong Deng, Hanna Najgebauer, Velislava N Petrova, Carla P Jones, Noor Wana
May Xueqi Hu, Jason Skelton
Article|2026-06-15|
OA
10.1038/s41588-026-02634-7
背景与设计
针对克罗恩病异质性问题,构建包含逾110万个细胞的末端回肠单细胞转录组图谱资源(源自111名患者和232名健康对照),并采用发现-验证队列设计确保结果可重复性。
核心发现与意义
上皮细胞中干扰素驱动的MHC-I类分子持续上调以及ITGA4+巨噬细胞的显著富集共同构成了克罗恩病的核心病理特征,为寻找干预靶点提供了全面框架。
上皮分子伤疤
活动性炎症沿隐窝-绒毛轴广泛驱动了12种上皮细胞中I型干扰素及MHC-I抗原呈递通路的显著激活,且在宏观炎症消退后该上调在祖细胞中依然持续存在。
巨噬细胞作用
ITGA4+巨噬细胞在炎症状态下显著扩增,并伴随JAK-STAT信号及IL-6、IL-12、IL-23等细胞因子通路的显著富集,提示其作为关键炎症驱动节点的潜在作用。
遗传力关联
遗传力分析将疾病易感性与S100A8/9+单核细胞、CXCL9/10+巨噬细胞及特定T细胞亚群的特异性基因表达显著相关联,支持免疫细胞在发病中的潜在因果作用。
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28
中国科学院动物研究所刘光慧/李静宜等Nature子刊:单细胞图谱揭示小肠衰老核心机制,二甲双胍可逆转
小肠肠道衰老单核RNA测序细胞图谱
IF: 25
Single-nucleus interrogation of primate small intestinal aging reveals NCoR1 decline as a conserved feature that is reversed by metformin
李静宜, Xiaoyong Lu, Tianhong Tong, Xin Zhou, Baohu Zhang, Xiaoyan Sun, Bing Zhao, Gang Xu
Jinjiang Yang, Yanling Fan, Jianli Hu, Haoteng Yan, Zhejun Ji, Mingheng Li, Shanshan Che, Yuanhan Yang, Yingjie Ding, Qiaoran Wang, Shuhui Sun, Shuai Ma, Si Wang, Juan Carlos Izpisua Belmonte
曲静, 张维绮, 刘光慧
Article|2026-06-09
10.1038/s43587-026-01131-0
背景与设计
针对灵长类小肠衰老机制不明的问题,利用单核转录组测序对比年轻与年老食蟹猴小肠,并结合人原代上皮细胞及类器官进行多维验证。
核心发现与意义
绘制了首个非人灵长类小肠衰老的高分辨率单细胞转录组图谱,并发现转录辅阻遏物NCoR1的表达下降是肠道衰老的核心保守特征,靶向恢复NCoR1水平(如使用二甲双胍)可延缓肠道衰老进程并维持上皮稳态。
衰老表型特征
年老食蟹猴小肠呈现屏障功能受损与慢性炎症,伴随干细胞分化轨迹由吸收性细胞向分泌性细胞显著偏移。
关键调控节点
多模态数据整合提示,核受体辅阻遏物1(NCoR1)在衰老肠道多细胞谱系中普遍下调,且该特征在人类肠道中高度保守。
体外机制验证
在人小肠上皮细胞与类器官中敲低NCOR1直接驱动细胞衰老及谱系失衡,而过表达该基因显著缓解氧化应激诱导的衰老表型。
体内药物干预
长期给予年老食蟹猴二甲双胍显著恢复了小肠NCoR1蛋白水平,并使肠道单细胞转录组衰老时钟“年轻”1.17年。
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29
Nature子刊:限时进食延长雄鼠寿命和两性健康寿命
限时进食健康寿命昼夜节律热量限制
IF: 25
Time-restricted feeding extends healthspan in both sexes and lifespan in male C57BL/6 J mice
Samantha E Iiams, Nathan J Skinner
Mary Wight-Carter
Victoria Acosta-Rodríguez, Carla B Green, Joseph S Takahashi
Article|2026-06-02
10.1038/s43587-026-01129-8
背景与设计
针对限时进食在标准饮食下对哺乳动物衰老的长期影响不明的问题,对528只C57BL/6J小鼠实施终身12小时或8小时夜间限时进食干预并监测健康与寿命指标。
核心发现与意义
限时进食显著延长了两性小鼠的健康期,且8小时限时进食驱动雄性中位寿命显著延长12%,揭示了该干预在衰老过程中的性别特异性效应。
行为与代谢节律
纵向行为与代谢监测显示,限时进食显著增强了摄食与跑轮活动的昼夜节律振幅,并改善了中年期的体重与体成分。
健康期延长
综合虚弱指数等多项生理与行为指标的健康期指数证实,限时进食显著降低了衰老相关的虚弱程度,且雌性获益时间占总寿命的比例更高。
