【第一百一十二期】AI+药物研发领域一周资讯
2024-01-28
临床结果临床1期紧急使用授权
前言AIDD Pro 根据国内外各大网站以及人工智能药物设计主流新闻网站及公众号，从 AIDD会议、AIDD招聘，重大科研进展、行业动态、最新报告发布等角度，分析挖掘了每周人工智能辅助药物设计领域所发生的、对领域技术发展产生重大推动作用的事件，旨在帮助 AIDD领域研究人员和业内人士及时追踪最新科研动态、洞察前沿热点。如果您觉得符合以上要求的内容我们有遗漏或者更好建议，欢迎后台留言。科研进展2024年1月26日【药物偶联物】J. Med. Chem. | 肽-药物偶联物：下一代肽治疗的新兴方向2024年1月26日【SARS-CoV-2】J. Chem. Inf. Model. | 类黄酮支架对SARS-CoV-2 3CLpro的抑制活性：来自计算和实验研究的见解2024年1月25日【药物发现】J. Med. Chem. | 微循环：加速药物发现的集成和自动化平台2024年1月25日【机器学习】J. Chem. Inf. Model. | 蛋白质分类-基于自由能计算和机器学习方法的蛋白质结合亲和力2024年1月25日【蛋白质结构预测】ACS Omega | PSSP-MFFNet：蛋白质二级结构预测的多特征融合网络2024年1月24日【人工智能】J. Chem. Inf. Model. | AutoMolDesigner for Antibiotic Discovery：一个基于人工智能的小分子抗生素自动设计开源软件具体信息，请滑动下方文字1.【药物偶联物】基于肽科学的最新进展，药物化学家已经开发出一种称为肽-药物偶联物的混合类生物偶联物，与肽和独立的小分子相比，它显示出更高的功效。在这个观点中，我们讨论了如何利用协同肽和小分子的偶联来克服复杂的疾病状态和耐药机制，这些疾病状态和耐药机制由于其多组分活性而无法通过当代治疗。我们强调肽-药物偶联物如何显示出与抗体-药物偶联物相似的多因素治疗机制，但也显示出改进的治疗特性，如不太严重的脱靶效应和具有更大位点特异性的偶联策略。讨论了多肽-药物偶联设计和优化的许多考虑因素，如多肽/小分子配对和化学选择性化学。我们还研究了几种肽-药物偶联物系列，它们对复杂的疾病状态(如神经退行性疾病和炎症)以及具有已建立的耐药机制的病毒和细菌靶点显示出显著的活性。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.3c01835DOI:https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.3c018352.【SARS-CoV-2】由于缺乏有效的抗病毒药物治疗，新冠肺炎疫情的出现已成为一个全球性问题。黄酮类化合物是一类通过抑制主要蛋白酶(3CLpro)对SARS-CoV-2具有抗病毒活性的植物次生代谢物。在本研究中，研究了从天然来源和半合成方法中获得的22种黄酮类化合物对SARS-CoV-2 3CLpro的抑制活性以及对Vero细胞的细胞毒性。利用分子动力学模拟研究了蛋白质与配体的相互作用。此外，还进行了QSAR分析，以阐明结构对生物活性的影响。因此，体外研究表明，四种黄酮类化合物，即tectochrysin(7)， 6″，6″-dimethylchromeno-[2″，3″:7,8]-flavone (9)， panduratin A(19)和genistein(20)，与标准黄酮类化合物黄芩素相比，具有更高的蛋白酶抑制活性。最后，我们的研究结果表明，在Millettia brandisiana中发现的异黄酮染料木素(genistein, 20)具有进一步开发作为SARS-CoV-2 3CLpro抑制剂的潜力。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.3c01477DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.3c014773.【药物发现】我们在此描述了一个模块化技术平台的开发和应用，该平台结合了基于平板的微尺度化学、自动净化、原位定量和机器人液体处理的最新进展，能够快速获取已经格式化用于分析的高质量化学物质。利用微尺度化学，消耗最少的化学物质，该平台不仅高效，而且遵循绿色化学原则。通过重新定位现有的高通量分析技术，该平台可以在每个学习周期中生成每组化合物的完整相关数据包。化学和性质空间的多参数探索由此由主动学习模型驱动。增强的化合物优化过程在前所未有的时间框架内为药物发现项目产生知识。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.3c02029DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.3c020294.【机器学习】理解大脑中神经元连接的复杂现象是神经科学领域的一大研究课题。在果蝇(Drosophila melanogaster)中，已确定dprp - dip相互作用组在这一过程中发挥重要作用。