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靶向突变
p53蛋白
的抗
肿瘤
药物
2024-02-28
·
药精通Bio
临床1期
IDC2024第六届化学创新药与改良型新药研发论坛报名即将截止!(报名即将截止,扫码报名)摘要
p53蛋白
是人体内十分重要的
肿瘤
抑制因子,通过调节细胞周期阻滞、诱导细胞凋亡等作用发挥
肿瘤
抑制功能。突变后的
p53
蛋白不仅具有显性负性效应(dominant negative effect,DN)抑制野生型
p53
蛋白功能,而且还通过功能获得性效应(gain of function,GOF)调节细胞代谢、侵袭、迁移等方式促进
肿瘤
的发生。
p53蛋白
在超过50%的
肿瘤
组织中发生突变,是
肿瘤
细胞区别于正常细胞的一个特异性药物靶点。因此,针对突变
p53
蛋白开发新型抗癌药物一直是研究的热点。长期以来,由于突变
p53
蛋白表面较为光滑,缺乏药物结合口袋,使其被认为是一个不可成药的靶点。随着高通量筛选技术的发展以及对突变
p53
蛋白结构的深入了解,许多靶向突变
p53
蛋白的小分子化合物被报道并在体外展现出较好的抗
肿瘤
活性,多款基于突变
p53
蛋白研发的化合物已经进入临床试验阶段。本文就靶向
p53
蛋白治疗
肿瘤
的直接和间接策略进行综述,重点针对突变p53蛋白重激活剂与降解突变
p53
蛋白的小分子化合物作用机制进行梳理,以期为后续开发靶向突变
p53
蛋白药物的创新提供帮助。正文
p53
蛋白是由
TP53
基因编码的53 ku蛋白,与p63蛋白和
p73
蛋白同属于
p53
样转录因子家族,其活性对于预防
肿瘤
的发生和发展至关重要。自1979年
p53
蛋白首次以癌蛋白抗原被报道以来,经过40多年的研究,人们不仅重新发现了
p53
蛋白的抑癌功能,而且认识到
TP53
基因是迄今为止发现与人类
肿瘤
相关度最高的基因。
p53
蛋白在生物体内可以暂停细胞周期进程,启动分子应答机制对损伤的DNA进行修复,并参与细胞分化、细胞凋亡等多种途径。同时,野生型
p53
蛋白调控着生物三大物质的代谢,通过限制细胞核酸物质的合成与对葡萄糖的摄取等作用抑制细胞生长。总之,
p53
蛋白可以看作是细胞内一个复杂而庞大的信号转导与调控网络的中心枢纽,在使细胞能够各司其职发挥正常功能方面起着重要的作用。在无应激的哺乳动物细胞中,
p53
蛋白通过不断的泛素化和26S蛋白酶体系的降解维持在较低水平,在应激状态下,
p53
蛋白可经过一系列如磷酸化、乙酰化、甲基化等蛋白质加工过程后被激活。正因为
p53
蛋白有着难以取代的重要作用,因此它一旦发生突变对细胞正常功能的影响是巨大的。突变后的
p53
蛋白不仅会丧失原本抑癌功能,同时还会进一步促进
肿瘤
的发生发展。研究表明,约50%的人类
癌症
中发现了突变
p53
蛋白,其主要突变类型为错义突变。科学家们尝试了多种靶向突变
p53
蛋白治疗
癌症
的策略,目前以恢复突变
p53
蛋白野生型构象及
MDM2
与p53蛋白相互作用抑制剂为代表的药物研究取得了较大突破。01
p53蛋白
的结构与功能1.1
p53蛋白
的结构
p53蛋白
在人体内以四聚体的形式发挥作用,单体间通过反向α螺旋和反向β折叠相互作用形成二聚体,二聚体借助平行的螺旋-螺旋接触面形成四聚体,其结构类似一个十字架。每个单体由393个氨基酸残基组成,从N端到C端依次可分为反式激活结构域(TAD)(1~61)、富脯氨酸结构域(PXXP)(62~94)、DNA结合域(DBD)(95~292)、低聚结构域(OD)(326~356)、羧基端结构域(CRD)(357~393)(图1)。TAD区包含TAD1(1~40)和
TAD2
(41~61),介导
p53
蛋白的转录活性。TAD1和
TAD2
不仅可以共同调节一些常见基因的转录,也可以相互独立介导不同基因的反式激活。此外,
p53
蛋白N端还包含泛素连接酶MDM2的结合位点,
MDM2
可以与
p53
蛋白相结合并对其进行泛素化标记,进而使
p53
蛋白被蛋白酶体降解。富含脯氨酸的结构域(62~94)以PXXP序列重复多次(P,脯氨酸;X可以是任何氨基酸),该区域与
p53