寿命与病理特征
生存分析及组织病理学评估表明,伴随自发性热量限制的8小时限时进食决定了雄性寿命的延长,而两性在肿瘤与肾小球肾炎等衰老疾病谱上表现出显著差异。
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30
湘雅三医院王晓艳/陈杰等GUT:喝酒如何影响肠炎风险?乙醛代谢基因说了算
乙醛代谢负担炎症性肠病酒精消费乙醛
IF: 24.6
Combined acetaldehyde metabolism burden modifies IBD susceptibility to alcohol consumption
陈杰, Yang Guo, Jia Hu
叶舒雨, Jialu Yao, Henit Yanai, Vipul Jairath, Laurent Peyrin-Biroulet, Fernando Magro
但林涛, 李雪, 王晓艳
Article|2026-06-17|
OA
10.1136/gutjnl-2026-338262
背景与研究设计
针对酒精与炎症性肠病风险关联的争议,整合前瞻性队列、孟德尔随机化、代谢组学及动物与人源类器官模型评估个体乙醛代谢负荷的修饰作用。
核心发现与意义
乙醛代谢负荷显著修饰酒精与炎症性肠病的关联,其中乙醛加剧肠道损伤而乙酸发挥保护作用,为基于个体代谢特征的精准营养干预提供依据。
风险修饰效应
队列分析显示,红酒摄入与低代谢负荷者的克罗恩病风险降低20%显著相关,却伴随高代谢负荷者发病风险升高38%。
群体遗传与代谢
孟德尔随机化提示代理低乙醛水平的高ALDH2表达与疾病风险下降显著相关,且高血清乙酸水平伴随全身炎症及患病风险降低。
表型与机制验证
在DSS小鼠结肠炎与细胞因子刺激的人源结肠类器官模型中,乙醛通过破坏粘膜屏障加剧炎症,而乙酸直接逆转上述损伤。
代谢酶靶向干预
药理学激活或抑制ALDH显著改变乙醛向乙酸的转化比率,从而决定性地缓解或恶化体内结肠炎的病理进展。
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31
GUT:抗菌肽GPR15L改善结肠炎,不靠免疫靠"养菌"
GPR15L肠道菌群结肠炎抗菌肽
IF: 24.6
The endogenous peptide GPR15L shapes the intestinal microbiota to counteract colitis
Miriana Leggio
Sebastian Schramm, Lisa Dietz, Borja Ocón, Stefan Wirtz, Fabiola Puertolas Balint, Bahtiyar Yilmaz, Jana Petzold, Li- Juan Liu, Mark Dedden, Arif Ekici, TRR241 IBDome Consortium, Xi Meng, David Bingham, Karen Anne- Marie Ullrich, Stefanie Heltmann- Meyer, Claudia Günther, Kai Hildner, Raja Atreya, Imke Atreya, Tanja M Müller
Sebastian Zundler
Article|2026-05-28|
OA
10.1136/gutjnl-2025-337619
背景与设计
针对GPR15L在慢性结肠炎中的作用机制不明这一问题,利用基因工程小鼠、微生物组学、抗菌实验及人类炎症性肠病(IBD)队列评估了其对肠道炎症及菌群的影响。
核心发现
GPR15L作为一种内源性抗菌肽,通过重塑肠道稳态菌群而非依赖T细胞招募来缓解结肠炎,为炎症性肠病提供了潜在的局部微生物干预策略。
非依赖性保护作用
Gpr15l缺失显著加剧而过表达显著减轻小鼠结肠炎表型,且该保护作用在缺乏T细胞(Rag1-/-)或GPR15受体的小鼠中依然存在。
菌群重塑效应
同笼饲养及粪菌移植实验证实疾病易感性由肠道菌群介导,测序显示Gpr15l表达伴随肠道内有益菌显著富集而潜在致病菌减少。
直接抗菌活性
厌氧条件下的体外实验证实,GPR15L呈剂量依赖性地选择性抑制病原菌生长,且该活性具有盐敏感性,提示通过电荷相互作用破坏细菌细胞壁。
治疗潜力与临床关联
直肠补充重组GPR15L显著减轻小鼠结肠炎并重塑菌群,且在IBD患者中,结肠GPR15L表达在活动期显著下调,其高表达与更高的微生物多样性及更长的无发作生存期相关。
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32
GUT:调节肠脑轴,神经调节剂与行为疗法改善IBS
肠-脑轴肠易激综合征神经调节剂
IF: 24.6
Efficacy of gut-brain neuromodulators and brain-gut behaviour therapies for irritable bowel syndrome: systematic review and network meta-analysis
Mais Khasawneh
Elyse R Thakur, Vivek C Goodoory, Paul Moayyedi, Christopher J Black
