英伟达投资的顶级AI制药Recursion，让药物发现工业化

2024-04-11

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▲5月30-31日第八届广州生物医药创新者峰会扫码立即报名注：本文不构成任何投资意见和建议，以官方/公司公告为准；本文仅作医疗健康相关药物介绍，非治疗方案推荐（若涉及），不代表平台立场。任何文章转载需得到授权。在前段时间举行的2024年世界政府峰会期间，英伟达/NVIDIA的创始人/CEO黄仁勋在会上表示，现在已经不是人人必须学计算机的时代了，人类生物学才是最复杂的科学之一，这一领域具有难以置信的影响力，但与其他领域相比，目前生命科学领域只能取得零星的进展。回顾整个2023年，英伟达多次出手，投资生命科学领域，其中不乏AI新药研发企业。2023年7月12日，AI制药上市公司Recursion Pharmaceuticals宣布获得英伟达5000万美元私募股权投资，英伟达将获得该公司约4%的股份。同时，Recursion计划利用其庞大的专有生物和化学数据集（超过23千兆字节和3万亿可搜索基因和化合物关系），加速英伟达DGX™ Cloud上基础模型的训练，从而帮助英伟达生成式AI药物发现云服务平台BioNeMo的商业化许可和发布。英伟达还将利用其AI堆栈和全堆栈计算专业知识，帮助Recursion优化和扩展基础模型。预计Recursion将使用英伟达的BioNeMo软件来支持其内部和合作伙伴的管线。合作宣布当日，Recursion（NASDAQ:RXRX）股价暴涨78.17%。Recursion Pharmaceuticals将自身定位为一家TechBio公司（科技生物公司），通过解码生物学（decode biology），使药物发现工业化（industrialize drug discovery）。其愿景是利用计算和机器学习的进步来解决药物发现和开发效率下降的问题。Recursion的联合创始人兼首席执行官Chris Gibson博士在犹他大学攻读医学博士期间，在联合创始人Dean Li博士（默沙东实验室现任总裁）的实验室中开发了Recursion最初的技术和方法；总裁兼首席运营官Tina Marriott Larson女士在生物制药领域拥有20多年的行业经验，曾在基因泰克、罗氏和Achaogen担任高级领导职务；首席技术官Benjamin Mabey在计算机科学、机器学习、软件工程和数据科学领域拥有超过15年的行业经验，曾担任Savvysherpa的高级数据科学家、Red Brain Labs的首席技术官；首席医学官David Mauro博士在肿瘤药物开发方面拥有20多年的经验，曾担任Codiak BioSciences、Checkmate Pharmaceutical、Prelude Therapeutics和Advaxis的首席医疗官，还曾在默沙东、百时美施贵宝和Becton Dickinson的临床和医疗事务团队中担任领导职务。Recursion正在构建生物、化学、自动化、数据科学和工程学的创新集成，在跨越了药物开发过程中几十个关键工作流程的全堆栈解决方案中，使药物发现工业化。例如，通过将高内涵显微镜技术与阵列式CRISPR基因组编辑技术相结合，可以在多种人类细胞环境中严格地描绘庞大的、高维的生物和化学扰动库，以创建人类生物学的数字“图谱”，并利用大规模计算能力，进行大规模的虚拟筛选来预测数十亿种化合物的蛋白质靶点。类似地，利用Recursion从自动DMPK模块和交互式平台生成的数据，能够分别预测ADME特性并识别毒性信号，明显快于传统方法。Recursion认为，利用这种方法可以从科研以外获得新的生物学见解，减少生物学发现中固有的人类偏见的影响，并在项目开始时就降低转化风险。Recursion操作系统（Recursion OS）是该公司的核心，这是一个跨多种技术构建的平台，能够在超过50pb的专有数据中描绘和处理数万亿种生物、化学和以患者为中心的关系。