蛋白介导的细胞凋亡和生长抑制有关。DBD可以与DNA进行序列特异性结合(95~292),它包含1个中央样免疫球蛋白β夹层支架、环状片螺旋结构和2个大环状结构,该区域在整个进化过程中高度保守,大约80%的
TP53
基因突变都发生在该区域。DBD后面是连接区域(293~325)以及OD(326~356),其中OD是
p53
蛋白四聚体化从而发挥功能所必需的,此外OD还包含一个核输出信号序列。CRD(357~393)是高度非结构化的,涉及多个不同的作用,如DNA结合、赋予蛋白质稳定性、辅助因子招募等。图1
p53
蛋白结构示意图Fig. 1 Schematic diagram of
p53
protein structure1.2
p53
蛋白的功能
p53
蛋白是人体内十分重要的抑癌转录因子。正常情况下,细胞中的
p53
蛋白维持在一个较低的水平,这主要是由体内E3泛素连接酶MDM2介导完成的。
p53
蛋白与
MDM2
形成的反馈调节通路,导致细胞内
p53
蛋白的半衰期为6~20 min。各种各样的细胞应激如DNA损伤、端粒侵蚀、代谢改变、缺氧、有丝分裂纺锤体功能异常以及几种不同的致癌基因如
Ras
、
Myc
和Ets的突变激活等均可以引起机体针对
MDM2
和
p53
蛋白的修饰,这些修饰抑制了
MDM2
的活性,导致
p53
蛋白水平升高并激活,启动了一系列不同的转录程序。每一种应激压力都由一组不同的蛋白质检测,这些蛋白质向
MDM2
和/或
p53
蛋白发出信号并对其进行修饰。根据修饰(磷酸化、乙酰化、甲基化等)和细胞类型(如分化状态、细胞是否转化或正常、细胞是否正在分裂或休眠),启动一个
p53
蛋白介导的信号通路(图2)。图2
p53
蛋白的功能Fig. 2 Function of
p53
protein
p53蛋白
是细胞中维持稳态的重要
肿瘤
抑制因子。在整个生命周期中,细胞都面临着持续的压力(内源压力、外部压力),每一种压力都由一组不同的蛋白质检测,这些蛋白质向
MDM2
和/或
p53
蛋白发出信号并对其进行修饰。启动一个
p53
蛋白介导的信号通路诱导细胞凋亡、衰老、分化等多种作用。激活状态下的
p53
蛋白通过与DNA序列(称为
p53
反应元件或
p53
结合位点)特异性结合诱导下游靶基因p21、
PUMA
、
NOXA
的表达,促进细胞凋亡、衰老、细胞周期阻滞、代谢改变、血管生成等多种作用,此外
p53
蛋白并非所有功能都是通过充当转录因子来实现的,比如细胞质中(尤其是定位于线粒体)的
p53
蛋白也参与调节糖酵解、氧化磷酸化、活性氧和自噬等。除了直接调节
肿瘤
细胞代谢外,
p53蛋白
还可以通过影响
肿瘤
微环境抑制
肿瘤
的发生,其中很重要的一点是调节微环境中的免疫细胞,目前大量证据表明,
p53
蛋白可以影响免疫系统功能,通过调节
肿瘤
相关免疫细胞的代谢活动进而影响
肿瘤
发展。02
p53
蛋白主要突变类型与特征自从在人类
结肠癌
中首次发现
TP53
突变基因以来,大量DNA测序项目已经检测了所有人类
癌症
中
TP53
基因的突变频率。总的来说,
TP53
基因突变的频率通常取决于
癌症
的类型,
睾丸畸形癌
中突变最少(1%~3%),
浆液性卵巢癌
中突变最多(100%)。组织和细胞类型都影响
TP53
基因突变的频率,多种突变类型导致
p53
蛋白原本功能的丧失。在整个
TP53
基因突变类型中,缺失、插入、移码和无义突变的发生率为10%,大多数情况下导致蛋白质不能产生或迅速被降解。其余90%的突变类型为错义突变,在这些突变中,90%定位于DBD,其中175、245、248、249、273和282氨基酸位点是其热点突变,p53R175H与p53R273H分别为
p53
蛋白错义突变的第一和第三大类型,其β片层结构都被很好地保存了下来,疏水表面变大,环的灵活性变高,从而易于在细胞内积聚。其次作为
p53
蛋白第二大错义突变类型的p53R248Q,热稳定性较低,可通过与
STAT3
结合并使其磷酸化,从而持续激活
STAT3
信号通路促进癌细胞的迁移。事实上与野生型
p53
蛋白相比,大多数突变
p53
蛋白除丧失与DNA结合及调控转录的能力最终导致抑癌功能丧失外,还会获得新的致癌活性以促进
癌症
的进展,称为功能获得性效应(gain of function,GOF),突变
