Cetuximab

往期回顾 科研热点 RNA修饰跃升癌症核心前沿！《Cancer Cell》重磅综述绘制最全功能-机制-治疗图谱 高分连发！非编码RNA+RNA修饰双热点联合，2025高分文章集锦！ 《Nat Rev Drug Discov》| IF=101.8！何川团队爆款综述：RNA修饰系统作为疾病治疗新靶点 重大发现！《Cell》揭示m6A-cenRNA调控癌细胞着丝粒稳态的机制，提出癌症治疗新策略 客户文章 《Nat. Commun》重磅：云序m7G修饰+单细胞测序破译过敏性鼻炎加重新机制！ 《Ann Rheum Dis》IF 27.4丨云序生物acRIP-seq助力解析类风湿性关节炎治疗新靶点——NAT10云序用户 Cell Metabolism（IF 27.7）重磅突破：m6A-去泛素化-组蛋白丙酰化共同调控脂肪肝的分子密码 客户文章Molecular Cancer IF=27.7 | NSUN6调控m5C修饰揭示宫颈癌放疗抗性新机制 引 言 RNA修饰是对RNA分子进行的动态且可逆的化学修饰，广泛存在于多种RNA类型中。作为转录后的关键调控机制，RNA修饰正成为理解肿瘤发生与演进不可或缺的调控维度。2025年，云序客户通过RNA修饰测序技术，揭示了RNA修饰在免疫、肿瘤、代谢等生命过程中的重要作用。一系列重磅研究登上《Nature Immunology》、《Advanced Materials》、《Nature Communications》等核心期刊。 这些研究发现：ac4C修饰是T细胞高效扩增、执行抗病毒防御的“加速器”；m7G修饰既能成为肿瘤化疗耐药的“帮凶”，也能调控过敏性炎症反应；m5C修饰与乳酸化组蛋白协同，驱动脉络膜新生血管形成；m6A修饰通过促进细胞周期转换驱动胶质母细胞瘤生长；而新型O8G氧化修饰则能促进心脏修复。 这些突破性发现的背后，离不开精准、可靠的RNA修饰测序技术的支撑。云序生物依托成熟稳定的检测平台与专业的生信分析体系，提供RNA修饰测序一站式服务，涵盖m6A、m5C、m1A、m7G、m3C、ac4C、NM、O8G和Ψ等多种修饰类型，提供IP富集与单碱基分辨两种主流技术路径。助力研究人员揭示RNA修饰在肿瘤发生、免疫反应及耐药中的关键作用，为生物标志物发现与靶向治疗开发提供坚实的数据支撑。 现在，让我们一同聚焦2025年云序客户发表的12篇RNA修饰高分研究成果，看研究者们如何借助这些技术，深入解析多种实体肿瘤疾病的机制，并指明潜在的治疗新方向。 👇👇👇 ac4C修饰高分文章 01 NAT10介导的mRNA ac4C修饰在T细胞扩增和抗病毒免疫中的关键作用 标题：A critical role of N4-acetylation of cytidine in mRNA by NAT10 in T cell expansion and antiviral immunity 发表期刊：Nature Immunology 影响因子：27.7   发表日期：2025/3/5 发表单位：复旦大学医学院附属中山医院&金山医院 修饰类型：ac4C  修饰分子：mRNA 样本类型：脾脏和肝组织 云序助力：acRIP-Seq、Ribo-Seq、RNA-Seq、RIP-qPCR 初始T细胞激活需脱离静息状态，这一过程依赖全局翻译以实现迅速扩增，但具体机制仍不明确。研究显示，激活过程中T细胞上调N-乙酰转移酶10（NAT10）表达，该酶负责mRNA的ac4C修饰。ac4C修饰的Myc mRNA 翻译效率更高，促进MYC蛋白合成，支持T细胞快速扩增。在小鼠T细胞中条件性敲除Nat10导致细胞周期停滞和因MYC缺乏引起的扩增受限，最终在急性淋巴细胞性脑膜炎病毒模型中加剧感染。此外，年长个体的T细胞中NAT10水平较低，增殖能力受损，这可能是老年人抗病毒反应减弱的部分原因。该研究揭示了调控T细胞扩增的机制以及ac4C修饰在T细胞介导免疫反应中的生物学意义。 云序为该研究提供acRIP-Seq、RNA-Seq、Ribo-Seq等服务，绘制了T细胞中ac4C修饰图谱与翻译效率图谱，通过多组学联合分析鉴定了NAT10调控的靶标MYC，并从修饰、表达、翻译多个层面揭示了ac4C修饰驱动T细胞快速增殖的功能机制，为阐明NAT10调控T细胞功能的直接靶标与相关分子通路提供助力。 图1. NAT10是维持Myc mRNA稳定性及翻译效率必需的蛋白质 02 抑制EGFR可增强NAT10抑制剂Remodelin在结直肠癌中的疗效 标题：EGFR inhibition augments the therapeutic efficacy of the NAT10 inhibitor Remodelin in Colorectal cancer 发表期刊：Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 影响因子：12.8   发表日期：2025/2/4 发表单位：武汉大学人民医院 修饰类型：ac4C  修饰分子：mRNA 样本类型：结直肠癌细胞系 云序助力：acRIP-Seq、RNA-Seq、RIP-Seq 结直肠癌（CRC）是全球癌症相关死亡的第二大原因，晚期CRC的治疗选择有限。