该公司将这种物理组件和数字组件的集成构建为“原子和比特”的迭代循环，将规模化的“湿实验室”生物学、化学和以患者为中心的实验数据（原子）由“干实验室”计算工具（比特）组织起来，从而识别、验证和转化治疗方面的见解。Recursion相信无偏见的、以数据驱动理解生物学的方法将为患者带来更多、更新、更好的药物。回顾2013年底，Recursion刚建立之时还是犹他州的一家小型初创公司，由两名研究生和一名教授创立，第一个办公室是附近大学研究园区的一个会议室，第一个实验室是从一间储藏室改造来的。而如今的Recursion是一家临床阶段的跨国公司，总部位于犹他州盐湖城，在加拿大多伦多、蒙特利尔和美国旧金山湾区设有办事处，并计划在英国伦敦开设新的办事处，拥有5个临床阶段项目，以及世界上最大的生物和化学数据集之一，并与罗氏/基因泰克和拜耳分别建立了药物发现合作。用Recursion的话来说，公司正领导着生物技术（BioTech）向科技生物（TechBio）的转变，500多名员工（Recursionauts）组成的团队中35%是生命科学背景，40%是计算和技术背景，这也是Recursion将自身定义为TechBio公司的一个重要因素，生命科学、计算和技术的平衡造就了一个能同时将经验数据、统计严谨性和创造性思维应用于决策的环境。2023年，Recursion收购了两家AI药物发现公司Cyclica和Valence Discovery（现为Valence Labs），进一步增强了数字化学、机器学习和生成式AI的能力。Recursion目前的三个关键价值驱动因素● 一个广泛的、内部开发的临床和临床前项目管线，专注于精确肿瘤学和基因驱动的罕见疾病，这些疾病存在未满足需求。在某些情况下，这些项目的年销售额可能超过10亿美元。● 与领先的生物制药和技术公司建立合作伙伴关系，以描绘和处理难以治疗的生物学领域，识别新的靶点，并利用先进的计算和数据资源开发潜在的新药。● 一个行业领先的数据集，旨在充分利用计算工具，并通过公司管线、合作伙伴关系和技术产品来加速价值创造。主要研发管线：罕见病+肿瘤 Recursion的研发项目主要针对病因明确，存在大量未满足的需求，没有批准的疗法，或者现有治疗模式存在重大缺陷的领域。目前Recursion有5个项目正在计划或已启动2期临床研究，并计划在2024年下半年递交第6个项目的IND申请。此外，该公司还在积极开发几十个临床前和药物发现项目。REC-994是一种口服小分子超氧化物清除剂，被开发用于治疗伴有CCM1、CCM2和CCM3突变的散发性和家族性脑海绵状血管畸形（CCM）CCM3突变的散发性和家族性脑海绵状血管畸形（CCM）患者。目前全球约有超过100万CCM患者，尚无药物获批治疗该病，大多数患者无法接受治疗或只能接受对症治疗。Recursion OS系统发现了REC-994在CCM中的治疗潜力，并通过细胞模型中大量超氧化物积累的清除进行了功能验证，长期给药可减少小鼠病变的数量。药融云数据www.pharnexcloud.com显示，REC-994已在美国和欧盟获得孤儿药资格认定。目前该药正在开展一项名为SYCAMORE的随机、双盲、安慰剂对照的2期临床研究，旨在探索REC-994在CCM患者中的安全性、耐受性，以及疗效。该研究于2023年6月完成全部62名受试者的入组，完成12个月治疗的绝大多数受试者继续选择进入长期扩展研究，预计2期研究数据将在2024年Q3公布。REC-2282是一种口服小分子HDAC（组蛋白去乙酰化酶）抑制剂，被开发用于治疗家族性和散发性2型神经纤维瘤病（NF2）脑膜瘤患者。目前市场上尚无药物获批治疗NF2，且手术切除困难，风险高。药融云数据www.pharnexcloud.com显示，REC-2282最早由俄亥俄州立大学研究，1期临床研究显示，REC-2282在接受肿瘤切除术的成年患者前庭神经鞘瘤中抑制了异常的ERK、AKT和S6通路激活。Recursion公司利用Recursion OS系统发现了REC-2282用于NF2的治疗潜力，并借助细胞和动物模型证明了这一发现。