p53
蛋白的GOF活性在1993年首次得到证实,当时Dittmer等报道了p53R175H和p53R273H的异位表达赋予了
p53
蛋白缺失细胞在软琼脂中形成集落和在裸鼠中形成异种移植瘤的能力,此后,包括使用细胞培养系统和小鼠模型以及临床研究在内的大量证据表明,许多
p53
蛋白错义突变均具有GOF活性以促进
癌症
的发生。到目前为止,已经报道了多种突变
p53
蛋白GOF活性,包括促进细胞增殖、转移、基因组不稳定性、代谢重编程、
肿瘤
微环境重塑、免疫抑制和
癌症
治疗抵抗。03靶向突变
p53
蛋白治疗
肿瘤
的策略寻找靶向突变
p53
蛋白的药物一直是治疗
癌症
的研究热点。然而,野生型
p53
蛋白和大多数突变
p53
蛋白缺乏结合口袋或变构位点,阻碍了常规的药物设计,因此经常被认为是“不可成药的”靶点。更重要的是,在人类
肿瘤
中已经发现2 000多种
p53
蛋白的突变形式,它们的结构、稳定性和生物学功能各不相同,几乎不可能用单一药物靶向所有
p53
蛋白的突变形式,对于每一种
p53
蛋白突变体,可能需要专门的药物治疗。本文主要梳理了两种靶向突变
p53
蛋白以治疗
癌症
的策略:a. 恢复突变
p53
蛋白野生型构象;b. 降解突变
p53
蛋白(图3)。并简要介绍了3种间接靶向突变
p53
蛋白治疗
癌症
的策略。尽管几十年来科学家们提出了各种各样针对突变
p53
蛋白治疗
癌症
的方式,但截至目前仍没有开发出一款疗效较为理想的药物,也正因如此,科学家们对
p53
蛋白的研究热情持续未减,未来无论哪种治疗策略及药物,若可以有效靶向突变
p53
蛋白治疗
癌症
,都将对人类医学产生划时代意义。图3 恢复或降解突变
p53
蛋白治疗
癌症
的策略Fig. 3 Strategies for cancer therapy targeting degradation or restoration of wild-type conformation of mutated
p53
protein(a)突变
p53
蛋白被
p53
蛋白激活剂恢复为野生型构象后被导入细胞核并四聚化,获得与其靶基因(如p21、
Bax
、
PIGs
、PAI)结合的能力,诱导
肿瘤
抑制反应(细胞周期阻滞、凋亡和衰老),抑制
肿瘤
发生。(b)突变
p53
蛋白不仅失去了与
肿瘤
抑制基因结合的能力,而且还获得了转录激活致癌基因(如
NF-κB2
、
BRCA1
)的功能,以诱导
肿瘤
的发生。突变
p53
蛋白降解剂可直接与突变
p53
蛋白结合,诱导其降解并抑制
肿瘤
的发生。3.1 恢复突变
p53
蛋白野生型构象
p53
蛋白属于热敏蛋白,突变后具有折叠与去折叠两种状态转换的能力,因此是否可以利用一些小分子化合物逆转突变构象,使突变
p53
蛋白重新恢复其野生型构象或功能呢?通过计算机对数千种化合物进行高通量筛选,发现极少数化合物似乎有这一能力,通过恢复突变
p53
蛋白的特定野生型功能,如诱导凋亡、促进细胞周期阻滞和抑制癌细胞增殖,证实了这种“突变体再激活”。3.1.1 COTI-2COTI-2是通过计算机高通量筛选发现的一种具有口服活性的第三代胺苯硫脲化合物(图4)。已被证明能与突变
p53
蛋白结合,恢复突变
p53
蛋白野生型活性,并使野生型
p53
蛋白靶基因表达正常化。除此之外,COTI-2似乎也能独立于
p53
蛋白发挥作用,该化合物可激活
AMPK
、抑制
mTOR
通路、诱导
肿瘤
细胞DNA损伤引起复制应激。COTI-2的这些不依赖
p53
蛋白发挥的效应可能进一步促进其抗癌作用,因为研究发现,诱导DNA损伤和复制应激会引起细胞凋亡,而抑制mTOR信号传导是一种成熟的治疗
癌症
的策略。图4 突变
p53
蛋白重激活剂结构示意图Fig. 4 Schematic diagram of reactivator structure of mutated
p53
protein与上述活性一致,Synnott等发现COTI-2可抑制多种
恶性肿瘤
细胞系和动物模型中
肿瘤
的生长,并且在研究的动物模型中具有良好的耐受性,没有发病或体重减轻的不良现象出现。Salim等发现,COTI-2可作为单一药物通过两种途径对多种
头颈部癌
细胞发挥明显的抗
肿瘤
