【第一百一十四期】AI+药物研发领域一周资讯
2024-02-17
临床结果临床1期
前言AIDD Pro 根据国内外各大网站以及人工智能药物设计主流新闻网站及公众号，从 AIDD会议、AIDD招聘，重大科研进展、行业动态、最新报告发布等角度，分析挖掘了每周人工智能辅助药物设计领域所发生的、对领域技术发展产生重大推动作用的事件，旨在帮助 AIDD领域研究人员和业内人士及时追踪最新科研动态、洞察前沿热点。如果您觉得符合以上要求的内容我们有遗漏或者更好建议，欢迎后台留言。科研进展2024年2月15日【靶向DNA】ACS Materials Lett. | 靶向DNA的生物活性光敏剂用于恶性肿瘤的化学光动力治疗2024年2月14日【SARS-CoV-2】ACS Omega | SARS-CoV-2细胞识别潜在抑制剂的生物物理分析及其对不同细胞类型病毒动力学的影响:基于体外实验数据的计算预测2024年2月13日【药物发现】ACS Med. Chem. Lett. | 人工智能在制药：MYC调节化合物和BET蛋白抑制剂改变药物发现和战略管理2024年2月13日【化学空间】ACS Cent. Sci. | 基于蛋白质结构的有机化学驱动的超大化学空间配体设计2024年2月13日【分子动力学模拟】J. Phys. Chem. B | 预测突变对蛋白激酶稳定性影响的波茨哈密顿模型和分子动力学自由能模拟2024年2月12日【抑制剂】J. Chem. Inf. Model. | 基于结构的SARS-CoV-2主要蛋白酶非共价中药抑制剂的发现具体信息，请滑动下方文字1.【靶向DNA】设计一种有效结合化疗和光动力疗法的生物活性光敏剂仍然是一个重大挑战。本文介绍了一种DNA靶向生物活性光敏剂CQA，它将DNA烷基化部分氯甲基与光敏部分结合在一起。通过DNA损伤实验和分子对接，CQA已被证明是一种有效的DNA靶向和靶向化疗药物。同时，CQA能显著放大光照下的DNA损伤。这种增强归因于蒽醌基团的引入，蒽醌具有良好的氧化还原性能，并作为电子受体促进电子转移。因此，CQA有效地产生i型和ii型活性氧(ROS)，发挥了良好的光动力治疗(PDT)效果。通过体内肿瘤生长实验、H&E染色和免疫组化分析，证实了CQA的抗肿瘤功效。本研究的设计强调靶向DNA损伤和增强ROS生成，强调高效协同化疗和光动力治疗在推进癌症治疗策略中的关键作用。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsmaterialslett.3c01511DOI：https://doi.org/10.1021/acsmaterialslett.3c015112.【SARS-CoV-2】最近的报告表明，细胞对SARS-CoV-2感染的易感性可能受到多种可能充当病毒受体的蛋白质的影响。为了进一步研究这一点，我们使用不同的细胞系统(Vero E6, HeLa, HEK293和CaLu3)在存在和不存在药物(驱虫剂，arb，抗凝血剂，丝氨酸蛋白酶抑制剂，抗疟药和非甾体抗炎药)的情况下进行了病毒动力学模拟，这些药物根据实验数据显示会影响刺刺蛋白的细胞识别。我们的模拟显示，模拟细胞系统对SARS-CoV-2感染的易感性在所有测试系统中都是相似的。值得注意的是，CaLu3细胞对SARS-CoV-2感染表现出最高的易感性，这可能是由于ACE2以外的受体的存在，这可能是观察到的易感性的重要部分。在整个研究过程中，所有被测试的化合物都显示出与刺突蛋白的热力学有利和稳定的结合。在所测试的化合物中，抗凝血药那莫他在热力学、动力学、理论抗病毒活性以及与受测试细胞系中SARS-CoV-2刺突蛋白介导的感染相关的潜在安全性(毒性)方面表现出最有利的特性。该研究提供了数学和生物信息学模型，可以帮助确定用于化合物评估和检测的最佳细胞系，特别是在重新利用药物及其作用机制的研究中。值得注意的是，这些观察结果应该经过实验验证，这项研究有望启发未来的定量实验。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.3c06968DOI：https://doi.org/10.1021/acsomega.3c069683.【药物发现】人工智能(AI)和突破性药物发现的协同整合正在重塑药物研发的格局，主要集中在myc调节化合物和BET蛋白抑制剂上。本专利重点研究了这一融合，说明了制药行业在药物开发、战略管理和治疗各种疾病(从癌症到炎症和纤维化疾病)方面的转型转变。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsmedchemlett.4c00057DOI：https://doi.org/10.1021/acsmedchemlett.4c000574.【化学空间】描述数十亿种化合物的超大化学空间正在彻底改变早期药物发现的命中识别。由于它们的大小，这些化学空间不能完全枚举，并且需要专门的计算工具来导航它们并选择可能有趣的点。