Alexander C Ford
Systematic Review & Meta-analysis|2026-06-26
10.1136/gutjnl-2026-339311
研究背景与设计
肠易激综合征(IBS)常涉及脑-肠轴功能障碍,截至2026年2月8日的随机对照试验被纳入系统综述与网络荟萃分析,用于比较肠-脑神经调节剂和脑-肠行为疗法在成人IBS中的相对疗效。
核心发现与意义
多种肠-脑神经调节剂和脑-肠行为疗法可改善全局IBS症状或腹痛,但疗效排序主要来自低或非常低确定性证据,临床选择仍需结合患者偏好、可及性和安全性。
主要疗效排序
66项试验共6542名患者的主分析显示,与等待名单对照相比,5-羟色胺-去甲肾上腺素再摄取抑制剂(SNRI)排名第一(RR 0.49),三环类抗抑郁药(TCA)排名第二(RR 0.60)。
行为疗法结果
动态心理治疗或情绪处理疗法排名第三(RR 0.62),认知行为疗法(CBT)、疾病自我管理疗法和肠道导向催眠疗法(GDH)也优于等待名单对照。
其他药物比较
选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRI)优于等待名单对照,SNRI在直接与间接比较中优于SSRI和α2δ配体药物,但多数活性治疗之间未见显著差异。
证据质量限制
SNRI排名靠前主要来自高偏倚风险试验,脑-肠行为疗法研究因干预特性难以双盲,部分分析存在发表偏倚或小样本效应。
结论与展望
TCA、动态心理治疗或情绪处理、CBT、疾病自我管理和GDH等疗法对IBS具有可用证据支持,未来仍需更多高质量头对头试验明确不同疗法的相对获益。
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33
浸大翟李翔团队Cell子刊:肠易激腹泻+胰岛素抵抗,一种肠菌代谢物带来双重缓解
腹泻型肠易激综合征胰岛素抵抗乙醇酰胺
IF: 23.2
Gut bacteria that produce fatty acid ethanolamides alleviate diarrhea-predominant IBS with insulin resistance
Shujun Xu, Junfang Lyu, Gengyu Bao
Ping Zheng, Yaqi Li, Ziwan Ning, Baohua Li, Min Zhuang, Hoi Ki Wong, Mingchun Wang, Yufei Zeng, Ya Zheng, Jingyuan Luo, Qin Liu, 张璐, Chengyuan Lin, Haitao Xiao, Chun-Su Yuan
王凯亮, 卞兆祥, 翟李翔
Article|2026-06-19
10.1016/j.chom.2026.05.020
背景与设计
针对腹泻型肠易激综合征(IBS-D)常合并胰岛素抵抗的现象,利用代谢组学分析患者血清,并结合小鼠模型与工程菌,探究微生物代谢物的干预效果和机制。
核心概述
肠道菌群衍生的脂肪酸乙醇酰胺(FAE)作为PPARα激动剂,通过上调5-羟色胺转运体(SERT)降低外周5-羟色胺水平,双重缓解肠道症状与代谢紊乱。
临床关联
队列数据显示,合并胰岛素抵抗的IBS-D患者血清中主要FAE(如油酰乙醇胺OEA)水平显著降低,且与腹泻及腹痛严重程度负相关。
表型验证
在IBS-D小鼠模型中,补充OEA显著缓解腹泻和内脏高敏感性。
机制深挖
单细胞测序及细胞实验表明,OEA激活回肠上皮细胞PPARα信号通路,进而上调SERT表达,促进5-羟色胺再摄取;PPARα拮抗剂或选择性5-羟色胺再摄取抑制剂可阻断该效应。
微生物疗法
定植高FAE粪菌、产FAE的共生菌(直肠真杆菌)或工程菌,均显著提升肠道FAE水平并缓解IBS-D症状。
代谢获益
高脂饮食IBS-D小鼠模型中,OEA不仅缓解肠道症状,还改善了糖耐量和脂代谢。
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34
东南大学姚红红/边亮等Cell子刊:不靠经典受体,靠肠菌!GLP-1药物抗抑郁新机制
肠道菌群利拉鲁肽抑郁症德氏乳杆菌
IF: 23.2
Microbiota-driven gut-brain signaling underlies antidepressant effects of a GLP-1 analog
边亮, 蔡阳, 张媛
Ling Shen, Huijuan Wang, Feng Gao, Ningbo Cai, Wenbo Chen, Conghui You, Yurui Yang, Fang Wang
袁勇贵, 韩冰, 姚红红
Article|2026-06-10
10.1016/j.chom.2026.05.003
背景与设计
针对GLP-1R激动剂神经精神作用机制不明的争议,结合临床观察、Glp1r-/-小鼠及菌群干预模型探究了利拉鲁肽的非经典抗抑郁通路。
核心发现与意义
利拉鲁肽通过GLP-1R非依赖性的肠道菌群-内源性大麻素-脑轴发挥抗抑郁作用,为代谢药物调节情绪提供了非经典机制与潜在干预靶点。
菌群依赖性