然而，实验数据表明，仅仅是有限的复合物子集，即总共231种复合物中的57种，表现出很强的结合亲和力。在这项工作中，我们试图使用最先进的方法，包括具有几何路线和机器学习(ML)技术的标准结合自由能计算，来确定结合亲和力差异背后的残留物水平分子基础。我们利用统计力学模拟确定了两种复合物的结合亲和力，实现了实验数据的良好再现。此外，我们预测了另外两个低亲和力配合物的结合自由能，而没有实验估计，同时确定了结合的关键残基。此外，通过使用机器学习算法、线性判别分析和随机森林，我们在区分强(同源)和弱(非同源)结合物方面取得了显著的准确性，高达0.99。所提出的机器学习方法包含易于转移的输入特征，使其广泛应用于任何相互作用组，同时促进对结合相互作用至关重要的关键残基的识别。对13个不同物种的相似蛋白家族进行了预测。我们的机器学习模型在这些额外的数据集上表现出值得称赞的性能，展示了其跨物种屏障的可靠性和鲁棒性。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.3c01586DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.3c015865.【蛋白质结构预测】蛋白质二级结构预测(PSSP)是现代生物信息学研究的一项基础任务，对揭示蛋白质的功能机制具有重要意义。为了提高PSSP的准确性，通常使用氨基酸序列产生的各种一般和基本特征来预测二级结构。本文提出了基于深度学习的PSSP多特征融合网络PSSP- mffnet，该网络将多视图深度学习架构与多序列比对(multiple sequence alignment, MSA) Transformer相结合，有效捕获蛋白质序列的全局和局部特征。在实践中，psp - mffnet采用多特征融合策略，将蛋白质序列产生的不同特征进行融合，包括MSA、序列信息、进化信息和隐藏状态信息。此外，我们使用MSA Transformer在输入MSA中交错行和列注意。在特征融合后，采用卷积神经网络和长短期记忆网络的混合网络结构提取高级特征。此外，我们还引入了一个变压器编码器来增强提取的高级特征。独立测试的对比实验结果表明，PSSP- mffnet具有出色的泛化能力，在包括CASP12、CASP13、CASP14、TEST2018和CB513在内的公共基准测试中，PSSP- mffnet平均优于其他最先进的PSSP模型1%。我们的方法有助于更好地理解蛋白质的生物学功能，这对药物发现、疾病诊断和蛋白质工程具有重要意义。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.3c10230DOI：https://doi.org/10.1021/acsomega.3c102306.【人工智能】发现具有新型化学型的小分子抗生素是解决抗生素耐药性的重要策略之一。尽管已经报道了相当数量的致力于分子设计的计算工具，但在专门为小分子抗生素发现开发的整体和高效工具方面存在缺陷。为了解决这个问题，我们报告了AutoMolDesigner，一个专门用于小分子抗生素设计的计算建模软件。它是一个广义的框架，包括两个功能模块，即生成深度学习的分子生成和基于机器学习的自动抗菌活性/特性预测，其中单独训练的模型和策划的数据集对于基于全细胞的抗生素筛选和设计是开箱即用的。它是开源的，因此允许合并新特性以灵活使用。与大多数基于Linux和命令行的软件程序不同，该应用程序配备了基于qt的图形用户界面，可以在具有多种操作系统的个人计算机上运行，使实验科学家更容易使用。该软件和相关材料可在GitHub (https://github.com/taoshen99/AutoMolDesigner)和Zenodo (https://zenodo.org/record/10097899)上免费获得。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.3c01562DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.3c01562上下滚动查看更多药企动态2023年1月27日【新时代药业】新时代药业利妥昔单抗生物类似药申报上市2023年1月26日【赛诺菲】首个！度普利尤单抗新适应症获FDA批准，治疗1至11岁EoE患儿2023年1月26日【辉瑞】重磅口服偏头痛新药！辉瑞CGRP受体拮抗剂在华获批上市2023年1月26日【强生】强生EGFR/c-MET双抗组合疗法在华申报上市2023年1月25日【药明生物】药明生物推出全新细胞株平台WuXia ADCC PLUS™赋能合作伙伴研发生产高ADCC活性无岩藻糖基化抗体2023年1月25日【CG Oncology】今年首家生物技术公司成功IPO，融资3.8亿美金，专注于基因疗法2023年1月24日【药明合联】药明合联与Celltrion就抗体偶联药物综合服务达成合作各动态具体信息，请滑动下方文字1.【新时代药业】1月27日，CDE网站显示，山东新时代药业的利妥昔单抗生物类似药上市申请获受理。原研利妥昔单抗来自罗氏旗下Genentech，是一种靶向CD20的治疗性单克隆抗体，1997年首次获FDA批准上市，并于2000年进入中国市场，商品名为美罗华。