作用,一方面COTI-2显著增强了对顺铂和/或辐射出现耐药性的
头颈部癌
肿瘤细胞对这些治疗的敏感性,另一方面COTI-2可在
TP53基因缺失或突变的头颈部癌
TP53
基因缺失或突变的头颈部癌细胞中诱导凋亡,而在含野生型p53蛋白的
头颈部癌
细胞中,COTI-2诱导衰老而非凋亡,这可能是由于COTI-2可增强含野生型
p53
蛋白的细胞中p21表达,而p21是这些细胞中已知的衰老诱导物。除此之外,Maleki等还发现,在
乳腺癌
细胞系中表达突变p53蛋白的细胞系比含有野生型
p53
蛋白的细胞对COTI-2更敏感。目前,
COTI-2
正在进行一项针对
复发性妇科癌症
治疗的临床I期试验,初步药代动力学评价显示,口服该化合物的药峰时间(Tmax)在15~90 min之间,半衰期为8~10 h,并且其耐受性良好,最常见的不良反应为
恶心
、
呕吐
、
疲劳
和
腹痛
。在接受治疗的24名患者中,只有2名(8%)需要减少剂量。然而,到目前为止在参与试验的妇科
癌症
患者中,还没有
肿瘤
消退的证据。总之,COTI-2在多种含突变
p53
蛋白的
肿瘤
细胞中具有非常有效的治疗效果,即使这些
肿瘤
细胞对
顺铂
和辐射具有固有的耐药性,此外,该药物似乎以一种新颖的方式发挥其作用,包括重新激活野生型
p53
蛋白靶基因,诱导
肿瘤
细胞凋亡等。事实上,COTI-2在含野生型
TP53
基因的
肿瘤
细胞中同样诱导许多凋亡基因上调,但细胞凋亡并不明显,很可能是因为这些促凋亡基因并没有在蛋白质水平上被COTI-2诱导。3.1.2 2-磺酰嘧啶p53Y220C突变是
p53蛋白
第9大突变类型,位于
p53
蛋白S3/S4环和S7/S8 环之间的220位酪氨酸突变成为半胱氨酸。p53Y220C突变不仅直接破坏突变氨基酸与周围氨基酸Leu145和Thr155之间的氢键,而且降低了
p53
Y220C cluster区域的折叠片S3和S8之间的氢键数量,使p53Y220C突变所形成的亲水性空腔变大,加速了水分子进入该蛋白质内部,大大降低
p53
蛋白的热稳定性。为了能够找到具有较好靶向这种特殊突变活性的小分子化合物,Bauer等通过差示扫描荧光法(DSF)筛选了一个旨在结合p53Y220C突变诱导产生的空腔配体文库,发现了一个2-磺酰嘧啶小分子PK11000(5-氯-2-甲磺酰吡啶-4-羧酸)(图4),它可将突变p53Y220C蛋白融化温度明显提高(ΔTm>1.2K),并且根据光散射法测定蛋白质聚合动力学怀疑PK11000与突变
p53
蛋白属于共价结合。然而后期发现PK11000还可以使细胞内其他突变类型的
p53
蛋白融化温度升高,证实其稳定突变
p53
蛋白活性不是通过与p53Y220C突变腔结合而实现的。Synnott等发现,2-磺酰嘧啶在生物环境条件下仅与高度亲核的半胱氨酸发生SNAr反应,因此是选择性化学修饰蛋白质的有用工具。通过HSQC NMR数据及ESI质谱,证实了PK11000对p53Cys182和p53Cys277的特异性烷基化作用,PK11000对Cys182和Cys277的特异性修饰可在不损害
p53
蛋白与DNA亲和力的情况下提高蛋白质稳定性。
PK11007
为PK11000的类似物,是温和的硫醇烷基化剂(图4),相对于PK11000具有更好的抗癌活性,这可能与其膜透性改善(疏水性更强)、巯基反应活性提高(吸电子取代基更强)和烷基化选择性增加(4-氟苯取代导致亲核芳香族取代的空间位阻)等有关,此外
PK11007
还可通过两条途径发挥抗癌作用,即
p53
蛋白依赖和
p53
蛋白非依赖途径。
PK11007
可选择性结合暴露于突变
p53
蛋白表面的两个半胱氨酸即Cys182和Cys277从而稳定突变
p53
蛋白,并不损害其DNA结合活性。在一些癌细胞系中,不稳定的突变
p53
蛋白被PK11007重新激活,导致
p53
蛋白靶基因如p21和PUMA的上调从而引起细胞凋亡。然而更普遍的是,
PK11007
可独立于
p53
蛋白通过消耗细胞内的谷胱甘肽,诱导细胞内活性氧水平的高度升高及内质网(ER)应激造成细胞凋亡,
PK11007
和其他2-磺基嘧啶化合物作为抗癌药物的先导具有很大的潜力。3.1.3 异硫氰酸苯乙酯(PEITC)PEITC大量存在于豆瓣菜和十字花科蔬菜中(图4),对多种