在慢性不可预知应激小鼠中,利拉鲁肽的抗抑郁作用在Glp1r敲除后保留,但在抗生素耗竭菌群或无菌小鼠中完全消失。
关键菌种与代谢物
粪菌移植及多组学分析证实,利拉鲁肽选择性富集德氏乳杆菌并显著恢复宿主内源性大麻素2-花生四烯酸甘油(2-AG)水平。
微生物代谢机制
利拉鲁肽直接促进德氏乳杆菌生长及丝氨酸与磷酸烯醇式丙酮酸合成,进而通过细菌三酰甘油脂肪酶提供二酰甘油前体以驱动宿主合成2-AG。
神经环路与干预
补充2-AG或定植德氏乳杆菌可通过激活大麻素受体1(CB1),抑制基底外侧杏仁核和背内侧下丘脑神经元过度激活,从而改善抑郁样行为。
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35
北京安定医院王刚团队Cell子刊:调节菌群-胆汁酸-炎症轴,粪菌移植辅助加速抗抑郁
粪菌移植重度抑郁症肠道菌群胆汁酸
IF: 23.2
Adjunctive fecal microbiota transplantation for major depressive disorder: A randomized, double-blind, placebo-controlled trial
Jing Li, Yaping Wang, Ruinan Li, Huanwei Huang, Xuequan Zhu
Xiaozheng Li, Zuoli Sun, Ling Zhang, 郑鹏, Yi He, Jing Liu, Xueshan Zhang, Siyu Ren, Mingxia Liu, Haixia Wang, Yanting Luo, Fei Wang
周晶晶, 杨健, 王刚
Article|2026-06-17|
OA
10.1016/j.chom.2026.05.017
背景与设计
针对肠道菌群调节能否提升抗抑郁疗效的问题,在一项重度抑郁症患者的随机双盲安慰剂对照试验中,评估了口服粪菌移植(FMT)胶囊辅助艾司西酞普兰治疗的疗效与多组学机制。
核心发现与意义
辅助FMT可加速并增强抗抑郁响应,其作用与供体菌株植入、胆汁酸代谢上调及全身炎症抑制相关联。
临床疗效
尽管第8周临床缓解率无显著差异,但FMT组在治疗第2周临床应答率显著高于安慰剂组(30.0%对6.7%),8周时汉密尔顿抑郁量表评分降幅也更大,且安全性良好。
菌群重塑
FMT导致供体菌株成功植入并与受体菌株共存,并持久富集以Lachnospira eligens为代表的毛螺菌科与颤螺菌科有益分类群。
代谢与免疫调节
FMT促进血清胆汁酸(如GCA、GDCA)水平显著升高,并与抑郁症状减轻相关,伴随IL-6、IL-17A等促炎细胞因子及趋化因子信号早期显著下调。
机制通路
多组学中介分析揭示一条由FMT驱动的微生物-胆汁酸-炎症轴,例如FMT富集的L. eligens通过上调胆汁酸GCA抑制炎症介质caspase-8,进而介导抑郁症状缓解。
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36
营养与健康所丁秋蓉团队Cell子刊:尿酸驱动肥胖的肝-肠轴新机制
尿酸肠道菌群约翰乳杆菌苯乳酸
IF: 23.2
Uric acid promotes dietary lipid absorption through microbiome and metabolomic remodeling via a liver-gut endocrine axis
Cheng Tian, Xiaozhen Guo
Dongmei Wang, Qiubing Chen, Haokun Shen, Xin Li, Chenyu Liu, Yunfei Qi, Yanhao Chen, Linwei Wang, YangYang Wang, Yutang Cao, Yan Liu, Hao Yin, Yan Chen
顾晓松, 江春平, Liming Tang, 谢岑, 丁秋蓉
Article|2026-06-03
10.1016/j.chom.2026.05.005
背景与设计
针对尿酸在肥胖中的因果作用争议,整合人类临床遗传学数据与小鼠模型,解析肝源性尿酸调控肠道脂质吸收的机制。
核心发现
肝脏赖氨酸乙酰转移酶5(TIP60)驱动的尿酸合成,经肝-肠轴抑制肠道约氏乳杆菌及其代谢物苯乳酸产生,解除对PPARα的抑制,从而促进脂质吸收和肥胖。
人群关联
人类血清尿酸水平与肠道膳食脂质吸收能力正相关,遗传学分析将KAT5编码的TIP60锁定为肝脏尿酸合成关键调控因子。
肝肠功能
小鼠肝脏特异性敲除Tip60可降低尿酸,并以依赖肠道菌群的方式,抵抗高脂饮食诱导的肥胖和脂质吸收。
菌群机制
尿酸通过干扰肽聚糖合成,选择性抑制约氏乳杆菌生长,导致其来源的苯乳酸减少。
代谢靶点
苯乳酸抑制肠道PPARα信号及CD36等脂肪酸转运蛋白表达,补充苯乳酸或药理学抑制PPARα均可抑制脂质吸收和肥胖。
治疗潜力
靶向Tip60的siRNA脂质纳米颗粒可降低尿酸,恢复约氏乳杆菌丰度,并逆转已建立的代谢综合征。
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37
Cell子刊:肠菌如何抵抗真菌定植?短链脂肪酸成为关键抑制分子
肠道微生物群短链脂肪酸白色念珠菌