2013年原研利妥昔单抗注射液中国专利到期，多家国内外制药企业加入其生物类似药的研发。链接网址请戳我2.【赛诺菲】1月26日，赛诺菲/再生元共同宣布，FDA已批准Dupixent（度普利尤单抗）新适应症，用于1至11岁嗜酸性粒细胞性食管炎（EoE）患者的治疗。新闻稿指出，Dupixent是目前美国首款也是唯一一款用于治疗这些患者的药物。链接网址请戳我3.【辉瑞】1月26日，辉瑞宣布，其偏头痛药物硫酸瑞美吉泮口崩片（Rimegepant）在华获批上市，用于成年人有或无先兆偏头痛的急性治疗。Rimegepant是全球首个且唯一个采用专利口崩片技术的降钙素基因相关肽(CGRP)受体拮抗剂,2020年2月首次获FDA批准用于成人急性偏头痛的治疗，2021年5月，又扩展新适应症，用来预防成人发作性偏头痛。链接网址请戳我4.【强生】1月26日，CDE网站显示，强生两款创新药物EGFR/c-MET双抗埃万妥单抗（amivantamab）EGFR/c-MET双抗埃万妥单抗（amivantamab）以及三代EGFR抑制剂兰泽替尼片（Lazertinib）EGFR抑制剂兰泽替尼片（Lazertinib）上市申请均获药监局受理，推测申报适应症为二者联合治疗EGFR突变局部晚期或转移性非小细胞肺癌（NSCLC）EGFR突变局部晚期或转移性非小细胞肺癌（NSCLC）患者。链接网址请戳我5.【药明生物】1月25日，全球领先的合同研究、开发和生产（CRDMO）服务公司药明生物宣布推出全新哺乳动物细胞株构建技术平台WuXiaADCC PLUSTM。该平台为高效、高产量、高ADCC活性的无岩藻糖基化抗体开发和生产平台。链接网址请戳我6.【CG Oncology】1月25日，CG Oncology成为首家于 2024 年 IPO的生物科技公司，首日股价大涨96%，市值达到22.5亿美元。值得注意的是，公司通过此次IPO发售中募集了3.8亿美元，超出原先2亿美元的预期。一些行业媒体指出，CG Oncology公司的表现可能成为今年IPO市场的晴雨表。链接网址请戳我7.【药明合联】1月24日，药明合联与韩国生物制药公司Celltrion共同宣布签署合作备忘录（MOU），为包括抗体偶联药物（ADC）在内的生物偶联药开发和生产提供全面的综合服务。链接网址请戳我上下滚动查看更多会议信息2024年2月28-29日 举办AntibodyChina 第七届抗体药物深度聚焦峰会2024年3月21-22日 上海恺默信息咨询有限公司举办SIT 2024第六届小分子药物创新与合作大会2024年3月21-22日 上海恺默信息咨询有限公司举办PDD 2024多肽药物产业发展大会2024年4月18-19日 举办第四届I-RNA小核酸药物深度聚焦峰会2024年6月27-28日 举办上海求实医药咨询有限公司ING 2024第七届免疫及基因治疗论坛各会议具体详情和参会方式，请滑动下方文字AntibodyChina 第七届抗体药物深度聚焦峰会会议时间：2024年2月28-29日会议地点：上海会议主旨：峰会议题跨越抗体药物研发的最前沿，追踪最新的临床进展，致力于打破行业的封闭循环，破除行业内卷，助推创新多元发展！一切尽在抗体药物的年度产业大会！链接网址请戳我SIT 2024第六届小分子药物创新与合作大会主办方： 上海恺默信息咨询有限公司会议时间：2024年3月21日-22日会议地点：上海会议主旨：峰会议题跨越小分子药物研发的热点领域，一览当下化学创新药研发新动向，致力于打破行业的封闭循环，破除行业内卷，助推创新多元发展！一切尽在小分子药物的年度产业大会！链接网址请戳我PDD 2024多肽药物产业发展大会主办方： 上海恺默信息咨询有限公司会议时间：2024年3月21日-22日会议地点：上海会议主旨：共谈多肽减重药物、多肽药物的法规与申报、开发案例与趋势、CMC 各个环节中的难点与挑战。力求为多肽企业致力于多肽药物研究的专家及科研人员提供一个深度的思想碰撞及经验分享平台。链接网址请戳我第四届I-RNA小核酸药物深度聚焦峰会会议时间：2024年4月18日-19日会议地点：苏州会议主旨：破解递送挑战与CMC难点，汇聚最新临床进展与热门研发方向；构建小核酸药物专属交流平台，打造产业闭环，推动国产小核酸药物产业化进程。链接网址请戳我ING 2024第七届免疫及基因治疗论坛主办方：上海求实医药咨询有限公司会议时间：2024年6月27日-28日会议地点：北京会议主旨：聚焦CGT领域开发的核心问题，破除技术壁垒，推动产业不断前进，开启生物医药产业下一个风口！链接网址请戳我上下滚动查看更多版权信息本文内容均由小编收集于公开的各个网络平台，发布的目的仅为了方便大家一站式了解AIDD行业信息，并未对发布源头进行真实性验证。如您发现相关信息有任何版权侵扰或者信息错误，请及时联系AIDD Pro（请添加微信号sixiali_fox59）进行删改处理。原创内容未经授权，禁止转载至其他平台。有问题可发邮件至sixiali@stonewise.cn关注我，更多资讯早知道↓↓↓
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