在此，我们提出了一种基于结构的超大化学空间筛选方法，首先将商业化学试剂与感兴趣的靶标对接，然后根据有机化学和拓扑规则直接连接，在靶标的三维约束下枚举类药物化合物。当应用于针对两种药物感兴趣的受体(雌激素β受体，多巴胺D3受体)的不同大小和化学复杂性的定制化学空间时，计算方法能够快速枚举命中目标受体的已知配体(或非常接近的类似物)以及化学上新颖的候选物，这些候选物可以通过体外结合试验实验证实。所提出的方法是通用的，可以应用于任何对接算法，并且需要很少的计算资源来优先考虑从数十亿大小的化学空间中容易合成的命中。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acscentsci.3c01521DOI：https://doi.org/10.1021/acscentsci.3c015215.【分子动力学模拟】激酶蛋白的单点突变可以影响其稳定性和适应性，对这些影响的计算分析可以深入了解该酶家族的蛋白质序列、结构和功能之间的关系。为了评估突变对蛋白质稳定性的影响，我们使用基于序列的激酶家族多序列比对(MSA)训练的Potts哈密顿模型来计算突变的统计能量(适应度)效应，并将其与显性溶剂中全原子分子动力学自由能扰动(FEP)模拟计算的相对折叠自由能(ΔΔGs)进行比较。Potts模型(ΔEs)中突变的适应度效应与实验热稳定性数据非常吻合(Pearson r = 0.68)，与基于结构的相对FEP模拟预测的ΔΔGs的相关性相似。认识到使用Potts模型快速估计癌症基因组学数据中看到的激酶突变的蛋白质稳定性效应的可能优势，我们使用Potts统计能量模型估计了基因组数据共享(GDC)数据库中报告的三种不同激酶(Wee1, Abl1和Cdc7)的65个保守和非保守突变的稳定性效应。由Potts模型计算的这些突变的ΔEs与FEP模拟的相应ΔΔGs一致(Pearson比值为0.72)。这些方法之间的一致性表明，Potts模型可以用作基于序列的工具，用于高通量筛选突变效应，作为预测突变稳定性效应的计算管道的一部分。我们还演示了基于适应度的Potts模型计算的可伸缩性如何允许使用FEP模拟不容易访问的分析。为此，我们在Potts模型中采用了位点饱和诱变，以研究不同癌症进化情景中突变的相对稳定性效应。我们使用这种方法来分析药物压力对Abl激酶的影响，通过对比在各种癌症类型中看到的体细胞突变的相对适合度惩罚与癌症耐药性相关突变的计算结果。我们观察到，与在各种肿瘤中看到的似乎中性进化的Abl体细胞突变相反，在Abl靶向治疗的药物压力下进化的癌症突变倾向于保持酶的稳定性。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.3c08097DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.3c080976.【抑制剂】中医药被广泛应用于治疗由严重急性呼吸系统综合征(SARS-CoV-2)引起的2019冠状病毒病(COVID-19)。然而，需要发现更多具有不同支架的SARS-CoV-2 Mpro抑制剂，以优化抗SARS-CoV-2先导化合物。本研究通过综合的计算机和体外实验，确定中药复方对SARS-CoV-2 Mpro的潜在抑制剂，Mpro是SARS-CoV-2的重要治疗靶点。通过对18263种中药化合物与15种SARS-CoV-2 Mpro构象的集合对接分析，确定了19种有潜力的中药化合物。体外实验证实3种化合物均为SARS-CoV-2 Mpro抑制剂，IC50值分别为4.64±0.11、7.56±0.78和11.16±0.26 μM, EC50值分别为12.25±1.68、15.58±0.77和29.32±1.25 μM。分子动力学(MD)模拟表明，这三种配合物在最后100 ns的生产运行中保持稳定。结合模式分析表明，活性化合物通过与关键氨基酸(如HIS 41、ASN 142、GLY 143、MET 165、GLU 166或GLN 189)的非共价相互作用，以特定的姿态占据SARS-CoV-2 Mpro活性位点的不同亚位(S1、S2、S3和S4)。总的来说，本研究提供的证据表明，从中药中获得的三种天然产物可以进一步用于抗covid -19研究，证明了中草药成分作为治疗靶点的生物活性成分的研究是合理的。链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.3c01327DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.3c01327上下滚动查看更多药企动态2023年2月16日【赛诺菲】再下一城！度普利尤单抗新适应症获批，治疗慢性自发性荨麻疹2023年2月15日【礼来】礼来将启动GLP-1R/GIPR/GCGR激动剂头对头司美格鲁肽III期研究2023年2月14日【亚盛医药】FDA批准耐立克全球注册III期研究，治疗经治慢性髓细胞白血病慢性期成人患者2023年2月14日【强生】显著降低截肢风险！首个重度冻伤疗法获FDA批准2023年2月13日【BioAge Labs】聚焦新一代减重疗法！