3篇子刊重磅文章，解析微生物组治疗的现状与未来

2024-04-13

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微生物疗法临床2期

本期话题：微生物组疗法，IBD，微流控，菌群-疾病关联，风险预测，久坐，胃肠疾病，药物研发，心血管，Probiotics，诺和诺德，卡培他滨片，上海医药，普洛药业该篇日报由R·AI辅助创作生成，人工审核校对。 Lancet子刊：人工微生物组疗法——微生态治疗的新前景（综述） Lancet Gastroenterology & Hepatology——[35.7] ① 调节肠道菌群在治疗感染性疾病和非感染慢性疾病方面具有前景；② 目前常见的肠道菌群调节方法包括益生菌、益生元、合生制剂和粪菌移植，其中粪菌移植用于复发性艰难梭菌感染（rCDI）等疾病治疗具有成效，但这些方法在精准性、监管、安全性、可重复性和靶向性方面存在局限；③ 新兴的人工微生物组疗法主要包括菌群联合体（粪菌衍生物或菌株明确的合成群落，少量产品已获批预防rCDI）、噬菌体、细菌代谢物（如短链脂肪酸）、工程益生菌（作为治疗载体）；④ 这些疗法旨在提供具有一致性、靶向性和安全性的治疗产品，在不同精准度和机制层面上通过调节肠道菌群改善rCDI、炎症性肠病、癌症、糖尿病等疾病治疗，一些研发已处于临床试验阶段；⑤ 人工微生物组疗法面临费用成本、缺少数据等挑战。【原文信息】 Fine-tuning the gut ecosystem: the current landscape and outlook of artificial microbiome therapeutics 2024-05-01 , doi: 10.1016/S2468-1253(23)00357-6 Lancet子刊：炎症性肠病的菌群疗法（综述） Lancet Gastroenterology & Hepatology——[35.7] ① 菌群疗法是炎症性肠病（IBD）治疗的新方向，这篇综述总结了IBD菌群疗法（包括粪菌移植（FMT）以及使用菌群成分和组成明确的菌群进行治疗）的研究现状和挑战；② IBD菌群疗法中的给药途径包括鼻胃管、口服胶囊、灌肠和结肠镜给药；③ 5项2期随机对照试验（RCT）中，300多名轻中度溃疡性结肠炎患者接受FMT治疗后，30.7%的患者实现缓解（安慰剂组为9.6%），2项初步RCT显示，FMT在克罗恩病治疗中具有前景；④ 这些试验在抗生素预处理、诱导缓解和维持缓解的给药途径、治疗剂量、供体数量、在菌株层面追踪受体的菌群植入情况等方面提供了宝贵经验，为未来试验奠定坚实基础；⑤ 菌群疗法有望与现有疗法互补或组合使用。【原文信息】 Microbiota therapeutics for inflammatory bowel disease: the way forward 2024-05-01 , doi: 10.1016/S2468-1253(23)00441-7 Nature子刊：充分利用菌群特征和权衡策略强化微生物组治疗（观点） Nature Reviews Bioengineering——[0] ① 本文探讨了如何利用肠道微生物的特性及其权衡关系来设计有效的微生物组治疗方法；② 肠道微生物为适应肠道环境的变化和挑战（如营养物质的周期性供应和宿主的竞争），已进化出多种生存策略；③ 微生物的生存策略存在权衡关系，例如快速生长与资源效率和环境适应性之间的权衡，这会限制所谓“超级菌”的存在；④ 数学模型可以帮助优化治疗性微生物群落的性能，但需要考虑微生物的灵活策略和权衡关系；⑤ 通过深入理解肠道微生物的生存策略和机制，可以指导更有效的微生物组干预措施的设计。