肿瘤
细胞表现出生长抑制活性,尤其对表达突变p53R175蛋白的
肿瘤
细胞具有优先抑制活性。p53R175H突变是人类
癌症
中最常见的
p53
蛋白错义突变,估计为5.6%的发生率。事实上,PEITC已经在临床I期和II期试验中进行了研究,作用机制包括恢复突变
p53
蛋白野生型构象、抑制
肿瘤
细胞迁移、诱导II期解毒酶、细胞周期阻滞和诱导氧化应激促进凋亡等。此外,PEITC处理还会使突变p53R175蛋白对
MDM2
依赖的蛋白酶体降解敏感。Lam-Ubol等将蛋白酶体抑制剂MG132或特异性MDM2抑制剂Nutlin-3与PEITC分别或共同处理SK-BR-3细胞。发现与单独PEITC处理相比,MG132或Nutlin-3均可以使SK-BR-3细胞全裂解液(WCL)中突变
p53
蛋白显著积累。这一结果表明,突变p53R175蛋白稳定性降低是由于
MDM2
依赖的蛋白酶体的降解。这可能是由于PEITC将突变p53R175蛋白恢复为野生型构象,而野生型
p53
蛋白在细胞内受
MDM2
的调控。Choudhury等用PEITC处理SK-BR-3细胞时,发现高浓度(≥8 μmol/L)的PEITC会引起突变p53R175蛋白发生聚集。由于蛋白质聚集物会引发自噬清除,Bommareddy等便研究了突变p53R175蛋白的降解是否经历自噬。他们将8 μmol/L PEITC和氯喹(CHQ)共同处理SK-BR-3细胞,在细胞裂解液中发现突变p53R175蛋白水平较单独PEITC处理时明显升高,而用4 μmol/L PEITC做相同处理时突变p53R175蛋白水平并无明显差异,这表明了高浓度PEITC可能诱导突变p53R175蛋白发生聚集并自噬。PEITC诱导的自噬,突变p53R175蛋白的再活化及其随后对降解途径的敏感性均有助于其依赖突变
p53
蛋白发挥抗癌活性。近年来科学家们的研究方向主要集中于从化学文库中寻找能重新激活突变
p53
蛋白的小分子化合物。然而,以膳食为基础预防或治疗突变
p53
蛋白的研究仍然很少。PEITC的发现提供了第一个突变
p53
蛋白被饮食中化合物激活的例子,对
癌症
预防和治疗具有重要意义。3.1.4 三氧化二砷(ATO)p53蛋白突变类型高达数千种,多为错义突变,由于在其DBD缺乏广泛适用的变构调控位点,这就使得针对突变
p53
蛋白的治疗显得尤为棘手。尽管Zinc(NSC319726)靶向锌配合位点已经显示了具有拯救突变
p53
蛋白的活性,但其对突变p53R175蛋白具有高度特异性并影响
p53
蛋白DNA结合活性。还有一个值得注意的结合位点,涉及到一个远离DNA结合表面的裂缝,目前已经开发出多种可插入这个缝隙的小分子如PK083、PK15796等,从而稳定突变
p53
蛋白。然而遗憾的是,这种结合裂隙是p53Y220C突变所特有的,并不适用于其他
p53
蛋白突变体。因此还需不断寻找靶向突变
p53
蛋白新的变构位点化合物。
ATO
是一种治疗
急性早幼粒细胞白血病
的药物,可通过与半胱氨酸反应拯救结构突变型
p53
蛋白。砷结合突变
p53
蛋白的晶体结构揭示了一个隐藏的变构位点,该位点位于远离突变
p53
蛋白DBD区的ABP口袋,涉及三个砷配位半胱氨酸。砷结合并稳定了突变
p53
蛋白DBD区的环-片-螺旋基序和整个β夹层结构,赋予结构突变型
p53
蛋白热稳定性和转录活性,值得注意的是,砷与ABP口袋中的半胱氨酸三联体的特异性结合不同于其他作用于突变
p53
蛋白半胱氨酸的小分子化合物,如APR-246,后者杂乱地结合暴露于蛋白质表面的半胱氨酸。但砷结合的半胱氨酸三联体同样可能存在于其他蛋白质中,从而使ATO产生独立于突变
p53
蛋白的抗癌活性或细胞毒性。在细胞和小鼠异种移植模型中,ATO重新激活了突变
p53
蛋白野生型活性并抑制
肿瘤
的发生。在对ATO介导拯救的25个人类
癌症
中最常见突变
p53
蛋白实验中发现,所有的结构突变型
p53
蛋白都可以被拯救,尽管程度不同。有趣的是,接触突变型
p53
蛋白p53S241F、p53R248W也显示出被拯救的迹象,这说明某些接触突变型
p53
蛋白活性丧失也是由于构象改变引起的。尽管ATO对结构突变型
p53