礼来合作伙伴BioAge完成1.7亿美元D轮融资2023年2月12日【武田】首个！武田布地奈德口服混悬剂在美上市，治疗11岁及以上EoE各动态具体信息，请滑动下方文字1.【赛诺菲】2月16日，赛诺菲/再生元宣布，日本厚生劳动省（HLW）批准Dupixent（度普利尤单抗）用于治疗12岁及以上、现有治疗方法无法充分控制的慢性自发性荨麻疹（CSU）。日本是首个批准Dupixent治疗CSU的国家。链接网址请戳我2.【礼来】2月15日，clinicaltrials.gov网站上登记了GLP-1R/GIPR/GCGR三靶点激动剂retatrutide的一项随机、多中心、开放标签的III期临床试验（研究代号：TRANSCEND-T2D-2，NCT06260722），旨在评估retatrutide相较于司美格鲁肽在二甲双胍联合或不联合钠-葡萄糖共转运体2抑制剂（SGLT2i）治疗血糖控制不佳的2型糖尿病患者中的有效性和安全性。链接网址请戳我3.【亚盛医药】2月14日，亚盛医药宣布美国FDA已同意奥雷巴替尼（商品名：耐立克；研发代号：HQP1351）开展一项全球注册III期临床研究，用于治疗既往接受过治疗的慢性髓细胞白血病（CML）慢性期（-CP）成年患者。这是耐立克获FDA批准的首项注册III期临床研究，是其国际临床开发的又一项重大里程碑。链接网址请戳我4.【强生】2月14日，FDA官网显示，强生收购Actelion Pharmaceuticals而获得的Aurlumyn（伊洛前列素注射液）获批用于治疗成人重度冻伤，以降低手指或脚趾截肢的风险。这也是重度冻伤患者拥有的首个治疗选择。链接网址请戳我5.【BioAge Labs】2月13日，BioAge Labs公司宣布已完成1.7亿美元的D轮融资，这也是2024年生物技术行业目前为止最大的一轮私人融资，这家加州初创公司正全力投入于当下最热门的减肥领域，以期开发新一代口服减肥药并保护肌肉。链接网址请戳我6.【武田】2月12日，武田宣布FDA已批准布地奈德口服混悬剂（TAK-721，商品名为EOHILIA）上市，这是首款也是唯一一款获FDA批准的用于11岁及以上嗜酸性粒细胞性食管炎（EoE）患者的口服疗法。链接网址请戳我上下滚动查看更多会议信息2024年2月28-29日 举办AntibodyChina 第七届抗体药物深度聚焦峰会2024年3月21-22日 上海恺默信息咨询有限公司举办SIT 2024第六届小分子药物创新与合作大会2024年3月21-22日 上海恺默信息咨询有限公司举办PDD 2024多肽药物产业发展大会2024年4月18-19日 举办第四届I-RNA小核酸药物深度聚焦峰会2024年6月27-28日 举办上海求实医药咨询有限公司ING 2024第七届免疫及基因治疗论坛各会议具体详情和参会方式，请滑动下方文字AntibodyChina 第七届抗体药物深度聚焦峰会会议时间：2024年2月28-29日会议地点：上海会议主旨：峰会议题跨越抗体药物研发的最前沿，追踪最新的临床进展，致力于打破行业的封闭循环，破除行业内卷，助推创新多元发展！一切尽在抗体药物的年度产业大会！链接网址请戳我SIT 2024第六届小分子药物创新与合作大会主办方： 上海恺默信息咨询有限公司会议时间：2024年3月21日-22日会议地点：上海会议主旨：峰会议题跨越小分子药物研发的热点领域，一览当下化学创新药研发新动向，致力于打破行业的封闭循环，破除行业内卷，助推创新多元发展！一切尽在小分子药物的年度产业大会！链接网址请戳我PDD 2024多肽药物产业发展大会主办方： 上海恺默信息咨询有限公司会议时间：2024年3月21日-22日会议地点：上海会议主旨：共谈多肽减重药物、多肽药物的法规与申报、开发案例与趋势、CMC 各个环节中的难点与挑战。力求为多肽企业致力于多肽药物研究的专家及科研人员提供一个深度的思想碰撞及经验分享平台。链接网址请戳我第四届I-RNA小核酸药物深度聚焦峰会会议时间：2024年4月18日-19日会议地点：苏州会议主旨：破解递送挑战与CMC难点，汇聚最新临床进展与热门研发方向；构建小核酸药物专属交流平台，打造产业闭环，推动国产小核酸药物产业化进程。链接网址请戳我ING 2024第七届免疫及基因治疗论坛主办方：上海求实医药咨询有限公司会议时间：2024年6月27日-28日会议地点：北京会议主旨：聚焦CGT领域开发的核心问题，破除技术壁垒，推动产业不断前进，开启生物医药产业下一个风口！链接网址请戳我上下滚动查看更多版权信息本文内容均由小编收集于公开的各个网络平台，发布的目的仅为了方便大家一站式了解AIDD行业信息，并未对发布源头进行真实性验证。如您发现相关信息有任何版权侵扰或者信息错误，请及时联系AIDD Pro（请添加微信号sixiali_fox59）进行删改处理。原创内容未经授权，禁止转载至其他平台。有问题可发邮件至sixiali@stonewise.cn关注我，更多资讯早知道↓↓↓
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