目前该药正在进展性NF2突变脑膜瘤患者中开展一项名为POPLAR的2/3期临床试验。该研究分为两个部分，第一部分预计将在23名成人和9名儿童中探索两种剂量REC-2282的效果，计划在2024年上半年完成成人患者入组，并预计在2024年Q4公布2期临床的安全性数据与初步疗效数据。REC-4881是一种口服小分子MEK（丝裂原活化的细胞外信号调节激酶）抑制剂，被开发用于治疗携带APC突变的FAP（家族性腺瘤息肉病）患者。目前尚无药物获批治疗该病，患者整个肠道息肉恶性转化的风险极高，标准治疗方案是结肠切除手术，复发风险高。Recursion OS系统显示，特异性的MEK 1/2抑制剂可在APC功能缺失的情况下产生影响，随后的APC突变多发性肠肿瘤小鼠模型显示息肉和异常增生腺瘤的显著减少。目前该药正在携带APC突变的FAP患者中开展一项名为TUPEOL的1b/2期临床试验，预计将在2025年上半年获得2期初步数据。药融云数据www.pharnexcloud.com显示，REC-4881已获得快速通道资格，以及美国和欧盟的孤儿药认定。该药最早由美国千禧制药（Millennium Pharmaceuticals）研发，该公司在2008年被武田制药收购，2020年Recursion从武田制药获得该药的全球独家许可（当时称TAK-733）。截图自药融云数据库在罕见病之外，针对肿瘤领域，2023年底，Recursion公司启动了一项名为LILAC的多中心开放标签的2期试验，旨在研究REC-4881在不可切除的、局部晚期的携带AXIN1或APC突变的晚期或转移性癌症患者中的应用，预计将在2025年上半年公布2期安全性和初步疗效数据。REC-3964是一种选择性小分子艰难梭菌毒素抑制剂，被开发用于治疗艰难梭菌感染。艰难梭菌感染的标准治疗方案包括抗生素治疗，但会进一步损害肠道菌群，并导致复发。REC-3964是一种非抗生素疗法，具有与标准治疗方案和其他疗法相结合的潜力。在此项目中，Recursion OS系统识别了一种针对复发性艰难梭菌感染的新化学实体，可通过糖基转移酶抑制来潜在地预防感染，并具有潜在的口服活性。据披露，REC-3964是first-in-class的艰难梭菌毒素抑制剂，也是Recursion开发的第一个新化学实体，在相关模型中显示出良好的临床前疗效数据（优于默沙东的贝洛托舒单抗），并在1期研究中表现出良好的安全性和耐受性，公司计划在2024年启动一项2期概念验证研究。临床前项目RBM39基于Recursion OS识别的一种新的CDK12相邻靶点，抑制该靶点可模拟抑制CDK12（细胞周期蛋白依赖性激酶12）的效果，同时减轻与CDK13抑制相关的毒性。公司计划将针对该靶点的主要候选分子开发为一种潜在的治疗同源重组功能正常的（HR-Proficient）卵巢癌和其他同源重组功能正常的实体瘤的单药疗法。RBM39项目由Recursion和精准医疗公司Tempus合作，Recursion正在利用各种肿瘤类型的基因组数据来识别扩展患者人群的临床生物标志物。目前RBM39项目正在开展主要候选分子的IND-enabling研究，计划在2024年下半年递交IND申请。临床前项目Target Epsilon旨在开发一种治疗纤维化疾病的新型疗法。Recursion通过人类PBMC（外周血单核细胞）表型筛选发现了新的、结构多样的小分子，可将疾病状态纤维细胞的表型特征逆转为健康状态细胞的表型特征。最有潜力的化合物分子已被证实为靶向一种纤维化新靶点的有效抑制剂。该项目来源于Recursion与拜耳最初的纤维化疾病合作，后来Recursion从拜耳公司获得了该项目的所有权，目前正在开展IND-enabling研究。新药&技术合作Recursion的对外合作可大致分为新药合作和技术合作。2021年12月5日，Recursion与基因泰克/罗氏签订了合作和许可协议，目标是在胃肠道肿瘤学适应症和神经科学的关键领域合作发现并开发小分子治疗药物。