IF: 23.2
Microbiota-derived short-chain fatty acids mediate Candida albicans gastrointestinal colonization resistance
Animesh A. Mishra
Suzette N Palmer, Christina M Zarek, Laura Coughlin, Nicole Poulides, Jana Dakour, Rebecca S. Chiu, Parastoo Sabaeifard, Wenling Li, Aidan C. Morrill, Jiwoong Kim, Shuheng Gan, Cassie L Behrendt, Monika I. Antczak, Xiaowei Zhan, Sebastian E Winter, Joseph M Ready, Lora V Hooper
Andrew Y Koh
Article|2026-06-04|
OA
10.1016/j.chom.2026.05.007
背景与研究设计
针对抗生素耗竭肠道菌群加剧白色念珠菌定植的问题,利用体外培养及小鼠模型探究了菌群衍生短链脂肪酸的抗真菌机制。
核心发现与意义
短链脂肪酸通过直接诱导真菌代谢重编程及依赖肠道菌群重塑的双重机制驱动定植抵抗,为预防侵袭性感染提供了代谢干预策略。
体外直接抑制
多组学分析证实,短链脂肪酸显著诱导白色念珠菌细胞内酸化,导致己糖摄取受损及中心碳代谢与氨基酸合成途径的广泛抑制。
体内菌群依赖性
补充丙酸或丁酸显著抑制常规小鼠肠道白色念珠菌定植,但该效应在无菌或持续抗生素暴露模型中大幅减弱,提示其高度依赖于菌群重塑。
丙酸的核心作用
定植缺乏丙酸合成能力的多形拟杆菌突变体小鼠其限制白色念珠菌定植能力显著下降,而补充菊粉丙酸酯显著促进白色念珠菌清除。
宿主因子非必需
在缺乏抗菌肽、缺氧诱导因子或特定短链脂肪酸受体的小鼠模型中,短链脂肪酸介导的定植保护作用依然存在。
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38
Cell子刊:肠道细菌指挥维生素A流向,重塑早期免疫
肠道菌群菌群-免疫互作维生素A视黄醇
IF: 23.2
The gut microbiota directs vitamin A flux to regulate intestinal T cell development
Tarun Srinivasan
Chaitanya Dende, Kelly A Ruhn, Stefanie L Moye, Ann C Johnson, Cassie L Behrendt, Brian Hassell, Goncalo Vale, Jiwoong Kim, Jake N Lichterman, Chaoying Liang, Carlos A Arana, Prithvi Raj, Xiaowei Zhan, Jeffrey G McDonald
Andrew Y Koh, Lora V Hooper
Article|2026-06-17|
OA
10.1016/j.chom.2026.05.019
背景与设计
针对肠道微生物调控适应性免疫的机制,利用放射性示踪及基因工程小鼠模型解析了维生素A通路的细胞与分子基础。
核心概述
微生物通过协调先天免疫信号与抗原递呈,沿“上皮-髓系-T细胞”轴将膳食维生素A定向递送至发育中的T细胞,决定出生后肠道免疫编程。
通路启动
微生物相关分子模式通过MYD88-ILC3-STAT3级联诱导肠上皮表达血清淀粉样蛋白A(SAA),SAA与髓系细胞LRP1结合驱动视黄醇从上皮向固有层CD11c+髓系细胞转移。
细胞迁移
SAA介导的视黄醇加载激活髓系细胞视黄酸受体信号并诱导CCR7表达,促进其向肠系膜淋巴结显著迁移。
抗原依赖性转移
在肠系膜淋巴结中,微生物抗原通过细胞接触驱动视黄醇从髓系细胞向T细胞转移,该过程依赖髓系细胞视黄醛脱氢酶活性。
发育期功能
该通路在出生后2-6周龄激活;T细胞获取视黄醇后上调肠道归巢基因表达,使得肠道CD4+T细胞显著累积。
菌群作用
单菌定植实验证实分节丝状菌是诱导SAA表达及增强该代谢流的强效驱动菌。
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39
Cell子刊:破坏真菌酸碱平衡,肠菌产物戊酸成抗念珠菌感染新武器
肠道菌群戊酸酸碱平衡近平滑念珠菌
IF: 23.2
Intracellular acidification by microbiota-derived valeric acid facilitates trans-kingdom ecology limiting Candida parapsilosis colonization
Keiko Yasuma-Mitobe
Chen Liao, Tibor Nemeth, Kevin Byrne, Audrey Billips, Ruben J F Ramos, Cristine Nicole Salinas, Eric Chan, Martina Perissinoto, Sophia Adami-Sampson, Ayesha Salman, Ashley M Sidebottom, George Plitas, Geraldine Butler, Justin R Cross, Eric G. Pamer, Attila Gácser, Joao B Xavier