蛋白具有普遍的拯救作用,但它们的野生型活性并不总是被有效地恢复,因为除了整体折叠外,局部
p53
蛋白DNA结合表面的完整性也决定了ATO拯救转录活性的效率。ATO联合
维甲酸
治疗APL为
癌症
治疗提供了新思路。令人鼓舞的是,
ATO
的治疗潜力在血液和一些
实体肿瘤
的临床实验中已有报道。目前一项针对含有突变
p53
蛋白的血液系统恶性肿瘤的I期临床试验正在进行。3.2 降解突变
p53
蛋白
TP53
基因的错义突变产生异常蛋白质,其抑癌功能被取消的同时也可获得促进
肿瘤
细胞侵袭、转移和化疗耐药的能力(GOF),最近的研究结果表明,突变
p53
蛋白的敲除降低了携带突变
p53
蛋白的
肿瘤
细胞的致癌特性。因此,确定突变
p53
蛋白稳定/降解的特异机制以及识别不改变野生型
p53
蛋白水平而使突变
p53
蛋白降解的化合物是至关重要的。靶向降解突变
p53蛋白
可能是开发新型抗癌药物的一种有前景的方法。3.2.1 藤黄酸(GA)GA是从甘草干乳胶中分离出来的一种黄酮(图5),在体内外均表现出强大的生物活性,如激活凋亡途径、诱导细胞周期阻滞、抑制端粒酶和
拓扑异构酶II
活性以及抑制血管生成等。迄今为止的所有研究都表明,GA是一种有效的抗癌剂,通过不同的机制具有不同的分子靶点。作为抗
肿瘤
候选药物,GA目前正在进行中国食品和药物管理局批准的II期临床试验。GA可以抑制含有野生型
p53
蛋白的
肿瘤
细胞生长,这是由于其可以抑制
MDM2
表达,增加
肿瘤
细胞内野生型
p53
蛋白水平,从而发挥抑癌作用。然而,半数以上的人类
癌症
中发现了突变型
p53
蛋白,有趣的是,
GA
对
MDM2
的影响在含有突变型
p53
蛋白的细胞中是不同的,Qin等发现在
GA
处理后的MDA-MB-435细胞中,
MDM2
蛋白水平和
p53
-
MDM2
相互作用均未受到显著影响,尽管已有报道
MDM2
可促进突变型和野生型
p53
蛋白的降解,但越来越多的研究表明,作为
E3泛素连接酶
的
MDM2
在突变型
p53
蛋白的降解中并不那么重要。而另一种突变
p53
蛋白降解途径,涉及分子伴侣
Hsc70
和
Hsp90
以及泛素/蛋白酶体系统的密切合作,这种降解途径的重要点在于伴侣相关泛素连接酶
CHIP
,
CHIP
通过与
Hsc70
和
Hsp90
的羧基端结合,与E2酶一起介导分子伴侣结合目标蛋白的泛素化,并诱导蛋白酶体降解目标蛋白。
Hsc70
和
Hsp90
在内的多种分子伴侣可特异性识别突变型
p53
蛋白,并在增强突变
p53
蛋白的稳定性中发挥重要作用。Liu等发现,
GA
可以通过调节这些分子伴侣进而达到降解突变
p53
蛋白的目的,
GA
可以上调
Hsc70
,下调
Hsp90
的表达,而对
CHIP
的蛋白质水平没有显著影响,进一步的免疫沉淀表明,
GA
改变了突变
p53
蛋白和分子伴侣之间的相互作用,呈浓度依赖性地破坏
Hsp90
与突变
p53
蛋白相互作用,并促进
Hsc70
/突变
p53
蛋白和
CHIP
/
Hsc70
/突变
p53
蛋白复合物的形成。随后Wang等在MDA-MB-435细胞中转染
CHIP
siRNA后,用
GA
处理相关细胞时发现伴侣相关泛素连接酶的消失导致突变
p53
蛋白水平的增加,这一发现强调了
GA
降解突变
p53
蛋白的机制,即
GA
通过上调与突变
p53
蛋白特异性结合的分子伴侣,并与
CHIP
、E2酶、26S蛋白酶体一起介导突变
p53
蛋白的泛素化降解。除此之外
GA
还可以增加携带突变
p53
蛋白的癌细胞对化疗药物的敏感性。这可能是由于突变
p53
蛋白本身就是克服
肿瘤
耐药性的药物开发潜在靶点,GA显著降低了
肿瘤
细胞中突变
p53
蛋白水平,从而使其对化疗药物的敏感性增加。3.2.2 YK-3-273YK-3-237为
combretastatin
a4(
CA-4
)的硼酸查尔酮类似物(图5),是
SIRT1
酶激活剂并对广泛含突变
p53
蛋白的
肿瘤
细胞表现出抗增殖活性。SIRT1酶是针对p53K382残基上的一个众所周知的去乙酰化酶。无论是野生型还是突变
p53
蛋白的去乙酰化都明显依赖于SIRT1酶的催化。野生型p53K382残基的乙酰化被认为是其保持稳定的重要决定因素,突变
p53