【原文信息】 Exploiting gut microbial traits and trade-offs in microbiome-based therapeutics 2024-04-04 , doi: 10.1038/s44222-024-00178-1 复旦团队：微流控技术助力肠道微生物疗法 Biomaterials——[14] ① 复旦大学商珞然团队开发了一种具有结肠靶向和粘膜粘附能力的水凝胶微球作为多功能递送平台，用于共同传递益生菌和辅助分子，以达到协同治疗疗效；② 该药物递送系统基于微流控技术，制备工艺简单，模式可控；③ 多功能微球可显著减少肠炎，修复肠道屏障功能，增强益生菌在肠道中的定植，并调节紊乱的肠道菌群；④ 在结肠炎小鼠模型中，多功能微球具有增强的治疗效果；⑤ 本研究揭示了基于微流控的智能滴状微球可以为先进的微生物疗法提供一个多功能平台。【原文信息】 Microfluidic-based multifunctional microspheres for enhanced oral co-delivery of probiotics and postbiotics 2024-04-03 , doi: 10.1016/j.biomaterials.2024.122564 Nature子刊：MintTea——多组学整合方法探索肠道菌群与疾病的关联 Nature Communications——[16.6] ① 通过引入“MintTea”方法，成功整合多组学数据，用于揭示与疾病相关的微生物组模块；② “MintTea”结合了典型相关性分析扩展、共识分析和评估协议，能够识别出在多个组学层面上协同变化、与疾病集体相关的多组学模块；③ 在代谢综合征研究样本中，识别出一个包含血清谷氨酸、TCA循环相关代谢物及与胰岛素抵抗相关细菌物种的模块；④ 识别出一个与晚期结直肠癌相关的模块，包括消化链球菌属和孪生菌属及粪便氨基酸，与这些物种的代谢活动及其与癌症发展的逐渐增加相符。【原文信息】 Multi-omic integration of microbiome data for identifying disease-associated modules 2024-03-23 , doi: 10.1038/s41467-024-46888-3 Nature子刊：结合遗传和肠道菌群，预测常见疾病风险 Nature Aging——[16.6] ① 本研究展示了结合多基因遗传风险评分（PRSs）和肠道微生物组评分，能显著提高常见疾病风险预测的准确性；② PRSs在预测冠状动脉疾病（CAD）、2型糖尿病（T2D）、阿尔茨海默病和前列腺癌方面，均优于传统风险因素；③ 肠道微生物组评分在预测CAD、T2D和前列腺癌方面，相较于仅基于年龄的模型有所提升；④ 将PRSs、肠道微生物组评分与传统风险因素相结合的综合风险模型，在所有研究的疾病中都比仅基于传统风险因素的模型具有更高的预测性能；⑤ 综合遗传和肠道微生物组的风险评估模型为常见慢性疾病的早期检测和风险评估提供了新的视角。【原文信息】 Integration of polygenic and gut metagenomic risk prediction for common diseases 2024-03-25 , doi: 10.1038/s43587-024-00590-7 李雪+邓敏子等：久坐可促胃肠疾病 EBioMedicine——[11.1] ① 浙江大学李雪、中南大学邓敏子与团队发表研究，通过孟德尔随机化（MR）分析，探究久坐生活方式和多种胃肠道疾病间的关联；② 较长的休闲屏幕时间（LST）与胃食管反流、胃溃疡、十二指肠溃疡等多种胃肠疾病风险增加相关，且大多数关联在调整中等至剧烈强度体育活动（MVPA）的遗传倾向后依然存在；③ 遗传倾向于MVPA的个体患有胃食管反流、胃溃疡等疾病的风险降低，即使在调整LST后，这些关联仍有所减弱但方向一致；④ 多变量MR分析表明，BMI和2型糖尿病在LST和MVPA与多种胃肠疾病间的关联中起到了中介作用。