NAT10介导的异常ac4C修饰在癌症进展中的调控机制尚不明确。研究者分析了CRC样本中NAT10表达水平，并与对应正常组织比较。利用RNA-Seq、RIP-Seq和acRIP-Seq探讨NAT10在CRC中的潜在机制。研究发现敲低NAT10可使PI3K-AKT通路失活，从而抑制CRC进展。进一步的表观遗传和转录组分析表明，NAT10以ac4C依赖的方式结合ERRFI1 mRNA的编码区，增强其稳定性。敲低NAT10降低ERRFI1表达，激活EGFR通路，抵消对CRC的抑制作用。 基于此，研究显示Remodelin联合特异性靶向EGFR的单克隆抗体Cetuximab单抗，对NAT10和EGFR进行双重抑制，其疗效优于任一药物单用。此外，观察到5-氟尿嘧啶（5-Fu）促进NAT10与UBR5的相互作用，增加NAT10的泛素介导降解，导致ERRFI1下调和EGFR再激活。Remodelin、Cetuximab和5-Fu三联疗法在KRAS、NRAS和BRAF野生型CRC异种移植小鼠模型中增强肿瘤消退,有望成为治疗KRAS、NRAS和BRAF野生型CRC的有效方案。 云序生物为该研究提供acRIP-Seq、RIP-Seq等服务，绘制了结直肠癌细胞中NAT10的RNA结合图谱与ac4C修饰图谱，通过多组学整合分析精准鉴定了其关键下游靶标，为解析NAT10通过ac4C修饰调控EGFR信号通路以影响肿瘤发展的机制提供了核心数据支撑。 图2. NAT10在结直肠癌细胞中下游靶标的鉴定 03 NAT10通过调控NFE2L3的ac4C乙酰化并激活AKT/GSK3β信号通路促进肾透明细胞癌进展 标题：NAT10 promotes the progression of clear cell renal cell carcinoma by regulating ac4C acetylation of NFE2L3 and activating AKT/GSK3β signaling pathway 发表期刊：Cell Death & Disease 影响因子：9.6    发表日期：2025/4/2 发表单位：山东大学 修饰类型：ac4C  修饰分子：mRNA 样本类型：肾透明细胞癌组织 云序助力：acRIP-Seq、acRIP-qPCR 肾透明细胞癌（ccRCC）是肾细胞癌最常见的组织学亚型，其肿瘤生长与转移和预后密切相关。N4-乙酰胞苷（ac4C）是RNA的主要修饰之一，由NAT10催化完成。NAT10在癌症中的作用正逐渐被揭示，但其介导的RNA ac4C修饰在ccRCC中的作用尚不清楚。 该研究发现，NAT10在ccRCC组织中表达上调，且与患者不良预后相关。HIF-1α在转录水平激活了NAT10的表达。功能实验显示，敲低NAT10可抑制细胞增殖、迁移及划痕愈合能力，而过表达则呈现相反效应。皮下移植瘤及尾静脉注射实验结果显示，NAT10在体内促进肿瘤生长与转移，而Remodelin则可抑制肿瘤生长。 通过acRIP-Seq、RIP、RNA稳定性及双荧光素酶报告基因实验，证明NAT10通过催化NFE2L3 mRNA的ac4C修饰，延长其半衰期并提高蛋白表达。ChIP-seq结果表明，NFE2L3调控LASP1的表达，进而激活AKT/GSK3β信号通路。综上所述，该研究结果表明，NAT10通过介导NFE2L3 mRNA的ac4C乙酰化，促进其mRNA稳定性，调控LASP1-AKT/GSK3β/β-catenin通路，从而促进肾透明细胞癌的进展。 云序为该研究提供了acRIP-Seq、acRIP-qPCR服务，绘制了肾透明细胞癌组织的ac4C修饰图谱，为阐明NAT10通过ac4C修饰稳定NFE2L3 mRNA并激活下游信号通路以驱动肿瘤进展的机制提供了数据支持。 图3. NAT10与NFE2L3相互作用并促进其稳定性 04 NAT10通过增强CCL2/CXCL1轴的ac4C修饰加剧急性肾脏炎症 标题：NAT10 exacerbates acute renal inflammation by enhancing N4-acetylcytidine modification of the CCL2/CXCL1 axis 发表期刊：PNAS 影响因子：9.4    发表日期：2025/4/22 发表单位：安徽医科大学 修饰类型：ac4C  修饰分子：mRNA 样本类型：人肾上皮细胞 云序助力：acRIP-Seq、RNA-Seq 炎症在清除病原微生物和组织修复中起着关键作用，但持续的炎症会加速肾脏损伤并推动疾病进展。因此，阐明急性炎症反应机制对开发急性肾损伤（AKI）等炎症性肾脏疾病治疗策略至关重要。该研究发现，NAT10是急性炎症的一个重要调控因子。 NAT10作为目前已知唯一催化ac4C的writer蛋白，在多种AKI模型、人肾活检组织以及肾小管上皮细胞（TECs）中均呈现上调。