蛋白高度稳定的机制目前尚不清楚,但Alves-Fernandes等发现,在TNBC细胞中,小分子化合物YK-3-237激活了SIRT1酶活性降低了突变
p53
蛋白的乙酰化,使突变
p53
蛋白水平明显下降。Rozenberg等通过real-timePCR定量分析发现,YK-3-273在
肝癌
细胞系HUH-7中可诱导
GADD45
、
PTEN
和
PERP
mRNA的表达,在
乳腺癌
细胞系T47D中,可诱导
GADD45
和p21 mRNA的表达,在
鼻咽癌
细胞系CNE-2中,诱导p21 mRNA的表达,在3种不同的TNBC细胞株HS578T、MDA-MB-468和SUM149PT中诱导野生型
p53
靶基因PUMA和NOXA的表达,这些结果提示,YK-3-237介导的去乙酰化可抑制突变
p53
蛋白在多种
肿瘤
细胞中的功能,并特异性释放突变
p53
蛋白对野生型
p53
靶基因的转录抑制。然而,YK-3-237激活SIRT1酶的分子机制需要进一步阐明。最近报道称,YK-3-237只有在蛋白质被7-氨基-4-甲基香豆素(AMC)标记的情况下才能激活其SIRT1酶活性,不能针对新生
p53
蛋白发挥作用。此外,YK-3-237还能激活人SIRT2酶活性,降低了细胞中α微管蛋白水平。通过SIRT2酶脱乙酰作用减少α微管蛋白可能与降解突变
p53
蛋白,上调野生型
p53
蛋白靶基因的表达共同发挥抗
肿瘤
作用。但是目前SIRT1酶在人类
癌症
中的作用还存在争议,已有报道称SIRT1酶抑制剂和激活剂(如
白藜芦醇
)都能抑制人类
肿瘤
细胞株的生长。虽然最近已经开发了几种SIRT1酶激活剂,但这些化合物的抗癌作用尚未见报道。鉴于SIRT1酶在
癌症
、衰老、
糖尿病
和神经元疾病等许多生物过程中的作用日益增加,YK-3-237可能会是一个很有研究和开发价值的小分子化合物。3.2.3 他汀类(Stains)突变
p53蛋白
在
肿瘤
细胞中的稳定存在对其GOF活性至关重要,然而目前对突变
p53
蛋白稳定/降解的特异机制还知之甚少。通过高通量筛选,发现了Stains降胆固醇药物可作为结构突变型
p53
蛋白的降解诱导物,并且对野生型
p53
蛋白和接触突变型
p53
蛋白的影响很小。突变
p53
蛋白本质上是不稳定的,因为细胞中E3泛素连接酶MDM2及
CHIP
均可以诱导其降解,但是在
肿瘤
细胞中,突变
p53
蛋白却可以与多种分子伴侣如
Hsp90
、
Hsc70
、
DNAJA1
等相互作用从而保持稳定的状态。甲羟戊酸途径在结构突变型
p53
蛋白的稳定以及GOF活性中发挥重要的作用。结构突变型
p53
蛋白可以结合并激活SREPB转录因子,从而上调参与甲羟戊酸途径的多种酶合成大量的5-磷酸甲羟戊酸(MVP),而 5-磷酸甲羟戊酸的上调又可以反过来促进结构突变型
p53
蛋白与
DNAJA1
等多种分子伴侣的相互作用,从而使结构突变型
p53
蛋白在
肿瘤
细胞中保持稳定的状态,就这样形成了一个正反馈循环。并且5-磷酸甲羟戊酸还可以通过调节蛋白质的异戊二烯化,促进
肿瘤
细胞黏附、迁移和增殖过程中靶蛋白的膜附着。HMG-CoA还原酶是催化甲戊酸途径的第一步限速酶,Stains药物通过抑制HMG-CoA还原酶活性,特异性减少细胞内5-磷酸甲羟戊酸的生成,抑制结构突变型
p53
蛋白与分子伴侣DNAJA1相互作用,从而使结构突变型
p53
蛋白被细胞内E3泛素连接酶MDM2及
CHIP
介导的泛素化标记并降解。Stains药物可以抑制对
癌症
进展至关重要的两种细胞活动——蛋白质异戊二烯化和突变
p53
蛋白的稳定化,它是一款较为理想的靶向结构突变型
p53蛋白
的小分子抑制剂。此外,Stains药物还可使含突变p53R172H蛋白的
肿瘤
细胞对阿霉素敏感,这表明了Stains药物可作为独立或与其他化疗药物联合治疗
肿瘤
的潜在作用。然而,Moon等发现在小鼠模型中只有
阿托伐他汀
和
瑞舒伐他汀
的日剂量分别达到30 mg/kg和10 mg/kg时才会有较好的抗
肿瘤
效果,这相当于约140 mg和约50 mg的人体剂量,高于成人规定的临床剂量,这也是为什么Stains药物治疗
癌症
的临床试验结果存在争议。因此目前最重要的是发现降低Stains药物剂量的同时仍保留其诱导突变