【原文信息】 Sedentary lifestyle, physical activity, and gastrointestinal diseases: evidence from mendelian randomization analysis 2024-04-06 , doi: 10.1016/j.ebiom.2024.105110 铁死亡生物学及其在胃肠道疾病中的作用（综述） Gastroenterology——[29.4] ① 铁死亡是一种非凋亡性、代谢调节的细胞死亡形式，是由活性氧种类（ROS）积累引起的铁依赖性磷脂过氧化作用，导致细胞膜损伤及损伤相关分子模式的释放，铁死亡与衰老和免疫有关，在消化道疾病病理中也有报道，但具体分子机制仍待证明，本综述对此进行了总结和探讨；② 铁死亡与肠道疾病如IBD，肝脏疾病包括急慢性肝脏损伤、病毒性肝炎、肝脏纤维化和血色素沉着症，以及消化道癌症均密切相关。这些疾病都可能涉及铁过载、ROS积累、脂质过氧化和抗氧化系统受损等调节铁死亡途径的关键步骤；③ 与细胞凋亡、坏死性凋亡以及细胞焦亡不同，铁死亡的调节机制十分多样和复杂，其中谷胱甘肽过氧化物酶 4 (GPX4) 铁死亡调节是经典的铁死亡控制途径。【原文信息】 Ferroptosis: Biology and Role in Gastrointestinal Disease 2024-02-29 , doi: 10.1053/j.gastro.2024.01.051 Nature Reviews：FDA2023年批准的胃肠肝病新药一览 Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology——[65.1] ① 2023年，美国食品药品监督管理局的药品评价与研究中心（CDER）批准了55种新药，其中4种与胃肠病和肝病相关；② 这些新批准的药物包括用于改善2型糖尿病患者血糖控制的Brenzavvy、治疗难治性转移性结直肠癌（CRC）的Fruzaqla、治疗溃疡性结肠炎的Omvoh和Velsipity；③ CDER还扩大了已批准药物的新用途，包括治疗儿童功能性便秘的Linzess、治疗先前接受过治疗的转移性结直肠癌的Lonsurf、作为克罗恩病首个口服药物的Rinvoq，以及扩展到新的儿科人群和治疗特定癌症的其他药物；④ CDER另批准了五种生物仿制药，如用于与化疗联合治疗转移性CRC和不能手术切除或转移性肝细胞癌的Avzivi、扩大注射范围的Entyvio、用于治疗特定患有脉络膜黑色素瘤肝转移的Hepzato和用于体重管理的Zepbound。【原文信息】 2023 FDA approvals in gastroenterology and hepatology 2024-03-07 , doi: 10.1038/s41575-024-00916-1 Nature Reviews：优化合并心血管和胃肠道疾病患者的抗血栓治疗（综述） Nature Reviews Cardiology——[49.6] ① 通过全面探讨心血管疾病和胃肠道并发症患者抗血栓治疗的优化策略，强调个体化治疗方案的重要性；② 各种临床状态，包括吸收不良综合征、肥胖手术、短肠综合征或肠道管饲养，都可能会影响口服抗血栓药物的吸收和生物利用度；③ 在高风险胃肠道出血（GIB）患者中，使用抗血栓药物极具挑战，而目前大部分用于预测冠状动脉疾病患者出血风险的模型并不能专门估计GIB的风险；④ 识别高危GIB患者、通过使用胃肠保护剂改变出血风险以及确定适当的抗血栓治疗方案在预防GIB中起着至关重要的作用；⑤ 在急性GIB发作后，确定抗血栓治疗中断的持续时间以及重新开始治疗的方案需要考虑出血严重程度和血栓事件风险之间的平衡。【原文信息】 Optimizing antithrombotic therapy in patients with coexisting cardiovascular and gastrointestinal disease 2024-03-20 , doi: 10.1038/s41569-024-01003-3 新加坡抗菌肽公司Probiotics获得620万美元A轮融资 ① 近日，新加坡抗菌肽初创公司Probiotics宣布，完成了620万美元（约合人民币4487万元）的A轮融资；② 本轮融资由Hatch's Blue Revolution Fund领投，Seventure Partners和SEEDS Capital等参投；③ Probiotics公司将利用这笔资金扩大生产规模，研发价格更低的抗菌肽产品，从而朝着减少食物链中抗生素使用这一目标迈进；④ Probiotics公司专注于利用生物技术研发出可工业化生产、成本可接受的抗菌肽产品，其首个产品面向水产养殖业行业，而该行业也是抗生素滥用的重灾区。