在小鼠肾脏中敲除NAT10可减轻肾功能障碍、炎症反应以及巨噬细胞和中性粒细胞的浸润；而过表达NAT10则会加剧这些表型。 在机制上，该研究通过acRIP-Seq和RNA-Seq分析发现，NAT10介导的ac4C乙酰化增强了一系列关键趋化因子（CCL2、CXCL1）mRNA的稳定性，增强其表达，从而促进了巨噬细胞和中性粒细胞的募集，加速了肾脏炎症。此外，CCL2和CXCL1的中和抗体或其受体抑制剂，能够消除NAT10过表达的肾小管上皮细胞或小鼠中的肾脏炎症。抑制NAT10能显著减轻肾脏炎症和损伤。因此，靶向NAT10/CCL2/CXCL1信号轴为炎性肾病的治疗提供了新的可行策略。 云序为该研究提供了acRIP-Seq、RNA-Seq服务，绘制了肾脏细胞在炎症刺激下的ac4C修饰与基因表达图谱，通过联合分析鉴定了NAT10缺失导致的修饰与表达共下调的炎症相关靶基因，为阐明NAT10在加剧肾脏炎症的机制提供了数据支撑。 图4. 通过acRIP-seq与RNA-seq分析NAT10敲低前后的ac4C修饰特征及其下游靶标 m7G修饰高分文章 05 无载体纳米表观药物双重靶向m7G tRNA修饰和组蛋白乙酰化以增强骨肉瘤化疗敏感性 标题：Dual Targeting of m7G tRNA Modification and Histone Acetylation using Carrier-Free Nano-Epidrugs to Evoke Osteosarcoma Chemosensitization 发表期刊：Advanced Materials 影响因子：26.8   发表日期：2025/10/10 发表单位：中南大学湘雅第二医院 修饰类型：m7G   修饰分子：tRNA 样本类型：人骨肉瘤细胞143B 云序助力：TRAC-Seq、ribo-Seq、RNA-Seq 骨肉瘤的临床疗效在过去四十年间进展滞缓，主要原因在于治疗过程中不可避免地出现化疗耐药性增加。尽管表观遗传调控为提升化疗敏感性提供了潜在新策略，但其在骨肉瘤中的作用机制尚不明确。该研究通过分析临床数据发现，甲基转移酶1（METTL1，m7G修饰调控因子）与骨肉瘤化疗反应不良相关的组蛋白去乙酰化酶1（HDAC1）异常高表达。为靶向这两个位点，该研究开发了一种创新的无载体纳米表观药物（siMBD-R NPs）。该纳米药物将一线化疗药物阿霉素（DOX）、靶向METTL1的小干扰RNA（siMETTL1）、HDAC抑制剂贝利司他（BEL）以及靶向肽DSPE-PEG2000-cRGD整合为一体，具有超高药物活性成分（API）载药量、肿瘤特异性靶向能力以及独特的pH响应释放特性。与游离的siMETTL1相比，其在肿瘤中的积累显著增强（提高约15.2倍）。 通过双重表观遗传调控，该纳米药物能显著放大DOX引发的DNA损伤。具体而言，siMETTL1选择性破坏了m7G修饰的tRNA所介导的DNA修复蛋白的翻译过程；而BEL抑制HDAC则使染色质重塑为更开放的状态，从而促进DNA损伤的积累。体内实验证明，siMBD-R NPs能显著增强化疗敏感性，使肿瘤抑制率相对提高81.5%，并能激活免疫应答。该研究彰显了利用双靶向表观遗传干预策略来增强骨肉瘤化疗敏感性的潜在价值。 云序为该研究提供TRAC-Seq、ribo-Seq、RNA-Seq等服务，分析了纳米药物siMBD-R NPs敲低METTL1后引起tRNA m7G修饰水平变化并调控mRNA翻译，为阐明该药物的作用机制提供助力。 图5. siMBD-R NPs对组蛋白去乙酰化、tRNA m7G修饰的双重表观遗传调控 06 应激颗粒组装通过损害巨噬细胞胞葬作用加重小鼠过敏性鼻炎 标题：Stress granule assembly impairs macrophage efferocytosis to aggravate allergic rhinitis in mice 发表期刊：Nature Communications 影响因子：15.7    发表日期：2025/7/1 发表单位：中国人民解放军海军军医大学 修饰类型：m7G    修饰分子：mRNA 样本类型：巨噬细胞 云序助力：m7G MeRIP-Seq、RNA-Seq 细胞质应激颗粒（SG）在应激诱导的翻译停滞时组装，是调控细胞命运及多种生理病理过程的关键信号枢纽。然而，SG形成在过敏疾病进展中的作用尚不明确。该研究通过分析过敏性鼻炎（AR）小鼠模型及AR患者的鼻腔组织，发现SG特异性地在鼻黏膜巨噬细胞中组装，并通过抑制巨噬细胞的吞噬作用加重AR病程。机制上，细胞内m7G修饰的Lrp1 mRNA被QKI7运输到应激诱导的SG中，导致其翻译受阻，最终导致巨噬细胞吞噬能力下降。研究揭示了应激颗粒在AR中的关键作用，为AR治疗提供了新靶点。 云序为该研究提供m7G MeRIP-Seq、RNA-Seq服务，鉴定了巨噬细胞中Lrp1 mRNA的m7G修饰，为解析QKI7转运特定mRNA至应激颗粒并抑制翻译的分子机制提供助力。 