Tobias M Hohl
Article|2026-06-04|
OA
10.1016/j.chom.2026.05.008
背景与设计
针对造血干细胞移植患者肠道近平滑念珠菌(Candida parapsilosis)定植引发感染的问题,利用机器学习筛选毛螺菌科代谢物并结合多模型解析定植抵抗机制。
核心发现与意义
肠道菌群来源的戊酸通过破坏真菌细胞内pH稳态直接抑制近平滑念珠菌生长,为利用代谢物干预跨界生态及降低念珠菌感染风险提供了新策略。
计算预测与临床关联
基于细菌培养上清液代谢组的随机森林模型预测戊酸是强效抑菌剂,且同种异体造血干细胞移植患者粪便中的戊酸丰度与近平滑念珠菌载量显著负相关。
体外抑制与转录重编程
戊酸在酸性环境下呈剂量依赖性地显著抑制多种念珠菌生长,并伴随真菌核糖体功能相关基因下调及脂肪酸β氧化途径上调。
细胞内酸化机制
表达比率型pH敏感荧光蛋白pHluorin的工程真菌株数据显示,戊酸暴露直接导致近平滑念珠菌细胞内发生显著酸化从而丧失pH稳态。
体内干预效果
口服甘油三戊酸酯或微囊化戊酸制剂在无菌小鼠模型中实现了全肠道递送,并显著驱动了检测到戊酸的胃肠道部位中近平滑念珠菌定植与扩增的减少。
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Cell子刊:探寻肠癌元凶,具核梭杆菌致病亚种展现全球地域差异
结直肠癌肠道微生物组荟萃分析
IF: 23.2
Meta-analysis reveals microbiome signatures for colorectal cancer that are universal across age groups and sequencing methods
Selin Pekel, Nicolai Karcher
Morgan Essex, Fabian Springer, Stefano Romano, Quinten R Ducarmon, Christian Schudoma, Martin Larralde, Alberto Lupatin, Sebastian Zeissig, Michael Zimmermann
Georg Zeller
Article|2026-06-24|
OA
10.1016/j.chom.2026.05.030
背景与研究设计
整合全球27项队列的6779份粪便与906份组织测序数据,利用混合线性模型和机器学习解析结直肠癌(CRC)肠道微生物组特征。
跨队列核心特征
梭杆菌属Fusobacterium与消化链球菌属Peptostreptococcus等核心菌属的富集特征在不同测序技术及人群中高度一致,据此构建的统一分类器区分CRC与对照的受试者工作特征曲线下面积达0.84。
年龄亚型一致性
早发性与晚发性CRC患者的肠道微生物富集模式高度重合,疾病状态对菌群组成的变异解释度显著高于发病年龄。
组织与粪便差异
肿瘤组织驻留微生物群与粪便特征高度重合,但早期和近端肿瘤核心菌属在粪便中的富集度偏低,提示粪便检测存在稀释效应。
膳食干预响应
横断面及干预队列分析证实,CRC微生物组特征评分与膳食纤维摄入量呈显著负相关,且高纤维饮食干预显著降低了该特征评分。
毒力及功能演化
宏基因组解析揭示氨基酸降解与毒力因子通路在CRC中显著富集,且具核梭杆菌F. nucleatum动物亚种的富集具全球普适性,其他亚种呈现显著地理差异。
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中山六院李孟鸿/马宁等:肠道细菌跨界投毒,劫持关键通路催化肝癌
粪肠球菌肝细胞癌细胞外囊泡
IF: 21.7
Enterococcus faecalis Extracellular Vesicles Deliver the Bacterial GTPase Obg to Hijack mTOR Signalling in Hepatocellular Carcinoma
马宁
Xiaoshan Xie, Jiarui Wang, Zhikai Zheng, Huilin Jin, Xijie Chen, Xiaoling Huang, Haidan Luo, Yue Wei, Qihao Pan, Boyu Zhang, Jiaying Zheng, Peng Zhang, Fenghai Yu, Xue Liu, Zhi-Min Zhang
周仲国, 孟祥祺, 李孟鸿
Article|2026-06-18|
OA
10.1002/jev2.70323
背景与设计
针对肝细胞癌(HCC)中肿瘤驻留菌机制不明问题,利用测序、CRISPRi及小鼠模型解析了粪肠球菌(E. faecalis)的促癌功能。
核心发现与意义
E. faecalis通过胞外囊泡跨界递送细菌GTP酶EF-Obg直接激活宿主mTOR通路驱动肝癌进展,为微生物指导的个体化治疗提供新靶点。
临床与表型关联