p53
蛋白降解能力的方法。通过Stains药物抑制甲羟戊酸途径-DNAJA1轴诱导结构突变型
p53
蛋白降解可能代表了一种有希望的治疗
癌症
的策略。3.3 间接靶向
p53
蛋白治疗
肿瘤
的策略3.3.1 重新激活被抑制的野生型
p53
蛋白功能在保持野生型
TP53
基因表达的
肿瘤
细胞中,最广泛采用的治疗方法是抑制野生型
p53
蛋白的降解。野生型
p53
蛋白降解的机制涉及E3泛素连接酶MDM2对其泛素化标记,最终导致野生型
p53
蛋白被细胞自身蛋白酶体所降解。
MDM2
介导的泛素化依赖其与野生型
p53
蛋白的直接结合,促使人们寻找抑制
MDM2
-
p53
结合的小分子作为稳定野生型
p53
蛋白并使其恢复效力的工具。于是大量靶向
MDM2
蛋白以重新激活野生型
p53
蛋白功能的小分子应运而生(表1)。表1
MDM2
/
MDMX
-
p53
抑制剂及其作用机制Table 1
MDM2
/MDMX-
p53
inhibitors and their mechanisms of action3.3.2 利用miRNA抑制含突变
p53
蛋白的肿瘤发生miRNA是一类由内源基因编码的长度约为22个核苷酸的单链RNA分子,主要功能为抑制其靶mRNA的转译或促进其降解,因此,miRNA水平的改变可以通过转录后机制进一步影响蛋白质水平。野生型
p53
蛋白可通过直接激活转录或促进成熟来调节miRNA水平,而突变
p53
蛋白会导致
p53
/miRNA轴的失调和其他miRNA的上调,从而赋予额外的致癌能力,如体细胞重编程等(表2)。此外,最近一些研究聚焦于循环miRNAs,探索其诊断和预后潜力,表明miRNAs的潜在临床应用价值。miRNAs可能是一种有效的
癌症
治疗工具。3.3.3 利用合成致死抑制含突变
p53
蛋白的肿瘤发生与直接靶向突变
p53
蛋白药物相比,合成致死方法对
p53
蛋白结构的依赖较小,这表明它可以广泛作用于多种
p53
蛋白突变类型。根据
肿瘤
细胞中所含突变
p53
蛋白功能丧失(loss of function,LOF)和GOF的不同,可使用不同的策略(表3)。04总结与展望
p53蛋白
是人体内天然免疫和抗
肿瘤
反应的重要组成部分。其突变不仅会造成原本抑癌功能的丧失,甚至还会出现一些促进
癌症
发生的新功能。几十年来,科学家们为了战胜突变
p53
蛋白提出了各种各样的观点,除上文提到的几种策略外,还提出从水解的突变
p53
蛋白中提取特异性肽作为新抗原由抗原提呈细胞(antigen presenting cell,APC)提供给B细胞和T细胞以激活免疫反应,利用靶向突变
p53
蛋白的小分子设计蛋白质水解靶向嵌合体(proteolysis-targeting chimeras,PROTAC)化合物以降解突变
p53
蛋白等多种方式,达到治疗
癌症
的目的。然而目前绝大多数针对突变
p53
蛋白的药物仍处于初级阶段,没有一款上市,因此现在就断定针对突变
p53
蛋白的治疗会对
癌症
有效还为时过早,但是一旦有针对突变
p53
蛋白疗效较好的化合物出现,就有可能开创
癌症
治疗新时代,特别是在
p53蛋白功能障碍
p53
蛋白功能障碍在人类
癌症
中如此普遍存在的情况下。总的来说,突变
p53
蛋白是一个有吸引力的
癌症
治疗靶点,随着针对突变
p53
蛋白的治疗策略及药物不断开发,根据患者的
TP53
基因突变情况设计个性化的治疗方案将成为可能。来源:生物化学与生物物理学进展作者:王若亚 张鸳 张继虹 俞飞文章内容由药精通Bio小编查阅文献选取,排版与编辑为原创。如需转载必须经过同意并按要求在转载文章最前方添加“药精通Bio”公众号,谢谢!ENDIDC2024第六届化学创新药与改良型新药研发论坛报名即将截止!(扫码立即领取限量免费参会名额)
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机构
-
适应症
肿瘤
结肠癌
卵巢癌
[+13]
靶点
p53
TP73
MDM2
[+23]
药物
COTI-2
顺铂
PK11007
[+8]
标准版
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