图6. m7G MeRIP-Seq检测Lrp1 mRNA的m7G修饰 07 METTL1介导的FoxO1 m7G甲基化调控代谢功能障碍相关脂肪肝病中的脂质代谢 标题：METTL1-mediated m7G methylation of FoxO1 regulates lipid metabolism in metabolic dysfunction-associated fatty liver disease 发表期刊：Metabolism-clinical And Experimental 影响因子：11.9   发表日期：2025/10/14 发表单位：河南医药大学 修饰类型：m7G   修饰分子：mRNA 样本类型：HepG2细胞系 云序助力：m7G MeRIP-Seq、RNA-Seq 代谢功能障碍相关脂肪肝病（MASLD）的特征是肝细胞内脂质积累与变性，其发病机制复杂，导致药物研发困难。该研究发现，METTL1在MASLD模型小鼠肝脏及临床样本中均呈现上调。肝细胞特异性敲除METTL1可抑制脂质合成并促进脂质氧化，从而缓解高脂饮食诱导的MASLD小鼠的代谢紊乱。相反，过表达METTL1则会增强脂质合成并抑制脂质氧化。 在机制上，该研究通过m7G测序证实，METTL1通过催化FoxO1第一外显子区域的m7G甲基化，提高FoxO1 mRNA的稳定性及其蛋白表达水平。此外，研究发现过表达FoxO1能够抵消METTL1缺失对MASLD小鼠代谢紊乱的保护作用。该研究还鉴定出一种METTL1的高效小分子抑制剂——甲溴后马托品（HtMBm），该化合物能显著改善高脂饮食诱导的MASLD。综上，METTL1在MASLD进展中发挥关键调控作用，靶向抑制METTL1为干预脂肪酸代谢、治疗MASLD提供了潜在的新策略。 云序为该研究提供了m7G MeRIP-Seq、RNA-Seq服务，绘制了肝细胞在不同代谢压力下的m7G修饰图谱，系统分析了METTL1缺失对修饰分布与丰度的动态影响，为阐明METTL1通过m7G修饰靶向调控脂质代谢关键因子（如FoxO1）的分子机制提供了数据支撑。 图7. METTL1调节FFA诱导肝细胞中内部m7G修饰mRNA的转录组图谱 08 METTL1介导的m7G tRNA修饰通过调控TNF-α的密码子特异性翻译驱动甲状腺乳头状癌进程与转移 标题：METTL1-mediated m7G tRNA modification drives papillary thyroid cancer progression and metastasis by regulating the codon-specific translation of TNF-α 发表期刊：Cell Death & Disease 影响因子：9.6    发表日期：2025/5/14 发表单位：福建医科大学附属第一医院 修饰类型：m7G  修饰分子：tRNA 样本类型：甲状腺乳头状癌细胞系 云序助力：TRAC-Seq tRNA的m7G修饰对于tRNA的生物学功能至关重要，并已被发现在多种人类癌症中发挥调控作用。然而，METTL1介导的m7G tRNA修饰在甲状腺乳头状癌（PTC）中的生物学功能尚不明确。该研究发现，与正常对照组织相比，METTL1在PTC组织中显著上调，且与患者不良预后相关。功能分析证实，METTL1以依赖其tRNA甲基转移酶活性的方式，促进PTC细胞的增殖与转移。 机制层面，敲低METTL1会导致特定m7G修饰tRNA的丰度降低，从而抑制了由m7G tRNA修饰介导的TNF-α的密码子特异性翻译。此外，外源性补充TNF-α可部分逆转由METTL1缺失引起的PTC细胞增殖与转移能力下降。通过对PTC组织芯片分析进一步证实，METTL1、WDR4与TNF-α的表达呈正相关，且三者协同影响PTC的增殖与转移。该研究结果揭示了METTL1介导的m7G tRNA修饰通过调控密码子特异性翻译效率在PTC中发挥促癌作用，并提示靶向METTL1可作为抑制PTC细胞增殖和转移的潜在治疗策略。 云序为该研究提供了TRAC-Seq技术服务，绘制了甲状腺乳头状癌细胞中tRNA m7G修饰的单碱基分辨率图谱，鉴定了METTL1缺失导致修饰下调的关键tRNA，为阐明METTL1通过m7G tRNA修饰驱动密码子特异性翻译以促进肿瘤进展的机制提供了数据支持。 图8. METTL1介导的m7G tRNA修饰调控TNF-α密码子特异性翻译 O8G修饰高分文章 09 MCPPIR通过促进POC1B mRNA的O8G修饰，促进心肌细胞增殖与心脏修复 标题：MCPPIR promotes cardiomyocyte proliferation and cardiac repair via O8G oxidation of POC1B mRNA 发表期刊：Cardiovascular Research 影响因子：13.3    发表日期：2025/12/1 发表单位：青岛大学医学院 修饰类型：O8G    修饰分子：mRNA 样本类型：心脏组织 云序助力：O8G RIP-Seq、RNA-Seq 成年哺乳动物心脏的再生能力极其有限。