E. faecalis在HCC组织中显著富集,其丰度与患者血清肿瘤标志物水平及较短的无复发生存期相关。
功能与机制
E. faecalis分泌的胞外囊泡被HCC细胞内吞后,其携带的EF-Obg在结构上模拟宿主Rheb的G1结构域,直接结合并激活宿主mTOR复合物驱动下游蛋白翻译。
遗传学验证
利用CRISPRi敲减E. faecalis的obg基因或突变EF-Obg的G1位点,均废除其结合mTOR及促癌能力。
治疗潜力
HCC组织中EF-Obg高表达伴随mTOR过度激活且预示不良预后,在E. faecalis定植小鼠中mTOR抑制剂依维莫司显著抑制肿瘤生长。
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Nature子刊:肠菌酶唤醒雄激素,调控肠神经与肠道运动
肠道菌群雄激素肠神经系统肠道运动
IF: 20.3
Microbial reactivation of host androgens directs enteric neuronal regulation of gut motility
Valentina N Lagomarsino
Ariel Robinson, Perry E. Mitchell, Mira Jiang, Lauren E. Hutchinson, Josh John Sekela, Patrick Caron, McKenzie K. Gehris, Kathleen I. Navas, Murillo Duarte-Silva, Michael Netherland Jr., Nur A. Hasan, Chantal Guillemette, Matthew R. Redinbo
Meenakshi Rao
Article|2026-06-02|
OA
10.1038/s41593-026-02321-0
背景与设计
针对肠道菌群调控肠道运动的机制问题,利用抗生素处理、条件性基因敲除小鼠及宏基因组学,探究雄激素信号在微生物-宿主-神经系统互作中的核心作用。
核心发现与意义
肠道菌群通过β-葡萄糖醛酸酶(GUS)将宿主排泄的无活性雄激素重新激活,驱动其信号传导至肠神经系统,从而调控结肠运动,揭示了一种全新的微生物-宿主-神经轴动态互作机制。
关键神经元靶点
条件性敲除实验证实,雄激素受体(AR)信号在NOS1+肠神经元和Scn10a+脊髓传入神经元中是维持正常肠道转运所必需的,敲除任一类型均导致转运显著减慢。
菌群与雄激素作用
抗生素消耗微生物导致血清睾酮显著降低、消除ENS中的AR表达、肠道运动减慢,该效应在青春期前或睾丸切除的雄激素低下小鼠中消失,而抗生素处理小鼠补充双氢睾酮可部分恢复肠道运动功能并重塑神经元AR表达,提示菌群通过雄激素发挥作用。
GUS酶的核心作用
粪便微生物GUS基因谱与活性在雄性小鼠及人类青春期发生改变;体外证实大肠杆菌GUS能有效去结合雄激素葡萄糖醛酸苷;结肠内灌注该酶足以在抗生素处理小鼠中恢复肠神经系统的AR与NOS1表达。
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中国药科大学高向东团队Nature子刊:改造共生肠菌,诊疗一体治肠炎
工程菌炎症性肠病多形拟杆菌生物传感器
IF: 18.7
Engineered Bacteroides thetaiotaomicron sense gut inflammation and deliver therapeutic molecules to alleviate colitis in mice
叶萌
Xinyu Liu, Zhengxiong Peng, Shuaichao Li, Xiaoyu Jia, Xiyuchen Yang, Shan Jiang, Feng Wang, Xiaobing Yang
虞菊萍, 刘玮, 高向东
Article|2026-06-01
10.1038/s41564-026-02378-4
背景与核心设计
针对炎症性肠病诊疗需求,以人肠道共生多形拟杆菌为底盘,开发整合一氧化氮与脱氧胆酸双传感器的工程菌。
核心成果概述
模块化活菌平台通过AND逻辑门精准感知肠道炎症微环境,驱动治疗分子原位释放,显著缓解小鼠结肠炎并重塑菌群稳态。
生物传感与计算
利用CRISPRi构建响应一氧化氮与脱氧胆酸的AND逻辑门,证实其在双信号输入下驱动基因表达表现出最高响应。
定植与炎症感知
在结肠炎小鼠中,工程菌展现出优于大肠杆菌Nissle 1917的病灶定植能力,并伴随粪便荧光信号显著增强。
靶向递送与修复
双信号驱动工程菌表面展示TFF3或分泌IL-35,体外促使上皮细胞划痕愈合率达46%并显著抑制巨噬细胞促炎因子。
体内干预功效
口服工程菌显著减轻结肠炎小鼠症状,降低肠道TNF-α及IL-6水平,并上调Occludin与Claudin-1以修复肠道屏障。
微环境重塑机制
细菌定植显著增加粪便短链脂肪酸,激活上皮AMPK诱导代谢重编程,提示其通过降低局部氧气与活性氧塑造利于定植的微环境。
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44
上海药物所谢岑团队Nature子刊:高脂饮食破坏大肠黏液微环境,如何导致小肠过度吸油?