2022年1月，罗氏向Recursion支付了1.5亿美元的预付款。2020年8月28日，Recursion与拜耳签订了一项合作，随后于2021年12月1日扩大合作，用于与纤维化疾病相关项目的研究。2023年11月8日，双方将合作重点重新调整为精准肿瘤学，为无药可及的肿瘤适应症开发新的疗法。2023年7月，Recursion与英伟达达成战略合作，利用Recursion的超级计算机BioHive-1和英伟达DGX™ Cloud的优先访问，加速生物和化学人工智能基础模型的开发。2023年11月，Recursion承诺与英伟达合作，将超级计算机BioHive-1的算力增加4倍以上，届时BioHive-1预计将成为TOP50世界上功能最强大的超级计算机，以及生物制药公司拥有并运营的最强大的超级计算机。2023年11月，Recursion与精准医疗公司Tempus合作，以获得世界上最大的专有、去标签、以患者为中心的肿瘤数据集，包括DNA、RNA、健康记录等，通过训练因果人工智能模型，支持发现潜在的具有丰富生物标志物的疗法。2023年12月，Recursion与乌克兰Enamine公司合作，为全球药物发现行业生成和设计丰富的化合物库。通过利用Recursion的AI模型MatchMaker（收购Cyclica获得）来识别Enamine REAL Space中（约360亿种化合物）预期的与高价值靶点绑定的化合物，从而生成用于药物发现的更加强大的化合物库。Enamine可将生成的化合物库提供给客户进行购买，并使用Enamine和Recursion的商标作为联合品牌。这是一种新的选择数据层驱动价值的形式。财务状况从创立至今，Recursion筹集的资金主要用于平台研究运营、药物发现、临床开发、数字和其他基础设施的运营和投资，以及创建知识产权组合和行政支持。由于尚未有产品获批上市，Recursion尚未产生销售收入。截至2023年底，Recursion拥有3.916亿美元现金和现金等价物，足以为公司未来1年的运营提供资金。2023全年，Recursion公司总收入为4458万美元，同比增长11.9%，主要是由于Recursion与罗氏/基因泰克合作收入的确认。全年研发费用为2.412亿美元，同比增长54.9%，主要是由于Recursion扩大和升级了平台能力，包括化学技术、机器学习和转录组学平台。全年一般及行政开支为1.108亿美元，同比增长35.8%，主要是由于薪酬、法律、软件和折旧费用的增加。2023全年该公司净亏损为3.281亿美元。截至2023年底，该公司累计赤字为9.676亿美元。上图为Recursion的投资方概况（截至2023年1月），更多相关信息可查询药融云数据www.pharnexcloud.com。截止发稿前，公司市值约20.13亿美元，每股8.58美元。此文仅用于向医疗卫生专业人士提供科学信息，不代表平台立场，不作任何用药推荐参考：NMPA/CDE；药融云数据www.pharnexcloud.com；FDA/EMA/PMDA；相关公司公开披露（正文图片均来自企业官方，除非另有说明）；https://www.recursion.com/；https://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_26379183；https://www.cnbc.com/2023/07/12/nvidia-invests-in-biotech-company-recursion-for-ai-drug-discovery-.html；https://siliconcanals.com/zh-CN/news/business-wire/bayer-and-recursion-focus-research-collaboration-on-oncology/；等等活动推荐 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