心脏损伤时的心肌细胞丢失，加上这种受限的再生潜能，是导致心力衰竭及相关死亡的根本原因。尽管piRNA在心脏组织中高度富集，其在心肌细胞增殖及心脏再生中的功能与分子机制仍不清楚。该研究系统解析了piRNA对心肌细胞增殖及心脏修复过程的调控作用。 通过piRNA芯片筛选，发现一条可显著促进心肌细胞增殖的新型piRNA，命名为MCPPIR（myocardial cell proliferation-promoting piRNA）。在新生小鼠心脏再生模型中，MCPPIR的基因敲除减弱了心肌细胞增殖并损害了再生能力；而过表达MCPPIR则能增强增殖、减少纤维化并改善心肌梗死后的心功能。通过质谱分析和RNA Pull-down实验，该研究确定HNRNPH1为其关键结合蛋白。心肌细胞特异性敲除HNRNPH1的小鼠表现出增殖能力增强。O8G RIP-Seq揭示POC1B是其下游靶标，MCPPIR能够阻止HNRNPH1对POC1B mRNA的抑制作用。在机制上，MCPPIR-HNRNPH1-POC1B轴维持着中心体的完整性，从而促进心肌细胞增殖和心脏修复。 该研究首次阐明piRNA在调控心肌细胞增殖中的重要作用，证实MCPPIR通过O8G依赖的POC1B mRNA转录后调控驱动成年心肌细胞增殖并促进心脏修复。MCPPIR/POC1B轴为缺血性心脏病提供了新的治疗靶点，也为心肌损伤后再生疗法的开发奠定了理论基础。 云序为该研究提供了O8G RIP-Seq等服务，绘制了心脏组织转录组的O8G修饰图谱，系统分析了MCPPIR缺失对修饰水平的影响，为鉴定MCPPIR的关键下游靶标POC1B及其调控心肌细胞增殖的机制提供了重要的数据支持。 图9. 通过全转录组O8G修饰分析鉴定MCPPIR的靶标 m5C修饰高分文章 10 乳酸化增强RNA m5C修饰驱动脉络膜新生血管形成 标题：Lactylation-Boosted m5C RNA Modification Drives Choroidal Neovascularization 发表期刊：Research 影响因子：10.9    发表日期：2025/10/2 发表单位：上海交通大学医学院附属第九人民医院 修饰类型：m5C    修饰分子：mRNA 样本类型：内皮细胞 云序助力：m5C MeRIP-Seq、RNA-Seq m5C作为一种普遍存在的转录后RNA修饰，广泛参与RNA代谢并调控多种细胞应答。然而，m5C及其甲基转移酶NSUN2在脉络膜新生血管（CNV）中的作用与机制尚不清楚。该研究发现，组蛋白乳酸化可促进NSUN2介导的m5C修饰，导致m5C水平上调，驱动CNV的病理进展。 该研究发现，在CNV的内皮细胞中，NSUN2的表达与m5C修饰水平均显著高于正常内皮细胞，且该升高由乳酸介导的组蛋白乳酸化所诱导。敲低NSUN2可抑制内皮细胞的增殖、迁移及成管能力。进一步研究发现，内皮细胞特异性敲除Nsun2的小鼠在激光诱导后的视网膜血管渗漏量显著低于对照组。通过多组学分析，该研究鉴定出NSUN2能够增强AKAP2 mRNA的m5C水平，从而激活内皮细胞内的PKA–VEGFR2信号通路，从而促进病理性血管新生。 综上所述，该研究揭示了组蛋白乳酸化与m5C RNA修饰之间的相互作用是CNV的一个重要病理触发因素，为此类疾病的治疗开辟了新途径。 云序为该研究提供m5C MeRIP-Seq、RNA-Seq服务，绘制了内皮细胞中NSUN2依赖的m5C修饰图谱，为阐明NSUN2通过m5C表观转录调控驱动脉络膜新生血管的分子机制提供了数据支持。 图10. AKAP2被鉴定为NSUN2介导的潜在靶标 11 NSUN2-tRNA^Val-CAC轴调控的密码子偏好性翻译驱动三阴性乳腺癌的糖酵解与进展 标题：NSUN2-tRNA^Val-CAC-axis-regulated codon-biased translation drives triple-negative breast cancer glycolysis and progression 发表期刊：Cellular & Molecular Biology Letters 影响因子：10.2   发表日期：2025/8/25 发表单位：中南大学湘雅医院 修饰类型：m5C   修饰分子：tRNA 样本类型：乳腺癌细胞株 云序助力：m5C Bis tRNA-Seq、tRNA-Seq 表观转录组学数据显示，tRNA修饰异常可通过促进癌基因的翻译来驱动肿瘤生长。m5C tRNA甲基转移酶NSUN2在三阴性乳腺癌（TNBC）等多种实体瘤中表达升高，但其如何驱动肿瘤的侵袭性行为及能否成为有效靶点尚不明确。 该研究通过RNA干扰、慢病毒转导及体内异种移植模型等功能性实验，评估了NSUN2在TNBC细胞增殖、转移及化疗耐药中的作用。