膳食脂肪肠道脂肪吸收杯状细胞
IF: 18.7
Dietary fat alters goblet cell function and microbial bile acid metabolism to promote intestinal lipid absorption in mice
Xinyu Liang, Yongxin Zhang, Wei Xie, Jiayi Xiong
Suqin Lin, Yingquan Wen, Yutang Cao, Shuwu Yu, Kanglong Wang, Jie Deng, Jingjie Zhao, Jingyi Xu, Yiyang Hu, Frank J Gonzalez
刘雅萌, 冯琴, 钟逸斐, 谢岑
Article|2026-06-10
10.1038/s41564-026-02381-9
背景与核心设计
针对高脂饮食致代谢障碍机制不明的问题,对比饮食诱导与遗传性肥胖小鼠模型,并利用肠道特异性敲除及代谢干预解析跨肠段调控轴。
核心发现与意义
膳食脂肪通过损害结肠杯状细胞并重塑微生物胆汁酸代谢,激活小肠FXR-PLIN2与PPARα通路驱动脂质吸收,揭示了靶向黏液微环境的干预新策略。
黏液层损伤
高脂饮食选择性导致结肠杯状细胞减少及黏液层变薄,并伴随黏液依赖共生菌嗜黏蛋白阿克曼氏菌显著耗竭。
杯状细胞机制
脂质超载显著抑制杯状细胞谷氨酰胺代谢与氧化还原稳态,直接导致黏液蛋白减少及细胞死亡。
微生物胆汁酸轴
黏液损伤促使胆汁酸转化菌Clostridium scindens扩张,导致次级胆汁酸显著增加,使胆汁酸池偏向FXR激动剂表型。
小肠吸收机制
改变的胆汁酸激活小肠FXR上调Plin2促进脂滴形成,同时膳食脂肪激活PPARα上调Cd36,双管齐下增强脂质摄取。
干预效果
补充谷氨酰胺显著恢复杯状细胞功能与黏液层完整性,重塑菌群与胆汁酸谱,进而抑制FXR-PLIN2信号并减少脂质吸收。
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仁济医院吴文广团队Nature子刊:产毒脆弱拟杆菌促进胆囊癌的双重机制
产肠毒素脆弱拟杆菌脆弱拟杆菌毒素胆...
IF: 18.7
Bacteroides fragilis toxin promotes gall bladder cancer in mice
Jun Chen, Yang An, Aiyanlun Tong, Siyuan Kang, Zisong Xu
Haoyan Liu, Peng Pu, Xiaoling Song
刘颖斌, Jingjing Qi, 吴文广
Article|2026-06-25|
OA
10.1038/s41564-026-02404-5
背景与设计
针对产肠毒素脆弱拟杆菌(ETBF)在胆囊癌(GBC)中的致病机制,综合临床样本、类器官及小鼠模型进行多组学与突变菌株联合解析。
核心发现与意义
ETBF通过表面蛋白锚定与毒素介导的微环境重塑双重机制驱动GBC恶性进展,为靶向肿瘤内微生物治疗提供新思路。
定植与促瘤表型
ETBF在GBC肿瘤中显著富集并定植于胆囊黏膜,其在体内外驱动GBC细胞增殖与肿瘤生长,该促瘤效应严格依赖脆弱拟杆菌毒素(BFT)。
直接互作机制
ETBF表面蛋白MltD特异性结合GBC细胞表面的跨膜丝氨酸蛋白酶13(TMPRSS13),从而激活肿瘤细胞内JAK2-STAT3致癌信号通路。
微环境重塑轴
BFT激活肿瘤细胞NF-κB信号,诱导趋化因子CXCL1分泌,进而招募髓源性抑制细胞(MDSCs)浸润并促进肿瘤血管生成。
正反馈与干预靶点
BFT介导的信号激活进一步上调TMPRSS13表达以增强细菌粘附,而敲除TMPRSS13、清除MDSCs或抑制血管生成可阻断ETBF促瘤效应。
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