【原文信息】 Probiotics lands US$6.2M funding to cut antibiotics out of food supply chain 2024-04-09 , E27 诺和诺德口服减重疗法中国申报临床 ① 4月10日，诺和诺德1类新药Amycretin片在中国提交的临床试验申请，获得国家药监局药品审评中心受理；② Amycretin是一款口服GLP-1受体和胰淀素受体的长效双重激动剂，用于治疗肥胖；③ 在1期临床试验中，患者使用Amycretin治疗12周后体重平均下降13.1%，远高于安慰剂组的1.1%；④ 诺和诺德计划于2024年下半年启动2期临床试验，以评估Amycretin在2型糖尿病患者中的疗效与安全性。【原文信息】 12周减重超13%！诺和诺德这款口服疗法在中国申报临床 2024-04-10 , 医药观澜山东新时代「卡培他滨片」获批上市 ① 近日，山东新时代药业旗下仿制4类药物卡培他滨片，获得国家药品监督管理局批准上市；② 卡培他滨片主要用于治疗多种癌症，包括结肠癌、乳腺癌和胃癌等；③ 原研药卡培他滨片由罗氏公司开发，1998年在美国获批，商品名为Xeloda；④ 国内已有6家企业拥有卡培他滨片的生产批文，且均已通过一致性评价；⑤ 卡培他滨片2022年在中国销售规模超15亿元，主要销售渠道为院内市场。【原文信息】 15亿抗肿瘤药，山东新时代拿下！ 2024-04-10 , 药春秋上海医药雷贝拉唑钠肠溶片通过仿制药一致性评价 ① 4月11日，上海医药发布公告称，旗下上药信谊药厂的雷贝拉唑钠肠溶片通过国家药监局仿制药一致性评价；② 该药品主要用于治疗胃溃疡、十二指肠溃疡、吻合口溃疡、反流性食管炎、卓-艾氏（Zollinger-Ellison）综合征，辅助用于治疗胃溃疡或十二指肠溃疡患者根除幽门螺旋杆菌；③ 上药信谊已投入约人民币1614万元用于该药品的一致性评价研发费用；④ QVIA 数据库显示，2023年该药品医院采购金额为人民币22.3亿元，主要销售厂家包括济川药业、卫材药业和成都迪康药业等。【原文信息】上海医药:上海医药集团股份有限公司关于雷贝拉唑钠肠溶片通过仿制药一致性评价的公告 2024-04-11 , 东方财富网普洛药业携手和泽医药推进「司美格鲁肽」等药学研发 ① 4月9日，普洛药业与和泽医药在横店签署战略合作协议；② 根据协议，双方将高效推进司美格鲁肽注射液等药学研发工作，以及司美格鲁肽治疗2型糖尿病和减重的临床疗效和安全性研究；③ 普洛药业创立于1989年，是深交所主板上市公司，并且在制剂领域具有国际领先的生产线和营销团队；④ 和泽医药是一家以药物研发为核心，从事药品持证及转化的服务型平台公司，为国内专业性、规模性、综合性最大的药品研发机构之一。【原文信息】普洛药业携手和泽医药，推进司美格鲁肽注射液等药学研发工作 2024-04-10 , 触界生物感谢本期日报的审核者：mildbreeze，九卿臣，圆圈儿，RZN，好雨，Richard 点击阅读过去10天的日报： 0412 | 10文聚焦国内团队新成果，肠道和菌群研究多点开花 0411 | 今日Nature：抵御病菌感染，结肠细胞如何与T细胞协作？ 0410 | 今日Cell：首个大规模泛癌转移瘤菌群图谱重磅出炉 0409 | 高分Nature子刊：菌群产物药物研发取得新进展 0408 | 300万人数据："好"胆固醇与消化道癌症风险有何关联？ 0407 | 100分综述详解：短链脂肪酸链起饮食、菌群和免疫 0406 | 贾伟/刘铁民/郑晓皎Cell子刊新发现：改善抑郁症的肠菌代谢物 0405 | 高分Cell子刊：中国农大团队详解后生元 0404 | 顶刊双发：肠菌相关神经发育和肠道免疫研究均有新发现 0403 | 今日Cell肠道研究双发：代谢胆固醇的肠菌+肠炎细胞图谱