利用Ribo-Seq、m5C Bis tRNA-Seq及密码子偏好性分析，探索了NSUN2介导的tRNA修饰背后的翻译调控机制；并通过糖酵解功能测定和分子对接，研究了代谢重编程及蛋白质互作。 研究发现，NSUN2在TNBC中显著上调且与患者不良预后相关。机制层面，NSUN2介导了tRNA^Val-CAC的m5C修饰，从而增强了糖酵解关键基因（包括ALDH3A2、ALDH7A1、HK1和PFKM）的翻译效率。敲低NSUN2破坏了tRNA^Val-CAC的m5C修饰，损害了这些代谢酶的翻译并抑制了糖酵解，最终抑制了TNBC细胞的增殖、迁移和侵袭。此外，过表达NSUN2会赋予细胞对多西他赛的耐药性，而抑制NSUN2则恢复TNBC对多西他赛的敏感性。该研究阐明了NSUN2通过tRNA^Val-CAC m5C修饰及对糖酵解相关mRNA的密码子偏好性翻译，驱动TNBC糖酵解重编程与翻译调控，为TNBC提供了新的预后标志物及和治疗靶点。 云序为该研究提供了m5C Bis tRNA-Seq、tRNA-Seq服务，绘制了三阴性乳腺癌细胞中tRNA的m5C修饰与表达图谱，鉴定了NSUN2敲低导致的修饰与表达共变化的tRNA靶点，为阐明NSUN2通过介导tRNA^Val-CAC的m5C修饰驱动肿瘤糖酵解与进展的机制提供了数据支撑。 图11. NSUN2通过调控tRNA^Val−CAC的m5C修饰促进TNBC进程 m6A修饰高分文章 12 TDP-43/ALKBH5介导的CDC25A mRNA m6A修饰通过促进G1/S期细胞周期转换驱动胶质母细胞瘤生长 标题：TDP-43/ALKBH5-mediated m6A modification of CDC25A mRNA promotes glioblastoma growth by facilitating G1/S cell cycle transition 发表期刊：Medcomm 影响因子：10.7    发表日期：2025/2/18 发表单位：南方医科大学南方医院 修饰类型：m6A    修饰分子：mRNA 样本类型：原代神经胶质瘤细胞系 云序助力：m6A MeRIP-Seq 胶质母细胞瘤（GBM）具有显著的肿瘤内异质性，表明其中存在生长速率各异的肿瘤细胞群体。该研究旨在鉴定GBM中的快速增殖细胞并阐明其潜在机制，以期实现精准治疗。 该研究发现，靶向抑制ALKBH5的表达能够损害GBM的增殖能力与肿瘤干细胞特性。在源自同一患者但具有不同增殖速率的单克隆细胞中，ALKBH5的核表达（而非总体表达水平）存在差异。在机制上，ALKBH5在快速增殖细胞中与TAR DNA结合蛋白43（TDP-43）发生相互作用。此外，TDP-43促进了ALKBH5的核定位及其与CDC25A前体mRNA的结合。TDP-43/ALKBH5复合物通过介导m6A去甲基化调控CDC25A mRNA的剪接，以维持其致癌亚型的表达，最终促进GBM细胞的G1/S期转换与生长。 化合物TRAD01能够选择性靶向TDP-43与ALKBH5之间的相互作用，在体外和体内均展现出显著的抗肿瘤效应。该研究揭示了一种新的表观遗传机制，即TDP-43/ALKBH5通过m6A修饰与可变剪接促进GBM生长。因此，靶向TDP-43/ALKBH5互作可能是治疗GBM患者的一种潜在治疗策略。 云序为该研究提供了m6A MeRIP-Seq服务，绘制并比较了不同增殖特性GBM细胞的m6A修饰图谱，鉴定了包括CDC25A在内的关键差异修饰靶基因，为阐明TDP-43/ALKBH5复合物通过m6A去甲基化调控选择性剪接以驱动肿瘤生长的表观遗传新机制提供了数据支撑。 图12. m6A MeRIP-Seq比较不同增殖特性GBM细胞系的m6A修饰图谱 有需要的老师可以扫描下方二维码 如果您对于RNA修饰研究有更多的想法或疑问，或是想要获取以上文献，欢迎您在后台留言，云序生物提供专业的技术支持服务！如果您在研究中遇到任何疑问，可以通过以下方式联系我们： 1.扫码关注【上海云序生物】公众号，获取更多资讯； 2.电话咨询：021-64878766，专业团队实时接听，为您解答疑问； 3.访问官网：https://www.cloud-seq.com.cn/，了解更多高通量组学服务详情。 4.邮箱留言：market@cloud-seq.com.cn 我们期待为您服务！ 云序生物RNA修饰优势 优势一：RNA修饰产品线齐全，热门修饰IP类/单碱基分辨测序 + IP试剂盒 优势二：200+篇SCI论文、数千例测序样本 优势三：MeRIP-seq全面升级，spike in严格质控IP实验 优势四：测序到验证、靶标定位到分子机制，云序提供一站式服务 RNA修饰测序是云序生物转录调控及表观组学旗下的重磅产品。在国内，目前云序生物具有全面的RNA修饰测序平台。云序累计助力客户发表200+篇RNA修饰SCI论文，影响因子1000+，累计完成数千例RNA甲基化测序样本，全面覆盖医口、农口等各类样本。文章涉及多种组学联合方案提供RNA修饰一站式服务，包括上游整体修饰水平的检测、RNA修饰高通量测序、测序后的验证实验，还提供“各类分子互作组研究”服务，助力探究深层分子作用机制！如果您有更多的想法及需求，欢迎与我们联系！ 云序生物介绍 上海云序生物科技有限公司（简称“云序生物”）成立于2015年，坐落于上海漕河泾新兴技术开发区，是国家高新技术企业及ISO9001认证单位。公司以RNA修饰组、表观遗传学与新型时空组学为特色，依托高通量测序、质谱技术、生物信息学等平台，致力于为全球科研与临床用户提供专业、精准、系统性的组学解决方案。云序生物以“技术创新+全链条服务”为核心，通过专利技术应用（如GLORI）、临床微量样本技术优化及单细胞-空间多组学整合能力，持续推动表观遗传与转录组学发展，赋能基础科研与精准医疗。  核心优势与创新技术 一、专利技术与特色平台 1. 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本文来自生命的光谱点击上方蓝字关注我们 📝 核心摘要一项大规模真实世界研究揭示了EGFR基因变异在非小细胞肺癌之外的多种实体瘤中广泛存在，其发生率达6.4%。研究详细分析了EGFR扩增、突变和融合的分子特征，发现与肺癌不同的突变模式，为泛癌种的精准治疗和新药研发提供了宝贵线索，有望拓宽EGFR靶向治疗的受益人群。EGFR：肺癌之外，它在更多癌症中扮演什么角色？ 表皮生长因子受体（EGFR）是细胞信号转导通路中的关键成员，属于受体酪氨酸激酶家族。在正常生理条件下，EGFR与其配体结合后被激活，通过下游的PI3K/AKT/mTOR、RAS/RAF/MEK/ERK以及JAK/STAT等多条信号通路，精确调控细胞的增殖、分化、存活和迁移。然而，当EGFR基因发生异常改变，如突变、扩增或融合时，它会持续性地自我激活，如同一个失控的“引擎”，不断驱动细胞恶性增殖，最终导致肿瘤的发生和发展。因此，EGFR被公认为是最重要的致癌驱动因子之一，也是癌症靶向治疗领域研究最深入、成果最丰硕的靶点之一。 在过去二十年里，针对EGFR靶点的药物研发取得了突破性进展。在非小细胞肺癌（NSCLC）领域，以吉非替尼（Gefitinib）和厄洛替尼（Erlotinib）为代表的第一代EGFR酪氨酸激酶抑制剂（TKIs），以及后续的奥希替尼（Osimertinib）等药物，彻底改变了携带EGFR敏感突变患者的治疗格局，显著延长了患者的生存期。在结直肠癌（CRC）领域，靶向EGFR的单克隆抗体药物，如西妥昔单抗（Cetuximab），也已成为KRAS野生型患者的标准治疗选择。这些成功案例凸显了EGFR作为治疗靶点的巨大价值。 然而，我们对EGFR的认知大多局限于NSCLC和CRC等少数几个癌种。尽管已有研究在多种其他实体瘤中检测到EGFR的基因变异，但这些变异的临床意义、发生频率以及对靶向治疗的响应情况，在很大程度上仍是未解之谜。EGFR TKIs在NSCLC之外的其他癌种中，疗效尚未达到足以改变临床实践的高度，这导致了大量存在EGFR变异的非肺癌患者面临着巨大的未被满足的临床需求。因此，深入探索EGFR在更广泛癌种中的变异特征，对于开发新的治疗策略、扩大靶向治疗的受益人群至关重要。泛癌种“寻宝”：大规模研究揭示EGFR变异新图谱 为了填补这一认知空白，一项大规模的真实世界研究应运而生。该研究利用了下一代测序（NGS）技术，对三星医疗中心收治的3286例转移性实体瘤患者的肿瘤样本进行了全面的基因组分析。值得注意的是，为了聚焦于EGFR在其他癌种中的情况，研究人员特意排除了EGFR研究已非常成熟的肺癌和已有专门分析的胶质瘤患者。这项研究旨在系统性地描绘除NSCLC和胶质瘤以外的泛癌种中，EGFR扩增、突变及融合的发生频率、分布特征，并探索其与其他关键基因变异（如MSI、TMB）的内在关联。研究核心发现概览 研究结果显示，在排除了肺癌和胶质瘤的3286例转移性癌症患者中，总体上有6.4%（209例）的患者被检测出存在EGFR基因变异。这是一个不容忽视的比例，意味着在广泛的癌种中，EGFR仍是一个潜在的重要治疗靶点。这些变异主要分为三类：EGFR扩增：最为常见，占所有患者的5.3%（175例）。EGFR突变：其次，占1.2%（38例）。EGFR融合：较为罕见，占0.2%（8例）。 该研究队列中，最常见的癌症类型是结直肠癌（34%）、胃癌（24.1%）和胆管癌（8.2%）。EGFR变异在这些主要癌种中均有分布，为未来的临床试验和个体化治疗提供了宝贵线索。 深度解读：三类EGFR变异的分子“面孔”1. EGFR扩增：最常见的“隐形驱动”，与免疫治疗有何关联？ EGFR扩增是指肿瘤细胞中EGFR基因的拷贝数异常增加，导致EGFR蛋白过度表达，从而持续激活下游致癌信号通路。在本次研究的175例EGFR扩增患者中，其分布呈现出明显的癌种倾向性，最常见于结直肠癌（83例），其次是胃癌（41例）和胆管癌（11例）。 研究发现，大多数患者的EGFR拷贝数增幅有限（76%的患者拷贝数小于10），但少数患者（如部分胃癌、结直肠癌和胰腺癌患者）的拷贝数可超过100，显示出高度的基因不稳定性。一个极其重要的发现是，所有检测到EGFR扩增的肿瘤均为微卫星稳定（MSS）状态。这与之前的研究发现（如HER2扩增肿瘤也多为MSS）相符，提示基因扩增这一事件可能更倾向于在DNA复制保真度较高的MSS肿瘤中发生。考虑到MSS肿瘤通常对免疫检查点抑制剂响应不佳，寻找像EGFR扩增这样的可靶向驱动基因，对于改善这类患者的预后具有至关重要的临床意义。 此外，EGFR扩增常常不“孤单”。研究发现，许多EGFR扩增的肿瘤还伴随着其他基因的共突变或共扩增，最常见的共突变基因为TP53（75%）和APC（46%），而最常见的共扩增基因为MYC、MET和ERBB2（HER2）。这些“伴随变异”可能共同驱动肿瘤进展，也可能成为EGFR靶向治疗耐药的根源。例如，MET或HER2的共扩增是公认的EGFR抑制剂耐药机制，提示对于这类患者，单一靶向EGFR可能效果不佳，未来或需采用双靶点抑制的联合治疗策略。 2. EGFR突变：警惕！泛癌种突变模式与肺癌大不同 在38例EGFR突变患者中，研究人员发现了一个与NSCLC显著不同的突变模式。在NSCLC中，超过90%的EGFR突变为经典的激酶结构域激活突变（如19号外显子缺失或L858R突变），这些突变位点是EGFR TKIs发挥疗效的关键。然而，在本研究的泛癌种队列中，许多突变位于近膜结构域（near-membrane domain）和C末端尾部，而非经典的激酶区。 近膜结构域在EGFR的自身抑制和激活调控中扮演着复杂角色，该区域的突变对肿瘤发生和药物敏感性的影响尚不完全清楚。这一发现或许可以解释为何EGFR TKIs在非肺癌领域的疗效普遍不佳——因为这些药物主要是针对ATP结合口袋（位于激酶域）设计的。这提示我们，对于不同癌种、不同位点的EGFR突变，可能需要开发全新的、具有不同作用机制的靶向药物。当然，也有例外，例如有证据表明奥希替尼对携带特定EGFR突变的结直肠癌具有一定疗效，这说明突变位点本身可能是预测疗效的关键生物标志物。 对于需要靶向药物治疗的患者和家属，如何获取药物信息和合规渠道是重要关切。《生命的光谱》致力于搭建一个信息共享与援助平台，您可以获取更多关于奥希替尼等靶向药的资讯，助力您对接合适的治疗资源。 3. EGFR融合：罕见基因变异，能否开启新的治疗窗口？ EGFR融合是一种罕见的基因重排事件，它将EGFR基因的一部分与另一个基因的片段“拼接”在一起，可能产生一个具有持续激酶活性的融合蛋白，从而驱动癌症。本研究在8例患者中检测到12个EGFR融合事件，涉及胃癌、结直肠癌、膀胱癌等多个癌种。 通过精细的生物信息学分析，研究人员评估了这些融合事件是否能产生有功能的致癌蛋白。结果发现，在12个融合事件中，仅有3个可能保留了完整的EGFR激酶结构域，从而具有潜在的生物学功能和可靶向性。这再次强调了精准解读NGS报告的重要性——并非所有检测到的基因融合都具有临床意义。对于携带这种功能性EGFR融合的患者，使用EGFR TKIs或其他靶向融合蛋白的药物可能是一种有效的治疗策略。 临床启示与未来展望：为更多患者点亮希望 这项大规模的真实世界研究为我们描绘了一幅全新的泛癌种EGFR变异图谱，其临床启示是多方面的：扩大EGFR靶向治疗的潜在人群：研究证实，在NSCLC和胶质瘤之外，仍有6.4%的转移性实体瘤患者携带EGFR变异。这提示临床医生在面对结直肠癌、胃癌、胆管癌等患者时，进行NGS检测以筛查EGFR变异具有潜在的临床价值。强调全面基因组分析的重要性：研究揭示了EGFR变异常伴随其他关键基因（如KRAS, PIK3CA, MET, HER2）的改变。这凸显了在使用EGFR抑制剂前，进行全面的生物标志物评估的必要性。单一靶向EGFR可能不足以克服由共存变异介导的原发性或继发性耐药。指导未来联合治疗策略的开发：基于共变异图谱，未来的临床研究可以探索更精准的联合治疗方案。例如，对于EGFR和MET共扩增的患者，使用EGFR-MET双特异性抗体（如埃万妥单抗）或EGFR抑制剂联合MET抑制剂可能是更优的选择。事实上，相关临床试验已在胃食管癌等癌种中进行。推动新型EGFR抑制剂的研发：鉴于泛癌种中的EGFR突变模式与NSCLC不同，未来需要开发能有效抑制非经典EGFR突变的新型药物，以满足这部分患者的治疗需求。 总而言之，这项研究是基于NGS真实世界数据的最大规模队列研究之一，它极大地拓展了我们对EGFR变异在肿瘤学中作用的认知。它不仅为当前临床实践中解读EGFR变异提供了重要参考，也为未来针对这些变异的靶向治疗研究奠定了坚实的基础。随着精准医疗的不断深入，我们有理由相信，EGFR靶点将在更多癌种的治疗中焕发新的光彩。 如果您对自己的基因检测报告或EGFR靶向治疗方案有任何疑问，希望获得更深入的解读和个性化建议，欢迎关注《生命的光谱》公众号，获取专业的支持和信息，帮助您做出更明智的治疗决策。 想了解更多关于【EGFR靶向治疗】的详细资料或加入病友群，请关注公众号《生命的光谱》。 - 全文完 -内容仅供参考，不构成医疗建议